4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Rattus norvegicus
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
1L41A 5B34A 1PXSA 1L99A 157LA 3HWLA 1SWZA 1CV3A 2JAFA 1EPYA 1L93A 1QTHA 244LA 4X1HA 1KS3A 111LA 1C68A 1P8IA 1P5CA 2YCYA 1LWKA 3KJ6A 3C7YA 1R84A 4FPDA 1L62A 4PXFA 1C69A 1L69A 3HT9A 1UAZA 3GULA 231LA 3C8QA 225LA 176LA 1L72A 3C7WA 1E0PA 5H2PA 1D2WA 3MBVA 141LA 180LA 1C6MA 3D4SA 1C6LA 1L74A 3DMZA 3VG9A 2I20A 1L14A 3HH4A 5ETZA 1LYHA 1P37A 219LA 1QUHA 1P8HA 1OVHA 2RAYX 4I7LA 1P8UA 2RBRA 1M0LA 3DN1A 3HDFA 4W55A 1P2LA 3V2YA 1C6NA 1X0I1 3V2WA 167LA 1L17A 2R4SA 3DMXA 4PK0A 185LA 191LA 5TGZA 2LCBA 1L67A 1L86A 239LA 2AT9A 1L40A 3DNAA 261LA 1S53A 3C7ZA 5A45A 1S8LA 5KKHA 138LA 1SX7A 236LA 1F88A 4EPFA 2BRDA 3HASA 2QARC 4EKSA 2Y01A 3NS0A 1LYJA 189LA 1L15A 4X32A 1T8AA 4N4WA 2M3GA 1L12A 165LA 1CV6A 260LA 3ZPQA 1L48A 5H2KA 1L46A 1L83A 144LA 1OVJA 5F8UA 1C6FA 259LA 4W54A 1L05A 177LA 1L28A 4KNFA 4G7QB 2OTYX 3QBLA 4JKVA 1C67A 4GYCA 1C3WA 1L03A 1QT8A 3GUOA 197LA 1L56A 3QDCA 1C6GA 1L76A 4I7TA 3QJVB 247LA 2OE4X 3HTGA 4YX7C 1DYEA 5C1MA 3GUJA 4AMJA 205LA 2QB0B 122LA 3DMVA 120LA 5G54A 2OE7X 1L20A 4I7JA 1KY1A 240LA 158LA 3GUNA 1BM1A 3PBLA 4UG2A 4PJZA 159LA 3VHZA 5H2OA 3OE9A 1B6IA 1F4ZA 1L75A 226LA 2CUUA 3HTBA 4N6HA 1DYDA 1IXFA 3QJUB 4QI1A 4EIYA 1D2YA 211LA 5J7AA 2NTUA 1E12A 3PDSA 1CUPA 1QM8A 5B0WA 1P7SA 238LA 127LA 5AHYA 1CU5A 3ZPRA 3G3WA 3S3CB 5B2NA 5G28A 5AWZA 5DHHA 183LA 3COCA 4W57A 3HTDA 1BRRA 1LLHA 1M0MA 1L64A 253LA 2Q9EA 169LA 2LZMA 1UCQA 4ZPUA 3QJRB 4HYXA 1LPYA 2Y04A 3UONA 4ARLA 1L21A 4XT3A 1CV5A 198LA 2YDOA 2I21A 1L02A 4I7OA 216LA 4FA7B 1L07A 1EHKB 4XT1A 3HU9A 1CU6A 1KW5A 156LA 2HUKA 190LA 2WJKA 126LA 2LC9A 3G3VA 1L11A 4S0WA 130LA 3EH3B 4WW3A 107LA 4ARQB 4G7RB 4ARJA 2L78A 3K2RA 1S54A 229LA 1Q5JA 250LA 2YCXA 1L45A 4FAAB 1L60A 1KNIA 1T6HA 2KS9A 4BV0A 174LA 1L57A 2OEAX 4I7SA 1JV7A 1JTMA 4JR8A 4I7RA 1QUOA 7LZMA 4XXJA 3HTFA 5H2HA 137LA 181LA 4A4MA 5DHGA 256LA 2Z6BA 3DKEX 4ARQA 3LZMA 4TL3A 1L98A 2J4YA 1L54A 4ARMB 3HT6A 3DDLA 1L29A 5AHZA 227LA 1M0KA 2ZFEA 4W56A 1HZXA 3C9LA 3A7KA 4BEZA 3NY9A 2ZZLA 1QT7A 1L43A 1L50A 1SSYA 222LA 3C8RA 4E97A 1AP9A 1L87A 1OWZA 3HH6A 152LA 1LYGA 1QT5A 2Y03A 3EH5B 1VGOA 3OE8A 1L06A 1CWQA 1KG9A 2B73A 1L94A 3NYAA 3SB6A 241LA 1DYCA 3PQRA 129LA 4ARMA 3HH5A 5AX0A 149LA 1L35A 4Y9HA 145LA 1CU2A 3RUNA 163LA 4N4YB 1L84A 1FBBA 1L36A 3ABWA 262LA 1L22A 246LA 3OAXA 3L64A 3S8GB 2RBNA 5ITCA 2F32A 2B7XA 1L81A 1C6KA 3HH3A 3QBGA 3SB8A 3CDOA 1VJMA 1CU3A 1DYGA 1QS9A 1LI6A 1LYIA 1MGYA 3X3BA 1XEPA 3CAPA 5G36A 223LA 2NTHA 1CX7A 4YXCA 1XJIA 4WAVA 1L01A 1LI3A 1PQDA 1C61A 1JQUA 228LA 3QAKA 3EMLA 1L30A 3AYMA 1P36A 237LA 2OTZX 4BVNA 3DN8A 1K28A 1L13A 3QJSB 3UZAA 3UZCA 3WQJA 1L27A 128LA 1L25A 4GBRB 1C6QA 1C6PA 3HARA 4MQSA 1C65A 4EXMA 2HPYA 4OO9A 1L49A 2EI4A 103LA 4BUOA 249LA 3F9LA 4PXKA 3HAOA 1L53A 5JJJA 4GP4B 1L66A 1CV1A 5BR5A 1QKOA 3AYNA 4L35A 3CDRA 131LA 166LA 3HAQA 2IGCA 1LWGA 1WTHA 1L85A 2B74A 258LA 139LA 2RBSA 4GBRA 1L42A 1OWYA 1FBKA 4KLYA 1L77A 1BRXA 4W53A 3SB5A 1P3NA 3VI0A 3JR6A 1L37A 212LA 162LA 4AMIA 1QUDA 151LA 186LA 4L6RA 1L39A 2RB2X 4DAJA 1C8SA 1L73A 254LA 1G0MA 1L38A 1SX2A 1L79A 1ZWNA 235LA 1CU0A 1D3NA 2O79A 4LZMA 4W51A 1KGBA 2Z55A 206LA 118LA 1JGJA 4MD2A 4QRYA 109LA 4EJ4A 3S3BB 4XTLA 5G2AA 1R2NA 4G70B 4IARA 1L92A 220LA 3GUMA 221LA 4EA3A 1L44A 1O0AA 1L52A 1L10A 4FBZA 3VW7A 2RB1X 5EN0A 1OVKA 1P56A 1LYFA 5LZMA 4DJHA 2NTWA 4J4QA 2QPDB 2Z73A 5G2DA 5G2CA 1L04A 4MD1A 213LA 1XMEB 2F2QA 3UTYA 1L70A 1OYUA 2YDVA 2ZIYA 2YCWA 4GRVA 3L2XA 3RZEA 2B70A 5A8EA 1C66A 1KG8A 1L61A 1G0LA 1C6IA 1QKPA 5H2LA 1L33A 1C6DA 104LA 3NY8A 1DYBA 1L24A 3SB9A 4IB4A 1QT6A 1QUGA 224LA 2B75A 1C6JA 3DN6A 4BEYA 6LZMA 1BRDA 232LA 4G7SB 2NTGA 1D9WA 1QTBA 1XJUA 3UTVA 125LA 201LA 3G3XA 2PEDA 1L0KA 5A44A 1QS5A 1LW9A 1C6HA 200LA 5LWEA 4UHRA 1DZEA 1L88A 1PY6A 4IAPA 110LA 5B6YA 3P0GA 1L26A 148LE 2KSAA 4XTOA 3PWHA 155LA 192LA 3T45A 5H2JA 1QTDA 1GZMA 164LA 3GUPA 1OV5A 3QJQB 3DN3A 1F50A 196LA 218LA 1QHJA 3S3DB 2KSYA 178LA 1L09A 2LNLA 3S8FB 1G0GA 1G06A 2B6TA 1IW9A 1QT4A 252LA 113LA 3EH4B 1QTCA 3HT8A 5DYSA 3HDEA 3VVKA 3REYA 1L89A 1OV7A 1L91A 123LA 3HT7A 119LA 1T8FA 5B6WA 2HULA 3ODUA 1C63A 1S52A 3HUKA 2B72A 4NC3A 1CV4A 2F93A 1QSQA 1C60A 1KMEA 1L65A 1CUQA 1ZYTA 146LA 4GPOA 2I35A 1C6CA 1L97A 1XJTA 257LA 4EKQA 4GP8B 3DN0A 3C81A 1U19A 4XTNA 2B6YA 4YXAC 3ZEVA 171LA 1C62A 210LA 5AX1A 1D3MA 4I7NA 3OE0A 1S51A 1JV6A 242LA 251LA 3VGAA 2Q9DA 1PQIA 1L16A 4K5YA 1P64A 3F8VA 4DKLA 2RAZX 3FADA 3GUIA 1G0JA 1IW6A 245LA 248LA 3HANA 4AQNA 1LI2A 2ANVA 4I7KA 3NSBA 1L34A 2YCZA 1JTNA 1XIOA 3CODA 233LA 2RBOA 1SWYA 2X72A 1KW7A 3CDTA 4MBSA 4W52A 2Y00A 4W59A 5B6XA 2RBQA 3HUAA 3UTXA 5H2MA 5JJNA 1CTWA 1L08A 1LGXA 1L90A 1L96A 2OU0X 2F47A 1D3FA 1L80A 1P2RA 217LA 3C83A 3HU8A 5I14A 5AZDA 184LA 2O7AA 4OV0A 3FA0A 1L82A 230LA 1G1WA 1NHBA 4I7MA 3QBIA 1DYAA 3C9MA 3QAPA 1D3JA 3DN4A 4EKRA 2B6ZA 1C6TA 4GP5B 4IAQA 1C6BA 150LA 161LA 4EPIA 1QTZA 1LN6A 1C6AA 2ANXA 108LA 188LA 2OE9X 2OU8A 1KY0A 4G72B 3X3CA 1L9HA 2F95A 168LA 5B6ZA 2OU9A 4I7QA 1L23A 1L0MA 4LDLA 115LA 1H2SA 199LA 2RBPA 5ITEA 243LA 3SBAA 1LYEA 4I7PA 3GUKA 1L0JA 2R4RA 234LA 1L47A 3FI5A 1Q5IA 2A4TA 112LA 1QTVA 160LA 3C82A 4HWLA 3DQBA 1GU8A 1T8GA 182LA 5BR2A 1DYFA 1L59A 1LGUA 1PQJA 2G87A 1PQMA 170LA 172LA 175LA 1CX6A 2B6WA 1QT3A 3CDVA 1C8RA 1L55A 147LA 1G0PA 1PXRA 2Y02A 195LA 1L32A 2O4WA 1JFPA 1H68A 3RFMA 187LA 1LGWA 255LA 1L19A 3QBKA 3UG9A 1C64A 1L71A 1TLAA 3SBBC 4EKPA 5G53A 3UTWA 1L31A 1T97A 4X31A 2WJLA 3BVDB 215LA 2L6XA 1P6YA 2JAGA 1CV0A 4W58A 1X0SA 2B6XA 5JJEA 1QSBA 1C6EA 2QPEB 3SN6R 2RB0X 2RH1A 3CDQA 2VT4A 3HAPA 102LA 3QJTB 3AM6A 5B35A 1AT9A 3C8SA 2I1XA 1L58A 209LA 1S8JA 4JQ6A 1LYDA 1CVKA 1SSWA 5H2NA 3SB7A 3OE6A 1ZURA 1PQOA 3DN2A 4MQTA 4HYJA 1GUEA 3C80A 4ARPA 1L63A 1TN5A 1I6SA 3HUQA 114LA 1L95A 140LA 142LA 1L68A 4LDOA 1G0KA 2HUMA 1TN0A 4G71B 4BWBA 1P46A 1X0K1 143LA 1G1VA 5B6VA 173LA 214LA 2KSBA 4LDEA 1L51A 1PQKA 5H2IA 3PXOA 1L00A 1G0QA 5FJGA 1G07A 1L18A 4QIDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BHZA 5B34A 1PXSA 1F10A 1GF5A 3HWLA 1SWZA 1CV3A 2LYZA 1L93A 1P5CA 5HMVA 1RJCB 1LWKA 3KJ6A 3C7YA 1L62A 4PXFA 4OWEA 3C8QA 225LA 1WTMA 3BKVA 3MBVA 1I20A 1L74A 1LHJA 1IC7Y 1L14A 3WVXA 219LA 1P8UA 4I7LA 1B7QA 3HDFA 1C6NA 1X0I1 167LA 4EOFA 1B7NA 3DMXA 5TGZA 3AYQA 1L86A 239LA 3AB6A 5A45A 1S8LA 5KKHA 4EPFA 4EKSA 4N4WA 1L12A 1HMKA 260LA 3ZPQA 4H93A 4M4OA 1UIBA 1L46A 4B1AA 5F8UA 1C6FA 4W54A 1WTNA 4JKVA 1AM7A 1PZYA 1C6GA 3AZ5A 4I7TA 2OE4X 1GBWA 5B1FA 5C1MA 3GUJA 1B5WA 5ILCA 5G54A 4GN4A 4I7JA 1SLYA 4I8SA 3PBLA 159LA 1BB7A 1GBXA 2CUUA 1B5VA 3HTBA 3W6AA 4G4HA 1IXFA 4RW2A 3PDSA 5APFA 1WQOA 1CU5A 2W1LA 1YAMA 1LZ4A 3G3WA 4Z46A 5G28A 5DHHA 3FE0A 169LA 2DQDY 1JKCA 2Y04A 4XT3A 1MLCE 1YAOA 2LZ2A 2I21A 1L02A 4FA7B 4NGOA 1BWJA 1L07A 1EHKB 4XT1A 1YAPA 4WL7A 1CU6A 2LC9A 130LA 4WO9A 107LA 229LA 2Z12A 4FAAB 1L60A 1T6HA 1IVMA 4BV0A 4WM1A 2OEAX 1IX0A 4OOOA 1QUOA 2HECA 3HFMY 3N9CA 2Z6BA 2ZIJA 3DKEX 4TL3A 1L98A 1WQNA 4H91A 2J4YA 1OUEA 3HT6A 4J1BA 1VDPA 1J1XY 4TTDA 1LHMA 3TXHA 1M0KA 3A7KA 3GXRA 1B5XA 2BQMA 4MSTA 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 2OU9 A;  4I7Q A;  1L23 A;  1L0M A;  4LDL A;  115L A;  1H2S A;  199L A;  2RBP A;  5ITE A;  243L A;  3SBA A;  1LYE A;  4I7P A;  3GUK A;  1L0J A;  2R4R A;  234L A;  1L47 A;  3FI5 A;  1Q5I A;  2A4T A;  112L A;  1QTV A;  160L A;  3C82 A;  4HWL A;  3DQB A;  1GU8 A;  1T8G A;  182L A;  5BR2 A;  1DYF A;  1L59 A;  1LGU A;  1PQJ A;  2G87 A;  1PQM A;  170L A;  172L A;  175L A;  1CX6 A;  2B6W A;  1QT3 A;  3CDV A;  1C8R A;  1L55 A;  147L A;  1G0P A;  1PXR A;  2Y02 A;  195L A;  1L32 A;  2O4W A;  1JFP A;  1H68 A;  3RFM A;  187L A;  1LGW A;  255L A;  1L19 A;  3QBK A;  3UG9 A;  1C64 A;  1L71 A;  1TLA A;  3SBB C;  4EKP A;  5G53 A;  3UTW A;  1L31 A;  1T97 A;  4X31 A;  2WJL A;  3BVD B;  215L A;  2L6X A;  1P6Y A;  2JAG A;  1CV0 A;  4W58 A;  1X0S A;  2B6X A;  5JJE A;  1QSB A;  1C6E A;  2QPE B;  3SN6 R;  2RB0 X;  2RH1 A;  3CDQ A;  2VT4 A;  3HAP A;  102L A;  3QJT B;  3AM6 A;  5B35 A;  1AT9 A;  3C8S A;  2I1X A;  1L58 A;  209L A;  1S8J A;  4JQ6 A;  1LYD A;  1CVK A;  1SSW A;  5H2N A;  3SB7 A;  3OE6 A;  1ZUR A;  1PQO A;  3DN2 A;  4MQT A;  4HYJ A;  1GUE A;  3C80 A;  4ARP A;  1L63 A;  1TN5 A;  1I6S A;  3HUQ A;  114L A;  1L95 A;  140L A;  142L A;  1L68 A;  4LDO A;  1G0K A;  2HUM A;  1TN0 A;  4G71 B;  4BWB A;  1P46 A;  1X0K 1;  143L A;  1G1V A;  5B6V A;  173L A;  214L A;  2KSB A;  4LDE A;  1L51 A;  1PQK A;  5H2I A;  3PXO A;  1L00 A;  1G0Q A;  5FJG A;  1G07 A;  1L18 A;  4QID A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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