4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Rattus norvegicus
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
1C67A 1L38A 1ZURA 1C6HA 2OEAX 1PQIA 3HAPA 1QT6A 1L28A 1L58A 3CDOA 191LA 5FJGA 3C9MA 2I1XA 1CU6A 1L10A 3A7KA 175LA 4GRVA 1L42A 2Z55A 1IW9A 1D2YA 4WAVA 4IB4A 2RH1A 3S3BB 5F8UA 1LI2A 261LA 1QT4A 4AMIA 1C3WA 1QTHA 3GUIA 4N6HA 4K5YA 255LA 3CAPA 4UG2A 1LWKA 1OVKA 214LA 1KG8A 4MD1A 1G1WA 1L46A 2OTZX 2M3GA 5G53A 5C1MA 4A4MA 3WQJA 1L35A 4XXJA 178LA 2NTGA 4ARMB 1BM1A 141LA 262LA 1L14A 2B70A 130LA 259LA 4GP8B 5I14A 185LA 3UZAA 2QPDB 4GP4B 1L44A 1L41A 3UONA 186LA 217LA 5G28A 209LA 196LA 1L13A 1QT5A 1C6TA 3HH4A 4QRYA 3GULA 1LPYA 2OTYX 3HANA 1L86A 5LWEA 3MBVA 3BVDB 4EJ4A 5A44A 2O7AA 5J7AA 1C8SA 213LA 3DN0A 1EHKB 1L30A 1QTVA 2ZIYA 1LGUA 1FBKA 176LA 2KSBA 5B35A 2LNLA 5TGZA 2RBOA 1R2NA 1L33A 4NC3A 3C8RA 1C63A 4W54A 1C6FA 2ANVA 1L40A 1L24A 1VJMA 5AHZA 3CDVA 2B6TA 1L26A 1L69A 2I35A 167LA 3NS0A 3HH3A 1G07A 1G0GA 223LA 1HZXA 4Y9HA 1DYBA 5EN0A 5A8EA 1OYUA 1D9WA 1M0LA 3HUAA 5H2OA 2YCWA 1L09A 4XT3A 4ARQB 5ETZA 1P46A 1B6IA 1KY1A 1OV5A 5B6ZA 1C6MA 2ZZLA 3REYA 149LA 1G0JA 2Y04A 1LGXA 150LA 1C64A 3PWHA 4GBRA 2B6XA 2F95A 2RBPA 1L96A 234LA 4EPFA 4EXMA 177LA 151LA 4JKVA 1C6GA 1H2SA 1P8UA 3HTGA 2Y02A 4W58A 241LA 1C61A 1L25A 1G0QA 4FPDA 115LA 4BEZA 1L12A 5B6YA 1C69A 3C8SA 3SB8A 114LA 1CV4A 3C82A 1CV6A 1L97A 198LA 102LA 5H2LA 109LA 1P5CA 1IW6A 3UTYA 174LA 4N4WA 1L77A 1JQUA 3X3CA 1KW7A 3AYMA 3OE0A 3CODA 1L34A 3QBGA 2JAGA 1WTHA 1C6KA 4IAPA 138LA 2LZMA 5BR2A 169LA 2KSAA 1XJIA 1EPYA 1CU3A 123LA 1TLAA 1LYIA 4HYJA 4AMJA 1C8RA 129LA 1G0PA 163LA 5G54A 3QJSB 3NY8A 1L0MA 1CWQA 1JTNA 2RAYX 1QT3A 3CDRA 2R4SA 3L2XA 1CV3A 131LA 1L51A 2QB0B 1M0MA 1BRDA 2A4TA 1TN0A 3SB9A 2X72A 2KS9A 2B6ZA 2CUUA 3QJTB 4LDLA 1G06A 1OWZA 232LA 119LA 5AHYA 3S8GB 144LA 206LA 5DYSA 3UTVA 4GYCA 173LA 1QS9A 5AZDA 3G3VA 1PXRA 3DKEX 3LZMA 3ODUA 5B6VA 1QUDA 1FBBA 5B6WA 4DAJA 1L52A 5B34A 1L45A 3PDSA 1XEPA 2HPYA 3DMXA 1L29A 1L11A 2QARC 158LA 1P8IA 3HDFA 3EH3B 3UG9A 215LA 3V2YA 3HAOA 244LA 236LA 2JAFA 1L70A 190LA 3NYAA 1L31A 4XTOA 4EKRA 125LA 1L43A 1QUGA 2RB0X 1TN5A 3DN2A 4L35A 1L00A 1BRRA 1QUOA 1C6IA 4XT1A 1L90A 5H2KA 3HTDA 3DN1A 1NHBA 1UAZA 1L20A 3PQRA 3EMLA 4BWBA 2OU0X 3SN6R 1IXFA 1E12A 4LDEA 4L6RA 1QTZA 1U19A 2YCZA 1L87A 245LA 2OE9X 1L56A 1P2LA 1C60A 1D2WA 1L19A 1L98A 2OU8A 2Y03A 159LA 1X0I1 2B73A 4G7QB 126LA 4ARPA 3S3CB 242LA 4PXFA 5ITCA 1D3JA 1QSBA 3HH5A 1L74A 2HUMA 3EH5B 3AM6A 2NTHA 201LA 3EH4B 5G2DA 3QBIA 2RB1X 4EKSA 5H2IA 1LI3A 4G71B 172LA 4PK0A 1Q5IA 4EPIA 4JQ6A 5A45A 5H2HA 1DYFA 1GUEA 212LA 2B7XA 1L64A 1C66A 4KNFA 104LA 5G36A 4OO9A 5AX0A 166LA 5JJNA 103LA 160LA 226LA 3S3DB 1QUHA 243LA 1OWYA 2WJKA 1ZYTA 3RUNA 1QM8A 250LA 2B75A 1S52A 1T6HA 2F47A 1C6DA 6LZMA 2Q9DA 220LA 4S0WA 4I7TA 3VG9A 180LA 3OAXA 2I21A 4ARLA 128LA 1LGWA 1L57A 1S51A 256LA 1G0LA 3L64A 3HARA 1CTWA 1DYCA 3UTXA 1CUQA 2F93A 2Y00A 5JJEA 1CV1A 2VT4A 1C6BA 1L62A 210LA 5JJJA 3DDLA 1KGBA 5AWZA 3CDQA 5B6XA 4J4QA 2Z73A 3G3XA 1JTMA 4MQTA 1P7SA 3ZEVA 4G7SB 2B74A 2YDVA 200LA 3ABWA 239LA 165LA 4FA7B 1P64A 4GBRB 1T8FA 251LA 4W59A 155LA 3C7ZA 2IGCA 3OE8A 1GZMA 252LA 1XIOA 3V2WA 2I20A 2NTWA 3SB5A 3VGAA 1P56A 5H2MA 4I7RA 142LA 1C62A 4QIDA 3OE6A 227LA 221LA 249LA 3HUKA 216LA 4IAQA 3UTWA 1LLHA 1LWGA 1DZEA 3T45A 4BEYA 1VGOA 1SX2A 1I6SA 1T8GA 1L80A 4I7KA 1UCQA 1L93A 205LA 143LA 147LA 3FADA 1KG9A 1L60A 233LA 2WJLA 1PQMA 1L89A 1G0KA 2HULA 229LA 1L27A 4ZPUA 1L94A 3COCA 1L39A 1L61A 192LA 4GPOA 1C65A 1P3NA 2LC9A 4LDOA 164LA 1QKOA 1L37A 1X0SA 197LA 3QJQB 4G72B 228LA 161LA 219LA 2OE4X 3SBAA 3HTBA 2BRDA 4XTLA 1C6NA 4GP5B 248LA 1PXSA 3DMZA 4MQSA 1R84A 110LA 3HT7A 1JV6A 1LI6A 189LA 1L82A 4N4YB 1L75A 1L59A 199LA 3VVKA 225LA 1L18A 2B6YA 1L72A 1D3FA 108LA 4I7JA 1JFPA 3GUJA 2Y01A 195LA 3NSBA 1XMEB 4IARA 1P2RA 1L06A 3NY9A 4LZMA 1PQJA 1C6JA 3JR6A 2RAZX 3F8VA 4EA3A 3DNAA 1KY0A 1OVHA 1L66A 188LA 1L01A 1XJUA 1L23A 2OU9A 3HU8A 1JV7A 2QPEB 3ZPQA 1L50A 1LYHA 1QT8A 1L63A 3DN3A 4EKQA 4BVNA 1LN6A 4UHRA 113LA 145LA 4HYXA 4AQNA 1L68A 4W56A 1L9HA 1G0MA 3HT6A 4E97A 5BR5A 2RBRA 4ARJA 4ARMA 1L55A 3F9LA 183LA 1G1VA 1L36A 2RBSA 1L04A 1L49A 1T97A 4W55A 1D3NA 2OE7X 4DKLA 4BV0A 254LA 5H2PA 122LA 1CV0A 4W53A 1LW9A 3DN4A 1CX7A 1L92A 4MBSA 2EI4A 3P0GA 1S54A 4X1HA 3DN6A 146LA 3C7YA 1AP9A 3QBLA 5DHHA 137LA 1L07A 258LA 1L84A 4W57A 1QTDA 4I7QA 1QSQA 120LA 2F32A 246LA 157LA 1SWZA 1F4ZA 1L85A 3FA0A 5H2NA 1AT9A 3C7WA 148LE 3DMVA 1S53A 2RBNA 2RB2X 5B2NA 1L47A 5B0WA 1L91A 1L71A 4YX7C 1L79A 3SB7A 1KMEA 257LA 2AT9A 1C6CA 1KNIA 3GUPA 3HT9A 4W51A 4EIYA 1C68A 3C9LA 3HAQA 1C6LA 238LA 253LA 127LA 3K2RA 4DJHA 1F88A 4OV0A 4PXKA 247LA 3QJVB 4JR8A 4ARQA 1GU8A 1LYJA 260LA 2F2QA 1JGJA 3C81A 1C6PA 3HT8A 3QAKA 7LZMA 222LA 3GUKA 1MGYA 2YCYA 168LA 1P37A 1LYGA 182LA 3C80A 4I7PA 2L78A 3PXOA 111LA 1DYGA 3C83A 2KSYA 4QI1A 4XTNA 5G2AA 181LA 1QHJA 1L17A 1PQDA 1E0PA 2RBQA 1S8LA 3HASA 3QJRB 3UZCA 1T8AA 3DN8A 3HWLA 3GUMA 2J4YA 5LZMA 4PJZA 1QS5A 240LA 1CU5A 1K28A 3QJUB 2ANXA 2O4WA 118LA 156LA 1CX6A 1CU2A 4HWLA 5KKHA 3G3WA 2NTUA 1XJTA 3ZPRA 1L16A 3PBLA 1C6AA 2ZFEA 1BRXA 1O0AA 224LA 4MD2A 1L76A 1C6EA 3AYNA 5ITEA 3VI0A 5G2CA 1OVJA 3X3BA 1CUPA 3KJ6A 1L0KA 1QTCA 3HDEA 230LA 4G70B 1CVKA 1P6YA 2HUKA 4EKPA 4I7SA 2Z6BA 171LA 1P8HA 4KLYA 3RZEA 1X0K1 1KW5A 1L67A 4FAAB 3VW7A 162LA 218LA 2LCBA 2O79A 1L21A 3SB6A 3QBKA 4I7LA 1OV7A 1L02A 1P36A 1PQKA 3SBBC 4I7MA 2B72A 2G87A 235LA 2R4RA 3DQBA 140LA 1DYAA 1L83A 1L03A 2Q9EA 4I7OA 4W52A 1SSWA 3OE9A 1S8JA 5DHGA 1L99A 3GUNA 170LA 4WW3A 4X31A 3HU9A 1F50A 3QAPA 1L15A 1PY6A 4FBZA 1L81A 3C8QA 1L48A 1LYDA 3QDCA 1L95A 1LYEA 1CV5A 3S8FB 187LA 231LA 237LA 3CDTA 1C6QA 1CU0A 4G7RB 112LA 1L05A 1QTBA 2L6XA 1PQOA 1L65A 1SWYA 4YXCA 1L0JA 1L53A 4BUOA 1KS3A 2B6WA 3GUOA 152LA 1QKPA 4I7NA 1L32A 1L88A 184LA 3FI5A 1LYFA 4X32A 1DYDA 1ZWNA 1L08A 1SX7A 4TL3A 2PEDA 1L73A 107LA 5AX1A 1L54A 139LA 3D4SA 1H68A 1Q5JA 1SSYA 5H2JA 1L22A 1QT7A 1M0KA 4YXAC 211LA 3HUQA 3HH6A 2YCXA 3RFMA 2YDOA 1DYEA 3VHZA 1D3MA 3HTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B6LA 3CB7A 2OEAX 2WARA 3TXFA 1L28A 1WVVA 4W96A 1HC0A 1L10A 4ETDA 4GRVA 2Z55A 1T3PA 5F8UA 4C3WA 4N6HA 3GUIA 3RT5X 4K5YA 4UG2A 2CJLA 1KG8A 1BVKC 1NQIA 2M3GA 2W1MA 178LA 4B49A 1AZFA 4WM1A 262LA 5I4XA 1L44A 1L41A 1QQYA 3UONA 1BWHA 186LA 3LHMA 209LA 2ZIKA 5KXWA 2OTYX 3MBVA 2O7AA 1UA6Y 3DN0A 1F6RA 1EHKB 1QTVA 5F14A 2ZIYA 5B35A 3B0IA 1JKAA 2RBOA 1GFRA 5AHZA 5I4YA 1L26A 1L69A 5LYZA 167LA 1YQVY 5A8EA 223LA 4N1CC 5H2OA 1BGIA 1LJ4A 2YCWA 1L09A 1BB3A 5ETZA 4ZEEA 1P46A 1B6IA 1C6MA 1IP1A 1LGXA 1FLUA 3PWHA 2RBPA 1DI3A 4EPFA 2MEEA 4NSJA 1B2KA 4JKVA 1YROA 1C45A 4LYBA 3HTGA 1QIOA 4XENA 4N1EI 1C61A 4FPDA 115LA 4H9CA 1O23A 3C8SA 3A95A 3C82A 1CV6A 102LA 1VDQA 109LA 1VDPA 4ETCA 2LYOA 4UWUA 3UTYA 1L77A 2IFFY 3AYMA 2YBJA 1L34A 1WTHA 5ILCA 133LA 1UBZA 5BR2A 5DN4A 5KY1A 3GXRA 4AMJA 129LA 3W6EA 4NGJA 1G0PA 1XGQC 5D5FA 1YKXX 4GCDA 1L0MA 4H8YA 1LMNA 2R4SA 3L2XA 1L51A 4DQJA 2DQIY 4WL7A 1G06A 119LA 5DYSA 2BQCA 1QS9A 3WUMA 4BAFA 3G3VA 1PXRA 4NG8A 1QUDA 3A6BY 4TSCA 1L52A 1XEPA 3B0OA 1L29A 1L11A 2XBRA 158LA 2Q0MX 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 3DMZ A;  4MQS A;  1R84 A;  110L A;  3HT7 A;  1JV6 A;  1LI6 A;  189L A;  1L82 A;  4N4Y B;  1L75 A;  1L59 A;  199L A;  3VVK A;  225L A;  1L18 A;  2B6Y A;  1L72 A;  1D3F A;  108L A;  4I7J A;  1JFP A;  3GUJ A;  2Y01 A;  195L A;  3NSB A;  1XME B;  4IAR A;  1P2R A;  1L06 A;  3NY9 A;  4LZM A;  1PQJ A;  1C6J A;  3JR6 A;  2RAZ X;  3F8V A;  4EA3 A;  3DNA A;  1KY0 A;  1OVH A;  1L66 A;  188L A;  1L01 A;  1XJU A;  1L23 A;  2OU9 A;  3HU8 A;  1JV7 A;  2QPE B;  3ZPQ A;  1L50 A;  1LYH A;  1QT8 A;  1L63 A;  3DN3 A;  4EKQ A;  4BVN A;  1LN6 A;  4UHR A;  113L A;  145L A;  4HYX A;  4AQN A;  1L68 A;  4W56 A;  1L9H A;  1G0M A;  3HT6 A;  4E97 A;  5BR5 A;  2RBR A;  4ARJ A;  4ARM A;  1L55 A;  3F9L A;  183L A;  1G1V A;  1L36 A;  2RBS A;  1L04 A;  1L49 A;  1T97 A;  4W55 A;  1D3N A;  2OE7 X;  4DKL A;  4BV0 A;  254L A;  5H2P A;  122L A;  1CV0 A;  4W53 A;  1LW9 A;  3DN4 A;  1CX7 A;  1L92 A;  4MBS A;  2EI4 A;  3P0G A;  1S54 A;  4X1H A;  3DN6 A;  146L A;  3C7Y A;  1AP9 A;  3QBL A;  5DHH A;  137L A;  1L07 A;  258L A;  1L84 A; 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 3G3W A;  2NTU A;  1XJT A;  3ZPR A;  1L16 A;  3PBL A;  1C6A A;  2ZFE A;  1BRX A;  1O0A A;  224L A;  4MD2 A;  1L76 A;  1C6E A;  3AYN A;  5ITE A;  3VI0 A;  5G2C A;  1OVJ A;  3X3B A;  1CUP A;  3KJ6 A;  1L0K A;  1QTC A;  3HDE A;  230L A;  4G70 B;  1CVK A;  1P6Y A;  2HUK A;  4EKP A;  4I7S A;  2Z6B A;  171L A;  1P8H A;  4KLY A;  3RZE A;  1X0K 1;  1KW5 A;  1L67 A;  4FAA B;  3VW7 A;  162L A;  218L A;  2LCB A;  2O79 A;  1L21 A;  3SB6 A;  3QBK A;  4I7L A;  1OV7 A;  1L02 A;  1P36 A;  1PQK A;  3SBB C;  4I7M A;  2B72 A;  2G87 A;  235L A;  2R4R A;  3DQB A;  140L A;  1DYA A;  1L83 A;  1L03 A;  2Q9E A;  4I7O A;  4W52 A;  1SSW A;  3OE9 A;  1S8J A;  5DHG A;  1L99 A;  3GUN A;  170L A;  4WW3 A;  4X31 A;  3HU9 A;  1F50 A;  3QAP A;  1L15 A;  1PY6 A;  4FBZ A;  1L81 A;  3C8Q A;  1L48 A;  1LYD A;  3QDC A;  1L95 A;  1LYE A;  1CV5 A;  3S8F B;  187L A;  231L A;  237L A;  3CDT A;  1C6Q A;  1CU0 A;  4G7R B;  112L A;  1L05 A;  1QTB A;  2L6X A;  1PQO A;  1L65 A;  1SWY A;  4YXC A;  1L0J A;  1L53 A;  4BUO A;  1KS3 A;  2B6W A;  3GUO A;  152L A;  1QKP A;  4I7N A;  1L32 A;  1L88 A;  184L A;  3FI5 A;  1LYF A;  4X32 A;  1DYD A;  1ZWN A;  1L08 A;  1SX7 A;  4TL3 A;  2PED A;  1L73 A;  107L A;  5AX1 A;  1L54 A;  139L A;  3D4S A;  1H68 A;  1Q5J A;  1SSY A;  5H2J A;  1L22 A;  1QT7 A;  1M0K A;  4YXA C;  211L A;  3HUQ A;  3HH6 A;  2YCX A;  3RFM A;  2YDO A;  1DYE A;  3VHZ A;  1D3M A;  3HTF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4UWU A;  3UTY A;  1L77 A;  2IFF Y;  3AYM A;  2YBJ A;  1L34 A;  1WTH A;  5ILC A;  133L A;  1UBZ A;  5BR2 A;  5DN4 A;  5KY1 A;  3GXR A;  4AMJ A;  129L A;  3W6E A;  4NGJ A;  1G0P A;  1XGQ C;  5D5F A;  1YKX X;  4GCD A;  1L0M A;  4H8Y A;  1LMN A;  2R4S A;  3L2X A;  1L51 A;  4DQJ A;  2DQI Y;  4WL7 A;  1G06 A;  119L A;  5DYS A;  2BQC A;  1QS9 A;  3WUM A;  4BAF A;  3G3V A;  1PXR A;  4NG8 A;  1QUD A;  3A6B Y;  4TSC A;  1L52 A;  1XEP A;  3B0O A;  1L29 A;  1L11 A;  2XBR A;  158L A;  2Q0M X;  3N9C A;  2JAF A;  1L70 A;  190L A;  1TN5 A;  4RW1 A;  1GFT A;  1NHB A;  4OOT A;  1JJ0 A;  1IXF A;  1QUS A;  3WH1 A;  4L6R A;  2YBM A;  1U19 A;  245L A;  5LVH A;  1KIQ C;  3W3E A;  1L56 A;  1LSA A;  3OJP A;  4DD7 A;  3P64 A;  1NWG A;  2OU8 A;  4G7Q B;  1X0I 1;  4H9F A;  4PXF A;  4NHT A;  5ITC A;  1GE1 A;  3EH5 B;  1F10 A;  1GB6 A;  4R6C A;  1GAY A;  5LA5 A;  1A4V A;  3ZEK A;  172L A;  4G71 B;  2HEA A;  1IC7 Y;  1JWR A;  3BKH A;  2G4N A;  1JTO L;  3G3A B;  4W94 A;  1DYF A;  2B7X A;  1JJ3 A;  1HFY A;  1LYZ A;  5AX0 A; 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