4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
1L17A 3NY8A 227LA 1C6NA 1L69A 1LGWA 2R4RA 3GUKA 223LA 4I7QA 240LA 2Z73A 4IAQA 3L2XA 129LA 3CDRA 2O7AA 2LCBA 148LE 2B75A 4W53A 119LA 234LA 1SWZA 229LA 1S51A 231LA 1L76A 1XJIA 253LA 1L09A 4HYXA 4S0WA 1PQMA 1L63A 2I35A 2B73A 3AM6A 102LA 1QT6A 4EKPA 4QRYA 1L91A 3QAKA 4XTLA 4EA3A 1L32A 4G7SB 244LA 1CV1A 4JQ6A 1XIOA 1CV3A 113LA 4EKRA 206LA 3HTGA 3CDTA 4LDEA 1P6YA 127LA 248LA 175LA 258LA 150LA 3HTDA 1B6IA 4L6RA 3VGAA 3DN3A 109LA 1L31A 218LA 1EHKB 3X3CA 151LA 3SB9A 249LA 1TN5A 3HU9A 3SBAA 254LA 144LA 1QTZA 3C81A 4I7MA 5B6YA 1PQKA 2OTZX 1U19A 1P2RA 1QT3A 1CV6A 256LA 3GUJA 3ODUA 1VJMA 166LA 2CUUA 1SWYA 4W58A 1C64A 3HT9A 1SX7A 1FBBA 3PXOA 4KLYA 2OU8A 1LI2A 3GULA 4BEYA 3DN2A 149LA 1L52A 1TLAA 1SSWA 1L10A 3HT8A 3HAOA 1C6HA 4MQSA 1QKPA 5ITCA 137LA 167LA 4GRVA 3SB8A 1QSBA 4FA7B 2NTWA 5JJJA 251LA 1G0KA 4ARJA 3HH6A 4PXFA 190LA 5JJNA 3RZEA 3S8GB 1QT5A 1E12A 3HARA 1KS3A 3WQJA 4HWLA 183LA 122LA 3GUMA 3AYMA 1C6CA 2B6TA 1JGJA 5DHGA 177LA 4W51A 2BRDA 3PQRA 1C61A 4G7RB 1D3FA 1SX2A 2OU9A 1PXSA 3MBVA 3QBIA 3C8RA 3FA0A 4MQTA 4XTNA 1P64A 1L96A 3DN4A 143LA 4W56A 4JKVA 2YCYA 1CTWA 4XXJA 1C6JA 1KGBA 5A44A 3FADA 2I20A 226LA 3V2YA 3C82A 3GUIA 3CODA 1QUOA 3BVDB 3EH4B 5B35A 1LI6A 4W57A 1L65A 5G36A 2RBPA 3PBLA 5I14A 161LA 1L56A 236LA 1L20A 252LA 3G3VA 3UG9A 4YXAC 138LA 103LA 1QUGA 2OE9X 3HTBA 2WJLA 4IB4A 1PXRA 142LA 155LA 3VW7A 4DKLA 5A8EA 2RBSA 3OE6A 4AMJA 1CU2A 5H2JA 1G1VA 3C7WA 5BR5A 1L44A 3PDSA 1OVHA 1H2SA 189LA 1M0LA 1F50A 1L70A 1OVKA 1XJTA 4JR8A 5A45A 199LA 140LA 162LA 1LWGA 4MD1A 141LA 2B74A 3V2WA 1S54A 1C6TA 1P2LA 1XJUA 1QHJA 4K5YA 2Y00A 3CDOA 4NC3A 3DQBA 1OV7A 3UTXA 128LA 5LZMA 5FJGA 1R84A 1DYFA 176LA 1GZMA 3S8FB 3SB5A 2KSAA 3DDLA 1LYDA 3QJRB 1CV5A 201LA 1QS9A 180LA 1QUDA 4G70B 1L38A 1QM8A 2B72A 3KJ6A 1L77A 3D4SA 1E0PA 2AT9A 147LA 1KY1A 1T6HA 1ZWNA 1OWZA 1KNIA 1L13A 1L40A 3HDEA 5H2LA 1LYHA 1XEPA 2YDOA 4FPDA 2YCWA 2RBRA 228LA 1LLHA 4MD2A 5AX0A 232LA 3VVKA 4LDLA 1M0KA 1G07A 3HDFA 1C6GA 1L80A 2Y01A 4XT3A 2NTGA 3DN6A 3QJVB 1SSYA 1K28A 237LA 1C6IA 3C8QA 3HH4A 1L85A 1L07A 1L0MA 3L64A 3QDCA 2HUMA 5EN0A 3DMZA 4XTOA 2NTHA 3HUKA 164LA 1L05A 4I7JA 1L25A 2R4SA 1C8RA 1OV5A 1L99A 1QTBA 233LA 1C6BA 3FI5A 4QIDA 1L42A 3UZAA 3NS0A 1IW9A 222LA 2NTUA 4BEZA 5C1MA 2HULA 2VT4A 3QJSB 257LA 1L0KA 2O79A 1KG9A 1T97A 5BR2A 5JJEA 2G87A 3C83A 1C6LA 3HWLA 4ARLA 1I6SA 2F32A 4PK0A 3QAPA 4AMIA 4X32A 1C6KA 5H2IA 4G7QB 4OV0A 4N4YB 1L67A 7LZMA 3DMXA 1L41A 215LA 3HH3A 1CU0A 3HT6A 246LA 3SN6R 4OO9A 2HPYA 3QBLA 1LPYA 5G2AA 5B2NA 110LA 3C9LA 2F47A 3UONA 1QS5A 1L19A 4AQNA 1DYBA 1S53A 4J4QA 156LA 173LA 4LZMA 4YX7C 262LA 1P8HA 4N6HA 3PWHA 1L87A 3NYAA 1D2YA 1L75A 3GUNA 1DYCA 3JR6A 4W54A 3F8VA 3GUOA 4UG2A 1OVJA 3UTYA 2ZIYA 1KW5A 4EPIA 2OU0X 3OE8A 4IARA 3SB6A 2OE7X 1L64A 1BRRA 2ZZLA 1BM1A 4G72B 2Z6BA 4GP5B 1PQIA 5G54A 1D9WA 160LA 1L16A 1X0K1 2I21A 3REYA 5G2DA 2OE4X 182LA 2Q9EA 2YCZA 245LA 4EXMA 5DHHA 5LWEA 1P36A 1L9HA 4GP8B 169LA 5AHZA 2B6XA 2ANXA 3QJQB 221LA 1P7SA 1KMEA 2IGCA 2EI4A 3DMVA 1C60A 146LA 255LA 184LA 1G0MA 3SBBC 3K2RA 163LA 2RBNA 2YDVA 174LA 1CU6A 1L33A 5F8UA 1DZEA 1G06A 1L58A 3S3DB 118LA 259LA 241LA 1L01A 1LWKA 4YXCA 1F4ZA 1WTHA 242LA 4PJZA 195LA 1L68A 1OYUA 1QTCA 4WW3A 4DJHA 5G28A 1EPYA 3LZMA 1CUPA 3CDVA 5G53A 1L61A 1G0PA 1L36A 2I1XA 1QT7A 114LA 4W59A 3DN0A 1L21A 4EIYA 1QTVA 1CVKA 2RH1A 3NSBA 1L71A 4EPFA 1C6EA 115LA 5B6WA 1JTMA 1CU3A 131LA 1IXFA 1P8UA 1C62A 2OTYX 1F88A 1C6QA 5ETZA 168LA 197LA 239LA 3C8SA 1L27A 2Y02A 3X3BA 1L35A 3C7YA 191LA 1PQJA 3HH5A 1T8FA 1C6FA 4N4WA 1O0AA 5H2KA 4BUOA 2X72A 1L50A 2J4YA 1IW6A 5B34A 3HU8A 3COCA 1P46A 4LDOA 4G71B 3C80A 1BRDA 2B7XA 3CDQA 2RB0X 1S8LA 3AYNA 250LA 1L22A 4W55A 4ARQA 1PQDA 1JFPA 4EKQA 4L35A 4X31A 3QJTB 205LA 4I7SA 3HUAA 2Q9DA 1MGYA 1L90A 1LYFA 192LA 4EJ4A 1L66A 4WAVA 1L06A 187LA 1PY6A 1LYGA 6LZMA 5B6ZA 1L97A 1QTHA 2QPDB 1FBKA 152LA 1G0GA 1VGOA 4XT1A 2A4TA 1S8JA 3UZCA 3UTVA 5AHYA 1P37A 1QTDA 1NHBA 200LA 2JAGA 5AX1A 261LA 4I7PA 2KSBA 2LNLA 1CV4A 3CAPA 4GPOA 3DN1A 3VG9A 1C6PA 1PQOA 1CWQA 1Q5JA 4TL3A 3C9MA 2Z55A 1GUEA 1CX7A 1L51A 4ARQB 2F95A 1P8IA 225LA 171LA 1L47A 4A4MA 212LA 217LA 2JAFA 1L59A 1LYIA 1LGUA 1BRXA 5DYSA 235LA 159LA 1JV7A 1M0MA 2QARC 1L83A 5G2CA 1JV6A 3EH5B 3ZEVA 188LA 1LYEA 3F9LA 3QJUB 4DAJA 4GBRA 2RB2X 1L00A 1L29A 211LA 2HUKA 3ABWA 2KSYA 3HASA 198LA 4I7OA 157LA 4ZPUA 1C66A 5B0WA 1AP9A 1L37A 214LA 1L89A 1L23A 107LA 247LA 1ZYTA 1L04A 1X0SA 243LA 1T8AA 2RAZX 5H2MA 145LA 3C7ZA 3ZPRA 1L02A 3P0GA 238LA 4I7LA 3OAXA 2B6ZA 2O4WA 1LN6A 3OE9A 4ARMA 1C6DA 1C6MA 1KG8A 3DKEX 1L48A 4ARPA 4KNFA 3EH3B 5KKHA 4GBRB 1HZXA 3QBGA 112LA 111LA 1L88A 1P3NA 1QT4A 209LA 1GU8A 120LA 1D2WA 3G3WA 5H2HA 3GUPA 1G0LA 4GYCA 1C63A 1D3MA 5TGZA 1L46A 2LZMA 1L98A 3S3CB 1L18A 1G1WA 1L60A 1L92A 1L45A 1L08A 1L79A 2ANVA 5H2OA 1L84A 1H68A 4HYJA 4UHRA 4IAPA 3EMLA 4QI1A 1Q5IA 1LYJA 2Y03A 1R2NA 2Y04A 1L49A 3HAQA 4ARMB 1L57A 260LA 1AT9A 1L34A 2RBOA 2KS9A 1QT8A 1CV0A 1C69A 1C68A 2WJKA 3HANA 3ZPQA 1L93A 1C6AA 1L39A 1TN0A 1L28A 5H2PA 1P56A 123LA 1D3JA 1KY0A 1L11A 219LA 4E97A 4BV0A 1DYDA 210LA 224LA 2M3GA 1G0QA 4Y9HA 3HUQA 181LA 3RFMA 3S3BB 172LA 1C3WA 126LA 1P5CA 1ZURA 1L43A 1L0JA 4FAAB 2OEAX 5B6XA 4GP4B 2F93A 4FBZA 125LA 1T8GA 1LI3A 178LA 3SB7A 1L82A 185LA 104LA 3RUNA 2RBQA 3HAPA 139LA 4EKSA 1OWYA 2YCXA 1C67A 1L86A 1XMEB 1L73A 158LA 1L53A 1DYAA 3HT7A 1C8SA 3A7KA 3NY9A 2RAYX 1S52A 1JQUA 2ZFEA 1CU5A 2L78A 186LA 1JTNA 3DNAA 4W52A 1G0JA 2PEDA 1L94A 3T45A 5B6VA 1QUHA 4I7RA 1LW9A 1L24A 2QPEB 5AZDA 4X1HA 4I7NA 220LA 1CX6A 4BWBA 4BVNA 170LA 2F2QA 108LA 196LA 4I7KA 1L12A 3G3XA 3OE0A 1D3NA 230LA 1L14A 3HTFA 213LA 4I7TA 1X0I1 1QSQA 5AWZA 2B70A 1UAZA 4PXKA 216LA 1DYGA 1QKOA 2LC9A 2QB0B 5ITEA 1L81A 2RB1X 1C65A 3UTWA 130LA 2L6XA 1L30A 5H2NA 1CUQA 1KW7A 3VI0A 3QBKA 3VHZA 3DN8A 4MBSA 1L26A 1L55A 1L72A 1L95A 5J7AA 1L54A 1LGXA 1L62A 1UCQA 1L15A 2B6YA 2B6WA 1L03A 1L74A 165LA 1DYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L17A 3NY8A 2R4RA 1LGWA 3W6FA 1LZ4A 4GCEA 1GF6A 1LHMA 4LFPA 4U3XB 1BHZA 3WPLA 1OUIA 129LA 2LCBA 4R6CA 1JEFA 1V7TA 1S51A 3A94A 1L09A 2I35A 102LA 4EA3A 1L91A 4WOAA 4G7SB 1CV1A 3TXEA 1GE3A 4EKRA 2W1LA 3T6UA 1G7LC 3HTGA 3A6CY 4PRQA 1P6YA 248LA 1LOZA 1B6IA 218LA 3F6ZA 3X3CA 3HU9A 5FCPA 3AW7A 1PQKA 1P2RA 256LA 3GUJA 166LA 1C64A 1XEKA 2OU8A 5KXMA 1L52A 5KXYA 1L10A 3WVYA 4GRVA 4C3WA 251LA 1G0KA 4PXFA 1UIBA 1BB3A 3RZEA 3ULRA 4LYCA 3HARA 1KS3A 1NQIA 1EQ5A 1C6CA 1C61A 4G7RB 1WTMA 4AXTA 4MQTA 1L96A 1V7SA 143LA 2FBDA 2BQIA 2YCYA 3FADA 4NGLA 1DI5A 3V2YA 1IWUA 2YDGA 1RCMA 3BVDB 5B35A 2HEBA 1B2KA 1EQEA 4LZTA 1HSXA 1L56A 3G3VA 1LHLA 4L41A 1B5YA 1GFKA 138LA 1BQLY 1QUGA 5I54A 1IO5A 4J7VA 1LHJA 2WJLA 3CB7A 1PXRA 4IB4A 142LA 5KXXA 5A8EA 1GE4A 3OE6A 4M6DA 1AT6A 5K7OA 5BR5A 2W1YA 3B6LA 189LA 4DWXA 5LYZA 1CKCA 3TMUA 1OVKA 1HMLA 4I8SA 4MD1A 4TSCA 3T36A 1XJUA 4H9IA 3CDOA 4G49A 3DQBA 1NKHA 4LT1A 4KL7A 1GB3A 1GBZA 1R84A 176LA 1UC0A 3W6DA 4GN5C 1QS9A 180LA 1DKJA 3P66A 5LVKA 1L38A 2B72A 4DQ7A 147LA 1GF0A 1VEDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1C69 A;  1C68 A;  2WJK A;  3HAN A;  3ZPQ A;  1L93 A;  1C6A A;  1L39 A;  1TN0 A;  1L28 A;  5H2P A;  1P56 A;  123L A;  1D3J A;  1KY0 A;  1L11 A;  219L A;  4E97 A;  4BV0 A;  1DYD A;  210L A;  224L A;  2M3G A;  1G0Q A;  4Y9H A;  3HUQ A;  181L A;  3RFM A;  3S3B B;  172L A;  1C3W A;  126L A;  1P5C A;  1ZUR A;  1L43 A;  1L0J A;  4FAA B;  2OEA X;  5B6X A;  4GP4 B;  2F93 A;  4FBZ A;  125L A;  1T8G A;  1LI3 A;  178L A;  3SB7 A;  1L82 A;  185L A;  104L A;  3RUN A;  2RBQ A;  3HAP A;  139L A;  4EKS A;  1OWY A;  2YCX A;  1C67 A;  1L86 A;  1XME B;  1L73 A;  158L A;  1L53 A;  1DYA A;  3HT7 A;  1C8S A;  3A7K A;  3NY9 A;  2RAY X;  1S52 A;  1JQU A;  2ZFE A;  1CU5 A;  2L78 A;  186L A;  1JTN A;  3DNA A;  4W52 A;  1G0J A;  2PED A;  1L94 A;  3T45 A;  5B6V A;  1QUH A;  4I7R A;  1LW9 A;  1L24 A;  2QPE B;  5AZD A;  4X1H A;  4I7N A;  220L A;  1CX6 A;  4BWB A;  4BVN A;  170L A;  2F2Q A;  108L A;  196L A;  4I7K A;  1L12 A;  3G3X A;  3OE0 A;  1D3N A;  230L A;  1L14 A;  3HTF A;  213L A;  4I7T A;  1X0I 1;  1QSQ A;  5AWZ A;  2B70 A;  1UAZ A;  4PXK A;  216L A;  1DYG A;  1QKO A;  2LC9 A;  2QB0 B;  5ITE A;  1L81 A;  2RB1 X;  1C65 A;  3UTW A;  130L A;  2L6X A;  1L30 A;  5H2N A;  1CUQ A;  1KW7 A;  3VI0 A;  3QBK A;  3VHZ A;  3DN8 A;  4MBS A;  1L26 A;  1L55 A;  1L72 A;  1L95 A;  5J7A A;  1L54 A;  1LGX A;  1L62 A;  1UCQ A;  1L15 A;  2B6Y A;  2B6W A;  1L03 A;  1L74 A;  165L A;  1DYE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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