4GRVA

The crystal structure of the neurotensin receptor nts1 in complex with neurotensin (8-13)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
461
structure length
454
Chain Sequence
NSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNSVTLFTLARKSLQSTVHYHLGSLALSDLLILLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVARYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNRSADGTHPGGLVCTPIVDTATVKVVIQVNTFMSFLFPMLVISILNTVIANKLTVMVNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLNNKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGSGSVQALRHGVLVARAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTTFLFDFYHYFYMLTNALAYASSAINPILYNLVSANFRQV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the agonist-bound neurotensin receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotensin receptor type 1, lysozyme chimera
molecule tags Signaling protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 154
structure length 454
sequence length 461
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4grvA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4grvA01
1OYUA 3QJUB 1AT9A 1L91A 3HH5A 1LWKA 4I7LA 3HU8A 215LA 1O0AA 1L88A 1PQOA 159LA 1OV7A 5G53A 3V2YA 1JGJA 1C68A 137LA 1L83A 3QAKA 1QUDA 2BRDA 1PQIA 212LA 1F50A 1QKPA 1L73A 4W57A 5H2LA 3HTFA 4W52A 4XXJA 1L38A 1G0PA 1P8UA 166LA 3HDFA 3SB7A 4L6RA 3UTYA 3DN0A 1OWZA 4YXAC 4X31A 1L10A 4LZMA 3REYA 2L78A 5AHYA 4DKLA 1QTVA 3DMZA 3HTDA 1QUGA 1L95A 4DJHA 4BEYA 1DYEA 4I7MA 1C3WA 3HAOA 2Z73A 123LA 167LA 1ZWNA 1L01A 5H2HA 5A44A 3C7WA 1QTCA 1L45A 214LA 1C6AA 1BRDA 1L84A 5B6YA 201LA 5G28A 111LA 2VT4A 4QI1A 2B6WA 1LYIA 1L03A 3HU9A 1KNIA 2KSBA 4LDEA 4BEZA 3CDVA 4IAQA 3QBIA 4W59A 211LA 2R4SA 205LA 140LA 3DKEX 151LA 1LGUA 5JJNA 2OTYX 3VHZA 162LA 3S8FB 222LA 2Y04A 1L13A 1L54A 2QARC 1L29A 1S8JA 1C61A 1BRRA 1C6HA 1PQMA 240LA 4EKQA 4FPDA 5B35A 1L63A 199LA 3KJ6A 2Q9EA 247LA 2YCXA 5LZMA 2F32A 2B7XA 2WJKA 150LA 3RFMA 1DYAA 1JTMA 2LCBA 4EA3A 5LWEA 1LI3A 160LA 2I35A 3GULA 3GUMA 1L44A 257LA 3HAPA 3S3BB 243LA 1L07A 1L52A 1L90A 115LA 3DN2A 3HUKA 1JV6A 1Q5JA 5H2MA 3ZEVA 145LA 1EPYA 1C8SA 2RBPA 1EHKB 3VVKA 2PEDA 2B6TA 113LA 128LA 1PXRA 3GUNA 4G7SB 228LA 4OO9A 3DQBA 2J4YA 1PQJA 1CV3A 1L99A 1VGOA 2YDVA 147LA 2WJLA 4HWLA 1GU8A 4IB4A 1D3FA 4W54A 118LA 5B34A 254LA 1C6DA 219LA 1UAZA 4ARMB 184LA 1L66A 1JFPA 5ETZA 1SX7A 1T8AA 163LA 1L86A 2ZZLA 1C65A 3EH5B 1C6JA 237LA 1L93A 4I7RA 3OAXA 1JQUA 1P5CA 1JTNA 1QSQA 4UG2A 4NC3A 1C64A 3QBLA 129LA 5B6WA 245LA 1OV5A 3T45A 4EKPA 3MBVA 1QTBA 259LA 3WQJA 2QPEB 1PQDA 253LA 3HT9A 1F4ZA 4I7OA 5I14A 2HUKA 3L64A 172LA 1L42A 3OE0A 1QT6A 1XMEB 1T8GA 3HARA 126LA 3P0GA 5J7AA 125LA 1L53A 5G54A 1L28A 1G1VA 3SB5A 1KS3A 155LA 1L89A 4XTOA 1L23A 1QS5A 2RB2X 4JQ6A 4OV0A 1CU5A 1SWZA 191LA 1L69A 2LNLA 3GUKA 1L06A 1T8FA 3PDSA 2KSAA 2ZIYA 5AHZA 148LE 1L9HA 2KSYA 1L12A 1L26A 1P8IA 2HUMA 5G2DA 3AM6A 2Z6BA 108LA 139LA 4LDOA 5H2KA 1L71A 1L05A 185LA 173LA 1CVKA 1L97A 1DYCA 1C69A 1QKOA 1X0SA 5AX0A 3OE9A 3V2WA 5B6XA 3GUOA 5FJGA 1P46A 4I7KA 4EIYA 1IW9A 1L40A 3UONA 1QT3A 4WW3A 1H68A 1L24A 1JV7A 4HYJA 1M0LA 3SB6A 1C6FA 1CWQA 1E12A 175LA 2F93A 5TGZA 1L51A 3HASA 1L43A 1DZEA 2F47A 1B6IA 3F9LA 2B75A 2RBSA 5G36A 3PWHA 1L49A 1DYBA 1SWYA 1CTWA 1C6QA 2B72A 1KW7A 1LW9A 1GUEA 244LA 4J4QA 3OE6A 4JKVA 1S51A 3UTVA 3PBLA 1L0KA 261LA 1OWYA 3RUNA 5H2NA 1ZYTA 3LZMA 1T6HA 4GRVA 1G0LA 248LA 3HUAA 152LA 2JAGA 3AYNA 5F8UA 3S3CB 3UG9A 206LA 2M3GA 4W53A 4BUOA 1L74A 4QRYA 4FBZA 149LA 3FI5A 3HH6A 4TL3A 2I21A 5B6VA 1L25A 249LA 4XTNA 1L82A 3DN6A 4W58A 5G2CA 4ARLA 1L32A 4IARA 1C6PA 4W51A 170LA 2Y00A 241LA 2B73A 4XT3A 1QSBA 3EH4B 218LA 1BM1A 1OVKA 262LA 3HT6A 4PXFA 1Q5IA 2Q9DA 1PY6A 1CX7A 236LA 1L72A 2OTZX 4EKSA 3PQRA 1L18A 2RAYX 1P3NA 1P64A 3RZEA 2RBNA 3AYMA 221LA 3VW7A 2I1XA 239LA 1M0KA 1L33A 5EN0A 1LYHA 2HULA 196LA 1L80A 1L67A 1WTHA 4N6HA 1C8RA 3DNAA 1CU3A 2RB1X 1KW5A 1LGWA 3CODA 5BR2A 4YXCA 192LA 1L09A 141LA 1L34A 4GBRB 5KKHA 1I6SA 2RH1A 2RBOA 4ARQB 2Y03A 119LA 2EI4A 1L17A 146LA 1QT7A 7LZMA 3QAPA 1L65A 3K2RA 1L22A 1LI6A 1ZURA 1IW6A 1CU6A 1L87A 4GPOA 1CU0A 164LA 3HTGA 1CV5A 3HT7A 3X3CA 6LZMA 258LA 1L85A 4XTLA 1G0JA 3CDRA 1R2NA 1L27A 1LI2A 1SSYA 165LA 4MQSA 2QPDB 3PXOA 1P2LA 1L75A 4ARPA 1LYGA 1L76A 195LA 2NTHA 174LA 3JR6A 157LA 200LA 1G0QA 4UHRA 1C6CA 1C6LA 4N4YB 2QB0B 102LA 1LWGA 1MGYA 4PXKA 1QTDA 1LN6A 4WAVA 3C81A 1C6TA 1L94A 1G06A 176LA 1L08A 246LA 1K28A 1L55A 5JJEA 3L2XA 4EKRA 1L47A 197LA 1D2WA 256LA 1M0MA 3SN6R 3QJVB 3UZCA 3UTWA 4BVNA 213LA 1L98A 209LA 3DN4A 4KLYA 1L70A 1QT8A 190LA 1L20A 3HTBA 4K5YA 1L39A 4ZPUA 142LA 3C9MA 216LA 2NTGA 1E0PA 1XJIA 1HZXA 1DYFA 1S52A 1C6KA 4BWBA 1L21A 1L92A 1QM8A 3VG9A 1L64A 1L36A 3C9LA 5C1MA 3C7YA 3S3DB 5ITCA 2LC9A 171LA 2CUUA 1QTZA 4PK0A 1P6YA 1U19A 127LA 223LA 2AT9A 3C8RA 1XJTA 1KG8A 4MD2A 5A45A 2Z55A 104LA 3ZPQA 1R84A 1P8HA 2G87A 4ARMA 1QTHA 2JAFA 1S54A 1CV4A 4W55A 224LA 1LPYA 4AQNA 1L00A 238LA 1LYEA 2NTUA 3EH3B 5G2AA 4L35A 3G3XA 180LA 220LA 2B74A 3GUJA 1L57A 2Y02A 1FBBA 1L58A 2F95A 2YCYA 1OVJA 1D3NA 3OE8A 1CU2A 1D3JA 2O4WA 235LA 4YX7C 5H2JA 1SSWA 4MQTA 130LA 2NTWA 2ANXA 2ZFEA 1CV6A 1X0K1 110LA 5JJJA 1C6GA 1LYFA 158LA 231LA 3QJTB 3SB8A 4I7JA 3SBAA 4EJ4A 2OU8A 3ZPRA 1G07A 120LA 1KGBA 1L68A 1G1WA 1QT5A 2OE4X 3GUIA 4Y9HA 227LA 3CDTA 230LA 114LA 189LA 1KY1A 3C8QA 2KS9A 4EPIA 4N4WA 1L41A 1L35A 1LLHA 3DN8A 2B6ZA 2L6XA 3DN3A 4AMIA 2YCZA 1CX6A 3HWLA 5B2NA 2F2QA 1C66A 1IXFA 103LA 1PXSA 3UZAA 4X32A 1LYJA 181LA 4G71B 2B6XA 1CUPA 1L11A 3NY8A 3F8VA 4G72B 4PJZA 4MD1A 1VJMA 3QBKA 5DYSA 4A4MA 4KNFA 3DMXA 2B70A 3QJQB 112LA 2RBRA 4I7PA 1SX2A 1L79A 122LA 1NHBA 225LA 1L77A 2HPYA 4GP4B 1L48A 3C80A 4GYCA 3HH4A 1CV1A 3NSBA 229LA 1DYDA 143LA 1L37A 1P37A 4DAJA 4EPFA 1GZMA 5DHHA 1QHJA 1G0GA 2YCWA 1C62A 1C63A 232LA 4G70B 4I7NA 3HH3A 4QIDA 2RB0X 3QBGA 1P36A 1DYGA 210LA 1C6NA 3UTXA 107LA 4EXMA 5H2IA 1C67A 1TN5A 1D3MA 1QS9A 1QT4A 2R4RA 4XT1A 168LA 1L14A 3G3WA 3SB9A 5H2OA 4S0WA 1H2SA 5BR5A 1L60A 2X72A 5AWZA 1L62A 3G3VA 4E97A 260LA 2IGCA 234LA 3BVDB 5H2PA 4G7QB 217LA 3DMVA 251LA 1L56A 3HANA 1FBKA 1TLAA 226LA 1D2YA 3NY9A 1P7SA 4I7SA 4I7QA 4GP5B 1C6IA 2A4TA 3X3BA 1G0MA 3ODUA 178LA 1L96A 4JR8A 3FADA 2Y01A 233LA 3VI0A 252LA 2RAZX 1BRXA 1L59A 1CV0A 2O79A 2OE9X 4MBSA 1L15A 4W56A 4GP8B 3C83A 1KG9A 5ITEA 1L19A 2OU0X 1L46A 3CDOA 3GUPA 1L02A 1KMEA 2OU9A 1L30A 4ARJA 1PQKA 188LA 1LYDA 2LZMA 242LA 1XJUA 1AP9A 4GBRA 1CUQA 4BV0A 4ARQA 1C6BA 1QUHA 2RBQA 2YDOA 1C6MA 2I20A 3VGAA 3C7ZA 3HT8A 5B0WA 1L61A 1L81A 3FA0A 4FA7B 3NYAA 4HYXA 5DHGA 144LA 3QJSB 3DN1A 5B6ZA 138LA 3ABWA 2O7AA 1QUOA 1XEPA 1L50A 1L0MA 4AMJA 109LA 2B6YA 1L0JA 4IAPA 3COCA 3NS0A 1L04A 3HDEA 1KY0A 198LA 1C6EA 1S53A 3QDCA 177LA 1G0KA 3SBBC 2ANVA 5AX1A 182LA 3HUQA 5AZDA 156LA 3HAQA 169LA 2OEAX 3D4SA 3CDQA 3DDLA 1XIOA 1LGXA 183LA 3A7KA 4LDLA 3CAPA 4FAAB 1X0I1 187LA 3S8GB 3EMLA 4I7TA 186LA 1TN0A 5A8EA 1D9WA 131LA 1P56A 1T97A 3C82A 1F88A 1L31A 250LA 3QJRB 1OVHA 1L16A 161LA 3C8SA 4G7RB 1S8LA 1P2RA 1C60A 1UCQA 255LA 4X1HA 2OE7X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A95A 1OYUA 3QJUB 1WTNA 5A3ZA 1YANA 1TBYA 1JGJA 5APCA 1LZDA 5DM9A 5C6JA 4NGZA 3AW6A 4CGEA 166LA 1P8UA 4L6RA 1KIQC 5II3A 1E8LA 5AMYA 4LZMA 1IP3A 5AHYA 1DYEA 3HAOA 2Z73A 154LA 1ZWNA 1YAOA 5A44A 3WPKA 1C6AA 4WLXA 1LSCA 1REMA 2VT4A 4QI1A 1LYIA 4B4EA 4LDEA 4BEZA 3QBIA 5LIOA 205LA 3RU5A 3VHZA 222LA 2QARC 4BAPA 3A67Y 240LA 199LA 4HPEA 2YCXA 3W3EA 1ZMYL 5FHWA 5E9RA 3RT5X 1HSWA 4ZFPA 3RFMA 4DDBA 5J7CA 4EA3A 257LA 3DN2A 1JV6A 4H8YA 4N1CC 4Z41A 3B6LA 1LYSA 3J4GA 4G7SB 4OO9A 4E3UA 2BQIA 2J4YA 1BVXA 2YDVA 1GE0A 5I54A 3ATOA 1LYZA 2WJLA 1GU8A 2H9JA 4DT3A 2BQOA 4LYMA 5B34A 1XEKA 1CJ8A 4RW1A 184LA 4J0LA 1YAQA 2ZZLA 1AT5A 4ETCA 237LA 1L93A 2XJWA 1JQUA 1MLCE 1OV5A 2Z12A 1LJFA 3T45A 4EKPA 259LA 1JEFA 1PQDA 3HT9A 1F4ZA 4J1AA 1O23A 5J7AA 5LVGA 1KS3A 1L89A 1NQIA 2FBBA 4XTOA 1GFRA 4H92A 4H9FA 4OV0A 1CU5A 1SWZA 3ZEKA 1JKAA 2ZIYA 5AHZA 1L26A 2YDGA 3OJPA 1L71A 1CVKA 1L97A 1IOCA 1DYCA 1HEWA 5B6XA 3TMVA 1QT3A 1OUCA 4P2EA 1YILA 1JV7A 4HYJA 5TGZA 2F93A 1IP1A 1L43A 1B6IA 3F9LA 4DWXA 4B1AA 1SWYA 2B72A 1KW7A 2G4NA 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 251L A;  1L56 A;  3HAN A;  1FBK A;  1TLA A;  226L A;  1D2Y A;  3NY9 A;  1P7S A;  4I7S A;  4I7Q A;  4GP5 B;  1C6I A;  2A4T A;  3X3B A;  1G0M A;  3ODU A;  178L A;  1L96 A;  4JR8 A;  3FAD A;  2Y01 A;  233L A;  3VI0 A;  252L A;  2RAZ X;  1BRX A;  1L59 A;  1CV0 A;  2O79 A;  2OE9 X;  4MBS A;  1L15 A;  4W56 A;  4GP8 B;  3C83 A;  1KG9 A;  5ITE A;  1L19 A;  2OU0 X;  1L46 A;  3CDO A;  3GUP A;  1L02 A;  1KME A;  2OU9 A;  1L30 A;  4ARJ A;  1PQK A;  188L A;  1LYD A;  2LZM A;  242L A;  1XJU A;  1AP9 A;  4GBR A;  1CUQ A;  4BV0 A;  4ARQ A;  1C6B A;  1QUH A;  2RBQ A;  2YDO A;  1C6M A;  2I20 A;  3VGA A;  3C7Z A;  3HT8 A;  5B0W A;  1L61 A;  1L81 A;  3FA0 A;  4FA7 B;  3NYA A;  4HYX A;  5DHG A;  144L A;  3QJS B;  3DN1 A;  5B6Z A;  138L A;  3ABW A;  2O7A A;  1QUO A;  1XEP A;  1L50 A;  1L0M A;  4AMJ A;  109L A;  2B6Y A;  1L0J A;  4IAP A;  3COC A;  3NS0 A;  1L04 A;  3HDE A;  1KY0 A;  198L A;  1C6E A;  1S53 A;  3QDC A;  177L A;  1G0K A;  3SBB C;  2ANV A;  5AX1 A;  182L A;  3HUQ A;  5AZD A;  156L A;  3HAQ A;  169L A;  2OEA X;  3D4S A;  3CDQ A;  3DDL A;  1XIO A;  1LGX A;  183L A;  3A7K A;  4LDL A;  3CAP A;  4FAA B;  1X0I 1;  187L A;  3S8G B;  3EML A;  4I7T A;  186L A;  1TN0 A;  5A8E A;  1D9W A;  131L A;  1P56 A;  1T97 A;  3C82 A;  1F88 A;  1L31 A;  250L A;  3QJR B;  1OVH A;  1L16 A;  161L A;  3C8S A;  4G7R B;  1S8L A;  1P2R A;  1C60 A;  1UCQ A;  255L A;  4X1H A;  2OE7 X; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4EKP A;  259L A;  1JEF A;  1PQD A;  3HT9 A;  1F4Z A;  4J1A A;  1O23 A;  5J7A A;  5LVG A;  1KS3 A;  1L89 A;  1NQI A;  2FBB A;  4XTO A;  1GFR A;  4H92 A;  4H9F A;  4OV0 A;  1CU5 A;  1SWZ A;  3ZEK A;  1JKA A;  2ZIY A;  5AHZ A;  1L26 A;  2YDG A;  3OJP A;  1L71 A;  1CVK A;  1L97 A;  1IOC A;  1DYC A;  1HEW A;  5B6X A;  3TMV A;  1QT3 A;  1OUC A;  4P2E A;  1YIL A;  1JV7 A;  4HYJ A;  5TGZ A;  2F93 A;  1IP1 A;  1L43 A;  1B6I A;  3F9L A;  4DWX A;  4B1A A;  1SWY A;  2B72 A;  1KW7 A;  2G4N A;  3D9A C;  1GUE A;  3OE6 A;  1S51 A;  1GD6 A;  2A7D A;  3PBL A;  1L0K A;  2W1X A;  1GFU A;  1LMN A;  4YM8 A;  3OK0 A;  4GRV A;  1G0L A;  3CT0 A;  5F8U A;  3UG9 A;  5B6V A;  149L A;  1DPX A;  3HH6 A;  3K3T A;  1L25 A;  3FI7 A;  1JKB A;  2YBL A;  5HNC A;  4ARL A;  1L32 A;  4IAR A;  2YVB A;  4OWH A;  2B73 A;  1QSB A;  3LHM A;  2H5Z A;  1VAT A;  2Q9D A;  1LJH A;  1GF4 A;  3W6D A;  2BQK A;  3PQR A;  3AGG G;  1P3N A;  3HFM Y;  1KXW A;  1T6V L;  2BQB A;  1LJI A;  1M0K A;  5EN0 A;  196L A;  1D0L A;  1L80 A;  4H94 A;  3CSQ A; 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