4GRVA

The crystal structure of the neurotensin receptor nts1 in complex with neurotensin (8-13)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
461
structure length
454
Chain Sequence
NSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNSVTLFTLARKSLQSTVHYHLGSLALSDLLILLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVARYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNRSADGTHPGGLVCTPIVDTATVKVVIQVNTFMSFLFPMLVISILNTVIANKLTVMVNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLNNKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGSGSVQALRHGVLVARAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTTFLFDFYHYFYMLTNALAYASSAINPILYNLVSANFRQV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the agonist-bound neurotensin receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotensin receptor type 1, lysozyme chimera
molecule tags Signaling protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 154
structure length 454
sequence length 461
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4grvA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4grvA01
3HT8A 3HDEA 1L77A 4OO9A 4PXKA 1L50A 109LA 1D2WA 1P56A 2OTYX 1L37A 241LA 1OWZA 5H2OA 3CAPA 104LA 1C61A 5A8EA 213LA 1L00A 1L74A 2AT9A 245LA 1DYFA 3V2WA 2NTUA 1LLHA 1L59A 1U19A 261LA 1D3NA 1L11A 3F9LA 1L98A 248LA 238LA 1X0K1 127LA 3GUNA 4W51A 4X1HA 1BRRA 221LA 3PQRA 3REYA 5A44A 1P64A 3PDSA 1C6HA 1CTWA 2BRDA 1L14A 1C69A 4I7KA 1PXSA 3C83A 2QPEB 2YCXA 3C9MA 5TGZA 4S0WA 4AQNA 3GULA 3SB6A 1L61A 1CV0A 3VGAA 1SSYA 1L94A 1TLAA 102LA 4EKRA 1C6NA 1L82A 1KW5A 4MD2A 122LA 5G53A 165LA 2F95A 2Q9DA 1L05A 3CDQA 2QARC 262LA 4GBRA 2RAZX 246LA 214LA 1L86A 1C6IA 4FPDA 1VGOA 1QS5A 151LA 1L58A 4ARPA 2PEDA 3SB5A 1L04A 2B6ZA 1X0SA 260LA 1KGBA 1C62A 4EJ4A 1UAZA 1P46A 5FJGA 2Q9EA 3D4SA 3S3DB 1G0PA 3FI5A 2RAYX 3NYAA 3VVKA 3MBVA 1E12A 3CDRA 1E0PA 1S54A 3HUAA 1C8SA 215LA 1L34A 1QTVA 175LA 4MQTA 1L09A 1LI6A 3QJQB 5B6XA 1SX2A 4W55A 1DZEA 4DKLA 1PQDA 3EMLA 3HT9A 5C1MA 3FA0A 7LZMA 167LA 1L99A 3DNAA 4FAAB 3G3VA 5BR2A 4HWLA 4WAVA 173LA 1G07A 220LA 2B70A 1C63A 247LA 2B6TA 1L63A 3HUKA 1M0LA 3T45A 1DYEA 1LYJA 3HUQA 2LC9A 1L52A 1X0I1 2R4SA 1G0LA 2I21A 5H2KA 1KY1A 4NC3A 1QT7A 3GUMA 3PBLA 1P6YA 3COCA 110LA 1T8FA 1L26A 142LA 1LGXA 1JGJA 1L36A 1CVKA 3C8RA 4ARMB 1GUEA 1CUQA 4XTNA 3HWLA 3HU8A 160LA 1L0JA 4GYCA 1DYCA 1JFPA 4TL3A 2X72A 1L08A 252LA 187LA 186LA 174LA 1L21A 5G2CA 235LA 4GP5B 112LA 2LNLA 1P3NA 1DYBA 5H2MA 3C81A 1QUOA 3AM6A 3UTXA 145LA 1T8GA 1OWYA 2RBQA 240LA 228LA 1JTMA 3ABWA 4JR8A 1C6PA 190LA 159LA 1G0MA 3HAQA 108LA 1L89A 2F93A 1C67A 5I14A 1L69A 210LA 1LYIA 1QKPA 1I6SA 166LA 3L2XA 4IAPA 3QBGA 1L62A 1L68A 1KY0A 1JV6A 3NS0A 1CV3A 1DYDA 3DN1A 4KNFA 4XTLA 3NY8A 1L80A 256LA 2ZZLA 1D2YA 3SB7A 141LA 226LA 1SWZA 4LDLA 2I20A 5AHZA 5F8UA 4ARMA 5B34A 2QPDB 3CDVA 4I7JA 1C60A 3V2YA 5KKHA 171LA 2HPYA 1L27A 115LA 2YCWA 1S8JA 1C3WA 5J7AA 125LA 1QT6A 184LA 2RB1X 3F8VA 2HUMA 3C8QA 1PQIA 4I7OA 4I7PA 1C6LA 2Z6BA 4PXFA 1L15A 5EN0A 3A7KA 4HYXA 2IGCA 1L30A 1C6CA 114LA 1PQKA 1QTBA 4PJZA 158LA 3EH5B 4G70B 1QS9A 3OE6A 5AZDA 3ZEVA 3QJTB 1L44A 2WJLA 1L31A 1P2RA 1L13A 1L42A 3VW7A 177LA 1KG8A 3AYMA 5B6WA 1C6JA 4LZMA 3DN3A 1L01A 2O7AA 1QT3A 1L32A 4DJHA 163LA 1QTDA 1L29A 1C8RA 1Q5IA 5G2DA 3DN6A 1L73A 1OVKA 1CU5A 1L48A 5JJEA 4K5YA 2KS9A 1CV6A 4ARQA 5H2NA 139LA 3DMVA 1EPYA 1L40A 1XJIA 126LA 232LA 3NSBA 1QTHA 4EKQA 1L24A 1L45A 1XEPA 5G28A 1JV7A 1L06A 1L35A 3DN4A 1ZWNA 206LA 1LI3A 1G0JA 146LA 4W52A 231LA 128LA 1C6GA 1L19A 2YDOA 182LA 1D3JA 3VI0A 3WQJA 254LA 1O0AA 1QTCA 1L12A 216LA 3S8FB 1L49A 189LA 3PWHA 3EH3B 3PXOA 3QJVB 1L47A 1L84A 4G72B 1BRDA 4W54A 1QUDA 5G2AA 3OE8A 3HTFA 243LA 3HT7A 4W53A 249LA 3L64A 181LA 1VJMA 4WW3A 1L53A 178LA 2I1XA 5DHGA 5AX0A 2O4WA 1XMEB 3HASA 4IAQA 5ITCA 5AWZA 1L93A 4PK0A 3ZPRA 3UZCA 1CU3A 2RBPA 1L03A 4XTOA 4MBSA 3HTDA 1F50A 172LA 3GUPA 5ETZA 3VG9A 1LWKA 130LA 123LA 1L43A 1L56A 237LA 1SWYA 3CDTA 2Y02A 1LN6A 1L38A 1L17A 1PQMA 223LA 1C6QA 5H2JA 1SSWA 233LA 3DN0A 3OAXA 5ITEA 2Y00A 251LA 1ZYTA 1CU2A 4XXJA 4Y9HA 3S8GB 3C80A 1KG9A 3S3BB 4FA7B 4GPOA 1C6MA 1M0KA 4KLYA 5DYSA 3QJUB 1F88A 4UG2A 1XJTA 2OTZX 4AMIA 4LDEA 2RB2X 1WTHA 4XT1A 155LA 1L16A 3UZAA 1CV1A 3G3XA 4I7RA 2G87A 3C7WA 2Y04A 4X31A 1QT4A 4EKPA 3X3BA 2B6YA 140LA 1L67A 1OV5A 3ODUA 198LA 3S3CB 5BR5A 1CV5A 3HH6A 1C6EA 2F47A 2O79A 1NHBA 1S8LA 1P37A 5AX1A 239LA 3QDCA 1ZURA 3SB8A 3JR6A 1L18A 230LA 1L02A 1QM8A 1CWQA 3RZEA 3UG9A 1P36A 1F4ZA 5H2IA 1S52A 4YXAC 131LA 3KJ6A 1G1WA 1T8AA 2RBOA 3QJSB 3AYNA 2KSYA 229LA 3HU9A 180LA 1L81A 1L28A 2M3GA 1LGUA 3RFMA 1QKOA 4G71B 1TN0A 4IARA 3SN6R 1LGWA 1CX6A 1LI2A 3GUOA 4YXCA 1P8IA 2YDVA 1C64A 201LA 4EPIA 1FBBA 2F2QA 3HTGA 1L0MA 162LA 169LA 4JKVA 1L22A 2YCYA 1L87A 2OU0X 1R2NA 1LW9A 4ZPUA 3QAPA 4A4MA 1LYEA 4L6RA 1L91A 2RH1A 1QT5A 1L66A 3K2RA 143LA 250LA 1L25A 1OYUA 1G0QA 4YX7C 4QIDA 3UONA 156LA 4MD1A 1L88A 3HH3A 1H68A 3UTWA 1L83A 4W56A 1QSQA 2L78A 1QHJA 1L97A 1L92A 1HZXA 236LA 3SBBC 2Y01A 2RBNA 1EHKB 5JJJA 3HH4A 3SBAA 2B73A 205LA 4GBRB 119LA 1K28A 2B6WA 1IW9A 1DYAA 1P5CA 2JAGA 222LA 199LA 1C68A 1L96A 211LA 2OE7X 4E97A 5DHHA 176LA 195LA 1D3MA 1L0KA 1C6FA 4MQSA 192LA 1MGYA 258LA 1L23A 138LA 1R84A 5JJNA 2I35A 1L70A 1L41A 2A4TA 3HDFA 4LDOA 1CX7A 3RUNA 4EKSA 170LA 103LA 1JQUA 2KSBA 1KNIA 3HTBA 1KMEA 4GP4B 1OVHA 2Y03A 5G36A 2RB0X 3GUIA 4EXMA 2ZFEA 4QI1A 5B0WA 1L57A 1PQJA 4GRVA 257LA 1SX7A 137LA 3OE9A 2ZIYA 3DMXA 3SB9A 2OE9X 6LZMA 4BV0A 4I7NA 3QJRB 2F32A 3C7ZA 1CV4A 3CODA 5G54A 1PQOA 2NTGA 3HAOA 3VHZA 1L71A 1C6DA 3DMZA 2R4RA 1L95A 227LA 2NTWA 5B6YA 1L20A 4X32A 1C6BA 1OVJA 1T6HA 1C6KA 1JTNA 1PXRA 2Z55A 4N6HA 111LA 2B72A 5B2NA 1L64A 234LA 1L9HA 3BVDB 3DDLA 1QTZA 4BUOA 2B74A 1BM1A 2L6XA 1L72A 1Q5JA 2JAFA 4G7SB 4J4QA 3UTYA 4BEZA 3DQBA 3HAPA 2OU8A 225LA 4N4YB 1L75A 3P0GA 4W58A 1L46A 1XJUA 1H2SA 4I7SA 4I7QA 218LA 191LA 4I7LA 2QB0B 253LA 4AMJA 2OEAX 1LYFA 1GU8A 3QBIA 5B6ZA 1L55A 4G7QB 1CUPA 1P2LA 188LA 3C82A 1L07A 168LA 1KS3A 1L85A 3CDOA 3FADA 3GUKA 1TN5A 2YCZA 4G7RB 1B6IA 5A45A 5H2LA 144LA 107LA 1C6AA 4BEYA 1QUHA 3LZMA 4FBZA 4IB4A 259LA 217LA 2B7XA 1IW6A 1L54A 5H2HA 4DAJA 4HYJA 242LA 3X3CA 255LA 4GP8B 2RBSA 4I7MA 1LYGA 185LA 1PY6A 3DKEX 5H2PA 4EA3A 3EH4B 129LA 244LA 1DYGA 2NTHA 1C66A 1KW7A 219LA 2LCBA 118LA 161LA 2B6XA 4QRYA 1OV7A 5B6VA 3C7YA 2OE4X 1P8UA 224LA 2LZMA 4ARJA 5LZMA 1UCQA 1D9WA 2WJKA 1T97A 4JQ6A 1G1VA 4ARLA 150LA 3QAKA 2KSAA 148LE 1D3FA 1C6TA 1QSBA 5LWEA 4I7TA 1L51A 1P7SA 3OE0A 4OV0A 3C9LA 152LA 1C65A 1XIOA 3QBKA 1G0KA 2HULA 1CU0A 4BVNA 1L39A 1P8HA 196LA 3C8SA 1L33A 3NY9A 212LA 4EIYA 1LPYA 1S51A 3HANA 1LWGA 5B35A 2RBRA 4W57A 1L90A 3HT6A 1QT8A 4N4WA 149LA 120LA 3UTVA 2B75A 1G0GA 157LA 1BRXA 1AT9A 3DN8A 113LA 209LA 183LA 3GUJA 1QUGA 147LA 3HH5A 197LA 2ANVA 2VT4A 4ARQB 1L65A 1M0MA 2CUUA 1FBKA 4UHRA 2J4YA 2EI4A 1CU6A 1AP9A 1L79A 4W59A 1S53A 3DN2A 3QBLA 4BWBA 200LA 4XT3A 1L76A 2HUKA 3HARA 3ZPQA 1L10A 1LYDA 1LYHA 3G3WA 1IXFA 2OU9A 5AHYA 2Z73A 1GZMA 1G06A 1L60A 164LA 2ANXA 4L35A 4EPFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HTNA 3TXGA 1L77A 2ZYPA 5LAGA 2OTYX 1L37A 3CAPA 1IP3A 5I53A 1IC4Y 1L74A 245LA 3LHMA 1U19A 132LA 153LA 248LA 4ETDA 1BGIA 3HBEX 1C6HA 4NEBA 1YKZX 3WULA 1LYYA 4I7KA 1C69A 5TGZA 4H9CA 1CKHA 4S0WA 1JKBA 5KXKA 102LA 1B7MA 4EKRA 1C6NA 1L82A 122LA 2F95A 2CJLA 4XJIA 3CDQA 2QARC 5LVKA 4GBRA 2RAZX 246LA 214LA 1L86A 4FPDA 5LVHA 1QS5A 1F10A 1L58A 4ARPA 4H8YA 1WTNA 1C62A 4EJ4A 3P65A 1G0PA 1NF5A 3VVKA 1E12A 1DI5A 3HUAA 3W3EA 1IP1A 1XEJA 1GFAA 3QNGA 2WARA 175LA 1LI6A 4H9EA 4W55A 4R0FA 3EMLA 4WM4A 5C1MA 2D4IA 3DNAA 4FAAB 2LYMA 4CFPA 1G07A 2B70A 1M0LA 2B6TA 1L63A 3HUKA 3T45A 4M4OA 4GLVA 1LYJA 1LMNA 3HUQA 1L52A 5DLAA 4RDSA 1QT7A 2BQBA 2BQDA 5LVGA 1GE0A 142LA 1CJ8A 1OUBA 4NSGA 3C8RA 4ARMB 3WYHA 4NSJA 3A34A 3AJNA 1NBYC 2BQLA 3HWLA 3HU8A 1L0JA 4TL3A 1GE2A 1J1OY 187LA 1L21A 5G2CA 235LA 4GP5B 5KKJA 5B59A 4B4IA 1NWGA 3WUAA 1B5XA 1T8GA 3B6LA 4JR8A 5C6JA 1IOCA 1LOZA 4LFPA 3HAQA 1L89A 2F93A 1C67A 4YOPA 5I14A 2AUBA 1LCNA 1LYIA 1QKPA 2D6BA 1KY0A 3DN1A 2MECA 1L80A 1LSYA 5FCPA 2I20A 1LZRA 7LYZA 1L27A 2LYZA 1GF0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1C6A A;  4BEY A;  1QUH A;  3LZM A;  4FBZ A;  4IB4 A;  259L A;  217L A;  2B7X A;  1IW6 A;  1L54 A;  5H2H A;  4DAJ A;  4HYJ A;  242L A;  3X3C A;  255L A;  4GP8 B;  2RBS A;  4I7M A;  1LYG A;  185L A;  1PY6 A;  3DKE X;  5H2P A;  4EA3 A;  3EH4 B;  129L A;  244L A;  1DYG A;  2NTH A;  1C66 A;  1KW7 A;  219L A;  2LCB A;  118L A;  161L A;  2B6X A;  4QRY A;  1OV7 A;  5B6V A;  3C7Y A;  2OE4 X;  1P8U A;  224L A;  2LZM A;  4ARJ A;  5LZM A;  1UCQ A;  1D9W A;  2WJK A;  1T97 A;  4JQ6 A;  1G1V A;  4ARL A;  150L A;  3QAK A;  2KSA A;  148L E;  1D3F A;  1C6T A;  1QSB A;  5LWE A;  4I7T A;  1L51 A;  1P7S A;  3OE0 A;  4OV0 A;  3C9L A;  152L A;  1C65 A;  1XIO A;  3QBK A;  1G0K A;  2HUL A;  1CU0 A;  4BVN A;  1L39 A;  1P8H A;  196L A;  3C8S A;  1L33 A;  3NY9 A;  212L A;  4EIY A;  1LPY A;  1S51 A;  3HAN A;  1LWG A;  5B35 A;  2RBR A;  4W57 A;  1L90 A;  3HT6 A;  1QT8 A;  4N4W A;  149L A;  120L A;  3UTV A;  2B75 A;  1G0G A;  157L A;  1BRX A;  1AT9 A;  3DN8 A;  113L A;  209L A;  183L A;  3GUJ A;  1QUG A;  147L A;  3HH5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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