4K5YA

Crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 1 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
411
structure length
407
Chain Sequence
HYHVAAIINYLGHCISLVALLVAFVLFLRARSIRCLRNIIHANLIAAFILRNATWFVVQLTMSPEVHQSNVGWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLSVAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVIATFRTGTWDAYDRLRAWMFICIGWGVPFPIIVAWAIGKLYYDNEKCWAGKRPGVYTDYIYQGPMALVLLINFIFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQARKAVKATLVLLPLLGITYMLAFVNEVSRVVFIYFNAFLESFQGFFVSVFACFLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Corticotropin-releasing factor receptor 1, T4-Lysozyme chime
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
total genus 148
structure length 407
sequence length 411
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4k5yA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4k5yA01
1CTWA 4LDLA 4ARPA 2Z73A 3SB5A 108LA 210LA 3X3BA 1LYJA 1S52A 4GRVA 238LA 4UG2A 1F4ZA 3HTGA 206LA 2F2QA 1BRXA 4I7QA 1L55A 2OE9X 1DYBA 2B72A 1GZMA 3AM6A 5H2LA 3DNAA 1LYHA 1OVHA 1U19A 1L68A 3AYMA 4W57A 237LA 1L11A 3RZEA 3GUNA 4GPOA 3C82A 2B6TA 1LI6A 2R4RA 2RAYX 1L09A 1PQIA 5JJNA 3FADA 5G2CA 3X3CA 251LA 1DYCA 1LWGA 3QBIA 5G2DA 1KS3A 1L39A 1CVKA 1L08A 3HANA 4IAPA 2X72A 4XXJA 2LZMA 152LA 5J7AA 5BR5A 1XJIA 5JJJA 3GUPA 1P6YA 1S54A 1E0PA 5G2AA 4EPIA 2WJKA 4BEZA 2QPDB 3VHZA 1D3JA 1G1WA 1PQDA 1SX7A 5ITCA 175LA 254LA 4W54A 3CAPA 245LA 1P36A 4PK0A 5H2OA 1QUHA 3DN8A 5LZMA 3AYNA 3C80A 1C6KA 1OWZA 3QJSB 161LA 1CX6A 1LW9A 2NTUA 1L66A 4EPFA 5AX1A 3QBKA 5G53A 3NSBA 1CV4A 2A4TA 3PQRA 1PQKA 4EKRA 4J4QA 192LA 1SSYA 1L30A 3CDOA 2RB0X 2YCXA 141LA 3EH4B 3QAPA 3VVKA 1M0KA 3SBBC 1X0I1 1QTBA 215LA 2BRDA 1L91A 1C61A 5AZDA 2O7AA 1CU0A 1C6QA 1C6HA 1L85A 4ARMA 259LA 4I7JA 205LA 3COCA 2YCYA 1QTZA 1LN6A 4PXKA 1L44A 1IW6A 4I7PA 1PQJA 1S8JA 3C9MA 109LA 2F93A 127LA 5B2NA 1KY0A 1CV0A 1DYGA 1L82A 5BR2A 1KW7A 3GULA 1C64A 2EI4A 1L98A 1L26A 2YCWA 1LYGA 2M3GA 1XMEB 3UG9A 4N4YB 2RBPA 1XJUA 4EKSA 1L48A 249LA 5AHZA 4IARA 172LA 1QS5A 167LA 3C8RA 2Q9DA 3V2YA 4WAVA 189LA 221LA 1AT9A 5A45A 1LYFA 190LA 3HTDA 3VGAA 4AQNA 3C7WA 242LA 4MQSA 4E97A 1P8UA 4GYCA 1L56A 1L60A 185LA 1IXFA 1L18A 3NY8A 1KG9A 1TN0A 1CV5A 1QM8A 1C67A 4HYJA 234LA 2Z6BA 1L51A 5C1MA 1DYDA 3HH4A 1D3MA 1I6SA 2OU9A 3DN2A 2OTYX 1CX7A 2B6XA 1L80A 2B70A 1P56A 262LA 1O0AA 219LA 197LA 104LA 3UTWA 1QKOA 130LA 3UTYA 5ETZA 1L50A 1TLAA 191LA 1C6FA 3HH5A 1L62A 4KLYA 5EN0A 1KMEA 4DAJA 2HPYA 148LE 244LA 1L28A 3QDCA 1L29A 1QSQA 243LA 3CDQA 3EMLA 1P8HA 145LA 1E12A 2KSBA 143LA 3UZAA 3DQBA 1CU3A 2HULA 150LA 2B74A 1L23A 1L32A 4EKQA 112LA 4QI1A 1L00A 4QRYA 4L35A 1L81A 1L77A 2KS9A 2Y02A 2KSYA 1L57A 1QSBA 227LA 1JFPA 1QS9A 2F32A 1L22A 2OTZX 1JGJA 159LA 3C7ZA 1L27A 255LA 1L52A 4ARQA 138LA 3OE9A 151LA 1EHKB 120LA 1L46A 230LA 3L2XA 113LA 1LYDA 1DZEA 3GUOA 1L75A 2G87A 1CU6A 4MD1A 1L49A 140LA 1L97A 233LA 1LYEA 1L89A 4I7SA 1OWYA 3C8QA 3V2WA 3FI5A 5H2KA 3CDTA 1L19A 1P5CA 5DYSA 2F95A 2Y04A 3SB9A 5B6WA 3DKEX 1L33A 1PY6A 144LA 1C6LA 1L34A 4XT3A 2OU8A 4DJHA 1M0MA 2ZFEA 2RBNA 1L9HA 4I7OA 2J4YA 3QJTB 5H2MA 3VI0A 3NY9A 223LA 1L72A 1X0SA 224LA 1S8LA 158LA 1C6EA 1L42A 246LA 3DN1A 1D3NA 1LI2A 2ZIYA 1L47A 170LA 5F8UA 3HUAA 235LA 1OV5A 2Y03A 2Y01A 122LA 1L35A 261LA 1L07A 173LA 1L64A 1ZURA 1TN5A 1L05A 2YDVA 2YDOA 1C6TA 3OAXA 4ARMB 1L04A 1R2NA 1PXRA 2L6XA 1P7SA 3OE0A 3SN6R 3HU8A 178LA 4N4WA 1L99A 1H68A 3HAOA 260LA 2RH1A 160LA 1S53A 1LGUA 4YXAC 1Q5IA 1QT6A 3PXOA 5KKHA 5B6YA 2JAFA 4XTOA 1CU2A 198LA 1L93A 239LA 5B6XA 1L17A 1L87A 258LA 3JR6A 3HASA 4MD2A 3HWLA 1L45A 4L6RA 3F8VA 4G70B 1C63A 4LZMA 1ZYTA 2I21A 1T8AA 1L61A 1L92A 1CV3A 4BVNA 3G3VA 1L83A 188LA 2OU0X 3S3DB 3ODUA 3QAKA 3DMVA 131LA 2AT9A 3HT8A 2Y00A 1G1VA 107LA 2B6YA 4W55A 1HZXA 1LWKA 3A7KA 1K28A 2OEAX 3UTXA 4GP8B 137LA 114LA 2LCBA 3SB8A 1LGWA 3HAQA 3ZPRA 4YX7C 183LA 1G07A 1QUOA 2B7XA 177LA 1X0K1 4G72B 5G36A 1AP9A 3K2RA 1C66A 5H2HA 3G3XA 1G06A 4MQTA 4HWLA 3PWHA 1CU5A 1QT3A 1KW5A 1L96A 1L43A 2RBOA 3HAPA 1CV1A 4GP5B 5H2JA 231LA 1C6IA 1C60A 3EH5B 5H2PA 1P37A 3F9LA 5DHGA 3C7YA 1OVKA 1QUDA 3DDLA 3PBLA 3P0GA 165LA 155LA 3QJUB 3S8GB 1G0GA 119LA 1QT7A 181LA 3S8FB 5G28A 3RFMA 228LA 5TGZA 2R4SA 256LA 4NC3A 4Y9HA 3D4SA 4WW3A 4ARQB 214LA 1G0LA 196LA 2I20A 1G0PA 1QUGA 180LA 1JQUA 232LA 220LA 4I7TA 4I7LA 2VT4A 4XT1A 2QB0B 1CUPA 1CUQA 1T97A 2WJLA 1BM1A 4BV0A 1C6JA 1KGBA 1L94A 4ARJA 1T6HA 5AHYA 1L31A 2ANXA 3CDVA 5B34A 1SWZA 4W51A 5B35A 1L53A 1R84A 1L37A 1UCQA 5JJEA 1C62A 1C6MA 2QPEB 4UHRA 3HTFA 3HUQA 213LA 5H2IA 3C81A 2RB1X 3L64A 247LA 2B6ZA 3C9LA 2CUUA 4AMIA 3DN3A 5I14A 5DHHA 171LA 5A8EA 1FBBA 3WQJA 3HT9A 1C6BA 1L20A 3ABWA 3ZEVA 3VW7A 1JTMA 1G0KA 1JV6A 2QARC 2O4WA 1L36A 1QHJA 4G7SB 3EH3B 142LA 1DYFA 4W53A 1C6AA 1Q5JA 1ZWNA 1L84A 4KNFA 1L69A 1L79A 1XJTA 4IAQA 1L12A 1QTVA 1GUEA 211LA 4G7QB 1L70A 110LA 2OE4X 1NHBA 3MBVA 2NTGA 4OO9A 1LLHA 1D9WA 1QT4A 3C8SA 1L41A 2YCZA 3LZMA 5ITEA 1C6NA 1OVJA 5B6ZA 4JR8A 1L58A 3C83A 1C65A 195LA 6LZMA 2HUKA 1QTDA 3QJRB 3FA0A 2L78A 2B73A 4GBRA 1LYIA 3G3WA 176LA 1LGXA 2O79A 3HARA 248LA 1C8SA 3REYA 1MGYA 156LA 3HH3A 111LA 2RBQA 1D2WA 1L54A 3QJVB 149LA 174LA 1C6GA 1BRRA 1P8IA 1C8RA 5G54A 3GUJA 103LA 218LA 4EXMA 5LWEA 3OE6A 3DMZA 1C68A 1L59A 4EJ4A 1VJMA 4X31A 1UAZA 257LA 1SSWA 1OYUA 4FA7B 1C6PA 1F50A 2B75A 1KNIA 4FBZA 1L10A 3SB6A 4G71B 4DKLA 4QIDA 187LA 3NYAA 222LA 2JAGA 129LA 1P3NA 241LA 2I1XA 250LA 1L65A 4A4MA 1T8GA 3HUKA 4W52A 1H2SA 4HYXA 4TL3A 4AMJA 3DN6A 4JQ6A 1KG8A 2OE7X 3HU9A 1P2RA 1CV6A 1L14A 2LC9A 115LA 4BEYA 3S3CB 1L15A 1L90A 1QTHA 1B6IA 1L13A 2NTWA 123LA 126LA 1M0LA 3DN0A 3HT7A 102LA 1P46A 4EKPA 4EA3A 1JTNA 4I7RA 2PEDA 1L38A 2RBSA 4GP4B 4S0WA 184LA 1SX2A 1L74A 4XTNA 1P64A 1G0MA 1BRDA 3SBAA 4PXFA 2RAZX 1L86A 3NS0A 2Z55A 4I7MA 169LA 201LA 1PQOA 1S51A 4LDOA 1D2YA 3HDEA 3OE8A 253LA 4PJZA 1L02A 217LA 1C3WA 1QT5A 3GUIA 1C69A 4ZPUA 5B6VA 182LA 3ZPQA 1XIOA 4I7KA 5A44A 3KJ6A 4BUOA 2NTHA 2Q9EA 1GU8A 1L0KA 1L88A 236LA 1DYAA 3HH6A 1L01A 1L24A 225LA 1L0MA 5AX0A 1L40A 3RUNA 240LA 1T8FA 4EIYA 1EPYA 3GUKA 4I7NA 5B0WA 1FBKA 1DYEA 1L73A 1LPYA 229LA 1L16A 4W56A 1IW9A 1G0QA 3UZCA 3HDFA 1L21A 1CWQA 1PXSA 1L76A 4FAAB 3GUMA 147LA 3QBGA 3CDRA 1VGOA 4G7RB 5H2NA 162LA 1PQMA 199LA 186LA 1F88A 4YXCA 4MBSA 1L71A 1WTHA 163LA 1L0JA 2LNLA 4JKVA 3DN4A 5AWZA 4IB4A 1L06A 3DMXA 2HUMA 1LI3A 212LA 2I35A 128LA 1KY1A 1SWYA 3QJQB 1OV7A 1QKPA 2RB2X 252LA 1L63A 4W58A 3HT6A 1P2LA 139LA 1L25A 3T45A 1QT8A 2F47A 200LA 7LZMA 2KSAA 3UTVA 2IGCA 1G0JA 2RBRA 1D3FA 226LA 118LA 2ANVA 157LA 166LA 1C6DA 3PDSA 209LA 164LA 2B6WA 2ZZLA 4N6HA 4X1HA 146LA 5FJGA 1L95A 4OV0A 3VG9A 4W59A 4GBRB 168LA 3BVDB 3UONA 4K5YA 1L67A 3HTBA 1C6CA 4BWBA 216LA 3QBLA 125LA 4FPDA 1QTCA 1XEPA 3CODA 3S3BB 1JV7A 4XTLA 4X32A 4ARLA 3SB7A 1L03A 4LDEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QIOA 2Z73A 1REMA 4NHIA 5I4WA 1CKHA 3X3BA 1S52A 5LVGA 4GRVA 1OUEA 4LYOA 3HTGA 1LZ9A 4TX7A 1CJ8A 1IY4A 1BRXA 1DYBA 2B72A 1IVMA 1BWIA 1F6SA 1IC5Y 3LZ2A 4GPOA 4DD9A 1LI6A 3RNXA 2RAYX 1L09A 1PQIA 4GN4A 1IORA 2MEHA 1DYCA 3CT1A 1L08A 2X72A 1LCNA 5BR5A 1XJIA 1QUTA 1S54A 1P6YA 1NDMC 1E0PA 4H9AA 2WJKA 1YAMA 5APEA 3TXDA 4ZFPA 1GFJA 2HEEA 5KXMA 254LA 1LJHA 3CAPA 4PK0A 1P36A 1QUHA 3QJSB 161LA 1IWZA 1IP1A 2DBTA 1IOQA 2MEDA 4EKRA 1LHHA 2YCXA 2RB0X 3EH4B 3QAPA 1LSFA 1QTBA 2BRDA 4H1PA 1CU0A 2Z19A 1C6HA 259LA 4I7JA 205LA 2I25L 1TBYA 2YCYA 4N5RA 2DQEY 1IW6A 1S8JA 109LA 5B2NA 1KW7A 1L98A 2YCWA 1LYGA 1JPOA 4N4YB 4EKSA 1IR9A 1L48A 3AW6A 4IARA 221LA 1NHEA 190LA 1JKDA 3LYMA 1FLWA 1LZ1A 1GE4A 4E97A 1P8UA 4GYCA 1KG9A 1CV5A 1A2YC 2ZNXY 1C67A 5C1MA 1I6SA 5HMVA 2CDSA 1P56A 2LYOA 219LA 4H90A 1QKOA 1JISA 3HH5A 5EN0A 1VDTA 1IWXA 4ZIXA 4DYGA 3TMXA 243LA 4XJIA 1JITA 4QRYA 2BQIA 2D4IA 3LN2A 4WM1A 4L35A 2F2NA 2KSYA 2OTZX 3A94A 2YVBA 2LYZA 1L52A 4ARQA 4NGLA 1WQOA 3OE9A 151LA 4HJZA 1EHKB 3L2XA 1L46A 2G87A 2I26L 233LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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