4K5YA

Crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 1 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
411
structure length
407
Chain Sequence
HYHVAAIINYLGHCISLVALLVAFVLFLRARSIRCLRNIIHANLIAAFILRNATWFVVQLTMSPEVHQSNVGWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLSVAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVIATFRTGTWDAYDRLRAWMFICIGWGVPFPIIVAWAIGKLYYDNEKCWAGKRPGVYTDYIYQGPMALVLLINFIFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQARKAVKATLVLLPLLGITYMLAFVNEVSRVVFIYFNAFLESFQGFFVSVFACFLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Corticotropin-releasing factor receptor 1, T4-Lysozyme chime
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
total genus 148
structure length 407
sequence length 411
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4k5yA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4k5yA01
1JTNA 2RAYX 3HH3A 177LA 1L82A 3PXOA 3ABWA 111LA 232LA 1QM8A 3C7WA 1P6YA 1H68A 1P2RA 146LA 1P7SA 3DMXA 3G3VA 169LA 1L54A 1LYFA 1L74A 3DMZA 5A44A 3DN0A 1UCQA 1L40A 4I7SA 4W51A 5LZMA 150LA 1L43A 4ARJA 1C67A 5B34A 3C8RA 205LA 4DKLA 1CU2A 4PK0A 201LA 4LDLA 1G0KA 3S3CB 5H2PA 1C65A 1ZWNA 1JQUA 3HUQA 3QAPA 1BRDA 1L86A 3HT6A 4UHRA 3RZEA 260LA 1CWQA 261LA 2J4YA 4W57A 1C61A 4GBRB 3UONA 1C6HA 2OU0X 4PXFA 1KNIA 254LA 1T8AA 4EKPA 1TN5A 1XIOA 2Y00A 4XTOA 1L87A 5I14A 3EH5B 2YCZA 4FAAB 3EH4B 1L33A 1L99A 3KJ6A 3CDTA 1C8SA 5B35A 1LYIA 1C64A 259LA 1LI2A 2NTHA 212LA 4LDOA 2RB0X 242LA 126LA 2B6ZA 1ZURA 3DN8A 5B6ZA 2OE7X 2RH1A 2ANVA 1CU6A 4MD2A 1LI6A 2RBQA 198LA 1G1VA 2KSYA 247LA 3S8FB 5AWZA 1DYGA 4YX7C 3X3BA 2NTUA 1SWYA 1HZXA 4AQNA 1S8JA 2R4RA 3HARA 1P56A 2PEDA 4QI1A 4YXCA 4I7KA 1L30A 1L19A 4XTNA 3GUPA 4WW3A 3NS0A 3S8GB 1PQIA 1E12A 3ZEVA 248LA 1PXRA 2WJLA 3CODA 1C6LA 3RUNA 1C6DA 3QDCA 162LA 3JR6A 3HU9A 1JGJA 1CX6A 1L70A 3QBIA 1DYBA 3UTXA 3SBAA 2B6TA 2OU9A 245LA 227LA 3OE0A 1P8HA 1L83A 2KSBA 1QUHA 3S3BB 2NTGA 2JAFA 4XT3A 141LA 191LA 1L45A 1P46A 1G07A 250LA 158LA 5DYSA 1L0JA 3DMVA 142LA 219LA 3CDVA 3HU8A 256LA 4OV0A 2F93A 112LA 1L07A 1L96A 4W54A 1L15A 1QSBA 1D3NA 1L49A 3P0GA 5H2LA 3DN3A 2HUMA 5AX0A 2LCBA 1U19A 3QJRB 152LA 3REYA 221LA 4EJ4A 4I7OA 240LA 183LA 1QKOA 1L95A 181LA 5ITCA 5H2JA 3HT8A 3V2WA 5G2CA 4TL3A 253LA 1QT3A 1L22A 3SN6R 123LA 1CTWA 1L52A 1CV4A 3NY9A 1F88A 1L11A 4W52A 3OAXA 1QHJA 161LA 4JR8A 4WAVA 1QS5A 2B6WA 3CDQA 229LA 3HTDA 1R2NA 5AZDA 3S3DB 1L92A 149LA 140LA 1KS3A 4AMIA 3L2XA 2RB2X 2YDOA 2O4WA 3G3WA 1QTDA 3SB7A 4ARQA 1KGBA 1S53A 4IB4A 1C6CA 5H2MA 1KG8A 1CV1A 3C7YA 2F95A 3VGAA 3DKEX 228LA 3QJVB 224LA 2G87A 1T8FA 1KG9A 3QJUB 209LA 1JV6A 1L53A 3AYMA 5BR5A 2BRDA 178LA 3PQRA 3GUNA 4I7JA 1LYEA 159LA 164LA 3HAPA 258LA 4PJZA 1QT6A 1D3MA 1L75A 3COCA 2B73A 195LA 1L08A 5C1MA 1QUDA 1L72A 2RBNA 1P36A 4I7RA 4ARLA 3VVKA 4YXAC 1C3WA 1L04A 3WQJA 1L06A 3GUIA 104LA 1L71A 1CU5A 1L56A 3UZCA 3HTFA 1L42A 1WTHA 4I7PA 4EIYA 3EMLA 1LYHA 3DDLA 3HUKA 3BVDB 5G54A 239LA 234LA 1L79A 167LA 3T45A 222LA 1O0AA 1KY0A 4LDEA 1G06A 3GUKA 1F4ZA 1TN0A 1C6PA 1D2WA 1L94A 1M0LA 5G2DA 5H2KA 131LA 5B0WA 128LA 4MQTA 4G71B 2RBSA 3NY8A 1D3FA 2HUKA 2B74A 1OYUA 1C8RA 4XT1A 2YCWA 236LA 1L13A 4XXJA 4W56A 7LZMA 1L48A 122LA 4W58A 1BRRA 4PXKA 1L23A 1CUQA 1L65A 1IXFA 3SB6A 1P8UA 3C8SA 1XJTA 5DHHA 1C6BA 206LA 4W55A 4EPFA 2Y02A 3F8VA 3QBKA 3D4SA 5AX1A 1DYEA 3C83A 1MGYA 4JKVA 1CV5A 4GP4B 4GPOA 1DYCA 211LA 3K2RA 1ZYTA 4OO9A 4DAJA 4NC3A 155LA 4FBZA 2F2QA 5B6WA 5A8EA 1S54A 1QT8A 1L90A 4FPDA 1LWGA 2Z6BA 1P5CA 4KNFA 2B6XA 4J4QA 157LA 188LA 2JAGA 108LA 1T8GA 4HWLA 5DHGA 1LN6A 3NSBA 4E97A 213LA 1L05A 1L60A 172LA 2KSAA 1XEPA 3GULA 130LA 1L25A 1L02A 2OU8A 2OTYX 2LNLA 4QIDA 1L01A 218LA 4ZPUA 1L57A 1AP9A 2KS9A 5G36A 231LA 2RBPA 4UG2A 143LA 1C63A 3C7ZA 4AMJA 1G0MA 2YCYA 1L85A 163LA 3QAKA 1SX7A 4IAQA 1TLAA 3ODUA 1OVHA 1C68A 3CDOA 1LI3A 2ZIYA 262LA 4I7TA 1L12A 2Z55A 1L77A 2RBRA 1C66A 3NYAA 1M0KA 4MBSA 1C6KA 1L47A 3C9LA 1L21A 4BWBA 1LYGA 3F9LA 1L41A 6LZMA 2R4SA 3DQBA 2Z73A 1L80A 246LA 1OV7A 184LA 174LA 3SB9A 2A4TA 1L39A 2LC9A 4XTLA 1KW7A 1C60A 3DN4A 1EPYA 3PBLA 5H2HA 1D3JA 1KW5A 1H2SA 1L00A 3FI5A 1L61A 1FBBA 4GP5B 120LA 180LA 1P3NA 249LA 233LA 1LW9A 2B7XA 3SBBC 1C6FA 1OVJA 4ARQB 1DYDA 1L35A 1L68A 1LGWA 2Y01A 2QPEB 3VG9A 1C6MA 1KMEA 199LA 1C6TA 2O7AA 4W53A 175LA 176LA 1D2YA 138LA 1NHBA 1PQMA 4I7NA 1JFPA 1LWKA 1L0MA 3PWHA 4L35A 4X32A 1L20A 223LA 2I1XA 3ZPRA 4BUOA 1L31A 4ARPA 1SWZA 1P8IA 225LA 3QBLA 1GZMA 5H2IA 196LA 127LA 3HT9A 1G0JA 2RAZX 1C69A 3UTWA 2Y04A 1L37A 3QJSB 1QSQA 1QTBA 1Q5IA 1LGUA 1L44A 3X3CA 1L62A 1LYDA 5J7AA 4BEYA 151LA 3HH5A 186LA 3VI0A 5G53A 200LA 109LA 3GUOA 170LA 1L36A 3EH3B 1L38A 1L88A 1L63A 1C6JA 3DN1A 103LA 3PDSA 1X0K1 4MD1A 119LA 1X0SA 255LA 1QKPA 3HH4A 2B70A 1L76A 1G0PA 5H2OA 4HYXA 4Y9HA 1CV3A 1P37A 4EKRA 3VHZA 1CU0A 1L89A 189LA 3C80A 185LA 1R84A 1L9HA 251LA 3AM6A 5G28A 2Q9EA 1L50A 1G1WA 3CAPA 1UAZA 1QS9A 216LA 2IGCA 1QTHA 4EXMA 2HPYA 2Y03A 3V2YA 1I6SA 115LA 1E0PA 1L55A 5B2NA 1L98A 1C6GA 3LZMA 1CUPA 1L17A 1BRXA 125LA 5B6VA 1AT9A 3AYNA 1QTVA 2F32A 1OWZA 1LYJA 241LA 3OE8A 1L24A 1VJMA 2VT4A 5TGZA 2OEAX 3HUAA 3HDFA 4GP8B 1QT4A 3HDEA 1S8LA 4G7SB 3UTVA 4ARMB 3OE9A 2M3GA 3UTYA 1FBKA 1PXSA 3VW7A 3HH6A 182LA 1CVKA 1LPYA 1JTMA 165LA 137LA 1GUEA 4X1HA 1L0KA 1L26A 1S51A 252LA 2OTZX 4I7MA 4W59A 4ARMA 2I35A 4JQ6A 1DZEA 3UG9A 3A7KA 4G70B 2YCXA 1L29A 187LA 5EN0A 2Q9DA 173LA 4IARA 1CU3A 5JJNA 5JJEA 3FA0A 4MQSA 4GBRA 1L14A 1G0LA 3QJTB 230LA 3QBGA 4BV0A 2F47A 1L09A 1C62A 1L46A 1PQDA 2RBOA 1L81A 5LWEA 2B75A 1L18A 3QJQB 4N4WA 3GUJA 2RB1X 2OE9X 4N6HA 3DN6A 3OE6A 1QTCA 257LA 220LA 235LA 3FADA 1EHKB 4S0WA 3DN2A 4BVNA 226LA 1C6QA 4EKQA 4L6RA 2QARC 3DNAA 3SB5A 3GUMA 2I21A 129LA 1L16A 210LA 1CV0A 2L78A 1F50A 5B6YA 4A4MA 4QRYA 2WJKA 1C6AA 5ETZA 147LA 217LA 3HANA 5G2AA 5B6XA 2EI4A 1C6NA 1XJUA 3G3XA 1G0GA 3HT7A 1XMEB 215LA 1L84A 5KKHA 2B6YA 214LA 5AHYA 4FA7B 2QPDB 3HAQA 1L97A 5BR2A 2ANXA 1KY1A 1Q5JA 1C6IA 4BEZA 2NTWA 114LA 1X0I1 237LA 3UZAA 4G7QB 1QT7A 190LA 1CV6A 4GRVA 3CDRA 197LA 2AT9A 2L6XA 4G7RB 1L32A 1SX2A 1LGXA 4K5YA 3C9MA 1B6IA 118LA 3SB8A 1GU8A 3C82A 1QUOA 3L64A 102LA 145LA 1OVKA 3HWLA 4G72B 1L59A 2LZMA 1L28A 1L27A 2B72A 5ITEA 1L58A 1S52A 244LA 4I7LA 5H2NA 4X31A 2YDVA 1PQOA 1QUGA 1D9WA 5A45A 4LZMA 166LA 1M0MA 1SSWA 3RFMA 1CX7A 1L73A 2I20A 148LE 1LLHA 4EKSA 1SSYA 168LA 1L67A 2QB0B 2ZFEA 2CUUA 5FJGA 156LA 1L10A 1T6HA 1PQJA 1DYFA 1L66A 1PY6A 1K28A 1QT5A 110LA 1QTZA 1T97A 3HTBA 1G0QA 1L51A 3HASA 3MBVA 4HYJA 2O79A 1IW6A 144LA 1DYAA 1JV7A 1L64A 4IAPA 3C8QA 4EPIA 1P2LA 1L69A 160LA 1L03A 107LA 3HAOA 4N4YB 2X72A 4DJHA 4EA3A 4I7QA 1XJIA 192LA 1C6EA 1L93A 1OWYA 4KLYA 3HTGA 3ZPQA 139LA 2HULA 2ZZLA 4GYCA 1VGOA 5JJJA 1IW9A 1P64A 5F8UA 1L34A 1OV5A 1PQKA 1BM1A 113LA 2OE4X 171LA 243LA 3C81A 238LA 1L91A 5AHZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YSSC 4KPMA 3PXOA 1EQ5A 3TMVA 1P6YA 169LA 1L74A 3DMZA 5A44A 2BQKA 2IHLA 1L40A 1IP4A 1GE4A 2XJWA 4I7SA 5LZMA 1PZYA 3C8RA 205LA 4DKLA 1JSEA 4GCFA 1YIKA 2D4KA 1LSFA 1KXYA 1JQUA 3HUQA 1L86A 4B4JA 3LN2A 4UHRA 3A3QA 3BKVA 4DT3A 4GCBA 4LT1A 5T3FA 1BWIA 4DD1A 2OU0X 4AGAA 4EKPA 5A3EA 1XIOA 4XTOA 5F9XA 3B0IA 1L33A 3B72A 5LVHA 1C8SA 1LYIA 1C64A 4L41A 2NTHA 4HTQA 135LA 3A90A 3DN8A 1KIRC 3AZ5A 5HMVA 1CU6A 2RBQA 198LA 1UIGA 1LSNA 2YBMA 1GBYA 5AWZA 2BQNA 3CT0A 3P64A 5KKIA 5C6IA 2PEDA 4QI1A 4I7KA 1L30A 3GUPA 1C45A 1E12A 248LA 1J1XY 5M1YA 1UIDA 1LPIA 162LA 4Z3MA 245LA 1LZYA 1P8HA 2MEAA 4HPEA 2JAFA 4HTKA 141LA 1L45A 1P46A 1VEDA 158LA 4ETDA 219LA 1IR9A 1BB3A 1H6MA 1QSBA 1D3NA 2BQLA 2BQHA 2Y8PA 2LCBA 1U19A 152LA 4NHIA 3REYA 1UC0A 183LA 4MR1A 181LA 5H2JA 3HT8A 5G2CA 4RLMA 4TL3A 4R0FA 123LA 1CV4A 3NY9A 3OAXA 1QHJA 3ATOA 1GFKA 2BQGA 5AZDA 140LA 4AMIA 1WQQA 2O4WA 1KGBA 1S53A 4LYBA 5H2MA 4LT0A 1UACY 3C7YA 4DC4A 1BWJA 1IWUA 1UICA 2CJLA 1L53A 3EBAB 3PQRA 1KIPC 164LA 1UIFA 1F6SA 4PJZA 1UIAA 1L08A 2DQDY 2H9JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1P8I A;  225L A;  3QBL A;  1GZM A;  5H2I A;  196L A;  127L A;  3HT9 A;  1G0J A;  2RAZ X;  1C69 A;  3UTW A;  2Y04 A;  1L37 A;  3QJS B;  1QSQ A;  1QTB A;  1Q5I A;  1LGU A;  1L44 A;  3X3C A;  1L62 A;  1LYD A;  5J7A A;  4BEY A;  151L A;  3HH5 A;  186L A;  3VI0 A;  5G53 A;  200L A;  109L A;  3GUO A;  170L A;  1L36 A;  3EH3 B;  1L38 A;  1L88 A;  1L63 A;  1C6J A;  3DN1 A;  103L A;  3PDS A;  1X0K 1;  4MD1 A;  119L A;  1X0S A;  255L A;  1QKP A;  3HH4 A;  2B70 A;  1L76 A;  1G0P A;  5H2O A;  4HYX A;  4Y9H A;  1CV3 A;  1P37 A;  4EKR A;  3VHZ A;  1CU0 A;  1L89 A;  189L A;  3C80 A;  185L A;  1R84 A;  1L9H A;  251L A;  3AM6 A;  5G28 A;  2Q9E A;  1L50 A;  1G1W A;  3CAP A;  1UAZ A;  1QS9 A;  216L A;  2IGC A;  1QTH A;  4EXM A;  2HPY A;  2Y03 A;  3V2Y A;  1I6S A;  115L A;  1E0P A;  1L55 A;  5B2N A;  1L98 A;  1C6G A;  3LZM A;  1CUP A;  1L17 A;  1BRX A;  125L A;  5B6V A;  1AT9 A;  3AYN A;  1QTV A;  2F32 A;  1OWZ A;  1LYJ A;  241L A;  3OE8 A;  1L24 A;  1VJM A;  2VT4 A;  5TGZ A;  2OEA X;  3HUA A;  3HDF A;  4GP8 B;  1QT4 A;  3HDE A;  1S8L A;  4G7S B;  3UTV A;  4ARM B;  3OE9 A;  2M3G A;  3UTY A;  1FBK A;  1PXS A;  3VW7 A;  3HH6 A;  182L A;  1CVK A;  1LPY A;  1JTM A;  165L A;  137L A;  1GUE A;  4X1H A;  1L0K A;  1L26 A;  1S51 A;  252L A;  2OTZ X;  4I7M A;  4W59 A;  4ARM A;  2I35 A;  4JQ6 A;  1DZE A;  3UG9 A;  3A7K A;  4G70 B;  2YCX A;  1L29 A;  187L A;  5EN0 A;  2Q9D A;  173L A;  4IAR A;  1CU3 A;  5JJN A;  5JJE A;  3FA0 A;  4MQS A;  4GBR A;  1L14 A;  1G0L A;  3QJT B;  230L A;  3QBG A;  4BV0 A;  2F47 A;  1L09 A;  1C62 A;  1L46 A;  1PQD A;  2RBO A;  1L81 A;  5LWE A;  2B75 A;  1L18 A;  3QJQ B;  4N4W A;  3GUJ A;  2RB1 X;  2OE9 X;  4N6H A;  3DN6 A;  3OE6 A;  1QTC A;  257L A;  220L A;  235L A;  3FAD A;  1EHK B;  4S0W A;  3DN2 A;  4BVN A;  226L A;  1C6Q A;  4EKQ A;  4L6R A;  2QAR C;  3DNA A;  3SB5 A;  3GUM A;  2I21 A;  129L A;  1L16 A;  210L A;  1CV0 A;  2L78 A;  1F50 A;  5B6Y A;  4A4M A;  4QRY A;  2WJK A;  1C6A A;  5ETZ A;  147L A;  217L A;  3HAN A;  5G2A A;  5B6X A;  2EI4 A;  1C6N A;  1XJU A;  3G3X A;  1G0G A;  3HT7 A;  1XME B;  215L A;  1L84 A;  5KKH A;  2B6Y A;  214L A;  5AHY A;  4FA7 B;  2QPD B;  3HAQ A;  1L97 A;  5BR2 A;  2ANX A;  1KY1 A;  1Q5J A;  1C6I A;  4BEZ A;  2NTW A;  114L A;  1X0I 1;  237L A;  3UZA A;  4G7Q B;  1QT7 A;  190L A;  1CV6 A;  4GRV A;  3CDR A;  197L A;  2AT9 A;  2L6X A;  4G7R B;  1L32 A;  1SX2 A;  1LGX A;  4K5Y A;  3C9M A;  1B6I A;  118L A;  3SB8 A;  1GU8 A;  3C82 A;  1QUO A;  3L64 A;  102L A;  145L A;  1OVK A;  3HWL A;  4G72 B;  1L59 A;  2LZM A;  1L28 A;  1L27 A;  2B72 A;  5ITE A;  1L58 A;  1S52 A;  244L A;  4I7L A;  5H2N A;  4X31 A;  2YDV A;  1PQO A;  1QUG A;  1D9W A;  5A45 A;  4LZM A;  166L A;  1M0M A;  1SSW A;  3RFM A;  1CX7 A;  1L73 A;  2I20 A;  148L E;  1LLH A;  4EKS A;  1SSY A;  168L A;  1L67 A;  2QB0 B;  2ZFE A;  2CUU A;  5FJG A;  156L A;  1L10 A;  1T6H A;  1PQJ A;  1DYF A;  1L66 A;  1PY6 A;  1K28 A;  1QT5 A;  110L A;  1QTZ A;  1T97 A;  3HTB A;  1G0Q A;  1L51 A;  3HAS A;  3MBV A;  4HYJ A;  2O79 A;  1IW6 A;  144L A;  1DYA A;  1JV7 A;  1L64 A;  4IAP A;  3C8Q A;  4EPI A;  1P2L A;  1L69 A;  160L A;  1L03 A;  107L A;  3HAO A;  4N4Y B;  2X72 A;  4DJH A;  4EA3 A;  4I7Q A;  1XJI A;  192L A;  1C6E A;  1L93 A;  1OWY A;  4KLY A;  3HTG A;  3ZPQ A;  139L A;  2HUL A;  2ZZL A;  4GYC A;  1VGO A;  5JJJ A;  1IW9 A;  1P64 A;  5F8U A;  1L34 A;  1OV5 A;  1PQK A;  1BM1 A;  113L A;  2OE4 X;  171L A;  243L A;  3C81 A;  238L A;  1L91 A;  5AHZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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