4LDLA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to hydroxybenzylisoproterenol and an engineered nanobody
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 166
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldlA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldlA02
2B6TA 2J4YA 199LA 1L11A 1QT7A 1BRRA 4JR8A 232LA 1L20A 1C6DA 1PQDA 3CDRA 1C3WA 1S52A 1F88A 2Z6BA 1O0AA 2OEAX 1SSWA 1G07A 1UAZA 3ZEVA 2ANXA 2F93A 4AQNA 5B6WA 1KG8A 1NHBA 1L08A 1L69A 1L66A 1X0K1 2M3GA 1L68A 115LA 1L64A 1DYGA 237LA 1QUHA 2OU0X 1GZMA 1C60A 155LA 260LA 1Q5JA 3NSBA 3SN6R 205LA 3CAPA 4LDLA 3G3VA 3UTVA 137LA 239LA 5A8EA 1P36A 1SSYA 5EN0A 252LA 5B34A 1L06A 4S0WA 3K2RA 4EA3A 125LA 1P5CA 1LGXA 1QUDA 1L01A 3COCA 158LA 2OU9A 3HAPA 1JQUA 3DDLA 2IGCA 3HTBA 3NY8A 1IW6A 5C1MA 1L43A 1L33A 1L21A 2NTUA 4K5YA 178LA 1L12A 4IAPA 1L46A 4FBZA 2EI4A 1CX7A 1QUGA 1SWYA 3CDOA 1LW9A 5G2CA 224LA 4ARQB 176LA 1SX2A 2YDOA 4MD2A 4AMIA 3S3DB 111LA 112LA 1H2SA 3RFMA 4GBRB 1L92A 3DMZA 4I7PA 2Y00A 1KW7A 3P0GA 1LI6A 5H2OA 1P8IA 5LZMA 248LA 4GRVA 1DYDA 4W54A 191LA 2RH1A 4LDOA 1T6HA 3UONA 1XEPA 1P56A 5AZDA 1L44A 4BEZA 1C6LA 1L96A 2LCBA 3DN6A 102LA 4LDEA 4I7NA 1ZYTA 240LA 1BRXA 3HH4A 2ZIYA 3QBLA 5H2PA 1QTZA 216LA 1L03A 3QBIA 163LA 1QT6A 3DN8A 2QPDB 3C82A 5LWEA 1L84A 1TLAA 5B6VA 1VGOA 3ZPQA 1DYEA 1OWYA 2B6XA 3VVKA 3OE9A 1PXRA 4N4YB 3ZPRA 2B74A 5JJJA 222LA 4DKLA 1KG9A 1C6HA 1L49A 3EH4B 156LA 5H2NA 1CV1A 1L88A 3DNAA 229LA 3GUIA 1L91A 2R4SA 182LA 3VI0A 1C8SA 1G1WA 1L99A 5DHHA 4KLYA 151LA 1JTNA 1G0LA 1P64A 1L53A 2WJKA 109LA 1D2YA 1QSQA 2LC9A 3OE8A 1PQMA 4KNFA 1QM8A 152LA 1L50A 4BV0A 1LYEA 4EPIA 3GUKA 103LA 3GUJA 1LYHA 1P3NA 4ARMA 2PEDA 1QHJA 1JGJA 5DYSA 1E12A 2L6XA 209LA 1G1VA 4GYCA 1L95A 3HT8A 231LA 4GPOA 118LA 3UTYA 1L42A 1L67A 5ITCA 3HUKA 174LA 1XJIA 2QB0B 1C65A 247LA 245LA 3DN0A 5H2MA 3DMXA 1C6KA 5AHYA 254LA 3F9LA 3SB6A 4FPDA 3PWHA 1CTWA 1CU6A 1L61A 2RBOA 3KJ6A 185LA 2ZFEA 3NYAA 217LA 1L0KA 1LWGA 1CU3A 1C6GA 1SWZA 4L35A 192LA 1QKPA 190LA 1L47A 1L87A 4QRYA 1LYFA 5FJGA 1QTDA 2OE4X 2RB2X 1D3JA 3AYMA 221LA 5ETZA 7LZMA 3C8SA 1L17A 230LA 4EPFA 129LA 1KY1A 4HYXA 2YCXA 4G7QB 1DZEA 1LN6A 1L18A 169LA 4XTNA 2I35A 1L9HA 3T45A 1C69A 1L54A 1L48A 1X0I1 3GUOA 4BUOA 1C61A 213LA 5H2HA 126LA 2B6ZA 1X0SA 183LA 4I7RA 1C6EA 4J4QA 4NC3A 1QUOA 201LA 200LA 226LA 3VG9A 2HUMA 2I20A 2KSYA 1L07A 5JJEA 198LA 1D3FA 3C83A 188LA 2Z55A 4ARJA 5F8UA 122LA 165LA 1QS9A 1IXFA 2OE9X 4EKSA 1KMEA 1LYGA 4I7SA 4ARPA 1L40A 1QT4A 3NY9A 2G87A 4GP4B 1EPYA 1L0JA 1L31A 1LI3A 4N6HA 2BRDA 4YXAC 1KW5A 3ODUA 1L90A 2JAFA 4IARA 5B2NA 1G0QA 2F47A 4EXMA 1JV6A 4I7JA 1XIOA 3SBAA 4BWBA 150LA 1L16A 4XXJA 197LA 2Q9EA 162LA 1C6MA 3OE6A 1C63A 166LA 4E97A 2AT9A 3BVDB 3OAXA 1L82A 1QTHA 177LA 3C9LA 1CUQA 2QARC 1L59A 2NTGA 4N4WA 4PJZA 4WW3A 1L10A 1C64A 1BM1A 4PXKA 1P7SA 4EIYA 4UHRA 4XTOA 3WQJA 3C8RA 1C6BA 1M0LA 2QPEB 3ABWA 2F32A 1R2NA 1BRDA 2I21A 3C81A 4BVNA 167LA 1G06A 228LA 3DN4A 1LPYA 5B6XA 1L63A 1LYIA 1L94A 1L72A 107LA 143LA 3DMVA 3HT6A 4L6RA 1VJMA 1L32A 3QJUB 131LA 1G0PA 1L77A 1R84A 3EH3B 1CU0A 233LA 170LA 5B0WA 2YCZA 1AP9A 1L81A 258LA 2HUKA 3HTDA 3PDSA 1HZXA 1L39A 3JR6A 114LA 171LA 3RZEA 4DJHA 1KNIA 4XT1A 1KS3A 2WJLA 187LA 1C6CA 1OV5A 1T8GA 250LA 256LA 2RBSA 3PQRA 172LA 4EKPA 2Y03A 3DN3A 1C6JA 3HT9A 4MQTA 2OU8A 1G0KA 219LA 1L38A 1LI2A 195LA 120LA 4YXCA 1QS5A 2I1XA 5H2LA 1EHKB 3SB5A 3VHZA 1L55A 1GUEA 5AHZA 3QJRB 1JTMA 1TN5A 3VGAA 3CDTA 1OWZA 3V2YA 3C80A 1M0MA 3QAPA 220LA 4I7KA 2NTHA 5J7AA 4G70B 1H68A 3DQBA 1D3MA 4HWLA 3EMLA 214LA 3F8VA 1CV5A 3A7KA 3HH6A 1F50A 2JAGA 2RBNA 1Q5IA 1L45A 1SX7A 238LA 1L14A 3C7WA 1XMEB 3REYA 1LYJA 3FA0A 3HDEA 223LA 3VW7A 1JFPA 241LA 1QT3A 138LA 5DHGA 175LA 1L19A 123LA 3UZAA 127LA 1D2WA 1OYUA 147LA 2VT4A 2YDVA 3SB7A 113LA 1L70A 1L41A 1C6FA 1CU5A 5KKHA 6LZMA 1C6AA 1G0GA 1L79A 1L35A 4W58A 4X32A 5BR2A 1L93A 227LA 1T97A 1L29A 3FADA 3QBKA 1L15A 144LA 2YCYA 3GUMA 4X1HA 1C62A 3UZCA 3QJSB 3LZMA 1F4ZA 1L62A 3V2WA 1L02A 3SB8A 4MD1A 2B6WA 2KSBA 1CU2A 2OTZX 1OVHA 1L22A 1L57A 242LA 235LA 3GUPA 3NS0A 3S3CB 3SBBC 3PBLA 1OVJA 2F95A 4QI1A 4IB4A 1XJTA 4JQ6A 5G2AA 5AWZA 5A44A 3FI5A 3GULA 2O4WA 1OV7A 139LA 1P6YA 1DYCA 3C7YA 1QT5A 4HYJA 1L27A 3X3CA 1L25A 1CV0A 4W53A 4ARQA 3HH5A 1C6TA 1OVKA 1L37A 4GBRA 1FBBA 180LA 249LA 1PQIA 1S53A 3AM6A 3HARA 4PXFA 1K28A 130LA 3HWLA 3OE0A 3QBGA 145LA 5G28A 3UG9A 173LA 1C67A 1G0JA 1PQJA 3HU8A 3UTXA 4YX7C 4XT3A 1LYDA 2Q9DA 3DN1A 234LA 3G3WA 181LA 3QJVB 3CDQA 1L52A 1DYBA 1PQKA 2HULA 1C68A 1L76A 1LLHA 3HT7A 1S8LA 4W52A 1CV4A 3UTWA 236LA 160LA 257LA 1L0MA 142LA 1QTBA 148LE 4ARMB 4G71B 243LA 184LA 4G72B 244LA 1P46A 1L09A 3C7ZA 2B7XA 1L85A 1P37A 4W55A 1C6QA 261LA 140LA 1AT9A 1C6IA 1QTVA 2RBRA 1L71A 4AMJA 1ZURA 4BEYA 1L26A 251LA 4I7MA 4W51A 110LA 1M0KA 1KGBA 1JV7A 4MQSA 1LGWA 2RBQA 1QTCA 2RB1X 5B6YA 3G3XA 1PY6A 1QKOA 3QJQB 1S8JA 3X3BA 2RAZX 1C6PA 1PQOA 1MGYA 1S54A 2Y01A 1UCQA 4I7OA 218LA 1D9WA 5I14A 2LNLA 1P2RA 2X72A 1L05A 4IAQA 4W57A 1GU8A 2ZZLA 2R4RA 5AX1A 1L28A 4QIDA 2B73A 3HDFA 168LA 246LA 1L89A 5B35A 1CUPA 1CX6A 2KS9A 1T8AA 3CDVA 1P8UA 4G7SB 4GP8B 4TL3A 3C9MA 1G0MA 1KY0A 4FA7B 2B70A 2RAYX 2O79A 2B72A 1CWQA 4LZMA 1L30A 4FAAB 2F2QA 2B75A 161LA 4I7TA 1LWKA 4EKQA 4GP5B 141LA 1TN0A 1T8FA 189LA 4MBSA 3DKEX 4EJ4A 1L00A 5JJNA 1L83A 4UG2A 1LGUA 2B6YA 3HUAA 3S3BB 2CUUA 1L36A 1CVKA 1DYAA 1P8HA 1L97A 3HH3A 2YCWA 3D4SA 225LA 2NTWA 1L51A 2Z73A 1L23A 2OE7X 2KSAA 1L65A 2Y04A 3GUNA 159LA 3L2XA 3QJTB 2LZMA 1DYFA 128LA 210LA 2HPYA 3QDCA 186LA 1C6NA 3QAKA 3MBVA 5G2DA 5TGZA 2A4TA 1I6SA 212LA 1L80A 2L78A 1IW9A 1E0PA 255LA 4X31A 5G54A 4I7QA 4ZPUA 3CODA 3PXOA 206LA 1PXSA 1QT8A 1ZWNA 5H2KA 3EH5B 4WAVA 3HAQA 1CV6A 119LA 4PK0A 104LA 5B6ZA 3DN2A 196LA 1P2LA 4DAJA 3SB9A 253LA 3HTGA 1L98A 1C8RA 1WTHA 1L58A 4ARLA 164LA 1L74A 2OTYX 1U19A 5ITEA 3HUQA 1QSBA 157LA 4W56A 1L34A 2ANVA 5G53A 4A4MA 5A45A 5G36A 3HAOA 3HU9A 3L64A 4XTLA 108LA 4JKVA 1L04A 1L56A 5AX0A 4OV0A 5H2IA 4Y9HA 149LA 1XJUA 4I7LA 211LA 5BR5A 1L75A 2Y02A 1L60A 215LA 3C8QA 2O7AA 1L73A 3AYNA 3HASA 2RB0X 1L13A 1B6IA 4OO9A 262LA 1C66A 1L86A 259LA 1CV3A 2RBPA 4W59A 4EKRA 3HTFA 1FBKA 1L24A 5H2JA 1D3NA 146LA 4G7RB 3S8GB 3HANA 1S51A 3RUNA 3S8FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LMAA 4ET9A 1O23A 2D91A 1C3WA 4NGYA 4PHIA 1IO5A 4ML7A 2F93A 4AQNA 4UWUA 1L08A 1A2YC 3A95A 1B7MA 4B4JA 1GAZA 4ZFPA 2EQLA 1UIHA 1B5YA 4LDLA 5II3A 2GV0A 4OOTA 2HEBA 2ZQ4A 4YEOA 1SSYA 5EN0A 3ZEKA 1VEDA 1YAPA 1L06A 2BQMA 4S0WA 5B34A 1LHIA 125LA 1P5CA 2BPUA 4NG1A 1NBYC 3COCA 2OU9A 3HAPA 1YAQA 3HTBA 1L21A 4MCKA 1GBYA 4WO6A 178LA 1L12A 1L46A 2EI4A 1CX7A 1QUGA 4IATA 1SWYA 1LW9A 3LZTA 176LA 1LSFA 2YDOA 4AMIA 1EQEA 4N5RA 3S3DB 3P66A 3RFMA 2Y00A 5H2OA 4LDOA 4OWAA 1XEPA 1LMTA 4BEZA 2LCBA 4LDEA 102LA 4I7NA 5I4XA 1GDWA 1BRXA 5H2PA 1GB3A 1D0LA 1B7RA 4QGZA 2ZIJA 2MEBA 3QBIA 1QT6A 5LWEA 1J1OY 2I26L 1LMNA 1TLAA 5B6VA 1VGOA 4B4EA 2B6XA 3OE9A 4ET8A 1PXRA 1B0DA 1C46A 5KXZA 1KG9A 1C6HA 1L49A 2F30A 3WL2A 1UBZA 4J0LA 3VI0A 1LHKA 1BVXA 5KXYA 1JTNA 4B4IA 2F4AA 9LYZA 3OE8A 1PQMA 2LZTA 152LA 4DDBA 1J1PY 1LZSA 2ZIKA 1XGPC 2PEDA 4YEMA 1CJ8A 4M4OA 3WW5A 2F2NA 2HECA 118LA 1L42A 5ITCA 1B5VA 2QB0B 3ULRA 3F9LA 3SB6A 1L61A 3KJ6A 185LA 2ZFEA 4RLNA 5LVIA 1DKKA 1SWZA 192LA 1HC0A 1C10A 4KL7A 1CKDA 1D3JA 221LA 4XJFA 1L17A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TN0 A;  1T8F A;  189L A;  4MBS A;  3DKE X;  4EJ4 A;  1L00 A;  5JJN A;  1L83 A;  4UG2 A;  1LGU A;  2B6Y A;  3HUA A;  3S3B B;  2CUU A;  1L36 A;  1CVK A;  1DYA A;  1P8H A;  1L97 A;  3HH3 A;  2YCW A;  3D4S A;  225L A;  2NTW A;  1L51 A;  2Z73 A;  1L23 A;  2OE7 X;  2KSA A;  1L65 A;  2Y04 A;  3GUN A;  159L A;  3L2X A;  3QJT B;  2LZM A;  1DYF A;  128L A;  210L A;  2HPY A;  3QDC A;  186L A;  1C6N A;  3QAK A;  3MBV A;  5G2D A;  5TGZ A;  2A4T A;  1I6S A;  212L A;  1L80 A;  2L78 A;  1IW9 A;  1E0P A;  255L A;  4X31 A;  5G54 A;  4I7Q A;  4ZPU A;  3COD A;  3PXO A;  206L A;  1PXS A;  1QT8 A;  1ZWN A;  5H2K A;  3EH5 B;  4WAV A;  3HAQ A;  1CV6 A;  119L A;  4PK0 A;  104L A;  5B6Z A;  3DN2 A;  196L A;  1P2L A;  4DAJ A;  3SB9 A;  253L A;  3HTG A;  1L98 A;  1C8R A;  1WTH A;  1L58 A;  4ARL A;  164L A;  1L74 A;  2OTY X;  1U19 A;  5ITE A;  3HUQ A;  1QSB A;  157L A;  4W56 A;  1L34 A;  2ANV A;  5G53 A;  4A4M A;  5A45 A;  5G36 A;  3HAO A;  3HU9 A;  3L64 A;  4XTL A;  108L A;  4JKV A;  1L04 A;  1L56 A;  5AX0 A;  4OV0 A;  5H2I A;  4Y9H A;  149L A;  1XJU A;  4I7L A;  211L A;  5BR5 A;  1L75 A;  2Y02 A;  1L60 A;  215L A;  3C8Q A;  2O7A A;  1L73 A;  3AYN A;  3HAS A;  2RB0 X;  1L13 A;  1B6I A;  4OO9 A;  262L A;  1C66 A;  1L86 A;  259L A;  1CV3 A;  2RBP A;  4W59 A;  4EKR A;  3HTF A;  1FBK A;  1L24 A;  5H2J A;  1D3N A;  146L A;  4G7R B;  3S8G B;  3HAN A;  1S51 A;  3RUN A;  3S8F B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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