4LDOA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to adrenaline and an engineered nanobody
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
total genus 164
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldoA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldoA02
2R4RA 2RB1X 255LA 1PQMA 2KSBA 2HULA 1L27A 3AYMA 141LA 148LE 4GBRB 3RFMA 1L16A 4I7TA 4EXMA 2KS9A 5DYSA 4PJZA 1L29A 2BRDA 2RAZX 1F4ZA 1QM8A 173LA 1C66A 3HDFA 238LA 3PBLA 1XIOA 1LPYA 214LA 1PQKA 5AHZA 1L95A 256LA 4QRYA 1L55A 1L56A 1C8RA 1C6PA 5H2LA 3OE8A 1L43A 2F47A 1DYEA 1OVJA 1M0MA 200LA 3HT8A 108LA 4XXJA 1C6FA 3HH3A 4W55A 2Y04A 1L25A 2VT4A 1EPYA 104LA 1CX7A 2OU9A 7LZMA 131LA 211LA 1X0K1 3CAPA 1OVHA 1P2RA 3T45A 1L82A 4EPFA 1WTHA 2NTGA 4FBZA 4JQ6A 1OWZA 3K2RA 5B2NA 2EI4A 4X31A 1L88A 2HUKA 138LA 3DQBA 3ABWA 4W54A 1L40A 5I14A 4BUOA 1C6JA 253LA 1L01A 110LA 1L63A 1C3WA 167LA 218LA 2LZMA 129LA 1L26A 3HAQA 1C8SA 2B70A 2B6XA 1D3FA 5H2PA 1L52A 4S0WA 2B6YA 1L79A 1AT9A 5B6ZA 1DYCA 1IXFA 261LA 209LA 4HYXA 4XTLA 236LA 1C6GA 3SB8A 233LA 3QJTB 1LLHA 1P5CA 1E0PA 1P8HA 4G7SB 4BEZA 232LA 5H2KA 221LA 3RZEA 1L17A 162LA 2B6WA 191LA 1L08A 4QIDA 234LA 3NY9A 3L2XA 4W57A 1L98A 1L65A 3CODA 2YCXA 2ZZLA 3GUNA 2I1XA 1L42A 4ARMB 1L39A 2Z55A 5H2IA 127LA 3UTYA 2KSAA 5ITCA 3QAKA 1QSQA 4W52A 1L11A 2CUUA 248LA 4I7MA 1R2NA 5JJEA 4L6RA 1XJUA 1L28A 2Q9DA 3C83A 1C69A 1PQOA 146LA 3DMZA 4XTNA 1P3NA 4A4MA 1L35A 152LA 1CV1A 1SWYA 258LA 4XT1A 1CU0A 2B7XA 1L70A 1JTNA 199LA 2O7AA 2RB2X 1L85A 1LYIA 1P37A 145LA 3QJVB 2HUMA 262LA 2OE4X 1QHJA 2RH1A 2WJLA 156LA 1LYHA 2KSYA 224LA 5G54A 4FAAB 1C6CA 1P46A 220LA 1L74A 3CDQA 1C61A 4EKPA 5AWZA 142LA 197LA 1E12A 4ARJA 239LA 1L77A 1PQJA 4GPOA 1P64A 4NC3A 130LA 4PK0A 2IGCA 2AT9A 1UAZA 1L68A 5H2OA 3GUOA 3PXOA 3REYA 226LA 1L32A 1T6HA 225LA 3UTWA 4UHRA 103LA 1QKPA 3SB9A 4EKSA 217LA 213LA 1L91A 1CTWA 3CDRA 1G0LA 212LA 115LA 1SX7A 3HDEA 4MBSA 3OE6A 3S3BB 2Q9EA 3DN0A 4EJ4A 1F50A 1JV6A 1T8FA 182LA 1DYFA 4YXCA 1L97A 1JV7A 123LA 1G1VA 4FPDA 1DZEA 172LA 2RBSA 1L48A 1L30A 3PDSA 4HWLA 1QS5A 4W56A 4GYCA 235LA 5B34A 1L76A 3HU9A 2G87A 1D3JA 2J4YA 5BR5A 1G0GA 1O0AA 1PQDA 3L64A 1H68A 3SN6R 228LA 1L99A 1FBBA 2NTWA 1L92A 1XMEB 4G70B 254LA 1L20A 3CDOA 3SB5A 4IAPA 4UG2A 3EH4B 223LA 3QBGA 2OTZX 109LA 1JFPA 4LZMA 1L61A 1KY0A 1DYBA 3KJ6A 205LA 5DHGA 1L18A 1CU2A 1L24A 2LNLA 2B74A 1HZXA 3DN8A 3GUJA 4YXAC 2ANVA 1G0QA 5A45A 1C63A 1C6TA 1TN5A 137LA 1L19A 1L41A 3ODUA 1L38A 1L81A 4I7QA 3QJUB 1L57A 249LA 3S3CB 1L89A 1QTBA 1XEPA 1I6SA 1T97A 3PQRA 1U19A 1L13A 3QBKA 1L0JA 2RAYX 3HAOA 5H2NA 1L75A 1L00A 3X3CA 3G3WA 1ZURA 3HARA 242LA 1C6MA 1C6KA 1PXSA 1S8JA 1G0JA 1P8UA 176LA 1CU5A 1L14A 1L90A 1C6HA 3EH3B 3HASA 4W58A 1QS9A 1L34A 1L31A 2A4TA 1C6BA 1KMEA 3SBBC 1LYEA 4GBRA 1BRDA 118LA 149LA 1L06A 5G2DA 2NTHA 3OE0A 126LA 3UTVA 1LYGA 1LN6A 4LDEA 3C8RA 1GU8A 1L04A 231LA 180LA 1C68A 3SB6A 5G2AA 3UTXA 163LA 201LA 1PY6A 4MQTA 1KG8A 1CV5A 237LA 252LA 4IB4A 1C65A 4WAVA 3QJSB 2OU8A 1CU6A 1L0MA 1KS3A 4PXFA 3VG9A 1QUDA 3C8SA 3F8VA 1H2SA 5JJNA 3C81A 3S8GB 185LA 4ARQA 215LA 4GP5B 4IARA 3JR6A 4HYJA 1TN0A 3DMXA 1JGJA 119LA 5LWEA 4I7LA 260LA 1L83A 112LA 1L37A 1LGUA 1M0KA 4E97A 2O79A 5LZMA 2JAGA 4I7JA 1X0I1 247LA 3WQJA 6LZMA 1L02A 4N4WA 244LA 4GRVA 1M0LA 1D3MA 1C6NA 1C62A 2F32A 1ZWNA 3PWHA 1D2WA 1L72A 1C6IA 1P7SA 1L60A 1QT3A 1L84A 184LA 1BRXA 4JR8A 4X1HA 5B0WA 4EKRA 3HUAA 1SSYA 2I21A 1B6IA 128LA 259LA 246LA 1T8AA 3DNAA 5H2JA 4ARLA 1QTHA 168LA 3HT7A 2M3GA 155LA 1T8GA 3UG9A 2L78A 1L73A 1CWQA 150LA 1LI2A 1L45A 3HWLA 1L66A 1SWZA 1L87A 1IW6A 169LA 1PQIA 4EPIA 1S52A 5B35A 1OV7A 3HUKA 4ZPUA 3HT6A 2YDVA 3OAXA 3QJQB 3ZPQA 5A44A 2LC9A 5ITEA 1L05A 3NY8A 3DKEX 3ZPRA 1KY1A 2ANXA 165LA 3QDCA 3QBIA 4GP8B 3DN4A 5B6VA 3S8FB 1CU3A 3FI5A 4AMJA 181LA 1C60A 257LA 1CVKA 3C80A 1S54A 3LZMA 1JQUA 1EHKB 1QTVA 3C7YA 3NYAA 3HUQA 230LA 198LA 4G7QB 4KNFA 4MD2A 1L36A 1KG9A 3HANA 1Q5JA 1C6DA 1QTCA 3AM6A 158LA 1L50A 1QT5A 3EMLA 1L0KA 4Y9HA 3UZAA 1KGBA 4AMIA 1S51A 1QTDA 2Z73A 2OTYX 5C1MA 3V2WA 3VHZA 2ZFEA 122LA 3C7ZA 2Y03A 1K28A 240LA 5H2MA 3HT9A 4DJHA 1L93A 5FJGA 1KNIA 3C7WA 3HH6A 1FBKA 3P0GA 3HH5A 2QARC 2I20A 4BWBA 1AP9A 5AHYA 4EA3A 1P6YA 4BV0A 1L07A 159LA 1LYDA 1LWKA 1OVKA 1SSWA 2OEAX 3ZEVA 1L15A 3QBLA 3VI0A 151LA 1XJIA 1C64A 2OU0X 1C6QA 1G07A 1L33A 1OWYA 5B6WA 1LYJA 4X32A 139LA 3DN3A 4EIYA 2RBRA 1C6AA 2YDOA 3COCA 5AX1A 2LCBA 3DDLA 4N6HA 1G1WA 1OV5A 3G3XA 1L12A 186LA 1QUHA 107LA 4JKVA 5AX0A 1L22A 1GUEA 250LA 3C9MA 5G36A 1DYDA 1L86A 1XJTA 4DKLA 1G06A 1L94A 2RBQA 1VJMA 2Y02A 2B75A 4YX7C 1L44A 222LA 3GULA 1L96A 1QT7A 1L9HA 1VGOA 2QPDB 2YCZA 1L67A 3OE9A 4ARQB 5F8UA 1L51A 1C6EA 160LA 1LGWA 2ZIYA 4N4YB 5ETZA 4OV0A 1CUQA 1ZYTA 2RBOA 1C67A 3DMVA 3X3BA 3UZCA 125LA 4G71B 4AQNA 1CV0A 2O4WA 4L35A 1KW7A 1G0PA 216LA 4LDLA 1QT6A 1GZMA 143LA 1L71A 113LA 1D3NA 3GUIA 2WJKA 3HTDA 147LA 183LA 1CV4A 3GUKA 1LI6A 3G3VA 174LA 1QT8A 2Y01A 5DHHA 1LWGA 4W59A 3CDTA 1L53A 4TL3A 5G53A 4KLYA 5B6YA 1L23A 1LW9A 3A7KA 187LA 1P2LA 5EN0A 4LDOA 3HU8A 1L69A 2R4SA 1QKOA 2PEDA 102LA 1P8IA 3HAPA 144LA 1DYGA 170LA 2B6TA 1QSBA 1L59A 3DN2A 3DN6A 1L21A 2YCWA 243LA 3FADA 3FA0A 4MQSA 2HPYA 5J7AA 4MD1A 2B73A 2OE9X 3V2YA 1C6LA 3CDVA 2NTUA 1G0KA 3GUMA 166LA 4I7NA 3VW7A 4W51A 3QAPA 245LA 164LA 1L47A 4I7PA 4K5YA 4G72B 1L49A 4I7SA 4G7RB 4BVNA 190LA 195LA 4EKQA 3SBAA 2JAFA 1P36A 4I7RA 1IW9A 4XT3A 3UONA 241LA 3NSBA 1Q5IA 1PXRA 3GUPA 161LA 3HTBA 4OO9A 3VVKA 1QUGA 192LA 2RBPA 114LA 1S53A 1L03A 1L54A 5A8EA 3MBVA 1DYAA 1BRRA 1UCQA 5TGZA 1QT4A 2Z6BA 2B6ZA 1TLAA 1L46A 2L6XA 5BR2A 5KKHA 140LA 3BVDB 1L62A 4XTOA 1L64A 5AZDA 1L10A 4DAJA 4ARMA 196LA 3C82A 1LI3A 3SB7A 4I7OA 2RBNA 189LA 2QPEB 2Y00A 3HTGA 5G2CA 1L09A 1KW5A 4IAQA 175LA 251LA 4QI1A 1CUPA 178LA 171LA 3NS0A 2OE7X 2QB0B 1OYUA 1L58A 1S8LA 3C9LA 3HTFA 4W53A 1MGYA 4GP4B 1LGXA 3VGAA 120LA 1CV6A 1X0SA 5H2HA 157LA 3D4SA 4FA7B 206LA 2F93A 3F9LA 3DN1A 4ARPA 2YCYA 5G28A 1G0MA 2B72A 3AYNA 2RB0X 4J4QA 3HH4A 227LA 1L80A 1SX2A 111LA 5B6XA 219LA 1JTMA 229LA 1CX6A 2F2QA 3EH5B 4WW3A 210LA 1D2YA 5JJJA 1D9WA 2X72A 3QJRB 3C8QA 177LA 3RUNA 1F88A 2I35A 4BEYA 2F95A 188LA 3S3DB 1R84A 1QUOA 1P56A 4I7KA 1NHBA 1QTZA 4PXKA 1CV3A 1LYFA 1BM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
255LA 1PQMA 3WPKA 4ETCA 2HULA 5L3IA 3TXFA 148LE 4GN4A 5DYSA 1EL1A 4PJZA 1HEWA 5KXNA 1IP6A 3HDFA 238LA 1LHKA 5F9XA 1L56A 3OE8A 5KXPA 1DYEA 3HT8A 108LA 4TUNA 4XXJA 3HH3A 1LCNA 2VT4A 4NY5A 104LA 1JTOL 4PRUA 2BQEA 1LZAA 4XJIA 2H9JA 4DDCA 2NTGA 4JQ6A 1GEVA 5HNLA 4Z41A 4H8YA 1GXXA 138LA 1L40A 3EO5A 4BUOA 1C6JA 1F0WA 4J1AA 4W94A 1GXV2 1L26A 2B6XA 4LT1A 5H2PA 4H9EA 5LVJA 4S0WA 1GF3A 5B6ZA 261LA 4HYXA 1C6GA 5I4WA 3QJTB 1LLHA 1UIHA 3LYOA 2ZYPA 162LA 5KXRA 4GCDA 2G4NA 1B7PA 1L98A 4DDAA 4KPMA 1LYOA 1UICA 5KXWA 5ITCA 3QAKA 4W52A 2CUUA 4I7MA 1R2NA 5E4PA 1UIAA 1RJCB 2PC2A 3C83A 3DMZA 5FDJA 5I5QA 4XTNA 1L35A 1CV1A 258LA 2B7XA 3ZEKA 1L70A 1CJ6A 1KIRC 3WW5A 4EOFA 1L85A 1GFRA 1LYIA 1LJFA 3QJVB 2HUMA 2W1YA 262LA 4ETAA 3TXIA 4DQ5A 156LA 4ZFPA 3ZVQB 1LMQA 1L74A 1C61A 3N9CA 1HNLA 4ARJA 2D4JA 5E9RA 1L68A 2ZNWY 3UTWA 1QKPA 1J1PY 1CTWA 4OWAA 5D5FA 1SX7A 3DN0A 3WMKA 1AZFA 2N5ZA 1G1VA 4FPDA 4ML7A 172LA 3AW7A 3PDSA 4HWLA 2Z18A 1ZMYL 2FBDA 1WTNA 2CDSA 235LA 1HEMA 2RSCA 2G87A 2F4AA 4TWSA 2Z38A 1G0GA 3W3EA 4YEOA 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 1JQU A;  1EHK B;  1QTV A;  3C7Y A;  3NYA A;  3HUQ A;  230L A;  198L A;  4G7Q B;  4KNF A;  4MD2 A;  1L36 A;  1KG9 A;  3HAN A;  1Q5J A;  1C6D A;  1QTC A;  3AM6 A;  158L A;  1L50 A;  1QT5 A;  3EML A;  1L0K A;  4Y9H A;  3UZA A;  1KGB A;  4AMI A;  1S51 A;  1QTD A;  2Z73 A;  2OTY X;  5C1M A;  3V2W A;  3VHZ A;  2ZFE A;  122L A;  3C7Z A;  2Y03 A;  1K28 A;  240L A;  5H2M A;  3HT9 A;  4DJH A;  1L93 A;  5FJG A;  1KNI A;  3C7W A;  3HH6 A;  1FBK A;  3P0G A;  3HH5 A;  2QAR C;  2I20 A;  4BWB A;  1AP9 A;  5AHY A;  4EA3 A;  1P6Y A;  4BV0 A;  1L07 A;  159L A;  1LYD A;  1LWK A;  1OVK A;  1SSW A;  2OEA X;  3ZEV A;  1L15 A;  3QBL A;  3VI0 A;  151L A;  1XJI A;  1C64 A;  2OU0 X;  1C6Q A;  1G07 A;  1L33 A;  1OWY A;  5B6W A;  1LYJ A;  4X32 A;  139L A;  3DN3 A;  4EIY A;  2RBR A;  1C6A A;  2YDO A;  3COC A;  5AX1 A;  2LCB A;  3DDL A;  4N6H A;  1G1W A;  1OV5 A;  3G3X A;  1L12 A;  186L A;  1QUH A;  107L A;  4JKV A;  5AX0 A;  1L22 A;  1GUE A;  250L A;  3C9M A;  5G36 A;  1DYD A;  1L86 A;  1XJT A;  4DKL A;  1G06 A;  1L94 A; 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 3VW7 A;  4W51 A;  3QAP A;  245L A;  164L A;  1L47 A;  4I7P A;  4K5Y A;  4G72 B;  1L49 A;  4I7S A;  4G7R B;  4BVN A;  190L A;  195L A;  4EKQ A;  3SBA A;  2JAF A;  1P36 A;  4I7R A;  1IW9 A;  4XT3 A;  3UON A;  241L A;  3NSB A;  1Q5I A;  1PXR A;  3GUP A;  161L A;  3HTB A;  4OO9 A;  3VVK A;  1QUG A;  192L A;  2RBP A;  114L A;  1S53 A;  1L03 A;  1L54 A;  5A8E A;  3MBV A;  1DYA A;  1BRR A;  1UCQ A;  5TGZ A;  1QT4 A;  2Z6B A;  2B6Z A;  1TLA A;  1L46 A;  2L6X A;  5BR2 A;  5KKH A;  140L A;  3BVD B;  1L62 A;  4XTO A;  1L64 A;  5AZD A;  1L10 A;  4DAJ A;  4ARM A;  196L A;  3C82 A;  1LI3 A;  3SB7 A;  4I7O A;  2RBN A;  189L A;  2QPE B;  2Y00 A;  3HTG A;  5G2C A;  1L09 A;  1KW5 A;  4IAQ A;  175L A;  251L A;  4QI1 A;  1CUP A;  178L A;  171L A;  3NS0 A;  2OE7 X;  2QB0 B;  1OYU A;  1L58 A;  1S8L A;  3C9L A;  3HTF A;  4W53 A;  1MGY A;  4GP4 B;  1LGX A;  3VGA A;  120L A;  1CV6 A;  1X0S A;  5H2H A;  157L A;  3D4S A;  4FA7 B;  206L A;  2F93 A;  3F9L A;  3DN1 A;  4ARP A;  2YCY A;  5G28 A;  1G0M A;  2B72 A;  3AYN A;  2RB0 X;  4J4Q A;  3HH4 A;  227L A;  1L80 A;  1SX2 A;  111L A;  5B6X A;  219L A;  1JTM A;  229L A;  1CX6 A;  2F2Q A;  3EH5 B;  4WW3 A;  210L A;  1D2Y A;  5JJJ A;  1D9W A;  2X72 A;  3QJR B;  3C8Q A;  177L A;  3RUN A;  1F88 A;  2I35 A;  4BEY A;  2F95 A;  188L A;  3S3D B;  1R84 A;  1QUO A;  1P56 A;  4I7K A;  1NHB A;  1QTZ A;  4PXK A;  1CV3 A;  1LYF A;  1BM1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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