4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Rattus norvegicus
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
248LA 1S52A 3CODA 219LA 1KY0A 1L79A 201LA 1L03A 5A44A 1QUGA 232LA 171LA 225LA 3UONA 245LA 1T97A 2HUKA 4LZMA 1L23A 241LA 4AQNA 181LA 1L20A 4EJ4A 4DAJA 1L35A 2LC9A 3HWLA 4I7NA 4W57A 4KNFA 1L51A 3DDLA 3UG9A 1L38A 222LA 5J7AA 113LA 5DHHA 152LA 5B6XA 2A4TA 1LW9A 1X0SA 1ZYTA 1C3WA 1P56A 1T8FA 4A4MA 214LA 192LA 1C6AA 197LA 3QJVB 2RH1A 3V2YA 1QT6A 250LA 2YCYA 151LA 1L16A 2OU8A 1L60A 1KW7A 4GP8B 5DHGA 3S8GB 244LA 3HTDA 3S3CB 5DYSA 4GPOA 2O4WA 1DYEA 4W53A 2RBSA 1HZXA 2O79A 1EPYA 4HYXA 2Y02A 3S8FB 243LA 3GUMA 3HTBA 1L71A 4QI1A 104LA 1OVJA 1GZMA 3SN6R 4ARQB 1X0K1 1OWYA 186LA 1CVKA 3VI0A 3DN4A 1TLAA 146LA 1L50A 1NHBA 5B0WA 157LA 1L19A 4G7RB 3OE8A 1GUEA 2JAGA 160LA 3GUJA 4GBRA 4EXMA 2JAFA 1G0QA 1QM8A 2LCBA 1L77A 139LA 1D2WA 2F32A 2OU0X 216LA 1L0MA 3ZEVA 3PXOA 3F8VA 1G0GA 1P2LA 3D4SA 1CWQA 1S8LA 1CV3A 1CV4A 1L61A 4I7TA 5EN0A 3HTFA 3X3CA 3AYNA 3NY8A 1L32A 3DMZA 3SB7A 4TL3A 1P6YA 1L27A 1LI3A 3DN2A 3HASA 2R4RA 5JJJA 3EH4B 2HULA 4JQ6A 1LGXA 233LA 5H2MA 4IB4A 112LA 3HH3A 1C6HA 4LDLA 205LA 3HANA 2RB2X 234LA 1QT7A 2Q9DA 3DMXA 4I7KA 1PXSA 3HT6A 1JFPA 211LA 3SBAA 1PXRA 1LLHA 3HT9A 1LYJA 5TGZA 3A7KA 1SX7A 3P0GA 1L13A 2YCZA 1L54A 4BV0A 4WAVA 5H2KA 2NTWA 1G07A 226LA 1L14A 126LA 4W52A 162LA 1L39A 1OVHA 3RZEA 3RUNA 4I7OA 2B6TA 1P2RA 4GP5B 143LA 236LA 1L64A 1TN0A 1LYIA 3KJ6A 1L9HA 1F50A 1TN5A 1L24A 2RBPA 5I14A 4N4YB 2B75A 4FA7B 4NC3A 2B72A 1L82A 177LA 3QAKA 1E0PA 1CV1A 3DQBA 3VGAA 148LE 1CU0A 2QB0B 4PXKA 5KKHA 3AYMA 1CX7A 2B6YA 1DYGA 1XIOA 3HAPA 4E97A 3DN8A 4W59A 239LA 3DMVA 4GYCA 109LA 131LA 147LA 3GUIA 5G28A 1L40A 2KSBA 1LYGA 144LA 212LA 1C8RA 2R4SA 5G2AA 1C68A 2OE4X 1B6IA 4GBRB 1CU5A 218LA 2Z55A 1FBBA 1GU8A 4I7LA 161LA 5ITCA 1JTMA 1L33A 4EPFA 227LA 3ABWA 5G53A 165LA 3HDEA 3C80A 1LGWA 3HAQA 215LA 1C63A 4WW3A 3C9LA 1C8SA 3SB5A 1H68A 4MD1A 4N4WA 4BVNA 3DN3A 1EHKB 1R84A 224LA 1C6EA 159LA 3G3WA 4MD2A 5JJNA 5FJGA 242LA 5A8EA 1L29A 1XJIA 1L44A 3LZMA 3C9MA 1QKPA 138LA 1L06A 3HH4A 1G0MA 2QARC 1G0JA 3CDTA 2NTUA 3QBGA 1L31A 2F93A 1P5CA 1C61A 1D9WA 3HDFA 2WJLA 3UTVA 1L00A 4EKPA 3QDCA 1LI2A 1CTWA 4BEZA 166LA 261LA 3RFMA 1QTCA 1VJMA 4OV0A 4X1HA 4EIYA 3HU8A 170LA 1L42A 4GRVA 1L90A 2B74A 1F88A 1C62A 127LA 1SX2A 172LA 2RBNA 237LA 1L93A 4S0WA 5B6WA 1LWKA 2I20A 169LA 3CDVA 1L80A 1L70A 184LA 1LYHA 1LPYA 3HH6A 1L46A 2YCXA 228LA 2RBOA 5B6YA 4I7MA 4XTLA 3S3BB 114LA 1QUOA 3OAXA 5AX1A 3QJUB 1L43A 3C8RA 4AMIA 1UAZA 2OTZX 213LA 4X32A 1L18A 1AP9A 2BRDA 2B6XA 4HYJA 3V2WA 4I7JA 260LA 1G0PA 1MGYA 1QSBA 1L26A 4ZPUA 253LA 4ARMA 235LA 1L83A 5AWZA 167LA 1QT3A 1L68A 251LA 4FAAB 200LA 1R2NA 4XT3A 5G36A 2OEAX 4K5YA 140LA 1DYAA 3NYAA 5C1MA 3UZCA 1C66A 2I1XA 4ARJA 1C60A 4W55A 4G71B 255LA 4ARPA 5A45A 1L63A 2RAZX 3X3BA 2Y01A 1C6KA 2L78A 3DN6A 111LA 1JGJA 2RB1X 1BRXA 221LA 4EA3A 1CV5A 3VW7A 4W58A 3CAPA 1LYDA 1L73A 2RB0X 4LDEA 3HU9A 5ETZA 188LA 2QPEB 3SB6A 2RBQA 4IAQA 1L04A 1L57A 5H2OA 1PQKA 4FBZA 4YX7C 2YDVA 3QJSB 191LA 1S54A 1P7SA 3VG9A 1L25A 3G3XA 185LA 2RAYX 230LA 175LA 3HT7A 125LA 1QTVA 183LA 1P64A 3HUKA 2B6ZA 3QJQB 123LA 1QTHA 223LA 1OV7A 3WQJA 262LA 1L95A 1L12A 4ARLA 1L92A 2B73A 1BRRA 2KS9A 231LA 1G06A 1ZURA 2Q9EA 182LA 1L85A 1U19A 1L96A 4G70B 3SBBC 3ZPRA 3JR6A 3NS0A 240LA 3CDOA 1P8IA 1CV0A 1E12A 1G0LA 2HPYA 1L62A 1M0LA 3GUPA 145LA 2I21A 1DYFA 1LWGA 1JQUA 3PBLA 4XTOA 5AHZA 1KG9A 4EKQA 3HT8A 2YDOA 246LA 2Z6BA 2YCWA 1L0JA 3CDQA 2Y00A 4G72B 3S3DB 5H2JA 1PQIA 3UTYA 1C6NA 2HUMA 1O0AA 1P36A 1D3FA 1L67A 2OTYX 1D3MA 3G3VA 1C6PA 4FPDA 3VHZA 4ARMB 1L08A 1L91A 1OYUA 2NTGA 2RBRA 1C64A 1DYBA 2KSYA 164LA 2OE7X 257LA 1KNIA 1LYEA 4EKRA 168LA 163LA 1X0I1 259LA 1P3NA 4QIDA 1L11A 1T8AA 149LA 1QSQA 1L84A 1L45A 155LA 2O7AA 2G87A 4XXJA 1LN6A 1L30A 1ZWNA 4BWBA 1IW6A 1C6CA 1IXFA 142LA 1P46A 3GUNA 1JTNA 1BRDA 1XMEB 189LA 1L86A 4MBSA 2OU9A 4W51A 4EKSA 1PQMA 1S51A 1L58A 1IW9A 3T45A 1OV5A 3SB8A 5G2DA 1CV6A 1L94A 190LA 3QJRB 1L81A 1D2YA 2Y03A 3ZPQA 2EI4A 4XTNA 4OO9A 1QS5A 1QUDA 252LA 238LA 4Y9HA 1T6HA 198LA 1G1WA 128LA 3ODUA 5B35A 1L36A 1C65A 1L87A 1L09A 1L89A 1SSYA 1P8HA 1Q5JA 178LA 2AT9A 2WJKA 258LA 5G54A 1L74A 1M0KA 3C81A 1L05A 3GUOA 4W54A 254LA 3EH5B 4L6RA 1C6IA 1C67A 1L76A 3DNAA 4I7QA 5B34A 187LA 3C7ZA 1QT5A 1C6JA 3HUAA 3PWHA 6LZMA 1C6DA 5BR5A 129LA 1L69A 1XJTA 2QPDB 199LA 3CDRA 1LI6A 1L97A 5BR2A 156LA 1G1VA 1QTZA 1Q5IA 3HUQA 2L6XA 1L72A 2B6WA 4DKLA 1C6BA 1LYFA 3NSBA 5B6ZA 1C6TA 1L48A 1T8GA 1L21A 5F8UA 2IGCA 1PQOA 5LWEA 1F4ZA 1PY6A 2ZZLA 3C83A 2ANXA 3MBVA 3UTXA 1JV7A 1QT4A 3GULA 4W56A 2ZIYA 4LDOA 1L28A 1L47A 1QTDA 3C8SA 1L34A 1L10A 1M0MA 3UTWA 1QS9A 3C7WA 4G7SB 4AMJA 1OVKA 1CUQA 1P37A 5H2PA 7LZMA 2OE9X 1CX6A 3FADA 3QAPA 3QBLA 4XT1A 174LA 4DJHA 2ZFEA 137LA 4PK0A 150LA 3DN1A 3GUKA 4I7SA 4BEYA 1XEPA 4IARA 1L55A 1UCQA 1SWYA 1QHJA 3QJTB 1CU2A 1L02A 4JKVA 3F9LA 4IAPA 2KSAA 130LA 4MQTA 3REYA 107LA 110LA 1L15A 1L0KA 4UHRA 1CU6A 3DN0A 5ITEA 5JJEA 108LA 1L88A 1D3JA 1QKOA 4BUOA 1L65A 1S8JA 2LNLA 1SWZA 1L01A 119LA 2Y04A 3BVDB 4UG2A 3C7YA 3OE9A 2F95A 3FA0A 256LA 1L99A 1L41A 4PXFA 1PQDA 1S53A 2VT4A 4L35A 141LA 176LA 2J4YA 1P8UA 1QTBA 206LA 103LA 1L37A 118LA 1QUHA 3EMLA 195LA 1L75A 4X31A 5AX0A 2NTHA 4HWLA 3NY9A 1KGBA 1G0KA 249LA 1C6LA 1L07A 1JV6A 1VGOA 2B70A 1D3NA 1PQJA 210LA 209LA 247LA 1L53A 1DYDA 3DKEX 3K2RA 3OE0A 3UZAA 4MQSA 3COCA 2X72A 4KLYA 5H2IA 1L49A 2F47A 4G7QB 2PEDA 1KS3A 1BM1A 196LA 3QBIA 5B2NA 1C6GA 1L98A 1KMEA 3C8QA 3EH3B 1QT8A 1CU3A 4YXAC 1AT9A 1H2SA 2ANVA 5B6VA 3L2XA 1L59A 2M3GA 1KW5A 3HH5A 120LA 2Z73A 3PQRA 3PDSA 4GP4B 1L17A 1LGUA 1I6SA 2CUUA 4ARQA 3HAOA 4J4QA 5H2HA 1L52A 3HTGA 1DZEA 3FI5A 1FBKA 3AM6A 180LA 4PJZA 1K28A 220LA 229LA 4N6HA 217LA 5H2LA 5AZDA 173LA 1KY1A 4YXCA 5AHYA 3OE6A 5H2NA 4EPIA 1WTHA 115LA 4I7PA 5LZMA 1C69A 2LZMA 3SB9A 1L22A 1OWZA 1C6MA 3L64A 122LA 2F2QA 1C6FA 1KG8A 1L56A 3VVKA 3C82A 3QBKA 4I7RA 102LA 1L66A 158LA 1XJUA 2I35A 1SSWA 5G2CA 1CUPA 1DYCA 2B7XA 4JR8A 1C6QA 3HARA 4QRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KY0A 1QUGA 232LA 3B0KA 225LA 245LA 3N9EA 1L23A 241LA 5FSTA 4AQNA 1L35A 2LC9A 5KXWA 3UG9A 4KNFA 1L51A 1DZBX 5B6XA 2A4TA 1C3WA 1T8FA 1BB5A 3QJVB 1DKJA 1YKXX 151LA 1L16A 2ZIJA 2H5ZA 1KW7A 1HZXA 1DYEA 4W53A 2RBSA 1JTPL 2O79A 4ETBA 5DL9A 1XEKA 2Y02A 1ZVYB 3GUMA 5L3HA 1LZ6A 1YKYX 4RW2A 1VDQA 3FI7A 1X0K1 186LA 1C43A 1B7QA 3DN4A 1TLAA 146LA 1GE2A 1LHKA 3ZVQB 1GUEA 5A3ZA 2YDGA 3OK0A 139LA 1D2WA 1LZNA 3PXOA 1S8LA 4HP0A 5EN0A 1LYOA 3WULA 3X3CA 1LZ1A 3AYNA 4H93A 3SB7A 1P6YA 1NQIA 1YROA 1HHLA 5HMJA 3DN2A 1NWGA 4H94A 3HASA 1LHHA 2HULA 5HNCA 1C6HA 1TBYA 4XYYA 4HJZA 1PXRA 1LYJA 3T6UA 2YCZA 4N1CC 4WAVA 5H2KA 2NTWA 1G07A 1JTOL 1L39A 1T6VL 1IWTA 3W6AA 1OUFA 1E8LA 4NIJA 1CKFA 4NWEA 4ETAA 2RBPA 2HEAA 4DQJA 1YIKA 1E0PA 3QAKA 1JISA 1O23A 4NG1A 4E97A 1GFRA 3DMVA 4DD7A 2KSBA 2BQLA 144LA 212LA 1C8RA 1YQVY 5G2AA 3A96A 5AMYA 4XADA 1HEWA 1B6IA 2OE4X 218LA 2CDSA 1LKRA 2BQMA 5ITCA 1JTMA 1C10A 1YAQA 3CT5A 2YSSC 1C63A 2LYZA 1CKGA 3SB5A 5KXLA 1B5WA 4WO9A 5JJNA 3W3EA 1FLWA 1L29A 1QKPA 1GBSA 4PRUA 2F93A 4IASA 5LXWA 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 2RBR A;  1C64 A;  1DYB A;  2KSY A;  164L A;  2OE7 X;  257L A;  1KNI A;  1LYE A;  4EKR A;  168L A;  163L A;  1X0I 1;  259L A;  1P3N A;  4QID A;  1L11 A;  1T8A A;  149L A;  1QSQ A;  1L84 A;  1L45 A;  155L A;  2O7A A;  2G87 A;  4XXJ A;  1LN6 A;  1L30 A;  1ZWN A;  4BWB A;  1IW6 A;  1C6C A;  1IXF A;  142L A;  1P46 A;  3GUN A;  1JTN A;  1BRD A;  1XME B;  189L A;  1L86 A;  4MBS A;  2OU9 A;  4W51 A;  4EKS A;  1PQM A;  1S51 A;  1L58 A;  1IW9 A;  3T45 A;  1OV5 A;  3SB8 A;  5G2D A;  1CV6 A;  1L94 A;  190L A;  3QJR B;  1L81 A;  1D2Y A;  2Y03 A;  3ZPQ A;  2EI4 A;  4XTN A;  4OO9 A;  1QS5 A;  1QUD A;  252L A;  238L A;  4Y9H A;  1T6H A;  198L A;  1G1W A;  128L A;  3ODU A;  5B35 A;  1L36 A;  1C65 A;  1L87 A;  1L09 A;  1L89 A;  1SSY A;  1P8H A;  1Q5J A;  178L A;  2AT9 A;  2WJK A;  258L A;  5G54 A;  1L74 A;  1M0K A;  3C81 A;  1L05 A;  3GUO A;  4W54 A;  254L A;  3EH5 B;  4L6R A;  1C6I A;  1C67 A;  1L76 A;  3DNA A;  4I7Q A;  5B34 A;  187L A;  3C7Z A;  1QT5 A;  1C6J A;  3HUA A;  3PWH A;  6LZM A;  1C6D A;  5BR5 A; 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 2Y04 A;  3BVD B;  4UG2 A;  3C7Y A;  3OE9 A;  2F95 A;  3FA0 A;  256L A;  1L99 A;  1L41 A;  4PXF A;  1PQD A;  1S53 A;  2VT4 A;  4L35 A;  141L A;  176L A;  2J4Y A;  1P8U A;  1QTB A;  206L A;  103L A;  1L37 A;  118L A;  1QUH A;  3EML A;  195L A;  1L75 A;  4X31 A;  5AX0 A;  2NTH A;  4HWL A;  3NY9 A;  1KGB A;  1G0K A;  249L A;  1C6L A;  1L07 A;  1JV6 A;  1VGO A;  2B70 A;  1D3N A;  1PQJ A;  210L A;  209L A;  247L A;  1L53 A;  1DYD A;  3DKE X;  3K2R A;  3OE0 A;  3UZA A;  4MQS A;  3COC A;  2X72 A;  4KLY A;  5H2I A;  1L49 A;  2F47 A;  4G7Q B;  2PED A;  1KS3 A;  1BM1 A;  196L A;  3QBI A;  5B2N A;  1C6G A;  1L98 A;  1KME A;  3C8Q A;  3EH3 B;  1QT8 A;  1CU3 A;  4YXA C;  1AT9 A;  1H2S A;  2ANV A;  5B6V A;  3L2X A;  1L59 A;  2M3G A;  1KW5 A;  3HH5 A;  120L A;  2Z73 A;  3PQR A;  3PDS A;  4GP4 B;  1L17 A;  1LGU A;  1I6S A;  2CUU A;  4ARQ A;  3HAO A;  4J4Q A;  5H2H A;  1L52 A;  3HTG A;  1DZE A;  3FI5 A;  1FBK A;  3AM6 A;  180L A;  4PJZ A;  1K28 A;  220L A;  229L A;  4N6H A;  217L A;  5H2L A;  5AZD A;  173L A;  1KY1 A;  4YXC A;  5AHY A;  3OE6 A;  5H2N A;  4EPI A;  1WTH A;  115L A;  4I7P A;  5LZM A;  1C69 A;  2LZM A;  3SB9 A;  1L22 A;  1OWZ A;  1C6M A;  3L64 A;  122L A;  2F2Q A;  1C6F A;  1KG8 A;  1L56 A;  3VVK A;  3C82 A;  3QBK A;  4I7R A;  102L A;  1L66 A;  158L A;  1XJU A;  2I35 A;  1SSW A;  5G2C A;  1CUP A;  1DYC A;  2B7X A;  4JR8 A;  1C6Q A;  3HAR A;  4QRY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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