4DKLA

Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
MVTAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGNILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIVNVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALITIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/antagonist
molecule keywords Mu-type opioid receptor, lysozyme chimera
publication title Crystal structure of the {mu}-opioid receptor bound to a morphinan antagonist.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 160
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dklA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dklA01
4G70B 4EPFA 1L46A 4WW3A 198LA 4OV0A 5DHGA 1P36A 4X31A 3RUNA 1C6FA 1X0K1 3HH6A 1OV5A 1WTHA 231LA 1PQDA 1C6MA 215LA 1L59A 2HUKA 4W57A 3LZMA 4GP5B 5G54A 3DN1A 4ARMA 1L61A 1KY0A 2ANXA 1L24A 4MQSA 1LYIA 5G2CA 1L69A 159LA 3FI5A 1C6AA 1P37A 4Y9HA 1C6LA 4HYJA 4N6HA 1DZEA 2OU8A 4PJZA 5AHZA 1L71A 1PXRA 168LA 205LA 1L05A 1L02A 3HTGA 2RBSA 172LA 3CDTA 2HPYA 1CV4A 1ZWNA 184LA 175LA 195LA 1L16A 165LA 245LA 3V2WA 1DYEA 4BWBA 1L63A 3VGAA 1P8IA 5JJNA 1LYDA 4MD1A 3UZCA 157LA 2OU0X 1S8JA 1U19A 1L26A 1L67A 3KJ6A 137LA 1L0MA 149LA 4X1HA 1C61A 1KNIA 1L00A 1L21A 2RAYX 3HH3A 1QTZA 3C8SA 2L78A 196LA 2RBRA 2F95A 2Y02A 3DN0A 5H2PA 3QJVB 1G0GA 1C6GA 1G06A 1LI6A 3CDRA 1G1WA 4L6RA 248LA 3S8GB 151LA 3RFMA 1G0KA 2RB1X 3COCA 4ARQA 2KSAA 3G3WA 4W56A 258LA 1C8SA 5DYSA 1L04A 5B35A 1C6CA 1LPYA 189LA 1UAZA 4GRVA 5LZMA 171LA 1CU5A 166LA 3HUKA 2KS9A 2B6ZA 1QT8A 219LA 5G2DA 4GP8B 3C9LA 251LA 5A8EA 1D3JA 228LA 3C7WA 3DMXA 1L77A 1ZURA 5H2KA 3HTBA 1L88A 1L29A 2IGCA 256LA 120LA 2YCWA 1E0PA 4MQTA 5AWZA 1QUGA 146LA 2EI4A 2WJLA 1KS3A 190LA 4LZMA 1E12A 3AYNA 3QJUB 109LA 5DHHA 3ZPQA 1P8HA 4XTOA 1L06A 2B7XA 3QBKA 5BR2A 1D3NA 4XTLA 3F9LA 126LA 3C7YA 3EMLA 3DQBA 4JQ6A 224LA 3UTWA 216LA 2F32A 3VW7A 1LI3A 1QS9A 3OE9A 174LA 3DDLA 1QTDA 2O4WA 3JR6A 1JQUA 2Z6BA 200LA 148LE 237LA 1PQOA 1L96A 1L82A 1L75A 3DN6A 4ARMB 4EJ4A 4W53A 110LA 150LA 1L28A 1XJUA 1TN5A 1PQKA 1C65A 2B6TA 3GUMA 1C6JA 4AQNA 138LA 4PXKA 3HANA 1L70A 4J4QA 1GU8A 2I1XA 1LYFA 2B6YA 3X3BA 5ETZA 1F88A 1DYAA 209LA 3GUJA 3HT7A 140LA 3NYAA 1L32A 112LA 128LA 4EIYA 4DJHA 4GP4B 5JJEA 4EA3A 2CUUA 3SB6A 1HZXA 3PQRA 4YXAC 4N4YB 2B75A 3DKEX 4K5YA 5B34A 1L45A 3HTFA 4I7NA 1JV6A 1D2YA 1L23A 232LA 1L43A 3HT9A 1L53A 1L90A 2LC9A 1KG9A 1L10A 2HULA 1O0AA 1BRRA 1UCQA 2Z55A 3S3DB 4EKRA 2M3GA 4KNFA 125LA 1SX2A 1IW6A 1CU2A 3UTXA 1L85A 2RBPA 4AMIA 167LA 1L11A 1L83A 2ZIYA 2ZZLA 4FBZA 5G2AA 1L91A 3GUPA 2YCZA 1QKPA 2Z73A 1T6HA 2NTWA 1L97A 1CUQA 3HT8A 170LA 3L2XA 1L37A 4UG2A 1L99A 2KSBA 1L07A 3VG9A 1FBKA 3HAPA 1L62A 1L19A 1P2RA 1L39A 1LYGA 4GBRA 2NTUA 1SX7A 1JGJA 3X3CA 115LA 1C6EA 3ODUA 1GZMA 3HU9A 2LCBA 1OYUA 1LWKA 1OVKA 3GUKA 3QAPA 5G28A 1XEPA 3HASA 252LA 3G3XA 4DAJA 4W52A 4W51A 4MD2A 1D2WA 5H2NA 1L68A 241LA 3C8RA 5LWEA 178LA 3C81A 1K28A 4ARLA 1ZYTA 1F50A 1M0LA 261LA 4ARPA 1C8RA 1DYDA 3C9MA 108LA 2RH1A 3PWHA 2ANVA 3CDOA 4ZPUA 5B6ZA 3SB9A 2OTYX 4PXFA 2F93A 185LA 5B2NA 102LA 4IAQA 1L30A 3S3BB 1L57A 2HUMA 2F47A 4NC3A 1G0MA 3VVKA 1L50A 2ZFEA 1L25A 5AHYA 2QPDB 1L18A 3C83A 1L08A 1L86A 3AM6A 3HTDA 1EHKB 1P5CA 4FPDA 1KW5A 104LA 5AX0A 3GULA 2PEDA 2B6XA 240LA 155LA 5G53A 1PY6A 1G0PA 1C6DA 1C68A 1L66A 235LA 1L01A 1C69A 5ITCA 1L35A 181LA 1KW7A 1QT5A 1LI2A 1QUOA 2J4YA 3HDFA 1KG8A 1QKOA 2X72A 5H2MA 1L33A 1L73A 2B72A 1L9HA 1L80A 3C80A 4ARJA 1L48A 1D3MA 1M0MA 1EPYA 1QM8A 4YX7C 3FADA 3NS0A 5C1MA 160LA 1L27A 1L15A 156LA 1PQMA 3NY8A 238LA 1L47A 1NHBA 1DYGA 4LDOA 4FAAB 254LA 1CU0A 4G71B 1C6BA 1L65A 5H2JA 5ITEA 1LWGA 1QT7A 1QTHA 244LA 4DKLA 1L34A 250LA 1L44A 4L35A 3MBVA 1QHJA 222LA 3SBAA 1P7SA 1L81A 1LYEA 1L54A 1JTNA 242LA 1IXFA 2LNLA 1PXSA 1L72A 1LYJA 123LA 1L20A 1LGXA 1XJTA 6LZMA 1P8UA 1TLAA 4XT1A 1DYBA 1L03A 3SN6R 4KLYA 1L31A 1L98A 4BVNA 1G0QA 4GBRB 1C6KA 1SSWA 3VI0A 3CODA 1G1VA 214LA 1F4ZA 1L92A 1VGOA 192LA 2VT4A 107LA 1JFPA 1S8LA 3REYA 4EPIA 1BRXA 1LGUA 1MGYA 3QBLA 4I7OA 4IARA 4GPOA 147LA 2YCYA 197LA 4HWLA 2B74A 3QBIA 1L94A 2QB0B 4IAPA 1P56A 230LA 5A45A 1L17A 4LDEA 103LA 1CV3A 249LA 2Y04A 2QPEB 3RZEA 3GUIA 1LW9A 4E97A 1DYFA 3ZEVA 152LA 1VJMA 1C6IA 4QIDA 1T8GA 1G0JA 255LA 1CV1A 1QTCA 243LA 2RBQA 2OU9A 5JJJA 4GYCA 2I21A 206LA 1L40A 3QJQB 1DYCA 1P64A 4I7KA 1R84A 4I7RA 3P0GA 1G07A 3AYMA 5B6WA 4G7RB 169LA 1QUDA 2Q9DA 188LA 2YDVA 3SB5A 3HAOA 2NTHA 5H2OA 229LA 162LA 4LDLA 3T45A 1B6IA 2NTGA 1C6HA 1QTVA 2OE7X 1L52A 3DMZA 4EXMA 5EN0A 4W55A 201LA 2YDOA 5B6XA 1LYHA 122LA 1CV0A 226LA 3C82A 2RB2X 1L09A 3C8QA 4XT3A 1LN6A 4S0WA 3PXOA 246LA 2YCXA 1L95A 1KMEA 4QI1A 1L14A 1XJIA 4HYXA 1LLHA 5J7AA 5AX1A 1Q5IA 223LA 4G7SB 5H2LA 1L74A 4N4WA 1CV5A 5H2IA 3VHZA 3EH3B 5H2HA 5I14A 1OV7A 1CU3A 1L51A 2Y01A 1OVJA 4WAVA 161LA 114LA 4BEZA 4BV0A 4I7LA 1C3WA 1AT9A 1P46A 3NY9A 1L89A 176LA 1C6QA 3HDEA 4QRYA 3DMVA 129LA 2QARC 5A44A 1L93A 142LA 1L87A 1L56A 1OWZA 1AP9A 1QSBA 2L6XA 2RAZX 5TGZA 3SB7A 1X0I1 3SB8A 1L76A 4TL3A 180LA 3BVDB 2B6WA 4PK0A 1QT6A 5G36A 247LA 1C67A 1L84A 227LA 1S53A 1L36A 1OWYA 3GUOA 1L38A 111LA 2RBNA 3CDQA 4I7JA 1X0SA 3D4SA 1PQJA 257LA 5F8UA 199LA 2WJKA 3FA0A 1PQIA 3WQJA 1C6NA 1KY1A 183LA 3HWLA 3ABWA 2O79A 3L64A 4XTNA 1JV7A 1L42A 1QTBA 259LA 2G87A 3HH4A 3DNAA 1S54A 1C6TA 3HARA 1T8AA 1CUPA 1R2NA 221LA 3QDCA 3CDVA 3V2YA 1CVKA 1L41A 3F8VA 2JAFA 3UONA 1L60A 3K2RA 2RB0X 5FJGA 4BUOA 1CWQA 3CAPA 3OAXA 4EKQA 2KSYA 141LA 3HH5A 4W59A 4JR8A 3S8FB 3UG9A 1QS5A 1IW9A 131LA 3G3VA 2BRDA 225LA 2Y03A 4W58A 3QAKA 1CX7A 253LA 7LZMA 1JTMA 211LA 173LA 4I7SA 3UTYA 2Q9EA 1I6SA 218LA 2LZMA 1L49A 1SSYA 1H2SA 1M0KA 3PDSA 4I7QA 119LA 1Q5JA 3OE0A 2F2QA 3DN3A 1L22A 3OE6A 3DN4A 4I7TA 1BM1A 2OTZX 2O7AA 1C63A 144LA 1QT4A 4IB4A 1C62A 4X32A 1L64A 2OEAX 3QJTB 163LA 2I35A 3NSBA 1P3NA 5AZDA 1XMEB 113LA 127LA 260LA 182LA 3S3CB 2OE4X 2B73A 177LA 233LA 4I7MA 1CTWA 239LA 3PBLA 1H68A 3UTVA 1C60A 5B6YA 1TN0A 1C66A 3C7ZA 1D9WA 4MBSA 262LA 3OE8A 1L58A 1CU6A 3HUAA 118LA 2A4TA 1L0KA 1S52A 3DN8A 3HAQA 186LA 1L12A 4BEYA 1KGBA 1QUHA 4JKVA 3UZAA 1D3FA 1S51A 1FBBA 2RBOA 217LA 3A7KA 1L0JA 1GUEA 3EH5B 3QBGA 164LA 4AMJA 5KKHA 145LA 3SBBC 1P6YA 210LA 1G0LA 3GUNA 5B0WA 1T97A 212LA 1SWYA 2B70A 4G7QB 1P2LA 1T8FA 1C64A 1L55A 1SWZA 1CV6A 4EKPA 1QSQA 213LA 3HT6A 4EKSA 139LA 4FA7B 2JAGA 143LA 2R4RA 1LGWA 4OO9A 4XXJA 1L79A 2R4SA 5B6VA 2Y00A 4I7PA 220LA 1CX6A 1C6PA 158LA 3ZPRA 4A4MA 4W54A 4G72B 3HU8A 1OVHA 3HUQA 234LA 130LA 2I20A 3QJRB 3QJSB 5BR5A 4YXCA 1XIOA 4ARQB 3EH4B 191LA 4UHRA 236LA 3DN2A 2AT9A 1BRDA 1L13A 1QT3A 2OE9X 187LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L46A 4OV0A 5DHGA 1FLQA 3BKVA 4W57A 3LZMA 4DD0A 1YILA 4ARMA 1CKCA 2BQLA 2ANXA 1YKYX 1GE0A 1LZDA 5G2CA 2DQHY 1P37A 1BB7A 1GBWA 1C6LA 4N6HA 3EMSA 1BQLY 4H1PA 1PXRA 205LA 1L05A 1L02A 3HTGA 1LSEA 1BGIA 1ZWNA 184LA 1L16A 245LA 4BWBA 1L63A 4ANRA 1LYDA 4MD1A 3UZCA 1U19A 1S8JA 1F6RA 1L26A 3KJ6A 3TXJA 1YAPA 5H2PA 3W6EA 2Y02A 3DN0A 1C6GA 2LHMA 1BWIA 5M1YA 3S8GB 4GCBA 4W56A 2HEEA 4XJHA 5DYSA 1C6CA 5LZMA 4DD9A 1BB3A 3HUKA 4GCDA 2DQFC 5G2DA 4GP8B 1IWZA 2BQBA 5KXYA 5LYMA 5A8EA 1LZCA 5LA8A 1LZ6A 3HTBA 1XFPL 256LA 120LA 2YBIA 4MQTA 1PZYA 1T3PA 1QUGA 3A91A 190LA 3QJUB 1A4VA 5DHHA 4XTOA 4XTLA 3C7YA 4JQ6A 3UTWA 1QDRA 216LA 3VWOA 3VW7A 5ILFA 2Z6BA 1GFVA 148LE 4ARMB 1BHZA 1LYYA 150LA 1C65A 2B6TA 3P66A 4AQNA 1OP9B 3HANA 1UA6Y 4H91A 2I1XA 2B6YA 1TAYA 3N9CA 8LYZA 1GFTA 2ZWBA 2BQJA 2HEBA 1VDPA 2HECA 4DJHA 5JJEA 1IWWA 5KXRA 1LJJA 1G7MC 4R6CA 4N4YB 4BAPA 4U3XB 3CQLA 4KT3A 4WG1A 1NWGA 1L23A 232LA 4LYZA 1L53A 1KG9A 1L10A 1LSZA 2HULA 1UCQA 1BRRA 1B5VA 4GLAA 4G49A 4EKRA 2M3GA 125LA 3LYTA 1C10A 4AMIA 2ZIYA 3A8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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