4EJ4A

Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
RSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKLKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTQPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDINRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
pubmed doi rcsb
molecule keywords Delta-type opioid receptor, Lysozyme chimera
molecule tags Signaling protein, hydrolase/antagonist
source organism Mus musculus
total genus 156
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ej4A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ej4A01
1AT9A 234LA 3KJ6A 2F32A 3HU8A 4ARMB 4ARQB 1LYEA 1XJTA 120LA 215LA 5G53A 1SX7A 1C6KA 3ZPQA 3HTFA 2YCZA 4GP5B 4GYCA 1L67A 173LA 1L07A 4W58A 1P2RA 3VGAA 1C63A 1L37A 3NSBA 4HWLA 5AHYA 261LA 102LA 1L93A 1TLAA 1LYFA 3DN3A 1L27A 2VT4A 4EKSA 3QBKA 4X32A 1L68A 1L09A 2F95A 2RBRA 4MQSA 5JJJA 3HWLA 2B6WA 2OE7X 1EHKB 1L44A 151LA 1JGJA 2KSAA 3UTVA 4LDLA 1QM8A 4GBRA 1L06A 254LA 1TN0A 3HDEA 2LC9A 3EH4B 1L60A 1D3JA 1D2WA 2RAZX 231LA 1PQJA 5BR2A 3P0GA 1DYBA 2NTGA 161LA 4NC3A 1QUHA 4A4MA 192LA 1F4ZA 229LA 3G3WA 1R2NA 1L48A 1AP9A 3G3XA 1L46A 244LA 2OU8A 3C7WA 1L77A 1L69A 3DN8A 2EI4A 1QUGA 5TGZA 4XTOA 252LA 4LZMA 1T97A 1G06A 4N4YB 2A4TA 4ARLA 235LA 4EKRA 1L38A 3T45A 226LA 2HPYA 144LA 2RBQA 1OVJA 4YXAC 3SBBC 1KW5A 1L28A 4W56A 1L63A 2O79A 1QT7A 1C62A 1OYUA 3HAQA 1LN6A 5H2PA 1G0QA 1L40A 205LA 248LA 3C7ZA 108LA 2Z55A 199LA 1L87A 185LA 4UHRA 1LGUA 4OV0A 242LA 5G2DA 127LA 1CV3A 1BRDA 246LA 2Z73A 3QJUB 4G71B 1L10A 3RFMA 1SSWA 1C6LA 1QT5A 3S3CB 5B6YA 5B6WA 191LA 1T8FA 2X72A 1QS9A 2RBSA 1D2YA 1KY1A 1VJMA 4PXKA 213LA 4W53A 5KKHA 4XXJA 3OE9A 5FJGA 1QT4A 2Y02A 5AHZA 3L2XA 3DN0A 2I20A 5DHGA 5I14A 3HDFA 1L00A 220LA 1L75A 3C8QA 4KLYA 1L57A 1EPYA 1CUQA 259LA 4BEZA 1L92A 5B6ZA 3GUPA 141LA 1L13A 1S8LA 3NS0A 3NY8A 2LCBA 148LE 111LA 1KS3A 3C81A 4MQTA 3VG9A 1G0GA 1DYDA 3GUNA 1L51A 1PXRA 2WJLA 1CV1A 1P7SA 2CUUA 1SWYA 2B6XA 4XT1A 1L30A 3SN6R 224LA 1X0SA 168LA 1L58A 258LA 2RB1X 245LA 262LA 190LA 1C6AA 1DYEA 1U19A 4BUOA 212LA 2OE9X 1OV5A 2F2QA 5H2LA 1L98A 3DN1A 1QTVA 1C6MA 1JFPA 1KW7A 1L50A 2OTZX 1PY6A 1GZMA 3CAPA 125LA 4BVNA 3C8SA 3PDSA 3ZPRA 3RUNA 1CX6A 209LA 4FBZA 1QHJA 177LA 4WAVA 183LA 3GUMA 3QJSB 4G72B 3OE6A 1L26A 5C1MA 5ITEA 5J7AA 2LNLA 3DDLA 1KG8A 5B0WA 3DQBA 1C6HA 149LA 4ARJA 1DYCA 243LA 1L99A 1PQKA 1G0LA 238LA 1M0LA 4ARQA 1KMEA 1IW6A 1CV4A 1GUEA 1DYFA 1L79A 198LA 1E0PA 1CVKA 1C64A 1C69A 3C8RA 1JV7A 3F9LA 5JJNA 1L15A 1LLHA 201LA 218LA 217LA 1X0K1 3ABWA 1L83A 4DJHA 216LA 1L76A 163LA 2B7XA 3ODUA 4J4QA 1C8RA 4IAQA 3HUAA 4I7KA 1LI2A 3SB6A 1C67A 3QJTB 1QTCA 1LYDA 223LA 4L35A 112LA 1NHBA 159LA 1PQDA 4HYJA 2Q9EA 1M0MA 3CDQA 1KNIA 2OU0X 3MBVA 4UG2A 1L85A 2B6ZA 1QKPA 188LA 1CV6A 5G2CA 200LA 3LZMA 2G87A 164LA 7LZMA 1L71A 210LA 3AYNA 3HT6A 170LA 214LA 1L20A 3SB5A 1LPYA 4EJ4A 189LA 143LA 3DMZA 1L66A 2RH1A 2OEAX 4DAJA 3HARA 4I7NA 3DKEX 3VVKA 256LA 187LA 5A44A 5AX1A 3HH6A 5A8EA 232LA 1CU5A 1IXFA 3QAKA 1QTHA 1QT3A 107LA 1C61A 1C6QA 1L21A 1L35A 1L9HA 1C6TA 227LA 1L81A 2QPEB 157LA 4G7QB 4I7TA 3C82A 3QAPA 4QIDA 1GU8A 1LI3A 4FPDA 2Q9DA 2LZMA 1G1VA 1L73A 110LA 3CODA 1L22A 5H2KA 1P56A 1WTHA 3GUJA 4JQ6A 1XIOA 1C6IA 1L96A 1L29A 4I7JA 3HUKA 1L33A 4KNFA 4PXFA 1LGXA 1QTDA 113LA 3QJVB 128LA 1KG9A 4BV0A 150LA 1C6FA 1G0KA 4GBRB 1D3FA 1L39A 5DHHA 1P8IA 3PXOA 1G1WA 2NTHA 4WW3A 4EPFA 1ZYTA 1ZWNA 3HT8A 1L54A 147LA 253LA 3UONA 1G07A 1JTNA 2YCXA 4X31A 1P46A 123LA 5ITCA 1QTZA 130LA 206LA 4G70B 122LA 2AT9A 1TN5A 4PK0A 3X3BA 1L61A 5BR5A 2B74A 1PQOA 2ZFEA 126LA 3S3BB 1P64A 103LA 4IB4A 3FI5A 4QRYA 5B6VA 3HAOA 3HH3A 1CU6A 2B6TA 3OAXA 131LA 182LA 3SB8A 4MD2A 4XTNA 165LA 3F8VA 186LA 1QSQA 1L02A 3RZEA 1C6EA 2YCYA 3EH3B 3ZEVA 5B2NA 3SBAA 115LA 1L04A 3DN2A 5B6XA 3WQJA 4BWBA 4I7PA 4EKPA 2OU9A 180LA 1D3NA 2B75A 5F8UA 4IAPA 2ANXA 1S8JA 178LA 1DYGA 2B72A 1QT8A 1QT6A 171LA 3CDRA 1FBKA 5ETZA 5A45A 2Z6BA 3HT9A 155LA 5B34A 2HULA 5AZDA 1L12A 3UZAA 142LA 109LA 5AX0A 2F47A 1P6YA 233LA 114LA 2BRDA 1UCQA 1L0MA 1L32A 211LA 228LA 3DN4A 1LWGA 221LA 1L89A 4EIYA 1QSBA 1H68A 3HANA 3UTWA 2B6YA 1PQMA 3GUKA 3EH5B 3QDCA 3VHZA 3V2WA 2HUKA 1P2LA 4ARMA 1E12A 2OTYX 3REYA 1LGWA 1T8GA 2RBNA 3NY9A 3FADA 3QJQB 1S52A 1CX7A 1L0JA 1IW9A 1VGOA 4FA7B 5G28A 1C65A 4I7QA 1C6GA 1L91A 1BM1A 3UTXA 2L78A 1D9WA 129LA 4JKVA 4ZPUA 1D3MA 1L90A 3BVDB 2B73A 197LA 1QTBA 1P5CA 4GRVA 1B6IA 1ZURA 3DMXA 1OWZA 1I6SA 4W57A 5H2JA 3UTYA 3PQRA 3X3CA 1CV0A 1QUOA 1LI6A 1LW9A 137LA 2RBOA 3EMLA 1L72A 174LA 3SB9A 4EPIA 1CTWA 4GPOA 1CWQA 5AWZA 1F88A 1L70A 1SSYA 3C9MA 1L43A 1S54A 1LYHA 4W55A 1L24A 3DN6A 3D4SA 1T6HA 3DNAA 146LA 1C6JA 2YDOA 1L45A 1R84A 3QBIA 169LA 1L88A 1XMEB 4EKQA 1T8AA 3VW7A 2PEDA 1L97A 255LA 4BEYA 181LA 230LA 1C66A 1L95A 1C6DA 3HTGA 3JR6A 1QKOA 3GUIA 4YXCA 3DMVA 1DYAA 145LA 1L86A 1L36A 4LDOA 1OVHA 1CU0A 1JQUA 160LA 1L23A 172LA 1F50A 2KSYA 2R4RA 4GP8B 3S8FB 3AYMA 4LDEA 4W59A 184LA 4OO9A 3L64A 4X1HA 3V2YA 2HUMA 1KGBA 1CU3A 1L08A 4K5YA 3COCA 1CV5A 1G0PA 2B70A 3G3VA 166LA 195LA 1L03A 1P8UA 1LYJA 225LA 138LA 2NTWA 4XT3A 1L11A 247LA 1L59A 2ANVA 3K2RA 4E97A 4G7SB 4I7MA 5EN0A 3A7KA 2JAGA 2QPDB 3CDVA 139LA 4I7SA 1FBBA 2WJKA 3HASA 3S3DB 2I35A 3HTBA 3UG9A 1C6NA 4PJZA 4Y9HA 5LZMA 1LYIA 4YX7C 1XJIA 3PWHA 2KS9A 176LA 4I7OA 241LA 4EA3A 1PXSA 222LA 156LA 1L34A 1P3NA 1L62A 1L05A 1LWKA 2O7AA 1M0KA 5G2AA 2Y03A 6LZMA 3CDOA 3OE0A 1HZXA 4HYXA 196LA 1LYGA 104LA 1L84A 1C6BA 1OVKA 239LA 4TL3A 3QJRB 1P8HA 2J4YA 4GP4B 4L6RA 2I1XA 1L14A 3GUOA 5G36A 4QI1A 2Y04A 5DYSA 1XJUA 1L41A 3C7YA 140LA 3SB7A 1O0AA 2JAFA 4N6HA 4FAAB 1L64A 1S51A 167LA 2YCWA 257LA 1Q5IA 1QS5A 4DKLA 1L49A 1L55A 1SX2A 1C6CA 175LA 5H2MA 5LWEA 1L80A 1L47A 3C9LA 1L25A 1C3WA 1MGYA 3C83A 1DZEA 251LA 2ZIYA 3VI0A 4JR8A 4W52A 2KSBA 1L01A 1L31A 2RB2X 3HAPA 2IGCA 236LA 3QBLA 1S53A 1L18A 2YDVA 2RBPA 3HUQA 3HT7A 1JTMA 4W54A 1G0MA 1L42A 1L56A 4I7RA 1CUPA 1L74A 1K28A 2QARC 3HH4A 4AQNA 2NTUA 1H2SA 2Y01A 219LA 3OE8A 249LA 3CDTA 1L53A 1L65A 240LA 1C8SA 3QBGA 1PQIA 4EXMA 3HU9A 1UAZA 1P36A 4IARA 1X0I1 2Y00A 237LA 162LA 4AMIA 4G7RB 1OWYA 4I7LA 4W51A 1C60A 1Q5JA 250LA 3AM6A 3FA0A 1L16A 3NYAA 1CU2A 2QB0B 3GULA 1L82A 3PBLA 1JV6A 2R4SA 5B35A 1C68A 4MD1A 3HTDA 2RB0X 4N4WA 1C6PA 4S0WA 1L17A 4AMJA 158LA 5G54A 1SWZA 2RAYX 1BRRA 1L52A 3S8GB 2I21A 118LA 1P37A 3HH5A 5H2HA 5H2IA 3UZCA 5H2NA 2ZZLA 1OV7A 1QUDA 1L94A 2F93A 1XEPA 2L6XA 5JJEA 2OE4X 1KY0A 4ARPA 2O4WA 3C80A 1G0JA 1L0KA 1L19A 260LA 1BRXA 5H2OA 152LA 2M3GA 119LA 4XTLA 4MBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JTOL 234LA 2F32A 3HU8A 3ZPQA 215LA 1XJTA 120LA 2IFFY 1C6KA 1LJEA 4GYCA 5LYZA 4DD2A 3NSBA 1L93A 4X32A 4EKSA 1L68A 1L09A 2F95A 4QY9A 2Q0MX 5JJJA 3HWLA 2B6WA 4NSJA 1JGJA 5HMJA 3HDEA 3ZEKA 1N4FA 1PQJA 3P0GA 1LHLA 2HUBA 2NTGA 1INUA 4LYZA 4C3WA 3RZ4A 4A4MA 1B5VA 192LA 4NWEA 4DYGA 1F4ZA 5EBHA 229LA 1L48A 4H9BA 4P2EA 5B07A 1J1PY 1LSPA 1WQPA 1QUGA 5KXXA 2G4QA 4XTOA 3A8ZA 1G06A 2A4TA 1IR9A 4YENA 4EKRA 2EKSC 144LA 4H1PA 4YXAC 3SBBC 1KW5A 1L28A 4YM8A 3HAQA 1LN6A 1IP2A 205LA 185LA 1LZYA 3W6FA 3P68A 1BRDA 246LA 1QDTA 4H8XA 1SSWA 1C6LA 1T8FA 1XGTC 5F14A 1VJMA 4PXKA 213LA 2Z2FA 4W53A 3OE9A 4WL7A 3B0OA 1GBWA 2I20A 4ETDA 1G7LC 4H92A 3C8QA 1EL1A 1A2YC 4BEZA 1IORA 3GUPA 2BQHA 2I25L 2ZNXY 3NY8A 1XFPL 4N1EI 4MQTA 4OWBA 1DYDA 1SWYA 2B6XA 1C6AA 4BUOA 212LA 1GFUA 4R6CA 3DN1A 4U3XB 1JFPA 1KW7A 4DD1A 2C8PA 4BVNA 2XQOA 4BADA 1NHEA 3C8SA 1CX6A 183LA 3AJNA 3GUMA 1LZ9A 3QJSB 1GFJA 1HSXA 4NHTA 4G72B 1CJ9A 1L26A 5M1YA 4ZFPA 135LA 5F16A 1LCNA 1RFPA 1PQKA 1M0LA 4XADA 1CV4A 2BQEA 1GUEA 1DYFA 4DD3A 1LJGA 1CVKA 5II3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4AMJ A;  158L A;  5G54 A;  1SWZ A;  2RAY X;  1BRR A;  1L52 A;  3S8G B;  2I21 A;  118L A;  1P37 A;  3HH5 A;  5H2H A;  5H2I A;  3UZC A;  5H2N A;  2ZZL A;  1OV7 A;  1QUD A;  1L94 A;  2F93 A;  1XEP A;  2L6X A;  5JJE A;  2OE4 X;  1KY0 A;  4ARP A;  2O4W A;  3C80 A;  1G0J A;  1L0K A;  1L19 A;  260L A;  1BRX A;  5H2O A;  152L A;  2M3G A;  119L A;  4XTL A;  4MBS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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