4EJ4A

Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
RSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKLKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTQPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDINRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein, hydrolase/antagonist
source organism Mus musculus
molecule keywords Delta-type opioid receptor, Lysozyme chimera
total genus 156
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ej4A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ej4A01
3RUNA 2LC9A 3HASA 1LGUA 4XTLA 4I7MA 1D3FA 1G0PA 2ZFEA 1P8UA 4HWLA 3G3XA 4I7SA 163LA 4W51A 5AHYA 2ANVA 2Y03A 4EKQA 2ZZLA 2R4SA 1L9HA 128LA 2Y02A 1C65A 1C6PA 1HZXA 140LA 2B72A 2O7AA 2YCXA 1L31A 1T97A 5FJGA 4BV0A 235LA 1P2RA 151LA 1KW7A 1L93A 107LA 245LA 2PEDA 1L00A 2QARC 3NYAA 109LA 259LA 4LDLA 3VW7A 1ZWNA 118LA 1P7SA 3DN0A 3HH5A 3OE8A 1AT9A 2Z55A 3QBLA 5ITCA 240LA 2OE7X 4OV0A 4BWBA 4EKSA 220LA 3UTWA 1QM8A 1L95A 4XTNA 120LA 1VGOA 4FBZA 4GP5B 1L32A 1JGJA 3QJSB 3X3BA 3HWLA 3CDVA 2M3GA 5H2OA 1OVHA 2JAFA 1P2LA 233LA 1DZEA 1R84A 2LZMA 1EHKB 1QUGA 1D2WA 2B6YA 1BRDA 158LA 3OE9A 3P0GA 4NC3A 2IGCA 2HUMA 2NTUA 165LA 3UZCA 3HU8A 4G7QB 1PQOA 1L86A 1D9WA 2RBOA 3OE0A 1BRRA 5G28A 1CUQA 142LA 1C64A 130LA 1D2YA 4UG2A 4G72B 5LWEA 115LA 1G1VA 2LCBA 4GRVA 4BEYA 4DKLA 122LA 1CV1A 4N4WA 5JJJA 1QUDA 6LZMA 1S51A 4QIDA 171LA 4EJ4A 1TN5A 1L29A 206LA 1QTCA 1L30A 3UTYA 145LA 1QKPA 189LA 1ZYTA 3C8RA 3GUJA 5H2LA 1LLHA 3REYA 5F8UA 1P56A 209LA 3F8VA 2Q9DA 3C8SA 1L23A 3DMVA 3QJQB 161LA 1FBKA 1OV7A 4ARJA 1L08A 1CU2A 1L70A 169LA 1LYFA 1QHJA 3EH3B 5H2MA 1CU5A 1OV5A 1P3NA 147LA 1L87A 1L21A 2RB1X 185LA 1UCQA 217LA 1X0K1 5DHHA 3HT9A 2WJKA 3GUNA 2OTZX 1BRXA 4PK0A 1L61A 4W54A 3QJTB 4IB4A 1LGWA 5EN0A 1CV5A 2QPEB 198LA 4A4MA 1L71A 112LA 1L97A 4KLYA 5H2PA 3ZPRA 110LA 226LA 164LA 1P5CA 2OE4X 4LZMA 1L13A 1C6QA 4L6RA 225LA 1LYHA 1M0KA 2KSAA 137LA 1L26A 4GPOA 3HH6A 172LA 5H2KA 123LA 1P6YA 1L33A 236LA 254LA 2F95A 5A44A 3FI5A 1L74A 1L0JA 4W53A 2B70A 143LA 1BM1A 3C9LA 237LA 1L10A 1G0MA 1LW9A 5AHZA 1S8JA 1L20A 230LA 4AMJA 5JJNA 7LZMA 2OU0X 3QAPA 2B6ZA 4EKRA 1JV6A 2KSBA 251LA 1XIOA 2F32A 3F9LA 152LA 252LA 4IAQA 1LGXA 1SX2A 166LA 1L57A 1L36A 3QAKA 3QJVB 4EPFA 3QBGA 4X32A 222LA 261LA 1L98A 1C61A 1DYEA 3HDEA 195LA 1CU6A 1C6BA 247LA 211LA 3V2WA 141LA 4L35A 4EA3A 1L56A 3DN6A 5DHGA 5G2CA 3L2XA 108LA 1C6HA 3AM6A 3K2RA 1C6DA 1LWKA 1L80A 1CX7A 1L43A 1L73A 1QSQA 2O79A 3NY8A 4EPIA 5G2DA 1LI3A 2YCYA 1D3NA 1R2NA 1JTMA 2G87A 1GU8A 5DYSA 1ZURA 214LA 1KY0A 3GUIA 1P8IA 1M0LA 3S3DB 4MD1A 3HAPA 2NTWA 1S52A 3CAPA 1L46A 3RFMA 213LA 2LNLA 3T45A 215LA 2I35A 1KNIA 4X31A 5B6YA 3C7YA 175LA 1CV0A 162LA 221LA 4IARA 4MBSA 1H2SA 182LA 1C6FA 2QB0B 3VVKA 3HANA 1S53A 119LA 1L38A 192LA 1L40A 3ZPQA 1PXRA 5G2AA 127LA 1L85A 3DN2A 1JV7A 5B35A 4MQTA 1L63A 255LA 3CDRA 4ARMA 3S3BB 131LA 139LA 4GP8B 1L96A 4I7PA 3C81A 1C67A 2AT9A 3S8FB 4HYJA 1L88A 3DNAA 4WAVA 111LA 3GUOA 5B0WA 1L67A 3LZMA 2A4TA 1X0I1 3HUKA 1L07A 1L81A 1IXFA 2RB2X 1LPYA 4MQSA 1G1WA 1XJTA 1L83A 1C66A 5KKHA 4I7NA 2EI4A 1DYAA 4JKVA 1G0KA 4EKPA 2Z73A 5H2HA 4LDEA 4W55A 2Y01A 129LA 1L09A 1LI2A 1LN6A 1SWZA 4DJHA 1L17A 1AP9A 1L55A 229LA 1U19A 1L65A 4KNFA 3EMLA 4I7TA 4JR8A 1K28A 1CUPA 1KW5A 156LA 1LYIA 4DAJA 2YDVA 1L77A 1LYGA 1G07A 260LA 2OTYX 3GUKA 4PXKA 150LA 3FADA 248LA 3ZEVA 216LA 1M0MA 1F4ZA 1F50A 3UONA 1QTHA 1L44A 1L84A 1L02A 1OYUA 1SSYA 3HTDA 3OE6A 238LA 2HPYA 4XTOA 4TL3A 177LA 3HARA 3DKEX 3QJUB 3PXOA 3C9MA 227LA 1QKOA 3DN8A 4XT3A 3UTVA 3AYNA 1P37A 219LA 1CU0A 1L42A 1X0SA 1I6SA 3DN4A 149LA 1L05A 3SB8A 187LA 3C7ZA 186LA 148LE 5AWZA 3BVDB 3SN6R 3SB7A 3SB9A 249LA 1PQDA 1L54A 1Q5IA 4GBRB 173LA 1L41A 3PWHA 5A45A 1G0LA 4GBRA 176LA 1DYFA 5B6ZA 1QUHA 1L90A 239LA 5B2NA 1DYGA 2VT4A 2YCWA 3KJ6A 3DMZA 1QTDA 1KS3A 2F47A 191LA 1CV6A 1CWQA 2I1XA 3HUAA 3FA0A 3G3WA 2OU9A 1TLAA 167LA 183LA 1E12A 1L68A 1L52A 4GYCA 1L49A 3S8GB 5AZDA 200LA 1T6HA 256LA 1S54A 5TGZA 1CU3A 1L48A 224LA 258LA 232LA 3DDLA 4W59A 1QSBA 2RAZX 4FAAB 4ARLA 2JAGA 3PQRA 1PQMA 243LA 5ITEA 1CVKA 241LA 3ODUA 1S8LA 250LA 1L99A 1T8FA 1L64A 5G54A 3DMXA 3HTGA 253LA 4YXCA 3HAOA 3CDTA 2F2QA 1GZMA 3D4SA 5B6WA 197LA 1KG9A 2WJLA 103LA 3NS0A 1KMEA 3ABWA 3GUMA 1GUEA 3SB5A 1TN0A 5BR5A 1L76A 205LA 2RBRA 1L14A 2B75A 102LA 4K5YA 3SBBC 1L16A 3HTFA 1L03A 3COCA 4E97A 181LA 3QJRB 4BVNA 188LA 1C6EA 246LA 1C60A 125LA 5BR2A 144LA 5B34A 1VJMA 174LA 1G0GA 4G7RB 1DYBA 4BEZA 1QS9A 5JJEA 1L15A 2B74A 1C68A 1L04A 4I7QA 5C1MA 1UAZA 1C6LA 4FPDA 2F93A 1L27A 3JR6A 4ARMB 5G53A 157LA 199LA 1C6NA 1P46A 4I7JA 4OO9A 159LA 231LA 262LA 1OWYA 1OVKA 4YX7C 2L6XA 3RZEA 2J4YA 4I7OA 1L60A 1MGYA 1PXSA 1P64A 1L89A 1C6CA 3EH5B 3NSBA 5A8EA 4HYXA 1L82A 3HAQA 1L06A 1L94A 1D3JA 5J7AA 155LA 4Y9HA 4MD2A 1IW6A 1Q5JA 113LA 1L66A 1KY1A 3C8QA 1QT6A 4ZPUA 5AX0A 1OVJA 1D3MA 1CV4A 1L51A 2Z6BA 4QRYA 1P8HA 2YCZA 1L25A 1P36A 2CUUA 4XT1A 5ETZA 4EXMA 138LA 1C69A 1C8RA 3WQJA 2RBSA 4FA7B 1KG8A 1SWYA 2OEAX 1L47A 4N4YB 1L0KA 3DN1A 1QS5A 3C7WA 3HU9A 3SBAA 3X3CA 3HT7A 1G0QA 1LYDA 1CX6A 1L28A 228LA 3V2YA 2HULA 4JQ6A 4PXFA 1JTNA 4AMIA 168LA 1C6TA 4AQNA 178LA 2I20A 3DQBA 1C6JA 210LA 1L12A 4I7LA 3MBVA 1SX7A 5I14A 2RBPA 4WW3A 196LA 4XXJA 1C3WA 104LA 1QTBA 190LA 1F88A 180LA 1C6KA 4YXAC 4J4QA 2ZIYA 1G0JA 1L59A 184LA 2RBQA 1CTWA 3CDOA 1G06A 3PBLA 3HH4A 1XJIA 3NY9A 1XEPA 2NTHA 4G70B 1NHBA 1T8GA 2RH1A 1B6IA 2B6XA 3HT8A 1L0MA 1SSWA 1L45A 3QBIA 5G36A 3VHZA 4G71B 1LYJA 2X72A 1L35A 4W57A 1FBBA 3VGAA 1DYDA 1KGBA 3UG9A 160LA 1C62A 218LA 1JFPA 3CODA 1QUOA 3C82A 3HUQA 2B6WA 1L69A 4W52A 1PQKA 2OU8A 3HT6A 4X1HA 3HTBA 1C6AA 2R4RA 2RBNA 2QPDB 2Q9EA 2OE9X 1L72A 2ANXA 244LA 3L64A 3GULA 1L34A 4W56A 4ARQB 3GUPA 2KSYA 257LA 2B73A 1E0PA 4BUOA 4ARQA 1C63A 1QT3A 201LA 1L75A 1QT8A 2Y00A 4G7SB 1QT5A 3HH3A 1O0AA 4I7RA 5B6VA 1DYCA 2B6TA 4LDOA 1C6IA 1JQUA 2B7XA 4GP4B 2L78A 1L91A 4I7KA 1L19A 4UHRA 1XJUA 2KS9A 114LA 3HDFA 1L79A 1L62A 3C83A 4PJZA 1QT7A 1L01A 5LZMA 5H2IA 1PQIA 2I21A 1C8SA 1H68A 4QI1A 1C6MA 234LA 2NTGA 126LA 4W58A 3A7KA 170LA 1CV3A 1L11A 5H2NA 3UTXA 1LWGA 2HUKA 2YDOA 1L58A 4IAPA 242LA 3QDCA 1L50A 3G3VA 3SB6A 3VG9A 1QTVA 1T8AA 1EPYA 5B6XA 1QT4A 1WTHA 3EH4B 1QTZA 2RB0X 2Y04A 3S3CB 1L92A 3VI0A 2RAYX 1IW9A 2O4WA 1XMEB 3C80A 1L37A 4N6HA 1L53A 3DN3A 1C6GA 3QBKA 223LA 146LA 1L22A 4S0WA 3UZAA 1L39A 1LYEA 3AYMA 5AX1A 4EIYA 1L24A 1L18A 4ARPA 1PQJA 2BRDA 212LA 3CDQA 3OAXA 1PY6A 3PDSA 1LI6A 1OWZA 5H2JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A94A 3HASA 2C8OA 4XTLA 4PGJB 3AYQA 1P8UA 2HTXA 4HWLA 6LYTA 4U3XB 163LA 3ATNA 2R4SA 1L9HA 4N0JA 1P2RA 1T6VL 5DN4A 107LA 4LYBA 3NYAA 118LA 2EIZC 5DN5A 4OV0A 1GD6A 1GFVA 3A34A 3AGIA 220LA 1YKZX 3QJSB 4NGWA 3CDVA 1OVHA 1DZEA 1EHKB 1GFTA 2Z37A 4GCBA 4NSJA 1D9UA 2IGCA 165LA 4HP0A 1BRRA 3A96A 1XGPC 1C64A 2LCBA 1GFJA 1HEOA 5JJJA 1S51A 171LA 4WM6A 1VFBC 1QTCA 1ZYTA 2ZILA 5F8UA 209LA 2LYOA 2Q9DA 3DMVA 1OV7A 4ARJA 1QHJA 5H2MA 4DC4A 1GAYA 1L21A 185LA 1W08A 5DHHA 3HT9A 2OTZX 3QJTB 4A4MA 4NSIA 134LA 5H2PA 3ZPRA 110LA 1LJNA 4LZMA 1CNSA 1LYHA 2KSAA 137LA 1LJIA 3D9AC 3HH6A 4DD2A 1L33A 236LA 4DQ5A 1L0JA 4W53A 143LA 1G7LC 3C9LA 1L10A 3LYOA 2C8PA 2BQNA 1L20A 3GXRA 4CFOA 5JJNA 1FKQA 1JV6A 2BQJA 251LA 1DZBX 3F9LA 4IAQA 4GN4A 1LPIA 3QAKA 4NHPA 3QBGA 1BWIA 3P4ZA 4XJDA 1KXYA 1LMAA 3HDEA 1C6BA 1V7TA 3FI7A 1EQEA 3DN6A 1LZSA 108LA 1XFPL 3QNGA 3K2RA 1C6DA 2BQIA 1QSQA 1UA6Y 5G2DA 3M18B 2YBNA 4UWUA 5IDDA 1LI3A 1GE0A 1IP3A 4LYOA 1ZURA 1IR8A 1KY0A 2ZWBA 1M0LA 1TCYA 4MD1A 3HAPA 1S52A 4Z98A 3RFMA 1FN5A 4X31A 1LMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1QTZ A;  2RB0 X;  2Y04 A;  3S3C B;  1L92 A;  3VI0 A;  2RAY X;  1IW9 A;  2O4W A;  1XME B;  3C80 A;  1L37 A;  4N6H A;  1L53 A;  3DN3 A;  1C6G A;  3QBK A;  223L A;  146L A;  1L22 A;  4S0W A;  3UZA A;  1L39 A;  1LYE A;  3AYM A;  5AX1 A;  4EIY A;  1L24 A;  1L18 A;  4ARP A;  1PQJ A;  2BRD A;  212L A;  3CDQ A;  3OAX A;  1PY6 A;  3PDS A;  1LI6 A;  1OWZ A;  5H2J A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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