4EJ4A

Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
RSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKLKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTQPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDINRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein, hydrolase/antagonist
molecule keywords Delta-type opioid receptor, Lysozyme chimera
publication title Structure of the delta opioid receptor bound to naltrindole
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 156
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ej4A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ej4A01
123LA 1OV5A 4N4WA 1L28A 5ITCA 3CDRA 1JFPA 1L64A 4ARJA 216LA 3CDOA 3CDVA 139LA 2QB0B 225LA 108LA 5JJEA 3OE8A 1L40A 5G53A 2I1XA 3S3CB 4EXMA 4MBSA 1Q5JA 3NYAA 4ARPA 1LLHA 4WAVA 1L83A 3PDSA 1S53A 2B70A 3RUNA 2YCWA 3BVDB 1QSBA 1ZURA 1DYFA 4Y9HA 1LYIA 3QBGA 3C9LA 1PXSA 142LA 118LA 160LA 3HT9A 1L35A 1L60A 205LA 3OE9A 239LA 1L92A 1QTVA 1D2YA 1L23A 2ANVA 1L57A 2B6YA 4G7QB 2R4SA 4BEZA 3K2RA 1TN0A 5G2CA 1L37A 4X32A 1C8RA 1JTNA 3GUKA 1XJIA 3V2WA 1DYCA 262LA 147LA 234LA 122LA 1L34A 260LA 223LA 1KNIA 1LN6A 3GULA 199LA 180LA 4IAPA 1D3FA 1D3MA 4LDLA 5ITEA 2YDOA 1QT4A 4QI1A 5H2HA 138LA 1L75A 4YX7C 1X0SA 4ARQB 2I35A 1QTBA 110LA 1L01A 3QAPA 3SB6A 1L90A 3VGAA 1E12A 4XT1A 5DYSA 1LYEA 2OU8A 249LA 2O4WA 1C8SA 4TL3A 1SX7A 1KG8A 1C69A 1L16A 1L59A 3CDTA 2KSAA 166LA 3QJQB 1VJMA 4DAJA 1C6LA 1C6GA 1L97A 1P2LA 215LA 221LA 3GUPA 3HTDA 1C65A 1KGBA 1L70A 1L98A 1ZWNA 5AHZA 5H2KA 2WJLA 3ZEVA 1LI3A 1C64A 5FJGA 5A44A 145LA 102LA 1G06A 5H2LA 190LA 4J4QA 1QM8A 4PK0A 206LA 1CU3A 1H2SA 1G07A 2YCZA 3VI0A 214LA 1I6SA 1M0LA 1L03A 3AYMA 5H2IA 1L21A 2B6XA 1KMEA 1T8AA 2Z55A 2I21A 2Y01A 1L91A 1LW9A 4ARQA 1UCQA 4HYJA 3DKEX 4YXCA 3CAPA 5B6XA 2ZFEA 1L55A 156LA 1P5CA 1QUOA 1SWYA 1L22A 1L0MA 1LI6A 2OE7X 1OVHA 1PQDA 1CV5A 1D9WA 3C9MA 3OE6A 224LA 4I7RA 3HU8A 1L30A 1L04A 141LA 1L50A 4N4YB 120LA 3QJUB 1QUDA 1CU2A 2F93A 1SSWA 1L79A 152LA 1QT6A 5G28A 4EA3A 1D3JA 165LA 181LA 2LNLA 4FPDA 4UG2A 1C6FA 169LA 3SB8A 1L58A 1L49A 3NY9A 4BVNA 1L08A 213LA 115LA 3HU9A 231LA 2Q9EA 5TGZA 4WW3A 1L26A 113LA 3HTFA 3EH4B 3RFMA 1LWKA 3C8QA 1P2RA 104LA 4I7SA 3DN6A 2M3GA 238LA 3SBBC 1PQOA 4NC3A 1PQMA 228LA 1DZEA 1L53A 1L36A 2YCYA 3COCA 109LA 183LA 3UTWA 3V2YA 259LA 5B35A 2F32A 3LZMA 1EPYA 209LA 229LA 2ZIYA 1D3NA 3QJVB 1F4ZA 253LA 1JTMA 3X3BA 251LA 1CU5A 1JGJA 1L81A 1G0PA 1L85A 3C82A 1DYBA 185LA 196LA 3DN2A 4AMJA 1QTCA 250LA 4UHRA 4FBZA 1TLAA 1UAZA 5I14A 3GUJA 1Q5IA 195LA 1LI2A 4I7PA 2VT4A 146LA 261LA 3PBLA 1QTHA 244LA 1C6DA 4I7KA 4W52A 5G2DA 3DN3A 168LA 1XIOA 5B6ZA 1L00A 4GP4B 2OTYX 3HH3A 1L15A 4ZPUA 3DN0A 1EHKB 1B6IA 3HH6A 5G54A 4YXAC 3EH5B 3HAPA 3DN1A 1L05A 2OE9X 4GP5B 3HWLA 4I7OA 1QKOA 2G87A 4BWBA 1C6KA 4IARA 3HASA 5H2PA 4EPIA 1KY1A 252LA 1ZYTA 1C6TA 1L44A 1L99A 1L19A 1G0KA 3DN8A 243LA 1L51A 158LA 1JV7A 1KW7A 1C6AA 114LA 1L46A 178LA 1CUQA 1C6PA 2B74A 1L10A 1L76A 3HTBA 3C7YA 5EN0A 1L77A 184LA 3GUMA 1QSQA 3DN4A 4EKSA 1L39A 258LA 4LZMA 4W57A 2RB0X 3SB7A 1PQJA 4GBRB 4G7SB 172LA 2NTWA 127LA 1CV0A 4EJ4A 3KJ6A 3HUKA 2L6XA 2Y02A 1CV6A 2Y03A 210LA 1LYDA 246LA 2NTGA 3C80A 1L18A 198LA 1L82A 3OAXA 5B2NA 3C8SA 1F88A 4IB4A 2B7XA 1S54A 3QBLA 4MQTA 1QT3A 1L43A 1LYJA 3HANA 3VHZA 4MD1A 3C7WA 1L41A 1CTWA 1GUEA 5F8UA 245LA 3HAQA 3SN6R 1P36A 1X0K1 1L71A 1GZMA 131LA 2Z73A 3UTXA 1C6JA 3QAKA 3GUNA 1L06A 1P6YA 3HT8A 1JV6A 107LA 2Y00A 1LPYA 1U19A 5A8EA 241LA 4BV0A 4I7LA 2YCXA 4I7JA 1LYHA 4GBRA 5C1MA 230LA 1L25A 200LA 2RB1X 3G3WA 197LA 1PQIA 2KS9A 3VW7A 1G0LA 4GRVA 2A4TA 1OV7A 1S51A 1QTDA 3L2XA 1CX7A 3S8GB 1LWGA 1L9HA 1L47A 1L86A 1C68A 5H2MA 1C63A 5DHGA 1L88A 233LA 3HTGA 2OE4X 3L64A 4PXFA 1L02A 129LA 1D2WA 2O79A 3C8RA 5J7AA 4EKRA 3QJSB 3QJTB 2QARC 170LA 1MGYA 4EPFA 4ARLA 1KY0A 1LYFA 3DDLA 3S3DB 257LA 2LCBA 1L0JA 237LA 5AX1A 3ZPRA 1G1WA 1L33A 4GPOA 4XXJA 163LA 4MQSA 1FBBA 5G36A 1L66A 2RBQA 7LZMA 161LA 4S0WA 1P8IA 248LA 4EIYA 3G3VA 175LA 3VG9A 192LA 1OVJA 3D4SA 4I7NA 3JR6A 3C81A 3UONA 3NS0A 3NSBA 157LA 1L13A 1IW9A 4XT3A 4BUOA 1C61A 3RZEA 1QTZA 4QIDA 1LGUA 1G0MA 4LDOA 1T97A 4L35A 1C6QA 1K28A 2HUMA 3SB5A 3PWHA 1L20A 1LGXA 2ANXA 4JR8A 4LDEA 1QS9A 5LWEA 4PXKA 187LA 2BRDA 2YDVA 1L27A 4EKPA 1G0QA 2B72A 1M0KA 219LA 1P8UA 5JJJA 2F2QA 4G7RB 4MD2A 1L67A 5BR5A 3SB9A 255LA 2NTUA 2RB2X 1CX6A 1L68A 3REYA 2RBOA 2NTHA 2PEDA 218LA 4GP8B 1L74A 2RBPA 1QS5A 3GUIA 1QKPA 1S8JA 4PJZA 1AT9A 1T6HA 3G3XA 3HDEA 1QT8A 1P8HA 4G70B 220LA 2L78A 4EKQA 143LA 1L69A 4AQNA 2X72A 4HWLA 112LA 1P46A 4A4MA 1L65A 2AT9A 2Y04A 103LA 3PXOA 1BM1A 3VVKA 1QUGA 1H68A 1L14A 1DYAA 1L96A 3FA0A 211LA 6LZMA 1KG9A 2OEAX 1S8LA 3CDQA 4HYXA 2LZMA 1C6HA 4W53A 151LA 3DMVA 1BRRA 2RH1A 247LA 3AM6A 201LA 1PXRA 3F8VA 1IW6A 2HULA 1FBKA 1L32A 1CWQA 5B34A 1L95A 2IGCA 5AHYA 1QHJA 3HT6A 1C6NA 1CV1A 1L29A 2B6WA 1G1VA 2WJKA 1L80A 167LA 1QT7A 1PY6A 3HUQA 4I7TA 1C6IA 164LA 1L17A 1C62A 217LA 3A7KA 2I20A 5KKHA 1KW5A 1AP9A 3QDCA 1C6EA 2F47A 3S8FB 1L07A 1T8FA 2RAYX 5JJNA 4W59A 4XTOA 177LA 3OE0A 1M0MA 235LA 3C7ZA 1S52A 2ZZLA 1QUHA 1T8GA 5A45A 1G0GA 1L52A 3SBAA 4W58A 176LA 1DYDA 1R2NA 1GU8A 189LA 3X3CA 171LA 1L56A 1CV3A 4JQ6A 3QBIA 3S3BB 128LA 1LGWA 4FAAB 3WQJA 1CVKA 1C6MA 1L0KA 1SSYA 2RBRA 1XEPA 5B6VA 3FI5A 188LA 3DNAA 2B6ZA 5B6YA 1PQKA 1L09A 3DMXA 5AWZA 1P37A 236LA 2KSYA 2JAGA 242LA 2R4RA 155LA 2Q9DA 1XJTA 212LA 1C6CA 254LA 1L73A 2B75A 150LA 1DYGA 1C3WA 2KSBA 2Z6BA 240LA 2RAZX 3DQBA 1G0JA 2CUUA 2QPDB 2QPEB 111LA 3HDFA 3ABWA 3QBKA 140LA 1E0PA 1CV4A 3EMLA 1L62A 3GUOA 3UTYA 3T45A 1P56A 162LA 3EH3B 1TN5A 1L12A 256LA 1VGOA 3MBVA 3C83A 4QRYA 1L89A 3ZPQA 1L63A 4XTLA 1F50A 1BRXA 3DMZA 3UZCA 2OU9A 3PQRA 5AX0A 5ETZA 4E97A 1XJUA 1L24A 1L54A 5H2NA 3AYNA 4JKVA 4AMIA 1L11A 148LE 1C60A 2O7AA 4W54A 4G72B 4XTNA 4DJHA 2J4YA 4OV0A 2RBSA 1P3NA 1L84A 3F9LA 1OVKA 1C67A 1DYEA 4K5YA 1WTHA 3HH4A 1IXFA 4G71B 2B6TA 5LZMA 1CU0A 4KNFA 222LA 5B0WA 1OWYA 5AZDA 5BR2A 4OO9A 182LA 137LA 186LA 1KS3A 1CUPA 3NY8A 1L61A 5G2AA 1X0I1 119LA 4L6RA 1L38A 3ODUA 1BRDA 173LA 1L45A 3P0GA 130LA 1C6BA 2HPYA 1R84A 1OWZA 4GYCA 3CODA 4FA7B 1JQUA 4X31A 1SWZA 1OYUA 4ARMB 2LC9A 1HZXA 3UTVA 232LA 227LA 5H2OA 1LYGA 1P7SA 3UZAA 144LA 1L48A 1SX2A 4BEYA 3QJRB 4X1HA 1NHBA 1O0AA 2EI4A 1L31A 149LA 159LA 2HUKA 5DHHA 4I7QA 126LA 4W55A 4W56A 2JAFA 5B6WA 1CU6A 4I7MA 1L93A 3FADA 4IAQA 226LA 1L87A 4W51A 3UG9A 1QT5A 125LA 191LA 3HH5A 3HARA 2RBNA 4KLYA 1C66A 1L42A 2OTZX 2OU0X 4DKLA 1L94A 3HT7A 3HUAA 1L72A 5H2JA 1P64A 2F95A 3HAOA 174LA 4N6HA 2B73A 4ARMA 1XMEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
123LA 1L64A 3IJVA 4AGAA 3CDVA 1IP4A 5G53A 4NHSA 2I1XA 5HQ1A 1Q5JA 4HPIA 5LVGA 3PDSA 3RUNA 1ZURA 1LOZA 2A7FA 4OOOA 3QBGA 1LCNA 142LA 3P65A 1L35A 205LA 3OE9A 5HMVA 1C10A 2N5ZA 2EQLA 4XJBA 4BEZA 2R4SA 3K2RA 1TN0A 4HV1A 1LJGA 1XJIA 5F16A 132LA 2BQOA 122LA 4H90A 180LA 3P64A 4LDLA 1GFGA 3AJNA 1GB9A 4ARQB 4DD1A 110LA 1L01A 1HENA 1GF9A 3VGAA 1E12A 4TL3A 2O4WA 1C8SA 1C69A 2KSAA 4U3XB 1P2LA 4KXIA 1KGBA 1L98A 5AHZA 1ZWNA 5H2KA 1LI3A 4M4OA 1CKHA 3RT5X 4PK0A 206LA 1H2SA 4NSJA 3AYMA 1KMEA 1N4FA 135LA 4ARQA 4DQJA 1L55A 3WULA 4GLVA 1F6RA 3OE6A 3IJUA 4B4JA 1L30A 3QJUB 1QUDA 3CSRA 3A93A 181LA 4G4HA 2LNLA 154LA 1C6FA 2Z2EA 3SB8A 1KIRC 3HU9A 3RFMA 2MEHA 3C8QA 2YBHA 4YF2A 4G49A 4NC3A 3TMXA 228LA 1L53A 2ZQ4A 1IWWA 4J7VA 1KXWA 4Z3MA 2BQFA 4B49A 1EPYA 1F4ZA 1DKJA 4MSTA 3CSQA 5LVHA 1JGJA 1G0PA 1L85A 3FI7A 5I4YA 3MGWA 3DN2A 2B5ZA 1TLAA 1NF5A 2MEAA 195LA 1HEQA 2Z39A 168LA 4N1CC 4BAFA 4YXAC 2DQAA 3EH5B 3T6UA 1CJ6A 1QKOA 4BWBA 2F4GA 3D9AC 4IARA 4XJFA 252LA 1IP2A 3GXKA 3DN8A 243LA 4NHQA 1KW7A 1C6AA 1B9OA 1XEJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3PWH A;  1L20 A;  1LGX A;  2ANX A;  4JR8 A;  4LDE A;  1QS9 A;  5LWE A;  4PXK A;  187L A;  2BRD A;  2YDV A;  1L27 A;  4EKP A;  1G0Q A;  2B72 A;  1M0K A;  219L A;  1P8U A;  5JJJ A;  2F2Q A;  4G7R B;  4MD2 A;  1L67 A;  5BR5 A;  3SB9 A;  255L A;  2NTU A;  2RB2 X;  1CX6 A;  1L68 A;  3REY A;  2RBO A;  2NTH A;  2PED A;  218L A;  4GP8 B;  1L74 A;  2RBP A;  1QS5 A;  3GUI A;  1QKP A;  1S8J A;  4PJZ A;  1AT9 A;  1T6H A;  3G3X A;  3HDE A;  1QT8 A;  1P8H A;  4G70 B;  220L A;  2L78 A;  4EKQ A;  143L A;  1L69 A;  4AQN A;  2X72 A;  4HWL A;  112L A;  1P46 A;  4A4M A;  1L65 A;  2AT9 A;  2Y04 A;  103L A;  3PXO A;  1BM1 A;  3VVK A;  1QUG A;  1H68 A;  1L14 A;  1DYA A;  1L96 A;  3FA0 A;  211L A;  6LZM A;  1KG9 A;  2OEA X;  1S8L A;  3CDQ A;  4HYX A;  2LZM A;  1C6H A;  4W53 A;  151L A;  3DMV A;  1BRR A;  2RH1 A;  247L A;  3AM6 A;  201L A;  1PXR A;  3F8V A;  1IW6 A;  2HUL A;  1FBK A;  1L32 A;  1CWQ A;  5B34 A;  1L95 A;  2IGC A;  5AHY A;  1QHJ A;  3HT6 A;  1C6N A;  1CV1 A;  1L29 A;  2B6W A;  1G1V A;  2WJK A;  1L80 A;  167L A;  1QT7 A;  1PY6 A;  3HUQ A;  4I7T A;  1C6I A;  164L A;  1L17 A;  1C62 A;  217L A;  3A7K A;  2I20 A;  5KKH A;  1KW5 A;  1AP9 A;  3QDC A;  1C6E A;  2F47 A;  3S8F B;  1L07 A;  1T8F A;  2RAY X;  5JJN A;  4W59 A;  4XTO A;  177L A;  3OE0 A;  1M0M A;  235L A;  3C7Z A;  1S52 A;  2ZZL A;  1QUH A;  1T8G A;  5A45 A;  1G0G A;  1L52 A;  3SBA A;  4W58 A;  176L A;  1DYD A;  1R2N A;  1GU8 A;  189L A;  3X3C A;  171L A;  1L56 A;  1CV3 A;  4JQ6 A;  3QBI A;  3S3B B;  128L A;  1LGW A;  4FAA B;  3WQJ A;  1CVK A;  1C6M A;  1L0K A;  1SSY A;  2RBR A;  1XEP A;  5B6V A;  3FI5 A;  188L A;  3DNA A;  2B6Z A;  5B6Y A;  1PQK A;  1L09 A;  3DMX A;  5AWZ A;  1P37 A;  236L A;  2KSY A;  2JAG A;  242L A;  2R4R A;  155L A;  2Q9D A;  1XJT A;  212L A;  1C6C A;  254L A;  1L73 A;  2B75 A;  150L A;  1DYG A;  1C3W A;  2KSB A;  2Z6B A;  240L A;  2RAZ X;  3DQB A;  1G0J A;  2CUU A;  2QPD B;  2QPE B;  111L A;  3HDF A;  3ABW A;  3QBK A;  140L A;  1E0P A;  1CV4 A;  3EML A;  1L62 A;  3GUO A;  3UTY A;  3T45 A;  1P56 A;  162L A;  3EH3 B;  1TN5 A;  1L12 A;  256L A;  1VGO A;  3MBV A;  3C83 A;  4QRY A;  1L89 A;  3ZPQ A;  1L63 A;  4XTL A;  1F50 A;  1BRX A;  3DMZ A;  3UZC A;  2OU9 A;  3PQR A;  5AX0 A;  5ETZ A;  4E97 A;  1XJU A;  1L24 A;  1L54 A;  5H2N A;  3AYN A;  4JKV A;  4AMI A;  1L11 A;  148L E;  1C60 A;  2O7A A;  4W54 A;  4G72 B;  4XTN A;  4DJH A;  2J4Y A;  4OV0 A;  2RBS A;  1P3N A;  1L84 A;  3F9L A;  1OVK A;  1C67 A;  1DYE A;  4K5Y A;  1WTH A;  3HH4 A;  1IXF A;  4G71 B;  2B6T A;  5LZM A;  1CU0 A;  4KNF A;  222L A;  5B0W A;  1OWY A;  5AZD A;  5BR2 A;  4OO9 A;  182L A;  137L A;  186L A;  1KS3 A;  1CUP A;  3NY8 A;  1L61 A;  5G2A A;  1X0I 1;  119L A;  4L6R A;  1L38 A;  3ODU A;  1BRD A;  173L A;  1L45 A;  3P0G A;  130L A;  1C6B A;  2HPY A;  1R84 A;  1OWZ A;  4GYC A;  3COD A;  4FA7 B;  1JQU A;  4X31 A;  1SWZ A;  1OYU A;  4ARM B;  2LC9 A;  1HZX A;  3UTV A;  232L A;  227L A;  5H2O A;  1LYG A;  1P7S A;  3UZA A;  144L A;  1L48 A;  1SX2 A;  4BEY A;  3QJR B;  4X1H A;  1NHB A;  1O0A A;  2EI4 A;  1L31 A;  149L A;  159L A;  2HUK A;  5DHH A;  4I7Q A;  126L A;  4W55 A;  4W56 A;  2JAF A;  5B6W A;  1CU6 A;  4I7M A;  1L93 A;  3FAD A;  4IAQ A;  226L A;  1L87 A;  4W51 A;  3UG9 A;  1QT5 A;  125L A;  191L A;  3HH5 A;  3HAR A;  2RBN A;  4KLY A;  1C66 A;  1L42 A;  2OTZ X;  2OU0 X;  4DKL A;  1L94 A;  3HT7 A;  3HUA A;  1L72 A;  5H2J A;  1P64 A;  2F95 A;  3HAO A;  174L A;  4N6H A;  2B73 A;  4ARM A;  1XME B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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