4K5YA

Crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 1 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
411
structure length
407
Chain Sequence
HYHVAAIINYLGHCISLVALLVAFVLFLRARSIRCLRNIIHANLIAAFILRNATWFVVQLTMSPEVHQSNVGWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLSVAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVIATFRTGTWDAYDRLRAWMFICIGWGVPFPIIVAWAIGKLYYDNEKCWAGKRPGVYTDYIYQGPMALVLLINFIFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQARKAVKATLVLLPLLGITYMLAFVNEVSRVVFIYFNAFLESFQGFFVSVFACFLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein, receptor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Corticotropin-releasing factor receptor 1, T4-Lysozyme chime
total genus 148
structure length 407
sequence length 411
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4k5yA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4k5yA01
1L26A 3QBLA 3RUNA 4I7TA 1QKPA 1QT8A 144LA 1C6MA 4GPOA 1OVJA 161LA 3C7ZA 1JQUA 3KJ6A 3X3BA 3HUQA 1P8UA 125LA 1L86A 1QTCA 3C81A 2KSAA 5B6ZA 4W58A 4X31A 1SSYA 1QTVA 1L00A 172LA 1L38A 3GUKA 3DMZA 191LA 2M3GA 3DDLA 3GUIA 5H2PA 1QHJA 5J7AA 1Q5IA 3ZEVA 107LA 155LA 2O4WA 1CV3A 1KS3A 1L67A 4BVNA 1G07A 2HUKA 216LA 4QRYA 3SB5A 5B6WA 171LA 1KW5A 1XJIA 1C62A 1S52A 1LI2A 1QUDA 1ZWNA 3QBIA 3HWLA 2Y04A 4IAQA 1QTHA 3REYA 1OVKA 1PQJA 1L89A 2CUUA 1L56A 5LZMA 146LA 3HTBA 2AT9A 1L70A 4EPFA 3C83A 188LA 1L46A 252LA 2B73A 5G54A 1L62A 1LYEA 231LA 2YCZA 1L96A 2B7XA 1PQOA 4BUOA 1T8FA 1SWYA 4DKLA 2NTGA 2OEAX 1L48A 2Y00A 3WQJA 3SB7A 4I7QA 1QS5A 4W53A 4X32A 1LWGA 3UTXA 1O0AA 1L05A 1T97A 3OAXA 3OE0A 1L16A 1OV7A 1C6BA 3VVKA 4I7NA 2NTUA 4ARPA 206LA 1JFPA 3HDEA 3EH5B 1F4ZA 4I7LA 236LA 3SN6R 2B6TA 2LNLA 3DMXA 1L93A 3C80A 5ITCA 1L35A 5KKHA 1LYFA 164LA 131LA 4HYJA 1P7SA 3VHZA 3S8FB 225LA 3DN2A 4EXMA 1L77A 1L28A 1BRRA 1IW6A 1L33A 1C6KA 1PQKA 6LZMA 1KY0A 2RBQA 1L82A 4ARMB 1P8HA 1C60A 1C6GA 2YDOA 1PQMA 2Y03A 1ZYTA 4GYCA 4MBSA 177LA 2L78A 4ARLA 3HARA 1P64A 4OV0A 3UTVA 3RFMA 138LA 3QAPA 1L11A 2EI4A 1KW7A 234LA 5G2DA 4LDOA 189LA 1D2YA 1C6IA 1MGYA 2YDVA 3S3CB 156LA 2KSBA 1L44A 2B74A 1U19A 4JKVA 4L35A 1L72A 1L60A 3QJUB 130LA 163LA 244LA 1C6EA 1D9WA 180LA 2RBNA 241LA 102LA 152LA 1F50A 1DYBA 1L18A 3HU9A 3EH3B 3HANA 4XTNA 2RB2X 4YXAC 4TL3A 4ARQB 1L02A 1PQIA 1G1WA 108LA 1L54A 1LYJA 4G70B 1L19A 173LA 242LA 1L98A 2L6XA 1LYGA 2F32A 1HZXA 5H2NA 1BRXA 126LA 4FA7B 1LPYA 128LA 215LA 222LA 1C6CA 5ETZA 214LA 3VW7A 1G0QA 4G71B 1DYEA 3QAKA 1CU2A 198LA 1GU8A 148LE 1QTZA 3DN8A 3EMLA 4LZMA 1DZEA 1G0KA 3HU8A 1P3NA 2OE9X 1B6IA 1L53A 4WAVA 3C8SA 4IB4A 1L39A 174LA 3JR6A 2ZZLA 3HH5A 5H2KA 4I7OA 3HTGA 2G87A 2OU8A 1QS9A 114LA 113LA 2RBRA 262LA 3HAOA 3HH6A 4BEYA 1PY6A 1JGJA 1L10A 1OVHA 1L85A 4QIDA 2NTHA 1P5CA 211LA 5H2OA 4WW3A 232LA 1L75A 1PQDA 1P56A 5B0WA 2BRDA 2IGCA 4I7KA 2OTZX 1H2SA 3FADA 3A7KA 3PWHA 3PBLA 1KNIA 1XJTA 2B6ZA 4KLYA 5G53A 3QDCA 2PEDA 182LA 1KMEA 3AYNA 1QUHA 2KSYA 1C6FA 4N6HA 1L36A 1C6HA 3UTWA 2QB0B 1M0LA 1L49A 2JAFA 1QT3A 175LA 118LA 212LA 3FA0A 5JJJA 141LA 200LA 3NS0A 4AMJA 4I7SA 1OWZA 1CU5A 1L9HA 1L0KA 7LZMA 5BR5A 1WTHA 4IAPA 1EHKB 4MQTA 1M0KA 1CV5A 1L21A 1SX7A 1L65A 3VI0A 1L42A 1L95A 1TN5A 1L29A 2A4TA 1GUEA 1XIOA 4G7RB 4QI1A 5JJNA 1G1VA 147LA 183LA 4EKQA 3K2RA 1P37A 1JV7A 2KS9A 1S53A 120LA 243LA 4I7JA 1LW9A 1JTNA 2JAGA 5H2IA 3DQBA 3HASA 1C6PA 1CX7A 1IXFA 122LA 4X1HA 1FBBA 246LA 2QARC 261LA 5ITEA 3HAQA 2ANVA 1P46A 4W57A 1C8SA 4EKSA 4PK0A 1X0I1 2ZIYA 123LA 3QJVB 150LA 5B35A 1L06A 1L0JA 1R84A 3DN0A 3OE6A 5H2LA 3CODA 195LA 1S8JA 4BWBA 3SB9A 1JV6A 4OO9A 4IARA 1I6SA 3CDOA 149LA 1P2LA 4I7PA 4G7SB 1C61A 1XMEB 157LA 178LA 1T6HA 196LA 1L81A 2OE7X 111LA 4FPDA 3QBGA 1C67A 245LA 3HT6A 1L69A 2Z55A 1LYDA 4PJZA 1UCQA 226LA 220LA 115LA 4W59A 2F93A 1CWQA 1NHBA 2RBOA 1L63A 3COCA 4JR8A 3OE8A 1VJMA 5B6YA 1C6JA 185LA 4W54A 1L40A 221LA 1H68A 2Q9DA 3MBVA 1L22A 4LDLA 5G2AA 1L27A 4XXJA 3DNAA 1FBKA 255LA 3DN6A 1L41A 1ZURA 1L37A 4FBZA 1C6TA 1L57A 3G3WA 1KG9A 1KGBA 1C68A 217LA 5G36A 1G0JA 5G2CA 210LA 5JJEA 1DYGA 1L91A 1CU3A 3SBAA 4GBRA 3DMVA 5B2NA 5F8UA 197LA 4MD2A 1L64A 4LDEA 1C3WA 4ARJA 1L87A 176LA 1KG8A 1LLHA 1L61A 237LA 235LA 4JQ6A 1CUQA 3PDSA 3NY9A 4I7MA 3DN1A 4W55A 3CDRA 3DKEX 3GUPA 5A45A 1T8AA 1D3NA 223LA 1X0K1 251LA 4YXCA 2ANXA 1C6AA 2HULA 2ZFEA 2LC9A 1UAZA 201LA 160LA 1L03A 5AWZA 5AHZA 2RAYX 1L73A 229LA 3GUMA 3HT7A 1LGUA 1E0PA 3PXOA 165LA 1G06A 1C8RA 3AM6A 3QJSB 3DN4A 1SSWA 5H2JA 1LN6A 1L50A 1P6YA 1AP9A 1L07A 3FI5A 1L68A 1CU6A 168LA 249LA 3CDVA 2R4RA 3C9MA 209LA 5A44A 1L43A 224LA 5AHYA 4XTOA 2YCWA 1SX2A 1D2WA 1D3FA 145LA 4XT3A 239LA 2OU9A 3HT8A 3UONA 1L31A 1QSQA 1L74A 3RZEA 1P8IA 1L76A 2NTWA 2F47A 3PQRA 1S54A 2F2QA 247LA 4BV0A 5FJGA 3SB6A 1L23A 3C8RA 1LI6A 4PXKA 3GUOA 2Z6BA 5DYSA 3CDQA 4YX7C 119LA 4GRVA 1L97A 4GBRB 4EIYA 1L88A 3SBBC 1QT7A 3F9LA 159LA 4EKRA 5C1MA 3G3XA 2Y02A 1C6DA 2QPDB 1OYUA 5BR2A 254LA 110LA 2OU0X 3UG9A 257LA 129LA 1C66A 3HDFA 258LA 1PXSA 1CV6A 1L80A 192LA 4PXFA 1L47A 3LZMA 4HWLA 4ARMA 2RAZX 1QT4A 4UHRA 4GP5B 3HTDA 1S51A 2F95A 1P2RA 1L17A 3CAPA 2I1XA 1L15A 233LA 3S3DB 3S8GB 1PXRA 1G0MA 3HTFA 3C9LA 1S8LA 1QUGA 4EA3A 5B6VA 2LCBA 1QT6A 3C8QA 1DYCA 1L01A 3C82A 1OWYA 4N4WA 4W52A 259LA 3QJQB 1BM1A 1L58A 1LI3A 4I7RA 4L6RA 4N4YB 4AMIA 4S0WA 190LA 2OE4X 3OE9A 5AX1A 3UZCA 1C63A 1BRDA 158LA 1C6QA 1M0MA 2R4SA 1L51A 2I21A 1LWKA 4HYXA 2WJKA 1XJUA 181LA 142LA 3ZPQA 4ARQA 248LA 1G0GA 2I20A 3P0GA 2B72A 4EPIA 1L90A 1QTDA 2B70A 4MQSA 169LA 1DYDA 167LA 1L0MA 4EJ4A 2HPYA 1L84A 1CUPA 1L45A 5H2MA 151LA 2RBPA 1C64A 112LA 2O7AA 3HH4A 1F88A 3QJTB 2RBSA 4XTLA 4XT1A 1IW9A 5TGZA 3VGAA 1G0PA 3D4SA 4MD1A 3V2YA 1L20A 2B6YA 1DYAA 127LA 3GUJA 2QPEB 143LA 1KY1A 1L66A 170LA 1L09A 4E97A 3HUKA 3GULA 5G28A 1X0SA 103LA 4ZPUA 2Y01A 3S3BB 1P36A 3EH4B 187LA 230LA 1Q5JA 2VT4A 3ZPRA 1L52A 3QJRB 1CU0A 3HAPA 3T45A 3ODUA 1L83A 253LA 3HT9A 109LA 228LA 5I14A 3UZAA 1D3JA 1L59A 3SB8A 5A8EA 1CVKA 5DHGA 4AQNA 1L55A 227LA 1EPYA 1QM8A 5B34A 1L94A 3QBKA 1CV0A 2WJLA 205LA 238LA 1L04A 2RH1A 3L64A 3G3VA 3DN3A 3BVDB 2OTYX 199LA 1L25A 1QSBA 184LA 250LA 1CV1A 4DJHA 5B6XA 1L99A 1L24A 3C7WA 1SWZA 256LA 2J4YA 3NY8A 1TN0A 4W56A 1CTWA 2YCXA 4J4QA 1L14A 2RB0X 4W51A 137LA 1OV5A 1L92A 4Y9HA 260LA 5LWEA 166LA 3AYMA 1QTBA 1L08A 3CDTA 4NC3A 1VGOA 4BEZA 1C6LA 1LYHA 4DAJA 2O79A 1QKOA 2X72A 5EN0A 1C6NA 4KNFA 1L30A 4K5YA 2Z73A 1R2NA 3ABWA 1L13A 240LA 4GP8B 1LGWA 2YCYA 4FAAB 2HUMA 1TLAA 1L79A 1T8GA 1LGXA 2B6WA 3HH3A 1L34A 1GZMA 1K28A 1JTMA 2I35A 2LZMA 1G0LA 1C69A 1L12A 1DYFA 5H2HA 3X3CA 4GP4B 2B6XA 139LA 1E12A 3HUAA 1LYIA 219LA 1C65A 3V2WA 5DHHA 3VG9A 1AT9A 218LA 3C7YA 162LA 5AZDA 1L32A 1CV4A 3L2XA 3UTYA 5AX0A 3F8VA 3NYAA 4A4MA 4EKPA 1QT5A 1L71A 186LA 4G72B 213LA 1D3MA 104LA 2RB1X 3GUNA 1QUOA 4G7QB 2B75A 1CX6A 3NSBA 2Q9EA 4UG2A 140LA 1XEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RUNA 4NSJA 2BQGA 4X3BA 161LA 3C7ZA 1HFYA 1P8UA 3C81A 5B6ZA 1L38A 1GF8A 3GUIA 5J7AA 3A93A 107LA 2DQGY 1RJCB 3SB5A 1IOCA 171LA 4HJVA 3TMVA 1S52A 1LI2A 1ZWNA 4H8YA 1QTHA 1DPWA 2BQOA 3REYA 1L89A 2CUUA 146LA 3HTBA 1L70A 1VEDA 2EIZC 1IR9A 4EPFA 5F14A 2B73A 1LYEA 5T3FA 1L96A 1B5UA 1UIAA 3RU5A 1KXWA 4OWCA 3SB7A 1J1XY 1QS5A 1TAYA 4W53A 1LWGA 4FDYA 1B2KA 1DPXA 1LZSA 3OAXA 3OE0A 4OOOA 1L16A 1LHMA 4I7NA 2C8PA 4HJYA 2LNLA 236LA 3DMXA 5ITCA 4WLDA 5APEA 3DN2A 1LKSA 3WUNA 1L77A 1L28A 3W6BA 3B0OA 6LZMA 1GF9A 2Y8PA 4ARMB 2H5ZA 4GYCA 177LA 2L78A 4ARLA 3HARA 4OV0A 1LZTA 1HFXA 1YKYX 5G2DA 234LA 1UCOA 1LJJA 4QEQA 1L44A 2B74A 3A6CY 1HC0A 1U19A 3TXEA 3QJUB 2RBNA 4RW1A 152LA 1LZ4A 1DYBA 4YXAC 1XSFA 4L41A 1L54A 1IWYA 1GB0A 1VFBC 1UIFA 2YVBA 1BRXA 4OWEA 1LSBA 4GLAA 1G0QA 1GFUA 4OWAA 4EMNA 1D0LA 148LE 1JTPL 5L9JA 4H9AA 1B6IA 1L53A 2D4JA 2EKSC 3B0KA 1FLYA 1L39A 2BLYA 3JR6A 3HH5A 4HTKA 2G87A 1OUEA 2RBRA 1PZYA 2EPEA 4QIDA 4DD7A 1LZ9A 4WW3A 5KXLA 5B0WA 1P56A 4C5FA 1VDQA 3A7KA 5G53A 1LHKA 3QDCA 2NWDX 3AYNA 2KSYA 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 1SSW A;  5H2J A;  1LN6 A;  1L50 A;  1P6Y A;  1AP9 A;  1L07 A;  3FI5 A;  1L68 A;  1CU6 A;  168L A;  249L A;  3CDV A;  2R4R A;  3C9M A;  209L A;  5A44 A;  1L43 A;  224L A;  5AHY A;  4XTO A;  2YCW A;  1SX2 A;  1D2W A;  1D3F A;  145L A;  4XT3 A;  239L A;  2OU9 A;  3HT8 A;  3UON A;  1L31 A;  1QSQ A;  1L74 A;  3RZE A;  1P8I A;  1L76 A;  2NTW A;  2F47 A;  3PQR A;  1S54 A;  2F2Q A;  247L A;  4BV0 A;  5FJG A;  3SB6 A;  1L23 A;  3C8R A;  1LI6 A;  4PXK A;  3GUO A;  2Z6B A;  5DYS A;  3CDQ A;  4YX7 C;  119L A;  4GRV A;  1L97 A;  4GBR B;  4EIY A;  1L88 A;  3SBB C;  1QT7 A;  3F9L A;  159L A;  4EKR A;  5C1M A;  3G3X A;  2Y02 A;  1C6D A;  2QPD B;  1OYU A;  5BR2 A;  254L A;  110L A;  2OU0 X;  3UG9 A;  257L A;  129L A;  1C66 A;  3HDF A;  258L A;  1PXS A;  1CV6 A;  1L80 A;  192L A;  4PXF A;  1L47 A;  3LZM A;  4HWL A;  4ARM A;  2RAZ X;  1QT4 A;  4UHR A;  4GP5 B;  3HTD A;  1S51 A;  2F95 A;  1P2R A;  1L17 A;  3CAP A;  2I1X A;  1L15 A;  233L A;  3S3D B;  3S8G B;  1PXR A;  1G0M A;  3HTF A;  3C9L A;  1S8L A;  1QUG A; 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 3ODU A;  1L83 A;  253L A;  3HT9 A;  109L A;  228L A;  5I14 A;  3UZA A;  1D3J A;  1L59 A;  3SB8 A;  5A8E A;  1CVK A;  5DHG A;  4AQN A;  1L55 A;  227L A;  1EPY A;  1QM8 A;  5B34 A;  1L94 A;  3QBK A;  1CV0 A;  2WJL A;  205L A;  238L A;  1L04 A;  2RH1 A;  3L64 A;  3G3V A;  3DN3 A;  3BVD B;  2OTY X;  199L A;  1L25 A;  1QSB A;  184L A;  250L A;  1CV1 A;  4DJH A;  5B6X A;  1L99 A;  1L24 A;  3C7W A;  1SWZ A;  256L A;  2J4Y A;  3NY8 A;  1TN0 A;  4W56 A;  1CTW A;  2YCX A;  4J4Q A;  1L14 A;  2RB0 X;  4W51 A;  137L A;  1OV5 A;  1L92 A;  4Y9H A;  260L A;  5LWE A;  166L A;  3AYM A;  1QTB A;  1L08 A;  3CDT A;  4NC3 A;  1VGO A;  4BEZ A;  1C6L A;  1LYH A;  4DAJ A;  2O79 A;  1QKO A;  2X72 A;  5EN0 A;  1C6N A;  4KNF A;  1L30 A;  4K5Y A;  2Z73 A;  1R2N A;  3ABW A;  1L13 A;  240L A;  4GP8 B;  1LGW A;  2YCY A;  4FAA B;  2HUM A;  1TLA A;  1L79 A;  1T8G A;  1LGX A;  2B6W A;  3HH3 A;  1L34 A;  1GZM A;  1K28 A;  1JTM A;  2I35 A;  2LZM A;  1G0L A;  1C69 A;  1L12 A;  1DYF A;  5H2H A;  3X3C A;  4GP4 B;  2B6X A;  139L A;  1E12 A;  3HUA A;  1LYI A;  219L A;  1C65 A;  3V2W A;  5DHH A;  3VG9 A;  1AT9 A;  218L A;  3C7Y A;  162L A;  5AZD A;  1L32 A;  1CV4 A;  3L2X A;  3UTY A;  5AX0 A;  3F8V A;  3NYA A;  4A4M A;  4EKP A;  1QT5 A;  1L71 A;  186L A;  4G72 B;  213L A;  1D3M A;  104L A;  2RB1 X;  3GUN A;  1QUO A;  4G7Q B;  2B75 A;  1CX6 A;  3NSB A;  2Q9E A;  4UG2 A;  140L A;  1XEP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4YXA C;  1XSF A;  4L41 A;  1L54 A;  1IWY A;  1GB0 A;  1VFB C;  1UIF A;  2YVB A;  1BRX A;  4OWE A;  1LSB A;  4GLA A;  1G0Q A;  1GFU A;  4OWA A;  4EMN A;  1D0L A;  148L E;  1JTP L;  5L9J A;  4H9A A;  1B6I A;  1L53 A;  2D4J A;  2EKS C;  3B0K A;  1FLY A;  1L39 A;  2BLY A;  3JR6 A;  3HH5 A;  4HTK A;  2G87 A;  1OUE A;  2RBR A;  1PZY A;  2EPE A;  4QID A;  4DD7 A;  1LZ9 A;  4WW3 A;  5KXL A;  5B0W A;  1P56 A;  4C5F A;  1VDQ A;  3A7K A;  5G53 A;  1LHK A;  3QDC A;  2NWD X;  3AYN A;  2KSY A;  1L36 A;  2Z38 A;  1QDT A;  1M0L A;  4CFO A;  175L A;  2DQH Y;  5JJJ A;  2IHL A;  1L9H A;  4IAP A;  1IOQ A;  3WU8 A;  4LFP A;  1F6R A;  1L42 A;  1L95 A;  1XGR C;  1ZMY L;  4G7R B;  1LHL A;  4IAT A;  147L A;  3K2R A;  1P37 A;  1XEJ A;  1JTN A;  2BQI A;  4X1H A;  4H9C A;  4WM3 A;  4N5R A;  4W57 A;  1C8S A;  150L A;  2H9J A;  5I53 A;  3WUA A;  1R84 A;  134L A;  195L A;  4BWB A;  4IAR A;  1I6S A;  3CDO A;  1P2L A;  2LYZ A;  4DD2 A;  5IDD A;  5FHW A;  178L A;  2OE7 X;  3IWR A;  1L69 A;  1I56 A;  4G4H A;  4PJZ A;  1QTK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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