4LDLA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to hydroxybenzylisoproterenol and an engineered nanobody
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
total genus 166
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldlA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldlA02
1QHJA 4KLYA 2QB0B 3HASA 2ANVA 1C6DA 3PXOA 218LA 197LA 3RFMA 1IXFA 1QTCA 2Z55A 4BEYA 2LNLA 3HDFA 1CU2A 1CVKA 231LA 1L60A 4W57A 2I20A 127LA 1L42A 1CV3A 1QT3A 4AMIA 1L71A 1L77A 4N4WA 1L61A 1DYEA 235LA 3HUQA 175LA 5B6ZA 4KNFA 140LA 2RBRA 1L47A 159LA 4PK0A 234LA 150LA 3FA0A 1C6AA 1UAZA 1KMEA 212LA 1L99A 4W54A 1L07A 1CUPA 1L62A 128LA 4EJ4A 1L51A 2PEDA 5H2PA 2RAYX 3HTBA 5G36A 4GYCA 109LA 1P8HA 4MQTA 5B34A 3C7YA 3UTVA 3S8GB 112LA 3KJ6A 3LZMA 4EPFA 192LA 1KS3A 2I35A 1L15A 1XJUA 261LA 176LA 142LA 1L14A 3C81A 3SB8A 1S53A 2KSAA 4L35A 1L44A 2LCBA 1L54A 126LA 199LA 4E97A 1S52A 5ETZA 1L32A 1OVHA 4I7NA 4ZPUA 1JV7A 220LA 3DN2A 244LA 1AP9A 232LA 120LA 1L57A 1C62A 3CDVA 4WAVA 1QUDA 1CU5A 4DAJA 3QBGA 3L64A 2J4YA 227LA 2RBQA 4W58A 5A45A 230LA 1M0KA 5JJEA 5EN0A 3QBLA 1L18A 1H2SA 3OE6A 3QAPA 1C6GA 1L31A 213LA 1HZXA 2Q9DA 4MQSA 3C82A 3GULA 143LA 1CV6A 2ZFEA 2B73A 1L82A 2L78A 1E0PA 1VJMA 4G7SB 1F50A 1SSWA 5DYSA 5AX1A 1L12A 222LA 1P8IA 1X0I1 3EH5B 1L59A 223LA 1PY6A 3AYMA 1C67A 1LLHA 137LA 3HANA 4UG2A 5JJNA 185LA 226LA 1L36A 2Y02A 1C6KA 4G72B 1P8UA 1CV4A 237LA 1L27A 1EHKB 239LA 1C6NA 1G0PA 1LGXA 1C3WA 4GBRA 171LA 1P3NA 5BR2A 4HYXA 1PQIA 5FJGA 4I7OA 3GUIA 4UHRA 2RBNA 1QTHA 2CUUA 5AHYA 1MGYA 1PQMA 210LA 3F9LA 4YXCA 2YCYA 4EKSA 1GU8A 2OEAX 1L90A 1KNIA 3DMZA 1R84A 250LA 195LA 1QTDA 1S8LA 1P64A 1L76A 198LA 5TGZA 1C6QA 1L11A 2Z6BA 1L91A 1ZURA 4LDEA 2LZMA 4XT1A 3HUAA 114LA 221LA 2OTZX 2IGCA 5G2AA 169LA 3DMXA 1K28A 1LI2A 1G0JA 5H2IA 258LA 1L24A 1L49A 1CU0A 3HT8A 4AMJA 3GUJA 167LA 4NC3A 1C6TA 148LE 3GUPA 2L6XA 2Y03A 2RH1A 7LZMA 3NY8A 3P0GA 188LA 1L94A 5H2KA 3L2XA 2R4RA 4QIDA 3NSBA 248LA 130LA 1L33A 1L85A 3RZEA 1L0MA 5G2CA 1QS9A 3UTYA 1L73A 1JTNA 5H2OA 3C83A 1C68A 2Q9EA 3HWLA 2JAGA 1G0KA 4BEZA 255LA 1OV5A 1L13A 1L41A 1L0JA 2WJKA 1L87A 1OWZA 4G7QB 201LA 2B6TA 3EMLA 1QTBA 1L25A 2B72A 191LA 1C64A 1L88A 1F4ZA 3AM6A 1G0QA 1L40A 211LA 4MD2A 1L10A 1L56A 2O4WA 4W53A 1GZMA 1SWYA 1L95A 1P5CA 123LA 2VT4A 2O79A 3EH3B 1L00A 5B35A 102LA 217LA 146LA 1L48A 1QSBA 3X3BA 229LA 3D4SA 1L81A 1X0K1 3HU8A 2NTWA 3HH5A 1L16A 2OE4X 2R4SA 180LA 3COCA 4HWLA 4ARJA 2G87A 4IAPA 118LA 1I6SA 1L93A 4JQ6A 5H2LA 155LA 181LA 1L38A 3OAXA 2Y04A 1XJTA 2AT9A 1C6HA 1NHBA 2RAZX 1L98A 233LA 3G3VA 4MD1A 1P6YA 5H2NA 4GBRB 3X3CA 1L37A 3AYNA 1L20A 1L80A 205LA 138LA 1H68A 4J4QA 2KS9A 3HTDA 1DYAA 1S8JA 4PXKA 4X1HA 4IAQA 3QJQB 1L67A 4BVNA 3GUKA 168LA 1L45A 1C6LA 4EA3A 5C1MA 4W56A 4N6HA 1QTZA 1C8RA 1C6PA 4ARMB 3HH6A 5LWEA 209LA 3UG9A 1LGWA 1QUGA 182LA 1D3JA 122LA 4IARA 4Y9HA 1P7SA 2OU9A 3DN6A 4FA7B 1L06A 3VW7A 1KGBA 1L58A 2LC9A 1QKOA 1L22A 2B6ZA 2NTUA 214LA 4AQNA 1UCQA 1D3MA 4BWBA 113LA 2B75A 170LA 3SB9A 4S0WA 3K2RA 2QPEB 1LYEA 1LYHA 4I7JA 1JGJA 4I7PA 1FBKA 1R2NA 1PQJA 3QAKA 3CDRA 3HH3A 5AWZA 2B7XA 1L0KA 3HT9A 4I7KA 3F8VA 4I7QA 2YCXA 2HUKA 1QT8A 1L17A 4ARQB 3VVKA 1L74A 1TLAA 219LA 4OV0A 2X72A 1D2WA 3DN4A 4BUOA 1CUQA 3CDQA 1L64A 2B74A 1L52A 251LA 131LA 158LA 246LA 216LA 215LA 3DN3A 4LZMA 5LZMA 1LN6A 1PXRA 4G71B 1L83A 4I7SA 1M0LA 1L08A 4GP4B 1ZYTA 3FI5A 1XEPA 4JKVA 3HAQA 4ARLA 3FADA 3C80A 2I1XA 3NY9A 4YXAC 1LI6A 3CAPA 3C7WA 1KG9A 156LA 165LA 3UZAA 1L34A 1QT5A 3G3WA 5B6XA 162LA 3A7KA 3SB6A 2F47A 5J7AA 1C69A 1BM1A 157LA 1L03A 1C6FA 1G0GA 3ABWA 1L86A 166LA 2OU0X 2YDOA 3HT6A 145LA 1QSQA 3UTWA 1L30A 2YCWA 1L96A 206LA 4HYJA 2KSBA 152LA 3WQJA 183LA 200LA 190LA 2Y00A 1L92A 189LA 1QT6A 1T8FA 3PBLA 1DZEA 4GRVA 1L05A 4K5YA 1X0SA 2RBOA 1DYDA 256LA 1CU3A 5AZDA 1L26A 1SWZA 3DDLA 3QJTB 1O0AA 2B6WA 4X31A 149LA 3OE9A 2Z73A 1LYIA 4XTOA 104LA 163LA 1QTVA 1L63A 2HULA 3OE8A 5DHGA 1GUEA 184LA 2I21A 1CX6A 225LA 1L9HA 4FAAB 3V2YA 5A8EA 2RBSA 1C6EA 1E12A 5BR5A 3CODA 3CDOA 107LA 3HU9A 257LA 1D3FA 1AT9A 2YCZA 5B0WA 5AHZA 1DYBA 2OTYX 3QDCA 3BVDB 4XT3A 1L21A 3DQBA 1OV7A 110LA 1C63A 3QJVB 4I7MA 2YDVA 1L28A 2B6YA 224LA 129LA 1C6BA 178LA 1Q5IA 3T45A 4BV0A 1BRXA 1CV1A 4I7RA 2ZZLA 1G07A 5B6WA 3VG9A 172LA 139LA 160LA 1C6CA 1LW9A 3HTGA 1L46A 252LA 1L55A 4X32A 4W59A 1IW6A 1Q5JA 1C66A 2OE7X 5H2JA 2F95A 4EPIA 4W52A 2NTGA 1D2YA 151LA 3HT7A 238LA 3OE0A 2F2QA 5AX0A 3C9LA 1M0MA 174LA 2O7AA 4FPDA 5KKHA 2HUMA 4XXJA 3DMVA 240LA 3QJUB 4W55A 3NYAA 4WW3A 1LPYA 1G1WA 3VI0A 3DKEX 3SB7A 108LA 1KY1A 5I14A 1KY0A 4PJZA 3UZCA 1EPYA 115LA 1L70A 260LA 2B6XA 1OVKA 1LGUA 4LDOA 1C8SA 1L72A 1QT7A 1T97A 2RB1X 3SBBC 1L75A 186LA 1DYFA 1QKPA 1C6MA 243LA 3MBVA 4QI1A 4G7RB 4LDLA 5G2DA 3S3CB 2RBPA 1C65A 3UTXA 1FBBA 161LA 3QJRB 4L6RA 3S8FB 1WTHA 5F8UA 1CU6A 3SN6R 5ITCA 4ARPA 1CWQA 4QRYA 5B2NA 1L39A 4PXFA 187LA 2F93A 4EIYA 1L79A 3C8SA 1JV6A 173LA 3S3BB 1P2RA 1T8AA 4G70B 2HPYA 1D3NA 1KW7A 1P36A 1P56A 2RB2X 2B70A 3ZEVA 1L09A 1QS5A 3HDEA 1L69A 1LYDA 1L04A 2WJLA 119LA 1CX7A 141LA 254LA 1L35A 1PQKA 2NTHA 4EKQA 3C9MA 4JR8A 4YX7C 1P2LA 1CTWA 1SX2A 1L43A 1L65A 1LYFA 3ZPRA 3PQRA 3G3XA 3RUNA 1KW5A 4DJHA 2OE9X 1L29A 4EKRA 1G1VA 2JAFA 2OU8A 2RB0X 4I7TA 1L02A 1P37A 1L53A 1QM8A 3QBIA 1U19A 3CDTA 3GUMA 2QARC 3ZPQA 3EH4B 1TN5A 228LA 3HAOA 262LA 3NS0A 1B6IA 1G06A 259LA 147LA 1OYUA 3DN1A 4N4YB 4A4MA 4OO9A 1OWYA 1SX7A 3HH4A 4XTNA 1CV0A 3C7ZA 1T6HA 3PDSA 3C8RA 3VHZA 1G0LA 1ZWNA 1JFPA 1S51A 5JJJA 196LA 2BRDA 4GP8B 3HTFA 1OVJA 1BRRA 3SB5A 1L84A 1D9WA 1XMEB 3PWHA 1C61A 1JTMA 1L89A 2M3GA 3QJSB 2Y01A 1L66A 242LA 4I7LA 249LA 4GPOA 2ZIYA 1LWGA 144LA 2F32A 2EI4A 1L23A 4W51A 1PQDA 1C60A 1QUHA 1KG8A 1BRDA 1SSYA 4ARMA 3UONA 1L50A 5H2HA 5B6YA 2A4TA 3VGAA 1T8GA 4FBZA 3SBAA 111LA 2ANXA 3JR6A 1XIOA 1JQUA 4IB4A 5H2MA 1F88A 3REYA 1VGOA 1LWKA 236LA 6LZMA 1DYGA 1TN0A 1IW9A 1PQOA 1LI3A 247LA 5DHHA 1L01A 4EXMA 177LA 3HARA 3DN8A 3S3DB 1L19A 4EKPA 1XJIA 5A44A 1CV5A 3DN0A 4DKLA 4GP5B 5B6VA 1L97A 1LYJA 3DNAA 125LA 4ARQA 1C6JA 3V2WA 1QT4A 1L68A 4MBSA 3HAPA 241LA 1DYCA 1LYGA 3GUOA 4TL3A 3C8QA 1C6IA 1QUOA 3ODUA 5G53A 5ITEA 3QBKA 245LA 2QPDB 5G28A 1G0MA 253LA 2KSYA 1S54A 3HUKA 3GUNA 1PXSA 4XTLA 103LA 1P46A 5G54A 164LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G3AB 3LHMA 4E3UA 218LA 197LA 5L3IA 1TAYA 1CU2A 5IDDA 127LA 5FSTA 3WU8A 1L71A 1JITA 3WL2A 1DYEA 235LA 1L47A 1F0WA 2YBNA 1C6AA 212LA 1L07A 2Z38A 3ZVQB 4DD3A 5H2PA 109LA 3UTVA 2YBIA 3KJ6A 3LZMA 2EKSC 1J1OY 192LA 1L14A 4XADA 2KSAA 3D9AC 1AP9A 120LA 1C62A 4XJDA 2BQIA 4OWBA 4PPOA 4WAVA 1QUDA 1GBZA 3QBGA 2J4YA 4NGYA 5D5FA 1AT5A 230LA 4IATA 5T3FA 3QBLA 2BQAA 3QAPA 1LHLA 1UICA 4GCBA 3GULA 1JIYA 1XEJA 1DQJC 1E0PA 5F81A 4KXIA 1SSWA 5DYSA 5AX1A 1L12A 222LA 1GFAA 1YAPA 4HJVA 3LN2A 4M4OA 5L9JA 185LA 3GXRA 4H8XA 5DL9A 3HBHA 1LHMA 5LIOA 1G0PA 1LGXA 1VDSA 171LA 5FJGA 1GAYA 4I7OA 3GUIA 1OUEA 2YCYA 4MR1A 1GU8A 1PS5A 4GN5C 1HELA 5APEA 4LT0A 1C6QA 2Z6BA 5HNLA 1L91A 4WLXA 1WQOA 1G7JC 4ANRA 5I53A 4XENA 1LZEA 1VATA 1GFGA 1LI2A 1G0JA 1IOCA 5H2IA 1L24A 1W6ZA 2IFFY 1CU0A 4AMJA 4ETBA 4NC3A 3GUPA 1AZFA 2L6XA 2RH1A 5LYMA 3P0GA 1LZTA 5H2KA 1IIZA 2IHLA 4RW2A 4YOPA 2R4RA 4XJFA 1JHLA 5E4PA 1L33A 5G2CA 1QS9A 3D3DA 1C68A 2Q9EA 5KXZA 4BEZA 1UIFA 1OV5A 1L41A 1QUTA 1L87A 4G7QB 4NIJA 2B6TA 3EMLA 1QTBA 1BB3A 1CKHA 2ZIKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CDT A;  3GUM A;  2QAR C;  3ZPQ A;  3EH4 B;  1TN5 A;  228L A;  3HAO A;  262L A;  3NS0 A;  1B6I A;  1G06 A;  259L A;  147L A;  1OYU A;  3DN1 A;  4N4Y B;  4A4M A;  4OO9 A;  1OWY A;  1SX7 A;  3HH4 A;  4XTN A;  1CV0 A;  3C7Z A;  1T6H A;  3PDS A;  3C8R A;  3VHZ A;  1G0L A;  1ZWN A;  1JFP A;  1S51 A;  5JJJ A;  196L A;  2BRD A;  4GP8 B;  3HTF A;  1OVJ A;  1BRR A;  3SB5 A;  1L84 A;  1D9W A;  1XME B;  3PWH A;  1C61 A;  1JTM A;  1L89 A;  2M3G A;  3QJS B;  2Y01 A;  1L66 A;  242L A;  4I7L A;  249L A;  4GPO A;  2ZIY A;  1LWG A;  144L A;  2F32 A;  2EI4 A;  1L23 A;  4W51 A;  1PQD A;  1C60 A;  1QUH A;  1KG8 A;  1BRD A;  1SSY A;  4ARM A;  3UON A;  1L50 A;  5H2H A;  5B6Y A;  2A4T A;  3VGA A;  1T8G A;  4FBZ A;  3SBA A;  111L A;  2ANX A;  3JR6 A;  1XIO A;  1JQU A;  4IB4 A;  5H2M A;  1F88 A;  3REY A;  1VGO A;  1LWK A;  236L A;  6LZM A;  1DYG A;  1TN0 A;  1IW9 A;  1PQO A;  1LI3 A;  247L A;  5DHH A;  1L01 A;  4EXM A;  177L A;  3HAR A;  3DN8 A;  3S3D B;  1L19 A;  4EKP A;  1XJI A;  5A44 A;  1CV5 A;  3DN0 A;  4DKL A;  4GP5 B;  5B6V A;  1L97 A;  1LYJ A;  3DNA A;  125L A;  4ARQ A;  1C6J A;  3V2W A;  1QT4 A;  1L68 A;  4MBS A;  3HAP A;  241L A;  1DYC A;  1LYG A;  3GUO A;  4TL3 A;  3C8Q A;  1C6I A;  1QUO A;  3ODU A;  5G53 A;  5ITE A;  3QBK A;  245L A;  2QPD B;  5G28 A;  1G0M A;  253L A;  2KSY A;  1S54 A;  3HUK A;  3GUN A;  1PXS A;  4XTL A;  103L A;  1P46 A;  5G54 A;  164L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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