The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
99
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sequence length |
283
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structure length |
283
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Chain Sequence |
EEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKDKLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPNAELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQYKKIVSWLEYESSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLSRRGEAHLAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAEEENKAKA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
3D structure of human FK506-binding protein 52: Implications for the assembly of the glucocorticoid receptor/Hsp90/immunophilin heterocomplex
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Isomerase
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| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
FK506-binding protein 4
|
| total genus |
99
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| structure length |
283
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| sequence length |
283
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
| pdb deposition date | 2003-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00254 | FKBP_C | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase |
| A | PF00515 | TPR_1 | Tetratricopeptide repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | ||
| Alpha Beta | Roll | Chitinase A; domain 3 | Chitinase A; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XCC A; 5LCW C; 5C1D A; 1Q6I A; 1U79 A; 4U0Z A; 2PPP A; 3NRK A; 2RUD A; 3CGN A; 4J8F A; 4ODQ A; 3VAW A; 3ASD A; 5HWB A; 2PQN A; 3UUX A; 5JJ6 A; 2KGJ A; 1FKG A; 2K8I A; 2YHC A; 3O5M A; 3Q5M A; 3U3W A; 1FKD A; 1FKF A; 4GZ6 A; 1OUV A; 3VTX A; 3TAX A; 4IQC A; 1E96 B; 4G23 A; 2RUC A; 1FKR A; 4DRI A; 2MF9 A; 3CVQ A; 3QKY A; 4LAX A; 3RKV A; 2PPO A; 4ODP A; 3OXL A; 4NQ0 A; 2PL2 A; 4LAV A; 4Y6C A; 1Q6U A; 1A17 A; 5FT9 A; 4U84 A; 1J4H A; 4I1A A; 1EYM A; 3JYJ A; 3CVP A; 2KCK A; 2KFW A; 2JLB A; 1F8A B; 3ASH A; 4YND A; 4GA0 A; 3LY8 A; 5DIV A; 1ROT A; 4APO A; 4MGV A; 4I2Z A; 5HW7 A; 2XP4 A; 1Q1C A; 3MKR A; 4U0S A; 1NMW A; 4O6F A; 3SF4 A; 4BT8 A; 3ZPJ A; 2FO7 A; 1D6O A; 4IPX A; 3I6C A; 4ME2 A; 2LSV A; 4N19 A; 1HZ4 A; 5G05 J; 1A7X A; 3PE3 A; 1M5Y A; 2M2A A; 3CGM A; 2VGX A; 4U07 A; 4DRN A; 2VYI A; 3CV0 A; 3LY7 A; 3S7B A; 4GYY A; 3WH0 A; 4LEU A; 4I9E A; 2XP3 A; 2PZI A; 4TW7 A; 4G2V A; 3OXG A; 3GW4 A; 2RUR A; 4EQF A; 2P58 C; 4TX0 A; 4JFK A; 4G24 A; 2F21 A; 2KI3 A; 2UY1 B; 5HI7 A; 4GA2 A; 4U85 A; 3AS4 A; 4TYO A; 5BT1 A; 1YAT A; 3IEG A; 2BUG A; 4A1S A; 5EX0 A; 4Y6W A; 3CVN A; 3O5F A; 5KJL A; 3Q4A B; 3RO2 A; 4KXK B; 3O5K A; 4UQX A; 3PRB A; 4AY5 A; 1ZBP A; 1FKH A; 4N3A A; 1FKT A; 4GIV A; 4F3V A; 3RIB A; 3WXX A; 2KO7 A; 4C02 B; 1PIN A; 3CK7 A; 3JYS A; 3ZHE A; 4DIP A; 1NZN A; 3LPZ A; 2LGO A; 3FAP A; 3IHZ A; 4G25 A; 4NNR A; 2XPA A; 4QIB A; 4WNF A; 1ZU2 A; 2LNI A; 3FWV A; 2N87 A; 4H7X A; 4XIF A; 4W9P A; 5KJN A; 4ITZ A; 4DT4 A; 4DZ3 A; 4DRP A; 3ZGQ A; 3MA5 A; 5ARG A; 2XP6 A; 3UQB A; 4U86 A; 5FZS A; 3NI6 A; 3ASG A; 2Y4U A; 4UQZ A; 3KAE A; 2R5S A; 1D7I A; 5HW6 A; 3N71 A; 2PQR A; 2MLZ A; 4W9R A; 4CGV A; 5EX3 A; 5A7D B; 3UI4 A; 4JFI A; 3QWV A; 4FN2 A; 1Y0O A; 4JFM A; 3TCZ A; 1T11 A; 3O5O A; 1IYG A; 1NMV A; 3LYA A; 3O5D A; 4O2T A; 2ZQV A; 1HXI A; 4U04 A; 4YVO A; 2ZQS A; 4DRM A; 1FCH A; 3O5P A; 1ROU A; 4MSP A; 3PDN A; 5HWC A; 4JHR A; 3Q49 B; 3LCA A; 4GYO A; 2L2S A; 2WQH A; 4AY6 A; 1HH8 A; 2XGM A; 4JL0 A; 2UZ5 A; 1ELR A; 3ESK A; 4H7Y A; 3IKD A; 3MV2 B; 3TG5 A; 3OOB A; 2MLY A; 4HOR A; 4RG6 A; 1C9H A; 2ZR6 A; 3MEK A; 4XI0 A; 3QDN A; 3S7D A; 2V5F A; 4TW6 A; 5GPG A; 4FAP A; 4BF8 A; 3B7X A; 5D75 A; 4J8E A; 4UI9 J; 1FKK A; 3O5J A; 3ODK A; 2XP9 A; 1F40 A; 4GZ5 A; 3KAG A; 2I6H A; 1JVW A; 3EDT B; 4LAY A; 3LY9 A; 2XPI A; 2FBN A; 3CKB A; 5HW8 A; 5J6E A; 4KYO B; 3KS2 A; 2NC9 A; 3S7J A; 3EY6 A; 1FKB A; 2Y4T A; 4WNG A; 4ABN A; 2LSU A; 2OOE A; 2PV2 A; 2E2E A; 4I2W A; 1ELW A; 2KCV A; 2FAP A; 3UPV A; 4JFJ A; 2XCB A; 2C0M A; 2KE0 A; 4GCO A; 2XEV A; 3QWP A; 4DRJ A; 5G04 J; 3CK8 A; 3H9R B; 2MHK A; 1J6Y A; 4GCN A; 2MLX A; 4CDR A; 1JNT A; 5DIT A; 3PE4 A; 1XNF A; 3RU0 A; 5JJ7 A; 1FD9 A; 5HKG A; 5A6C A; 1HXV A; 3GZ1 A; 1B89 A; 2ZR4 A; 2XP8 A; 2XGO A; 3GPK A; 5FZR A; 3O5I A; 4U0U A; 3ZFW A; 2M08 A; 4IQ2 A; 4LAW A; 4B94 A; 4TNS A; 5I98 A; 4UI9 K; 1L1P A; 2FKE A; 1JNS A; 1FKJ A; 4HOQ A; 2OFN A; 4ODL A; 5FJY A; 5M72 A; 3RJV A; 5ARF A; 4ODR A; 5EKQ D; 4I17 A; 1NA3 A; 3MDY B; 4ODK A; 3UF8 A; 1YA0 A; 5CHE E; 4G50 A; 3RGC A; 3TGO A; 2KCL A; 2DG9 A; 3AS8 A; 3KAF A; 3VTY A; 5LCW J; 2MPH A; 3Q15 A; 2RQS A; 4QT2 A; 4N2S A; 2IFU A; 2RSE A; 4G26 A; 3LKU A; 1QPL A; 4DRH A; 2M1I A; 3ZHE B; 2HR2 A; 3KCE A; 5BXJ A; 2XP7 A; 3NF1 A; 3NTP A; 3GYZ A; 3IK8 A; 1FAP A; 1PBK A; 3PRD A; 1J4R A; 4AM9 A; 2ZQU A; 1WAO 1; 2VCD A; 5FTP A; 4CGW A; 5AYW D; 2VSY A; 2XGS A; 4ODM A; 3RO3 A; 3O5L A; 3JXV A; 3CVL A; 1FJD A; 3IKG A; 1KLX A; 4BTA A; 4N2Q A; 2ZQT A; 4DH0 A; 5BNW A; 3O5G A; 2Y78 A; 5B8I C; 1D7H A; 4WND A; 3ASF A; 2VQ2 A; 2XP5 A; 4NRH B; 1NSG A; 3R9A B; 3OXF A; 5DIZ A; 4JYS A; 4BTB A; 3O5E A; 2F4E A; 4J8D A; 2VGY A; 3GZ2 A; 3TG4 A; 4N3B A; 3CK9 A; 4XI9 A; 2PPN A; 2DBA A; 4J4N A; 2C2L A; 4KBQ A; 5DIU A; 1Y8M A; 2PV1 A; 4YVQ C; 5KJM A; 2GW1 A; 5HUA A; 4WNE A; 3URZ A; 3Q47 B; 5CCM A; 2XPB A; 3KAC A; 1W3B A; 3KAB A; 2HO1 A; 5BW8 C; 2AWG A; 2LKN A; 4DRQ A; 1IHG A; 1Q6H A; 2Q7F A; 3LUO A; 4QT3 A; 1NA0 A; 2J9Q A; 3UI5 A; 3UQA A; 3FFL A; 2KC7 A; 4R0X A; 2DG3 A; 4J4O A; 1FKI A; 4HOT A; 3BEE A; 3E4B A; 4GPK A; 4ODO A; 3JYM A; 3RFW A; 4GGQ A; 3O5R A; 3CEQ A; 4GA1 A; 4HOS A; 1KT0 A; 2UWJ G; 1QPF A; 3QOU A; 4JA9 A; 4J0U A; 3SZ7 A; 3CKC A; 5HTG A; 2MNT A; 1D7J A; 5HT1 A; 1B6C A; 2LJ4 A; 4N39 A; 2D9F A; 4G2P A; 3FP3 A; 3MV3 B; 2OND A; 2VGX B; 1WM5 A; 5FZQ A; 5KJK A; 4RG9 A; 4GYW A; 2UY1 A; 2C0L A; 5JJT A; 2PBC A; 4UQY A; 3O5Q A; 2KR7 A; 5D0Q D; 4UI9 C; 4WUY A; 4N3C A; 4JA7 A; 2YQ8 A; 3UQI A; 2HYZ A; 1EQ3 A; 3U4T A; 4BWR A; 1YW5 A; 1QQE A; 4W9Q A; 4W9O A; 1ZK6 A; 3TDB A; 4GZ3 A; 2RUQ A; 3UQ3 A; 3O48 A; 2F2D A; 5DBK A; 2L6J A; 5CCL A; 5G05 C; 1J4I A; 3S7F A; 4TW8 A; 5HQ8 A; 5G04 C; 4JFL A; 3ZN3 A; 4DZ2 A; 2ZR5 A; 3UI6 A; 3KAH A; 3HYM B; 1FKL A; 2ITK A; 4N5C A; 1N1A A; 3QWW A; 1R9H A; 1TCO C; 1W26 A; 4AIF A; 1BL4 A; 2JZV A; 4HOU A; 2LPV A; 2QFC A; 4G1T A; 1QZ2 A; 4I9C A; 2FEZ A; 2FF4 A; 1KT1 A; 4DRO A; 1ZCN A; 3KAD A; 2VSN A; 3KZ7 A; 2IF4 A; 4DRK A; 2FI7 A; 5D0O D; 3ULQ A; 2Q5A A; 1P5Q A; 3K9I A; 3AS5 A; 2VN1 A; 3KAI A; 1TJC A; 1BKF A; 3TC5 A; 1FKS A; 2KAT A; 4BT9 A; 4IN3 B; 4ODN A; 2PV3 A; 1PC2 A; 2AVP A; 2WPV A; 2DG4 A; 3PA7 A; 3KD7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CVY A; 1VF8 A; 5CED B; 1N4P A; 5LCW C; 1NI1 A; 3NRK A; 4F1S A; 1TR4 A; 2I9C A; 4MNJ A; 3VAW A; 1JWF A; 2OEW A; 1GPF A; 3Q5M A; 3ZW3 A; 2KM4 A; 2OV8 A; 2XPZ A; 3VTX A; 4IQC A; 1E96 B; 5FQ7 A; 5AJD A; 2PPO A; 3TWW A; 4ODP A; 2MYO A; 2P9K G; 5FT9 A; 2P9L G; 3ARV A; 3JYJ A; 3CVP A; 1ZL1 A; 2JLB A; 2DVW A; 3JQ0 A; 4HRM B; 1F8A B; 4DPR A; 4YND A; 4GTQ A; 5C2Y A; 3MKR A; 4ML4 A; 1MZC A; 3DXK G; 3PRA A; 4IPX A; 4N19 A; 1HZ4 A; 5G05 J; 1LL6 A; 3FH7 A; 2M2A A; 4S3K A; 1E6P A; 3CVU A; 3LY7 A; 3UX4 A; 3B8S A; 3S7B A; 4GYY A; 2XS8 A; 4LEU A; 3DRA A; 2XP3 A; 3VLD A; 2PZI A; 3FUM A; 2F8Y A; 3FUD A; 3GW4 A; 2P9N G; 2WMN A; 2DWZ A; 4DK5 A; 4JFK A; 2KI3 A; 2H6F A; 1KZO A; 4BES A; 1UN8 A; 1JPL A; 3AS2 A; 4U85 A; 3AS4 A; 3RAU A; 1HKM A; 5EX0 A; 4Y6W A; 3CVN A; 3D9P A; 3PS6 A; 4KXK B; 3AAA C; 4UQX A; 2GRL A; 3BU8 A; 3ZXP A; 4F3V A; 1SA5 A; 2X3M A; 4PS8 A; 2IUZ A; 4JXT A; 1ZU8 A; 2CG2 A; 2RFM A; 3CH9 A; 4MKT A; 2LGO A; 5ITZ F; 4GTT A; 4I1O B; 4DX7 D; 5ANR A; 4W9P A; 3CQG B; 2DSU A; 3IXE A; 3MA5 A; 4Q22 A; 2P9I G; 3ESL A; 3UIN C; 5HW6 A; 1O1S A; 4JZY A; 4CGV A; 3UI4 A; 4TXR A; 4FN2 A; 2WXK A; 1Y0O A; 3LJN A; 4JFM A; 2YIN A; 5DEZ A; 4YVO A; 5BUZ A; 4MSP A; 5CRU A; 4JHR A; 3MJW A; 4GYO A; 2WQH A; 3MYV A; 4AY6 A; 4J7W A; 4JL0 A; 2IJG X; 3EHN A; 2XRZ A; 3ESK A; 1Z6T A; 4B93 B; 5AN8 A; 3T5X A; 2LAI A; 2MLY A; 5AAR A; 2OEV A; 2ZR6 A; 4XI0 A; 5GPG A; 3B7X A; 1XHG A; 3B9A A; 5AIJ A; 2XP9 A; 4KQZ A; 2P9U G; 4R5E A; 2ZIS A; 4Q7N A; 4LAY A; 3LY9 A; 4ILH B; 3ZXS A; 3HRA A; 5CBO A; 2XPI A; 3D9K A; 2FBN A; 3CKB A; 2VSX E; 2NC9 A; 3CST A; 1FKB A; 1H2V C; 2PV2 A; 2E2E A; 4NIK A; 2KE0 A; 3CK8 A; 3WQV A; 3Q7F A; 4R7L A; 1JNT A; 5DIT A; 3PE4 A; 3PZD A; 4G11 A; 1JND A; 2GRO B; 4ZPW R; 4GML A; 5A6C A; 1IKN D; 2X38 A; 3FTS A; 1E90 A; 1O5M A; 1CTN A; 3FUN A; 5FZR A; 2F37 A; 4IYP A; 3FDH A; 4LAW A; 4QFV A; 4K0R A; 1ITX A; 3KSL A; 1HKK A; 1L1P A; 2G41 A; 5HKP A; 3TWX A; 1JNS A; 3MX3 A; 4L7T A; 4ODR A; 3MDY B; 2J07 A; 5CHE E; 4G50 A; 4E6H A; 2Y3A A; 1HU3 A; 2XEE A; 3AS8 A; 4I1M A; 4TXQ A; 1S63 A; 5LX8 A; 2MPH A; 1FFQ A; 4HVB A; 3AG2 E; 1DNP A; 3EHR A; 5FIO A; 3Q9U C; 3E37 A; 2KXP C; 2O9O A; 5BXJ A; 3NF1 A; 4MTV A; 3ARY A; 5HBF A; 3X2Q E; 2R03 A; 2IO3 C; 3C3O A; 1BI7 B; 5FTP A; 4CGW A; 5AYW D; 4HNA D; 1GOI A; 5GQB A; 4PDX A; 1X81 A; 3WD0 A; 2XGS A; 4ODM A; 4EBA G; 3CVL A; 3PR9 A; 4LUN U; 2ZQT A; 4K5A B; 5BNW A; 5BV1 A; 2Y78 A; 1UN9 A; 4FUL A; 4WND A; 5KNH D; 2F8X K; 1D7H A; 3CHE A; 4WK9 A; 2VQ2 A; 3L13 A; 4NRH B; 5EYP F; 1LD8 A; 1FPP A; 2OCC E; 1O1T A; 3ZEF A; 1K1B A; 4KZC A; 4BTB A; 2XS1 A; 5T3R A; 3B7U X; 3GZ2 A; 1UR8 A; 2WXH A; 2C2L A; 4M7C A; 3NB2 A; 1E7V A; 2GW1 A; 3JUI A; 4M3O A; 4Z2K A; 3Q47 B; 2DYR E; 1D9S A; 1W3B A; 4JW1 A; 5AQB A; 1JNE A; 3LUO A; 3RSE G; 5H7P A; 2J9Q A; 2KC7 A; 3ZVV A; 4DWS B; 3ARO A; 4HOT A; 3BEE A; 4Q96 A; 4Z68 A; 3JYM A; 1HJX A; 3RFW A; 3EIP A; 1JCS A; 2O92 A; 1NL4 A; 4K5C A; 1KT0 A; 1QPF A; 3FUL A; 2QC9 A; 2WXQ A; 4JA9 A; 4BSX A; 5ENT D; 5FQ4 A; 2MNT A; 3RK6 A; 2D9F A; 4G2P A; 3MV3 B; 2XPY A; 4HI8 A; 4Q94 A; 5B1A E; 1K8K G; 4RG9 A; 4GYW A; 3WL1 A; 5D0Q D; 4UI9 C; 2I1J A; 3LXU X; 3R7Q A; 1EF1 C; 4U8H A; 3ARU A; 1D8E A; 1UG3 A; 1V55 E; 4Z2J A; 1ZK6 A; 3O4Z A; 4GZ3 A; 3BUA A; 3G2V A; 4WKH A; 3B7B A; 1N4S A; 2L6J A; 3S7F A; 3RRU A; 4LSZ E; 1OGB A; 2DZN A; 4JFL A; 1SYT A; 2WXF A; 3HYM B; 1FKL A; 1TNZ A; 1W26 A; 3CHO A; 3AS3 A; 3TWU A; 1FVF A; 2JZV A; 3DEO A; 2QZA A; 4PS3 A; 2LPV A; 2YBT A; 2WXG A; 1NWT A; 2QY7 A; 3FUI A; 1TNO A; 2FDM A; 4DRO A; 3B7R L; 1X6L A; 2VSN A; 4GTP A; 4NSB A; 1W1P A; 4EBA A; 2IOL A; 3CVX A; 4XZ4 A; 2H6H A; 2V4L A; 3ABM E; 3ARQ A; 5D0O D; 4URK A; 2IY0 C; 2IO2 C; 2Q5A A; 3ASO E; 2WMO A; 1BKF A; 1UOH A; 3KEZ A; 4WKA A; 2AJA A; 2FUL A; 3L9T A; 1FKS A; 3SD5 A; 1N52 A; 4ODN A; 4ILI A; 2PV3 A; 2PM6 A; 3UT8 A; 3WIJ A; 4ILG A; 1YYH A; 2AVP A; 3IKG A; 1ELK A; 4BY6 A; 5DO2 A; 3CHS A; 3FTY A; 2XCC A; 4EHM A; 4JD2 G; 1H0I A; 1LTX A; 2PPP A; 3CLJ A; 3EUV A; 1NWR A; 1HFA A; 4ODQ A; 3FTZ A; 3ENE A; 5HWB A; 2IU1 A; 2PQN A; 3TL5 A; 2KGJ A; 1FKG A; 2YHC A; 3APD A; 2EUL A; 1SR0 A; 4XE0 A; 4P8W A; 2ETC A; 1FKF A; 4O1P A; 1OUV A; 3OTN A; 3Q9N C; 4K03 A; 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