The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
210
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structure length |
207
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Chain Sequence |
DWYVGTEWEDKNRGLAKKVIGLQFTEMDKPTIISTVEFSVNKKATNLGGRPSKYLVSDTYPQKHSLEMGTSLTAVDCYLELLLQQFVPGETAACSITTKTGERIEFELKLEKIVKNTQVEKLSAAEIYEVALRLKESGVATFKTFPKFAFDYFVRAAKLLITYKPFDKLTKKTNGINGQAVEELFIQIQTNLAACLLQEKRYEHVIY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Noncanonical FK506-Binding Protein BDBT Binds DBT to Enhance Its Circadian Function and Forms Foci at Night.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| molecule keywords |
CG17282
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| total genus |
59
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| structure length |
207
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| sequence length |
210
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-01-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF18023 | FKBP_N_2 | BDBT FKBP like N-terminal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Hypothetical protein 1500032h18. | ||
| Alpha Beta | Roll | Chitinase A; domain 3 | Chitinase A; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LRK A; 2A9U A; 3ZST A; 4U31 A; 1WR0 A; 5FVK A; 4U3C A; 3ZT7 A; 4U33 A; 3ZT5 A; 3EAB A; 4NIQ A; 2K3W A; 4CN6 A; 5FVL A; 2MPK A; 2JQK A; 4U7Y A; 5CJ5 A; 2CPT A; 2V6Y A; 2JQH A; 4ZEY A; 4A5X A; 4IT6 A; 3K1S A; 4U7I A; 1WFD A; 4IT4 A; 2V6Y B; 4CN4 A; 4WZX A; 3ZSS A; 2CRB A; 1WCR A; 1YXR A; 5LB7 B; 2WWV A; 4U2Y A; 2W2U A; 2V6X A; 4U2Z A; 2WY2 A; 2DL1 A; 2XZE A; 2JQ9 A; 3ZT6 A; 5CGM A; 2RPA A; 4P1N A; 2LRL A; 4CN1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KT0 A; 3AAE B; 3M3Z B; 3W4R A; 4Z2K A; 4DMV A; 1VF8 A; 3PR9 A; 4IDP A; 5AQV B; 4DR4 T; 4TW6 A; 4GGQ A; 2CXL A; 2RQS A; 3AEC A; 4TNS A; 4K0U A; 1E7P A; 5JQG E; 1HG5 A; 2DL1 A; 3T1H T; 3EIP A; 3WD0 A; 4ZI2 D; 2CLY B; 3CQC B; 4YSY A; 1W9R A; 4CN1 A; 3EDU A; 3EUH A; 4YFS A; 4PJJ A; 5JDL A; 1D0Y A; 5JH8 A; 3LSV A; 5CJ5 A; 4ZEY A; 4A5X A; 4I50 E; 4OHF A; 4ZPT R; 4EAH A; 2N1G A; 2X51 A; 3O1I A; 5LJM A; 4U84 A; 4UVA B; 2OLH A; 1LG2 A; 3UQI A; 1YQ3 A; 4GYR A; 1QSD A; 3P7I A; 4ERR A; 1GPF A; 2VKD A; 2UXN B; 4P8V A; 3QC9 A; 3ARQ A; 4AKH A; 2H7O A; 1OGB A; 3TDB A; 1E9L A; 5FKY A; 4S3K A; 4ZI3 C; 4PNI A; 3PUW F; 3O5M A; 4ODM A; 1WB0 A; 2WLY A; 1HKJ A; 4X66 T; 2PPO A; 3JAF A; 2J47 A; 1YW0 A; 5HWY A; 4HFI A; 2DPE A; 4WJX A; 3WKZ A; 1LL6 A; 5ETW A; 4IE5 A; 2WS3 A; 4R0X A; 5H6Q B; 5AQQ B; 2DCF A; 2VK9 A; 2KT9 A; 2LKN A; 3OBV E; 4AKG A; 5ABG A; 2FBW A; 2ZM2 A; 4MGV A; 2PJQ A; 1SR0 A; 2CCQ A; 1D6O A; 2PBI A; 4LF7 T; 5DJQ C; 4EXT A; 3AS1 A; 2XAH B; 3T1Y T; 2EUL A; 2V5C A; 1KFW A; 2WM0 A; 4HBE A; 4L3N A; 1Y01 A; 2N2N A; 2KLQ A; 3ARR A; 4U86 A; 2CMR A; 2ZMA A; 2WZH A; 1HS7 A; 4B6X A; 4V1A v; 5L47 A; 2L9Q A; 3IEE A; 2O9O A; 3PRA A; 3AA6 B; 3IK8 A; 2PV3 A; 4OYJ A; 1OED E; 3MJX A; 4ZZB A; 3C98 B; 4H9S E; 5HXR A; 3W15 B; 3F57 A; 4IIJ E; 4F8H A; 2E8I A; 3AEA A; 3VKH A; 1IAP A; 3N5L A; 3CWZ B; 2H88 A; 1A7X A; 5FVK A; 5HKG A; 3KIN B; 3UU4 A; 3MK7 C; 4JI3 T; 3AE6 A; 4DMW A; 4UEM A; 5LMN T; 4Z2I A; 3P4Q A; 4H63 V; 4KMC A; 5AQR B; 1ZP0 A; 2D2S A; 1LVF A; 1MND A; 3PUG A; 5JDH A; 4Q22 A; 4A98 A; 4IL9 A; 2LM9 A; 3RI5 A; 3B13 A; 1E2A A; 5CA0 E; 5KX5 E; 2BKO A; 4NUU A; 2DSU A; 5C8Y E; 5HT1 A; 3Q2M A; 1W0A A; 1IBL T; 2ACZ A; 1W9V A; 4B3M T; 1EYM A; 2CXD A; 4GK0 E; 2BDE A; 3P4P A; 3L8R A; 1FKS A; 1NMW A; 1F40 A; 2WK2 A; 2I6H A; 1IBK T; 4QT2 A; 3X1D A; 3O5J A; 4HKA A; 3VAW A; 2LJ4 A; 3ZST A; 2Q9Q D; 2DT2 A; 2F2D A; 1UCU A; 2NTY A; 3NRX A; 4ODK A; 2DT3 A; 1HXV A; 3LG7 A; 4EED A; 4TNV A; 2G0U A; 2EHO B; 2X0Y A; 1UGO A; 2YBT A; 4A56 A; 2VCD A; 2Y78 A; 3K3O A; 3H37 A; 2FUP A; 3UI6 A; 4MNM A; 4ODL A; 2ZQV A; 2LSK A; 4DVD A; 1GOI A; 5LHI B; 2K3W A; 2Q9Q B; 2KR7 A; 2BZB A; 3PUR A; 3GN5 B; 1ZL1 A; 2UZ5 A; 4Z2G A; 3EAM A; 4WZX A; 2A3B A; 3ARY A; 2QF8 A; 3VRB A; 2CHN A; 2F21 A; 2G41 A; 2DG3 A; 3ALG A; 4HE8 A; 3TLT A; 3Q5E A; 3UQB A; 2H7V C; 4DRN A; 2XSA A; 3HA4 A; 2D5U A; 2NTX A; 2V7M A; 5JDM A; 1OED B; 2NWB A; 4TW7 A; 2CWO A; 2C5J A; 4JV5 T; 3ZYL A; 2VQE T; 2K48 A; 2PBC A; 2AE9 A; 3AA7 B; 1DU2 A; 1OWA A; 2WZI A; 2WP9 A; 5JVD E; 2MLX A; 4J2C A; 4Z2L A; 2KE0 A; 4GIV A; 2NW8 A; 3BQI A; 1D1B A; 2WAU A; 2XM2 A; 3JC6 C; 5GON E; 2Y6X A; 3VR8 A; 1X6N A; 1GQE A; 4F6R C; 4G63 A; 4ZZC A; 4AY1 A; 2MPK A; 2IW5 B; 2CPT A; 2OA5 A; 3O5O A; 2CBJ A; 1WYB A; 2HH7 A; 4TNW A; 5LXT E; 4HFH A; 4LMJ A; 2ZQU A; 4X62 T; 4TX5 A; 3R6N A; 4AQF C; 2E9X C; 4P1N A; 5LCY A; 4TV9 E; 2BKP A; 2VL0 A; 2K9A A; 5IYZ E; 3CML A; 4TWD A; 3TC5 A; 4P09 A; 3A8Y C; 1NEN A; 1S35 A; 5BMV E; 3E0Z A; 5JDQ A; 5KMG P; 3P4S A; 3PUA A; 4HAR A; 4OX9 T; 3AVR A; 3AE5 A; 2QVA A; 1W1T A; 1SUM B; 3WAJ A; 4YHJ A; 1HNZ T; 4O2B E; 2RSE A; 2DLR A; 2VKO A; 2WWU A; 1D1A A; 1Q6U A; 4KQZ A; 4AQF A; 4UR9 A; 4UDM A; 2E9X A; 2LHN A; 2J4G A; 3JAE A; 3RF1 A; 4IQ2 A; 3DJB A; 4DND A; 1VCS A; 4OFZ A; 4I0U A; 5A1L A; 2IHR 1; 4E7Z A; 2XAJ B; 4WKF A; 1HF8 A; 1W1V A; 1K9T A; 4DR2 T; 4EOZ B; 2JRK A; 4YTP A; 1XMQ T; 3WD2 A; 1H7C A; 2I59 A; 1JND A; 1J1J A; 4DRJ A; 2BS3 A; 3SWH A; 1UX5 A; 3N2O A; 3G6L A; 3BXW A; 4X1Y E; 1KEY A; 1YAT A; 5HXH A; 4NZC A; 3PTR B; 3VU7 H; 3PUX F; 4DRQ A; 3O5I A; 3OYX A; 2DSZ A; 2ZM8 A; 4GYS A; 4H9R C; 4CI1 B; 5LOV E; 1LL7 A; 3N9O A; 5IWA T; 3JYJ A; 2BVM A; 1FKH A; 4IL4 A; 3MXZ A; 1B6C A; 1LJY A; 4C02 B; 1FMW A; 4X65 T; 4ZS3 A; 2X9H A; 4IT6 A; 5FMN A; 4P8U A; 5LMU T; 3MA9 A; 2PPP A; 2W61 A; 3PUS A; 3E22 E; 4AKR B; 5LGU B; 3NWI A; 4IRE A; 2X9Y A; 4OK0 A; 3UQ4 A; 4GKJ T; 1WYC A; 4EB6 E; 4H9N C; 4IQC A; 3I9Y A; 2IUZ A; 5AQO B; 3OVU A; 2MBG A; 2VB6 A; 4O4H E; 1NWM X; 4MPK A; 1E15 A; 4KUM B; 4U7Y A; 3FZL B; 5LBQ B; 1MMD A; 3UU3 A; 2J62 A; 5F3J A; 4IHJ E; 3FZK B; 4W9Q A; 3O5E A; 1XWM A; 3F31 A; 4WBN E; 2ZR4 A; 4FN2 A; 4XAK A; 5HEU A; 4JBW F; 2Q9Q C; 1ZBV A; 2PPN A; 3FBZ A; 3L3P A; 4ML4 A; 1FKJ A; 2HHH T; 3CHE A; 3O5P A; 4U3C A; 1NSG A; 3WI3 A; 2WDQ A; 2IML A; 4HFD A; 3UQ7 A; 5HUA A; 2MPH A; 3UUM A; 4O4L E; 3GU0 A; 1OED C; 4ADZ A; 3LK4 2; 3CHC A; 3ZSS A; 3IKD A; 4QX7 B; 1WAW A; 3HL6 A; 4O4I E; 2LSY A; 1IX5 A; 4MHC A; 5ADX L; 5HEG A; 4HFE A; 1FD9 A; 3N2K E; 1SYT A; 5L3D B; 1CTN A; 5AQI B; 2Q9Q A; 3O9X A; 3PUV F; 5F5W A; 1ZU8 A; 3O5K A; 1JNT A; 3AB3 B; 2NW9 A; 2K5B B; 4FJO A; 1YXR A; 2JQQ A; 4KHZ F; 3CQX C; 3EVY A; 2BBH A; 3ZT6 A; 3ZCI A; 3TLU A; 1OED A; 4TWH A; 3A5X A; 5LP6 E; 1KNP A; 4ILC A; 1HG2 A; 1IZN B; 3AE2 A; 3RKO A; 1Q6I A; 2YDS A; 2Y48 B; 2YU1 A; 4S3J A; 3ONJ A; 2KFW A; 3ZC0 A; 3CPZ A; 1Q6H A; 1T11 A; 2FJA A; 3AE8 A; 4MLK A; 1HJW A; 3FBL A; 2E5L T; 3ZT5 A; 4MTV A; 2WQY A; 1BKF A; 1I6Z A; 3SFE A; 4OYK A; 2VQF T; 4DUZ T; 3P4R A; 1FJG T; 2N9D A; 3C4W A; 1N36 T; 1CUN A; 2BG9 E; 4UF0 A; 5AQH B; 4YJ3 E; 1KFY A; 4DRM A; 4Q25 A; 3NZQ A; 2M08 A; 2CE7 A; 3RIA A; 2YK0 A; 2K24 A; 2D9D A; 3WD4 A; 3V5U A; 3NBX X; 2AOS A; 3IHR A; 2DSV A; 3EI0 A; 3LK3 B; 4ZHQ E; 3OYZ A; 3ZMS B; 4PFO A; 2RUR A; 2N87 A; 1HR0 T; 4URI A; 2W67 A; 2ETN A; 3MAC A; 4MNL A; 3Q5D A; 5LG3 A; 4LF4 T; 4GIW A; 1ROT A; 5JH7 E; 4ILB A; 3NRY A; 1WFD A; 4AXP A; 2XJ7 A; 4ITZ A; 5LB7 B; 5HW8 A; 5FNV E; 1J5W A; 1Z8U A; 3ARV A; 4ODQ A; 2R6G F; 1UR9 A; 3U3I A; 4QXC B; 4IDN A; 5L3F B; 4MSP A; 4LFB T; 1FKK A; 3C64 A; 3RIU C; 1E44 A; 3AED A; 3JC6 D; 5L3G B; 2HN2 A; 2DI4 A; 2DNX A; 1MNE A; 3RM4 A; 4IST A; 3OJA A; 5J0Z A; 4WKH A; 5FP3 A; 3VHL A; 1ZBC A; 4PJL A; 5AQM B; 1X79 A; 2E9X D; 1SHZ C; 3UTK A; 1EIB A; 1U4Q A; 2KMF A; 2QGS A; 5ABF A; 1UX4 A; 1C9H A; 2F4V T; 2W4X A; 5AQS B; 2ACX A; 2M6B A; 3KAD A; 2W0G A; 3MZK B; 2MTQ A; 3M65 A; 3RIU A; 5HEJ A; 1ZEE A; 1U79 A; 3PJA A; 1J6Y A; 1F8A B; 2CM0 A; 4IDO A; 3S4U A; 2BG9 B; 2LLY A; 3KV5 A; 3B9E A; 2XY8 B; 4QH5 A; 4EZ4 A; 4UV8 B; 2UXX B; 1HX1 B; 2E9X B; 4PAG A; 2NW7 A; 2B76 A; 2MLZ A; 5HEH A; 2VVN A; 1X9B A; 1KNZ A; 4NUV A; 1MIV A; 3D0T A; 2JPF A; 2V8S V; 1J5E T; 1L0V A; 3N9P A; 3NI6 A; 2VKJ A; 2C5I T; 4XBF B; 1XNR T; 1XDP A; 4EZH A; 3BQK A; 3H3M A; 1SE7 A; 4JEH B; 2MF9 A; 3ZJ2 A; 1JNE A; 2KWH A; 1ZHC A; 4LAW A; 2KWI B; 1HTJ F; 2YKS A; 4N78 D; 3UUB A; 1D0Z A; 2LM2 A; 2IC6 A; 5EK3 A; 3UFG A; 3KAG A; 2VL8 A; 4QT3 A; 3EDV A; 5AFU L; 4MAL A; 2M6I A; 5HYA A; 2D9F A; 1XHG A; 2UXB T; 3RIF A; 5LGT B; 2WU5 A; 4PW8 A; 1U5P A; 4U2Z A; 2BVL A; 3PDY A; 4KHP T; 2ZQS A; 2D0U A; 4AQG A; 2MYS A; 3AEB A; 3FZH B; 4Z2H A; 3ZJ1 A; 4BAY B; 2KSR A; 1GUV A; 2V5D A; 4O2A E; 3P4W A; 4WKA A; 1HKK A; 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