The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
162
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structure length |
162
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Chain Sequence |
HMERDEVGAHKNAVDEEIERLSQPGGSEDQRLNALAERFGGVLLSEIYDDVSLEDAPYFSALYGPSRHAIVVPDLSQVTEHLEGLTDCPEDLYLIEGDPQSFDDSVFSVDELEKAVVVKIADRQWRYSRFPEVPLFGRAARESRIESLHAEREVLSERFATL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cell cycle
|
| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Crystal structure of the MukB hinge domain with coiled-coil stretches and its functional implications.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Chromosome partition protein MukB
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| total genus |
48
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| structure length |
162
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| sequence length |
162
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces | Immunoglobulin FC, subunit C | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Taq DNA Polymerase; Chain T, domain 4 | Taq DNA Polymerase; Chain T, domain 4 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZW0 A; 3ZDM A; 1MFT A; 5EFW B; 2LXC B; 4ZNC A; 4ZMD A; 2KZI A; 4GOD A; 1H0T A; 4WWI A; 4EYY Q; 1OVU A; 2RKL A; 2SPZ A; 4NPD A; 1OVV A; 3QWO C; 2M5A B; 4K35 A; 1U7M A; 4ASW A; 2LXB A; 1EC5 A; 1FC2 C; 2K3R A; 4GOF A; 3FXE A; 2KZJ A; 1LP1 B; 2M5A A; 2B87 B; 2I8D A; 2B88 A; 5CBN A; 2KUB A; 2R44 A; 3S1K A; 3IBP A; 4IOI H; 1X0T A; 4HB1 A; 1JM0 A; 2WMM A; 1EDL A; 1U7J A; 2KIK A; 5K5G B; 1LP1 A; 1EDJ A; 3MHV A; 2B87 A; 1OVR A; 1SS1 A; 2KI7 B; 2LR2 A; 2HR3 A; 1BDD A; 2OTK E; 2Q1K A; 4NPF X; 2P58 A; 3PH0 A; 2KS1 B; 2M0B A; 2QRX A; 5DJT B; 1H0T B; 1EDI A; 4GOE A; 4CPG A; 4JBZ A; 1DEE G; 2UWJ E; 4HJG H; 3MZW B; 4ASV A; 1S3J A; 4BXL A; 1NVO A; 1ZXG A; 1EDK A; 4K3A A; 1JMB A; 1Y47 A; 4HKZ H; 4NPE A; 2ZAE B; 3FXD A; 1Q2N A; 2QVA A; 5DJU B; 1BDC A; 5C39 A; 5CBO A; 2JWD A; 2B89 A; 4MN4 C; 3RGU A; 4KJM A; 1LT1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IFD K; 4YPC A; 3AE8 C; 1NYH A; 1SQP J; 1KLN A; 2XDJ A; 3M06 A; 2PAJ A; 5KLV K; 1G2C A; 1ZR4 A; 2QIW A; 2SPZ A; 4WY4 C; 3Q2Y A; 3TAP A; 3GF7 A; 3O6Q B; 1URQ B; 4JQ0 D; 2ZYA A; 5B5E H; 1SQB J; 2K3R A; 5BU5 A; 3B5N C; 1KYO H; 2BCC E; 4N56 A; 4F4K A; 3D6Z A; 5APY A; 2KUB A; 1FDM A; 3GHG C; 4DJG A; 3L71 E; 4L76 A; 1TKD A; 3H1J E; 4H44 C; 1DEB A; 1SKR A; 3EFG A; 1ZN5 A; 1E5W A; 5B66 H; 1IFM A; 2PGD A; 2HHT A; 1VF5 C; 4C8M A; 1L4A C; 1H0T B; 4W7Z A; 1IK7 A; 1RF0 A; 2UWJ E; 1U4B A; 4H0L B; 2XO7 A; 1FZC A; 1ZLL A; 3AE3 C; 5H2F E; 5AW0 B; 2K1A A; 4UB6 E; 4DSK A; 3CL3 D; 2W27 A; 1IFN A; 1JMM A; 3SFD C; 1CSB A; 1SQQ E; 1KIL A; 2HVH A; 2W6B A; 2BCC D; 3AE2 C; 3A0B H; 2NPS A; 4O9B A; 1X9S A; 3RBZ A; 2YMK A; 1SQP K; 5KAI E; 2XY7 A; 1NK5 A; 4RO0 A; 2XNX A; 3BCC G; 1EZV E; 1EQ7 A; 5CJ4 A; 3SV4 A; 3V6I A; 3H1J D; 1VQP P; 1U45 A; 1NU1 E; 3OAK A; 1ZR2 A; 1U7M A; 1GL2 D; 1FBM A; 4DWI A; 3RK2 C; 1J1D B; 1Y8A A; 3TSI A; 4PD4 E; 2IPP A; 2IDB A; 2FXM A; 2IZ1 A; 1J2J B; 4C7R A; 1QVG O; 2H43 A; 1SQV K; 1L2P A; 1NTK E; 3CME P; 3H1L E; 2B88 A; 3MD0 A; 2D2C C; 3A7O A; 1FE6 A; 3S1K A; 2WPV B; 3P32 A; 3CWB E; 2JEE A; 2ZFC A; 1W2E A; 3HUS C; 1GL2 B; 3V4W A; 1SQQ D; 4R4M A; 1OIP A; 1QX8 A; 3PP5 A; 1N7S D; 2WIT A; 2XKM A; 4LLH A; 3WU2 E; 3CCE P; 2MKV A; 3TAN A; 1FDO A; 5AVQ B; 1EZV D; 3I5C A; 2LKM A; 3MGN A; 4WY4 D; 1GK4 A; 5AW2 B; 1SFC C; 5APS A; 1KB9 H; 3JCU E; 3MIW A; 1NU1 D; 1PPJ G; 2W6A A; 1DX7 A; 1K8A Q; 1BE3 J; 3U59 A; 1SL2 A; 2R32 A; 3BAS A; 4PD4 D; 3R2P A; 1OFC X; 1N7S B; 4L75 A; 1PP9 G; 2CK3 H; 3V2P A; 1LT9 B; 3JC2 2; 1L3T A; 5C39 A; 1NTK D; 2N1T A; 3H1L D; 3HE5 B; 3TDK A; 4B9L A; 1LTG C; 2Q5U A; 1L0L G; 2K37 A; 2ZVN B; 3LWM A; 1BCC G; 1PGQ A; 3CWB D; 1OVU A; 2Y9Z A; 1T3J A; 2ZXE B; 1VF5 D; 5KAF H; 1L3V A; 1RH5 B; 1N73 A; 5KJ7 A; 3CC7 P; 1OW7 A; 5TJH A; 3RBX A; 1VL2 A; 2KLU A; 3FWN A; 1SP4 A; 2O1K A; 3VTP C; 1VQ4 P; 3AEC C; 1LP1 B; 2WSF H; 2AEM A; 5KLV G; 3D71 A; 1RF0 C; 1HJ0 A; 1NAY A; 3L73 G; 1NTZ E; 3HT3 A; 3VMA A; 4RJT A; 1K73 Q; 1MUU A; 3H32 A; 1VQO P; 4BWM A; 1QGK B; 1AVY A; 2FXO A; 2B87 A; 5GTH H; 4XFJ A; 1YJ9 P; 1KFN A; 2ZYD A; 2IBZ I; 2Z5I A; 1KIL C; 2KS1 B; 3L75 E; 3Q3D A; 3IAO A; 3L74 E; 2E74 C; 1P84 D; 3PX0 A; 3VYI A; 3V2R A; 2NPS C; 1CZQ A; 1DEE G; 1VQ6 P; 3M9B A; 4HJG H; 5TIS E; 1IFJ A; 3H1K E; 3RK2 D; 3NXS A; 3I56 P; 1HUC A; 2YO3 A; 1PGJ A; 1NAF A; 4N6J A; 5L8R J; 1UIX A; 1FJP A; 1TK5 A; 3N4X A; 1BGY E; 2JP3 A; 3AEE C; 4MN4 C; 2R5D A; 1AA0 A; 4BRY A; 2FFD A; 4A7P A; 2Y1I A; 1D7M A; 1NWQ A; 3BCC J; 2YKQ A; 1TK0 A; 2FYU G; 4JF7 A; 1IFP A; 1MV8 A; 2WSE J; 3RL0 D; 2P10 A; 2C9L Y; 3H1H E; 2JKV A; 3L75 D; 1ZOY C; 4Y99 B; 3L74 D; 2H7H A; 4DSL A; 2WSS H; 4BWN A; 1LTT C; 1X79 B; 4I1L A; 3KXD A; 3THV A; 4PJ0 H; 3H1K D; 4C8O A; 1JM0 A; 5K5G B; 2QEX P; 1JY2 O; 3RL0 B; 2KNC A; 3PX6 A; 1RY3 A; 4IL6 H; 1BGY D; 2E5Y A; 1HGV A; 1SQV G; 5CCG A; 2CPB A; 2AXT E; 1EDI A; 2N1T C; 1U48 A; 3AEB C; 3C8V A; 2QJP B; 1PGO A; 2AEJ A; 5KJ7 C; 1LTJ B; 2P7J A; 3H1H D; 4ELU A; 2WT7 B; 2QVA A; 1PP9 J; 1S1C X; 1G1I A; 5KTQ A; 1AJY A; 3LID A; 1KQF B; 4U3F E; 2A06 E; 3GG2 A; 3VMZ A; 1L0L J; 1JTH B; 1BCC J; 2WZ7 A; 2P2U A; 3CPW O; 1KN7 A; 4C8N A; 3IFM A; 2R3C A; 3OJA B; 3QWO C; 3GF3 A; 3TI0 A; 1SKS A; 4D6T E; 1S2E A; 3IR9 A; 3KZI H; 2NPS D; 4AQR D; 4C8K A; 3D70 A; 3CX5 H; 1MZ9 A; 1FZC B; 1KSP A; 2WSF J; 1SQP E; 5KLV J; 3SWK A; 1SQX G; 3L72 G; 3CCQ P; 2R44 A; 1KQG B; 3G71 P; 3L73 J; 1N2D C; 3PV8 A; 5APT A; 2HHU A; 1Q86 Q; 2ZVO B; 3LIE A; 2KI7 B; 2E75 B; 3SWF A; 3ITK A; 4WVZ A; 2NPS B; 3PHL A; 1SQB E; 3CXH E; 5AW8 B; 1NKZ B; 4U3F D; 2A06 D; 1KZU B; 2H8P D; 2KLV A; 2K9J A; 2QJY B; 1PFI A; 2FFD C; 3G3Z A; 4ASV A; 3WMM 0; 2YXQ B; 3B4S A; 4B9M A; 1NTM G; 1S5L H; 2K9Y A; 2KOG A; 3HTK A; 4GT1 A; 1KTM A; 4Z1M H; 4IFM A; 4D6T D; 3S9O A; 1J1E B; 1HTL C; 3AEA C; 2KP8 A; 4TT3 H; 2L91 A; 3KDP B; 3SFE C; 2PFX A; 5AVU B; 1JY3 O; 1OWA A; 2HOD B; 4DQQ A; 1SQP D; 1GU5 A; 4ZMD A; 4H13 C; 4JYC A; 3SSU A; 1ZYQ A; 4DSJ A; 1RF1 B; 2FYU J; 1M57 D; 4KT0 J; 1NOH A; 3T97 B; 3HD7 D; 1FZE A; 2Z4E A; 1SQB D; 3CXH D; 3HRN A; 3K5B A; 5CCG C; 3CC4 P; 2KZJ A; 2FYN B; 1SFC A; 2M5A A; 3AE1 C; 1R8E A; 3VP8 A; 2RH0 A; 3V2Q A; 5KJ7 D; 1QTM A; 1N7L A; 4HB1 A; 2WSC J; 4I7Z B; 2XY5 A; 2O1J A; 4EZ9 A; 4RKU J; 1QL1 A; 3C9I A; 1DD4 A; 3HD7 B; 1OW8 A; 3BDP A; 4B9U A; 2OYI C; 1YQ3 C; 1USE A; 1SQV J; 1TK8 A; 2ITA A; 5E79 E; 1NJW A; 1H8A A; 2YO2 A; 4HH2 A; 4JBZ A; 5KKZ B; 3LW5 H; 1T2K C; 3SWY A; 1JCC A; 1N73 B; 1S3J A; 3VMY A; 1X8Y A; 3H25 A; 1UII A; 4IL6 X; 3W67 A; 2WPQ A; 1JEK A; 1H88 A; 1KMI Z; 1YQ4 C; 4I6M C; 1ZV8 A; 2Q7C A; 2IYP A; 1JMB A; 5APU A; 1QEX A; 3OA7 A; 2A45 I; 2M3B A; 4KHX A; 3A0H H; 2JO1 A; 2JR8 A; 4UB8 E; 4DQP A; 1LT1 A; 5EFW B; 4EZ6 A; 3D6Y A; 1JY2 P; 1X9M A; 2Q9I A; 4HYT B; 2FYU K; 3RTV A; 2RKL A; 3RRG A; 1D8Y A; 1NK7 A; 1BE3 E; 5APV A; 2L5G B; 4PV1 C; 1CI6 B; 5AVW B; 3F89 A; 1IZN B; 3V2N A; 1JXE A; 3HE4 A; 1EXJ A; 2YIU C; 1SQX J; 5CMZ A; 3L72 J; 2FXP A; 4EDF A; 1M1J B; 5AW3 B; 3KYQ A; 1NK0 A; 5KLI C; 1OVR A; 3RK3 C; 3GLM A; 4LC1 A; 1R5S A; 1GMJ A; 3HPO A; 5B5E E; 5AW9 B; 1KYO E; 4H13 D; 4ELV A; 5GTI E; 3AE9 C; 2KK7 A; 1W5C E; 4F3O A; 2KFZ A; 3CD6 P; 1A02 F; 3CXH I; 5AW1 B; 2HPC B; 3PX4 A; 1NTM J; 1RE4 A; 1JY2 N; 2KTQ A; 3CCV P; 1BE3 D; 5CCG D; 3FXD A; 1USD A; 4EOT A; 1DD3 A; 3FGA D; 1FDI A; 3CCM P; 3KTQ A; 4DQR A; 1NHL A; 4L73 A; 4GKG A; 3TF5 A; 4H13 B; 1S5L X; 1XWL A; 1NKE A; 2KXP B; 5AVY B; 1YIT P; 2HLO A; 2HFE D; 2O01 N; 1LGH B; 1TU3 F; 3B5N D; 3CMA P; 1KFS A; 3VMX A; 4DS4 A; 2JDI H; 4K35 A; 3V4Q A; 2WQY C; 1LJ2 A; 1ZP0 C; 1LTI C; 2KSJ A; 1P84 E; 1WRG A; 4GDO A; 1N86 A; 1T2K D; 1KYO D; 4H44 D; 4WY4 B; 2XND H; 4ZKU A; 2I8D A; 3A0B E; 1S4X A; 3O6Q A; 1SQX K; 1URQ A; 3BCC E; 1VQL P; 1L3S A; 1OZH A; 3B5N B; 3FWL A; 1L4A D; 1IFD A; 2ZT9 C; 2QJK C; 1EDJ A; 2WVR A; 3L35 A; 1QVF O; 2WPS A; 1Q7Y Q; 5E41 A; 2KFN A; 2HR3 A; 3GHG B; 1BDD A; 1N8R Q; 2OTK E; 1JY3 P; 4YFU A; 4NPF X; 1L0N G; 3PO4 A; 4H44 B; 4OGQ C; 3WUV A; 1VQ7 P; 3MP7 B; 2FY8 A; 1HVV A; 2IFM A; 4R4L A; 2C9N Y; 3LW5 J; 4DF8 A; 3VN0 A; 1VF5 B; 1L4A B; 1K05 A; 1NTM K; 3AE7 C; 4EI2 A; 1Y47 A; 4B9T A; 3G6E P; 3VP9 A; 1AQ5 A; 3RR8 A; 4C46 A; 1BDC A; 2CPS A; 2VRS A; 1IFI A; 4ELT A; 4DFK A; 3L37 A; 2OYH C; 2XV5 A; 1NK9 A; 1IO4 A; 2AXT H; 1S72 P; 5AVV B; 1VQK P; 3BCC D; 2A45 H; 1M90 Q; 2A45 G; 4EYY Q; 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