4JBZA

Structure of mcm10 coiled-coil region
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
401
structure length
401
Chain Sequence
MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYAAGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMGVCQEKSKDELEDELRKMQAQMKKLQEQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN FUSED WITH XENOPUS LAEVI
publication title Mcm10 self-association is mediated by an N-terminal coiled-coil domain.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Replication
total genus 131
structure length 401
sequence length 401
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.5.420 Mainly Alpha Up-down Bundle Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces Immunoglobulin FC, subunit C 4jbzA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jbzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jbzA01
1H3DA 1PBQA 4IY5A 4ZEBA 2V3QA 1ZU0A 3W15C 2LXCB 4KI0E 2DSFA 3T9HB 5ICTA 4NE4A 5KCJB 3MWBA 4IOIH 5L8DA 3C35A 5M2VA 4QFOA 4H65A 4JB7A 2ZNTA 3ILTB 1FTJA 4KR5A 2HZLA 3V89B 2M5AB 4IO2A 1IXCA 1IIWA 4CPGA 4UA8A 3Q28A 3H3GA 2UVIA 5JTYB 1B32A 4NF5A 1OVVA 1EH3A 4KYSA 3K6VA 2ZNSA 3PGFA 3MVYA 1B05A 2XXWA 4R2FA 3P7IA 4F3PA 1SYIA 5F7VA 4QFLA 3O6HA 1LGBC 4F3BA 2ALUA 5AA3A 4GXAA 3VLVA 2Q89A 3K4UA 5A5XA 4F1VA 4QRZA 2O68A 1TWYA 2QL3A 1EDKA 1SW4A 1USYH 3MP6A 4R74A 4FEDA 4GOEA 5FTIA 5ITOA 2GH9A 2ZMBA 5CMCA 1LCTA 1PEBA 1YCJA 4H67A 2LXBA 4KHZE 1RYOA 3H03A 3CFZA 3OSQA 2DOJA 3K0VA 4U21A 3VVEA 1GV8A 3FZVA 3T9XB 3W9WA 4NPEA 3QXMA 4NPDA 1FTKA 3EPEA 1IEJA 1LAHE 3R26A 3KZGA 4U4SA 1MPCA 1MPBA 4I8CA 1Z7ME 2HXWA 4LZ5A 4H1XA 5LOMA 4HKZH 3C36A 4N6PA 1R9LA 5H8FB 3CVGA 2P58A 3QWOC 5I59B 2BJJX 1N84A 4R6YA 1HSEA 2IEEA 4R6KA 3E3KA 2I4CA 1B3EA 3QIMA 4GIZA 3MZ1A 3OO8A 2OCUA 2DVZA 2QRYA 3PMVA 1D9VA 4U22A 4F31B 2F5XA 1POY1 5CBRA 2I3VA 3IORA 3T9UA 2HFBA 4I62A 1B7ZA 3SDFA 3N6TA 2ZXTA 3KN3A 1H43A 1BLFA 1PDAA 4I9DA 3ECRA 4LZ7A 3N94A 4PFYA 1AOVA 3PUWE 1UTHB 4OVJA 2B88A 2Y84A 2ZYNA 4G4PA 4BDOA 1MQDA 2F7BA 5AA2B 4LONB 1LT1A 3VFJA 3UN6A 2X7QA 3B6WA 4R73A 5DJUB 1OVTA 2DVCA 2UYEA 3TQLA 4H8IA 4IO4A 3UP9A 1EZOA 3IR1A 2QS2A 2DWHA 4ASVA 2O1MA 1LAGE 4R9GA 5AA4B 3JZJA 1ZTYA 4OWDA 3RGUA 3UGWA 4XTCQ 1LFHA 4GQOA 2F6GA 1MXZA 3HCQA 1DPEA 3HN0A 1DTZA 3K6WA 2O84X 4X1BA 2Q2AA 4E0XA 1X0TA 3DM0A 4Z0IA 2UXAA 4YAHX 5DJTB 4GL8A 2ESNA 1BDCA 2HAVA 3OXNA 3LSFB 1URDA 2Y7WA 2M5AA 3PMXA 3RUMA 2KIKA 1A40A 1QUIA 5I2KB 3IOWA 1M5BA 2RKLA 2VP1A 1NMUA 5I56A 2DYXA 4LVQA 1SYHA 4DXCA 1AL3A 2H9BA 3IAZA 3KSJA 3VVDA 2XHDA 2AIXA 2CMOA 5KDTA 3VE1B 2PMSA 1MQJA 1F9BA 2O7IA 4ELOA 3H6VA 4H8JA 4PFUA 5H8SA 3U93A 2DE4A 1SDXA 4XKNA 5DEXB 1Y20A 3A09A 5I57A 5AA1A 5CMMA 3HPIA 1I69A 2A5TA 3A3CA 2GHAA 2RKMA 1D4NA 3M3FA 2VD2A 4F39A 2OWTA 2B87A 1XT8A 3U92A 2OJTA 1PB7A 2Z22A 1LFIA 3RTFB 5L9MA 2R9JA 3OO7A 4KCCA 3TTNA 4U4XA 5H8NB 1FQAA 5AA2D 2Z8EA 1A99A 1B1HA 2H25A 2XXYA 4ECFA 2NWJA 4NWCA 2NXOA 5I2NA 2HAUA 2OLBA 3ODBA 1PBPA 2E0SA 1B5HA 1ELJA 4PFWA 3MP8A 3HHFA 1OVRA 2UVHA 3M8UA 4OXVA 1S9TA 4NPFX 1JVXA 1QKBA 3LC8A 2F6PA 1FQFA 1XVYA 2H99A 3N6UA 4MH5A 3O66A 5JK4A 2XXPA 1NH7A 4XKQA 3QAXA 2Q8JA 1M5FA 1LAXA 4IGTA 2Q88A 1P1UA 1Q1KA 2XXTA 2Q1KA 4R75A 4EF1A 1XC1A 1MG1A 1UQWA 4OERA 1A54A 4JBZA 3KOTA 4F1UA 5CRYA 3IB2A 4WWIA 1FQEA 1B7UA 3S9EA 3BKIB 1SD3A 3ZKKA 2KI7B 2Y7PA 4AB5A 1FTMA 1A8FA 3G3JA 3TZAA 1B51A 4IO6A 3K00A 1H0TA 2XD2A 2V3TA 3HSTA 3DELB 3IO6A 1LP1A 1H44A 3LR1A 3SEUA 3O6GA 2GFEA 3MAMA 2O7UA 1II5A 5EYFA 1A7LA 2FA7A 3CG3A 3BFTA 2QS1A 3S4UA 2RC7A 5B7DA 4GOFA 1UIUA 1OMPA 1PC3A 2OWSA 4EYYQ 4LQ2A 4DLDA 2UWJE 2QRXA 1NVOA 1NL5A 3USDA 4HJGH 3OOAA 1XS5A 4KYEA 4JWXA 5L9OA 2DXYA 2P2AA 3K1MA 2I0CA 2E1SA 1Y1ZA 4OMBA 2I8DA 2XX9A 2OBGA 1GR2A 3O6IA 3RPWA 3TPAA 4HTGA 1BKAA 3IOUA 4BXLA 2RCAA 2QMXA 1Y3PA 2I49A 4NF8A 1MDP1 4JWYA 5H8QB 4F3SA 2ANJA 4C0RA 4NF4B 4TQUQ 3IX1A 5ISUA 1MM7A 2HEUA 1DSNA 3PD8A 3MBPA 4IY6A 1NFTA 4U1ZA 4Q30B 5CBSA 1IUDA 3V8XB 2LR2A 5CC2A 3FV2A 2R6GE 1EC5A 3KBRA 3KJTA 4DDDA 2H4IA 1MQHA 1UIVA 1WVJA 3DP6A 2QS4A 1U7MA 4QFNA 2B3FA 3OD7A 4G68A 1LFGA 5ELVA 5TP9A 4QF9A 1LBBA 1B3HA 4OFJA 3PPRA 1MFTA 2VD3A 3VLUA 2XXVA 1LBCA 4ONYA 4FATA 4EXLA 3CR9A 4PFTA 3GZGA 4LA9A 3S2VA 3MPLA 1D9YA 2I4BA 4N07A 2CZLA 1SQYA 1Q35A 4ZZAA 4P0GA 3TDJA 2Y7KA 1JW1A 4YKIA 1MH3A 2P1SA 2V3UA 1B40A 1WODA 4JSDA 4R2BA 3TTKA 4ESXA 2I0BA 2F34A 5FHOA 1XVXA 2XX7A 4M4GA 3CG1A 1OLCA 4OQOA 3U94A 3FXQA 1UTBB 2P0SA 2XXUA 3DP8A 1BDDA 4BDLA 3Q26A 5DVJA 4ELPA 1B3LA 2KZJA 5HBCA 3FGSA 2DS9A 1IXIA 1KWHA 3PUYE 3ZKLA 1EZPA 2V84A 5K5GB 3K2DA 1Y3NA 4PETA 5CMBA 4GD5A 3B6TA 4KQPA 3Q29A 3Q25A 3HV1A 1B52A 1N04A 4DIGA 3IO4A 3E4RA 3PPNA 4ZE9A 3AXFA 4OENA 3KGCA 3KJ7A 1MDQA 2ZYKA 1JM0A 4K3FA 2DE3A 3SESA 4KPTA 4POXA 4ELQA 1Y47A 3MPKA 2QPQA 2PT1A 4KYDA 1JEUA 2RC8A 4C1TA 1VE4A 3T9VA 3EHTA 3T22A 1LAFE 1P1NA 1BIYA 5TPAA 4ZEFA 1M5DA 3B6QA 4WEPA 3W9VA 1P99A 3HO7A 4OEUA 1D3KA 3TYHA 1SW2A 1ZKBA 3TTMA 1N7XA 4THIA 1EZ9A 2F97A 4U2RA 4BDNA 1B9JA 3CFXA 3MVZA 3MZWB 4OHNA 1URGA 1MXVA 3KSXA 1ATGA 5JEIA 2H98A 4K35A 2HR3A 4ZMDA 3VXBA 5H8QA 1IXGA 5KCJA 4NF6B 2PT2A 4DCYA 3FVGA 4L17A 4IO3A 1QUJA 2B65A 3TTRA 4PP0A 4LATA 1MXUA 3RLFE 4EQ7A 1FTOA 4LP2B 3MJNA 4F19A 2REJA 5JTYA 3TKDA 1LCFA 4ZEDA 1US4A 5B70A 2HZKA 1SW5A 4H5GA 4DE8A 3RY3A 4Z7EA 3ILUB 3UA8A 1SI0A 4IB2A 4MFIA 1DEEG 1US5A 3H6WA 1IQ7A 1MY1A 5CMKA 4GOTA 4WEDA 3V83A 2D5WA 2OK2A 1I6QA 3SEXA 3RTWB 5DVIA 1B5JA 4POWA 3LSWA 1QKAA 4NEDA 3F11A 1FCKA 1B46A 2O1LA 3VLWA 3FVKA 3OMBA 1VSOA 4NF5B 3O9PA 1MRPA 3T66A 3OELA 2XX8A 4OESA 1ZIUA 1ZW0A 4RJZA 1VFEA 3S9MC 3TELA 2DXRA 3MUQA 5DTBA 3PPQA 3MVWA 1FTLA 3PPOA 3O28A 1P1OA 5H8FA 5CM6A 5I59A 3H4ZA 5A5XB 2REGA 2M8CA 3PH0A 2FYIA 1LB8A 3PPPA 1OIBA 3FASA 3IOTA 4G8MA 4G8NA 3I3VA 1B4ZA 5DT6A 2OTKE 3FUZA 3ZSFA 4YB5A 4RPOA 4FJPA 4EF2A 4H6DA 3RT8A 2W7YA 4ESWA 3MZBA 3K01A 3EF7A 4R6HA 4FORA 2UVJA 3O2AA 3PD9A 2O6AA 1UTHA 2Z8FA 1EDJA 3MZ9A 1MPDA 1JMBA 4O3AA 1FQCA 2I48A 4QHQA 4FIMA 5AA2A 3M3LA 3C4MA 4ZE8A 4ISUA 4YZZA 1Y4TA 2F7AA 3UK4A 1JQFA 5EHMA 5K2XA 3TODA 2F78A 1MQIA 3KN7A 4ZECA 4OTEA 1QUKA 5AA4A 1QULA 1O63A 1B4HA 4X1DA 4NTLA 4KJMA 3LSLA 4YKJA 3VDFA 2ZYOA 4N13A 2PBWA 2KZIA 2ABHA 2F7CA 3VXCA 3T93B 2JWDA 3RQTA 1JETA 4G8HA 3MHVA 4FECA 1IXHA 2QSXA 2XD3A 2OZZA 3D4GA 2ZAEB 1YTVA 4LUBA 1DMBA 1P1WA 3WAEA 3VVFA 2ZNUA 4GXSB 3GXAA 1EDLA 4F1YA 3TQWA 4KCDA 4R72A 1I6AA 3L6GA 3RGYA 4EDPA 3TTLA 3KFMA 5I2KA 3ONMA 2V25A 2G29A 1QVSA 5FHMA 4HW8A 3FJ7A 2K3RA 4QSDA 1Y3QA 3BFUA 5H8HB 4F2QA 5C39A 4YICA 3OSRA 3K6UA 1MY4A 1Y1MA 1NNPA 3A3UA 2Y7RA 4PQJA 4DXBA 2PX1A 4RA1A 4DZ1A 4ZEKA 1B2HA 1MY3A 2HCAA 2IA4A 1P1QA 4RK9A 5BUUA 5DEXA 2SPZA 5KZTA 2RC9A 4JDFA 1S50A 1I6BA 1R6ZA 3RT6B 2B3BA 3FXDA 4PE5B 2UVGA 1OLAA 1MQGA 4MF3A 5I56B 2I58A 2H5YA 3LUYA 1GGGA 3TMGA 2DP8A 4RYAA 5I58B 5H8NA 4NWDA 2NVUB 5HM4B 1MY0A 4EQBA 2KS1B 3DP4A 4F2OA 3GBBA 4XXUA 5CBNA 2XXIA 3C33A 1WDNA 1ANFA 1JEVA 3H6TA 3FJMA 4XIGQ 5KDTB 4TLMB 2X26A 1DTGA 4BLAA 1EDIA 2A5SA 1LLSA 3G3KA 4LQ5A 4EXKA 2ONRA 4RY1A 3U72A 2DWJA 1YAEA 2VGQA 4WXJA 1MXXA 4XKRA 2G93A 4FE8A 2DE2A 4AB6A 1B0LA 3TAJA 4LZ8A 1USYE 3O97A 5K2YA 3EQ1A 3O29A 4JXIA 3G3FA 2Z8DA 1OQHA 2F35A 4YB6A 2M0BA 5I57B 4MBPA 3FXRA 2A5TB 2D3IA 3KG2A 2V93A 1MXWA 4ZZEA 3V5AA 1Y9UA 4MLQA 3C31A 5ITPA 2B87B 3OEKA 4EQ9A 4FEBA 1NKXA 4U23A 2YJPA 1FQDA 3E9XA 4YU0A 3R6UA 3S9LC 2YLNA 2ONKE 3JV9A 4R9FA 1RKMA 3RNNA 1N7WA 3G3IA 5I2NB 4QFPA 3LBSA 3Q27A 1OVUA 3EN3A 4OFLA 3G7WA 4ASWA 1DPPA 1U7JA 3SEYA 3MVXA 3EHSA 2O51A 3IJOB 4TLLB 4O3BA 3OENA 4Q5TA 4OYVA 4U1OA 4YKPA 3B7DA 5I84A 4BDRA 3H7MA 3S9NC 2RINA 3CIJA 1VR5A 1YPNA 1NNTA 4QSEA 1ZBMA 4O3CA 3KEIA 2RF1A 4ZEIA 3SERA 2D21A 2PYYA 1A55A 3FIRA 1B7HA 1B0HA 1B5IA 3ZS6A 4HS7A 3CFLA 3CRBA 1S7YA 4G2ZA 1Y4CA 3TUSA 2GHBA 4F22A 3ZDMA 3PUXE 3MW0A 1R1NA 4IO7A 5CI5A 4KFQA 3FXUA 3IL1B 3IK6B 5F1QA 3MC2A 4E0WA 3SEWA 3TCGA 4JSOA 5H8HA 1B3FA 4HB1A 2GRVA 1R9QA 4G68C 1H45A 1TT1A 3I6VA 2KUBA 1SVXB 1XOCA 2B89A 2XXRA 1NNKA 1RYXA 1EU8A 4NF4A 1N76A 1H0TB 3FVNA 3I5OA 3K02A 1VFDA 1LP1B 1ZLQA 4K3AA 3QUFA 1B6HA 2F36A 4BDMA 3FATA 2HQ0A 3JYRA 3HHGA 4RK2A 4MLVA 1N0TA 1SBPA 3K6XA 2QS3A 1ZXGA 3IOVA 2AL4A 4F29A 4I1DA 3LSXA 4X48A 3VV5A 2I6EA 4TOZA 1NH8A 1TFAA 3FD3A 1QJMA 2XXXA 1OQGA 3PU5A 3QYTA 4WKMA 1GVCA 1ZJLA 1PB9A 5CBOA 3TCFA 3IB0A 5EFWB 2DWAA 4H0WA 1N3XA 5I58A 3OEMA 1A8EA 1TFDA 3K1NA 4NF8B 4RXLA 4YB7A 2O69A 1LSTA 4H5FA 4FAJA 4OZ9A 4IO5A 4HCWA 1ZMGA 4GVOA 1B3GA 3IB1A 2DQVA 5ICQA 5IAIA 2XXQA 1FC2C 3OO9A 4KD5A 3GLBA 4GF8A 4X9TA 3CSBA 3C34A 3G3GA 3D4CA 5BWJA 1SS1A 4RPNA 3TEPA 1AMFA 1DOTA 1URSA 1J1NA 3U8QA 4QSCA 4UACA 3CI8A 4C1UA 1Q2NA 3E13X 2VHAA 4HCYA 3SEVA 4G68B 1UTBA 4ZS9A 1O7TA 3FV1A 1L5TA 1OVBA 2ZYMA 3WAFA 2RCBA 3DLNA 5TP9B 3FJGA 1BP5A 4ELRA 3N5LA 1FQBA 2F8DA 3TCHA 4RNSA 3SETA 3L6HA 1IZ1A 2AL5A 2WKYA 1MS7A 5FHNA 2KLFA 5HPQA 3KOSA 1B1XA 4YMAA 4M1VA 1MXYA 1IITA 1M5EA 2NOOA 2R71A 4MN4C 1FW0A 4EUOA 4P0IA 1Z7NE 2AYSA 5AE4A 4DCXA 5DYHA 3SKPA 1LB9A 4DXUA 1H76A 5IKBA 4Q8RA 3N26A 1POTA 1N3WA 3FXEA 2ONSA 2XXHA 4ZNCA 2VOZA 4XKPA 3PUVE 3H06B 4OEVA 4YKKA 3PUZE 1HSJA 3C32A 4GRKA 3UIFA 3OO6A 3MQ9A 5DVFA 1MY2A 1GTKA 3RN8A 2I3WA 2Q9TA 4OETA 5TU0A 1NNFA 3PV0E 5J1DA 3CSGA 3TFLA 1JW4A 2WMMA 1XHYA 3M3KA 4Q0CA 4GL0A 2Z23A 1JVYA 3S1KA 4GLIA 4NMYA 1MM6A 3BBRA 1AIVA 3GBAA 4ND9A 4AQ4A 3G3HA 5FTHA 3K1PA 1JW5A 3T96B 2Y7IA 4NF6A 3U1OA 4BDQA 2X7PA 3FVOA 2THIA 2DWIA 3H6UA 1S3JA 4G77A 1SI1A 5L9SA 3R7XA 2R44A 1AH5A 4GWOA 1MH4A 2LAOA 1QW0A 1M5CA 3QUJA 3EHUA 3C9HA 4JWOA 5TPAB 1SW1A 3QSLA 3UORA 4F18A 4F3GA 1BTJA 1T0KA 2YPNA 3THIA 2QVAA 4YMBA 4OFOA 2QJEA 3PMWA 1JNFA 1B58A 3KN8A 2NUVA 2PVUA 1TXFA 1HSLA 3IJXB 2QMWA 1PB8A 2FNCA 2UYFA 5EHSA 4GODA 4GFRA 2Q2CA 3MP1A 1O64A 1CB6A 4P11A 4ZDMA 4IGRA 1CE2A 4QFKA 3QK6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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