2P10A

Crystal structure of a putative phosphonopyruvate hydrolase (mll9387) from mesorhizobium loti maff303099 at 2.15 a resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
277
structure length
268
Chain Sequence
KRPTRSELVDRFQKKIRAGEPIIGGGAGTGLSAKSEEAGDIDLIVIYNSGRYRMAGRGSLAGLLAYGNANQIVVDMAREVLPVVRHTPVLAGVNGTDPFMVMSTFLRELKEIGFAGVQNFPTVGLIDGLFRQNLEETGMSYAQEVEMIAEAHKLDLLTTPYVFSPEDAVAMAKAGADILVCHMGLTGKSMDDCVSLINECIEAARTIRDDIIILSHGGPIANPEDARFILDSCQGCHGFYGASSMERLPAEEAIRSQTLAFKAIRRQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Mesorhizobium loti
publication title Crystal structure of hypothetical protein (NP_085906.1) from Mesorhizobium loti at 2.15 A resolution
rcsb
molecule keywords Mll9387 protein
total genus 92
structure length 268
sequence length 277
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09370 PEP_hydrolase Phosphoenolpyruvate hydrolase-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.5.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces Single helix bin 2p10A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2p10A01
4MVAA 3MP5A 5IM51 1OFPA 3PUOA 4IJBA 1WBHA 2V2CA 2Y88A 5DY3A 4A21A 3W2KA 1XDMA 2TMDA 5BOOA 2YR1A 2WPBA 4OV9A 1IXPA 3EXSA 1SZGA 1XI3A 1WA3A 3OEXA 3M7WA 4IWWA 3THQA 2ZA2A 5D2YA 1OYCA 4JTIA 3S1WA 4M6VA 2V5BA 3W75A 4DF1A 4OHQA 1LRNA 3W23A 3S5OA 4LWWA 2NWRA 1GJPA 4HIBA 3KRUA 4EVZA 3WK1A 3EWYA 2ZZ2A 3S6DA 3PBUA 1A5CA 3JS3A 3ZFHA 3NQDA 1DHPA 3L21A 1TTJA 1K7EA 1Y0EA 2ZZ4A 1AK5A 3W70A 3ELFA 4WJEA 3B0PA 5LNRA 2WSRA 1R47A 2ZYFA 3PWAA 4BWLA 1G7VA 3DBPA 3MP3A 4NZFA 1OMIA 1OK6A 3NPXA 1F6KA 2YW3A 2YFNA 1K3UA 3OVRA 4O14A 4UFJA 3PULA 3LCLA 4W9TA 1WOAA 3L67A 6TIMA 1PCKA 4Y8FA 3CPRA 3LHWA 4XQ6A 1ME9A 1S3HA 3C2FA 2V5LA 4Y6GA 4Q32A 5EKYA 1A5BA 2EGZA 3STFA 4AEOA 2NX9A 1EX5A 3GDMA 4FNRA 1FX6A 3N3MA 1FWTA 4LVGA 3GVGA 3L5LA 3TK7A 3TC6A 2B0MA 2EPHA 2VEKA 1WX0A 1QO2A 2ZZ7A 4NJIA 4PODA 1EEPA 4GJ1A 2H90A 2GJNA 4X22A 5FF2A 3NL3A 3TKFA 2NV2A 3OIXA 1N8FA 2NLIA 4JTTA 3S1UA 4I9AA 1WMKA 2YW4A 4BFAA 1SU5A 3RFAA 1W1ZA 1QMLA 2WO5A 4FB7A 3NM3A 1QWGA 2AAMA 3W2JA 3KRZA 4O0ZA 3L0GA 3KVJA 2QCNA 1XBZA 3TQVA 3NZ1A 1PL9A 4JTHA 4UMCA 2QCDB 1FWRA 5BMWA 5DBUA 4IPJA 4POCA 3W7CA 2YYUA 3E96A 7TIMA 3NQ2A 4MYAA 3R89A 3N9SA 3DFSA 4IGHA 1FDJA 4AAJA 3A9IA 5I3IA 1A50A 1Q6LA 1GOXA 1LOSA 1IF2A 2NWSA 4K37A 4IMGA 1SO4A 3NNTA 1LZOA 3TAKA 3HMJG 3M47A 2J9ZA 4G1KA 1KTBA 2ISSA 4Y9AA 5HR6A 5CZJA 3EX4A 2JKEA 4CQ8A 1VLIA 4X9SA 1W56A 5HULA 1SPQA 1OFBA 1KFCA 4RXGA 1H1ZA 3OA3A 3WK3A 3G1DA 1TPEA 4BWLC 1V5XA 3BGGA 3S8HA 2FB3A 2QCFA 2CLOA 1JULA 3GLCA 3LTSA 3W7MA 4DBDA 3G0UA 3O6CA 4C1KA 5AFDA 3MBDA 4O1AA 4KWVA 1H7NA 4MZ8A 4PA8A 3UXDA 4WY0A 3CB8A 4MZ1A 4O1CA 5G1YA 2A0NA 3TE9A 3QSRA 2X1UA 4AXKA 4IPIA 2VFFA 1QPRA 3IEBA 2GQAA 3M0ZA 2A7PA 3W7OA 2Q3RA 3TR2A 3MW7A 3CWNA 3SI9A 1OABA 3UWUA 3IGUA 1JJKA 4M6PA 1SW7A 2WSQA 5K9DA 1G4PA 3QM3A 3LOTA 3W22A 4QM1A 3QMSA 3NL6A 3NQCA 1LRTA 2Q8LA 5F4XA 3UWYA 1OK4A 5LNUA 1G4EA 1X6UA 2BLEA 1GYNA 1KLYA 3H53A 4EOUA 4JTEA 4D2JA 1FWNA 3W2MA 4O12A 1PCWA 1QAPA 2NXIA 4ORIA 1LBFA 2HTMA 5E0KA 4DQWA 4WOQA 4B5NA 2R14A 1H62A 1HL2A 5C6MA 1D3HA 2EKCA 1TQXA 1X7FA 2A5HA 1TYGA 3HG5A 2Y7EA 4RLIA 3VI2A 3W83A 2WJZA 4TO8A 1FCVA 1J4EA 3N2XA 4XBKA 4PC8A 3PUDA 1MSSA 1GVQA 5D37A 3DI0A 4HNTA 4CNOA 2BSLA 3MI3A 4OT7A 5CPOA 4HKPA 4O16A 1RQBA 3N34A 3S5NA 4UTKA 4M7SA 3N2MA 2O7QA 3BVJA 3L2IA 1YTEA 4ONVA 5DELA 2OJPA 4ZZ9A 4LV9A 1K8YA 4JTUA 3S42A 5EL1A 1VLWA 3TW7A 1ZY9A 2QCHA 4WXYA 4QITA 1EWDA 3WK2A 4UFMA 2E6FA 3W7RA 5IBXA 3EX1A 4CQ9A 2P1FA 5LHEA 1PIIA 3I68A 2CLMA 3RF9A 4UMBA 4JDBA 4FNTA 1IXOA 1JCJA 4JN6A 3PM6A 5AN7A 2FJKA 3W1RA 1XCFA 1VHCA 1I2NA 4PEKA 2FTPA 3PAJA 1MEHA 4E0CA 1H5YA 1BWKA 1OHLA 4UFKA 4NUWA 3TQKA 1K8ZA 4FX8A 1SW3A 2ZQ0A 3LERA 1FDIA 5I3FA 2C16A 1SW0A 1F74A 3B06A 1GTEA 3CWOX 1IIGA 4FNQA 2CZ5A 5AHNA 4MY9A 3CTLA 5D32A 4IX2A 3ANYA 3BW3A 3UYCA 1B9BA 3NPWA 3W1TA 2A4AA 2GQ9A 5EA9A 4QJ1A 1VZWA 3T4CA 2I9EA 2ZRXA 1TJRA 4WD0A 1O5KA 4O4WA 1TPFA 5D2WA 1A5SA 1OX4B 4JTLA 3NL5A 3L9CA 1VS1A 1R2TA 3CEPA 4M7TA 1OX5A 2X1TA 2PCQA 3NQ8A 5CZ0A 3DHDA 5GVJA 3ATYA 3S9YA 3NQGA 1U5JA 1W5PA 3TIMA 3KHJA 4LC8A 3LHTA 2CW6A 5EYWA 2WNNA 2Q3OA 3NPUA 3WJXA 4JICA 4CCDA 3U2OA 2ZTJA 5DCBA 3EWUA 1M5WA 2TSYA 5K7JA 1LLWA 3LX9A 1KM6A 2DJXA 3S0CA 4RKAA 1YXCA 3P80A 3UWQA 3CC1A 3GDKA 4Z1CA 4WOZA 4L4MA 1KM2A 3MP4A 4LS2A 4RZ4A 2P10A 5FI8A 3C3NA 3G1HA 3TCEA 1SSGA 3R13A 1LORA 5HNRA 2HS6A 2QCLA 1UB3A 3ZWSA 5L9FA 1ZAIA 3FOKA 1W54A 1EB3A 2ISWA 1A5AA 3CIXA 5AYYA 3O07A 3VE7A 4RR4A 3LM7A 4Z1BA 3RLVA 1W8SA 3C8FA 3RMJA 2DZPA 3W2LA 1GVFA 2V30A 2GQ8A 2XFWA 3QYQA 3RK8A 3OHIA 4AMAA 1FXPA 4UTWA 3Q2DA 2O7SA 4DO5A 3GZ3A 1FDZA 5ABTA 2QUTA 5LNSA 5CZTA 4KFPA 4IXXA 1LLZA 4K38A 2ZRYA 3W1MA 1RZMA 1YTDA 2ZRVA 4O4VA 4UTTA 1N55A 3B4UA 3KXQA 5AB3A 4O8RA 3TNOA 3FYPA 1LBLA 2VFHA 3GB6A 4UTMA 2CZFA 4KWWA 4M6QA 4DXVA 1OG0A 1KM0A 3NG3A 3W7LA 1PV8A 4NXSA 2WNQA 2ZZ3A 3W1UA 3LCWA 4KFOA 3L68A 3VFLA 4J9JA 2W79A 4UFHA 3O05A 3O6QA 2E6DA 1R46A 4GC4A 1DVJA 1B4KA 1OFAA 1VH7A 3G22A 3G24A 1L6SA 3BW4A 1O94A 3NOEA 3QC3A 3TC7A 1UJPA 3CEUA 1LBMA 1C29A 4N9CA 1XBYA 2Y7GA 3W86A 4JS3A 4DF0A 3P5ZA 4XKYB 1ZENA 4JY8A 2YCEA 4N9EA 5G4WA 1H7RA 3T40A 1SZEA 1C8VA 3TSMA 3S5YA 2YFOA 1THFD 2TRSA 3ABRA 4XTIA 4I7WA 1L9WA 1ML1A 2Y89A 3QMRA 4GBUA 2CLHA 4N2YA 2VEIA 3LHZA 1FDOA 4EWND 5EMUA 1PE1A 3PY2A 3G1AA 4Q33A 4WX2A 2BXVA 2DZSA 2W6RA 1S5TA 3NQ6A 4UMAA 5F1UA 2RH9A 3USBA 2VEPA 1GG1A 3PUEA 1T99A 2NUXA 3W72A 1OX6A 2I1OA 2ZFAA 3H55A 2PRLA 3UD6A 1RQHA 4NXKA 1KTCA 1S5VA 4JD4A 3OBKA 3JR2A 5CPNA 1UASA 1S5WA 4GNJA 3B04A 1G67A 1P0KA 2ZRUA 4WXZA 4UCGA 5I3GA 2NUYA 5KZDA 4K7YA 1EWEA 3M43A 3GIYA 3U8GA 3SFKA 4GUIA 1L6YA 1MEIA 4LVBA 3LHVA 3STCA 4BI5A 5AHIA 1EP1A 4EF9A 4ALDA 2V8ZA 4ICNA 2C3ZA 4ZQOA 2DZWA 4JX4A 1ICQA 5I3HA 3SW6A 2ZA1A 1DJQA 1B3OA 1GG0A 1K7XA 4LOCA 1NFBA 4UC5A 3TUUA 3BLEA 1TB3A 3KVMA 3LCHA 3MBFA 1LM1A 4TU1A 3UQNA 3PF3A 1XKYA 1Z41A 3T55A 5F2IA 3NDOA 5KZMA 4HT3A 3QQ1A 4HSOA 3NA8A 1EUNA 4JYFA 1W31A 3DKLA 3SY5A 2X30A 4AB4A 3GNNA 3L5MA 3HB9A 3A5VA 3C0JA 3HGOA 1NSJA 2Y6ZA 4ADUA 4QAIA 2I14A 3LCFA 4QQ3A 4MJZA 3LRKA 5LKYA 1FY6A 1B4EA 1X1ZA 5D2VA 3W2UA 4N02A 3ABOA 2QUUA 3ABQA 4CQAA 1G6CA 3EX2A 4M19A 3MJYA 1OYBA 1PHWA 1W5QA 4JNMA 4FXSA 3P8IA 5A8GA 2Y61A 4Z1AA 3LI1A 1QR7A 5DCEA 4IXHA 2DZXA 1FUYA 2DU2A 4FNUA 2NV1A 5HWMA 1EP3A 5C55A 4H4IA 3W7JA 4GXMA 1QPNA 3LB0A 3HBLA 1DL3A 1WQ5A 2LLEA 2KZHA 3NZRA 1JUEA 2Z1BA 3LRLA 1MZHA 1XM3A 1YPIA 2VKZG 1LTDA 4JX5A 3W1QA 3WJYA 3UWVA 4MY1A 1OFRA 1UUOA 3A5FA 3SGUA 4K36A 3MHGA 3W3OA 2OT0A 4MIMA 4UXDA 2QCDA 3P61A 3P62A 4FX6M 3T78A 5AC8A 1OFDA 4GRSA 2Y70A 2Z2UA 3PC0A 5K9CA 3A22A 4R33A 3LBMA 2J24A 1QCWA 2BWGA 1ICPA 5U7SA 3D0CA 1FBAA 1W5OA 3IIZA 2ABAA 4LUJA 4OQVA 3IV3A 1BWLA 3C2OA 3DFTA 5DXYA 4IUOA 4JTJA 1RQEA 4HN4A 1AMKA 2GVJA 2PURA 4RJEA 3O63A 3TJXA 3QQ0A 3L5AA 5FESA 5G2WA 1XUUA 3TXZA 1KA9F 2R8WA 5LSMA 3EB2A 1O4UA 1JRBA 3FJLA 4MZYA 4UTLA 4EIVA 5KMYA 2YZRA 4ZQPA 1QDSA 2C14A 1H7XA 3KAOA 3WFAA 3EKZA 4I7UA 1KFKA 3TFCA 3W85A 3LLFA 3NR0A 4TX9A 3TH6A 2EF9A 3BW2A 5LGXA 4RZ5A 2J88A 1W3NA 3W7IA 4RCXA 2AGKA 3UWZA 3DHFA 5D33A 5F2GA 3NEVA 4PL2A 3R8RA 2FFCA 4OBTA 1E51A 2CLFA 4O15A 2JGYA 4JTFA 3R12A 4BI7A 3NO5A 1H1YA 2ALDA 5D30A 2VXNA 3MMTA 2ATMA 2ZA3A 4LC6A 4A3UA 3INPA 2C0AA 4LNYA 2WNZA 4PFMA 3NM1A 1NF7A 4GUGA 5DCDA 5J5RA 3Q94A 2B7NA 1LRQA 4NVTA 2YSWA 6ALDA 1JCMP 3TX9A 1LROA 3EWWA 1WBJA 2FQIA 2CLKA 3NGJA 1YXDA 4DELA 3G3DA 2E6YA 2OX1A 4O52A 4LVDA 1PVNA 3BK0A 5D04C 3CLMA 5KSWA 3QEZA 3M5XA 2UV8G 3VCRA 3FJ6A 1JR1A 3HJZA 2YDAA 4AWTA 1KBJA 3G3MA 2A21A 3P7YA 3CHVA 4WQ6A 1L6WA 5KTLA 2Y7FA 3V1PA 3BO9A 3IVSA 1YDNA 1AW5A 1H7PA 3T7VA 4BI6A 3I7RA 3GXPA 4JDYA 1QNVA 1WXJA 3STGA 2E5CA 4WZHA 3HGSA 1HFBA 3C4UA 2IQTA 3AJXA 1K8XA 5AHEA 2V9DA 1L2UA 3W2NA 3EXTA 1H51A 4O19A 4O17A 4PTNA 2WV8A 1M7PA 1FCBA 3LCXA 1P1XA 1TV7A 3A21A 2RDTA 2VFDA 2C6QA 2ZRWA 3NAVA 4UIOA 3BARA 5LZLA 3FYOA 2ATSA 4K8HA 1K02A 4LVAA 5EBUA 3FKKA 5TIMA 3W1NA 2F7FA 2RDUA 4M5PA 3ZWTA 4AF0B 3DENA 4DO6A 1ONRA 2A6NA 2PE4A 3PBWA 4UR7A 3I6RA 3IGXA 5C2XA 1RPXA 1T8XA 4OGZA 3G1XA 3SZ8A 3TV8A 2QCGA 4HHPA 4AWUA 4YCPA 3E02A 1YDOA 2C19A 4N6FA 3TDFA 4HNUA 5FF0A 4FX7A 1DOSA 4Z1DA 2HS8A 1LDCA 3NPVA 1DV7A 2YYTA 3QF0A 1JUKA 1D9EA 3W71A 2A2IA 4MJMA 1SFJA 3DAQA 4LV4A 3W7QA 5HR7A 1QFEA 3HGJA 4JEQA 5LGZA 1I2PA 5D2XA 3W07A 1XUZA 1KM4A 2YPIA 4QNEA 1TRDA 4CCEA 4O53A 2QAFA 4L4LA 1EA0A 1YDVA 3L65A 3HPXA 5H91A 3M44A 2C18A 3MYOA 3HPSA 4FEZA 4YL2A 1TCDA 1ZJIA 1SZNA 1DKWA 3FIGA 4O57A 1KM3A 1SR9A 1H60A 1GYLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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