The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
MCAVLRQPKCVKLRALHSACKFGVAARSCQELLRKGCVRFQLPMPGSRLCLYEDGTEVTDDCFPGLPNDAELLLLTAGETWHGYVSD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the heterodimeric complex between CAD domains of CAD and ICAD.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Dna binding protein
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
CASPASE-ACTIVATED DNASE
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| total genus |
11
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| structure length |
87
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| sequence length |
87
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF02017 | CIDE-N | CIDE-N domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GB4 A; 2J53 A; 2JWU A; 4OZA A; 2JSV X; 2KAC A; 1IGD A; 1HEZ E; 1MI0 A; 2IGG A; 1FCC C; 1IBX B; 1PGA A; 2LHD A; 3MP9 A; 1K53 A; 2EEL A; 4OZC A; 4HKZ E; 2N9L A; 1XF5 L; 2QMT A; 1YNT E; 2JU6 X; 2LGI A; 2ZW1 A; 2J52 A; 1GB1 A; 1IBX A; 1MPE A; 1F2R C; 1KH0 A; 4IKG A; 3UI3 A; 2N7J A; 1MHX A; 1D4B A; 1K52 A; 1QKZ A; 2JXT A; 2KDM A; 1Q10 A; 4KGS A; 4IOI E; 2LHE A; 4OZB A; 1K51 A; 2KQ4 X; 5HHD G; 1MVK A; 1PGX A; 1PGB A; 2PLP A; 1C9F A; 4MAC A; 2ON8 A; 1EM7 A; 2I2Y A; 2QSD A; 2KN4 A; 5JXV A; 2OED A; 2IGH A; 1P7F A; 2RMM A; 4D2K A; 2I38 A; 1XCT L; 1K50 A; 2GI9 A; 2RPV A; 2NMQ A; 3V3X A; 1ZXH A; 5BMG A; 5HFY A; 1F2R I; 2GB1 A; 2LUM A; 1MHH E; 2ONQ A; 2ZW0 A; 4GLS C; 4KGT A; 1HZ6 A; 2PTL A; 2N9K A; 3FIL B; 2IGD A; 4KGR A; 5HI1 A; 4HJG E; 5BMI A; 1FD6 A; 3GB1 A; 2KWD A; 3FIL A; 2JZP A; 1P7E A; 1UWX A; 1FCL A; 1IGC A; 1JML A; 1HZ5 A; 5HG2 A; 4WH4 A; 2K0P A; 1XCQ L; 2PW9 A; 5BMH A; 1YMH E; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KJT A; 3WAN A; 1F0Z A; 3R2I A; 1D5Z C; 4JWS C; 5LXI B; 1ZW7 A; 4DDG D; 2L32 A; 4FUL A; 3VUY A; 2KAC A; 1R4M I; 2RDH A; 5FK9 C; 2JWZ A; 2N1W A; 1FRR A; 1EF5 A; 1V6E A; 2AWT A; 1WX9 A; 1I4P A; 1EU3 A; 2RPQ A; 4AQ7 A; 1V80 A; 3PTF C; 2M0X A; 2CU3 A; 3DHG C; 2N9L A; 2IPK D; 1YNT E; 2QMT A; 3I57 A; 3FAH A; 4DBG A; 1KH0 A; 4J6I A; 3L10 B; 1E5W A; 3H7P B; 3V61 A; 1CMX B; 4FHJ A; 4MJS A; 4WWN A; 4YL8 A; 3TEW A; 2BS2 B; 3V60 A; 1V2Y A; 2KX0 A; 3DBR I; 1MVK A; 3PO0 A; 1ZDV A; 3AE9 B; 2DWQ A; 1JWU D; 2A5U A; 1UH6 A; 4MEL A; 1H4R A; 2V4I B; 2CHW A; 3UQA A; 3RCZ A; 2LVQ A; 2EKE C; 2KMM A; 1HXY D; 4NJC A; 2QIE B; 3LB8 C; 4ASW C; 2FUH B; 2RDB C; 2PKO A; 1YX6 B; 2DAF A; 4WJO A; 2L7R A; 5KHO A; 2LVP A; 1S1Q B; 2M1M A; 2ZPN A; 4RH6 A; 1WX8 A; 4ZYN A; 4CQN A; 2PPH A; 1T0S C; 3P42 A; 2BKF A; 4ANU A; 2D5G A; 3GE3 C; 4G50 A; 4HKQ A; 3A1Q B; 2KC1 A; 1GB4 A; 2O6V D; 3NUH B; 1LO5 D; 3TIX A; 2IJ0 A; 3U4E G; 3RT3 B; 1WGK A; 2W55 A; 3AUL A; 1PDX A; 2XNA C; 3H9D A; 2G45 B; 1HEZ E; 2IGG A; 4GDK A; 1L5P A; 3W5V B; 3SHQ A; 2MBE A; 3JW0 X; 3K9O B; 1WWT A; 4IUM B; 4PK1 A; 3ONS A; 4LNK A; 2MW5 A; 3VH3 B; 3JVZ X; 1C4A A; 4II3 B; 3ZDM C; 2LGI A; 2MJ3 A; 3Q14 C; 5HKH A; 3P4R B; 4ICU A; 2JXX A; 1KTK A; 1ZOY B; 2WXO A; 4IKG A; 4NJ6 A; 2MCN B; 4IW0 A; 4BBN F; 4EEW A; 2LHE A; 3PHW B; 1SGH A; 3Q8C A; 4K7W A; 5IO9 A; 4ARC A; 2BTE A; 2KQ4 X; 3AU4 A; 5HHD G; 1WE7 A; 3A9K B; 2LGY A; 2M17 A; 1TJE A; 3FKY A; 3TSS A; 1J7A A; 4REZ A; 2KN4 A; 3IVF A; 1HTO A; 2Q5W D; 2D11 A; 4EZK A; 3NY5 A; 2K25 A; 2V0G A; 2N1V A; 4JX1 C; 4BZA A; 2AQ1 B; 2DYM A; 2C7N B; 3IAS 1; 3O13 A; 1PUT A; 4FLH A; 4IG7 B; 4X57 B; 3M95 A; 2MQJ A; 4KKI A; 3UF8 A; 4RCO A; 1JRU A; 3ZYY X; 2KWD A; 3NOB A; 1JQ4 A; 3DHH C; 1CJE A; 3DPD A; 5BMH A; 2KOX A; 2K8B A; 3AEE B; 1B1Z A; 2KFK A; 4H2A A; 2L0F A; 3NG0 A; 4F7Z A; 1C79 A; 2LXA A; 1E8W A; 4YWG G; 1NDD A; 1R4N B; 1P98 A; 3Q3N C; 2WDV B; 1CZP A; 1CQV A; 1I4Q A; 1V86 A; 1FNU A; 1PGA A; 4JWU C; 5J2R A; 4LCD E; 4HVB A; 1HE8 A; 1EU4 A; 2JZZ A; 1UBQ A; 3VRA B; 4JQW C; 2G4S A; 1IBX A; 2NTT A; 3TCA A; 4IDI A; 3W1S A; 1VZ6 A; 1WXA A; 4LTU A; 5JZE B; 2FCQ A; 1L0V B; 4W9L A; 3VH4 B; 2B76 B; 1QKZ A; 3NRZ A; 3NVV A; 1FM0 D; 5E6N A; 3PHX B; 4OVZ A; 4RMA A; 4XWW A; 2KTR A; 1VDV A; 1DOI A; 4EKU A; 5EE3 A; 1DOY A; 2GOW A; 4L1B A; 3RNG C; 1V1P A; 2L1A A; 1SEB D; 2JRH A; 3D32 A; 3VQI A; 3NZ3 A; 4M8M A; 2I38 A; 3PZD A; 3BY4 B; 3T3N A; 5FR3 A; 3BVG A; 2ZVN A; 4ZHO A; 2GRI A; 4I6P A; 4XWT A; 2QCZ A; 4BBN C; 2C7M B; 2MP2 B; 1WZ0 A; 2X8X X; 1OQY A; 4IWO A; 3LJ3 A; 4B95 A; 2PTL A; 4L23 A; 3NHE B; 1UBI A; 3BVM A; 1RM6 C; 1T5X D; 3DBR B; 4KX6 B; 3HIZ A; 3C8Y A; 3R2T A; 2MEK A; 2A4Z A; 1AYF A; 4MH8 A; 3RYT A; 2MWS B; 3HRD D; 2NS5 A; 1WGG A; 1YQB A; 3OAW A; 2KQ7 A; 4MSM B; 4A6Q A; 1J8C A; 2K9X A; 3ZJU A; 2KMA A; 1FEH A; 3N30 A; 2AEH A; 5IA7 A; 4BKS D; 1WGD A; 2ZEQ A; 4BVU C; 5CHW A; 1SF0 A; 1N6Z A; 4AS1 A; 1XLP A; 3ZIM A; 4GXB A; 1L6U A; 4HRO A; 2BS4 B; 2JT4 B; 2ACZ B; 1E8X A; 3TJP A; 3CST A; 5IAA C; 2MLB A; 2O2V B; 4ITK A; 2CR5 A; 2CKH B; 4GB9 A; 4I6L B; 2QIL A; 4FA6 A; 1QT9 A; 2NPT B; 3PLV A; 2IZV B; 4F1S A; 3EFC A; 4MM3 B; 2IDY A; 2XK5 A; 2WXN A; 4BAX A; 4KGS A; 4LDT D; 2IY0 B; 2JYT A; 2K8C A; 1KLU D; 2KK8 A; 4OZB A; 1FNV A; 1ZPS A; 3DBH B; 2Z59 B; 1WYG A; 2WXF A; 3Q8F A; 2NBU A; 1C9F A; 3QWZ B; 4EE2 A; 4FAD A; 3B2G A; 4WAA A; 1E10 A; 1TTN A; 1XQQ A; 3TBL D; 1HTQ A; 2WX0 A; 1YJI A; 4MGY E; 1A70 A; 3HM6 X; 2BGF A; 3KUD B; 5C23 A; 5JHB A; 2BF8 B; 5HFY A; 5GXG B; 4NJ7 A; 3QCA A; 3CMM B; 2ICI A; 2KWC A; 1TGZ B; 3FIL B; 1JRP A; 4BKG A; 1L4D B; 3WA0 A; 4Q2J A; 1N63 A; 1I42 A; 4A9A A; 5C2T B; 3QAQ A; 1GC7 A; 5CHV C; 2DYO A; 1VLB A; 3IFW B; 2WWZ A; 4S17 A; 4DHZ B; 2FCM A; 5L83 A; 1JML A; 1JWS D; 3P63 A; 2BBC A; 1FXA A; 2WP9 B; 4DK5 A; 4GSW A; 1WIA A; 1P1A A; 5TR5 A; 3A9J B; 4MJS B; 3AE5 B; 1GOZ A; 3QC8 B; 2AYO B; 4HRS A; 4XGA B; 2AL3 A; 3PGE A; 4EZL A; 5BYS A; 3QX1 A; 3PRP B; 1N5X A; 4GIV A; 1N5W A; 2IND C; 1ZGU B; 3QQ8 B; 4XDC A; 2BB5 A; 4F8C B; 2PVG C; 3PRM B; 2MA9 B; 1WR6 E; 4W9D A; 1AWD A; 4ANX A; 1KOT A; 3M63 B; 2ZW1 A; 1WJ6 A; 3VTW A; 3IT6 B; 1MPE A; 3ZKJ C; 1YQ3 B; 1WJN A; 4ZRI A; 2WDR B; 2M56 B; 4DXF A; 2KX3 A; 4K1R B; 3JSV A; 4MH0 E; 2D10 A; 5DPT A; 2GBN A; 4DQO C; 1V9J A; 1GPX A; 4KSK C; 4M01 A; 2PLP A; 4NQL B; 1VD2 A; 1GG3 A; 2WHI A; 1JWA D; 3GS2 A; 3KLS X; 2L3Z A; 3SFE B; 3NS1 A; 2RPV A; 4BOS C; 3V3X A; 5D2M B; 3AE7 B; 3AXC A; 1YJJ A; 1EF1 A; 4ANV A; 3NS8 A; 4KGT A; 5EE1 A; 3OWE B; 4LNO A; 3PRE A; 4GDK B; 1SJH D; 2OJR A; 1BML C; 1JWB D; 3N32 A; 2KJ6 A; 2Z0D B; 4A3P A; 2KDI A; 5D6J B; 1L0X B; 1C1Y B; 4S0R A; 2IO0 B; 5J18 A; 2JZP A; 1TZO A; 2LFI A; 3HVD A; 4UDU C; 3WAP A; 3SEB A; 2MBH A; 3L13 A; 1GNU A; 1FNW A; 4A20 A; 1D5M C; 3RNC C; 3ZDT A; 2L76 A; 2RR9 A; 1R4N I; 4WJN A; 4OZA A; 1TS3 A; 2WXI A; 1T0Q C; 3V6E B; 2QDF A; 4OHJ A; 1TKE A; 3W2D A; 1BUI C; 5EE0 A; 3DCG A; 2WLB A; 3EC8 A; 5BO4 B; 3TEZ A; 2HE7 A; 3V62 A; 3SDL C; 2K39 A; 4GOC A; 5DPR A; 3K9P B; 5AZG A; 5JH5 C; 2AQ2 B; 4HK2 A; 1I4X A; 3NZS A; 1STE A; 2R61 A; 1LQB A; 2AQ3 B; 2BS3 B; 4FJY A; 1ET6 A; 4JGH B; 3B2F A; 4NAM A; 4LDT B; 5IKC M; 1NEK B; 3ML8 A; 4PS7 A; 4YTP B; 4WWP A; 1UNS A; 3KWL A; 1WXQ A; 1YN4 A; 1HA5 A; 3NVY A; 5AZH A; 3OLM D; 5G55 A; 4YT0 B; 4RGT A; 2K6D B; 2DHZ A; 1RYJ A; 2IO3 B; 1HQR D; 1ZDX A; 3Q69 A; 3DHI C; 2KFK B; 2MX2 A; 1SIJ A; 3W1Y A; 1F2R I; 2KNB A; 4XC2 A; 1KLG D; 4KIK A; 1OGW A; 1P3Q U; 1C3T A; 1EWC A; 3P4Q B; 2WDQ B; 1DYQ A; 2Y5C A; 1C4P A; 5AZF A; 2L05 A; 2JPH A; 1RFA A; 1RRB A; 2V9H A; 4CO7 A; 4PS8 A; 3PSE B; 1I4H A; 1TYG B; 3EA6 A; 3ETR A; 1TY0 A; 2E6X A; 3GE8 C; 2JSV X; 4G3X B; 4XDD A; 2LWP A; 1V49 A; 1OEY A; 1L4Z B; 3MC9 A; 5CX3 A; 2WYQ A; 2YVC A; 4DWF A; 2DBY A; 2PEA A; 3ZXR A; 3R3M A; 1GB1 A; 1YQ4 B; 1YJ1 A; 1E7V A; 3ZNG C; 4ZDV A; 4KDL B; 4WJP A; 3ZO5 B; 1SE3 A; 2N4F A; 3DBH I; 3DWM A; 5BYQ A; 3HM3 A; 1YD8 U; 1VCB A; 3ZLZ A; 1WFY A; 2UYZ B; 2RGF A; 2MRP A; 2JVC A; 4W9I A; 1GJZ A; 1H8C A; 1CK1 A; 3EGR A; 3L0W B; 1WGR A; 2KMC A; 1SB3 C; 5GMV A; 3ZNH B; 1P7F A; 1TKG A; 1TIF A; 1ENF A; 3AMZ A; 2FCS A; 2G4D B; 1DOX A; 2FIF A; 1XD3 B; 2KVR A; 1PFD A; 5DPW A; 4BFR A; 2L8J A; 2LGS A; 2ZW0 A; 3BZD B; 1ISN A; 5C1Z A; 3W1S C; 3KQ4 A; 3BK1 A; 1M4V A; 5E6P A; 3S2A A; 2WS3 B; 5BMI A; 3VUW A; 2MJE A; 4CHK A; 1SIF A; 1WXM A; 3ZNI D; 2LGD A; 1WRD B; 2HTM E; 3AB5 A; 1MG4 A; 4II2 B; 4WQO B; 3ZUN A; 3ABV B; 2IYD B; 2DYB A; 3OJ4 B; 2XK5 B; 5DCN A; 4FHK A; 2WXM A; 2G1E A; 1MI0 A; 1C76 A; 3RI7 C; 1WH3 A; 2CJN A; 1SBB B; 2JQR B; 1N60 A; 4P1C C; 3A4R A; 3RZF A; 3UGB B; 4GN1 A; 1K53 A; 3AE2 B; 3V6C B; 4P6V F; 1MFW A; 2J52 A; 4DXA B; 4DDI D; 4ZRQ A; 1KM7 A; 4BKT A; 4JIO U; 2LGX A; 3AEB B; 3A33 B; 1J0G A; 5E6J A; 1LFD A; 4W9J A; 5LNK 1; 3H8H A; 1QIL A; 2OJW A; 4AP4 C; 3BII D; 2LVO A; 2XEW A; 2GBJ A; 2OED A; 2IGH A; 1IP9 A; 4LLG M; 2DZM A; 3I9V 1; 2KDF B; 3DWG C; 3U7Z A; 2NMQ A; 4C4V A; 1ZXH A; 3VRB B; 4HXD A; 4MSQ B; 2J42 A; 2V3N A; 2ONQ A; 2WU2 B; 4CYE A; 3MHS D; 1F52 A; 4ICV A; 3LDZ E; 2W9N A; 1E7P B; 3RFZ B; 1LXD A; 3APF A; 1V1O A; 2NTS A; 5EE9 A; 3UIN B; 3C0R B; 3AE4 B; 3GB1 A; 2HJ8 A; 2WXL A; 5H92 C; 2WXQ A; 2LI5 A; 3VTV A; 3AE8 B; 5HG2 A; 4O1N A; 3PV1 A; 4J3O D; 1E0Z A; 3IBE A; 2KHW B; 2KVZ A; 2PE9 A; 2ZNV C; 3GOE A; 4RF0 A; 2KKC A; 1OTR B; 3RNA C; 2OHF A; 3ZRC A; 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3EEC A; 2BYF A; 4HDQ A; 2MH7 A; 4WWO A; 2G3Q B; 2SAK A; 3SU8 X; 4RF1 A; 1Y8R C; 2KJR A; 4RGO S; 2EEL A; 4OZC A; 3SD5 A; 4HKZ E; 1XXG A; 2L52 A; 3RUL A; 4PYU A; 2D3G A; 2BW2 A; 5T8I A; 2CS4 A; 4KIK B; 5D3D A; 2HDE A; 5JHA A; 3H1U A; 1I7H A; 1G6J A; 2K5P A; 4AJY B; 1MHX A; 2KC2 A; 2C60 A; 4LNN A; 2KDE B; 3B08 A; 2DLB A; 3L16 A; 4L2Y A; 2PJH A; 1WR1 A; 2J0K A; 4MEM A; 2GI9 A; 3KUZ A; 3ZRF A; 1Q0W B; 1FIQ A; 1UUP A; 2QC8 A; 3WAM A; 2ZCC A; 3AEA B; 1MJD A; 4KGR A; 2K1F A; 2RDG A; 4LJP B; 1T6B X; 5DPS A; 2LXC A; 3Q3O C; 3WCQ A; 2BYV E; 4GMV A; 4YXD B; 2DZI A; 3QAR A; 1KFY B; 3ZNZ B; 2PE6 B; 1WJ4 A; 3U52 E; 1VRA B; 3P4P B; 1UWX A; 2WXH A; 3MHZ A; 2INC C; 4G0N B; 4ZYS A; 3DVG Y; 2HJ1 A; 4RM9 A; 4RGM A; 1UD7 A; 3Q2A C; 2KO3 A; 2REX A; 1N61 A; 4B6W A; 1E90 A; 4NPN A; 1VZ7 A; 2X38 A; 2VZK B; 2IO2 B; 2O6V A; 1BXT A; 1T0Y A; 2EKI A; 3ZW3 A; 2AL6 A; 2IY1 B; 4IWQ A; 3MP9 A; 1TY2 A; 2GMI C; 5IN7 A; 3E9S A; 3VTU A; 1TKY A; 1WRI A; 1WM2 A; 1RWS A; 4C7Z A; 2JY6 A; 3PT2 B; 1Z5S B; 4JLC A; 1TZ1 A; 1RAX A; 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