The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
112
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structure length |
112
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Chain Sequence |
APIKGVTFGEDTVWEVQGYKNVRITFELDERVDKVLNEKCSVYTVESGTEVTEFACVVAEAVVKTLQPVSDLLTNMGIDLDEWSVATFYLFDDAGEENFSSRMYCSFYPPDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
|
| source organism |
Sars coronavirus
|
| publication title |
Nuclear magnetic resonance structure of the N-terminal domain of nonstructural protein 3 from the severe acute respiratory syndrome coronavirus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NSP3
|
| total genus |
9
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| structure length |
112
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| sequence length |
112
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| ec nomenclature |
ec
2.7.7.48: RNA-directed RNA polymerase. |
| pdb deposition date | 2006-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GRI A; 2IDY A; 2M0A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4TSS A; 2G3Q B; 2LAS A; 3RNF C; 1MHX A; 4O1N A; 1ROE A; 1ZDX A; 1E9M A; 5C3J B; 3SD5 A; 2IGD A; 2KQS A; 3AV8 A; 1CZP A; 1QLB B; 3QA8 A; 3VTW A; 1FIQ A; 2RD0 A; 1D5Z C; 1YN3 A; 2N9P C; 4GN1 A; 4KGS A; 4NAW A; 1WF9 A; 1XCT L; 2AQ1 B; 5G5H A; 3CMM B; 3ZLZ A; 1E8W A; 4K1R B; 2V9H A; 3U30 A; 2JRI B; 3NVW A; 4HCN B; 1C79 A; 3KYD D; 5IP4 D; 3P4S B; 3QQ8 B; 2IO2 B; 4IWO A; 4L2Y A; 3PHW B; 1WMH B; 3W1S C; 1YOV B; 5BMH A; 3ZTD A; 2J53 A; 1T6B X; 2VZK D; 3WAN A; 1ET9 A; 2RDB C; 2MHJ A; 3C8Y A; 4FN2 A; 3L0W B; 2L00 B; 1J19 A; 2WXN A; 2MWS B; 2C5L C; 2DZK A; 3ZW3 A; 3V62 A; 1HE8 A; 1VJK A; 3RCZ A; 4IWQ A; 1T0Y A; 3BVM A; 3BIN A; 3VQI A; 5DCN A; 5J18 A; 3B08 A; 2GBN A; 2J7Q B; 4RGM A; 3RD2 A; 1E7U A; 5CHW A; 5E6J A; 4TQ0 A; 2YEP F; 4P16 A; 2GBJ A; 4IOI E; 2V3S A; 2G45 B; 1WXS A; 4OVU A; 3IBE A; 4EFO A; 4J6I A; 2NBV B; 5TSS A; 3GZN I; 2MBE A; 3R3M A; 1YQ4 B; 3OG5 A; 2AWT A; 4M01 A; 2INP E; 1LFD A; 3NZU A; 4YTM B; 4W9J A; 2M4N A; 2C7N B; 3BVZ A; 1WM2 A; 2PW9 A; 1F9J A; 4EZL A; 2GB1 A; 3DBH B; 2WWZ A; 1F2R I; 3RI7 C; 1E5W A; 3MFG A; 1UH6 A; 1Q0W B; 1V9J A; 4MGZ E; 1Z5S B; 2Z0E B; 1P98 A; 3DWG C; 3U7D A; 1XLN A; 2WU5 B; 2ZCC A; 1K53 A; 1MHH E; 3IT6 B; 2O6V D; 4M02 A; 4KDI C; 2CHZ A; 2JZZ A; 1N61 A; 2D3G A; 1E6E B; 4W9G A; 1FPY A; 2W3S A; 1FRR A; 1F2R C; 5BMG A; 5FR6 A; 3BK2 A; 1K8R B; 2EKI A; 2IO1 B; 1DOI A; 2FNJ B; 1WE6 A; 3ALB A; 2K9X A; 2WNM A; 2O2V B; 4YTN B; 3L54 A; 2ZCB A; 3WAL A; 2DAJ A; 3ZRF A; 1XXG A; 1T0Q C; 3C0R B; 2N0S B; 1RFA A; 3RNA C; 2H89 B; 3GE8 C; 2I1J A; 3A9J B; 2LJ5 A; 4MT5 A; 3KWV A; 2BS4 B; 4LNO A; 2JX5 A; 1IUE A; 3AU4 A; 3HK0 A; 2V3N A; 2BYE A; 2VZK B; 4MDK E; 3NVV A; 3PVL A; 1C4C A; 2BPS A; 1IGD A; 1RWS A; 4HVB A; 3ZIM A; 1TZ1 A; 5H92 C; 2CHX A; 2V4L A; 4LDT D; 4CQN A; 5J17 A; 2B3A A; 1UD7 A; 2ACZ B; 1R7S A; 1ZOY B; 3TUO A; 2PVO D; 4LK0 M; 3KUD B; 2K39 A; 1YN5 A; 4XC2 A; 2BKR B; 1P7E A; 4GDL A; 1V5O A; 1ACC A; 3P42 A; 1GJZ A; 4US8 A; 4BKT A; 4AWJ A; 3X0W A; 4K3B A; 5E6P A; 3ZKJ C; 2IJ0 A; 2KN5 A; 2KTF A; 3T8M A; 2QJL A; 3IFW B; 1BUI C; 2R61 A; 3Q3N C; 1X1M A; 4S17 A; 2IGG A; 4LLG M; 3VVW B; 4GB9 A; 1QZE A; 1FEH A; 1NI2 A; 2M56 B; 2DZM A; 4A6Q A; 1JRO A; 5L83 A; 2LGD A; 3PLV A; 1WXV A; 3LJ3 A; 3ZNI D; 3NS8 A; 3ZO5 B; 4NPN A; 3H7P B; 2NPT A; 2QDF A; 1YN4 A; 1WRI A; 4DDI D; 4XZ4 A; 1WGY A; 2WLB A; 3VRA B; 4EOY A; 3H7S A; 3I3T B; 2L0F A; 2JT4 B; 3MHS D; 3I63 C; 2FBW B; 4MGY E; 1RRB A; 4DXA B; 4AOF A; 3GE3 C; 3TSS A; 1YJI A; 2LVP A; 1MFW A; 4M0W A; 4DHJ D; 3BVG A; 2LEK A; 5BYS A; 4XWW A; 1I35 A; 1J7A A; 4KX6 B; 3OWE B; 2NVU I; 2OOB B; 5AUK A; 2D3B A; 1V1P A; 4FA6 A; 4GMV A; 1EWC A; 1OFF A; 4WQM A; 2KWC A; 1SIJ A; 3AEE B; 2WS3 B; 2LD9 A; 2WP9 B; 4KDL B; 2Y5P A; 3A4S C; 3VUW A; 5EE1 A; 3P2B A; 1QQR A; 3UI3 A; 4GLS C; 1T0S C; 3ZTC A; 3DVN U; 1EF5 A; 3GS2 A; 1SF0 A; 2NS5 A; 3WCQ A; 4PS7 A; 2LUE A; 3ECI A; 1F0Z A; 3ETR A; 3ML8 A; 4WWP A; 4AP4 C; 3P4P B; 3NVZ A; 4MH8 A; 2KMM A; 2ZJD A; 4ZRI A; 4GGQ A; 4MAC A; 3APC A; 3EHV A; 1WY8 A; 3RT3 B; 4JPS A; 3KYC D; 3A4R A; 3VH3 B; 1Y8R C; 4MM3 A; 2IO3 B; 1SJE D; 1P1A A; 4FBJ B; 3UF8 A; 4RGT A; 1WJN A; 3IXS A; 1WGD A; 1LO5 D; 3QAR A; 3VTV A; 3L4P A; 3L08 A; 2RPV A; 2BYF A; 3R2I A; 1H8C A; 3KWL A; 2D2Q A; 4KVG B; 2LMC A; 1UUP A; 1UNS A; 1P9D U; 1YJ1 A; 2OJW A; 4BBN C; 3DHG C; 2M0X A; 4W9F A; 1PFD A; 2KJR A; 4YWG G; 3TEW A; 4FUL A; 4RM9 A; 4PT5 A; 2DBY A; 2NBU A; 1L0Y B; 3DHH C; 2A5U A; 3SFD B; 2M19 A; 1SGH A; 4F1S A; 4EEW A; 2IDY A; 5LXH A; 1HZ6 A; 2N7E A; 5FR3 A; 1NBF C; 2WYQ A; 4GSW A; 3Q8C A; 3Q8F A; 2KKC A; 4HDQ A; 1QKZ A; 4HLE A; 1WWT A; 4OVZ A; 2ONQ A; 5C23 A; 4AJY B; 4DHJ B; 4D2K A; 4LTU A; 2MX2 A; 1JWB D; 3EFC A; 4IM2 A; 2J42 A; 1TKE A; 1YX5 B; 1WJ6 A; 3ZGZ A; 4A90 A; 3L16 A; 3NZS A; 4HXD A; 3KUC B; 1ZP0 B; 5L95 C; 3KLS X; 1OEY J; 1C4A A; 1I42 A; 3Q6B A; 2IBI B; 4IG7 B; 1E8Y A; 4WQO B; 3NUH B; 4ICV A; 2N1W A; 2QSD A; 3P4Q B; 2KD0 A; 2R2Q A; 1PGB A; 1F1H A; 2K6Q A; 2QC8 A; 5CX3 A; 3DWM A; 2JWZ A; 2INC C; 4LNI A; 1T0R C; 4KSL C; 4C4V A; 3AE9 B; 3MTN B; 2DLB A; 1JW9 D; 2N1V A; 2KQ4 X; 3U7Z A; 5JHA A; 1TT5 B; 1KLV A; 3RUI B; 2DNF A; 1JRU A; 2GI9 A; 3AEG B; 4ZYS A; 2PPH A; 1R4M B; 3PHX B; 2V4I B; 3PZ7 A; 3Q2A C; 2ZW1 A; 1XLQ A; 1WMH A; 2WXL A; 3MP9 A; 4M8N A; 3R7Q A; 2L05 A; 4TMA B; 4K7U A; 2KLC A; 1KFY B; 4WAA A; 4AUQ C; 5JH5 C; 2KWU B; 2MEK A; 3BYT B; 2HJ1 A; 1A70 A; 2LWP A; 4ZRQ A; 1N6Z A; 1D3Z A; 1NEK B; 4JL9 A; 4AS1 A; 1V86 A; 2JQR B; 3K9O B; 1TY0 A; 4KIK B; 2KHW B; 2UYZ B; 1ZW7 A; 4HRO A; 1WXM A; 5EE3 A; 1DGJ A; 3SDL C; 1VR9 A; 1L6V A; 1WX7 A; 1JWS D; 3AM9 A; 4MSQ B; 2J4X A; 1SE3 A; 2KDF B; 3V61 A; 4HPP A; 2KNB A; 1STE A; 4ANV A; 4GXB A; 5D6J B; 1WSP A; 2RGF A; 1WH3 A; 2QEJ C; 3BII D; 3P1M A; 1TKG A; 3NG0 A; 1B9R A; 2JY6 A; 5HKH A; 5HG2 A; 2Z59 B; 3A9K A; 2HDE A; 4E74 A; 4G11 A; 3WAO A; 2DWQ A; 4IDI A; 4FLH A; 4IM3 A; 3H9D A; 2IYD B; 3RNB C; 1CMX B; 3DBR B; 3AE3 B; 2KDB A; 5C1Z A; 1WGG A; 2WXI A; 2J52 A; 2MBH A; 3EFU A; 4S0R A; 4DK5 A; 3HM3 A; 3N1X C; 1FRD A; 2BF8 B; 2ZNV C; 1V2Y A; 2AL6 A; 4F8C B; 2KAC A; 3NRZ A; 2SAK A; 2M17 A; 4HEA 1; 1Z2M A; 2NTS A; 3PRZ A; 4USA A; 2KK8 A; 2LZ6 A; 2LHE A; 3RZW C; 2EMT A; 4UDU C; 1EF1 A; 4NAM A; 4FJY A; 2FCM A; 2K1F A; 4WWN A; 1P7F A; 3MHZ A; 1WRD B; 1AAR A; 5IO9 A; 4A3O A; 1YD8 U; 1TS4 A; 4NQL B; 1QIL A; 1FCL A; 1VZ8 A; 4ANW A; 2V3P A; 1NVI D; 3HRD D; 4RFB A; 4G50 A; 5C2T B; 1TJE A; 5DPR A; 3VAW A; 3Q8A A; 2WXG A; 2GRI A; 1GAQ B; 1I4X A; 3HIZ A; 2KQ7 A; 4HDO A; 1WI0 A; 4OVV A; 3J9C A; 1L4D B; 2W82 A; 5IAA C; 2BWE S; 3BWU D; 1T3Q A; 4ARC A; 1C77 A; 3Q3M C; 1R4N I; 3ABV B; 1T5X D; 1WYG A; 3AMZ A; 3ZJT A; 3PLU A; 4MGK E; 5D94 A; 4CO7 A; 4PS8 A; 5HI1 A; 2L8J A; 1HTO A; 3HVZ A; 2K8B A; 1C76 A; 1FFV A; 2BB5 A; 1NYQ A; 2ZZP B; 2FCN A; 1TTN A; 1C78 A; 5KHO A; 2PVG C; 2MJD A; 4XWT A; 2KJ6 A; 3H1U A; 4DBG A; 3GZN B; 2KO3 A; 4BKS D; 1SIF A; 1NYR A; 1JQ4 A; 2O6V A; 1V97 A; 3CST A; 3H7P A; 5LXI B; 2BGF A; 5AEK B; 1RAX A; 1SEB D; 2TSS A; 1MJD A; 2AQ3 B; 3QHT A; 1WX8 A; 3WIM A; 1WGH A; 2HD5 B; 4QAY A; 1N63 A; 5FKA C; 4JX1 C; 1IGC A; 3W5U B; 3TCA A; 4N6E B; 4L1B A; 3VHT C; 4W9L A; 2IPK D; 1XLP A; 5AZH A; 1WJ4 A; 3DBS A; 3VDZ A; 2SEB D; 1WZ0 A; 4OZB A; 1WX9 A; 5EE9 A; 4ITK A; 1FM0 D; 1XT9 B; 1FXT B; 2FE8 A; 3TBL D; 1ZXI A; 3KW5 B; 4RMA A; 1E8Z A; 1SJH D; 2FCQ A; 1V80 A; 2FAZ A; 3NZ3 A; 3AE2 B; 3DOW A; 4NAW B; 4ZYN A; 4RCO A; 1J8C A; 3UQA A; 1IPG A; 2YVC A; 3DBL I; 2MA9 B; 1TGZ B; 2GLS A; 3RFZ B; 4W9E A; 3AU5 A; 2W54 A; 1L4Z B; 3LXF A; 1QT9 A; 3FC4 A; 4KKJ A; 2KVR A; 4ACF A; 2ZW0 A; 3AE6 B; 3MC8 A; 3JYU A; 4ASW C; 2MBQ A; 4MJS B; 2KVZ A; 1V49 A; 2FID A; 2JZ3 B; 2MBB B; 2D3C A; 3SU8 X; 4GIV A; 3TJP A; 3ZNZ B; 2K8C A; 4BZA A; 3UGB B; 3N1Z C; 2LHD A; 1V6E A; 4EE2 A; 5AZF A; 1KLU D; 2ZVN A; 1DOY A; 1M94 A; 4FJZ A; 1UF0 A; 4LCD E; 3UIO B; 3N30 A; 2K0P A; 5G5G A; 4TUU A; 5BO4 B; 2G9H D; 3AE5 B; 2L52 A; 2L7R A; 3N20 C; 3GP7 A; 1JWU D; 4Q2J A; 1D5X C; 3RNE C; 1ZUD 2; 1YQB A; 2AX5 A; 3GOE A; 2M1M A; 4F7Z A; 3URY A; 3APD A; 4C7Z A; 1SXT A; 4HK2 A; 3QWZ B; 1YIW A; 2VH2 A; 3L10 B; 2PE6 B; 2XEW A; 4FAD A; 2B76 B; 1YNT E; 3R66 C; 3DVN V; 4X57 B; 3ZUN A; 1N60 A; 4RNA A; 1P0R A; 1FNU A; 4M8M A; 2WDR B; 4RF1 A; 2LXC A; 4DXF A; 3ZNG C; 4P1B C; 3ML9 A; 5IA7 A; 3IHP C; 3L13 A; 4KZC A; 3N32 A; 3Q3O C; 5D2M B; 2MSE D; 2WXF A; 1GOZ A; 1J7B A; 3W5V B; 4A55 A; 5HFY A; 4K7S A; 1CJE A; 3QK0 A; 2XK5 A; 1RYJ A; 2IY0 B; 1IYF A; 2QIE B; 3VXW A; 3JSV B; 3TIX A; 2REX A; 4RF0 A; 2V1Y A; 1VZ7 A; 1VRA B; 2ASQ A; 2N4F A; 3CWI A; 1FO4 A; 4JIO U; 2MJ3 A; 3FIL B; 3BZD B; 1I4R A; 3OJ3 A; 4B0M A; 2WU2 B; 1OGW A; 1PGX A; 4DDG D; 5EE0 A; 4NY0 A; 3QC8 B; 3OJ4 B; 5AUI A; 4KGR A; 1GC7 A; 2LFI A; 4ZHP A; 2L0T A; 4AQ7 A; 4W9I A; 1D5M C; 1H4R A; 2JPH A; 1WJU A; 3RUL A; 3V05 A; 2NCN A; 2K22 A; 2LVQ A; 3EC8 A; 1SE9 A; 1EUV B; 3PO0 A; 4G0N B; 1D6E C; 2KC1 A; 4KIK A; 4GDL B; 2K5P A; 4KKI A; 2KTR B; 3MJ5 A; 3R7R A; 2IY1 B; 2DAF A; 4PYU A; 4RH6 A; 1K50 A; 3N9Y C; 3PRP B; 4DXG A; 2CR5 A; 1FXA A; 4N58 A; 1G6J A; 4XGA B; 2L83 A; 2RR9 A; 2D3A A; 2QIL A; 2AYO B; 3L17 A; 2C60 A; 1EU3 A; 5DPW A; 2L3Z A; 1C9F A; 1N5W A; 1KOT A; 2DEN B; 2RMM A; 2N9K A; 3I9V 1; 5EDS A; 1EM7 A; 1HTQ A; 2XBB C; 2BTE A; 3HHM A; 3VTU A; 3RMK C; 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5HHD G; 5FK9 C; 2UU7 A; 1KJT A; 3V6E B; 1WFY A; 2AQ2 B; 2A4Z A; 4TV3 A; 1FNV A; 1WGK A; 3QIJ A; 3NHE B; 3O65 B; 2GBR A; 2MRP A; 4MGI E; 2KYW A; 3SFE B; 1FNW A; 2MJE A; 3EUB 2; 3AXC A; 1EWY C; 3U2S C; 1V8C A; 5TR5 A; 4K81 A; 4REZ A; 2JYE A; 2C9W B; 3RPF C; 4FJV B; 2CHW A; 2KAJ A; 2Y5B B; 1XD3 B; 1GB1 A; 2AEH A; 3KQ4 A; 1Y56 A; 2KJH B; 2W55 A; 1M4V A; 4IKG A; 2IO0 B; 2ZVO A; 2ZNV B; 1QOG A; 2KDE B; 2JVC A; 2RDH A; 3ZXV A; 2LRU A; 4B9K A; 3ZQ4 A; 4JE3 B; 4FXC A; 5LNK 1; 2HTH A; 3IAS 1; 3ZNH B; 4BKG A; 2KLG A; 4WWM A; 4C00 A; 2NMQ A; 2WXM A; 4HKQ A; 3P63 A; 3WAM A; 2O2V A; 3A33 B; 2V0G A; 1EO6 A; 1L7Y A; 3H8H A; 1FCC C; 4I6L B; 3A9J A; 1N5X A; 2PE9 A; 4HRS A; 2KFK B; 4WH4 A; 2KWV B; 3UQB A; 1PQS A; 2BS2 B; 2W9N A; 3BK1 A; 5DPS A; 3LDZ E; 5D3I B; 4KGT A; 4XE0 A; 1S3S G; 5I4D A; 3Q3J A; 2JXX A; 4ICU A; 4HKZ E; 1BT0 A; 3QAQ A; 4XX5 A; 4EKU A; 2GMI C; 2H88 B; 2OED A; 2DYB A; 4OZA A; 4LNK A; 4KZ0 A; 4LJP B; 2KAN A; 4GDK B; 4C4V B; 2GOW A; 5CHV C; 5J2R A; 3Q14 C; 3VH4 B; 4DHZ B; 3NVY A; 3MC9 A; 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