The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G binding protein G
|
| publication title |
Evaluation of backbone proton positions and dynamics in a small protein by liquid crystal NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
15
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OZA A; 1XF5 L; 1GB4 A; 2K0P A; 4HKZ E; 4IOI E; 5BMH A; 1FD6 A; 1D4B A; 5JXV A; 5HI1 A; 2N7J A; 1HZ5 A; 1MHX A; 3FIL A; 4KGR A; 2KQ4 X; 1KH0 A; 4GLS C; 3V3X A; 1F2R C; 1MHH E; 1MPE A; 2RMM A; 1P7F A; 2IGH A; 1JML A; 1IGC A; 2KDM A; 2ONQ A; 2KWD A; 2ZW1 A; 2GB1 A; 2PTL A; 2J52 A; 2QMT A; 1HZ6 A; 4HJG E; 4KGS A; 1QKZ A; 1K50 A; 1XCT L; 4IKG A; 2N9K A; 2N9L A; 2JSV X; 1PGX A; 1PGA A; 1IBX A; 1XCQ L; 1K53 A; 1IGD A; 3UI3 A; 1YNT E; 2J53 A; 1K51 A; 2IGG A; 1ZXH A; 1YMH E; 1C9F A; 2I2Y A; 2NMQ A; 1FCC C; 2PW9 A; 2LHD A; 4WH4 A; 3MP9 A; 2OED A; 1PGB A; 2JZP A; 4OZB A; 4KGT A; 1Q10 A; 2IGD A; 2KN4 A; 1GB1 A; 1F2R I; 2JU6 X; 4OZC A; 3FIL B; 5HFY A; 1MVK A; 2LGI A; 2ZW0 A; 2JXT A; 1HEZ E; 2RPV A; 1UWX A; 4MAC A; 2ON8 A; 1FCL A; 5HHD G; 2QSD A; 1EM7 A; 2LUM A; 4D2K A; 2GI9 A; 1MI0 A; 2EEL A; 2KAC A; 1P7E A; 5HG2 A; 3GB1 A; 2I38 A; 2LHE A; 5BMG A; 5BMI A; 2PLP A; 1IBX B; 1K52 A; 2JWU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AXC A; 2BS2 B; 3U30 A; 1BUI C; 1L7Y A; 3AE6 B; 2O6V D; 1Q0W B; 4MM3 B; 2LVO A; 2Y5C A; 2KMM A; 1VZ6 A; 1A70 A; 2ZZP B; 1KH0 A; 1JWU D; 4K3B A; 1SJH D; 2FCS A; 3V05 A; 1NI2 A; 4QAY A; 4DXG A; 2ZNV C; 1FFU A; 2ZCB A; 4WUR A; 2KZR A; 2QMT A; 5J17 A; 1V1P A; 1J8C A; 1HXY D; 4RGT A; 3L54 A; 4B0M A; 1ZE3 D; 1FXA A; 2XNA C; 3PVL A; 1H4R A; 1L0Y B; 2Y5B B; 4FJV B; 5D94 A; 3H6N A; 2C7M B; 3NVV A; 1WY8 A; 1P0R A; 2E6X A; 1LO5 D; 4MGY E; 2NVU I; 1YNT E; 4URK A; 1U4A A; 2MX2 A; 2EMS A; 2N9E B; 3LJ3 A; 1FCC C; 3R66 C; 5AUI A; 2RPQ A; 1I4P A; 3ECI A; 3R7R A; 1DYQ A; 4RFB A; 1YOV B; 3FKY A; 1UEL A; 4DXF A; 2MJE A; 5BYS A; 3Q3O C; 4II3 B; 4RCO A; 3T3N A; 4EZL A; 3L13 A; 2RPV A; 4M8M A; 1FMA D; 4ARC A; 1FRR A; 1SE4 A; 4LJO B; 1IYF A; 1EM7 A; 3AMZ A; 4E71 A; 3PLU A; 4GSW A; 5HKH A; 2MBE A; 1QOB A; 4RNA A; 3ZRC A; 2G4S A; 1FO4 A; 4W9G A; 2EEL A; 1NEN B; 1TZ1 A; 3SD5 A; 2V3P A; 1SE9 A; 1TS2 A; 3HVD A; 2DLB A; 4M0W A; 4I6P A; 4L2Y A; 1Y8R C; 2LZ6 A; 4JIO U; 1KOT A; 1C79 A; 3VDZ A; 1LFD A; 4ITK A; 4HRO A; 3L10 B; 1TKG A; 4W9K A; 4HDQ A; 1JWB D; 2NTS A; 2QEJ C; 3RZF A; 1XO3 A; 1OTR B; 3BZD B; 1YN3 A; 1CMX B; 2DYB A; 3JYU A; 2JRH A; 5E6N A; 3CWI A; 4WJQ A; 3MC0 B; 1JWA D; 3EFU A; 1GOZ A; 2Z59 B; 5AEK B; 2DYO A; 1N63 A; 2LXA A; 4WWN A; 2YEP F; 2MP2 B; 3E9S A; 3ZNH B; 2D3G A; 1NYR A; 3UI3 A; 4AOF A; 4A6Q A; 2WX0 A; 2V3S A; 3X0W A; 1D3Z A; 4CO7 A; 4HKQ A; 3IFW B; 1SE2 A; 4F1S A; 4BZA A; 4G3X B; 2A5U A; 3AV8 A; 3ZTD A; 5D2M B; 3OWE B; 2R61 A; 2BQQ A; 3ZVV A; 3B9J A; 1VLB A; 1S1Q B; 1L2N A; 3SR6 A; 3MHS D; 2MJ3 A; 2LVP A; 5CHV C; 5FR6 A; 3PO0 A; 4P1C C; 4ANU A; 2IJ0 A; 2KQ7 A; 3NG0 A; 1J7B A; 2D2Q A; 4LNN A; 3EFC A; 2W9N A; 1GJZ A; 1TYG B; 2KAC A; 3VHT C; 3TJP A; 4EUT A; 3V61 A; 3NHE B; 1T6B X; 2AQ2 B; 4K81 A; 2GBR A; 4W9I A; 4AQ7 A; 2LI5 A; 4KSL C; 2FCN A; 3U4E G; 2PEA A; 3QX1 A; 2QHO A; 2BKR B; 4H2A A; 3RNC C; 3ZO5 B; 1GB4 A; 3L08 A; 1I42 A; 2J7Q B; 3DBS A; 5E6P A; 4J6I A; 3KVF B; 1EUV B; 3S2A A; 2DYM A; 2NBV B; 4C00 A; 1PQS A; 4AUQ C; 2AEH A; 4GN1 A; 4EEW A; 2RMM A; 1JML A; 2HE7 A; 4GDL A; 2DAJ A; 4FA6 A; 5H92 C; 2DEN B; 3VTV A; 2GBJ A; 4GXB A; 3TUO A; 4HPP A; 2XK5 B; 4K7W A; 2NTT A; 1LQB A; 4HK2 A; 4CHK A; 1VDV A; 2ZVN A; 2KVR A; 2KNB A; 4LDT B; 2YEP B; 1QT9 A; 2KTR B; 3A1Q B; 4GIV A; 5D3I B; 4ZDV A; 3HRD D; 4ANX A; 3PHW B; 1EF5 A; 3BII D; 4PS7 A; 3NZ3 A; 1WF9 A; 3MJ5 A; 4NJ7 A; 2DZJ A; 3RYT A; 1SXT A; 3H7P A; 1CZP A; 3ZRF A; 2I1J A; 3RN9 C; 3RCZ A; 1RAX A; 1RRB A; 1TS4 A; 2N4F A; 3B2F A; 3NS1 A; 2K6Q A; 3QWZ B; 2J0K A; 3KLS X; 5EE3 A; 1C3T A; 1MFW A; 4NY0 A; 2ON8 A; 3KYC D; 2SEB D; 1V6E A; 1J7C A; 2Z0D B; 3Q3N C; 1R4N I; 3KUC B; 3K9O B; 2Y5P A; 2LJ5 A; 1V1P B; 2GI9 A; 3IAM 1; 2R2O A; 3VRA B; 2I38 A; 3DBR I; 2D3C A; 4I6N B; 3ZQ4 A; 1HE8 A; 1JQ4 A; 3RNG C; 3L16 A; 2L3Z A; 2DAF A; 1T0Q C; 1BML C; 2W3R A; 2CHW A; 1XLP A; 4FJZ A; 3MHZ A; 2HDE A; 2XBB C; 2WWZ A; 4JL9 A; 3PZ7 A; 1KRH A; 1JAL A; 3TSS A; 1MG8 A; 1RFK A; 2WXF A; 2PVO D; 2ICI A; 4HPM B; 1Z2M A; 2MQJ A; 4A3P A; 2M1M A; 4AJY B; 2FCM A; 4KDL B; 3NZU A; 2KQS A; 3SDL C; 4MJS A; 4KGS A; 2Z0E B; 3M95 A; 2UWQ A; 3B08 A; 4LJP B; 1SF0 A; 2L7R A; 1E6E B; 4WJN A; 4XDD A; 5LXI B; 2N9K A; 3EA6 A; 2JSV X; 1E8Z A; 1I4R A; 4RF1 A; 4KZ0 A; 2WGS A; 2LGX A; 4XWW A; 1WJ4 A; 5EDS A; 3AB5 A; 1K51 A; 1E7V A; 2EKE C; 2WQY B; 1V49 A; 2M17 A; 4M0W B; 3UIO B; 4MGK E; 5LXH A; 1LXD A; 2JQR B; 1R4M B; 3TCA A; 3KUD B; 4OZB A; 3E56 A; 2C7H A; 3VTW A; 2V4I B; 1V80 A; 1WJU A; 1MVK A; 5IO9 A; 3RT3 B; 2D10 A; 2N7E A; 2M8S A; 2GRI A; 4WJP A; 3PT2 B; 4TKN A; 2QSD A; 4FLH A; 4RM9 A; 3IAS 1; 2AX5 A; 2KX0 A; 3W5U B; 4CYE A; 4RGN A; 3Q8C A; 4TSS A; 4KX6 B; 5DPW A; 3GB1 A; 1WXS A; 3R7Q A; 1ESF A; 5BMI A; 2V1Y A; 2O2V A; 3H9D A; 3PSE B; 1K52 A; 1TZO A; 2VH1 A; 1XF5 L; 2W54 A; 1Q5W B; 5EE0 A; 2V4L A; 4EZK A; 2FIF A; 1UUP A; 2KJH B; 3B1L X; 4FN2 A; 4A3O A; 3ENE A; 2RDB C; 2ACZ B; 3BWU D; 1D5X C; 4US9 A; 2CJO A; 4IM2 A; 4KGR A; 3RUI B; 4J3O D; 3C8Y A; 4ANW A; 4DHJ D; 4W9H A; 5TSS A; 4II2 B; 1QOA A; 2L52 A; 2RSU A; 1E10 A; 4GGQ A; 3NOB A; 2CHX A; 2BWF A; 2BTE A; 1WR6 E; 4JQW C; 3DCG A; 4HJG E; 1RWS A; 4ASW C; 1YX5 B; 2CU3 A; 3PS6 A; 4M01 A; 4W9E A; 2TSS A; 4CQN A; 2GLS A; 3IG3 A; 2GBK A; 1ENF A; 2NBW B; 2BT6 A; 1L4D B; 2O6V B; 3I63 C; 2AQ3 B; 3JSV A; 3UF8 A; 2BS4 B; 4WH4 A; 1S3S G; 3DWG C; 2JWZ A; 2WXO A; 3KWV A; 2WXJ A; 2CHZ A; 4US8 A; 4XZ4 A; 3A4R A; 3L4P A; 2N1W A; 4YTM B; 2KX3 A; 2EMT A; 4GDK A; 3Q14 C; 4C80 A; 4HJK A; 1FEH A; 3AE3 B; 1XLQ A; 4OVZ A; 1T0Y A; 2JY6 A; 3PV1 A; 3O13 A; 3Q8F A; 4HPL B; 2LVQ A; 2MH7 A; 2PLP A; 3TIX A; 1VR9 A; 1T3Q A; 2PJH A; 1WZ3 A; 2KWU B; 2WXI A; 1C4C A; 4MH8 A; 1WI0 A; 1FD6 A; 3SFE B; 2ZNV B; 4RM8 A; 3H7P B; 1AW7 A; 4L1B A; 3LYY A; 1AYF A; 2L83 A; 1JW9 D; 4HWI B; 3X23 A; 2KXJ A; 2DWQ A; 3U52 E; 4ARI A; 2IZV B; 4OW0 A; 3OG5 A; 3N30 A; 2ZW1 A; 3BVZ A; 2IPK D; 3KYD D; 1ZDV A; 2JX5 A; 1NBF C; 1WM2 A; 3HIZ A; 3IVF A; 1L4Z B; 4IKG A; 3W1S C; 4EFO A; 1WXQ A; 4PK1 A; 4XDC A; 3WAN A; 2ASQ A; 2JUO A; 3AEB B; 4WIP A; 3K9P B; 3EEC A; 4BOZ B; 3UGB B; 2K8C A; 2KJ6 A; 1CQV A; 2BWE S; 3W2D A; 2JYE A; 2LFI A; 1J0G A; 4GU2 A; 5CHW A; 2MBQ A; 1V81 A; 1YN4 A; 1UBQ A; 3KW5 B; 3PLV A; 3AE7 B; 3ML8 A; 3HUI A; 4REZ A; 1HEZ E; 1SJE D; 3M62 B; 5JH5 C; 2WXR A; 1NDD A; 2BBC A; 3A4S C; 3H7S A; 1KLG D; 1JRP A; 5CHF A; 1WE7 A; 4RH6 A; 4P16 A; 1OQQ A; 2QC8 A; 4MJS B; 1STE A; 2J4X A; 3LB8 C; 5HG2 A; 5JHA A; 1GC6 A; 4P7I A; 2IDY A; 2BYT A; 1ET9 A; 2JWU A; 2HTM E; 4AWJ A; 2EKI A; 3QHT A; 2Q5W D; 2KDF B; 1TT5 B; 1V5T A; 1FPY A; 3DVN U; 2KK8 A; 4AJW A; 3TEY A; 3A9J A; 3VH3 B; 4GOC A; 2XEW A; 5JXV A; 1PFD A; 4FXC A; 3ZNI D; 1E9M A; 4IG7 B; 4A55 A; 3RFZ B; 2WDT B; 3P4P B; 1KLU D; 1CJE A; 1I4X A; 2GOW A; 2K25 A; 5IN7 A; 2KWV B; 1TBE A; 1P7F A; 2HD5 B; 1J7A A; 2PTL A; 1EWY C; 1VJK A; 1WXM A; 1GPX A; 2L0T A; 3ONS A; 1XLO A; 2E3T A; 1FNW A; 2V9H A; 4C4V A; 3AN1 A; 5D3D A; 2O2V B; 3R3M A; 3BY4 B; 1D5M C; 1E7U A; 3CSF A; 2JVC A; 1N61 A; 4LNF A; 1PDX A; 1E7P B; 1WE6 A; 2MBB B; 1KTK A; 3GOE A; 4LTU A; 4AS1 A; 2VH2 A; 4YTN B; 3URY A; 3GZN B; 3VTU A; 2NBU A; 2KLG A; 2J42 A; 3T3O A; 1E8W A; 1F2R I; 5HFY A; 4DHZ B; 3DVN V; 3Q69 A; 2BW2 A; 2BB5 A; 4A90 A; 4EKU A; 3L0W B; 1FXI A; 2KTF A; 1WSP A; 4PT5 A; 1F0Z A; 2M56 B; 3NS8 A; 2D07 B; 3P1M A; 1WJ6 A; 3GE3 C; 2GBN A; 3CIR B; 4A8X C; 3V6E B; 5BMG A; 1V86 A; 2K8B A; 2OHF A; 1ZUD 2; 1FNU A; 3BK2 A; 2N9X A; 1ZGU B; 2C5L C; 3PGE A; 4BBN F; 1WRI A; 1WZ0 A; 3JSV B; 1QF6 A; 4M02 A; 2AQ1 B; 2NCN A; 3Q6B A; 3KWL A; 1D6E C; 4WAA A; 2IO0 B; 1R4M I; 4TV3 A; 4GDK B; 2JZZ A; 1UWM A; 2WNM A; 2C7N B; 2IY0 B; 4N59 A; 4WAF A; 2K5P A; 2VZK D; 4FHJ A; 1L0X B; 1H8C A; 3IT6 B; 2YLM A; 1SBB B; 1PGX A; 3LDZ E; 1DOY A; 3ZNG C; 4MEL A; 4K7S A; 2IGG A; 2PE6 B; 1ZXH A; 2I2Y A; 2G3Q B; 2PKO A; 2MSE D; 4NZL B; 3CF6 E; 3NRZ A; 4LLG M; 1K8R B; 3AE8 B; 1Q10 A; 3AE1 B; 2UU7 A; 1EF1 A; 4JGH B; 3W1S A; 2IND C; 2GBM A; 2LGI A; 5IKC M; 4C7Y A; 3ZTC A; 3SFD B; 1LM8 B; 4MEM A; 4NPN A; 3PRM B; 4A20 A; 2MJD A; 2NPT A; 2KC2 A; 4YTP B; 2V3N A; 1WIA A; 2HTH A; 2N7D A; 3RNF C; 2LRW A; 2JF5 A; 4ZRJ A; 1P7E A; 4YSY B; 3RNE C; 1C76 A; 3RNA C; 3HHM A; 4YXD B; 1P98 A; 3RMK C; 2LMC A; 4FHK A; 1ZP0 B; 1YIW A; 1E90 A; 3WAM A; 1F77 A; 1TY0 A; 3B0A A; 2KKC A; 4ZHP A; 2WP9 B; 3BVM A; 1F52 A; 3NZS A; 2WXH A; 2K6D B; 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4P6V F; 2OJR A; 3DWM A; 3Q3M C; 4DDI D; 3DDC B; 2WYQ A; 3B2G A; 1YQB A; 3W9C B; 2FBW B; 2RGF A; 2Z8L A; 2IBI B; 2BF8 B; 2M0X A; 3APC A; 4BKG A; 3DHH C; 2RR9 A; 4KV2 A; 4M8N A; 1UGM A; 1HZ6 A; 1WMH A; 4HLE A; 4XYC A; 2INC C; 1WGR A; 3SU8 X; 5G5H A; 4FAD A; 4LCD E; 1KFY B; 2LXC A; 4BAX A; 2G1E A; 3R2I A; 1XCQ L; 3ALB A; 1KJT A; 4IDI A; 3ZIM A; 4XGA B; 4ZYS A; 1OQY A; 2ZCC A; 2JRI B; 1GB1 A; 2WHI A; 3FAH A; 5C3J B; 5IA7 A; 3APD A; 3OLM D; 2JXT A; 3BYT B; 3PRZ A; 2HJ8 A; 3QIJ A; 2KD0 A; 3T9L A; 4DBG A; 5HHD G; 3DQV A; 2KFK A; 4D2K A; 5BO4 B; 3QC8 B; 3VR8 B; 1MI0 A; 1EU4 A; 4IM3 A; 5AUK A; 4JWS C; 5DPT A; 3VFK A; 4ZRK A; 1ZDX A; 1R4N B; 2OOB B; 2PMV A; 1E5W A; 3W1Y A; 4RMA A; 3ML9 A; 1YJI A; 3TL5 A; 1TKY A; 2MRP A; 3QCA A; 1WGH A; 1HTO A; 2K0P A; 1ZW7 A; 4GDL B; 2W3S A; 4HKZ E; 4P1B C; 1T5X D; 4TMA B; 1OEY J; 5EE9 A; 1IUE A; 3FIL A; 4K7U A; 2DZM A; 2KQ4 X; 4B9K A; 1UBI A; 4FUL A; 5L83 A; 3ZXV A; 1V97 A; 4G0N B; 5KHO A; 3P42 A; 2L05 A; 2KDM A; 4X57 B; 4ZRQ A; 2NPT B; 1JCK B; 4MSQ B; 4WJO A; 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