The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| publication title |
Evaluation of backbone proton positions and dynamics in a small protein by liquid crystal NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G binding protein G
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| total genus |
15
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I38 A; 1FCC C; 2PLP A; 4OZA A; 2ONQ A; 2ZW1 A; 4IOI E; 2NMQ A; 1IGC A; 1IBX A; 1QKZ A; 4KGT A; 4WH4 A; 2N7J A; 1MI0 A; 1HZ6 A; 2QMT A; 1ZXH A; 1K50 A; 5HHD G; 2ON8 A; 3MP9 A; 1K53 A; 2JWU A; 2PTL A; 4KGR A; 3UI3 A; 2LGI A; 1F2R C; 2LHD A; 4IKG A; 2KAC A; 1XCQ L; 1FD6 A; 2KQ4 X; 2RPV A; 2GI9 A; 1YMH E; 5HG2 A; 2IGD A; 1XCT L; 2EEL A; 1P7F A; 1P7E A; 1IGD A; 2J53 A; 2RMM A; 4HKZ E; 1MPE A; 2N9L A; 2IGG A; 1C9F A; 2J52 A; 4MAC A; 3GB1 A; 2I2Y A; 1IBX B; 4KGS A; 3FIL A; 5BMG A; 1HEZ E; 1PGX A; 2K0P A; 2KDM A; 2KN4 A; 5HI1 A; 2IGH A; 2N9K A; 2JSV X; 2JU6 X; 2JZP A; 1UWX A; 5BMH A; 1D4B A; 1EM7 A; 2KWD A; 2LHE A; 2JXT A; 2ZW0 A; 5BMI A; 2GB1 A; 1PGA A; 4OZB A; 3V3X A; 1FCL A; 1MHX A; 1K51 A; 4HJG E; 1MVK A; 2PW9 A; 1MHH E; 5JXV A; 2QSD A; 1K52 A; 1KH0 A; 1YNT E; 4OZC A; 4D2K A; 5HFY A; 1GB1 A; 1XF5 L; 1GB4 A; 1HZ5 A; 1F2R I; 1Q10 A; 1PGB A; 1JML A; 2LUM A; 4GLS C; 3FIL B; 2OED A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MBQ A; 1WGG A; 4RM8 A; 4EKU A; 4WAF A; 1A70 A; 2AQ3 B; 1IBX A; 1AW7 A; 3QA8 A; 2AWT A; 2DZK A; 1UH6 A; 4DHZ E; 2DYM A; 2LEK A; 3MC9 A; 2KTR A; 1KLU D; 3SDL C; 1RRB A; 2WNM A; 1EO6 A; 5IN7 A; 3QX1 A; 5LLI A; 1JRP A; 4WJQ A; 3MP9 A; 3OJ4 B; 3N1Z C; 1V8C A; 4DHZ B; 5DPS A; 2M56 B; 2BKF A; 4P6V F; 2LHD A; 2DAJ A; 3VH3 B; 3PVL A; 2FID A; 2E6X A; 5DPR A; 3NZ3 A; 1R4M I; 2CHZ A; 1E6E B; 1WX8 A; 2J53 A; 3ALB A; 2A5U A; 4B6W A; 5E6O A; 1C9F A; 4EE2 A; 4ICU A; 2DYB A; 4O1N A; 1X1M A; 3NS1 A; 2JPH A; 2IDY A; 4KV2 A; 3VUX A; 4F1S A; 4C7Z A; 1E8W A; 3QAQ A; 1F1H A; 3NZU A; 2LXA A; 5L83 A; 3ZRF A; 5BMH A; 3KWV A; 3VTV A; 1WGY A; 1YOV B; 1P1A A; 2O2V A; 4NJ6 A; 5BYS A; 2M0X A; 2MBH A; 4HCP B; 4DK5 A; 4XDD A; 1C3T A; 1SIF A; 5LXI B; 4MM3 A; 3V62 A; 4GDK B; 4ANU A; 4QAY A; 3AE2 B; 3C19 A; 1E9M A; 4A3P A; 4AOF A; 2OHF A; 2HDE A; 3KW5 B; 3ONS A; 4II2 B; 1OGW A; 4W9J A; 5G55 A; 2DEN B; 2CU1 A; 2LVP A; 3NVW A; 3PRE A; 2ONQ A; 1T5X D; 4BKT A; 2WXR A; 2N4F A; 1JRU A; 5EE3 A; 4C80 A; 3RFZ B; 2LFI A; 2Z0D B; 3DVG X; 4B0M A; 1UNS A; 2CKH B; 5H92 C; 4EFO A; 1K50 A; 4A6Q A; 3U7D A; 2C7N B; 4NZL B; 3RYT A; 2FAZ A; 4RH6 A; 3RNC C; 3W5U B; 4GDL B; 1VZ8 A; 4AQ7 A; 4JLC A; 3ZJV A; 3B2F A; 2LGI A; 1F2R C; 5C2T B; 3DVN V; 2RPV A; 4J3O D; 3ZO5 B; 4BOS C; 4AJW A; 4F8C B; 4W9K A; 1UBQ A; 1J0G A; 2M0A A; 4TQ0 A; 1TZO A; 3R8B A; 2D3C A; 3O13 A; 2WS3 B; 2KQS A; 3R3M A; 1IGD A; 2HTH A; 3PT2 B; 2GBR A; 3VRB B; 1V9J A; 3PRZ A; 3MHZ A; 2JY6 A; 3UIP B; 4US9 A; 4TMA B; 5I4D A; 5CHV C; 2WXG A; 3IFW B; 1D5Z C; 3R2I A; 1UWM A; 1FO4 A; 2IY0 B; 2HTM E; 3TEY A; 5IAA C; 2YVC A; 2JSV X; 2KMA A; 3Q3M C; 1OQQ A; 2BW2 A; 2LHE A; 4W9L A; 2JXT A; 3L54 A; 1WYW B; 2J0K A; 1IYF A; 2VRR B; 1T6B X; 1F77 A; 1EF1 A; 4F7Z A; 1FCL A; 4MDK E; 4II3 B; 1AWD A; 1UZX B; 5J2R A; 4GGQ A; 3ABV B; 3NVV A; 5BO4 B; 4WWP A; 3L0W B; 3DDC B; 2RGF A; 2KFK B; 5AZF A; 5D3D A; 2DWQ A; 2KKC A; 2L7R A; 2QCZ A; 3WAP A; 3J9C A; 2NTT A; 3AEG B; 2KLG A; 3ZW3 A; 3PRP B; 2ZW1 A; 1QOA A; 2MBO A; 2W55 A; 3IT4 B; 1ROE A; 3ZXV A; 2NMQ A; 1SE4 A; 4URK A; 1SE3 A; 3PLU A; 1QKZ A; 4AP4 C; 3N20 C; 1NEN B; 2N7J A; 4HJK A; 2BWF A; 4W9I A; 1EUV B; 4KKI A; 3HVZ A; 2JT4 B; 1YQ3 B; 5AUI A; 1H4R A; 3WAM A; 4HRO A; 3T8M A; 3WA0 A; 3TSS A; 3ZJT A; 2V3P A; 4HVB A; 2K3U A; 1YX6 B; 4KVG B; 3AEB B; 3AE7 B; 4ANX A; 1WE6 A; 1ZP0 B; 4XWT A; 4MSQ B; 2WYQ A; 3BY4 B; 3L17 A; 2NBV B; 3P2B A; 4FN2 A; 4GDK A; 1XLO A; 2KO3 A; 4REZ A; 3DBH I; 1LM8 B; 4A8X C; 1E5W A; 2UWQ A; 4MGZ E; 1ZW7 A; 3KQ4 A; 3PTF C; 4LCD E; 3SFD B; 2GRI A; 2MBE A; 3HM3 A; 4ZRI A; 2KAJ A; 1HEZ E; 1TGZ B; 2FIF A; 3PSE B; 3DVG Y; 1WXA A; 1EM7 A; 1TT5 B; 1WXV A; 1WXS A; 1YX5 B; 4RGO S; 2G45 B; 2KYW A; 2BYE A; 3V3X A; 2RR9 A; 4LNI A; 2EMT A; 2W82 A; 2IYD B; 2RDH A; 1ESF A; 4GDL A; 1VRA B; 2RDB C; 1QZE A; 2J0J A; 2WXN A; 3Q3J A; 2BYF A; 2TSS A; 3SHQ A; 1ZXI A; 4LDT D; 2JX5 A; 2IO2 B; 1D5M C; 2MW5 A; 4M8M A; 4TQ1 A; 3ZNZ B; 5MPO A; 3HM6 X; 4XX5 A; 4LDT B; 2LUM A; 3ZKJ C; 3EC8 A; 4YSZ B; 4G50 A; 3LJ3 A; 3PS6 A; 3N32 A; 2B76 B; 3Q8A A; 3AN1 A; 2INP E; 4WH4 A; 1E7P B; 1K8R B; 4IUM B; 3Q3F A; 1N62 A; 1ZXH A; 3ZUN A; 1ZUD 2; 3PLV A; 1QLB B; 1I35 A; 1KOT A; 2JQR B; 4JL9 A; 1N63 A; 3DCG A; 2LZ6 A; 2L52 A; 4P1C C; 3EFU A; 1WGD A; 2V3N A; 4LJO B; 2KQ4 X; 3D32 A; 5CHW A; 4HPM B; 2PVG C; 1H8C A; 2J42 A; 2IGD A; 3E56 A; 3DQV A; 2KFK A; 5C23 A; 2D07 B; 3PV1 A; 2MWS B; 3BVZ A; 2KT7 A; 2KK8 A; 3KYC D; 2QIE B; 3DBL I; 1PQS A; 4NQL B; 1WXM A; 3AUL A; 4HLE A; 1TS4 A; 2L0T A; 2WP9 B; 2CJO A; 3OLM D; 1SB3 C; 2AEH A; 2JXX A; 2KN4 A; 4YTN B; 3EFC A; 4IDI A; 1DYQ A; 1XT9 B; 5TR5 A; 2ZNV C; 4K81 A; 4A55 A; 3TEZ A; 3VXW A; 3TUO A; 1WJU A; 4RMA A; 4OZB A; 1GG3 A; 2KX3 A; 2N0S B; 3RNG C; 2LJI A; 4W9G A; 3H9D A; 2KC2 A; 2K8C A; 3VRA B; 3GZN B; 2L76 A; 4IG7 B; 1SF0 A; 1FXI A; 4GU2 A; 4IM0 A; 1PGB A; 1TY0 A; 4GLS C; 2I38 A; 4OVU A; 3ZIM A; 2XBB C; 4YWG G; 3AE5 B; 2C9W B; 1HXY D; 1XO3 A; 2MH7 A; 1IGC A; 1WR6 E; 4EEW A; 2PE9 A; 2SAK A; 2JRH A; 2LGD A; 2KWU B; 2REX A; 3IHP C; 4ZOH C; 1KLV A; 3X0W A; 2LRW A; 3IVF A; 3NS8 A; 1UEL A; 2DBY A; 1VJK A; 2KJH B; 3P1M A; 3DBR B; 1XCQ L; 4MH8 A; 3P4P B; 4M0W B; 1FMA D; 3Q14 C; 4ZYN A; 2DZI A; 4CHK A; 1D5X C; 4JX1 C; 4J6I A; 4CYE A; 3BIN A; 1IUE A; 4P7I A; 2EEL A; 3CWI A; 1TKY A; 3FC4 A; 2IBI B; 1Q0W B; 3ZJU A; 4EZL A; 2EKI A; 4RGN A; 3OWE B; 2KJ6 A; 1L2N A; 4PYU A; 1L7Y A; 1SJH D; 3ZRC A; 4C4V B; 1UUP A; 2WQY B; 1YN3 A; 4K7U A; 1G6J A; 1FRD A; 3IBE A; 2DHZ A; 1AAR A; 4NPN A; 2LGY A; 1NYR A; 4RGT A; 1KLG D; 3BK2 A; 4DDI D; 2NR2 A; 2BF8 B; 3AED B; 2MHJ A; 2KOX A; 2M17 A; 4KSK C; 2PKO A; 4BBN C; 5FK9 C; 2QHO A; 1TIF A; 2MJE A; 1GPX A; 4CQN A; 1XEE A; 5IA7 A; 5G5H A; 3W9C B; 2KLC A; 2OED A; 4NAW B; 2BQQ A; 1HQR D; 3BK1 A; 3KVF B; 5GXG B; 1JWM D; 3NUH B; 4JWS C; 3Q8B A; 3A9J B; 2HJ1 A; 1B1Z A; 2GBM A; 3L4P A; 1TTN A; 1SE9 A; 3AE8 B; 1GNU A; 3GE8 C; 3VR8 B; 1WRI A; 3BII D; 4H2A A; 3DVN U; 2AX5 A; 2FE8 A; 4W9F A; 1C79 A; 2GBK A; 4FUL A; 1L6U A; 1L0Y B; 1TY2 A; 1BXT A; 3AXC A; 3HK0 A; 3Q6B A; 1WZ3 A; 2R2Q A; 4LJP B; 4UDU C; 2XK5 B; 1NYQ A; 2L3Z A; 2WXP A; 2ACZ B; 5C1Z A; 2C60 A; 4LNN A; 3AB5 A; 2N9L A; 3Q8E A; 4YSY B; 4MAC A; 4DXA B; 2BGF A; 4A9A A; 2KN5 A; 2DZJ A; 3V6C B; 2NBU A; 1OTR B; 4WJP A; 3P63 A; 2Y5B B; 2KC1 A; 5DPW A; 3UQA A; 3Q2A C; 2I1K A; 2QIL A; 2MSE D; 2WDQ B; 1FNU A; 4PK1 A; 2V9H A; 3RNF C; 1C4A A; 4KIK B; 3TIX A; 4BZA A; 4ARI A; 1VZ7 A; 1I4H A; 5G2N A; 5C3J B; 4WQM A; 1MVK A; 2PW9 A; 1XLP A; 1SSN A; 1ZE3 D; 2A4Z A; 4JE3 B; 3M3J A; 4YL8 A; 2K6Q A; 1QQR A; 2KMM A; 4M0W A; 2QC8 A; 1WSP A; 2DLB A; 3U30 A; 3N1Y C; 2QDF A; 3RUL A; 2JF5 A; 4XDC A; 1TS2 A; 4GN1 A; 2N7D A; 3TJP A; 3JSV B; 5FR3 A; 5D3I B; 1MG4 A; 1NBF C; 4IWP A; 4ZHO A; 4KSL C; 5FR6 A; 2V1Y A; 1GJZ A; 2M19 A; 3RZF A; 3P4R B; 4BAX A; 5D94 A; 4W9D A; 3P4S B; 1XLQ A; 3VTU A; 2YEP F; 4C4V A; 4DWF A; 4XWW A; 3KUZ A; 4E74 A; 2K1F A; 1E0Z A; 2ON8 A; 2JWU A; 2PTL A; 3WCQ A; 2I1J A; 5IKC M; 3DHG C; 4L2Y A; 5LXH A; 4NY0 A; 1JWS D; 4IKG A; 3CMM B; 1YQ4 B; 1FD6 A; 1SEB D; 1QOF A; 1TZ1 A; 3URY A; 4KX6 B; 3VDZ A; 1WE7 A; 4FJV B; 4MJS B; 3WAN A; 2JZZ A; 3SU8 X; 4C00 A; 2KAN A; 2BBC A; 4BOZ B; 4N58 A; 1STE A; 3TBL D; 2PJH A; 4G3X B; 4KGS A; 4MT5 A; 4B0E A; 2L8J A; 2GBN A; 4NAW A; 2PEA A; 5FKA C; 4GSW A; 3AU5 A; 1J8C A; 3A9J A; 2JZP A; 1YN4 A; 2K5P A; 1D4B A; 2D5G A; 4KKJ A; 3L10 B; 2KVR A; 4FXC A; 4ZDV A; 2C7H A; 4R3D A; 2BS2 B; 2PIA A; 1WM2 A; 1M4V A; 3Q8C A; 4US8 A; 4RGM A; 4YTM B; 2NTS A; 4GXB A; 1RFA A; 2G1E A; 4ZYS A; 3TEW A; 2K6D B; 2Z0E B; 1F2R I; 4JGH B; 4ACF A; 1JWU D; 2XK5 A; 3PPA A; 2KQ7 A; 2NS5 A; 4BFR A; 4W9E A; 3BVG A; 4G0N B; 3KH0 A; 2W3R A; 2BT6 A; 1WX9 A; 4HPP A; 5EE1 A; 2FCM A; 3SD5 A; 3AH7 A; 1RFK A; 1LO5 D; 3MJ5 A; 2KDE B; 3W2D A; 3AE6 B; 3AMZ A; 1RYJ A; 3Q8F A; 1EU3 A; 3ZNH B; 4KIK A; 4PS8 A; 4WJO A; 2MCN B; 4ZRK A; 3UI3 A; 1TS3 A; 3Q3O C; 2KHW B; 2L05 A; 4B9K A; 2EMS A; 2M1M A; 2M8S A; 4HEA 1; 2L0F A; 1P7F A; 2WDR B; 2G9H D; 2Y3A A; 3HHM A; 1Z5S B; 2MRP A; 1J7A A; 4P1B C; 2CU3 A; 1E90 A; 5JHB A; 1CQV A; 3JSV A; 4GB9 A; 4HWI B; 1JQ4 A; 4LK0 M; 3PZ8 A; 2K0P A; 4IW0 A; 1SE2 A; 3CF6 E; 3JYU A; 5HI1 A; 3QC8 B; 3B08 A; 2FBW B; 4IM2 A; 4MGK E; 2BKR B; 3VVW B; 4XYC A; 1C4C A; 2WXI A; 1GUA B; 1P9D U; 3AV8 A; 1KH0 A; 2BB6 A; 1A5R A; 1JRO A; 1WMH B; 3NY5 A; 3PHW B; 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2N9P C; 3H8H A; 4ITK A; 3Q3N C; 1FCC C; 2LI5 A; 4AUQ C; 2IPK D; 4AWJ A; 3APD A; 2AQ2 B; 3N30 A; 1RAX A; 4L1B A; 4M01 A; 4BKS D; 1WGR A; 2INC C; 3HIZ A; 1V5O A; 3ETR A; 1WF9 A; 2FUH B; 4DXG A; 3AE1 B; 1PDX A; 1FNV A; 3B1L X; 2WX0 A; 4YSX B; 1I42 A; 2WLB A; 1EWY C; 2IND C; 1VZ6 A; 1ZOY B; 2KWV B; 3KUC B; 5JH5 C; 2BVC A; 3UQB A; 4MH0 E; 4B95 A; 2K25 A; 4BVU C; 3EUB 2; 1J7C A; 2HE7 A; 1WMH A; 2VH1 A; 1T0Q C; 3RCZ A; 4ZRQ A; 1SBB B; 2LAS A; 3AI5 A; 1MPE A; 2D3G A; 2J52 A; 2EKE C; 4FA6 A; 2XNA C; 4P16 A; 4CO7 A; 1YD8 U; 2MP2 A; 4L23 A; 5DPT A; 2LJ5 A; 2L32 A; 2IGH A; 3HVD A; 3PGE A; 4WIP A; 2KWD A; 2MX2 A; 5BMI A; 2IO1 B; 1R4M B; 2KMC A; 2AQ1 B; 1PGA A; 1V49 A; 4HXD A; 2IO0 B; 2NVU I; 3ENE A; 4FBJ B; 1WGK A; 3ZDT A; 4YXD B; 4IC7 B; 2JUO A; 3BZD B; 2K22 A; 1KFY B; 5J17 A; 1XLN A; 3AEC B; 2R2O A; 3LXF A; 3FAH A; 1E10 A; 4S0R A; 2CJN A; 4IWO A; 2C7M B; 2WXH A; 3RI7 C; 3R7R A; 4DHJ B; 1V5T A; 2WXK A; 4JIO U; 4N6E B; 3P42 A; 1OEY J; 3M62 B; 4ICV A; 3RNB C; 2RD0 A; 3GP7 A; 4X57 B; 4WWO A; 3R2T A; 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