The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
NTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLQEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
Nuclear magnetic resonance and molecular dynamics studies on the interactions of the Ras-binding domain of Raf-1 with wild-type and mutant Ras proteins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
RAF PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE
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| total genus |
14
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 1998-03-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02196 | RBD | Raf-like Ras-binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J7Q B; 3L16 A; 5E6N A; 3ZVV A; 2ZNV C; 1Z5S B; 3SD5 A; 4CO7 A; 2LI5 A; 2N4F A; 3PV1 A; 4M8N A; 3VAW A; 4E3C A; 2KQS A; 3VUX A; 2XK5 B; 4HCP B; 1WFY A; 3A9K A; 5TR5 A; 5L83 A; 1WXV A; 1NBF C; 2MBE A; 3UGB B; 1KLV A; 4RMA A; 4PS7 A; 4IWQ A; 2PPH A; 2XBB C; 1RFA A; 1XQQ A; 2KDI A; 4AJW A; 2M0X A; 3B08 A; 2FID A; 4B6W A; 1Q1O A; 4EZK A; 5JHA A; 2I1J A; 4E74 A; 3KUC B; 2LRU A; 2ZCB A; 1OGW A; 1CMX B; 2PE9 A; 2K39 A; 3ML9 A; 3R3M A; 3S2A A; 2L05 A; 4K7U A; 3WAL A; 3T8M A; 5JZE B; 4OVU A; 2AYO B; 4PS3 A; 4II2 B; 5G55 A; 3A4S C; 2MX2 A; 4G50 A; 3A9J A; 2LGD A; 2IO3 B; 4XZ4 A; 2DAJ A; 3U7D A; 4ANW A; 2AL3 A; 2LUE A; 4AOF A; 2EMS A; 2KDE B; 2CHZ A; 1E7V A; 5JHB A; 4GB9 A; 3MHS D; 1ISN A; 4NJ7 A; 4PYZ A; 4ZRK A; 2IO2 B; 5LLI A; 4DK5 A; 2GBK A; 3QX1 A; 3PT2 B; 5DPT A; 1WYW B; 3A1Q A; 1EO6 A; 3A9J B; 3JSV B; 1UH6 A; 3BIN A; 4HXD A; 1Z2M A; 2BWE S; 4BKT A; 2PJH A; 5LXI B; 4X57 B; 3SDL C; 5E6O A; 1BT0 A; 4GN1 A; 2LRW A; 2C7H A; 4FA6 A; 5D2M B; 2KDB A; 3M3J A; 4GIV A; 5J18 A; 4N9F 4; 3VFK A; 2I1K A; 2G4D B; 3A1Q B; 3OJ4 B; 5KHO A; 1AAR A; 3OAW A; 2HJ8 A; 2B3A A; 1C1Y B; 2OOB B; 3H7S A; 3W1Y A; 2KMC A; 1OQY A; 3X0W A; 3ZLZ A; 1UEL A; 4GOC A; 5J17 A; 2LZ6 A; 3U30 A; 4MH0 E; 4MSQ B; 2GBM A; 2K25 A; 4ZDV A; 3B1L X; 4ZYN A; 4M8M A; 4ASW C; 3U8Z A; 3VHT C; 1UBQ A; 2NCN A; 4E71 A; 1WGR A; 2RGF A; 2YVC A; 3R7Q A; 2FUH B; 3T9L A; 4W9I A; 2CU1 A; 4FN2 A; 1WRD B; 2K6D B; 3DPD A; 2LVQ A; 4NQK E; 4WJP A; 3GZN I; 1V9J A; 2MBO A; 2V3S A; 1IYF A; 3AXC A; 1MG8 A; 1A5R A; 3L08 A; 2CR5 A; 5JH5 C; 2PE6 B; 2M1M A; 1WGG A; 2JRH A; 2LWP A; 2RR9 A; 2Z0E B; 1RRB A; 4GDK A; 5LXH A; 3R7R A; 1GNU A; 2MW5 A; 1WJ4 A; 3H7P A; 2ZPY A; 4KDL B; 3UF8 A; 1V49 A; 4BBN C; 4EFO A; 4HWI B; 1K8R B; 4AWJ A; 2KX3 A; 4HPL B; 3APC A; 3IVF A; 2DYM A; 2KKC A; 4WWO A; 2IY1 B; 3ZDM C; 4HDO A; 2KTF A; 5D6J B; 3PLU A; 4BFR A; 4GDK B; 3L17 A; 5AZH A; 4IW0 A; 5IA7 A; 4MSM B; 3HK0 A; 4W9J A; 5C23 A; 3QCA A; 3H7P B; 4K1R B; 2N9X A; 1YIW A; 1KM7 A; 2MP2 B; 2L7R A; 4W9H A; 3UQB A; 3VH4 B; 3DVN U; 2K8H A; 2IO0 B; 1PQS A; 3DCG A; 4AP4 C; 3QAQ A; 2N9E B; 2R2O A; 2D07 B; 3NY5 A; 4FJZ A; 1U4A A; 3VUY A; 2KMA A; 3ZRF A; 2D11 A; 3CF6 E; 3CSF A; 4NNJ B; 4HVB A; 1H8C A; 3I3T B; 4ICU A; 1WXM A; 4KZC A; 1KJT A; 2K1F A; 4LJO B; 3V60 A; 2NBV B; 2ZVO A; 3WAP A; 3RD2 A; 5HKH A; 2MSE D; 1WM3 A; 2ZNV B; 2L00 B; 3QIJ A; 1WMH A; 2G3Q B; 4W9E A; 4NAW A; 2V4L A; 2RSU A; 4KDI C; 4K81 A; 1NDD A; 3IFW B; 2PEA A; 2GBR A; 3QWZ B; 2M17 A; 3VQI A; 4WJN A; 3TIX A; 4K7S A; 1WGD A; 2MQJ A; 3C0R B; 3PHX B; 3M63 B; 1WMH B; 3VVW B; 4NAW B; 4LDT B; 1X1M A; 3N32 A; 3RZF A; 2KWC A; 1WY8 A; 5DPR A; 3DQV A; 3KUZ A; 4BVU C; 2FCN A; 2L0F A; 2JF5 A; 3AU5 A; 2V1Y A; 1WR1 A; 5BO4 B; 1J8C A; 1V5O A; 2C7M B; 3ENE A; 2HE7 A; 3HIZ A; 5G2N A; 4HPM B; 2AL6 A; 2A5U A; 4AUQ C; 1EUV B; 4ANU A; 3L13 A; 4DDG D; 4BKS A; 3D32 A; 3L54 A; 4KIK A; 2L0T A; 2LVP A; 3WAN A; 5D7G A; 3RUL A; 4F8C B; 1M94 A; 3ZDT A; 3TBL D; 1Q5W B; 1UGM A; 2JZZ A; 3A9K B; 4I6P A; 1WF9 A; 3ECI A; 4EKU A; 2BKR B; 3WAM A; 2C60 A; 3ZIM A; 1KOT A; 1UZX B; 2BF8 B; 2DEN B; 1SGH A; 2NBW B; 2MLB A; 4KIK B; 4WJQ A; 4FJV B; 3LDZ E; 5DPW A; 1UD7 A; 3MTN B; 2G4S A; 2KTR A; 2M4N A; 2NPT A; 2J0M A; 1NI2 A; 4LDT D; 3N3K B; 4KSK C; 4NJ6 A; 3WA0 A; 2EMT A; 4IG7 B; 2KXJ A; 3KUD B; 4WWN A; 1WXS A; 2J0K A; 5EDS A; 1QZE A; 1V2Y A; 3M62 B; 1WH3 A; 1E7U A; 2MWS B; 3PZD A; 4BOZ B; 1LQB A; 2NPT B; 4G3X B; 1LM8 B; 2IZV B; 3DBR I; 4HLE A; 1GUA B; 3CST A; 5C1Z A; 3QK0 A; 4FHK A; 4TUU A; 4W9C A; 2KFK A; 4YL8 A; 2QHO A; 4FUL A; 4P7I A; 4II3 B; 2BGF A; 2BWF A; 2KK8 A; 1G6J A; 3DBS A; 2LVO A; 3APD A; 4KV2 A; 1UBI A; 3PS6 A; 3ZNG C; 2FNJ B; 4ANX A; 3OJ3 A; 4BKS D; 3WIM A; 2MBH A; 4EZJ A; 3P2B A; 4DXA B; 4EOY A; 2KFK B; 1WI0 A; 4DBG A; 3H9D A; 2GBN A; 3PRM B; 2BPS A; 2UYZ B; 2ZJD A; 3QC8 B; 2C5L C; 4F1S A; 2UWQ A; 1E8Y A; 2KJR A; 3HHM A; 4EUT A; 2RPQ A; 2JY6 A; 2ZVN A; 1OTR B; 4M0W B; 3UQA A; 4BKG A; 3JVZ X; 3NOB A; 3A33 B; 3PTF C; 1P1A A; 3W1S C; 2KOX A; 4W9G A; 4HCN B; 2KJH B; 2R2Q A; 2DZI A; 2O6V A; 2ZEQ A; 2WDT B; 5E6P A; 3L0W B; 3RZW C; 1SE9 A; 2ZZP B; 1WE6 A; 1C3T A; 2REX A; 3DVG Y; 2KZR A; 4FLH A; 3PVL A; 1RAX A; 2JT4 B; 3KYC D; 3RT3 B; 1WJU A; 3PRP B; 3LJ3 A; 2KDF B; 3H1U A; 5GMV A; 2O6V B; 2OJR A; 5CHF A; 3VDZ A; 3VXW A; 3EEC A; 1WE7 A; 2HTH A; 2KX0 A; 2DZJ A; 4B95 A; 5DCN A; 4DWF A; 5L95 C; 3AUL A; 5IAA C; 4AJY B; 1WZ3 A; 1V5T A; 2NVU I; 3DVN V; 1P98 A; 2N1V A; 3ZTD A; 1V6E A; 5J2R A; 3KW5 B; 1TZ1 A; 3DBH I; 3AU4 A; 4IM2 A; 2CS4 A; 2KN5 A; 1WJN A; 2GBJ A; 3IHP C; 2LXA A; 5D94 A; 3WAO A; 4KSL C; 4DHZ E; 4MEL A; 3X23 A; 4IWO A; 2DYB A; 3NZS A; 3Q3J A; 2MA9 B; 2LXC A; 4DHZ B; 2D3G A; 4IM0 A; 3KH0 A; 3QAR A; 3BY4 B; 2A4Z A; 4W9K A; 4TKN A; 3PLV A; 2MRP A; 1XT9 B; 2O6V D; 1YX6 B; 3Q3F A; 1WJ6 A; 2M8S A; 1Q0W B; 1S1Q B; 4F7Z A; 3PGE A; 1R4N I; 2WX0 A; 4KZ0 A; 4FAD A; 3SHQ A; 3NS8 A; 1SIF A; 3JYU A; 2CHX A; 4A20 A; 1ZKH A; 2NBU A; 3N30 A; 2JVC A; 2LGX A; 2AWT A; 2K8B A; 2G45 B; 2KC2 A; 3MJW A; 4MEM A; 4MGY E; 2FCS A; 2MCN B; 3GOE A; 2GMI C; 2RD0 A; 4W9F A; 2JWZ A; 2FCQ A; 2D10 A; 3HM6 X; 3VTV A; 4HDQ A; 1L2N A; 1TBE A; 1WM2 A; 5CTR C; 2EKE C; 2J0J A; 1TGZ B; 2BKF A; 3VTW A; 3DOW A; 4ANV A; 4WQO B; 4GU2 A; 3ZRC A; 2JRI B; 2LD9 A; 1IP9 A; 2WWZ A; 4HJK A; 3PRZ A; 2LGY A; 4WWP A; 5DPS A; 1I35 A; 1P9D U; 3DVG X; 3UIO B; 1OEY J; 2DHZ A; 3UIP B; 5CHV C; 2IYD B; 3ZUN A; 2WX1 A; 1Y8R C; 2L76 A; 4DDI D; 2KC1 A; 3ZNZ B; 3QJZ A; 4JIO U; 1WX8 A; 1P0R A; 4G11 A; 2AEH A; 2KO3 A; 4J6I A; 4BOS C; 2CKH B; 3QQ8 B; 1F9J A; 4GDL A; 2NS5 A; 1H4R A; 4CYE A; 1ZW7 A; 2KTR B; 1WIA A; 4EEW A; 4PYU A; 2MBB B; 1S3S G; 3ZW3 A; 1WGY A; 2L3Z A; 1YQB A; 1V80 A; 3A4R A; 4GDL B; 4MM3 A; 4XC2 A; 3RYT A; 3V61 A; 3EHV A; 3PSE B; 3RUI B; 2DZK A; 2DAF A; 2N7D A; 3DBL I; 5CHW A; 2N7E A; 3ZO5 B; 3TL5 A; 3W1S A; 3JSV A; 2JXX A; 3H6N A; 3EC8 A; 3KVF B; 2DZM A; 4MJS A; 1WX9 A; 2K6Q A; 4ZRI A; 4KVG B; 3V62 A; 4JLC A; 3ONS A; 4EZL A; 2N9P C; 2FIF A; 1E90 A; 4IC7 B; 1LXD A; 4TQ0 A; 2KVR A; 2C9W B; 3OLM D; 4JGH B; 2LAS A; 2O2V A; 3TMP B; 1EF5 A; 3APF A; 2Y5B B; 1E8X A; 2DYO A; 1R4M I; 4DHJ B; 2IO1 B; 4MJS B; 2D2Q A; 3QA8 A; 4MGK E; 4ICV A; 3R66 C; 4FBJ B; 4IM3 A; 2FAZ A; 3VTU A; 1JRU A; 3L10 B; 3EFU A; 4WAA A; 2IBI B; 2O2V B; 2WYQ A; 4G0N B; 4W9L A; 2JPH A; 3ZTC A; 4JL9 A; 4FHJ A; 2MBQ A; 1GJZ A; 4MGI E; 5CX3 A; 1T0Y A; 4WJO A; 1L7Y A; 1YD8 U; 1I42 A; 1J0G A; 1E8W A; 2Z0D B; 1P3Q U; 1VCB A; 4IWP A; 1TTN A; 3DDC B; 5FR6 A; 3UIN B; 3ALB A; 2ZCC A; 4IUM B; 2BYE A; 4GGQ A; 2N1W A; 4HK2 A; 2NR2 A; 3IG3 A; 4CHK A; 4NY0 A; 2KNB A; 3JW0 X; 4DHJ D; 1RLF A; 2CHW A; 2GOW A; 2IY0 B; 4I6L B; 2JZ3 B; 3PPA A; 1E8Z A; 2KD0 A; 1GC6 A; 4NQL B; 2KAN A; 5AEK B; 3NZU A; 2KJ6 A; 4GSW A; 4LJP B; 2C7N B; 1WGH A; 3QHT A; 2KHW B; 3K9P B; 4MDK E; 1J19 A; 1HE8 A; 1GG3 A; 2KLC A; 2MP2 A; 4K7W A; 3ZNI D; 3TJP A; 2ASQ A; 3B0A A; 2Z59 B; 4GMV A; 4LCD E; 2HD5 B; 4PS8 A; 1GC7 A; 1ZGU B; 2XEW A; 5AZG A; 1D3Z A; 4OVV A; 4NPN A; 4TQ1 A; 2DX5 B; 2K8C A; 3SU8 X; 3ZNH B; 3AI5 A; 1VD2 A; 1IPG A; 1WX7 A; 2LJ5 A; 2KFJ A; 3HM3 A; 3PHW B; 4FJY A; 3VH3 B; 1YJ1 A; 3M95 A; 2BYF A; 1V81 A; 2FCM A; 4B9K A; 1WZ0 A; 1EF1 A; 2BYV E; 3KYD D; 4TV3 A; 4XX5 A; 1YX5 B; 3TCA A; 3V6E B; 1FXT B; 1LFD A; 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4ZYN A; 3T3O A; 4M8M A; 3U8Z A; 2PKO A; 2NCN A; 1WGR A; 3C19 A; 2BB6 A; 3T9L A; 4FN2 A; 2BS4 B; 3Q8E A; 3Q14 C; 1QOF A; 2LVQ A; 3DPD A; 4NQK E; 2V3S A; 2CR5 A; 2PE6 B; 2QSD A; 2Z0E B; 1EM7 A; 1GNU A; 2MW5 A; 3KWL A; 2ZPY A; 3UF8 A; 1V49 A; 4HWI B; 3ZDM C; 5D6J B; 3P63 A; 3KWV A; 5AZH A; 5C23 A; 3U4E G; 1YIW A; 2TSS A; 3TUO A; 3DVN U; 3R8B A; 3RNG C; 2IO0 B; 4AP4 C; 1JRO A; 4FJZ A; 5TSS A; 4P6V F; 4WWM A; 2FBW B; 2JYT A; 2KMA A; 2LFI A; 2D11 A; 4HVB A; 1MJD A; 4L23 A; 1H8C A; 4ICU A; 1WXM A; 4KZC A; 3SEB A; 3V60 A; 2ZVO A; 3RD2 A; 3BK2 A; 2BTE A; 1PGX A; 3LXF A; 2L83 A; 3L4P A; 2VH2 A; 4DQO C; 4K81 A; 1PGA A; 1VR9 A; 1NDD A; 3U7Z A; 1C4P A; 3GE8 C; 1WGD A; 1WGK A; 3PHX B; 3M63 B; 1WMH B; 3R2T A; 4NAW B; 3P42 A; 1XCQ L; 3AE6 B; 2J53 A; 2C7M B; 2IGG A; 3BK1 A; 4HPM B; 4RF1 A; 2AX5 A; 4ANU A; 4DDG D; 2RDG A; 5HHD G; 3H8H A; 5D7G A; 4US8 A; 1M94 A; 3ZDT A; 2VZK D; 2QMT A; 1Q5W B; 1WF9 A; 3B2G A; 3ECI A; 4EKU A; 3ZIM A; 4S17 A; 2BF8 B; 2DEN B; 1I4X A; 2G4S A; 1NI2 A; 4IG7 B; 2KXJ A; 4WWN A; 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