The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
PHMSSTCTKVLYFTDRSLTPFMVNIPKRLEEVTLKDFKAAIDREGNHRYHFKAMDPEFGTVKEEIFHDDDAIPGWEGKIVAWVEED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Molecular basis of WNT Activation via the DIX-domain protein CCD1
rcsb |
| molecule keywords |
Dixin
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| total genus |
17
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00778 | DIX | DIX domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D5G A; 4WIP A; 1WSP A; 3PZ7 A; 3PZ8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OLM D; 1SIJ A; 1WM3 A; 3P4P B; 2CHW A; 4IG7 B; 2M1M A; 4ARC A; 2H88 B; 3HK0 A; 2BWF A; 2JT4 B; 1NYQ A; 2EMT A; 2PE6 B; 4LNN A; 2CHZ A; 3V05 A; 1FXT B; 3QA8 A; 2WXI A; 4FBJ B; 2KX0 A; 3A9K A; 3TSS A; 1FEH A; 4RF1 A; 2D3C A; 4IWQ A; 2GRI A; 2KAJ A; 1RWS A; 2X38 A; 4FUL A; 4LTU A; 4EEW A; 4B9K A; 5BYQ A; 2KO3 A; 4PS3 A; 4BAX A; 3IG3 A; 4C7Z A; 3AN1 A; 1OQQ A; 2MWS B; 2QSD A; 2LHE A; 2CS4 A; 5D3I B; 2ZPN A; 5C1Z A; 4JL9 A; 4KZC A; 5J2R A; 4YSY B; 3PLV A; 2KDB A; 4RH6 A; 2BS4 B; 1FXI A; 1Q1O A; 3NVV A; 1XCQ L; 2R2O A; 4DHZ E; 2C7N B; 5IP4 D; 1V81 A; 1VCB A; 4WWN A; 1WXM A; 3V60 A; 5E6O A; 5TR5 A; 3JSV A; 1WM2 A; 3A33 B; 4GXB A; 2KVR A; 3BK2 A; 2LD9 A; 2O6V A; 4RGM A; 2I1J A; 3DBL I; 4GDL A; 4MEL A; 4LNF A; 4W9I A; 3CWI A; 1R7S A; 3ZO5 B; 2IYD B; 2KFK B; 3DQV A; 3OJ4 B; 5LXH A; 2LGX A; 4W9L A; 2JPH A; 2OOB B; 4TV3 A; 1XEE A; 1EWY C; 3P42 A; 4WWP A; 3NOB A; 3E9S A; 4DK5 A; 4DQO C; 4FJV B; 3AEF B; 3U4E G; 4L23 A; 1I4P A; 4M8N A; 2L32 A; 3TMP B; 3I5J C; 2WWZ A; 3DBR I; 1T3Q A; 4G11 A; 3DBH I; 2C7H A; 4XWT A; 2WGS A; 2IGG A; 1WGR A; 2K8C A; 4TMA B; 2L00 B; 1ET9 A; 1E7U A; 1C77 A; 1QKZ A; 1IYF A; 1WIA A; 3KLS X; 1LM8 B; 1NBF C; 4B0E A; 4ZRQ A; 2NS5 A; 3ENE A; 4JIO U; 1MPE A; 2NR2 A; 1Q0W B; 3DWM A; 4EZL A; 3V6C B; 3IAM 1; 2OHF A; 2JRH A; 4DHZ B; 4HEA 1; 3C8Y A; 2LZ6 A; 4A9A A; 5IKC M; 1R4M I; 2KHW B; 5BYS A; 1YQ4 B; 3AE2 B; 1KLV A; 2HE7 A; 1F52 A; 1QZE A; 2G45 B; 5EE9 A; 2M56 B; 2KTF A; 3O65 B; 4OVZ A; 4KDL B; 2K39 A; 5AZG A; 1P7E A; 2QMT A; 3KH0 A; 3ZYY X; 2ZW1 A; 4FXC A; 1WY8 A; 3RUL A; 4A3P A; 3TJP A; 1N5W A; 3ZNZ B; 4NNJ B; 4E74 A; 3NVY A; 3EFC A; 1DOY A; 1PGA A; 4DHJ B; 3DBL B; 4TKN A; 3GE8 C; 4Q2J A; 1MVK A; 4ANW A; 3Q8A A; 2B3A A; 1TS2 A; 2JYT A; 4S0R A; 5FKA C; 2GLS A; 4DBG A; 5JXV A; 2LGD A; 2WU2 B; 1JWS D; 1XXG A; 2FCQ A; 1TZ1 A; 2GB1 A; 2ZPY A; 1UEL A; 2PVG C; 1SSN A; 2DWQ A; 1XT9 B; 1AWD A; 2LUE A; 1YJJ A; 3P4Q B; 2RDG A; 1UF0 A; 1VZ7 A; 4BKS D; 1H8C A; 1ZXI A; 1DYQ A; 3V62 A; 3ZXV A; 2VZK B; 2KAN A; 2DYM A; 3DBH B; 3EA6 A; 2BF8 B; 1FCL A; 2K25 A; 3SEB A; 2MBH A; 3P4R B; 2J0J A; 4B95 A; 4W9G A; 2GBR A; 3SFD B; 2PPH A; 4G0N B; 5IOI A; 1L0V B; 2MJE A; 4HJK A; 3V61 A; 2L7R A; 2GBJ A; 4OHJ A; 1IP9 A; 1N5X A; 4OVV A; 4BBN C; 1WZ3 A; 2DZM A; 2IO2 B; 3HUI A; 1RFA A; 2MA9 B; 1NEN B; 1FFV A; 2LVP A; 1GB1 A; 3ML9 A; 2IND C; 2D11 A; 2BKR B; 2D3B A; 1WXS A; 2BS2 B; 2BTE A; 4M0W A; 1NEK B; 2RDB C; 2MSE D; 4C4V B; 1V97 A; 4P7I A; 1JRU A; 2KOX A; 2W82 A; 5CHW A; 1NVI D; 2NCN A; 3NZU A; 2WXP A; 2RPQ A; 3CIR B; 2IO1 B; 5E6J A; 2Y3A A; 1T0Q C; 2KD0 A; 3GOE A; 4YSX B; 2KZR A; 3JVZ X; 1DOX A; 1M94 A; 4K3B A; 3V3X A; 2LGI A; 4NJC A; 1F1H A; 1KM7 A; 2JVC A; 3APD A; 1FXA A; 3KUZ A; 2L0T A; 1E8X A; 5D94 A; 2DAJ A; 1XQQ A; 1RRB A; 3AE8 B; 2DEN B; 1P1A A; 1NDD A; 2KN5 A; 3RNC C; 2WXJ A; 4J6I A; 4EKU A; 4KSK C; 1J19 A; 3R2T A; 1JWU D; 2IO0 B; 2NBU A; 2RGF A; 1FRR A; 1V86 A; 1F2R I; 2BGF A; 5AUI A; 5EE0 A; 1QOB A; 4XX5 A; 4C4V A; 2D3G A; 1SBB B; 1HTQ A; 1L4Z B; 3Q3F A; 3DVG Y; 4BKG A; 3RNE C; 2GOW A; 1KFY B; 1D6E C; 3H6N A; 3NY5 A; 2WDV B; 4DXA B; 1TT5 B; 5J18 A; 2WS3 B; 1WYG A; 3UI3 A; 2V1Y A; 2KJH B; 2JU6 X; 2UWQ A; 1JCK B; 1VLB A; 2PIA A; 1NI3 A; 1WXQ A; 4I6N B; 1VDV A; 4LJO B; 4PK1 A; 1ZUD 2; 2QJL A; 2IPK D; 1K53 A; 3RNA C; 2QIL A; 4F7Z A; 4OVU A; 4K1R B; 3ECI A; 5G5G A; 2OJR A; 2XNA C; 4ZYS A; 1SGH A; 3TEW A; 1V6E A; 1PGX A; 3B2F A; 4JPS A; 2LVQ A; 3EFU A; 2MP2 B; 3KUC B; 1RFK A; 4IWO A; 3RZF A; 5AEK B; 1B9R A; 4BBN F; 2IZV B; 3W1S C; 1ZDX A; 3VTW A; 2KWU B; 3O13 A; 3APF A; 3L16 A; 2REX A; 3L0W B; 5LNK 1; 2IY1 B; 2KNB A; 2OJW A; 1MI0 A; 1YIW A; 2N0S B; 5BMG A; 4EZJ A; 1J0G A; 1E8W A; 1EO6 A; 2DLB A; 4PS8 A; 3SU8 X; 4K3C A; 1T6B X; 2FAZ A; 3AV8 A; 2DZK A; 4OZC A; 3URY A; 1WSP A; 2KFJ A; 2I1K A; 1UUP A; 3ZIM A; 4N6E B; 2ZW0 A; 5CHF A; 1GAQ B; 4X57 B; 4BOS C; 2FCS A; 3PTF C; 1D5Z C; 3GP7 A; 1FNW A; 3VAW A; 2BVC A; 2HJ1 A; 3VQI A; 2PE9 A; 3ZTC A; 1JML A; 3RUI B; 4ZRJ A; 1L6U A; 2NBW B; 4K7W A; 2ZNV C; 1R4N B; 4TQ0 A; 1P98 A; 2SAK A; 1HTO A; 4NQL B; 2BPS A; 4IM3 A; 4JX1 C; 2Z8L A; 4GU2 A; 1EWC A; 2WQY B; 3PHX B; 2JX5 A; 2Z0E B; 1JWB D; 2MJ3 A; 3NVW A; 1VZ8 A; 4AOF A; 3FAH A; 3AI5 A; 3KVF B; 2J4X A; 2MLB A; 4XGA B; 2YEP F; 2INC C; 3NRZ A; 1EU3 A; 1N60 A; 2KX3 A; 2JWU A; 2MQJ A; 3KWV A; 1TBE A; 4WAA A; 1NI2 A; 1V8C A; 3C0R B; 4HKQ A; 5FK9 C; 3OWE B; 3PS6 A; 3WAO A; 2R61 A; 4PT5 A; 1BT0 A; 1XO3 A; 3ZGZ A; 2J42 A; 1WYW B; 2KQ7 A; 3CST A; 3MP9 A; 3PZ8 A; 1WX9 A; 1E90 A; 2N7D A; 3MJ5 A; 1I4G A; 1UD7 A; 2NBV B; 4B6W A; 2CJO A; 3H7P A; 3I3T B; 4GDK B; 4LJP B; 4HPM B; 1C4P A; 3Q69 A; 3P1M A; 3AU4 A; 4UDU C; 1PDX A; 5DPW A; 1ISN A; 4GSW A; 2BT6 A; 3MC9 A; 2DAF A; 3ABV B; 1WFY A; 2ON8 A; 4FHK A; 2A5U A; 2ZCC A; 1FO4 A; 1WI0 A; 2RMM A; 2JF5 A; 3ZLZ A; 4GIV A; 3AEG B; 4LNO A; 2JRI B; 3Q6B A; 2K9X A; 2K5P A; 4MH8 A; 3B2G A; 5AZH A; 4JGH B; 1V1P A; 1QOG A; 4KGS A; 1ZP0 B; 1WR6 E; 2BS3 B; 2C60 A; 1WE7 A; 1Y8R C; 2KC1 A; 4E3C A; 3Q3O C; 3JYU A; 2V9H A; 3WCQ A; 4AS1 A; 2JXT A; 4YT0 B; 1UBI A; 2MBO A; 2MBE A; 2DBY A; 3Q8C A; 1EM7 A; 3AU5 A; 3KQ4 A; 1FNV A; 2YLM A; 3K9O B; 3BWU D; 2LGS A; 4KZ0 A; 4WQO B; 1XF5 L; 2N1V A; 1VJK A; 1AAR A; 2N9K A; 2JZP A; 2LHD A; 4E71 A; 1WWT A; 1WX8 A; 1DGJ A; 2RPV A; 2KTR B; 4IC7 B; 2D5G A; 1T0R C; 1XCT L; 4DDI D; 2N7E A; 4JQW C; 1GOZ A; 4LLG M; 4ANU A; 1KLU D; 4JLC A; 5DPR A; 4K7S A; 2IBI B; 4IW0 A; 1OGW A; 3SR6 A; 2G3Q B; 1HE8 A; 1TKG A; 1WZ0 A; 4GMV A; 1PUT A; 3W9C B; 1LXD A; 3ZVV A; 1T0S C; 3ZNI D; 4K81 A; 2XEW A; 3UIN B; 3UIO B; 3VH4 B; 1OEY J; 3RPF C; 1YN4 A; 2K3U A; 1WGH A; 1I4Q A; 5CX3 A; 4ZRK A; 4II3 B; 4W9H A; 4A8X C; 5C23 A; 2W55 A; 1JRP A; 4W9E A; 4KV2 A; 2MX2 A; 1IUE A; 1TY0 A; 1ACC A; 4NZL B; 2K8H A; 4YSZ B; 4ZDV A; 3VR8 B; 2JZZ A; 4YTP B; 3RMK C; 1FM0 D; 1Y56 A; 1ROE A; 3PPA A; 1JAL A; 5FR6 A; 1GUA B; 1C4A A; 1WJ4 A; 3OAW A; 2K8B A; 3QWZ B; 3NZS A; 4DHJ D; 2AX5 A; 4YTN B; 3AED B; 5C3J B; 1F9J A; 2KFK A; 2WP9 B; 3R3M A; 3PV1 A; 5E6N A; 3VRA B; 1CZP A; 1WRD B; 1ZPS A; 1I4R A; 1V2Y A; 3DVG X; 2ICI A; 3L13 A; 2BYE A; 2DZI A; 2FCM A; 3VFK A; 2WXO A; 2VZK D; 5AZF A; 2KWV B; 4BZA A; 2KMM A; 2AL3 A; 1YD8 U; 3W2D A; 3IVF A; 1KH0 A; 3N20 C; 2J52 A; 1OQR A; 3ONS A; 1K8R B; 1F77 A; 1E10 A; 3N1Z C; 4ZOH C; 2E6X A; 2BB6 A; 1YOV B; 3NZ3 A; 3BVZ A; 1YX6 B; 1C9F A; 2O2V B; 3PSE B; 3BY4 B; 5IA7 A; 4C00 A; 3A4S C; 1BXT A; 3ML8 A; 2EKE C; 1I42 A; 2PKO A; 4EUT A; 5KHQ A; 4P6V F; 2IGH A; 2CJN A; 3Q3J A; 2KWC A; 1SE2 A; 2QIE B; 3DBR B; 1HEZ E; 4CO7 A; 3QJZ A; 4AUQ C; 2OED A; 2L8J A; 4KKI A; 3D32 A; 1HZ6 A; 1WE6 A; 1MG4 A; 3FKY A; 1E6E B; 4REZ A; 5HFY A; 1P9D U; 4RCO A; 5I4D A; 1SJH D; 2UYZ B; 1LQB A; 5JZE B; 1TGZ B; 1Q10 A; 2LXA A; 1FNU A; 3ZRC A; 2K6Q A; 3DPD A; 4RFB A; 5HKH A; 2MBB B; 3A4R A; 2LEK A; 1UGJ A; 1R4M B; 1P7F A; 4MAC A; 3BYT B; 4A3O A; 4GN1 A; 1E7P B; 4S17 A; 3A9J B; 4WJN A; 4C56 C; 1YN5 A; 3L08 A; 1EUV B; 2LAS A; 3T9L A; 3VXW A; 1I4H A; 3ZNG C; 4HLE A; 3Q8E A; 2WLB A; 4D2K A; 1XLQ A; 1AN8 A; 3X0W A; 4MGK E; 3M63 B; 1UGM A; 1H4R A; 4US9 A; 2ZJD A; 4JWU C; 1QOA A; 3T3O A; 1SE3 A; 1JWM D; 1KTK A; 3VHT C; 2KJR A; 2BW2 A; 3IT4 B; 3VR9 B; 3N32 A; 1KLG D; 4ASW C; 4EZK A; 2D07 B; 3IBE A; 2WYQ A; 2JXX A; 1FMA D; 1FD6 A; 1C78 A; 4HJG E; 1ZOY B; 2NVU I; 2M4N A; 4LCD E; 1XLO A; 1IBX B; 1ZXH A; 2D10 A; 4BKS A; 2DYB A; 4PS7 A; 1ESF A; 5LXI B; 3OJ3 A; 1KOT A; 2XK5 B; 1PYW D; 3AEA B; 1N63 A; 1V1O A; 3GB1 A; 4KX6 B; 3H8H A; 2QEJ C; 3NVZ A; 3A9J A; 2BB5 A; 3LDZ E; 4CYE A; 4KVG B; 3M95 A; 2H89 B; 1HQR D; 3U30 A; 1GNU A; 2KQS A; 4NAW B; 3N30 A; 2V3S A; 2FUH B; 1WXA A; 4R3D A; 4L1B A; 2KVZ A; 3NS1 A; 4FA6 A; 2KK8 A; 1VZ6 A; 4FLH A; 2MBQ A; 2VRR B; 3ZKJ C; 2G4D B; 3AUL A; 1S1Q B; 1OTR B; 2KKC A; 3DHI C; 4A20 A; 1IGC A; 2J0K A; 1FIQ A; 2Y5C A; 5FR3 A; 3ZJV A; 4MGY E; 4PYZ A; 3AE7 B; 3FIL B; 3QAR A; 2KC2 A; 2JUO A; 1SXT A; 4HXD A; 4WWO A; 3B9J A; 1YNT E; 3DVN U; 4KIK B; 1QLB B; 2IY0 B; 3B1L X; 5CHV C; 4US8 A; 3N9Y C; 5D3D A; 4M02 A; 2Z0D B; 1JW9 D; 1A5R A; 2XK5 A; 3AE4 B; 3KYD D; 3LYY A; 3ZJT A; 4RMA A; 1EU4 A; 2MHJ A; 2ASQ A; 4ACF A; 4P1C C; 1Q5W B; 1T5X D; 2ACZ B; 1UZX B; 2N7J A; 1TJE A; 1CK1 A; 2LXC A; 3QK0 A; 4W9K A; 3HIZ A; 2QDF A; 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2GBM A; 2UU7 A; 4QAY A; 4HCP B; 2JZ3 B; 3E56 A; 1UNS A; 1TKE A; 1TS3 A; 4EE2 A; 4KSL C; 2EEL A; 3I9V 1; 2PLP A; 5IAA C; 2KQ4 X; 3PT2 B; 4J3O D; 1QT9 A; 4ZRP A; 2QHO A; 2BWE S; 1I35 A; 3QCA A; 4I6L B; 3H7S A; 3JSV B; 3LJ3 A; 1TKY A; 2GI9 A; 4F8C B; 1L0Y B; 3U52 E; 2QC8 A; 1P0R A; 5TSS A; 4GDL B; 3PGE A; 2EMS A; 2JY6 A; 2Y5P A; 3DOW A; 4MH0 E; 1IGD A; 1GC6 A; 3RYT A; 3C19 A; 1HZ5 A; 4WJO A; 1WGK A; 4MGI E; 4GDK A; 1CMX B; 1P3Q U; 3SD5 A; 4HK2 A; 4IDI A; 2CU1 A; 3WAP A; 4RF0 A; 1VR9 A; 4I6P A; 2E3T A; 1LO5 D; 4L2Y A; 2LVO A; 3ZDT A; 1K51 A; 1PFD A; 3P63 A; 5GXG B; 2K0P A; 3QQ8 B; 4RM8 A; 3CSF A; 1K50 A; 1D4B A; 1C76 A; 1K52 A; 3GZN I; 1TY2 A; 1ZKH A; 2LJ5 A; 1QOF A; 3SDL C; 2XBB C; 1X1M A; 1UBQ A; 2LJI A; 1KF6 B; 2KMC A; 3FC4 A; 2HTM E; 4N58 A; 3CF6 E; 3T3N A; 2W3S A; 4KDI C; 4WJP A; 2KLC A; 2L05 A; 3PRM B; 4NPN A; 4NQK E; 3Q14 C; 4WQM A; 1J7C A; 2L52 A; 1AYF A; 5EE1 A; 5E6P A; 2L0F A; 2WXQ A; 4HVB A; 3U8Z A; 4G3X B; 2N4F A; 2X8X X; 4RNA A; 2VH2 A; 1TIF A; 3UGB B; 4IM2 A; 2WX0 A; 3GE3 C; 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