The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
MEEVTIKANLIFANGSTQTAEFEGTFEEATSEAYAYADTLEEDNGEWTVDVADEGYTLNIEFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Protein L
|
| publication title |
Structural basis for the aminoacid composition of proteins from halophilic archea
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Peptostreptococcus magnus
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| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
15
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-11-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RMM A; 5HG2 A; 2PW9 A; 1GB4 A; 4KGR A; 4HKZ E; 1K51 A; 1K53 A; 2IGD A; 1HZ5 A; 1FD6 A; 2PLP A; 2KAC A; 2JU6 X; 4IOI E; 2LHE A; 2LGI A; 3GB1 A; 1EM7 A; 1P7F A; 1Q10 A; 5HFY A; 2N9L A; 2ONQ A; 2QSD A; 1C9F A; 1QKZ A; 4GLS C; 1XF5 L; 3UI3 A; 2J52 A; 4MAC A; 2RPV A; 4WH4 A; 1UWX A; 1XCT L; 1F2R I; 2IGH A; 2ZW1 A; 1GB1 A; 1MHX A; 2EEL A; 1PGB A; 2KN4 A; 4OZA A; 1P7E A; 2KWD A; 1F2R C; 5BMH A; 2KQ4 X; 4IKG A; 5HI1 A; 1K50 A; 2I2Y A; 1PGX A; 2GI9 A; 3V3X A; 1IBX A; 1IBX B; 2QMT A; 1MI0 A; 1MHH E; 1K52 A; 2N7J A; 1IGC A; 1YMH E; 2JXT A; 2IGG A; 4KGS A; 2JSV X; 1HZ6 A; 2ZW0 A; 2K0P A; 1IGD A; 3FIL B; 2OED A; 5HHD G; 2JWU A; 1HEZ E; 5BMI A; 1FCC C; 1MPE A; 2N9K A; 4D2K A; 4OZB A; 1PGA A; 2LUM A; 1KH0 A; 2ON8 A; 2NMQ A; 3MP9 A; 5JXV A; 1D4B A; 2I38 A; 2LHD A; 2KDM A; 1JML A; 2J53 A; 1XCQ L; 2PTL A; 1ZXH A; 2GB1 A; 3FIL A; 4HJG E; 1YNT E; 1FCL A; 1MVK A; 4OZC A; 4KGT A; 2JZP A; 5BMG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4P1B C; 1L0Y B; 3H7S A; 5KHO A; 1WXM A; 3QJZ A; 4JWU C; 1C79 A; 4NJ6 A; 4DK5 A; 2NBV B; 1P3Q U; 4ASW C; 4WWM A; 4GGQ A; 2JYT A; 1D5Z C; 1JAL A; 1MFW A; 4IW0 A; 2AQ3 B; 2WXG A; 2GLS A; 1T3Q A; 1TZO A; 3DWM A; 5BO4 B; 1GB1 A; 1I4G A; 3T3O A; 1TT5 B; 4RNA A; 3ML9 A; 4MEM A; 2ZEQ A; 4UDU C; 4A3P A; 3N30 A; 4WWN A; 1TYG B; 1HQR D; 5DPS A; 1QOF A; 2JWZ A; 2N0S B; 1IBX B; 4TV3 A; 1KLU D; 1K52 A; 2BS2 B; 3PHX B; 2FUG 1; 3AB5 A; 1Y8R C; 4IM3 A; 2INN E; 2W82 A; 3APC A; 2JWU A; 2ASQ A; 4FJY A; 4HCP B; 4XZ4 A; 2N7D A; 2LZ6 A; 3HHM A; 1ROE A; 4KKJ A; 2EMS A; 2BKR B; 2XEW A; 3AEB B; 4B9K A; 1WGH A; 3KWV A; 1ZE3 D; 1WE7 A; 2IYD B; 1F52 A; 3M95 A; 2KC1 A; 3R3M A; 1UBI A; 2C5L C; 3MP9 A; 1LFD A; 3MC9 A; 1E6E B; 2MP2 B; 3CF6 E; 2Y3A A; 2KDM A; 3DHH C; 4WQM A; 2I1K A; 1FIQ A; 5HKH A; 3PO0 A; 2JPH A; 1V2Y A; 3DBH I; 4E3C A; 1JWU D; 1OTR B; 2MSE D; 1N6Z A; 4ANW A; 3BK2 A; 2HTH A; 1E0Z A; 2L83 A; 3C19 A; 4L1B A; 2JXX A; 3ALB A; 4DBG A; 3AM9 A; 3N32 A; 3UIO B; 2WXP A; 4RF0 A; 2A4Z A; 4HKQ A; 2KXJ A; 3RZF A; 4FBJ B; 2O6V A; 2WXO A; 2NPT B; 4TMA B; 2N9L A; 2ONQ A; 3KUD B; 2DBY A; 5GMV A; 1C9F A; 2WLB A; 3VR8 B; 4A20 A; 2KDE B; 1AAR A; 2ZCB A; 4K3B A; 3JW0 X; 4HCN B; 1NYQ A; 2JX5 A; 2EEL A; 4C4V B; 1KM7 A; 5AZF A; 2BQQ A; 1SB3 C; 4ANU A; 2KQ4 X; 4N6E B; 3ENE A; 4AQ7 A; 3H7P B; 2FUH B; 2LVP A; 3AEC B; 2XK5 B; 5IAA C; 1ZXI A; 2Z59 B; 3PGE A; 3EFU A; 4BKS A; 2JT4 B; 1JWS D; 4BFR A; 5HHD G; 3VHT C; 2N9P C; 1EF1 A; 3OAW A; 4MGY E; 3HM3 A; 3DBR I; 4JPS A; 3Q2A C; 4X57 B; 1E10 A; 3WAM A; 3TEY A; 1BUI C; 2L76 A; 2FBW B; 5EE3 A; 4A90 A; 4LNN A; 3M62 B; 3PSE B; 3AEG B; 3QQ8 B; 2MWS B; 4IC7 B; 1WXS A; 1XCQ L; 2GBJ A; 1YNT E; 4B95 A; 2FAZ A; 3PRZ A; 2WXI A; 4MEL A; 3EC8 A; 4N58 A; 3VVW B; 4DXA B; 1E9M A; 3OJ4 B; 4W9E A; 1WIA A; 4GSW A; 3AV8 A; 3RMK C; 3JVZ X; 5LXI B; 4TQ1 A; 1CJE A; 2KWV B; 1FRR A; 4HDQ A; 2GBR A; 5EE9 A; 3DCG A; 2L0T A; 4IWQ A; 3RT3 B; 3IG3 A; 2KKC A; 3GB1 A; 3PVL A; 1WZ0 A; 1P7F A; 3MHS D; 5E6J A; 2W54 A; 4KIK A; 4ZHP A; 1XD3 B; 5EE0 A; 2ZW1 A; 3AE5 B; 4MGZ E; 3P2B A; 4LNI A; 4C7Z A; 1QLB B; 3TCA A; 1UGM A; 2QHO A; 2KN4 A; 4KSL C; 1STE A; 2CJO A; 2QC8 A; 4LNF A; 1LM8 B; 3R7R A; 2FCM A; 1ZDX A; 2N4F A; 2C9W B; 2D5G A; 2G4D B; 2IO2 B; 3NZ3 A; 4ZOH C; 1WR6 E; 3Q3N C; 2MEK A; 2L0F A; 4KGS A; 4LNO A; 1HZ6 A; 2MCN B; 1SE3 A; 3TBL D; 3DVG Y; 4G11 A; 1QF6 A; 3U4E G; 4XWW A; 5BMI A; 1FCC C; 2KQ7 A; 1NEK B; 1ACC A; 4M0W A; 1SE4 A; 5H8Y E; 2JF5 A; 2LXC A; 4EZJ A; 3OLM D; 3AE4 B; 4XYC A; 3NS1 A; 3VDZ A; 3ZRF A; 3A9K A; 4RCO A; 1PDX A; 3E9S A; 3RUL A; 2KTR B; 2B3A A; 3R2I A; 1WY8 A; 1TY2 A; 1TS5 A; 1ZKH A; 2M56 B; 1KRH A; 5J18 A; 2JZZ A; 4JWS C; 4WJN A; 4RMA A; 3IXS A; 3I3T B; 4KGT A; 3AE3 B; 1E8X A; 1L4D B; 2RMM A; 1LO5 D; 5BYR A; 2UWQ A; 2JRI B; 2K6D B; 5AUI A; 3W1S C; 1SE2 A; 2M0A A; 4ZDV A; 1WX8 A; 2CHW A; 5G5H A; 2L00 B; 5FK9 C; 2LJI A; 3NY5 A; 2LHE A; 3VAW A; 2KX0 A; 3M3J A; 4W9K A; 1RAX A; 2JQR B; 3ZUN A; 2RPV A; 4DHJ B; 1JQ4 A; 4YSY B; 3RNB C; 1YQB A; 1TJE A; 5LXH A; 3P1M A; 3T3N A; 4WAA A; 4YTN B; 1XLN A; 3A9J A; 1TS2 A; 1WZ3 A; 4GDL B; 3U30 A; 4S0R A; 2RDG A; 3IT6 B; 3ZJV A; 2KDI A; 4ZRQ A; 1V80 A; 2VH1 A; 3AEF B; 1ENF A; 2G4S A; 3PLV A; 3L54 A; 4MSQ B; 1IGC A; 1XEE A; 1FMA D; 4J6I A; 2R2Q A; 3C8Y A; 1GG3 A; 2ZW0 A; 2QCZ A; 4LDT B; 3PT2 B; 1N62 A; 1UUP A; 4K81 A; 1YJJ A; 5E6O A; 4FJV B; 3AH7 A; 1EUV B; 1ESF A; 1AWD A; 1L7Y A; 1RRB A; 4NAM A; 5IKC M; 1V5T A; 4D2K A; 1N5W A; 2KJR A; 1FO4 A; 4HRO A; 2PVG C; 1RFA A; 3DOW A; 1FPY A; 1E5W A; 2Q5W D; 1JML A; 1QOG A; 5H92 C; 1FNU A; 2LD9 A; 2WU2 B; 3MJ5 A; 3W1Y A; 3DDC B; 3DWG C; 1TIF A; 4KX6 B; 4G3X B; 3L0W B; 3ABV B; 5BMG A; 1P1A A; 2LVO A; 5AZH A; 1TKG A; 2DEN B; 4GXB A; 1K51 A; 1WH3 A; 2IGD A; 4DHJ D; 4MT5 A; 3BII D; 3CMM B; 2XNA C; 1KJT A; 2LGI A; 2MBO A; 1Q10 A; 5T8I A; 3A4R A; 1YN3 A; 3NJT A; 2W3R A; 3ZTD A; 3ZIM A; 1IYF A; 5CHV C; 5I4D A; 4ZRI A; 1L0X B; 2PE6 B; 1V97 A; 2FID A; 4DWF A; 1MHX A; 1B9R A; 2TSS A; 2WXR A; 3Q8A A; 2A5U A; 2G45 B; 2OJW A; 1P7E A; 2X38 A; 1M94 A; 5BMH A; 3WAL A; 2AQ2 B; 2YEP F; 3UIN B; 2RPQ A; 2L8J A; 3APD A; 3V60 A; 1LQB A; 2D07 B; 3U7Z A; 1IP9 A; 2G3Q B; 1WRD B; 1RWS A; 4KKI A; 4O1N A; 2LGS A; 3HRD D; 1DGJ A; 3N20 C; 1TKE A; 1HEZ E; 3PRE A; 1WGY A; 2KFJ A; 2OJR A; 2Z0D B; 4FA6 A; 5MPO A; 2ZNV B; 1V1P A; 2NTS A; 2HJ8 A; 3GZN B; 3ONS A; 4KZC A; 4REZ A; 4W9F A; 2KVZ A; 2N9X A; 2K39 A; 4BOS C; 1NBF C; 2V9H A; 1YN4 A; 4LCD E; 2BS3 B; 3ZDM C; 5JZE B; 2JZ3 B; 1UGJ A; 1MVK A; 1JRO A; 4DXF A; 3NZS A; 1C77 A; 1WM3 A; 3KUZ A; 3KWL A; 3DHG C; 2WDR B; 2DX5 B; 3L16 A; 1WGD A; 5D7G A; 3CWI A; 1XQQ A; 2DAF A; 1SIJ A; 1R7S A; 4GDK A; 4WWP A; 1TTN A; 1Z2M A; 1JRU A; 1S3S G; 1C4P A; 1V9J A; 1FD6 A; 3W2D A; 3S2A A; 3FC4 A; 3JYU A; 3R66 C; 3Q8C A; 1HA5 A; 2KX3 A; 3KYC D; 2MBB B; 5IOI A; 1XCT L; 3QA8 A; 1H8C A; 3HIZ A; 4LJO B; 5FR3 A; 3N1Z C; 4ZYS A; 3HVZ A; 1RLF A; 2ZCC A; 1UBQ A; 4RM8 A; 3RYT A; 2KFK A; 1WMH B; 2WDT B; 3AE7 B; 1WRI A; 4EFO A; 2KMA A; 4ZRP A; 4IM0 A; 4DQO C; 3P42 A; 4KV2 A; 1UNS A; 4C56 C; 4HK2 A; 4W9I A; 4CYE A; 1TZ1 A; 2LUE A; 2JXT A; 1F0Z A; 2BT6 A; 3NOB A; 5C2T B; 2PJH A; 1WJ4 A; 3Q14 C; 2W55 A; 3OJ3 A; 3UIP B; 3QAR A; 1C4C A; 1ZPS A; 5DPR A; 1SF0 A; 3A4S C; 3BIN A; 4AP4 C; 3B0A A; 1FRD A; 4S17 A; 2CKH B; 3I57 A; 2KWU B; 2MQJ A; 3IAM 1; 3WA0 A; 1JWA D; 1YX5 B; 1YJ1 A; 1MG4 A; 3Q6B A; 3IBE A; 3V62 A; 2NS5 A; 2CHZ A; 4B0E A; 4OZC A; 4MGI E; 2AQ1 B; 2PKO A; 3WIM A; 3B2F A; 1V86 A; 1XO3 A; 4NNJ B; 4MDK E; 2XBB C; 2CR5 A; 3NS8 A; 4YL8 A; 1OQR A; 4II3 B; 5FR6 A; 1ET9 A; 2MJ3 A; 1J7A A; 1HZ5 A; 4NZL B; 2PLP A; 5IP4 D; 1CZP A; 5JHA A; 2AX5 A; 3BY4 B; 2B76 B; 3X23 A; 5AZG A; 2J0J A; 3VFK A; 1WYW B; 4OVU A; 2QSD A; 4MAC A; 1EU4 A; 4JLC A; 1WJU A; 1VDV A; 3GE3 C; 5D2M B; 3MTN B; 2WXH A; 3NVZ A; 3ZKJ C; 4BBN C; 1PGB A; 1NI3 A; 2MRP A; 3VRA B; 4A6Q A; 2WDQ B; 4NJ7 A; 5HI1 A; 1P98 A; 3GZN I; 1NDD A; 3K9O B; 3RN9 C; 1I35 A; 2JY6 A; 3T9L A; 4F7Z A; 3B1L X; 3SFD B; 4ITK A; 2MBE A; 1AN8 A; 4GMV A; 4RF1 A; 2AL3 A; 3HM6 X; 5BYQ A; 1GC7 A; 3OG5 A; 4FXC A; 1M4V A; 4LTU A; 3MFG A; 3W5U B; 1T0R C; 2O2V A; 2J7Q B; 3VXW A; 1YJI A; 2V1Y A; 5AEK B; 2K5P A; 3APF A; 2RD0 A; 1FXA A; 4ICV A; 3BVG A; 4NJC A; 1WX7 A; 1D4B A; 3AE2 B; 2DYM A; 1PYW D; 4NAW A; 2Y5B B; 1BXT A; 1WGR A; 1HXY D; 1SGH A; 3O65 B; 3FIL A; 1RFK A; 1WWT A; 2BYF A; 3SFE B; 2C60 A; 5J2R A; 1GAQ B; 1FCL A; 1YD8 U; 2RSU A; 1N60 A; 3TIX A; 5C1Z A; 3ZDT A; 5EE1 A; 1F9J A; 3KH0 A; 4BAX A; 1UF0 A; 3PZ8 A; 2D3C A; 1F77 A; 4MM3 A; 5JH5 C; 1ZP0 B; 1DOX A; 3N3K B; 1R4N B; 2JU6 X; 3JSV A; 5DCN A; 4IOI E; 2FNJ B; 4DXG A; 1I4P A; 3ZNI D; 4ZRJ A; 3TMP B; 5HFY A; 4PS8 A; 4LK0 M; 4XE0 A; 2J0M A; 1F2R I; 1T0S C; 3H9D A; 2ZNV C; 4P7I A; 3L13 A; 2M1M A; 2M8S A; 4EEW A; 1C4A A; 1J7B A; 3AI5 A; 4F1S A; 4DDI D; 3A1Q A; 1K50 A; 2L7R A; 4AS1 A; 4HXD A; 3QCA A; 1VJK A; 2K8C A; 3NVY A; 1U4A A; 1P0R A; 4FJZ A; 4B0M A; 2AEH A; 2DZK A; 3QC8 B; 3UF8 A; 2IDY A; 2WP9 B; 2LEK A; 2E6X A; 3AUL A; 2MJE A; 3VTU A; 1WGG A; 1FEH A; 3PRM B; 4I6N B; 3ZNH B; 3DBS A; 3AN1 A; 1TBE A; 3EHV A; 2ICI A; 5D6J B; 5IO9 A; 4N9F 4; 1TKY A; 5CHF A; 2FE8 A; 2LRW A; 4KDI C; 1PUT A; 5IN7 A; 4RM9 A; 4PS3 A; 3I63 C; 5JXV A; 2MA9 B; 3BYT B; 4IDI A; 4H2A A; 2J53 A; 2KC2 A; 4KDL B; 2G1E A; 1K8R B; 3EGR A; 2HDE A; 2K1F A; 1EO6 A; 4XWT A; 3IVF A; 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2O6V B; 4YTP B; 4C00 A; 3IAS 1; 2GBK A; 2EMT A; 1FFU A; 1QKZ A; 1XF5 L; 2J52 A; 3MJW A; 3MHZ A; 3TEX A; 1PFD A; 1WJ6 A; 4IG7 B; 4KZ0 A; 1QT9 A; 1LGR A; 4OZA A; 1T0Y A; 4C4V A; 2O2V B; 3A33 B; 2BW2 A; 3VTV A; 3CSF A; 2WDV B; 4XDD A; 3C0R B; 2GI9 A; 3ZYY X; 3RNE C; 3Q3J A; 3DPD A; 3ZXV A; 1ZDV A; 3H7P A; 1G6J A; 4M01 A; 2XK5 A; 1XXG A; 2D10 A; 3PLU A; 2WGS A; 3RI7 C; 1JCK B; 3GP7 A; 2KLG A; 2K0P A; 3FIL B; 2KMC A; 1DOY A; 1C3T A; 3AEE B; 1GJZ A; 3B08 A; 2RGF A; 2QDF A; 1PQS A; 4LDT D; 4LNK A; 1L0V B; 2WX1 A; 5D3I B; 3ZGZ A; 2BYE A; 3RUI B; 3AXC A; 4WQO B; 4TQ0 A; 1B1Z A; 4BBN F; 2I38 A; 1C76 A; 1SE9 A; 4E71 A; 4AJY B; 2V3P A; 2Y5P A; 2M0X A; 2BB6 A; 2WS3 B; 3JSV B; 4HJG E; 3P4P B; 1YQ3 B; 4AUQ C; 3AE6 B; 3RD2 A; 3RCZ A; 3AU4 A; 2GRI A; 2O6V D; 3UQA A; 2IY0 B; 4GN1 A; 4TUU A; 1J0G A; 4KVG B; 4A8X C; 2HTM E; 4MSM B; 2LI5 A; 4N59 A; 4OVV A; 3PRP B; 3J9C A; 1GPX A; 1A5R A; 2VH2 A; 1ZW7 A; 3VUY A; 3Q3F A; 3VUX A; 4KIK B; 1I4R A; 2NVU I; 3UI3 A; 2K9X A; 3CIR B; 3P63 A; 4WH4 A; 3PPA A; 4CHK A; 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