The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
MIKVLFFAQVRELVGTDATEVAADFPTVEALRQHMAAQSDRWALALEDGKLLAAVNQTLVSFDHPLTDGDEVAFFPPVTGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ligase
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| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Mechanism of ubiquitin activation revealed by the structure of a bacterial MoeB-MoaD complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MOLYBDOPTERIN BIOSYNTHESIS MOEB PROTEIN
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| total genus |
21
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NVY A; 1NEK B; 1XO3 A; 3RPF C; 1FO4 A; 1NYQ A; 1N61 A; 1QOA A; 1V8C A; 3P4R B; 1CZP A; 1FXA A; 1QT9 A; 2WS3 B; 1QOG A; 4YTM B; 2BS3 B; 3EUB 2; 5C3J B; 2WDR B; 2L52 A; 4IDI A; 3W9C B; 1FFU A; 4JWU C; 1TYG B; 3AN1 A; 1ZOY B; 2W3S A; 4YXD B; 1WWT A; 1DOY A; 2ACZ B; 1WYG A; 3AE9 B; 3B2F A; 1KF6 B; 1VJK A; 3VR9 B; 1F0Z A; 1JWA D; 2CJN A; 2K9X A; 3NRZ A; 1NEN B; 1PFD A; 4USA A; 1FMA D; 3AB5 A; 2DWQ A; 3AEE B; 1A70 A; 3AEG B; 4N59 A; 1FRD A; 3AM9 A; 5GXG B; 4US8 A; 2WP9 B; 1N60 A; 2LEK A; 3P4S B; 2Y5C A; 3AH7 A; 3PO0 A; 1E0Z A; 1NI3 A; 2W55 A; 2WU5 B; 3AE8 B; 3CIR B; 1JQ4 A; 1ROE A; 3B2G A; 2BS2 B; 5AUI A; 1N5W A; 3DWG C; 1J7A A; 1XLQ A; 1L5P A; 1WRI A; 3P4Q B; 1J7C A; 1DOI A; 5H92 C; 3P1M A; 4YSZ B; 2WDV B; 1RYJ A; 1VLB A; 2W54 A; 4C7Z A; 2QIE B; 1VDV A; 3BII D; 4ZOH C; 1PUT A; 3B9J A; 2G1E A; 2PVG C; 1N5X A; 2N0S B; 3AE5 B; 1UWM A; 4JX1 C; 4JWS C; 5H8Y E; 1RWS A; 2EKI A; 4YTP B; 2QJL A; 4HRS A; 2JQR B; 4HRO A; 3KWL A; 3ABV B; 1OQR A; 3FC4 A; 3SFD B; 1NVI D; 2KMM A; 3HUI A; 1I7H A; 4P6V F; 4US9 A; 2Q5W D; 2HTM E; 2KAJ A; 1AYF A; 1RFK A; 3NVZ A; 3ETR A; 1GPX A; 1L6U A; 1ZP0 B; 1FM0 D; 3AE7 B; 3AEA B; 3AMZ A; 1QOB A; 1GAQ B; 1YJJ A; 2MH7 A; 1TJE A; 1N63 A; 4A9A A; 4WWM A; 1OQQ A; 4YSY B; 5G5G A; 1DGJ A; 3AE3 B; 1NYR A; 2DBY A; 3SFE B; 3W5U B; 4ZHP A; 3LB8 C; 3AE4 B; 5EE1 A; 2M56 B; 4KX6 B; 3LXF A; 1SB3 C; 2B76 B; 1EWY C; 2MJ3 A; 4LTU A; 4FXC A; 2L83 A; 4WQM A; 1YQ3 B; 1TKE A; 1XLO A; 1J7B A; 3AE1 B; 1KFY B; 2CU3 A; 5AUK A; 4YT0 B; 1TKY A; 1SIJ A; 3ZYY X; 1FXI A; 3P63 A; 3NVW A; 5EE9 A; 4N6E B; 1ZUD 2; 3AE6 B; 3SR6 A; 2PIA A; 1QF6 A; 1E10 A; 3AEB B; 2WU2 B; 1IUE A; 2MJE A; 4C7Y A; 1WXQ A; 1T3Q A; 1WGK A; 1YJI A; 5G5H A; 1E7P B; 1SF0 A; 1E6E B; 1N62 A; 1E9M A; 1JRO A; 1XLN A; 3AE2 B; 1JWB D; 3AEF B; 5MPO A; 2BT6 A; 1OFF A; 1AWD A; 4N58 A; 3AV8 A; 4YTN B; 4ITK A; 5C2T B; 3VR8 B; 4ZHO A; 5EE0 A; 2K22 A; 1B9R A; 1L0V B; 1YQ4 B; 1TKG A; 3WCQ A; 4C80 A; 2OHF A; 3P4P B; 2WLB A; 3W5V B; 2WDQ B; 2CJO A; 2M19 A; 2AX5 A; 1V97 A; 3HVZ A; 1KRH A; 1QOF A; 3AEC B; 1ZXI A; 1FFV A; 3HRD D; 4YSX B; 2H88 B; 2MJD A; 1DOX A; 1JW9 D; 2WQY B; 1R7S A; 1JAL A; 2FBW B; 2E3T A; 3DWM A; 5EE3 A; 3VRA B; 1JRP A; 1PDX A; 2BS4 B; 2PKO A; 3FAH A; 2H89 B; 1CJE A; 2PVO D; 2W3R A; 1FIQ A; 3CWI A; 3VRB B; 1XLP A; 1L6V A; 2K5P A; 2JX5 A; 1RM6 C; 1QLB B; 1FRR A; 3AED B; 3NVV A; 3L4P A; 3NS1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L8J A; 3L08 A; 2N1V A; 3ZDM C; 1CZP A; 3W1S A; 2IND C; 4J6I A; 2BS3 B; 5C3J B; 3CF6 E; 1E7U A; 3AN1 A; 4GGQ A; 4E3C A; 3DVN V; 1FCL A; 1IYF A; 3OJ3 A; 3R7Q A; 4USA A; 4W9D A; 3ZDT A; 1TS4 A; 4W9J A; 3VVW B; 1E7V A; 1JQ4 A; 4TQ1 A; 1ROE A; 2IJ0 A; 4RGN A; 2G1E A; 4RMA A; 4ICU A; 3NZU A; 4YTP B; 1TY0 A; 4C4V B; 2PLP A; 3Q3F A; 2N9X A; 3R7R A; 1AYF A; 2ZVO A; 5AEK B; 1JCK B; 3ZQ4 A; 1GAQ B; 2GI9 A; 4LNN A; 1E5W A; 2IZV B; 3C19 A; 1DGJ A; 3AE3 B; 4GMV A; 1K8R B; 2AQ1 B; 3LB8 C; 4W9F A; 5LXH A; 2RR9 A; 5J17 A; 2KMC A; 1SE9 A; 2J42 A; 2JZP A; 3FIL A; 3DVG X; 2L32 A; 4W9K A; 1JWS D; 2LUE A; 2K8C A; 4OVZ A; 1WM2 A; 2J4X A; 2NS5 A; 2Z0E B; 1TKY A; 2KJH B; 4DBG A; 1E10 A; 3WAL A; 2WYQ A; 1UUP A; 2KFK A; 4PS3 A; 2MJE A; 1T3Q A; 1E6E B; 1JRO A; 3PZD A; 4JQW C; 1UF0 A; 1WSP A; 1B1Z A; 2OOB B; 2JY6 A; 1Y8R C; 2MBH A; 3ALB A; 3ZTD A; 2PMV A; 2Z59 B; 1JAL A; 1YD8 U; 5HKH A; 3DWM A; 3CST A; 3NG0 A; 1DOX A; 2MA9 B; 3PS6 A; 2KLC A; 2KNB A; 1N61 A; 4HKQ A; 2G3Q B; 1K50 A; 3Q8B A; 2LFI A; 5E6J A; 1SJE D; 2M1M A; 1GB4 A; 2MP2 B; 1HZ5 A; 1FMA D; 3BYY B; 2ON8 A; 4NPN A; 3MTN B; 1Q0W B; 4KDI C; 1C3T A; 2C9W B; 3PZ7 A; 3CIR B; 5IAA C; 3HM6 X; 3DWG C; 3U30 A; 2DZJ A; 2O6V B; 1RYJ A; 4L2Y A; 2BBC A; 4ZOH C; 4RGM A; 2HJ1 A; 1L0Y B; 2FAZ A; 2KAN A; 1E8X A; 4JWS C; 4OZC A; 2KYW A; 2JRH A; 4NQL B; 4RCO A; 2YLM A; 4LJO B; 2IYD B; 1LGR A; 2SAK A; 4GN1 A; 3NVZ A; 1L6U A; 2KC1 A; 2MH7 A; 1N63 A; 5G5G A; 2M8S A; 2BWF A; 4XWW A; 1SB3 C; 4WJQ A; 1P1A A; 2LVO A; 2DX5 B; 1WJ4 A; 1KTK A; 3Q3N C; 1WXM A; 4IC7 B; 2WNM A; 1HZ6 A; 5G5H A; 4WWN A; 1JWB D; 1VZ7 A; 2K1F A; 1KLV A; 3I9V 1; 4BKG A; 3WCQ A; 1AN8 A; 3Q3O C; 3Q69 A; 2MWS B; 3PT2 B; 3A1Q A; 2I2Y A; 1V1O A; 1UWX A; 1UH6 A; 4MEL A; 1RM6 C; 4F1S A; 3RPF C; 4OZB A; 1QKZ A; 2IPK D; 1TIF A; 2ZCC A; 1J8C A; 2JT4 B; 2LGI A; 3RFZ B; 1JWA D; 4WAF A; 3DBR B; 2ZEQ A; 4BOZ B; 4XDC A; 2AL6 A; 4MJS B; 4XWT A; 1A5R A; 1YMH E; 2L00 B; 2I1K A; 3QIJ A; 1NBF C; 1I4Q A; 1C76 A; 2EKI A; 2K0P A; 4EUT A; 1V2Y A; 2AQ2 B; 4HRS A; 3KWV A; 3N30 A; 1TZO A; 4W9C A; 2D3C A; 1RFK A; 3A4R A; 5IKC M; 1GPX A; 5IA7 A; 5E6P A; 3L13 A; 4L1B A; 1ZW7 A; 3PGE A; 2XBB C; 3RNE C; 3ZLZ A; 5LLI A; 2VZK B; 3GE8 C; 1KLU D; 4A3P A; 5HFY A; 1QIL A; 2LD9 A; 1SIJ A; 4IWP A; 4NAM A; 3L54 A; 1ZUD 2; 1OEY J; 4NZL B; 2JU6 X; 3GE3 C; 1GB1 A; 2WU2 B; 1SEB D; 2IY0 B; 4KGS A; 2KQS A; 4YTN B; 2J0K A; 1TKG A; 4B0M A; 1WRD B; 3E9S A; 1QOF A; 4WJN A; 1FFV A; 4ICV A; 2LRU A; 3Q3J A; 2QHO A; 2FBW B; 3R2T A; 5EE3 A; 3PV1 A; 3DOW A; 1GC7 A; 3A9K A; 2KQ4 X; 2Y5B B; 1VCB A; 3EUB 2; 4DHZ E; 3W9C B; 2JUO A; 1DOY A; 1WWT A; 2MLB A; 3JSV B; 1F0Z A; 3Q8E A; 4G11 A; 4BFR A; 4K7W A; 4MAC A; 1TZ1 A; 4KSL C; 3NS8 A; 2VH1 A; 1JWM D; 1OEY A; 1XLQ A; 1DOI A; 5C23 A; 2WDV B; 1M4V A; 2EKE C; 4PYU A; 2GB1 A; 4HPM B; 1M94 A; 3E56 A; 1AW7 A; 2WX1 A; 3EGR A; 2KMM A; 2RMM A; 1YIW A; 1P9D U; 4KDL B; 1AAR A; 2XEW A; 2WGS A; 4K81 A; 2LXA A; 1SSN A; 1F77 A; 3ZNG C; 3ENE A; 4X57 B; 3GOE A; 1NYR A; 4HVB A; 2C5L C; 4W9L A; 2D3A A; 2YEP B; 1T0Q C; 4M8M A; 2QDF A; 4ANU A; 2GBJ A; 5AZH A; 4O1N A; 3SU8 X; 3RD2 A; 3ZGZ A; 3SR6 A; 2UU7 A; 5HI1 A; 4H2A A; 5C2T B; 4P16 A; 1V49 A; 2N7E A; 4LDT B; 4F7Z A; 3DVN U; 2NPT A; 3KLS X; 4C80 A; 2JPH A; 2WXJ A; 2IO2 B; 1ZXI A; 3WAN A; 4BVU C; 1MVK A; 2KWC A; 1TS2 A; 2H89 B; 2GRI A; 2JX5 A; 5LNK 1; 2JF5 A; 3EHV A; 3N3K B; 3W1S C; 4EKU A; 5TR5 A; 3NZ3 A; 1C4C A; 4AJY B; 2KN4 A; 5D6J B; 1E90 A; 4IDI A; 2NMQ A; 2FUG 1; 2FIF A; 5D7G A; 1R4N B; 1WZ0 A; 3NRZ A; 1PFD A; 3BWU D; 2FCS A; 1A70 A; 1RAX A; 4M02 A; 2LGS A; 4W9I A; 3APD A; 4N59 A; 4DK5 A; 1FRD A; 1KH0 A; 4US8 A; 2WP9 B; 3N1X C; 3BIN A; 1MI0 A; 4A55 A; 1KLG D; 1T6B X; 3PVL A; 3PHW B; 2WXM A; 3B9J A; 1WMH B; 1WXA A; 3IBE A; 2GOW A; 3AE5 B; 1YN5 A; 2KWV B; 4ZRK A; 1P98 A; 3IAM 1; 2JXX A; 4FJY A; 2WXO A; 3DBL I; 3KH0 A; 2KAJ A; 3KYD D; 1L7Y A; 2MQJ A; 2GBN A; 4K7U A; 2GBR A; 2WXL A; 2XN9 C; 4ACF A; 1YQ3 B; 2K8H A; 3DDC B; 4FBJ B; 2BF8 B; 4NJC A; 1MHX A; 2OED A; 2AL3 A; 2L3Z A; 1QF6 A; 4GOC A; 1WR6 E; 2O2V A; 2M0X A; 2R2Q A; 1D6E C; 4ZYN A; 2L0F A; 1UZX B; 2BT6 A; 1WI0 A; 1UD7 A; 2OHF A; 2RSU A; 1IPG A; 3WAO A; 1KOT A; 1IGD A; 2MW5 A; 3GS2 A; 4MSQ B; 4RNA A; 4WH4 A; 3DPD A; 2DZK A; 4GIV A; 4LJP B; 1R4M B; 2KAC A; 4OHJ A; 4NJ7 A; 3Q6B A; 3DBH B; 4WAA A; 2KDF B; 2N7D A; 1NEK B; 3H8H A; 1FXA A; 2N9E B; 4EFO A; 5E6O A; 3AU5 A; 4JPS A; 3RI7 C; 2NR2 A; 2D11 A; 4A20 A; 4W9H A; 4LCD E; 3VTW A; 1L5P A; 1WRI A; 4YSZ B; 4MM3 B; 1PUT A; 2ONQ A; 3QC8 B; 3N1Y C; 3A33 B; 1PQS A; 5DPS A; 4JX1 C; 3UIP B; 2QJL A; 5IN7 A; 1F1H A; 3FC4 A; 4KIK A; 1NVI D; 2C7M B; 4WWP A; 2V3N A; 4XZ4 A; 3IAS 1; 1PGA A; 4I6N B; 1YOV B; 1MJD A; 3QCA A; 1WYW B; 3VH4 B; 5EE1 A; 3I63 C; 1EWY C; 2PTL A; 4RGO S; 2KX0 A; 3A1Q B; 3WIM A; 1XCT L; 1WR1 A; 3ZYY X; 3R3M A; 4IWO A; 1D5M C; 3EFU A; 3MHZ A; 4EZJ A; 2ZZP B; 2X8X X; 3MJW A; 2WXG A; 3PSE B; 2BPS A; 1E7P B; 3AE2 B; 4XC2 A; 1OFF A; 1XQQ A; 2FCM A; 2KTF A; 2D3B A; 3H7P A; 3QQ8 B; 3TBL D; 4IM2 A; 3HRD D; 3RNC C; 3M3J A; 2ZW0 A; 3B0A A; 1F52 A; 3AU4 A; 3QJZ A; 1R7S A; 4DXG A; 3V6C B; 4MH8 A; 3DQV A; 3SHQ A; 1BML C; 3UGB B; 1WXV A; 4GDL A; 4HDQ A; 5D3D A; 4NAW A; 2K3U A; 2K25 A; 1FFU A; 2ACZ B; 1IBX B; 2KVR A; 4AUQ C; 2E6X A; 2MHJ A; 4M00 A; 3PTF C; 5FKA C; 5L83 A; 2MEK A; 3U52 E; 1LXD A; 3AH7 A; 2KTR A; 1T0R C; 1T0Y A; 1E0Z A; 2LJ5 A; 4KV2 A; 1T0S C; 3B2G A; 3QAR A; 1CMX B; 2LAS A; 4BAX A; 4GDK A; 1WY8 A; 3H9D A; 3H6N A; 2KDM A; 2MCN B; 4FHK A; 4HCN B; 1TTN A; 3M63 B; 4TMA B; 4IUM B; 5H8Y E; 1RWS A; 4IKG A; 2L05 A; 3CSF A; 4RF0 A; 4P6V F; 2I1J A; 3RNF C; 3ETR A; 2XK5 A; 3AEA B; 1I4G A; 4HEA 1; 2V4L A; 1OQQ A; 4IM0 A; 4MSM B; 1WZ3 A; 4NQK E; 4UDU C; 2IO0 B; 3TEZ A; 4FXC A; 5CX3 A; 3VTU A; 4WQM A; 3V05 A; 4KKJ A; 1XLO A; 3AE1 B; 2M0A A; 1E8Y A; 2CU3 A; 4FLH A; 5AUK A; 1EUV B; 3ZO5 B; 4E71 A; 4AS1 A; 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2REX A; 3QHT A; 2IBI B; 4IWQ A; 5C1Z A; 1D4B A; 2VRR B; 3J9C A; 4RGT A; 4KGR A; 4BBN C; 2LUM A; 3AEF B; 1EO6 A; 4E74 A; 1YX5 B; 4FHJ A; 3DBR I; 4II3 B; 2KVZ A; 1P7E A; 2WXI A; 3DHH C; 3W5V B; 1WJN A; 3A4S C; 4IM3 A; 3ONS A; 1TBE A; 2AQ3 B; 5LXI B; 2E3T A; 3LJ3 A; 3T3O A; 1LFD A; 3PRM B; 1XLP A; 2BKR B; 2FNJ B; 3BY4 B; 1XXG A; 3KUZ A; 4MEM A; 2JRI B; 2AWT A; 1V5T A; 3P42 A; 3MFG A; 1UEL A; 3IG3 A; 4YTM B; 3AE9 B; 3VR9 B; 2LGD A; 2IGG A; 3UQA A; 2LVP A; 2G4S A; 1L4D B; 1ET9 A; 3ZNZ B; 3GZN B; 2BYT A; 2BS2 B; 2QSD A; 3P1M A; 3IFW B; 5E6N A; 4W9E A; 2O6V A; 2EMS A; 2X38 A; 3HVD A; 3JYU A; 3RNG C; 4ZRP A; 1RRB A; 4J3O D; 2NBW B; 2Y3A A; 2MSE D; 1SIF A; 2NBV B; 3ZNI D; 4KZ0 A; 2O2V B; 3GB1 A; 4JE3 B; 4OZA A; 3K9P B; 1STE A; 1NI2 A; 1TGZ B; 1VRA B; 3SFE B; 3W5U B; 3AE4 B; 1GNU A; 4I6L B; 2MJ3 A; 4C00 A; 1IP9 A; 3X23 A; 1J7B A; 4FUL A; 4GSW A; 4CHK A; 4IW0 A; 4YT0 B; 1XT9 B; 1ZPS A; 1FXI A; 2BTE A; 3APC A; 3PRP B; 4BKS A; 3LDZ E; 3ZRC A; 2OJW A; 3AV8 A; 2J52 A; 4HPL B; 1F2R C; 3PLU A; 5JXV A; 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