The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
82
|
structure length |
82
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Chain Sequence |
DTKIIYHMDEEETPDLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFKSMDQDFGVVKEEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1
|
| publication title |
Molecular basis of WNT activation via the DIX-domain protein CCD1
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Signaling protein
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| total genus |
12
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D5G A; 1WSP A; 3PZ8 A; 3PZ7 A; 4WIP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NNJ B; 2AX5 A; 1RLF A; 3AH7 A; 1MHX A; 4JE3 B; 3VR8 B; 1QIL A; 2D3C A; 3NG0 A; 3BK1 A; 1YQB A; 3RN9 C; 1RWS A; 3ZTC A; 2WXJ A; 2LZ6 A; 2LVP A; 1K50 A; 3AEG B; 2NPT B; 3MHS D; 5C2T B; 4ZYS A; 4E71 A; 1WR1 A; 3ZDM C; 1RAX A; 3DVN V; 2WS3 B; 2JY6 A; 4JIO U; 1JQ4 A; 3SR6 A; 5G5G A; 3MJW A; 1Q1O A; 1S1Q B; 3PGE A; 1OFF A; 1EU3 A; 4HDO A; 1T0R C; 1J7C A; 1BT0 A; 1IGC A; 1WJN A; 3I63 C; 3B0A A; 3AU4 A; 3BIN A; 5BYR A; 1WX7 A; 4MEM A; 3UI3 A; 1JCK B; 3M95 A; 1XLN A; 2YVC A; 3AEE B; 3KUD B; 1OEY J; 1HEZ E; 5DCN A; 3EA6 A; 1XLO A; 2ON8 A; 5BO4 B; 3VH4 B; 5BMG A; 2NCN A; 1MPE A; 2BYT A; 3NVZ A; 3M62 B; 5HG2 A; 2WXR A; 2ZVO A; 2LD9 A; 1N6Z A; 2K1F A; 2LVQ A; 1N62 A; 1QOF A; 3Q69 A; 4WJP A; 2KAC A; 1V1P A; 2DLB A; 2G9H D; 2KZR A; 4PS3 A; 4BKT A; 2BKF A; 2KDE B; 2EKI A; 5IAA C; 2MRP A; 2MJD A; 4GDL B; 2MJE A; 1F77 A; 3FC4 A; 3BII D; 5HFY A; 3ZNZ B; 4XDD A; 1C9F A; 3V6C B; 3DCG A; 1YN3 A; 4X57 B; 2VZK B; 1YJI A; 4WIP A; 4KGR A; 1YQ3 B; 2QDF A; 4YTN B; 4TV3 A; 1T3Q A; 2YLM A; 3IT6 B; 2JPH A; 3PZD A; 2WDQ B; 2GBN A; 2LGI A; 1Z2M A; 3ZJU A; 1TTN A; 4MH8 A; 4ANW A; 3V05 A; 1XF5 L; 4W9I A; 3NVV A; 1ACC A; 3RNB C; 1V97 A; 2FNJ B; 1UF0 A; 2J52 A; 4GU2 A; 1YD8 U; 2KTR B; 2OHF A; 4IDI A; 2JX5 A; 2DNF A; 4MGZ E; 4BFR A; 4RF0 A; 3APF A; 1C3T A; 4WUR A; 3PT2 B; 4GB9 A; 4TKN A; 5GXG B; 5LLI A; 2LAS A; 2M1M A; 5FR3 A; 2BW2 A; 4JLC A; 3R2T A; 3RYT A; 1WF9 A; 1PGX A; 3APD A; 5HI1 A; 3W2D A; 2J4X A; 2QEJ C; 4M01 A; 4JPS A; 4Q2J A; 1WGG A; 1WXQ A; 4W9F A; 2VZK D; 2A5U A; 2L0T A; 2IO1 B; 2R2Q A; 3SD5 A; 4NQK E; 4AP4 C; 1FRD A; 2RMM A; 4K7W A; 4C7Z A; 2XK5 B; 1WRD B; 2B3A A; 5AUI A; 4RGO S; 3AE7 B; 2LMC A; 4LJP B; 3IG3 A; 1V80 A; 1UWM A; 4IUM B; 3TEX A; 4M8N A; 5H8Y E; 2KDB A; 1KRH A; 2D3B A; 2KQ7 A; 1ZDX A; 4HRO A; 4IWP A; 3ZYY X; 4LNF A; 2KVR A; 3L0W B; 2NPT A; 1T0Y A; 4HWI B; 1E7P B; 2IDY A; 3VHT C; 3TJP A; 1A70 A; 2QSD A; 2ZPY A; 1SE3 A; 1WR6 E; 4TUU A; 1VDV A; 3JVZ X; 2JT4 B; 2WGS A; 4GDK B; 1WJ6 A; 3APC A; 5J18 A; 4IKG A; 2Z0E B; 5J2R A; 3S2A A; 1SIF A; 2WU5 B; 4REZ A; 4ANU A; 1AW7 A; 2FCM A; 2KDM A; 2JXT A; 1TT5 B; 1QKZ A; 5JHB A; 3P42 A; 2LGY A; 3LB8 C; 4OZA A; 4YSX B; 1E6E B; 4GGQ A; 4F1S A; 1Q0W B; 1JWS D; 1DYQ A; 5CHF A; 2QJL A; 3OLM D; 2L83 A; 2MBO A; 2CHX A; 4D2K A; 2C7N B; 2RD0 A; 4ICU A; 4KGS A; 2N1V A; 4MDK E; 3T9L A; 4US9 A; 4LNI A; 4CHK A; 1WWT A; 2B76 B; 3L16 A; 2VH1 A; 2PE9 A; 3DBR I; 3ZXR A; 3FIL B; 3C0R B; 4C56 C; 2JRH A; 4WAF A; 4J6I A; 3KVF B; 3NY5 A; 1IGD A; 1DOI A; 4YSY B; 4GDL A; 4OZC A; 3MJ5 A; 1I4G A; 3IBE A; 1HTQ A; 1I4X A; 3ZW3 A; 5IP4 D; 3W5U B; 3KW5 B; 3A4R A; 3RI7 C; 1QOA A; 1SSN A; 2V3N A; 3RUL A; 4WJQ A; 3V60 A; 4WWO A; 3W1S C; 5E6O A; 3X0W A; 1FFV A; 1QZE A; 4HRS A; 4LTU A; 4DDG D; 1NYR A; 2JZZ A; 3GE8 C; 2I2Y A; 1EM7 A; 3P4Q B; 1HE8 A; 4A9A A; 4P1B C; 3P4R B; 2JUO A; 3ML9 A; 3H1U A; 1WXS A; 1XLQ A; 3VTV A; 1FCL A; 2K6Q A; 2LRU A; 1QOG A; 4KDI C; 4US8 A; 2KTR A; 3Q8A A; 2D3A A; 1F2R C; 4DDI D; 4KSK C; 5LXI B; 1I35 A; 2V3S A; 3AE5 B; 1I4H A; 3E56 A; 2LJ5 A; 2BF8 B; 5IO9 A; 1EF5 A; 3H9D A; 4AJY B; 1RFA A; 2OOB B; 1WH3 A; 2CHZ A; 4A90 A; 1P9D U; 2MBB B; 1FM0 D; 2V4L A; 2LUE A; 2RR9 A; 4WH4 A; 1UEL A; 1Q10 A; 4BBN C; 1TS4 A; 4ACF A; 3WAN A; 2XK5 A; 3E9S A; 3MC9 A; 3PVL A; 4TSS A; 2KOX A; 1N5X A; 2CJN A; 4K1R B; 4ZRP A; 1GC6 A; 1ISN A; 3ZDT A; 2MCN B; 4ZRJ A; 2N9X A; 1RM6 C; 3TEZ A; 2A4Z A; 4MM3 B; 5DPS A; 2LGX A; 2WXG A; 3EFU A; 1GB1 A; 2FCN A; 1U4A A; 4JQW C; 1K52 A; 2R61 A; 2KO3 A; 2MX2 A; 1WMH B; 1PYW D; 1FMA D; 3WAP A; 3WCQ A; 1E8X A; 4BZA A; 4P16 A; 1XLP A; 1R4N I; 1ET9 A; 4GDK A; 2CR5 A; 5AZF A; 2UU7 A; 1I42 A; 1L0V B; 4FBJ B; 3AM9 A; 3EEC A; 1UGM A; 3RNA C; 3W1S A; 3DWG C; 2PLP A; 3U52 E; 4CO7 A; 1NDD A; 5AUK A; 3C19 A; 4MGY E; 2Z0D B; 4EZJ A; 3DBH I; 3OAW A; 3VRA B; 1BXT A; 2YEP B; 4DHZ B; 2N1W A; 3HVZ A; 1FNV A; 4CYE A; 1KJT A; 1FEH A; 2J0J A; 3HK0 A; 1FXI A; 1QQR A; 4I6L B; 4HPL B; 2N0S B; 1ZXH A; 5C1Z A; 2DYB A; 4XDC A; 3DBL B; 4GIV A; 3FIL A; 3BVZ A; 2JWZ A; 2KYW A; 1AWD A; 1I7H A; 3GE3 C; 1TKG A; 1FNW A; 1T6B X; 4M02 A; 1VR9 A; 1D6E C; 3R8B A; 2FCS A; 3VTU A; 5JHA A; 1WGR A; 1XO3 A; 4HK2 A; 1KOT A; 3EGR A; 5T8I A; 4KKJ A; 3AB5 A; 1PGB A; 4K3B A; 1FFU A; 2DYO A; 2O2V A; 3LJ3 A; 4HVB A; 3Q3N C; 4IOI E; 3ZXV A; 2UYZ B; 4N6E B; 4BBN F; 4EOY A; 2WWZ A; 3LYY A; 3ECI A; 2X8X X; 1ENF A; 4OHJ A; 4II2 B; 1I4P A; 4LCD E; 4DXF A; 3A4S C; 3VRB B; 2KKC A; 2K0P A; 2L76 A; 2DX5 B; 1ZW7 A; 2AQ1 B; 4I6N B; 2FID A; 2O6V B; 1SXT A; 3ENE A; 4NPN A; 3R3M A; 2HD5 B; 1E10 A; 2WNM A; 1VZ8 A; 1N61 A; 3V3X A; 5HKH A; 2XBB C; 1TS5 A; 1RYJ A; 3Q14 C; 3W1Y A; 3TBL D; 3VTW A; 1CZP A; 4MJS B; 5IOI A; 3DQV A; 5E6J A; 1L6V A; 2RPQ A; 3RNG C; 1FO4 A; 4GOC A; 1WYW B; 3CMM B; 1R4N B; 2R2O A; 1PQS A; 1T0Q C; 3VR9 B; 2C9W B; 2ZJD A; 1E8Z A; 3UIN B; 5JZE B; 3BZD B; 4IM0 A; 5MPO A; 1AYF A; 3LDZ E; 4MM3 A; 3QAR A; 2IO2 B; 1LXD A; 2MJ3 A; 3A9J B; 1V2Y A; 3MC0 B; 2O6V D; 2WX0 A; 2D3G A; 2DAF A; 3DVN U; 3TSS A; 1L0X B; 2NTT A; 5JXV A; 4W9C A; 1WMH A; 3VAW A; 1F0Z A; 1P3Q U; 1VCB A; 2DZI A; 5CTR C; 4HPM B; 2KN5 A; 2TSS A; 3AE4 B; 1XCQ L; 1YX6 B; 1VZ6 A; 2Q5W D; 3HM3 A; 1ET6 A; 5CX3 A; 2N9P C; 2IY1 B; 2BBC A; 2WXH A; 3AE6 B; 5DPT A; 2IJ0 A; 5IA7 A; 1LM8 B; 4FA6 A; 4BKS D; 1WX9 A; 2WP9 B; 2ZPN A; 4XWW A; 4FHK A; 1OQQ A; 1PDX A; 1XCT L; 2WU2 B; 2GBM A; 2MQJ A; 3OJ4 B; 1WXA A; 1T0S C; 3ZJV A; 4ARC A; 2KC2 A; 1V49 A; 2IGG A; 3H6N A; 5LXH A; 1KTK A; 2DEN B; 2KNB A; 3N30 A; 4RM8 A; 3O65 B; 2MSE D; 2IBI B; 1KLU D; 3N3K B; 2WQY B; 1WXM A; 4ZDV A; 4KV2 A; 3NHE B; 1UNS A; 4TQ0 A; 2FIF A; 1ROE A; 3R7Q A; 4DHJ B; 2KQS A; 2BVC A; 5BYQ A; 2MLB A; 2KTF A; 3I9V 1; 3WAO A; 3PRE A; 1CMX B; 1ZGU B; 3DVG Y; 1YNT E; 5J17 A; 1IYF A; 1DOY A; 3ML8 A; 2LXC A; 4KVG B; 1HTO A; 2L1A A; 2V3P A; 4GN1 A; 3R2I A; 1J0G A; 5TSS A; 2JXX A; 1V5O A; 2HTM E; 2HJ8 A; 2N4F A; 4XWT A; 1Y56 A; 3PRZ A; 3GB1 A; 4PK1 A; 5AZH A; 3PLV A; 1STE A; 2GBK A; 2KDI A; 3VH3 B; 2IGD A; 2ASQ A; 5G55 A; 3DVG X; 1TY2 A; 4GLS C; 4ZHP A; 4M8M A; 3BYT B; 1TS2 A; 1KM7 A; 4NZL B; 2KMA A; 3CST A; 4YTP B; 3Q8C A; 2KWV B; 3GS2 A; 2RPV A; 4WWM A; 2O6V A; 5FK9 C; 2KDF B; 3QX1 A; 1LO5 D; 4FJZ A; 1L4D B; 2LRW A; 4WWN A; 2MA9 B; 3PO0 A; 2UWQ A; 1P7E A; 2SEB D; 1Y8R C; 2JU6 X; 2WXN A; 1V1O A; 2MHJ A; 3P4P B; 3TCA A; 3L13 A; 2QC8 A; 3SFE B; 1QF6 A; 2EMT A; 3I3T B; 4DHJ D; 4MJS A; 2LGD A; 3RT3 B; 1G6J A; 3AXC A; 3VUY A; 4BKS A; 3B2G A; 3ZIM A; 4OVU A; 4A55 A; 4NAM A; 1JML A; 3H8H A; 4JWU C; 1RFK A; 4FXC A; 4TMA B; 4PS8 A; 1C1Y B; 3NZS A; 3RMK C; 1D4B A; 4KIK B; 3ZO5 B; 4WJO A; 2LFI A; 3URY A; 4C00 A; 3R66 C; 3Q3M C; 2MP2 B; 2KX3 A; 3PV1 A; 3ETR A; 3Q6B A; 2FUG 1; 2D07 B; 3VXW A; 5HHD G; 4YL8 A; 3A9J A; 3V62 A; 2LVO A; 3BK2 A; 2V1Y A; 1L6U A; 2E6X A; 3ZGZ A; 3T3N A; 2N9L A; 2D5G A; 1ZDV A; 2L8J A; 3HRD D; 2ICI A; 2KWC A; 4NQL B; 4EEW A; 3MHZ A; 4H2A A; 4K81 A; 4BAX A; 4ARI A; 4BOZ B; 1B1Z A; 4HCP B; 1ZP0 B; 4E74 A; 4DWF A; 3U7Z A; 1XXG A; 1FD6 A; 2PJH A; 1I4Q A; 2AQ2 B; 4YWG G; 3GOE A; 4LNN A; 4DHZ E; 3ALB A; 2H89 B; 3OG5 A; 1YOV B; 3P63 A; 3ZNI D; 4B6W A; 2Y5B B; 2JF5 A; 2KJR A; 1KLG D; 5I4D A; 2KLG A; 1UH6 A; 2KN4 A; 4B0E A; 3T3O A; 1M94 A; 3WIM A; 1NEN B; 3EC8 A; 1SJH D; 3HHM A; 4FAD A; 4M0W A; 1JWU D; 2I38 A; 2BYE A; 3N9Y C; 2KJ6 A; 4DK5 A; 2KWD A; 5JH5 C; 1NBF C; 2NR2 A; 4M00 A; 2K8C A; 1SB3 C; 1WJ4 A; 2QIE B; 2O2V B; 2KAJ A; 4AUQ C; 2FE8 A; 3AMZ A; 4MH0 E; 1ZKH A; 2GRI A; 1X1M A; 5E6P A; 2KWU B; 2J42 A; 1D3Z A; 1HXY D; 2JSV X; 2K8B A; 3U4E G; 4KZ0 A; 2ZZP B; 4ANV A; 1NI2 A; 1J7A A; 1NEK B; 4P1C C; 4KGT A; 4A6Q A; 5C23 A; 1UZX B; 2PW9 A; 2KX0 A; 4W9D A; 4WQO B; 1VRA B; 2L00 B; 2BYV E; 2K39 A; 3N1X C; 3CSF A; 1TJE A; 1MI0 A; 4KKI A; 2WXQ A; 2DZK A; 1YN4 A; 3KWL A; 2NBU A; 3H7P B; 1MFW A; 1JRO A; 2DZJ A; 1PGA A; 1JAL A; 1MHH E; 1VZ7 A; 2N7E A; 4P7I A; 4W9H A; 2G4D B; 1QLB B; 2M19 A; 4ASW C; 3AED B; 2KJH B; 1V9J A; 1FPY A; 4IM2 A; 4IG7 B; 1N5W A; 1WFY A; 5D7G A; 3QK0 A; 4OVZ A; 4ZYN A; 1TGZ B; 3L08 A; 3MC8 A; 2EEL A; 4RGT A; 1EF1 A; 1OQR A; 1N60 A; 1TS3 A; 2AYO B; 3RUI B; 1ZOY B; 3I5J C; 4RCO A; 4EKU A; 1FIQ A; 1MVK A; 3PSE B; 1WE7 A; 2LGS A; 4PYU A; 2L0F A; 4ANX A; 3D32 A; 4KSL C; 1WZ3 A; 3AE8 B; 2IO3 B; 1F52 A; 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4A3P A; 4RGM A; 4BKG A; 5BYS A; 4HCN B; 1MG8 A; 3DHG C; 3A9K B; 3SDL C; 1FNU A; 3SU8 X; 5GMV A; 3DHI C; 5G2N A; 4A8X C; 5AEK B; 1UWX A; 2BGF A; 3WA0 A; 3IT4 B; 2ZCC A; 3L17 A; 1LQB A; 3IVF A; 1A5R A; 4DBG A; 2L7R A; 1SIJ A; 2ZNV B; 2IO0 B; 2C5L C; 3Q8F A; 4B95 A; 3H7P A; 2Z59 B; 4RF1 A; 2FBW B; 3N32 A; 5L95 C; 4G50 A; 3NOB A; 3L54 A; 5IKC M; 2HDE A; 2BS3 B; 4NJC A; 1E0Z A; 3M3J A; 3PLU A; 2MBQ A; 2Y3A A; 1C76 A; 2BYF A; 3VUX A; 3MP9 A; 3CIR B; 2EKE C; 3IAS 1; 4GMV A; 2J0K A; 3SFD B; 4ZOH C; 4XX5 A; 2ACZ B; 2KLC A; 4JX1 C; 4AOF A; 4C7Y A; 1GAQ B; 3V61 A; 4WWP A; 5G5H A; 3ZNG C; 4G11 A; 3PZ7 A; 4OVV A; 1AAR A; 2KHW B; 3KLS X; 1R7S A; 3AEB B; 3N1Y C; 3HVD A; 1L2N A; 3B1L X; 1KF6 B; 1EUV B; 4MAC A; 3UIO B; 2BT6 A; 3DBH B; 2PE6 B; 3EUB 2; 1P98 A; 1YIW A; 2CHW A; 2K8H A; 3JSV B; 2ZNV C; 4N58 A; 3DDC B; 1E8W A; 3CWI A; 2L32 A; 1KH0 A; 3AI5 A; 5BMI A; 2WXI A; 5FKA C; 1F9J A; 3ZNH B; 1JRU A; 3RFZ B; 4FHJ A; 1WGH A; 1SE9 A; 1BML C; 4G0N B; 3BVM A; 3KH0 A; 2INN E; 2IY0 B; 2ONQ A; 2WLB A; 2IZV B; 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