The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGIAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Gb98
|
| publication title |
Mutational tipping points for switching protein folds and functions.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Artificial gene
|
| molecule tags |
De novo protein
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| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2N9L A; 1F2R C; 2I2Y A; 2RMM A; 2J52 A; 5HFY A; 1K50 A; 2IGG A; 5BMI A; 1K53 A; 1PGX A; 1QKZ A; 2GI9 A; 1YNT E; 1IBX A; 4HJG E; 1IBX B; 1PGB A; 4IKG A; 1XF5 L; 2JU6 X; 1F2R I; 5BMH A; 2RPV A; 1UWX A; 2ZW1 A; 1ZXH A; 3MP9 A; 3UI3 A; 2ON8 A; 2PTL A; 4OZB A; 1K52 A; 3V3X A; 4KGT A; 1MHX A; 3GB1 A; 1C9F A; 2ZW0 A; 4KGR A; 4MAC A; 1FCC C; 1IGC A; 1Q10 A; 2JXT A; 2LUM A; 2KDM A; 4WH4 A; 2J53 A; 2I38 A; 2JSV X; 2LHD A; 2QSD A; 1MPE A; 1GB1 A; 2KQ4 X; 1XCT L; 1IGD A; 1YMH E; 2NMQ A; 1PGA A; 5HHD G; 5HI1 A; 4IOI E; 5HG2 A; 2EEL A; 2GB1 A; 2N9K A; 2QMT A; 2IGD A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 2N7J A; 1HZ5 A; 5JXV A; 1D4B A; 2LGI A; 4D2K A; 5BMG A; 1P7E A; 3FIL B; 2ONQ A; 1K51 A; 1EM7 A; 1FD6 A; 1P7F A; 1GB4 A; 2OED A; 4OZA A; 1KH0 A; 1JML A; 2JWU A; 2KAC A; 1HEZ E; 4OZC A; 4KGS A; 2PLP A; 1FCL A; 1MHH E; 1XCQ L; 2LHE A; 4HKZ E; 3FIL A; 2KWD A; 2JZP A; 2IGH A; 2PW9 A; 1MVK A; 4GLS C; 2KN4 A; 2K0P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RYT A; 1WFY A; 4G50 A; 1K50 A; 3Q3N C; 4BBN F; 1ACC A; 4TSS A; 2DYB A; 1FFU A; 4MSQ B; 3L13 A; 1ENF A; 3EHV A; 1XLO A; 3BYY B; 1F9J A; 3DVG Y; 4JE3 B; 1E5W A; 1WI0 A; 1QIL A; 3DHG C; 3AEE B; 2AL6 A; 1JRO A; 4DHZ B; 3BY4 B; 3KUC B; 1FXT B; 3AE6 B; 2QIL A; 1SB3 C; 4LDT D; 1YX6 B; 3B2F A; 2KWC A; 1MFW A; 3KYD D; 1WJ6 A; 4C4V B; 3DBH B; 2I38 A; 3IG3 A; 3VH4 B; 3DDC B; 3NY5 A; 3Q8C A; 1WJU A; 2JWZ A; 2INP E; 1J19 A; 3V61 A; 1GOZ A; 4HPM B; 1ISN A; 4ZOH C; 1HTQ A; 1UEL A; 2JZZ A; 3ZXR A; 3TEY A; 3GE3 C; 3KQ4 A; 3TIX A; 4ZHP A; 1TY0 A; 1UGM A; 2G1E A; 4FJV B; 4J6I A; 1KRH A; 3VUY A; 1YOV B; 2IO2 B; 2WXF A; 4G11 A; 3PGE A; 1KF6 B; 1GPX A; 2M17 A; 3VAW A; 2BKF A; 2XEW A; 2LJI A; 4BKG A; 1HEZ E; 1A5R A; 4LJO B; 4JWU C; 4OVZ A; 2Y5P A; 2QIE B; 4MEL A; 1SE2 A; 2DZM A; 5IP4 D; 2B3A A; 2M0X A; 3M63 B; 2GBM A; 2KQ7 A; 3AN1 A; 4USA A; 2MCN B; 1WRI A; 2MA9 B; 3RNG C; 4DXA B; 2BYV E; 2K0P A; 3APF A; 2RR9 A; 2YLM A; 4TQ0 A; 2LRU A; 3TBL D; 1C4A A; 1ET9 A; 1FNV A; 1AWD A; 4DQO C; 1V2Y A; 1ZGU B; 2WXR A; 1N61 A; 2OJW A; 4XDC A; 2MHJ A; 3MHS D; 3URY A; 1WGR A; 2MX2 A; 3Q3M C; 4K7U A; 3FAH A; 2KT7 A; 2GRI A; 4HRO A; 1MHX A; 3VHT C; 2ZW0 A; 3ZTC A; 3SHQ A; 2D3C A; 4TUU A; 3V60 A; 5EE0 A; 4KSL C; 3KWV A; 1N63 A; 3TEX A; 5IN7 A; 4WUR A; 1XXG A; 5D2M B; 2PJH A; 2KJ6 A; 2WXL A; 2MWS B; 1QOF A; 3I5J C; 2JSV X; 4KIK B; 3K9O B; 1VLB A; 2HD5 B; 4W9C A; 2FUG 1; 2V3P A; 2RD0 A; 3N1Y C; 2Y5C A; 4A3O A; 2EEL A; 2G4S A; 1TGZ B; 2L05 A; 3H8H A; 4GGQ A; 5JXV A; 4GXB A; 1GJZ A; 3X23 A; 1V97 A; 2G3Q B; 1TS4 A; 4HLE A; 4KIK A; 2RGF A; 1KJT A; 1SF0 A; 4B0M A; 1JML A; 1BT0 A; 2INN E; 4W9K A; 2BS3 B; 1TKY A; 2ZJD A; 4BFR A; 1QZE A; 5GMV A; 2IO3 B; 1YJ1 A; 2EMT A; 2FIF A; 1LGR A; 3GE8 C; 2W9N A; 1VDV A; 1TYG B; 2IPK D; 2QJL A; 3DQV A; 1BUI C; 1C76 A; 3APC A; 2IGG A; 5BMI A; 1SBB B; 2XK5 B; 3TEZ A; 2O6V D; 2SAK A; 1WR1 A; 2O2V B; 3X0W A; 3U30 A; 4R3D A; 4WIP A; 4WWN A; 2V0G A; 3N1Z C; 2BYF A; 2RPV A; 5H92 C; 1KLU D; 1EUV B; 1V5T A; 5EE3 A; 4YSX B; 2K1F A; 1XEE A; 1KLV A; 4OVU A; 1OQR A; 1I35 A; 2LI5 A; 4AQ7 A; 3RNF C; 4HEA 1; 2O2V A; 2UU7 A; 3IHP C; 5C2T B; 5JHA A; 1NEK B; 2MRP A; 2L83 A; 2NCN A; 1VJK A; 1E8W A; 2DYO A; 3A9J A; 1BML C; 1UZX B; 2QSD A; 4N59 A; 3W1S C; 1WY8 A; 4NAW B; 1PUT A; 2CR5 A; 2IGD A; 4FHK A; 2CKH B; 4CHK A; 2ZEQ A; 4NJC A; 4KKI A; 1IYF A; 2AQ3 B; 1V80 A; 1TBE A; 3PZ7 A; 1P7E A; 1WE7 A; 2G9H D; 2KC1 A; 2Z8L A; 2BWE S; 2MH7 A; 1TJE A; 2KVR A; 1TS5 A; 3QA8 A; 3ZJT A; 1E7P B; 2LVO A; 2MJE A; 4YSZ B; 2DZK A; 2BBC A; 2N7D A; 3VUW A; 2BVC A; 4HRS A; 4ASW C; 2IGH A; 2WXQ A; 1I4X A; 1F0Z A; 1F2R C; 4HJK A; 4ZYS A; 5HFY A; 4RF0 A; 3RPF C; 4EE2 A; 3E9S A; 1ZDX A; 1SGH A; 1YNT E; 4AS1 A; 1NBF C; 4RH6 A; 4P7I A; 2MBO A; 1T5X D; 2KKC A; 1XD3 B; 2JU6 X; 4LNI A; 1FIQ A; 5CHF A; 2REX A; 3QWZ B; 3IT4 B; 4PS8 A; 3TEW A; 5IKC M; 2J7Q B; 1ZKH A; 1GAQ B; 4DXF A; 3EEC A; 3I57 A; 2RSU A; 3V3X A; 4JIO U; 3ETR A; 3ZKJ C; 4KGR A; 1FCC C; 2JXT A; 3Q69 A; 4US8 A; 2L1A A; 3ZIM A; 2PE9 A; 1C4C A; 2ZVN A; 3QJZ A; 4A6Q A; 2IDY A; 1LO5 D; 3NHE B; 1QT9 A; 3QQ8 B; 3ZRC A; 4W9H A; 3W5U B; 2DHZ A; 3U2S C; 2WWZ A; 3SR6 A; 4M00 A; 2NMQ A; 3DOW A; 2L0T A; 3MC0 B; 1SE4 A; 2MSE D; 2WXK A; 4ZYN A; 2QMT A; 2BYT A; 1UGJ A; 2BB6 A; 3H7P B; 3RI7 C; 1TKE A; 3RFZ B; 4FA6 A; 1QOB A; 3VR8 B; 2BQQ A; 3Q3J A; 4FHJ A; 4IM2 A; 3ZDM C; 4EOY A; 2NVU I; 4FXC A; 1WMH B; 3AE1 B; 4YWG G; 2FAZ A; 2FCS A; 1RM6 C; 1R4M I; 2MBE A; 4KGS A; 2K39 A; 3CST A; 1ROE A; 1WWT A; 3M95 A; 1T6B X; 3EC8 A; 1RAX A; 1WJN A; 2VH2 A; 1WMH A; 2ZPY A; 1YN4 A; 1WXA A; 1V9J A; 3L17 A; 2O6V A; 4NAM A; 2DNF A; 1K53 A; 1PGX A; 2WDV B; 3N9Y C; 4WWO A; 1PGB A; 2BW2 A; 2ZZP B; 3JVZ X; 3DHH C; 1VZ7 A; 4REZ A; 1UNS A; 1L4Z B; 2G4D B; 1C78 A; 3AE3 B; 3SD5 A; 2DAJ A; 2CJO A; 3DHI C; 4DK5 A; 1RFK A; 2QDF A; 2PTL A; 1DOY A; 3BVG A; 4RGT A; 3RNA C; 1CJE A; 2K6D B; 2VZK D; 4GDL B; 1EO6 A; 2J0K A; 2LVP A; 3IAS 1; 3LJ3 A; 5D94 A; 1MJD A; 4LLG M; 2GBN A; 3VRB B; 2JRI B; 2WXG A; 4WAF A; 1D3Z A; 3PZD A; 5D6J B; 3RZW C; 1XQQ A; 2K9X A; 1F1H A; 2GLS A; 5J17 A; 3IT6 B; 2KDB A; 4W9G A; 4IG7 B; 1K8R B; 1HA5 A; 2OOB B; 2MBH A; 1JWB D; 2KJR A; 2LGD A; 2MQJ A; 4MEM A; 5H8Y E; 1TZO A; 2KZR A; 3VH3 B; 2KO3 A; 1BXT A; 3KUD B; 4KZC A; 3UIP B; 2KTF A; 4A8X C; 2ZVO A; 3WIM A; 4IM0 A; 2IZV B; 1QF6 A; 4DHJ D; 4ACF A; 2WYQ A; 1XLQ A; 2JZ3 B; 1SIJ A; 3V05 A; 4A90 A; 1C1Y B; 4B95 A; 3L0W B; 1XCQ L; 4NY0 A; 2JY6 A; 4X57 B; 4K3C A; 5IO9 A; 4K7S A; 1R4M B; 3T3N A; 3Q14 C; 2WXP A; 2BGF A; 3L10 B; 1CMX B; 2VH1 A; 2RDH A; 2LGX A; 4J3O D; 4W9D A; 2FCQ A; 2BT6 A; 3U7Z A; 1OEY J; 4HJG E; 4JWS C; 3M3J A; 4PS7 A; 1YX5 B; 1WZ3 A; 4IKG A; 1WGY A; 5BMH A; 4ICV A; 3LDZ E; 1JWS D; 2I1J A; 1YQ4 B; 2JRH A; 1WE6 A; 3A1Q A; 2L76 A; 1S3S G; 4W9L A; 1E7V A; 4AOF A; 2CHZ A; 2INC C; 4G0N B; 3WAN A; 1SEB D; 4FLH A; 2HE7 A; 4B6W A; 1T0R C; 1NEN B; 4AJY B; 3QC8 B; 4HDQ A; 2JT4 B; 3BZD B; 1V1P B; 3LYY A; 4N58 A; 3MJ5 A; 3PVL A; 3WAL A; 3C0R B; 3KLS X; 2LHD A; 3HK0 A; 1Z5S B; 2TSS A; 4II2 B; 3I3T B; 3ECI A; 2WXI A; 1FXA A; 1Q5W B; 2B76 B; 1T0S C; 4XWW A; 3N1X C; 2JF5 A; 4MGZ E; 1V1P A; 1AYF A; 4WJN A; 1VCB A; 2KMC A; 4FJY A; 2PE6 B; 4MSM B; 1YJI A; 3OAW A; 2HJ1 A; 2ZCC A; 2D3G A; 2ASQ A; 4HK2 A; 4MM3 A; 4K7W A; 5E6N A; 2BF8 B; 2JX5 A; 2E3T A; 2KDF B; 2KAC A; 3BYT B; 4L1B A; 2PLP A; 2NTT A; 1AAR A; 3UIO B; 2FBW B; 1D5M C; 1VZ8 A; 2M4N A; 3K9P B; 1UF0 A; 4BKS D; 1S1Q B; 3W9C B; 2N9L A; 4M01 A; 2DYM A; 4RF1 A; 1VZ6 A; 2DWQ A; 4GU2 A; 2ZNV B; 4HKQ A; 5CTR C; 3PV1 A; 4JLC A; 1QOA A; 1OFF A; 3TCA A; 3ZO5 B; 1LQB A; 1OQQ A; 5AZF A; 3QAR A; 4MH8 A; 3AV8 A; 3RD2 A; 2ACZ B; 4I6L B; 4ARI A; 1XF5 L; 1WX7 A; 3BK2 A; 2WDR B; 2K3U A; 2WX1 A; 5KHO A; 4FUL A; 2V3S A; 3ZNH B; 2C5L C; 4XC2 A; 1E8X A; 3E56 A; 3R7Q A; 5C23 A; 2ON8 A; 4FJZ A; 4ZRQ A; 4AJW A; 2V4L A; 2R61 A; 4F7Z A; 1Q10 A; 4NZL B; 2KDM A; 4HPP A; 3A4R A; 1X1M A; 3HUI A; 4JX1 C; 2KMM A; 1IPG A; 4TV3 A; 4YTP B; 3NVV A; 2NPT B; 3AE7 B; 4AUQ C; 2WNM A; 1FMA D; 3ALB A; 5HI1 A; 3KYC D; 1GUA B; 3IAM 1; 1WYW B; 2C7N B; 2X38 A; 4W9F A; 3H6N A; 4WWP A; 1WRD B; 2PMV A; 2NPT A; 3AXC A; 1ZDV A; 2KYW A; 2M56 B; 4M8N A; 4O1N A; 3N3K B; 1C77 A; 5L83 A; 1PDX A; 1VD2 A; 5BYR A; 2L3Z A; 4RCO A; 1C3T A; 3VTV A; 2W82 A; 2GBJ A; 2BWF A; 2D3A A; 4OZC A; 2E6X A; 4JL9 A; 3VVW B; 1IUE A; 2LAS A; 3DBR I; 5AUI A; 2WXH A; 4MJS A; 1YN5 A; 2JQR B; 2N9P C; 3M62 B; 3OJ4 B; 4PT5 A; 4HPL B; 2EKI A; 2NBU A; 3L54 A; 3PS6 A; 2LD9 A; 3C19 A; 3QHT A; 1IBX A; 3DBL I; 1YQ3 B; 5DPS A; 5AZH A; 3B1L X; 2V1Y A; 2K8H A; 1GG3 A; 2EKE C; 3RCZ A; 3U7D A; 3R2I A; 3WAM A; 3AED B; 4S0R A; 1ESF A; 1SE3 A; 2AQ1 B; 1UWX A; 3CIR B; 4WAA A; 2L7R A; 4L2Y A; 3UI3 A; 4RNA A; 3R7R A; 3NZU A; 4DDI D; 4W9E A; 1F52 A; 1WXQ A; 3AI5 A; 3TSS A; 4LDT B; 3P4S B; 2FCM A; 2KMA A; 4BOZ B; 2WX0 A; 3VXW A; 2W3R A; 3ZDT A; 2V9H A; 3ONS A; 4P1B C; 1XT9 B; 1FNW A; 1P3Q U; 4XYC A; 3RNE C; 3NUH B; 1AW7 A; 3A9J B; 1WM2 A; 2KN5 A; 1XCT L; 4DDG D; 1L7Y A; 3AMZ A; 1PGA A; 2MBQ A; 2MJ3 A; 5BYQ A; 1RFA A; 1HZ5 A; 2KVZ A; 4P6V F; 4PS3 A; 2MEK A; 4D2K A; 4GB9 A; 4WWM A; 2C60 A; 2M0A A; 3OWE B; 4K81 A; 1K51 A; 1I7H A; 3ZUN A; 4ZRK A; 3HHM A; 2K22 A; 3HVD A; 3PHX B; 2RDB C; 5E6O A; 4BVU C; 4RMA A; 2YEP B; 3QK0 A; 1MHH E; 2PKO A; 5FKA C; 3QIJ A; 3RUI B; 3ZJV A; 2LVQ A; 2D11 A; 3CSF A; 4ANV A; 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