The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLILNLKQAKEEAIKEAVDAGIAEKYFKLIANAKTVEGVWTYKDEIKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
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| source organism |
Artificial gene
|
| publication title |
Mutational tipping points for switching protein folds and functions.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Gb98
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| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QMT A; 2JXT A; 2KQ4 X; 3FIL B; 4KGT A; 1IBX B; 2ZW1 A; 1XF5 L; 1FCC C; 1PGB A; 2KWD A; 1HZ6 A; 1MHX A; 1K53 A; 4IKG A; 4OZB A; 2LUM A; 2GB1 A; 2KDM A; 5JXV A; 2QSD A; 2RPV A; 4KGR A; 1FCL A; 2LGI A; 1UWX A; 1IGD A; 1MVK A; 1P7E A; 2K0P A; 5HHD G; 2I38 A; 2NMQ A; 2IGD A; 2N7J A; 3UI3 A; 2I2Y A; 3MP9 A; 4OZC A; 4GLS C; 4MAC A; 2JSV X; 1F2R I; 4HJG E; 2IGH A; 5HI1 A; 3GB1 A; 2IGG A; 2N9L A; 1K50 A; 2GI9 A; 4WH4 A; 2JU6 X; 4HKZ E; 2J53 A; 4D2K A; 1YMH E; 2N9K A; 1PGX A; 2PLP A; 1XCQ L; 1JML A; 1XCT L; 1QKZ A; 2EEL A; 1K52 A; 1P7F A; 2JZP A; 1D4B A; 2RMM A; 1KH0 A; 1MHH E; 2KN4 A; 1IBX A; 2OED A; 4KGS A; 5BMI A; 5HFY A; 1IGC A; 1K51 A; 1MPE A; 3V3X A; 5BMH A; 1ZXH A; 2JWU A; 2J52 A; 1HEZ E; 1FD6 A; 2LHD A; 2ON8 A; 5HG2 A; 2LHE A; 1YNT E; 5BMG A; 2ZW0 A; 2PW9 A; 3FIL A; 2PTL A; 1MI0 A; 1GB1 A; 1F2R C; 1C9F A; 1PGA A; 2ONQ A; 4OZA A; 1HZ5 A; 1EM7 A; 1GB4 A; 1Q10 A; 4IOI E; 2KAC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WRI A; 3K9O B; 3SDL C; 2L52 A; 4QAY A; 2WDT B; 2V3P A; 5FKA C; 1I4P A; 1UUP A; 3WAM A; 4YSZ B; 5J2R A; 4ICV A; 3VTW A; 4A55 A; 5JHB A; 2RPV A; 1UD7 A; 1JRP A; 4ACF A; 4N59 A; 4ANW A; 2JY6 A; 2FAZ A; 2M56 B; 1E9M A; 3IG3 A; 4H2A A; 1GUA B; 3Q8A A; 5D6J B; 3U8Z A; 2E6X A; 3KYD D; 5DPR A; 3NVV A; 1I4R A; 4MAC A; 3ZXR A; 4W9L A; 2LGX A; 2N9L A; 4LLG M; 3NJT A; 4M02 A; 4NAM A; 2KDE B; 3VTU A; 4PYU A; 1SE3 A; 4X57 B; 3AU5 A; 1KJT A; 4FLH A; 4HKQ A; 1JWB D; 2EKI A; 1TKG A; 4WAA A; 2IPK D; 2KMC A; 5CHV C; 2BB6 A; 4JL9 A; 4XE0 A; 4F1S A; 4M8M A; 2CS4 A; 2JVC A; 1RFA A; 4NAW B; 2ACZ B; 2G1E A; 1HEZ E; 4HCN B; 3ZQ4 A; 3VRB B; 4XWT A; 1T3Q A; 2WQY B; 1KLV A; 4CHK A; 3W1Y A; 1QOB A; 4DDI D; 2PMV A; 4HXD A; 2KN5 A; 1WJ4 A; 3DVG Y; 2YEP B; 4GSW A; 2KQ7 A; 2X38 A; 3V6C B; 2ONQ A; 5AEK B; 1RFK A; 3W9C B; 3RZF A; 3P4R B; 4ZHO A; 2W55 A; 3QA8 A; 3IXS A; 4FN2 A; 3VHT C; 1FNU A; 3QWZ B; 2KJ6 A; 4DXG A; 3TBL D; 4GDK A; 1DOI A; 1QIL A; 4K7S A; 2KAC A; 4HWI B; 3H9D A; 2HDE A; 1FXT B; 2QIE B; 1JWM D; 4OVZ A; 2PJH A; 4KSL C; 5GMV A; 4C56 C; 4FJZ A; 1SJH D; 1HQR D; 3H8H A; 3ZDM C; 1HZ6 A; 1EF5 A; 1ACC A; 3URY A; 5E6N A; 2XK5 A; 2KDM A; 4M00 A; 1V1P A; 1WIA A; 2NVU I; 2QSD A; 4ZRQ A; 1C3T A; 3MHZ A; 1D5M C; 2MH7 A; 3PLU A; 3RNC C; 3RUL A; 5HHD G; 2MRP A; 2JXX A; 2FCN A; 3O13 A; 2KC1 A; 3U7D A; 2YVC A; 1WGR A; 2BKR B; 1KLU D; 3PPA A; 1YD8 U; 1ZXI A; 3FKY A; 2L83 A; 3AH7 A; 4IM3 A; 3NG0 A; 4IWO A; 2RD0 A; 2PKO A; 5IAA C; 4KDI C; 5DPW A; 2KDF B; 3EUB 2; 3H7P A; 4GMV A; 1KH0 A; 2XNA C; 1WJN A; 3ZGZ A; 2NS5 A; 1XLP A; 3APF A; 3AXC A; 1GPX A; 1YQ3 B; 4G3X B; 1IGC A; 3AE9 B; 1NDD A; 3PVL A; 4WJQ A; 4DHZ E; 4JE3 B; 2JWZ A; 1KOT A; 1ET9 A; 3ENE A; 3HVZ A; 5IO9 A; 2HTH A; 4NY0 A; 1R4M I; 2D3C A; 4XDC A; 1ZDV A; 3BK1 A; 2XN9 C; 2D11 A; 2PVO D; 1OQQ A; 4RGT A; 4CO7 A; 3BYT B; 3AM9 A; 3PV1 A; 1GC7 A; 3N30 A; 3APD A; 3NVW A; 3A33 B; 2Z0E B; 1ZUD 2; 3MJ5 A; 3RI7 C; 3TUO A; 3AED B; 2K3U A; 3SHQ A; 2LEK A; 1ISN A; 3FIL B; 4PYZ A; 3ZW3 A; 3X23 A; 1MFW A; 3GE8 C; 1C78 A; 1T0Q C; 4RGM A; 1TY2 A; 2K6Q A; 3WA0 A; 3ZDT A; 5DPS A; 2TSS A; 2DX5 B; 4WWM A; 4BKT A; 4W9E A; 2I1K A; 3AV8 A; 3NHE B; 2KAN A; 2G3Q B; 4S17 A; 4F8C B; 4ICU A; 1F2R I; 1OGW A; 4YT0 B; 3R8B A; 2KK8 A; 3NVY A; 2PE6 B; 2QJL A; 2RR9 A; 4A8X C; 4ARI A; 2DYB A; 5L83 A; 1LO5 D; 1BT0 A; 5DCN A; 1OEY J; 3VDZ A; 5MPO A; 1NI2 A; 1V86 A; 1WXS A; 2ICI A; 2W82 A; 2MBB B; 3Q14 C; 4ZOH C; 2D2Q A; 4HK2 A; 5C1Z A; 4TMA B; 1IYF A; 2Z8L A; 3PO0 A; 2LHD A; 3KLS X; 4KZC A; 3P4Q B; 2LVO A; 1KLG D; 1WJU A; 1TGZ B; 3Q6B A; 4XGA B; 2KLG A; 2JZZ A; 2KTR B; 1GB1 A; 5JZE B; 1OEY A; 1TYG B; 2V4I B; 4UDU C; 1WMH B; 3IHP C; 3WAP A; 2K9X A; 3QCA A; 4IC7 B; 2BB5 A; 4B95 A; 3L4P A; 1WXQ A; 4B9K A; 1C76 A; 1N5W A; 3SEB A; 4BOS C; 2G4D B; 4YSX B; 4RFB A; 2WX1 A; 1M4V A; 1EWC A; 4HDQ A; 2B76 B; 1V9J A; 4RF1 A; 2JXT A; 2DZK A; 1PQS A; 1XLQ A; 3B2G A; 1FCC C; 3Q3M C; 4MJS A; 3B2F A; 3GZN I; 2KZR A; 2O6V B; 5D7G A; 4LDT D; 3KWL A; 4MEM A; 3L08 A; 3R66 C; 1EF1 A; 2A4Z A; 1JRU A; 2JRH A; 3JSV A; 2MX2 A; 3V62 A; 2MP2 A; 3RCZ A; 1R4N I; 2R2Q A; 3FAH A; 2L32 A; 1V5T A; 3NS8 A; 2J42 A; 4D2K A; 4IWP A; 3H1U A; 3JVZ X; 1QOF A; 2IO1 B; 4AJW A; 1XCT L; 5AZF A; 4AUQ C; 4HVB A; 4PS7 A; 2ZNV B; 2RMM A; 2YEP F; 4PS8 A; 4EZJ A; 3OAW A; 2LVQ A; 4C4V A; 1AWD A; 3T8M A; 2MBO A; 4N58 A; 4LNF A; 3MJW A; 1I42 A; 4RCO A; 4AWJ A; 4P1C C; 4BFR A; 2HD5 B; 4LNN A; 1V8C A; 1UNS A; 4ZDV A; 2FCM A; 2JPH A; 1TS5 A; 1CMX B; 3MFG A; 2NTS A; 4W9J A; 3AEF B; 1WX7 A; 3C19 A; 2XBB C; 2JQR B; 2KTF A; 4M01 A; 1HZ5 A; 1WI0 A; 4JWU C; 1FNV A; 1EM7 A; 1N61 A; 4R3D A; 2HJ8 A; 1E8Z A; 4NQK E; 3IFW B; 1WGH A; 4F7Z A; 3TMP B; 3TEW A; 1WGG A; 2C7N B; 2HJ1 A; 3RNA C; 1WM2 A; 3N9Y C; 3MHS D; 4ITK A; 2WXL A; 2O2V B; 4LNK A; 4EOY A; 1YJ1 A; 2BVC A; 3AN1 A; 2KWC A; 3V05 A; 2WXI A; 3QJZ A; 1M94 A; 2N1W A; 3PT2 B; 5E6P A; 2WXK A; 4DHJ D; 3NZS A; 3QC8 B; 2GRI A; 3Q8C A; 1T0Y A; 3BY4 B; 4GDK B; 3PZ7 A; 2QCZ A; 3KVF B; 3UIO B; 3UI3 A; 1NVI D; 4YL8 A; 4C7Z A; 4LNI A; 3ZJT A; 4E74 A; 5EE1 A; 5D2M B; 1FO4 A; 1ZP0 B; 2ZPN A; 2BWE S; 2LGS A; 5L95 C; 4HKZ E; 3ZLZ A; 2XK5 B; 3PRP B; 4WWP A; 1C77 A; 3PS6 A; 1C4C A; 5KHQ A; 4TQ1 A; 1XCQ L; 1QKZ A; 2VZK D; 3VR9 B; 3KQ4 A; 2KN4 A; 1B1Z A; 5HKH A; 2IY1 B; 5HFY A; 3VTV A; 1T0R C; 4IDI A; 1LGR A; 1FM0 D; 2WXQ A; 2RDH A; 4A3O A; 2LJI A; 4WWN A; 4KVG B; 1SEB D; 2X8X X; 2LHE A; 5D3I B; 2WXN A; 2K22 A; 5EE0 A; 2Z0D B; 4BKS D; 2L05 A; 1V80 A; 4HLE A; 1TY0 A; 4RM8 A; 2G45 B; 4ZYN A; 3TSS A; 3CSF A; 3AE7 B; 1E5W A; 4GDL A; 3MC9 A; 4W9H A; 1GB4 A; 1ZGU B; 2BBC A; 2WP9 B; 5FR6 A; 2KDB A; 2E3T A; 1WY8 A; 1TIF A; 5BYS A; 4DBG A; 1NEK B; 5BO4 B; 4OVU A; 2J0J A; 2N7E A; 2DAJ A; 4ANX A; 3RMK C; 1SBB B; 1JRO A; 5JH5 C; 3ZNH B; 1V6E A; 2MSE D; 3TEZ A; 1SF0 A; 3NS1 A; 4JIO U; 5EDS A; 2I38 A; 4XYC A; 3QK0 A; 3HM3 A; 2KC2 A; 1E7V A; 1EU3 A; 2JSV X; 4MGK E; 1YN3 A; 2KWV B; 3Q3J A; 2N4F A; 1UGJ A; 2WU5 B; 4GIV A; 3DPD A; 1A5R A; 2L0F A; 1TZ1 A; 4EE2 A; 1E90 A; 1C79 A; 1PGX A; 2IO2 B; 1SXT A; 4AQ7 A; 2IO3 B; 3ONS A; 1P7F A; 2N9P C; 4BKS A; 3N1X C; 1NEN B; 2NBW B; 4GGQ A; 2KVR A; 1XT9 B; 1Z5S B; 4LNO A; 1WXV A; 2JWU A; 4BAX A; 2WXF A; 2ASQ A; 3DBR B; 3AE5 B; 1Y56 A; 1WGY A; 1I7H A; 1KFY B; 5IOI A; 2PW9 A; 1P98 A; 4RMA A; 4EFO A; 1F0Z A; 1VD2 A; 4A9A A; 3AE1 B; 3M62 B; 2OJW A; 3VVW B; 2INN E; 3MC8 A; 4W9C A; 3ZJV A; 2IJ0 A; 1UGM A; 3Q3O C; 2BS2 B; 4BBN F; 1J0G A; 3RNE C; 2PEA A; 2NPT A; 2SAK A; 1K53 A; 2MCN B; 4M0W B; 1ESF A; 4W9F A; 4N9F 4; 4B0M A; 2QIL A; 1TJE A; 1AW7 A; 2ZVN A; 2OOB B; 2GBJ A; 3ALB A; 1KM7 A; 2KFJ A; 1JCK B; 4B6W A; 4P1B C; 4KV2 A; 3BIN A; 3IBE A; 3RUI B; 4JX1 C; 2GI9 A; 2I1J A; 2KDI A; 1EWY C; 1E10 A; 4DK5 A; 4FJV B; 1TTN A; 1L4Z B; 1CK1 A; 2L0T A; 1K52 A; 3AEB B; 3W1S A; 1MHH E; 2N0S B; 5BMI A; 4ANU A; 1LFD A; 1Z2M A; 2CKH B; 3IT4 B; 4OW0 A; 2MP2 B; 2HTM E; 1WE7 A; 3U2S C; 1ZXH A; 3L16 A; 2FUG 1; 1TBE A; 2EMT A; 3R2T A; 3GS2 A; 1S1Q B; 3RT3 B; 5J18 A; 4YTP B; 2DWQ A; 2AL3 A; 5C23 A; 3OJ3 A; 2ZVO A; 1C4P A; 1YNT E; 1K8R B; 3N3K B; 1UZX B; 2J4X A; 2HE7 A; 4YXD B; 4GOC A; 2KVZ A; 4KDL B; 4ZRP A; 3LB8 C; 1J19 A; 2MJD A; 3L10 B; 2FBW B; 1VDV A; 4ASW C; 3KUZ A; 4P16 A; 2Y5C A; 1WFY A; 1ZW7 A; 2ZCC A; 1WE6 A; 3UQB A; 2OHF A; 4IKG A; 2L8J A; 3A9K B; 2RDB C; 2ZZP B; 4KIK B; 3ZRC A; 1GOZ A; 3PZ8 A; 4KGR A; 4L23 A; 3P1M A; 2D10 A; 1N6Z A; 4ZYS A; 4LDT B; 1WR6 E; 2FCS A; 1X1M A; 2IGD A; 4FHJ A; 2N7J A; 3U52 E; 4FHK A; 4OZC A; 3A9J A; 4DWF A; 3WCQ A; 3AEG B; 3VQI A; 2KYW A; 2KO3 A; 2WHI A; 3KUC B; 5D3D A; 1ET6 A; 2DBY A; 4GB9 A; 3X0W A; 2JU6 X; 3T3O A; 1WSP A; 2V3N A; 1NI3 A; 2K25 A; 1J8C A; 1MG8 A; 5G55 A; 3ZJU A; 3IAM 1; 3DVN V; 4TQ0 A; 4FA6 A; 2D3B A; 1YJJ A; 5C3J B; 3CF6 E; 1H4R A; 1DOX A; 3ABV B; 1I4G A; 1MG4 A; 2NCN A; 3LDZ E; 4JQW C; 2RDG A; 4AOF A; 4MM3 A; 1HE8 A; 3AEE B; 4BKG A; 5BMG A; 4NZL B; 2VH2 A; 2WXP A; 2WNM A; 4EZK A; 2CHW A; 1Y8R C; 1D6E C; 4MT5 A; 3I63 C; 3DBH B; 4AJY B; 4DQO C; 4IWQ A; 1WWT A; 2BT6 A; 2MJE A; 1QZE A; 1T6B X; 1OQY A; 2DZJ A; 2NTT A; 1YIW A; 3HM6 X; 1TKY A; 2WU2 B; 3ML8 A; 1BUI C; 5C2T B; 1FFU A; 1QOG A; 1AAR A; 1P9D U; 5LXH A; 2KHW B; 4NAW A; 2W9N A; 4WJN A; 1IBX B; 4WUR A; 3TEY A; 3ZNI D; 2WDV B; 4EEW A; 5TR5 A; 1CQV A; 1UWM A; 1HTO A; 2BGF A; 4GDL B; 2BYE A; 3NZ3 A; 1QF6 A; 5AUK A; 1MVK A; 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2L76 A; 3M3J A; 3Q3F A; 4C7Y A; 2K8B A; 2PPH A; 1JWS D; 4FJY A; 3ML9 A; 2LZ6 A; 2JZP A; 1D4B A; 4J6I A; 1WGK A; 3PZD A; 3W1S C; 2K1F A; 4MSM B; 1TS4 A; 4RNA A; 1JW9 D; 4W9D A; 1L6V A; 1LQB A; 1UBI A; 2PE9 A; 2K8H A; 1K51 A; 1ENF A; 4HPP A; 3L17 A; 3LYY A; 5H8Y E; 2G4S A; 1OQR A; 2J52 A; 1YN5 A; 4G11 A; 3P2B A; 3BVG A; 1V1P B; 2JX5 A; 1KRH A; 2ZW0 A; 2K6D B; 3ZNG C; 1XLO A; 3TL5 A; 3OWE B; 1E8Y A; 3DVG X; 2D5G A; 3BVZ A; 3CST A; 1L0V B; 2NBU A; 3FC4 A; 2M1M A; 1ZDX A; 3DVN U; 2O6V D; 4WJO A; 3E9S A; 4MGY E; 1XD3 B; 4RF0 A; 2DZM A; 3AEC B; 3ZTD A; 4K3B A; 1XO3 A; 4PT5 A; 2KQ4 X; 2BWF A; 3H7P B; 3I9V 1; 3DBS A; 1QLB B; 3ZUN A; 1N60 A; 2QEJ C; 4YSY B; 2KWD A; 1GNU A; 3NOB A; 1Q1O A; 4LJP B; 1F77 A; 3L54 A; 3SFD B; 5IKC M; 2GMI C; 1T5X D; 2KTR A; 2NMQ A; 2KXJ A; 3MP9 A; 1RM6 C; 3DQV A; 3VUW A; 2JT4 B; 1I4H A; 4I6L B; 4WIP A; 2Z59 B; 3VUX A; 3UQA A; 3E56 A; 3ETR A; 3A4S C; 1AYF A; 1UBQ A; 3U30 A; 1P1A A; 3UIP B; 1D5X C; 4AP4 C; 4E71 A; 1L4D B; 4ZRI A; 1XEE A; 3VRA B; 1VLB A; 1VZ8 A; 4KSK C; 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