The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
MVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
INTERNALIN B
|
| publication title |
Fold and Function of the Inlb B-Repeat.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Listeria monocytogenes egd
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
11
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y5P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ZRQ A; 4MM3 B; 1UZX B; 5HFY A; 4GLS C; 1Q5W B; 3R66 C; 3NZ3 A; 4JWU C; 4S17 A; 3ZTD A; 1WXQ A; 2DYB A; 3A4R A; 5IO9 A; 2GLS A; 3DPD A; 2FCQ A; 5FK9 C; 2WXP A; 1N5X A; 3SFD B; 2KDI A; 1WI0 A; 4OHJ A; 1KRH A; 1WFY A; 2JVC A; 4DBG A; 4B9K A; 3N1X C; 2K1F A; 4BFR A; 5G5G A; 4A9A A; 1FPY A; 1KM7 A; 3KUD B; 2PEA A; 1X1M A; 4WJN A; 1Y8R C; 2WP9 B; 1GC6 A; 4A55 A; 3T9L A; 3ZJV A; 1HXY D; 1FCL A; 2LWP A; 3QQ8 B; 3UGB B; 1H4R A; 1QIL A; 2IDY A; 1C1Y B; 4IWO A; 5C2T B; 4EZJ A; 2KWV B; 2I1J A; 4AP4 C; 3RCZ A; 1SE2 A; 1TGZ B; 3PTF C; 3W2D A; 1I35 A; 3RNE C; 4HCN B; 4M0W B; 3ZNZ B; 2NTT A; 1Z2M A; 2D5G A; 3ZUN A; 3L08 A; 2OHF A; 4KGS A; 3ZLZ A; 1L0Y B; 3LXF A; 1EO6 A; 3PVL A; 2BWF A; 3A1Q B; 4ICU A; 5DPR A; 1YD8 U; 4I6N B; 1IUE A; 1ZW7 A; 3B1L X; 4IUM B; 1MPE A; 1UGJ A; 3BZD B; 1F2R C; 1IBX B; 1JRO A; 3EA6 A; 3PS6 A; 4RGN A; 3V6E B; 4FLH A; 4LJO B; 5T8I A; 2WQY B; 4HRO A; 4WJQ A; 2V3S A; 1R4N I; 4GU2 A; 2WXI A; 3BII D; 5IKC M; 1V5T A; 2MBB B; 4W9E A; 4W9J A; 3P63 A; 4XZ4 A; 3DBH I; 2IJ0 A; 1PDX A; 3CST A; 1WXS A; 3A9J A; 4DXA B; 2KMA A; 1XXG A; 3OWE B; 3ZNG C; 3T8M A; 1QOF A; 2HTM E; 1FIQ A; 4IM0 A; 3DVG Y; 2MJ3 A; 2GBJ A; 2N9X A; 3A33 B; 4KIK B; 1B9R A; 3VUW A; 1WX8 A; 4C00 A; 2VZK B; 2UYZ B; 4CHK A; 3ECI A; 4MAC A; 4XDC A; 4QAY A; 2PMV A; 3IVF A; 1D3Z A; 2BW2 A; 1WJU A; 1E0Z A; 3W1S C; 1R7S A; 4MJS A; 5D7G A; 3R8B A; 2INP E; 1H8C A; 3DVG X; 2JUO A; 1ROE A; 1WMH B; 2BS2 B; 3AUL A; 2KAJ A; 2RDH A; 1JW9 D; 3PLU A; 5KHQ A; 2A4Z A; 2MWS B; 1ZKH A; 1QZE A; 4MH0 E; 1R4N B; 1N60 A; 1I7H A; 4TUU A; 2HDE A; 3LJ3 A; 1PFD A; 1OEY A; 1HA5 A; 4HXD A; 1JAL A; 2BQQ A; 3DBH B; 4BAX A; 4Q2J A; 2JU6 X; 2DLB A; 3PO0 A; 4MDK E; 3ZXV A; 1WY8 A; 2KJR A; 2BTE A; 3DVN U; 4REZ A; 2KMC A; 3U30 A; 3ZRC A; 1WM2 A; 5EE3 A; 4LCD E; 4HDO A; 1E5W A; 2LGD A; 2VH1 A; 3ENE A; 4K7W A; 3MC9 A; 1HQR D; 2MBQ A; 3W1S A; 2OOB B; 2RDB C; 1WF9 A; 3P42 A; 3QA8 A; 4W9I A; 1TJE A; 1NYR A; 2INC C; 2L52 A; 2BS3 B; 4FUL A; 5LNK 1; 1L7Y A; 3VVW B; 3AEB B; 3AMZ A; 1BXT A; 4IKG A; 4HCP B; 2ZW0 A; 2QIL A; 2N9E B; 3LB8 C; 3NZS A; 1E10 A; 4FHK A; 4N59 A; 2KYW A; 3IBE A; 2H89 B; 4DHZ B; 4K1R B; 2WDQ B; 2KWC A; 5TSS A; 3AED B; 3OG5 A; 3KVF B; 3ZXR A; 2D10 A; 2OJR A; 1JQ4 A; 4JQW C; 2X38 A; 2YVC A; 1WGK A; 4FHJ A; 2A5U A; 2C60 A; 1OQR A; 4EOY A; 2CHZ A; 5DPT A; 1TS3 A; 2BPS A; 1I4X A; 3HIZ A; 4GOC A; 4ANX A; 3WAN A; 4BZA A; 1ZXH A; 1UNS A; 2XK5 A; 4OZC A; 1P0R A; 1FCC C; 1TKG A; 1SIF A; 4MT5 A; 4AOF A; 1QOG A; 3VTV A; 1WGG A; 3T3N A; 4ZHP A; 3APF A; 1NBF C; 3NG0 A; 3CMM B; 4ZRK A; 1TYG B; 3AE7 B; 1YQ3 B; 4LNO A; 3IHP C; 4BVU C; 4JX1 C; 1N5W A; 3SDL C; 2WXN A; 1SGH A; 1GG3 A; 3OAW A; 1OEY J; 4AJW A; 2G4S A; 3RN9 C; 4P7I A; 2V3N A; 3NVY A; 3RT3 B; 3HVD A; 1V1P B; 3RFZ B; 1NEN B; 3Q3F A; 3CIR B; 4WUR A; 2DZM A; 4KGR A; 1SSN A; 3RI7 C; 4RH6 A; 3R7Q A; 3AEC B; 3VRB B; 4ICV A; 4EZL A; 3R3M A; 2JX5 A; 2IO3 B; 4L23 A; 5HHD G; 2MBE A; 4W9H A; 1V86 A; 3ZJU A; 3CF6 E; 3Q8C A; 3BK2 A; 3I9V 1; 4IWP A; 4YWG G; 2Y5B B; 1EM7 A; 4EUT A; 1RM6 C; 3DOW A; 2KC2 A; 3ABV B; 3AI5 A; 3NHE B; 4W9K A; 4ZHO A; 3O65 B; 1JML A; 4P1C C; 4JWS C; 5CHW A; 1D4B A; 3DWM A; 1BUI C; 1Q0W B; 1UBI A; 4MSQ B; 1WR1 A; 2WHI A; 1FRR A; 2Y5P A; 5D3I B; 5E6J A; 2YEP B; 5HI1 A; 2HJ1 A; 5BMG A; 1VLB A; 5J2R A; 1V1O A; 3R7R A; 3NY5 A; 4C4V B; 5G55 A; 1TS4 A; 2I2Y A; 2FCN A; 2BWE S; 4I6P A; 2WXM A; 2ZCC A; 3V60 A; 5IAA C; 1RRB A; 4HPP A; 1NVI D; 1RAX A; 3I3T B; 4XYC A; 1RFK A; 2EMS A; 2LUM A; 1GOZ A; 3DQV A; 3VH3 B; 5CTR C; 1XLN A; 4XDD A; 3E56 A; 5I4D A; 3Q3O C; 2IY1 B; 1YIW A; 5GXG B; 3NUH B; 1YX5 B; 2FUH B; 3KWL A; 2KQ7 A; 1ESF A; 3WAM A; 4JIO U; 1XCQ L; 2JYT A; 2EKE C; 2LHE A; 2ZEQ A; 3Q3N C; 4GB9 A; 2CU1 A; 2QMT A; 2ZZP B; 1WJ6 A; 1JWA D; 5AUI A; 2FIF A; 3TEY A; 3DBR I; 3EFU A; 4DDI D; 2DHZ A; 2GBN A; 1UWM A; 2C7M B; 1WM3 A; 3AE3 B; 3UQA A; 4NJ6 A; 3N30 A; 1KF6 B; 5C23 A; 1JWM D; 3AE2 B; 4KDI C; 1L6V A; 1F1H A; 4EEW A; 1A5R A; 1C4P A; 3PGE A; 2ZNV B; 2WXG A; 4W9C A; 3ZDT A; 2JF5 A; 2K9X A; 3IG3 A; 1FXA A; 1F9J A; 5L83 A; 3UI3 A; 2IGD A; 3TUO A; 3Q69 A; 1E6E B; 3BY4 B; 4NPN A; 3PRM B; 2KFK A; 2GB1 A; 2GBR A; 2W9N A; 3PZ8 A; 2IND C; 2CU3 A; 5E6O A; 2N7D A; 4A3P A; 3ZKJ C; 1LFD A; 3VR8 B; 3PT2 B; 2LGI A; 3SR6 A; 4N58 A; 2JZZ A; 3ZO5 B; 1CJE A; 3VTU A; 5EE0 A; 4BKT A; 3DBR B; 1WXM A; 3PLV A; 3N1Z C; 2WXJ A; 2KDE B; 2ZPN A; 3I5J C; 2BBC A; 3TEZ A; 3V62 A; 3B0A A; 4MGY E; 4OVV A; 4BBN F; 2R61 A; 3IFW B; 4RGM A; 5KHO A; 5IA7 A; 1C4C A; 2DNF A; 2D3G A; 1WGR A; 4PT5 A; 2K5P A; 4LNF A; 2V0G A; 1FM0 D; 2BYV E; 3Q8A A; 3AB5 A; 4F1S A; 2D07 B; 4XE0 A; 4NAW B; 3FIL A; 1ET9 A; 1WZ3 A; 3U4E G; 4KZ0 A; 2QCZ A; 2EMT A; 2BYF A; 4IG7 B; 1T0Q C; 5JZE B; 2LRU A; 4DK5 A; 4TSS A; 1WGD A; 2N7E A; 4AQ7 A; 1LXD A; 1D5M C; 4JE3 B; 4HEA 1; 1K53 A; 2IO1 B; 2JWU A; 4PYZ A; 1E7V A; 2BF8 B; 2E3T A; 4G11 A; 4B0M A; 1NI2 A; 3IT4 B; 2QJL A; 2KDF B; 1IGD A; 5EE1 A; 3SHQ A; 4IM2 A; 3N20 C; 4ACF A; 3Q6B A; 4L1B A; 2ZVO A; 3NRZ A; 4RCO A; 2FCS A; 2KTF A; 4XC2 A; 2DWQ A; 4B0E A; 1V2Y A; 5C1Z A; 1TIF A; 1ZDX A; 2O2V B; 2WDV B; 4M8M A; 3B08 A; 2IGG A; 3ZJT A; 2O6V B; 2J52 A; 4KGT A; 2BYT A; 1IYF A; 2L7R A; 1J7C A; 3ZRF A; 2JXX A; 4RF0 A; 2KNB A; 1MHX A; 1V6E A; 3FKY A; 3NJT A; 1C79 A; 4WQO B; 4IWQ A; 3EHV A; 1F77 A; 1E8Z A; 3UF8 A; 1L6U A; 2MP2 B; 3PZD A; 5BYS A; 2KVZ A; 4WWN A; 3U2S C; 2AQ3 B; 1YQB A; 4II2 B; 3C19 A; 2MLB A; 3H9D A; 1L5P A; 2L8J A; 2ZJD A; 4LJP B; 2VRR B; 1K51 A; 2M8S A; 5H8Y E; 4MGI E; 3U7Z A; 3VAW A; 3SFE B; 1B1Z A; 3L16 A; 1IPG A; 4YT0 B; 2PKO A; 4W9G A; 1UBQ A; 3SD5 A; 1JWU D; 3W9C B; 2J0M A; 2NBW B; 4WQM A; 2NMQ A; 4CYE A; 1YOV B; 2HTH A; 3V3X A; 2V3P A; 3AEG B; 2MEK A; 4GDL A; 1T5X D; 4ZYN A; 2PJH A; 3P4S B; 1UWX A; 1E7P B; 1NEK B; 2O6V D; 4B95 A; 5J17 A; 1WJN A; 3QWZ B; 2N9K A; 1S3S G; 1CMX B; 2GBM A; 4K3C A; 2KTR B; 1OGW A; 5GMV A; 4GDK B; 1T0R C; 4DHZ E; 4RFB A; 3QAQ A; 1ENF A; 5LXI B; 1E8Y A; 1IP9 A; 3QAR A; 2RR9 A; 2LI5 A; 5HG2 A; 4ARI A; 2UWQ A; 2KLC A; 2Z0D B; 5BMI A; 2DX5 B; 4FA6 A; 3PHW B; 2Q5W D; 1EF5 A; 3M3J A; 1KLG D; 4E71 A; 3TEW A; 3W5U B; 2PLP A; 2BT6 A; 4TQ1 A; 1ZP0 B; 2LJ5 A; 1WH3 A; 1VZ6 A; 1ZXI A; 2EKI A; 4GSW A; 2SEB D; 4TKN A; 2RSU A; 1KJT A; 1QLB B; 3ZIM A; 1M94 A; 3Q14 C; 1QKZ A; 3A9K B; 2RPV A; 2IY0 B; 3JSV A; 1GB4 A; 2RGF A; 1PUT A; 1GJZ A; 2KFK B; 2JPH A; 3GE3 C; 1OQY A; 1ZDV A; 1WRI A; 3AE6 B; 4HKZ E; 1Q10 A; 2NBV B; 2KHW B; 1J0G A; 2M4N A; 1R4M I; 3AV8 A; 1U4A A; 1C9F A; 2KOX A; 3BK1 A; 1SE3 A; 4KV2 A; 1HZ5 A; 1SEB D; 2IGH A; 1XO3 A; 3H7P B; 2E6X A; 3GS2 A; 2MQJ A; 3AE8 B; 3PSE B; 2AQ1 B; 2NVU I; 4MGZ E; 3VRA B; 3MHS D; 2MX2 A; 3C0R B; 1DOI A; 2W82 A; 4ZRP A; 5J18 A; 3S2A A; 2J0K A; 4UDU C; 2JQR B; 4G3X B; 3P4R B; 2LD9 A; 2C9W B; 2NPT B; 3W1Y A; 3ZQ4 A; 4ARC A; 2KD0 A; 2WXQ A; 3V05 A; 1GUA B; 2VZK D; 2CJN A; 3MP9 A; 3VFK A; 2AWT A; 2HE7 A; 5CX3 A; 3KQ4 A; 4GMV A; 4FJZ A; 1T0S C; 4BKS D; 2LJI A; 3WA0 A; 4OZB A; 2K39 A; 3L54 A; 3K9O B; 1R4M B; 3TL5 A; 4MSM B; 3QX1 A; 1I4R A; 4ZOH C; 2CR5 A; 5BMH A; 1A70 A; 2PE6 B; 1HTO A; 3KH0 A; 4CQN A; 1XQQ A; 1UGM A; 3P1M A; 4ANW A; 1NYQ A; 1C76 A; 4H2A A; 2KJH B; 3N32 A; 1P9D U; 4XX5 A; 2LGS A; 1C4A A; 1MG8 A; 3DVN V; 3U8Z A; 4C7Y A; 3U52 E; 3J9C A; 1NDD A; 4B6W A; 1FXT B; 3NS8 A; 1WX9 A; 2DZK A; 3ALB A; 4XWW A; 2LHD A; 5D3D A; 2DYO A; 4NZL B; 4JGH B; 1AW7 A; 2WXF A; 4WWP A; 1VZ7 A; 4IDI A; 1UF0 A; 2NBU A; 1XLO A; 2QEJ C; 2AYO B; 3GZN I; 3VXW A; 5JH5 C; 1WZ0 A; 4ASW C; 2D3C A; 2DZI A; 5FR6 A; 4IW0 A; 2V1Y A; 2K0P A; 4ANV A; 2LZ6 A; 4EFO A; 1KFY B; 4MM3 A; 3VTW A; 1EWC A; 1WR6 E; 2K25 A; 2FCM A; 1JRU A; 1P7E A; 2ICI A; 2Z0E B; 1HZ6 A; 2KQS A; 4NJC A; 3TEX A; 2JY6 A; 4DHJ B; 2BGF A; 2L3Z A; 2KDB A; 2MH7 A; 2WDT B; 2MBO A; 3QK0 A; 3H8H A; 2MSE D; 3V61 A; 1FEH A; 2GOW A; 4DWF A; 3KLS X; 2D3A A; 1HEZ E; 2KFJ A; 3P2B A; 2MRP A; 2ZW1 A; 4LLG M; 4K7U A; 2WYQ A; 1V80 A; 3H7S A; 3R2T A; 4DXF A; 2WNM A; 3AE4 B; 3GZN B; 3N3K B; 5CHV C; 3RZF A; 1ZOY B; 2FBW B; 5AEK B; 1F2R I; 3TBL D; 2JRH A; 2N9L A; 4KKJ A; 3RMK C; 1WRD B; 3QCA A; 3ZGZ A; 2CHW A; 4M00 A; 4US9 A; 3NZU A; 2HD5 B; 2JZ3 B; 3BYT B; 4NAM A; 1AYF A; 3T3O A; 4M0W A; 2ZPY A; 1WYW B; 4K3B A; 4C7Z A; 3CWI A; 3KUZ A; 2PIA A; 4FJY A; 3VUY A; 2W3S A; 4LK0 M; 4YXD B; 1ACC A; 1LGR A; 2RDG A; 5L95 C; 3A1Q A; 1MHH E; 1I4Q A; 4YSY B; 3A9J B; 2PE9 A; 4D2K A; 1QQR A; 2W54 A; 1RFA A; 1KLU D; 4A90 A; 2M0A A; 1V9J A; 2NS5 A; 4WWO A; 3AU5 A; 2L0F A; 1IBX A; 5D2M B; 1WSP A; 1ZPS A; 1N62 A; 3DWG C; 3NVW A; 4BBN C; 3OJ3 A; 4XGA B; 3AE1 B; 1N63 A; 2OED A; 1AN8 A; 1DGJ A; 1VZ8 A; 1GC7 A; 2TSS A; 1HE8 A; 4MJS B; 1P98 A; 3RD2 A; 1CK1 A; 2DAF A; 4L2Y A; 1GB1 A; 2WU5 B; 3ZVV A; 2KN5 A; 2J42 A; 4FJV B; 4KDL B; 2IYD B; 4KIK A; 1QF6 A; 2UU7 A; 4KVG B; 2JSV X; 3L4P A; 4DQO C; 4AWJ A; 4P6V F; 2WX0 A; 3Q8F A; 4URK A; 4S0R A; 1VDV A; 2NR2 A; 3EEC A; 2C7N B; 2KZR A; 2KC1 A; 2LRW A; 1IGC A; 2HJ8 A; 4KSK C; 4R3D A; 2L76 A; 1GAQ B; 4A6Q A; 1RWS A; 2D11 A; 4AJY B; 1V97 A; 2X8X X; 3JW0 X; 2L1A A; 2LXA A; 1WMH A; 2CJO A; 1VR9 A; 2QC8 A; 2ZCB A; 3KWV A; 3Q8E A; 2L83 A; 3HK0 A; 4RM9 A; 5E6N A; 3A4S C; 3ZYY X; 2M1M A; 4PS8 A; 5FKA C; 1Q1O A; 2IZV B; 2N1V A; 2G45 B; 1XCT L; 3OJ4 B; 3ZDM C; 2LEK A; 2PW9 A; 2XN9 C; 2PPH A; 2G3Q B; 2LXC A; 1Y56 A; 3KUC B; 1DOX A; 1TKE A; 3B9J A; 1SIJ A; 3RUL A; 2PVO D; 5C3J B; 1K50 A; 2WXK A; 1XF5 L; 2B3A A; 1PGA A; 1YJI A; 3HM6 X; 3RZW C; 1S1Q B; 2WGS A; 4RGO S; 1KOT A; 2K6Q A; 4M01 A; 1MFW A; 2DYM A; 3RNB C; 4AUQ C; 2WDR B; 2QDF A; 3JVZ X; 4HWI B; 1E90 A; 4RNA A; 5BYR A; 3WAP A; 3DCG A; 3NVV A; 4JL9 A; 2WXO A; 2KDM A; 4NNJ B; 4OVU A; 1JCK B; 2LVP A; 3AN1 A; 2GBK A; 4II3 B; 5G5H A; 1QOB A; 3NS1 A; 3OLM D; 2XK5 B; 3AE5 B; 5AZH A; 1P7F A; 4K81 A; 1E7U A; 2N1W A; 1FMA D; 3VUX A; 4A3O A; 2LVO A; 4LNK A; 4YTP B; 3RNF C; 2AL3 A; 2LGY A; 2I1K A; 3RNC C; 3GOE A; 4CO7 A; 2AQ2 B; 4HK2 A; 5D6J B; 1UUP A; 2ASQ A; 1JWB D; 1SBB B; 4P16 A; 3H1U A; 2KT7 A; 4GIV A; 4N6E B; 2JWZ A; 2D2Q A; 4HKQ A; 2KWU B; 3L0W B; 5D94 A; 1PQS A; 1FNV A; 3W5V B; 4BKG A; 1YX6 B; 1V5O A; 3H6N A; 3MJW A; 1J7A A; 1T3Q A; 4YL8 A; 4WH4 A; 1FNU A; 3EUB 2; 4ITK A; 4JLC A; 2R2Q A; 3O13 A; 2R2O A; 1XLQ A; 2KWD A; 4AS1 A; 3FC4 A; 4NJ7 A; 3WAO A; 2AL6 A; 2V4I B; 4EKU A; 2BKR B; 1PGB A; 1YMH E; 3PHX B; 4FAD A; 2FE8 A; 4HJG E; 1BML C; 4P1B C; 1STE A; 4PYU A; 3IT6 B; 2LVQ A; 1TKY A; 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