The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
b'TGSLSVDNKKFWATVESSEHSFEVPIYAETLDEALELAEWQYVPAGFEVTRVRPCVAPK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Bacterial RNA polymerase inhibitor
|
| publication title |
Structural and Mechanistic Basis for the Inhibition of Escherichia coli RNA Polymerase by T7 Gp2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Enterobacteria phage t7
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| molecule tags |
Transcription
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| total genus |
10
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| structure length |
59
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| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF16857 | RNA_pol_inhib | RNA polymerase inhibitor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2WNM A; 4LLG M; 2LMC A; 4LK0 M; #chains in the Genus database with same CATH topology 4WQM A; 2PJH A; 4MT5 A; 2KJH B; 3DBL B; 1J8C A; 5HHD G; 2BKF A; 4LNI A; 1SF0 A; 4L1B A; 4YSX B; 4KGR A; 2GBR A; 1UZX B; 1DOI A; 2BTE A; 1J7B A; 4I6L B; 1UGM A; 2V4I B; 3M63 B; 2KMC A; 1C4P A; 5D6J B; 4AJY B; 1WGD A; 5BMH A; 2V0G A; 2KDB A; 1PQS A; 3ONS A; 1ZXI A; 1I35 A; 1IPG A; 2CJO A; 3L10 B; 3Q3J A; 3IT4 B; 2V1Y A; 3C19 A; 1P1A A; 3EEC A; 2CU1 A; 4YSY B; 1GNU A; 4G3X B; 1EWY C; 3VR8 B; 1YJ1 A; 1F1H A; 4BBN C; 2M8S A; 3B2G A; 4GN1 A; 3X23 A; 2MBQ A; 1L6U A; 2FCQ A; 4WWP A; 2DHZ A; 2B3A A; 3UQA A; 2MA9 B; 3Q8A A; 2KC1 A; 3A4S C; 3VRA B; 3RI7 C; 1LXD A; 1D6E C; 3K9P B; 3AM9 A; 4GU2 A; 4A6Q A; 4KSL C; 4S0R A; 4OHJ A; 3AEC B; 4IM0 A; 2LHE A; 3ZGZ A; 1C4C A; 1C3T A; 4XX5 A; 1F2R I; 4ANV A; 5IN7 A; 4TUU A; 3BVM A; 1YOV B; 5H8Y E; 1NEN B; 5LNK 1; 2W82 A; 1Q10 A; 3TJP A; 1FXA A; 4FLH A; 5IAA C; 1P7E A; 3MHZ A; 1WX7 A; 2DYM A; 1WFY A; 5E6J A; 3U7D A; 5IOI A; 2KYW A; 3M62 B; 1UBQ A; 2PVG C; 2QMT A; 4MGI E; 2KLC A; 3VXW A; 2GRI A; 3SEB A; 1GOZ A; 2JSV X; 4S17 A; 2LJ5 A; 1J7C A; 1UH6 A; 2L52 A; 1V81 A; 1E8Y A; 1GB4 A; 1Y8R C; 4KKI A; 3PRP B; 2N9K A; 2PKO A; 1YQ3 B; 2WP9 B; 4GDK B; 2ZJD A; 3R66 C; 1YNT E; 2N7E A; 2ZVN A; 2ZCC A; 4ANU A; 3W5U B; 1HXY D; 3LJ3 A; 1QKZ A; 4KGT A; 3ZIM A; 4RM8 A; 2C60 A; 1AAR A; 2WXR A; 1I4X A; 1TZ1 A; 4HDQ A; 4EKU A; 2N9P C; 2WXK A; 4IDI A; 2K5P A; 4DXF A; 5GMV A; 2L32 A; 4W9F A; 2DZM A; 3W9C B; 3U2S C; 1ESF A; 2I1J A; 1SBB B; 1B9R A; 2Q5W D; 2UWQ A; 3B08 A; 1LQB A; 4K7S A; 4WJP A; 2A4Z A; 1R4N B; 3AE5 B; 3DCG A; 1ZE3 D; 1JWA D; 3HM3 A; 3ZTC A; 2LRW A; 1FNU A; 3ZXV A; 1NI2 A; 4TV3 A; 4P6V F; 2IO0 B; 3QA8 A; 5EDS A; 2YVC A; 4WWM A; 2BT6 A; 2KWC A; 3DBS A; 1NI3 A; 2W3S A; 4EZL A; 2E3T A; 2NTT A; 1XT9 B; 4BVU C; 4HDO A; 2JVC A; 2WLB A; 1PDX A; 4IWQ A; 5IA7 A; 3WA0 A; 3MC8 A; 2JZP A; 1GJZ A; 2MQJ A; 2OJW A; 3ZQ4 A; 3EA6 A; 3AE4 B; 2NTS A; 1SGH A; 3FKY A; 2FUH B; 5HI1 A; 2MBB B; 4TMA B; 1QIL A; 2J0M A; 4W9J A; 4BKS D; 2IO3 B; 4ANX A; 3BY4 B; 3PLU A; 4YWG G; 3DVG Y; 1WXV A; 4BBN F; 1JAL A; 1FRR A; 1T0R C; 2AYO B; 2LFI A; 4DHZ E; 3SU8 X; 4BOS C; 3N1Z C; 3C0R B; 5DCN A; 1IGD A; 3PHX B; 1E8X A; 3I57 A; 3T3O A; 1JML A; 1K8R B; 4NAW A; 2JXX A; 3APD A; 3ML9 A; 2WXM A; 2BS3 B; 2BBC A; 3AED B; 2IZV B; 4NAW B; 1VJK A; 2NBV B; 2WXN A; 1FCC C; 2JRI B; 2M0X A; 2FCS A; 4PS7 A; 3N1X C; 2EEL A; 4E3C A; 3CST A; 2PMV A; 2Y3A A; 2JX5 A; 2WXO A; 3TSS A; 1P98 A; 2RPQ A; 1RFK A; 2Y5B B; 3Q3M C; 1OEY J; 4MGZ E; 3CIR B; 4PT5 A; 1OQY A; 1SE2 A; 1T3Q A; 3OG5 A; 1DOY A; 3L4P A; 4TQ0 A; 4PK1 A; 2KAC A; 2BYF A; 4XDC A; 3LDZ E; 2SAK A; 4YT0 B; 4LJP B; 1IGC A; 3MC0 B; 2D3B A; 4F7Z A; 3VQI A; 3IFW B; 5GXG B; 1NBF C; 1ZXH A; 1S1Q B; 2FCM A; 1WXA A; 2AL3 A; 5HG2 A; 2FID A; 2V3N A; 4M0W A; 2PEA A; 2RDH A; 1WGY A; 1WM2 A; 4KZC A; 5DPT A; 4DHZ B; 1CMX B; 3GE8 C; 1CZP A; 4M0W B; 4EE2 A; 2JZZ A; 1ZPS A; 4I6N B; 2MHJ A; 2N0S B; 5AUI A; 4YTN B; 3AEE B; 1K52 A; 4ZYN A; 3EC8 A; 2Z0D B; 3ECI A; 3SFD B; 4W9E A; 3ZO5 B; 4CO7 A; 2HD5 B; 3DQV A; 4LJO B; 2BS4 B; 2PPH A; 4J3O D; 3TUO A; 1YJJ A; 2WHI A; 3JVZ X; 5TR5 A; 3KQ4 A; 2OJR A; 1JWU D; 2ONQ A; 2J52 A; 2OOB B; 1PGA A; 4MGK E; 5D2M B; 3V61 A; 1V9J A; 2KN4 A; 3AEF B; 3W1S A; 4A90 A; 3L08 A; 1QOF A; 2BKR B; 3AEG B; 1EUV B; 1IUE A; 1WGG A; 1WZ3 A; 2AQ2 B; 3OJ3 A; 3QIJ A; 3N9Y C; 4HEA 1; 3DPD A; 2WDQ B; 1PUT A; 2PVO D; 2KX0 A; 1SIF A; 3K9O B; 1QF6 A; 4RGN A; 2JYT A; 2E6X A; 4ICV A; 3RT3 B; 1ZGU B; 1AW7 A; 2LI5 A; 4P1C C; 3MTN B; 5DPW A; 2LD9 A; 3L17 A; 2NPT A; 2J4X A; 1J0G A; 2IY1 B; 3PRZ A; 3EHV A; 4JWS C; 1I42 A; 4MGY E; 1IBX A; 3AN1 A; 1GC7 A; 4LNN A; 4IKG A; 5CHF A; 2QDF A; 2JU6 X; 4MM3 B; 4NNJ B; 2WU2 B; 2MBE A; 4RCO A; 4OVZ A; 2N9E B; 2CU3 A; 3PVL A; 3GS2 A; 1GG3 A; 4XWT A; 3I3T B; 3KH0 A; 3PZD A; 1A70 A; 3I9V 1; 4GDL B; 3DBR I; 4EOY A; 2Z8L A; 3SR6 A; 4MSM B; 2L00 B; 5FR6 A; 2LVQ A; 4C4V B; 4URK A; 3ZKJ C; 1YX6 B; 2LRU A; 4HKZ E; 4ACF A; 1KF6 B; 2OED A; 3R7Q A; 1HEZ E; 3VH4 B; 1CQV A; 1UWM A; 3WAP A; 1SJE D; 3KLS X; 2ICI A; 3NY5 A; 3ZDM C; 2WWZ A; 1QOG A; 4AJW A; 4F1S A; 4C80 A; 4HJK A; 4RF1 A; 2KTR B; 1G6J A; 2AQ3 B; 2KMM A; 1I4Q A; 5CHV C; 1TTN A; 1V2Y A; 1WXS A; 1FRD A; 4IOI E; 2CHX A; 2FBW B; 4ICU A; 4RM9 A; 2I2Y A; 1I4R A; 4M8N A; 3GOE A; 2O6V B; 4KKJ A; 3R2T A; 4LCD E; 4ANW A; 4D2K A; 1GUA B; 3HVZ A; 4GXB A; 4FAD A; 1C78 A; 4IW0 A; 1N63 A; 1YN5 A; 2UU7 A; 4WJO A; 1K50 A; 2R2Q A; 3HIZ A; 4G11 A; 2W54 A; 5D7G A; 2LGX A; 5IP4 D; 1TBE A; 2LJI A; 1MG4 A; 2WDR B; 2MX2 A; 1C76 A; 1TS2 A; 2BF8 B; 2KHW B; 2G45 B; 4FJY A; 3RD2 A; 4MH0 E; 1SB3 C; 2GBK A; 1F77 A; 2MWS B; 1ZOY B; 1V1P A; 3VTU A; 1I4P A; 2WS3 B; 4C00 A; 4HXD A; 3N20 C; 1M94 A; 3PZ7 A; 4ZDV A; 1PGX A; 4LNO A; 2BB6 A; 1TKG A; 2N7D A; 5C2T B; 1V1P B; 2N9L A; 4FJZ A; 1SE9 A; 1WMH A; 2YEP B; 1BT0 A; 3J9C A; 1KJT A; 3V6E B; 4JGH B; 1P3Q U; 3OJ4 B; 4BKS A; 2CR5 A; 2ON8 A; 1MHH E; 1NVI D; 2KX3 A; 1WMH B; 1Q5W B; 3NJT A; 4XC2 A; 2FAZ A; 1UWX A; 2BYE A; 3T8M A; 2WDV B; 1YX5 B; 2KWU B; 5JXV A; 5AUK A; 1FCL A; 3QX1 A; 4RGM A; 4KX6 B; 4YTM B; 4Q2J A; 1MI0 A; 2ZZP B; 2RSU A; 3RFZ B; 1HA5 A; 4M02 A; 2J7Q B; 1UGJ A; 2HJ8 A; 2VZK D; 1TS4 A; 1ZDV A; 1OEY A; 2KDM A; 1HTO A; 3NS1 A; 4N9F 4; 2QIE B; 1FEH A; 1UUP A; 1P9D U; 1UEL A; 2MBO A; 1C1Y B; 3KUC B; 1H4R A; 1MHX A; 4OVU A; 2K0P A; 2XBB C; 3RZW C; 3O65 B; 3VHT C; 3R7R A; 2M19 A; 2HJ1 A; 2L3Z A; 4ZRP A; 2YLM A; 2CS4 A; 2LAS A; 3KVF B; 3V60 A; 5DPR A; 5KHQ A; 1FD6 A; 2D2Q A; 2G4D B; 2V3S A; 1FIQ A; 2KT7 A; 2DAJ A; 3A9K B; 1EWC A; 3UIP B; 1XLO A; 4ZHO A; 1N5X A; 2JYE A; 4DK5 A; 3APC A; 3WAN A; 4B0M A; 4JPS A; 2RGF A; 1OFF A; 1K53 A; 3R8B A; 4WWO A; 3HK0 A; 4KIK A; 3DVN V; 1PYW D; 3U8Z A; 1V5T A; 4LK0 M; 1D5X C; 3ZJT A; 2LUM A; 1T6B X; 2LWP A; 1JRU A; 1SXT A; 3NHE B; 2KDE B; 4MSQ B; 1T0Q C; 4KIK B; 2L83 A; 2AL6 A; 2L1A A; 4GDK A; 1WZ0 A; 4R3D A; 2QHO A; 2NCN A; 3NZS A; 3H7P B; 4RH6 A; 2IGD A; 1HZ6 A; 1FFV A; 1GC6 A; 2QIL A; 1KFY B; 1N5W A; 4RNA A; 2K6Q A; 4IG7 B; 1E9M A; 4WJQ A; 1R4N I; 4BKT A; 1MVK A; 3L16 A; 2MLB A; 3DDC B; 2BWF A; 3CSF A; 4B6W A; 3PO0 A; 3Q8F A; 2X8X X; 2A5U A; 3CWI A; 3QJZ A; 2VH1 A; 2LXA A; 2O6V D; 2WXI A; 3UIN B; 3CMM B; 1TS3 A; 2B76 B; 3W1Y A; 3T9L A; 4OZC A; 3H7S A; 2D10 A; 3PPA A; 4NJ7 A; 4L23 A; 3TMP B; 4GMV A; 4K3B A; 3U4E G; 1FNW A; 1ZKH A; 1FPY A; 3QHT A; 4A9A A; 3DWM A; 4XYC A; 4US9 A; 2Z0E B; 1TIF A; 1ISN A; 4ZHP A; 2HDE A; 3X0W A; 1FNV A; 4JIO U; 2V9H A; 4OW0 A; 3ZNG C; 4PS8 A; 3C8Y A; 2H88 B; 2DLB A; 5D94 A; 1Z2M A; 3T3N A; 1SE3 A; 2K39 A; 1E7U A; 3RUI B; 2KK8 A; 2KFK A; 4GB9 A; 2XNA C; 4DXG A; 4W9D A; 1RFA A; 1WR1 A; 3QAQ A; 4TKN A; 2FUG 1; 3ZRF A; 1YMH E; 2BGF A; 4OZB A; 4HRO A; 2LGD A; 2KFK B; 2FE8 A; 3MJ5 A; 1ACC A; 2NS5 A; 2LEK A; 3KW5 B; 2YEP F; 3A9J B; 2N7J A; 2MH7 A; 3IXS A; 1TYG B; 5LLI A; 1Q0W B; 4ZRI A; 4DWF A; 2W3R A; 3IT6 B; 1GPX A; 2FNJ B; 2ZPN A; 4TSS A; 2HE7 A; 1VLB A; 4HLE A; 3RNA C; 2N1V A; 4HJG E; 1FO4 A; 1HZ5 A; 4HWI B; 4JLC A; 5EE0 A; 3VUY A; 3P1M A; 1XLN A; 2NBW B; 1VR9 A; 1EF1 A; 3P63 A; 1MFW A; 3PGE A; 2JY6 A; 3FIL A; 2MW5 A; 3P4S B; 5C3J B; 2ZCB A; 2WQY B; 4GSW A; 3TBL D; 3ZDT A; 3O13 A; 2AQ1 B; 2SEB D; 4C56 C; 3P2B A; 2C7M B; 3FIL B; 1VZ6 A; 2DX5 B; 3P4P B; 1XXG A; 1E0Z A; 2LZ6 A; 2PE9 A; 2G3Q B; 3GB1 A; 5AZF A; 4HCP B; 4UDU C; 4E71 A; 1J19 A; 3TEY A; 4CYE A; 2M0A A; 1KM7 A; 5J18 A; 1LFD A; 1RM6 C; 2KC2 A; 4JWU C; 2JZ3 B; 3Q2A C; 4FHK A; 2WXG A; 5JZE B; 5MPO A; 4HPL B; 1UNS A; 2UYZ B; 3KWL A; 2MCN B; 3APF A; 2WXJ A; 3VFK A; 5KHO A; 2KMA A; 2INN E; 4EZJ A; 2DYB A; 4XGA B; 3WAO A; 2QJL A; 2PW9 A; 2AX5 A; 4J6I A; 2L76 A; 1RLF A; 2M17 A; 1EF5 A; 4AP4 C; 2EKI A; 2KJ6 A; 3FC4 A; 4REZ A; 1E8W A; 2MSE D; 4XWW A; 3AMZ A; 4ITK A; 4I6P A; 1OQQ A; 5D3D A; 3VRB B; 4RF0 A; 2LUE A; 1XCT L; 5BYQ A; 1ZUD 2; 2WGS A; 4LNF A; 3PRE A; 1E8Z A; 3DBH B; 2C7H A; 1TKE A; 4ARI A; 2JT4 B; 1N62 A; 3ML8 A; 3UIO B; 4ZRK A; 3M95 A; 1QLB B; 5IKC M; 3RCZ A; 4WJN A; 4W9G A; 3H1U A; 3I63 C; 1ZDX A; 2IDY A; 2VRR B; 1TGZ B; 3U30 A; 3VTW A; 3V6C B; 2KO3 A; 2DZJ A; 3URY A; 1YIW A; 2N4F A; 4RFB A; 2KAJ A; 2L0F A; 1HE8 A; 4HKQ A; 1GAQ B; 4FJV B; 3TEZ A; 1SEB D; 3QK0 A; 3HHM A; 1LO5 D; 3TIX A; 4YTP B; 3PTF C; 2VZK B; 2MJD A; 4A3P A; 2J0K A; 3BVZ A; 4HVB A; 3GZN B; 2KKC A; 2M4N A; 1ZW7 A; 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3RN9 C; 2BS2 B; 1WE6 A; 5FKA C; 2L05 A; 1XQQ A; 4HCN B; 2FCN A; 1OGW A; 2WU5 B; 3P42 A; 3Q3N C; 4OZA A; 2GI9 A; 2WXH A; 3AV8 A; 3EGR A; 1WF9 A; 2QCZ A; 3N1Y C; 2G9H D; 2MJ3 A; 3QCA A; 2RD0 A; 2IO2 B; 4P7I A; 3V05 A; 1KLG D; 4G50 A; 2DBY A; 2WX1 A; 4K1R B; 2ZNV C; 3BK1 A; 3VAW A; 1OQR A; 2G1E A; 2Z59 B; 2BQQ A; 4P16 A; 2OHF A; 2MJE A; 3MFG A; 2KDI A; 5L95 C; 1LGR A; 5HFY A; 2W55 A; 2KQ4 X; 4KSK C; 2KDF B; 3BZD B; 3RNB C; 4C7Z A; 1I4G A; 1NEK B; 1UBI A; 4WQO B; 4CQN A; 3HUI A; 2ZPY A; 5JHA A; 2K1F A; 5EE1 A; 5EE3 A; 3RUL A; 2AEH A; 2DNF A; 3AXC A; 3N30 A; 1R4M I; 2O2V A; 4LDT B; 1D3Z A; 4RMA A; 2ZW1 A; 2NBU A; 1RWS A; 1TJE A; 1WYW B; 2JPH A; 2O2V B; 4B0E A; 3A1Q A; 2GMI C; 3M3J A; 2DZI A; 3DHG C; 3OWE B; 3IVF A; 1HQR D; 2IGH A; 1E7P B; 3AE7 B; 1R7S A; 5E6O A; 3A1Q B; 2LGS A; 2LGY A; 2JUO A; 1WXQ A; 1N60 A; 1R4M B; 1TZO A; 4M00 A; 4N58 A; 1NYR A; 2KVR A; 1L0X B; 3WAM A; 1D4B A; 2AWT A; 4W9C A; 1CK1 A; 1XF5 L; 4W9K A; 2ZVO A; 1WR6 E; 2J42 A; 1E7V A; 1TY2 A; 2QC8 A; 4ASW C; 5G5G A; 4G0N B; 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