The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
AKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFDDVEYTKNVNPNWS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Dc-Module of Doublecortin: Dynamics, Domain Boundaries, and Functional Implications.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEURONAL MIGRATION PROTEIN DOUBLECORTIN
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| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
22
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| structure length |
96
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| sequence length |
96
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03607 | DCX | Doublecortin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Doublecortin domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DNF A; 1UF0 A; 5IOI A; 5IP4 D; 1MJD A; 5IKC M; 1MG4 A; 5IO9 A; 2BQQ A; 5IN7 A; 1MFW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3GS2 A; 3N1Z C; 2SAK A; 5HHD G; 3DCG A; 3HUI A; 4M0W B; 3W9C B; 3OG5 A; 5EDS A; 2KNB A; 2ZCB A; 3BY4 B; 4GU2 A; 2MW5 A; 2RGF A; 3HVD A; 5GMV A; 3VRA B; 2L32 A; 3A1Q A; 3UIO B; 3RNE C; 1MHH E; 2ZW0 A; 2RDB C; 2YLM A; 4J3O D; 1T5X D; 4LNN A; 2INC C; 3RYT A; 1RYJ A; 2PVO D; 2KAJ A; 2AX5 A; 2INN E; 2VZK B; 2KOX A; 2JPH A; 3RNF C; 4HCP B; 3VTU A; 1ISN A; 2NVU I; 1JWU D; 2Z0D B; 2M4N A; 1UWM A; 1KJT A; 3Q3F A; 3EFU A; 4F7Z A; 3T3O A; 3TEY A; 3BYT B; 4HDO A; 3DBS A; 1P9D U; 2H89 B; 3HM6 X; 2FCS A; 3AU5 A; 3ZDM C; 1UD7 A; 2J0K A; 2MBB B; 1NYQ A; 1KLU D; 4OZA A; 2KTR B; 2MQJ A; 1AN8 A; 5TR5 A; 4M0W A; 3TEX A; 2BTE A; 1FXT B; 4IM0 A; 1YD8 U; 5DPS A; 2EKI A; 4RFB A; 3VTW A; 2KDM A; 3NVY A; 4W9H A; 3DVG Y; 2V3S A; 4A3O A; 4US8 A; 4K81 A; 2KWU B; 4TSS A; 4W9F A; 3AEE B; 2L7R A; 2LFI A; 3MTN B; 5IOI A; 2WXG A; 3VVW B; 1R4N B; 2ACZ B; 1T0R C; 1SEB D; 4G0N B; 2RDG A; 2PKO A; 3SFD B; 1F1H A; 1X1M A; 2MHJ A; 5JXV A; 3WAO A; 4EFO A; 2IGH A; 4M8M A; 4BKS A; 3UQA A; 4USA A; 1WJN A; 3GZN I; 1TGZ B; 1TZO A; 4ZHP A; 3AE5 B; 2KC1 A; 2NTS A; 2KTR A; 3R3M A; 4JLC A; 3L4P A; 3LYY A; 3APD A; 2CU3 A; 4TUU A; 1E8X A; 2RSU A; 3MC0 B; 4YTM B; 4JWU C; 3U7Z A; 3DVN V; 3IT4 B; 4B9K A; 3VXW A; 1MPE A; 4GDL B; 1WIA A; 3BVG A; 3Q3O C; 2WYQ A; 2IYD B; 3PTF C; 3ZRC A; 1RFA A; 4ANX A; 4HRO A; 4BZA A; 5JHA A; 2LGX A; 1P7E A; 2DZK A; 4X57 B; 1WSP A; 2B3A A; 3IAM 1; 3ZDT A; 4F8C B; 2BGF A; 2D10 A; 2ICI A; 2D11 A; 1VJK A; 3QK0 A; 4ZRI A; 2ZCC A; 1WGD A; 3TJP A; 2JSV X; 1F52 A; 2WGS A; 4K7S A; 2GBJ A; 3DVN U; 4BBN F; 1ROE A; 1STE A; 1RM6 C; 2KWV B; 1N62 A; 2LGY A; 3R8B A; 2MA9 B; 4PT5 A; 3EEC A; 4RNA A; 3SD5 A; 4RGM A; 2BF8 B; 1SJE D; 4GDL A; 1V6E A; 2CU1 A; 4ZOH C; 4RM8 A; 2J53 A; 2SEB D; 1XO3 A; 3ZXR A; 1YJI A; 2EMS A; 2N9L A; 3P4R B; 3VTV A; 2IJ0 A; 3Q8B A; 2N1W A; 1UZX B; 1VZ8 A; 3U7D A; 1DYQ A; 3W1Y A; 2B76 B; 4BKT A; 1SGH A; 2KMM A; 1XCQ L; 4GB9 A; 3FIL B; 4ZHO A; 1QOG A; 2GOW A; 4URK A; 1YIW A; 4P7I A; 3UGB B; 3GE8 C; 3P1M A; 3LJ3 A; 4Q2J A; 4DWF A; 2MBQ A; 2PPH A; 1WE7 A; 2WXI A; 3I57 A; 3N32 A; 3RT3 B; 3VRB B; 3AE4 B; 2PJH A; 2QIL A; 2I1J A; 2IDY A; 2JRI B; 3AE9 B; 4WUR A; 4AJY B; 1PUT A; 4LNK A; 4RF0 A; 4HWI B; 4EZJ A; 2M17 A; 1V1P B; 1C4A A; 3VUW A; 2IBI B; 5HI1 A; 3ZJT A; 1OEY A; 4HPL B; 1UNS A; 2IY0 B; 3FIL A; 4OZB A; 3PV1 A; 3JVZ X; 5G2N A; 3SFE B; 5E6O A; 4CHK A; 2FCQ A; 2JXT A; 2INP E; 4FA6 A; 4I6N B; 3AUL A; 4AUQ C; 1JRU A; 1CQV A; 5JZE B; 3RD2 A; 3S2A A; 4LLG M; 4LDT D; 1S1Q B; 2DYB A; 4RM9 A; 4XE0 A; 3ZNG C; 2LUE A; 2KFK B; 1V9J A; 4RH6 A; 1WI0 A; 2AYO B; 1CMX B; 3JSV B; 3ZQ4 A; 3W1S A; 2BW2 A; 2BWE S; 1V1P A; 2LHE A; 1UEL A; 4ZYS A; 1FD6 A; 4ZYN A; 2N7J A; 4WJP A; 2YVC A; 2FBW B; 3TSS A; 4GXB A; 3ZNI D; 1YNT E; 4MGZ E; 1Q10 A; 1N63 A; 1ACC A; 1WWT A; 3DBR I; 1HTO A; 3ZJV A; 1KH0 A; 2NS5 A; 4TQ1 A; 2GBN A; 3EHV A; 3M63 B; 1TY0 A; 4GIV A; 4RMA A; 2Z59 B; 1IPG A; 3L54 A; 2WXL A; 2JXX A; 1SJH D; 1FXI A; 2A5U A; 2PE6 B; 2WXH A; 4B0E A; 3VH3 B; 1K53 A; 2VZK D; 1PQS A; 5DPT A; 3ZRF A; 3MHZ A; 1H4R A; 2LI5 A; 1GC7 A; 2KFK A; 5H8Y E; 2BWF A; 3KH0 A; 1C9F A; 4NQL B; 2KMA A; 4RGT A; 4C4V B; 1GG3 A; 4K7W A; 3L13 A; 3JSV A; 4OVZ A; 1ET9 A; 5EE0 A; 2LJI A; 1YJJ A; 4BKS D; 3ZNZ B; 3ZKJ C; 1SIJ A; 4AQ7 A; 3DPD A; 3EFC A; 2A4Z A; 2Y5P A; 1TIF A; 3NUH B; 1C77 A; 2KDE B; 4W9E A; 5C3J B; 2W54 A; 3PPA A; 4ARC A; 3WIM A; 3QX1 A; 3AEA B; 1NDD A; 1OTR B; 4EEW A; 3W1S C; 5BMG A; 1JAL A; 1AAR A; 1MHX A; 4KZ0 A; 2L83 A; 3ZNH B; 1WXM A; 1JWA D; 1WXQ A; 2UWQ A; 2IZV B; 2WX0 A; 2QCZ A; 3ABV B; 2WHI A; 1NEN B; 2CJO A; 1WZ3 A; 3AE6 B; 3O65 B; 5FK9 C; 1C4C A; 1I7H A; 2GRI A; 2L8J A; 2FIF A; 3I63 C; 3APC A; 1TKG A; 1PGB A; 4C4V A; 4MSM B; 3I9V 1; 1WGK A; 1FNW A; 1ESF A; 1V1O A; 3VAW A; 2UU7 A; 2K0P A; 3SDL C; 1E7U A; 5JH5 C; 2RR9 A; 1YX6 B; 2I38 A; 3U2S C; 3VQI A; 2LJ5 A; 3ZJU A; 2BKF A; 2BYT A; 5DPR A; 2HJ1 A; 4WQM A; 4YT0 B; 4II2 B; 1E5W A; 3DQV A; 1Y8R C; 5FR3 A; 4J6I A; 4YSZ B; 1N60 A; 1LFD A; 4BOS C; 3UIN B; 4WWP A; 3W2D A; 3EA6 A; 1R7S A; 4HEA 1; 2C7M B; 2BS4 B; 1MI0 A; 1TS2 A; 1OEY J; 3V6E B; 3LB8 C; 4GLS C; 1SBB B; 1V5O A; 2OJW A; 1TS5 A; 4WIP A; 1GOZ A; 4DK5 A; 1V80 A; 3PLU A; 3LDZ E; 4IDI A; 1ZGU B; 2CKH B; 2Y5B B; 4KDL B; 1XF5 L; 3N1X C; 2CHZ A; 5AEK B; 2W55 A; 2IGD A; 4DHZ E; 3OLM D; 1WGR A; 3MP9 A; 1LO5 D; 1FRR A; 2V1Y A; 1KRH A; 4P1B C; 4AOF A; 1KFY B; 2QEJ C; 2JZP A; 2Z0E B; 2LXA A; 3V60 A; 5T8I A; 4G50 A; 2G4D B; 4IKG A; 3VDZ A; 1V8C A; 2JZZ A; 1WJ4 A; 2FID A; 3V62 A; 2GBR A; 1E10 A; 4IG7 B; 3Q8A A; 1XLQ A; 4YSX B; 1N5W A; 1E8Z A; 2DWQ A; 2WXP A; 2DX5 B; 3QWZ B; 1WZ0 A; 1EF5 A; 1BT0 A; 4JQW C; 3KUZ A; 2JZ3 B; 2J4X A; 2D3B A; 1WJ6 A; 3RFZ B; 4DDI D; 1WYG A; 4MH8 A; 2KLC A; 2MBE A; 1Z5S B; 4GMV A; 2PEA A; 2WWZ A; 1SB3 C; 1ZE3 D; 3AB5 A; 1XEE A; 3PLV A; 3PRE A; 3BZD B; 4DXA B; 2M1M A; 3BK2 A; 4DDG D; 5BYS A; 3RCZ A; 2LD9 A; 4MEL A; 1TYG B; 2N9X A; 3RNG C; 3T3N A; 3BVM A; 1DGJ A; 4MH0 E; 4RGO S; 2X38 A; 4YWG G; 2IO3 B; 2IO0 B; 2KTF A; 2XNA C; 1HA5 A; 2N9P C; 3FAH A; 3NZ3 A; 3BII D; 1TS4 A; 4KKJ A; 4WWO A; 1PDX A; 3AEC B; 4KSK C; 4HXD A; 4A90 A; 1FXA A; 4N58 A; 1XLO A; 2ASQ A; 2JQR B; 2KFJ A; 4M00 A; 1K52 A; 2K5P A; 3RUL A; 4BKG A; 2XEW A; 2V3N A; 3NZU A; 1P7F A; 3QAR A; 3DBH I; 4II3 B; 2M19 A; 2GBK A; 2IPK D; 3X23 A; 1H8C A; 4IUM B; 3KUD B; 3OAW A; 5HG2 A; 2KJR A; 3DDC B; 1QIL A; 4XWW A; 1MG8 A; 4EZL A; 4UDU C; 2L0F A; 4A20 A; 1Q0W B; 5I4D A; 5CHV C; 4NJ6 A; 1SE4 A; 1C1Y B; 1OQY A; 2HTH A; 3N20 C; 4I6P A; 2LWP A; 4M8N A; 4KX6 B; 5L95 C; 4L2Y A; 3U52 E; 1F9J A; 5AUK A; 3DWM A; 4K1R B; 4NPN A; 2C9W B; 3SR6 A; 3A9K B; 4JL9 A; 1Z2M A; 1L5P A; 2FUG 1; 3VUY A; 4MAC A; 3P4S B; 1KTK A; 2WXN A; 2E6X A; 3U4E G; 3H6N A; 2BBC A; 4FN2 A; 5JHB A; 2NCN A; 2JT4 B; 3C19 A; 4C7Y A; 3FC4 A; 3QAQ A; 3BWU D; 4JPS A; 1E8Y A; 1G6J A; 2WS3 B; 3M3J A; 3L08 A; 4REZ A; 2ZW1 A; 1WRI A; 3P4Q B; 2VRR B; 2WXR A; 2WXF A; 3DBL I; 3MJ5 A; 3NVW A; 1FFV A; 1FNV A; 2I1K A; 1QOF A; 4KDI C; 1QZE A; 1T0Y A; 2KWD A; 2LRW A; 2CS4 A; 3QIJ A; 4C80 A; 5BMH A; 1VR9 A; 3NZS A; 5BO4 B; 3A9K A; 5CX3 A; 3IBE A; 1I4H A; 3P4P B; 2W3R A; 3HRD D; 4WJQ A; 3Q14 C; 5E6N A; 3QQ8 B; 2GLS A; 2AEH A; 3ZGZ A; 3IXS A; 2LVO A; 1ZW7 A; 2DAF A; 1HZ6 A; 1SF0 A; 2BYF A; 3K9O B; 5BYQ A; 4B0M A; 4S17 A; 1WR1 A; 1F2R I; 1UUP A; 4LJO B; 2KWC A; 1QOB A; 2WXQ A; 3PZ8 A; 1NI3 A; 3E9S A; 2FCN A; 5IKC M; 4ASW C; 1F77 A; 5G5H A; 1ZP0 B; 2NBV B; 3B2G A; 4PYU A; 1RLF A; 1FFU A; 1YQ3 B; 2D2Q A; 1I4G A; 2R2O A; 3DHG C; 2DYM A; 4K7U A; 1E7P B; 3HIZ A; 3CF6 E; 2KQS A; 4KVG B; 5FR6 A; 3RNC C; 1XLP A; 3AEF B; 2WXJ A; 2VH2 A; 3R7Q A; 3TIX A; 3DHI C; 1KM7 A; 2PE9 A; 3L0W B; 4RGN A; 1JRP A; 4G11 A; 1MFW A; 2WU2 B; 2WLB A; 1V86 A; 4CYE A; 3W5U B; 1XT9 B; 4HVB A; 3TL5 A; 1WXV A; 5BYR A; 3KLS X; 1T6B X; 2O2V B; 1DOY A; 3A9J B; 3WAL A; 3PVL A; 1J7A A; 1J7B A; 3B0A A; 1K8R B; 4CQN A; 2FE8 A; 3DBH B; 3EGR A; 3GOE A; 1GB4 A; 4W9C A; 1SSN A; 3APF A; 4MGI E; 3UQB A; 2C5L C; 3R2I A; 3KWL A; 2RPQ A; 3AMZ A; 3H8H A; 4XX5 A; 3U8Z A; 1IGD A; 3AE7 B; 4JIO U; 3SHQ A; 3BYY B; 3ZXV A; 1V81 A; 3TCA A; 4XWT A; 1L0V B; 1VDV A; 1Q1O A; 1NI2 A; 4FAD A; 2KK8 A; 2REX A; 3BK1 A; 4NAW B; 4IM2 A; 3VR9 B; 1ZKH A; 4RF1 A; 3PHW B; 1QQR A; 2O2V A; 4O1N A; 1L4Z B; 2KAN A; 2KMC A; 2K6D B; 3A9J A; 4JWS C; 2MP2 B; 3RMK C; 5IA7 A; 3KWV A; 2DNF A; 1K50 A; 3A4R A; 1TT5 B; 4MM3 A; 4XZ4 A; 2JUO A; 3MHS D; 2BS2 B; 3IG3 A; 4YXD B; 1YQB A; 1D4B A; 4B95 A; 1XLN A; 1MJD A; 2BB5 A; 3ETR A; 2G9H D; 2BKR B; 1SE2 A; 3IFW B; 1ET6 A; 2MJD A; 3AU4 A; 1TBE A; 2YEP F; 3H7P B; 3R7R A; 3DBL B; 2K22 A; 1YMH E; 1EU3 A; 1WXS A; 4KV2 A; 2JU6 X; 5J18 A; 4NAW A; 2KDB A; 4OZC A; 1OGW A; 4GDK B; 4BBN C; 2K9X A; 1FNU A; 2L3Z A; 4HKZ E; 3H9D A; 4WH4 A; 5D6J B; 2AL6 A; 4PK1 A; 2MP2 A; 1P1A A; 3H7S A; 1ZDX A; 2XN9 C; 3MC8 A; 2MJE A; 3Q3M C; 3RI7 C; 2KN5 A; 2DZM A; 1ZDV A; 3RPF C; 3DWG C; 4WJN A; 3ZTD A; 5HKH A; 4K3B A; 3ZTC A; 1T0Q C; 3SU8 X; 1UGM A; 1ZPS A; 2N9K A; 1OFF A; 2MCN B; 2O6V B; 4KGS A; 1WFY A; 3X0W A; 1ZOY B; 2OHF A; 2XK5 B; 3ML8 A; 4HCN B; 3I3T B; 3H7P A; 3KUC B; 1QKZ A; 3RZF A; 1JW9 D; 1VZ6 A; 2IO1 B; 3UI3 A; 1WR6 E; 1JQ4 A; 4GDK A; 2BB6 A; 4LNI A; 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2PIA A; 2FAZ A; 1TY2 A; 4P16 A; 2J7Q B; 5D2M B; 3ZYY X; 4FBJ B; 1IBX B; 2ZNV B; 4AS1 A; 4TQ0 A; 4NAM A; 2MLB A; 4E71 A; 1FM0 D; 3AM9 A; 4NNJ B; 1QF6 A; 3WA0 A; 3ZLZ A; 3QCA A; 4M02 A; 1I4Q A; 4LTU A; 1N61 A; 3D32 A; 2TSS A; 2AL3 A; 4IW0 A; 3NG0 A; 1WX8 A; 3AN1 A; 3P42 A; 1V5T A; 3PT2 B; 1UH6 A; 1B9R A; 2MEK A; 2D3C A; 4IWO A; 3ZW3 A; 4FJZ A; 2FCM A; 1P98 A; 2DHZ A; 2QSD A; 4TV3 A; 4KGT A; 1PGA A; 3C0R B; 2LAS A; 3RZW C; 1XQQ A; 1JWS D; 5CHF A; 2ZEQ A; 4FHJ A; 3RN9 C; 2KHW B; 3W5V B; 1FPY A; 2D5G A; 5C23 A; 2W9N A; 3K9P B; 1IBX A; 1HE8 A; 4P6V F; 4BOZ B; 5KHQ A; 2HJ8 A; 4L1B A; 2LUM A; 4N6E B; 2I2Y A; 1TKE A; 2HE7 A; 2BYV E; 5CHW A; 2LVP A; 3P63 A; 3B9J A; 2RDH A; 3E56 A; 3KW5 B; 2Y5C A; 2LVQ A; 3U30 A; 1L0X B; 1T0S C; 4LCD E; 1QLB B; 5IO9 A; 2QIE B; 5GXG B; 1EUV B; 4IWQ A; 3QC8 B; 2WDV B; 2LGI A; 1NYR A; 4DXF A; 2LHD A; 4NQK E; 4DHJ B; 3CSF A; 2K6Q A; 1F0Z A; 2ZVO A; 3T8M A; 2KZR A; 2EKE C; 3CWI A; 2C7H A; 4ANU A; 1FEH A; 3GE3 C; 3HK0 A; 1C4P A; 2IY1 B; 2JYE A; 2J0J A; 5J2R A; 2LEK A; 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