The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Supramolecular protein structure determination by site-specific long-range intermolecular solid state NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
12
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PGA A; 2JWU A; 3FIL A; 1HZ5 A; 5BMI A; 1EM7 A; 1PGB A; 5HFY A; 1K53 A; 2I2Y A; 2RPV A; 3FIL B; 1PGX A; 5JXV A; 1IGC A; 1C9F A; 4MAC A; 3MP9 A; 2IGG A; 2KQ4 X; 2K0P A; 2QMT A; 1UWX A; 1IGD A; 2PLP A; 2PTL A; 1GB1 A; 1ZXH A; 1HEZ E; 3V3X A; 2PW9 A; 4OZB A; 2I38 A; 2JXT A; 4IKG A; 2J53 A; 1MVK A; 2OED A; 2LGI A; 1K52 A; 2IGH A; 1FCC C; 2LHD A; 1MPE A; 4KGS A; 4OZC A; 1D4B A; 2KAC A; 2ZW0 A; 5BMH A; 2IGD A; 2EEL A; 2JSV X; 2ON8 A; 5HG2 A; 4HKZ E; 1QKZ A; 1MHX A; 2RMM A; 2ZW1 A; 1MHH E; 1XCQ L; 2GB1 A; 2GI9 A; 2KWD A; 1XCT L; 3UI3 A; 4IOI E; 1F2R I; 4OZA A; 1XF5 L; 4HJG E; 1GB4 A; 1FCL A; 1IBX B; 5HHD G; 2LHE A; 1K51 A; 2N9K A; 2JZP A; 1FD6 A; 2ONQ A; 2KN4 A; 1P7F A; 5BMG A; 3GB1 A; 4KGT A; 1P7E A; 4KGR A; 1JML A; 1F2R C; 2LUM A; 5HI1 A; 2KDM A; 1YMH E; 2N7J A; 1HZ6 A; 1KH0 A; 1IBX A; 2N9L A; 2NMQ A; 1YNT E; 4WH4 A; 1MI0 A; 4GLS C; 2J52 A; 4D2K A; 2JU6 X; 2QSD A; 1Q10 A; 1K50 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V60 A; 2Z8L A; 2LFI A; 3RUI B; 4EEW A; 1RFA A; 1HZ5 A; 1TKY A; 2BTE A; 1YIW A; 4GU2 A; 3O65 B; 1EU3 A; 1DOX A; 1ZDV A; 3ZXR A; 2ZVO A; 2J42 A; 4MAC A; 5IP4 D; 2KQ4 X; 3VTU A; 1VDV A; 4NPN A; 2KZR A; 3A9J B; 2K5P A; 2V3P A; 3V3X A; 1E8W A; 3B0A A; 1U4A A; 4I6N B; 4YT0 B; 5D6J B; 1DGJ A; 2MBQ A; 1SJE D; 5EE0 A; 1MVK A; 2GOW A; 2OED A; 1V1P B; 1A70 A; 4BKG A; 4E71 A; 5EE3 A; 4OZC A; 2IO0 B; 3HRD D; 1FXI A; 1Y56 A; 2IGD A; 2EEL A; 4MDK E; 1WYW B; 5D3D A; 3IFW B; 2ON8 A; 2K8H A; 2JXX A; 2M4N A; 1P98 A; 3NVZ A; 4L1B A; 1GAQ B; 3CSF A; 2C7N B; 1CMX B; 2MLB A; 3AU4 A; 1F2R I; 2WDV B; 4RGT A; 2VRR B; 1WXM A; 3B08 A; 2MWS B; 4IW0 A; 4ZRJ A; 5AUK A; 1PUT A; 1OEY J; 1VLB A; 1HTQ A; 1J19 A; 2CHZ A; 2INP E; 1K51 A; 1XXG A; 1WSP A; 4ZHO A; 4HCP B; 2KAN A; 3UQB A; 4HPP A; 2GRI A; 1QQR A; 2JRH A; 2V1Y A; 3JVZ X; 3C19 A; 4K3C A; 4FHK A; 3BII D; 2HD5 B; 3L17 A; 1XLN A; 2DHZ A; 1AWD A; 2Y5B B; 4RCO A; 4A3P A; 4GLS C; 3W5V B; 1VD2 A; 2J52 A; 3GE3 C; 3N1Z C; 2WYQ A; 1C77 A; 2KDB A; 1WR6 E; 3H8H A; 1H4R A; 4JLC A; 3GZN B; 2RPV A; 3Q2A C; 1WGY A; 1IGC A; 1C9F A; 1WJ4 A; 4RGO S; 4BVU C; 4GDK B; 3Q8E A; 1UUP A; 2PLP A; 1AYF A; 2L0F A; 4K3B A; 4OZB A; 3HM6 X; 3R66 C; 1AAR A; 2AQ3 B; 1CK1 A; 2BQQ A; 2AYO B; 2KX3 A; 1Y8R C; 3P2B A; 1YQ3 B; 3GP7 A; 2WDT B; 2IGH A; 1MPE A; 3VRA B; 2FCS A; 4RM9 A; 3BZD B; 4PS7 A; 2D5G A; 1WGG A; 3TMP B; 4HKZ E; 2PPH A; 4JWS C; 2DYM A; 2WU5 B; 1FXT B; 1WYG A; 4JGH B; 2OJW A; 3RN9 C; 3NZU A; 4MJS A; 1LQB A; 4AP4 C; 3CWI A; 1FO4 A; 2N9K A; 3GS2 A; 1EWY C; 1FD6 A; 4S17 A; 3L4P A; 3SFE B; 3VTW A; 3T3N A; 4FJY A; 3APC A; 1F2R C; 2LUM A; 2VZK D; 5LNK 1; 1E7P B; 1SE9 A; 3RYT A; 4K81 A; 1SB3 C; 2FID A; 4BOS C; 1WI0 A; 3LDZ E; 5C1Z A; 3NG0 A; 2NMQ A; 5BO4 B; 2DZJ A; 2IY0 B; 4LNO A; 2BW2 A; 4DXA B; 1NEK B; 4G3X B; 5DPS A; 2BBC A; 2ZPN A; 3OG5 A; 1V86 A; 3U52 E; 4BBN C; 1KLU D; 2W3R A; 2M0A A; 3FIL A; 2IO3 B; 2KLG A; 4A3O A; 5BMI A; 1UGM A; 3L0W B; 2YLM A; 2G3Q B; 2KMM A; 3Q3N C; 4TQ1 A; 4NNJ B; 3W1S C; 1C1Y B; 4A20 A; 1JAL A; 4LTU A; 2K0P A; 3RUL A; 1NVI D; 3GE8 C; 3EHV A; 1HEZ E; 4A9A A; 4ACF A; 3DBS A; 2N0S B; 3SEB A; 3BK2 A; 1WX9 A; 2G1E A; 4K7U A; 3X23 A; 1FNU A; 1L7Y A; 4F1S A; 3M3J A; 4KDI C; 1QOA A; 4WQM A; 2EMS A; 1ZE3 D; 5IKC M; 1NYQ A; 5HG2 A; 3PHX B; 3TSS A; 3R7Q A; 2M8S A; 2IND C; 1SE2 A; 2ZVN A; 3DVN V; 2UYZ B; 4XDD A; 1WX7 A; 4C4V B; 2DZK A; 4P1B C; 3EEC A; 2CJN A; 2KAJ A; 4W9H A; 1WXV A; 3KQ4 A; 2KFK B; 2KOX A; 3SR6 A; 1TY2 A; 1I42 A; 5E6O A; 3VHT C; 3WAM A; 3FKY A; 1V8C A; 4LCD E; 2IBI B; 5BMG A; 1EF1 A; 1JRO A; 1WH3 A; 1ACC A; 3PRP B; 3VR8 B; 4DHZ E; 1N62 A; 2L3Z A; 2KX0 A; 3PGE A; 2DWQ A; 3AE5 B; 3MFG A; 3NOB A; 2BT6 A; 3GOE A; 3WAP A; 5C3J B; 2C60 A; 1SSN A; 2LXC A; 1QIL A; 4MH8 A; 1L6U A; 2WXQ A; 2LEK A; 3DWG C; 1Q10 A; 1FEH A; 1P0R A; 4KIK A; 3AB5 A; 4H2A A; 3DVG Y; 2AQ2 B; 1PGB A; 1XEE A; 1V5O A; 3EA6 A; 3O13 A; 3ZLZ A; 4WUR A; 3FC4 A; 3KVF B; 1FMA D; 1D5Z C; 3P4Q B; 4ARC A; 1WXA A; 1WRD B; 1R7S A; 2J4X A; 1UWX A; 4MM3 A; 3IT6 B; 2KD0 A; 4FLH A; 5D3I B; 1GB1 A; 1P9D U; 1YOV B; 1IPG A; 3BVG A; 4ZYN A; 4LDT B; 4LNI A; 3AE6 B; 2LHD A; 4IWO A; 2Q5W D; 4KGS A; 4N59 A; 4IG7 B; 3DVG X; 1E6E B; 3PLU A; 3KWV A; 3QA8 A; 2ZW1 A; 1MHX A; 3ZRF A; 4YTM B; 1TIF A; 1J7A A; 1RWS A; 2GBR A; 1LFD A; 1E0Z A; 3CST A; 5IO9 A; 2J0M A; 3N30 A; 1ZUD 2; 2V3S A; 3DOW A; 3HM3 A; 3LXF A; 4HJG E; 3TEX A; 2C7M B; 1FNV A; 3IAS 1; 1QT9 A; 1L4D B; 4OW0 A; 2V4I B; 2N7D A; 1TZ1 A; 4ANW A; 3ZTC A; 1E5W A; 1P7E A; 3AEF B; 2LXA A; 5J2R A; 3AUL A; 3OWE B; 5E6P A; 4AWJ A; 1WFY A; 3T3O A; 4MSM B; 1R4N I; 2WXF A; 3PTF C; 2D3G A; 5AEK B; 3ZNZ B; 2N9L A; 3H6N A; 1N60 A; 3NUH B; 2O6V D; 1YX5 B; 1MI0 A; 4RMA A; 1JWM D; 5L83 A; 4BKS D; 1CQV A; 1WRI A; 2KYW A; 2LGY A; 2MP2 A; 1FIQ A; 1E90 A; 2CKH B; 1PGA A; 4USA A; 2CU1 A; 5JZE B; 4GB9 A; 3A4R A; 4NAW A; 4B0M A; 3P1M A; 4JL9 A; 3U7Z A; 4YXD B; 2QMT A; 3ABV B; 4XDC A; 2LUE A; 2W54 A; 1XLO A; 1UD7 A; 4ITK A; 1V1P A; 2PW9 A; 3PHW B; 4OVZ A; 5AUI A; 3P4P B; 3P4R B; 4YL8 A; 3JW0 X; 2INC C; 2JXT A; 1V2Y A; 1NI3 A; 2ASQ A; 4NY0 A; 3MC9 A; 2FAZ A; 1Q0W B; 1HA5 A; 3DCG A; 3UF8 A; 4F8C B; 2XNA C; 2KLC A; 3ZKJ C; 4YWG G; 1WX8 A; 4LNN A; 4DDG D; 4BAX A; 2BYE A; 2JSV X; 2V0G A; 4C7Y A; 1FFV A; 3ZDM C; 2FIF A; 4G50 A; 4RF1 A; 1OGW A; 1FRD A; 1XCT L; 3ZW3 A; 4DBG A; 2DYB A; 3DHI C; 3R2T A; 4J3O D; 1D6E C; 1FXA A; 1C4A A; 4XX5 A; 3U4E G; 4KZC A; 4P7I A; 2PJH A; 4W9C A; 1SE3 A; 1C79 A; 3RCZ A; 2WDR B; 3VH3 B; 1B9R A; 4HWI B; 1QLB B; 3MHS D; 4W9K A; 4M8N A; 2BYF A; 2WLB A; 3VVW B; 1UWM A; 1F52 A; 4EUT A; 2KDM A; 2PIA A; 2Y5P A; 4ZDV A; 5BYS A; 4EE2 A; 4M8M A; 1MJD A; 3QCA A; 4DDI D; 4TKN A; 1LM8 B; 5LXI B; 1UGJ A; 4GSW A; 4D2K A; 2K39 A; 2MJE A; 2RD0 A; 5T8I A; 1SE4 A; 2KQS A; 1IUE A; 1UH6 A; 4XC2 A; 3N3K B; 1C4C A; 4GDK A; 2JY6 A; 3VFK A; 5JHB A; 1JWA D; 1EUV B; 3DBL I; 3W9C B; 2KC2 A; 3HVD A; 3LYY A; 1WWT A; 3QAQ A; 3M63 B; 3TEZ A; 4TMA B; 5CHW A; 2KJ6 A; 1E7V A; 4FJV B; 1GNU A; 3PT2 B; 3DBR B; 2REX A; 4REZ A; 5JH5 C; 3ZTD A; 1TS2 A; 4CYE A; 3HUI A; 1QOG A; 3PRZ A; 1L0X B; 1G6J A; 1NYR A; 1GOZ A; 1YQB A; 1YJJ A; 1VRA B; 2JF5 A; 4I6L B; 2RGF A; 1N61 A; 4DWF A; 4C00 A; 3AE3 B; 2Z0E B; 5G55 A; 3VXW A; 4YSX B; 5AZG A; 2N9P C; 2AWT A; 2WXM A; 2GI9 A; 4HVB A; 2WS3 B; 4ICU A; 1KM7 A; 2HE7 A; 1VZ8 A; 3U7D A; 4L2Y A; 3Q8B A; 2HJ8 A; 4II3 B; 1N5X A; 4R3D A; 1RRB A; 2N9E B; 3EUB 2; 4NQK E; 2JZP A; 2GBJ A; 4XGA B; 2LI5 A; 1ESF A; 3AE9 B; 2YVC A; 5HI1 A; 4Q2J A; 4ANX A; 1HZ6 A; 3ZUN A; 1IBX A; 4CHK A; 3Q8A A; 4GN1 A; 4LJP B; 3HHM A; 1Q5W B; 1YNT E; 2IJ0 A; 3NVW A; 5E6N A; 2KQ7 A; 4KV2 A; 3IVF A; 5G5G A; 3N9Y C; 3EFC A; 2SEB D; 2JWU A; 2JRI B; 1RLF A; 3VH4 B; 1MG4 A; 5HFY A; 3DBH I; 4GIV A; 3UQA A; 3A1Q B; 3APF A; 4MSQ B; 1XLP A; 2ZPY A; 2L1A A; 1S1Q B; 4W9F A; 1BUI C; 2AL3 A; 3H1U A; 1BXT A; 2K1F A; 3RZF A; 4KSK C; 2XEW A; 1WZ0 A; 1FFU A; 4DK5 A; 2A4Z A; 3ML9 A; 4IKG A; 2JQR B; 3RT3 B; 4JPS A; 5DPW A; 3N32 A; 4LK0 M; 2MH7 A; 2Y3A A; 3V62 A; 2WXO A; 2X38 A; 5FKA C; 5DCN A; 2KJR A; 4TQ0 A; 3AE4 B; 1UNS A; 4C4V A; 1Z5S B; 1L5P A; 4AUQ C; 3IG3 A; 1MG8 A; 3CF6 E; 2KFK A; 1T0S C; 4AOF A; 2BB5 A; 2KTF A; 4C7Z A; 1WR1 A; 3MJW A; 3PRM B; 4DQO C; 1WJN A; 3T9L A; 4BKT A; 2PE6 B; 3DHG C; 5MPO A; 1SXT A; 3VQI A; 2LHE A; 3WAN A; 2ONQ A; 3HIZ A; 2X8X X; 3TBL D; 4KKJ A; 4M0W B; 1TKG A; 4KVG B; 5BYR A; 1JML A; 1TGZ B; 2PKO A; 2KN5 A; 2MCN B; 3PLV A; 3SDL C; 2L32 A; 4QAY A; 4ZRK A; 2B3A A; 2N1V A; 1FPY A; 2LJ5 A; 3TEW A; 4WIP A; 2MA9 B; 4WWN A; 4DHJ B; 1D5M C; 2KWU B; 1C4P A; 4IUM B; 2VZK B; 4NQL B; 1F1H A; 4RF0 A; 2BF8 B; 5D94 A; 1XD3 B; 3I5J C; 3RNF C; 1WM2 A; 4DHJ D; 1WM3 A; 2VH2 A; 3KUZ A; 1EWC A; 5D2M B; 4M01 A; 2ZEQ A; 3A9K B; 3OLM D; 2PVO D; 1WIA A; 2WX0 A; 2KTR B; 1UF0 A; 4LLG M; 3VUX A; 4S0R A; 3A33 B; 3V05 A; 3DVN U; 3L13 A; 1Z2M A; 2QC8 A; 4TV3 A; 1B1Z A; 3W5U B; 4JE3 B; 2GMI C; 2FUH B; 2HTH A; 5CHV C; 3V6C B; 3KH0 A; 2EMT A; 3S2A A; 2D07 B; 4DXF A; 1I7H A; 2NTS A; 5FR6 A; 3C0R B; 2LVO A; 2M17 A; 3KUC B; 4TUU A; 2FBW B; 1SJH D; 3E9S A; 2ICI A; 2KVR A; 1TS5 A; 3L54 A; 1T3Q A; 1V6E A; 2LVP A; 2ZNV B; 4FHJ A; 2IZV B; 3ZNI D; 3PS6 A; 1OFF A; 1WMH B; 2KKC A; 1V9J A; 3CMM B; 2MW5 A; 4YSY B; 3BWU D; 3U30 A; 1GPX A; 2DX5 B; 4AJY B; 1V49 A; 5EE1 A; 3W2D A; 1XLQ A; 5D7G A; 2KN4 A; 3AE8 B; 4X57 B; 4B9K A; 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4ARI A; 2WXL A; 1TTN A; 2MX2 A; 2RDB C; 1GUA B; 1L0V B; 1EO6 A; 2KVZ A; 4NAM A; 3MTN B; 2O6V B; 1PGX A; 1I4H A; 2OJR A; 2DEN B; 1GC7 A; 1C3T A; 1L4Z B; 4L23 A; 1IGD A; 4WQO B; 3H7S A; 1ZXH A; 2NBU A; 2XK5 B; 3DBL B; 2MQJ A; 4WWO A; 4KZ0 A; 5CX3 A; 1WXS A; 3JSV B; 4WJQ A; 2L83 A; 2LGI A; 3IT4 B; 4B6W A; 3URY A; 3CIR B; 4TSS A; 3A9J A; 4IC7 B; 3RD2 A; 3ETR A; 1WGD A; 1H8C A; 2D3A A; 3DWM A; 3IAM 1; 1E8Z A; 3M95 A; 4N9F 4; 3V61 A; 2LRW A; 2JUO A; 3Q3M C; 2L05 A; 1YJ1 A; 2LZ6 A; 1XCQ L; 2TSS A; 2D2Q A; 5KHQ A; 1KLV A; 2CS4 A; 1I4Q A; 2PMV A; 2DBY A; 5G5H A; 5FR3 A; 1OQR A; 2V9H A; 1T0Q C; 3APD A; 3QJZ A; 2IO1 B; 1J8C A; 3MC0 B; 2KDF B; 2M0X A; 2NS5 A; 3NZ3 A; 3OAW A; 1WJ6 A; 1E10 A; 3ZNH B; 1OEY A; 4MH0 E; 4FBJ B; 4HPL B; 1WF9 A; 2L7R A; 2VH1 A; 3TCA A; 2DAJ A; 1PFD A; 2L52 A; 3WAO A; 2BVC A; 5LLI A; 1KTK A; 3QQ8 B; 1LO5 D; 1VZ6 A; 2NPT B; 3N20 C; 1L6V A; 3MC8 A; 2K8B A; 4EZJ A; 3TJP A; 3BYY B; 2NVU I; 4WH4 A; 3EGR A; 3J9C A; 4HXD A; 5L95 C; 1ZPS A; 3FAH A; 4ZHP A; 1K50 A; 5AZF A; 4M00 A; 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