The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Supramolecular protein structure determination by site-specific long-range intermolecular solid state NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
12
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-04-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FCL A; 4MAC A; 1IGC A; 4WH4 A; 2N9K A; 1F2R C; 1Q10 A; 5HG2 A; 5JXV A; 1FCC C; 3GB1 A; 1K50 A; 4KGS A; 2KQ4 X; 1IGD A; 3UI3 A; 2KAC A; 1K51 A; 2IGH A; 1JML A; 5HI1 A; 1PGA A; 1GB4 A; 2JSV X; 4OZC A; 2OED A; 2QMT A; 4OZA A; 1D4B A; 2I38 A; 2KWD A; 1MPE A; 5BMH A; 1EM7 A; 2LGI A; 1K53 A; 1XCT L; 1XCQ L; 4OZB A; 1HZ6 A; 1UWX A; 1XF5 L; 2ZW1 A; 2NMQ A; 1ZXH A; 5BMG A; 2ZW0 A; 2N9L A; 3MP9 A; 2N7J A; 1GB1 A; 2RMM A; 1FD6 A; 4KGR A; 4IOI E; 1MHX A; 2JU6 X; 1IBX B; 2GI9 A; 2LHE A; 2K0P A; 2PW9 A; 1YMH E; 1MVK A; 1MI0 A; 2RPV A; 2J53 A; 2JXT A; 4IKG A; 2ON8 A; 1KH0 A; 2EEL A; 1HZ5 A; 3FIL B; 2KN4 A; 1YNT E; 4D2K A; 3V3X A; 1PGB A; 2JWU A; 5HFY A; 1QKZ A; 5BMI A; 1MHH E; 1IBX A; 2LUM A; 2GB1 A; 5HHD G; 2JZP A; 2PLP A; 4KGT A; 2J52 A; 2I2Y A; 4HJG E; 1HEZ E; 2IGD A; 2ONQ A; 2PTL A; 1P7E A; 3FIL A; 1PGX A; 1P7F A; 1F2R I; 2QSD A; 1C9F A; 4GLS C; 4HKZ E; 2LHD A; 1K52 A; 2KDM A; 2IGG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CHV C; 1E7V A; 1WGD A; 2INP E; 5TSS A; 3U7Z A; 2N1W A; 4MM3 A; 2NBV B; 4US8 A; 3AU4 A; 5AZG A; 3SFE B; 1GG3 A; 5KHQ A; 1KF6 B; 2KDI A; 1K51 A; 1L6U A; 4WWN A; 4YT0 B; 1HTQ A; 3MC8 A; 2KLG A; 2LJ5 A; 3DBS A; 3EHV A; 2OJR A; 4BBN F; 3AM9 A; 4FXC A; 3PS6 A; 4B0E A; 4EFO A; 2AQ3 B; 4MEL A; 2LGI A; 3PGE A; 3DBR B; 2DZK A; 1XCQ L; 3PT2 B; 3UGB B; 1SB3 C; 2INN E; 3SDL C; 4L1B A; 1LGR A; 1RWS A; 1WYG A; 2D3B A; 5BMG A; 2ZW0 A; 2N4F A; 2N9L A; 2AWT A; 2O2V A; 4RM9 A; 4K7S A; 3U8Z A; 2L32 A; 2LHE A; 1IUE A; 1YMH E; 3U52 E; 2WXG A; 3A33 B; 2L3Z A; 4K1R B; 1JCK B; 4OW0 A; 4W9H A; 1Z2M A; 2K8H A; 1WX7 A; 3EFU A; 3VTW A; 4EZK A; 1XXG A; 5BYQ A; 2FUG 1; 1ZDV A; 2PE9 A; 1F9J A; 3LYY A; 2D10 A; 1T0Y A; 3BK2 A; 4PYZ A; 1WY8 A; 2WWZ A; 3K9O B; 2XN9 C; 2ZZP B; 3BVM A; 3BZD B; 3GE8 C; 4R3D A; 2LJI A; 1BUI C; 3MTN B; 1I4X A; 4HDO A; 1R4M I; 5MPO A; 3CF6 E; 2WDT B; 3NY5 A; 1ZPS A; 1ESF A; 1F2R I; 1ZP0 B; 4GIV A; 2CS4 A; 4ZDV A; 4LLG M; 3P1M A; 2PPH A; 2BS2 B; 4I6L B; 4RM8 A; 4N58 A; 1DOY A; 2DHZ A; 3Q2A C; 3PV1 A; 1CMX B; 4NJ6 A; 2RDH A; 2LGS A; 2M1M A; 3BYY B; 3GB1 A; 1I4H A; 1CJE A; 2BWF A; 4XDD A; 1YQ4 B; 2QCZ A; 3IHP C; 1C4P A; 1J8C A; 3ECI A; 3R7Q A; 1PGA A; 5G55 A; 2OED A; 2QIE B; 3ZIM A; 2GBJ A; 1PYW D; 3AED B; 3AE2 B; 1EO6 A; 1MJD A; 4DHZ B; 4A55 A; 1QOA A; 2WXP A; 2MSE D; 1AWD A; 1ZKH A; 3Q6B A; 1YQB A; 2SEB D; 4EOY A; 3NVZ A; 4K3B A; 2HTM E; 2FBW B; 3W1S A; 1VLB A; 4WWO A; 1BXT A; 2IDY A; 1SSN A; 5IAA C; 2YVC A; 1YX6 B; 2K0P A; 3W5V B; 4B95 A; 3VVW B; 2WXN A; 2C9W B; 2R2O A; 1ROE A; 3AE8 B; 3TMP B; 3VXW A; 3ZDM C; 5DPW A; 2EKE C; 4RF1 A; 2ON8 A; 3EUB 2; 2G4D B; 3FIL B; 2MBQ A; 1SIJ A; 2Z0D B; 3B2G A; 2JWU A; 4BKG A; 5HFY A; 1WMH A; 3BK1 A; 4C7Y A; 1E9M A; 4KSL C; 4M02 A; 3NUH B; 5HHD G; 1WGG A; 1NI3 A; 4XE0 A; 3ZXV A; 1OQR A; 3ZQ4 A; 3ENE A; 3OLM D; 4YSZ B; 4YTP B; 2JUO A; 2PMV A; 1L6V A; 2DYB A; 4FBJ B; 2IZV B; 1C78 A; 2KDF B; 4W9L A; 1Y56 A; 3AE3 B; 1C1Y B; 1WGR A; 5D6J B; 2JVC A; 3VAW A; 1EUV B; 4AJY B; 2GBR A; 2DWQ A; 2C5L C; 2RSU A; 3HVZ A; 3D32 A; 3QAQ A; 2V0G A; 1WJU A; 2A4Z A; 2JSV X; 4BOZ B; 3HK0 A; 3KWL A; 4TMA B; 3UQA A; 2YLM A; 1F1H A; 5E6N A; 5EE3 A; 4IM2 A; 2ZEQ A; 1WZ0 A; 4GDL A; 4XWW A; 1FXT B; 1EWY C; 4HDQ A; 1J0G A; 3P63 A; 5DPS A; 1WR6 E; 2GBN A; 3MHS D; 3ZNG C; 1V6E A; 4LJP B; 3EA6 A; 1V81 A; 1YN5 A; 2XK5 B; 1QOB A; 1OEY J; 3KH0 A; 1WZ3 A; 1YJ1 A; 1CK1 A; 2I1J A; 5E6J A; 4LNI A; 5IOI A; 3PHW B; 1BML C; 4XDC A; 3I9V 1; 1WXQ A; 3FAH A; 1N5X A; 1TZO A; 2JWZ A; 4RGT A; 3APF A; 2KAJ A; 4DQO C; 3A9K B; 1WWT A; 4TQ1 A; 3L13 A; 1LFD A; 1P3Q U; 3OG5 A; 5J18 A; 1TKY A; 2V3S A; 2BB6 A; 4LNO A; 4C7Z A; 4ZHP A; 2M4N A; 2WXM A; 1WYW B; 3LXF A; 3AE7 B; 2BF8 B; 3IVF A; 4RGM A; 2UWQ A; 4TQ0 A; 1Q10 A; 2PEA A; 1KTK A; 2KAC A; 4Q2J A; 3TBL D; 4XZ4 A; 2L7R A; 1E8Z A; 2N9X A; 1KOT A; 2Y5P A; 2EKI A; 1JWB D; 4KV2 A; 1FM0 D; 3A9J A; 4EE2 A; 4LNK A; 2WNM A; 3AEG B; 1YD8 U; 2BT6 A; 4OHJ A; 3Q69 A; 4M00 A; 2A5U A; 3I5J C; 2IO1 B; 4EZL A; 1ISN A; 2BYT A; 2IPK D; 2ZJD A; 2CHX A; 4HKQ A; 1V9J A; 1XQQ A; 2OJW A; 4KKJ A; 3ZUN A; 4S0R A; 2KAN A; 1SE3 A; 2REX A; 3EC8 A; 3DBL B; 2CKH B; 4GDK B; 2E6X A; 1SE2 A; 2G1E A; 3TL5 A; 2KN4 A; 3VUY A; 1HA5 A; 4C4V A; 3ZO5 B; 2W54 A; 1WSP A; 3L10 B; 1L2N A; 3DBR I; 1P1A A; 1MHH E; 5CX3 A; 3H9D A; 2BTE A; 1GUA B; 3VR9 B; 2JZP A; 2Y5C A; 2WXF A; 4ZHO A; 4YTN B; 3GZN B; 2FE8 A; 3LJ3 A; 3NHE B; 3AEA B; 2CHZ A; 3SD5 A; 2M19 A; 3VTU A; 1AW7 A; 1PGX A; 2BW2 A; 2LUE A; 1NI2 A; 5H8Y E; 3U30 A; 2AEH A; 2PVO D; 3VRB B; 3BVG A; 5IKC M; 4DHJ D; 1J19 A; 4MDK E; 1UWM A; 1FCL A; 4O1N A; 2KVR A; 2N9K A; 4MT5 A; 4B0M A; 3KWV A; 2MJD A; 1C77 A; 4IUM B; 1PDX A; 3QC8 B; 2O6V D; 4KIK A; 3Q3M C; 1OGW A; 2C7H A; 2ZCC A; 1D4B A; 2WQY B; 1UEL A; 3Q14 C; 3PRP B; 4DXG A; 4OZB A; 3L0W B; 1E7P B; 4RFB A; 2IYD B; 1NYQ A; 1TT5 B; 1ZW7 A; 1J7B A; 1LXD A; 2NTT A; 3ZVV A; 1UGM A; 2CR5 A; 4GGQ A; 1Q1O A; 1YOV B; 3Q8E A; 4IOI E; 1SE4 A; 1P98 A; 1VZ8 A; 1H8C A; 2BKF A; 1KM7 A; 3BYT B; 3ML9 A; 3PVL A; 1KLU D; 4DK5 A; 1QT9 A; 3AI5 A; 1ENF A; 1TS2 A; 1E8X A; 2JXT A; 3HM6 X; 4WAA A; 3Q3N C; 4II3 B; 4IWQ A; 2FCM A; 3WAP A; 1KLG D; 2RPQ A; 1WX9 A; 3FKY A; 5IA7 A; 2V3P A; 2B3A A; 4C80 A; 3L17 A; 1P9D U; 4IWP A; 3DHG C; 5J2R A; 2NPT B; 1FO4 A; 2WU5 B; 1IBX A; 1AN8 A; 2WXJ A; 2WDV B; 3DQV A; 3JYU A; 4A3P A; 3NJT A; 3QIJ A; 3DOW A; 4KGT A; 2GBM A; 3H1U A; 1JW9 D; 4II2 B; 2YEP F; 4G11 A; 1SIF A; 2BYF A; 1ZDX A; 2O2V B; 4ZRI A; 3MFG A; 1I7H A; 1SEB D; 5LLI A; 3VR8 B; 1TS4 A; 2FCN A; 3PZ8 A; 4IDI A; 4IWO A; 3BIN A; 3RD2 A; 2K5P A; 3QWZ B; 2KDM A; 3E9S A; 2K3U A; 3O13 A; 4ARI A; 3ZJV A; 1JAL A; 5DPR A; 2LGD A; 3N9Y C; 3DBH B; 2DEN B; 4NAW B; 1I4R A; 2VZK D; 3SU8 X; 1ET6 A; 1KJT A; 1V1P A; 2N0S B; 2XNA C; 3HHM A; 3ALB A; 4PS3 A; 2MBO A; 3OJ4 B; 3PRZ A; 4OZC A; 1TBE A; 2WXK A; 4WWM A; 3UIO B; 4WWP A; 4JIO U; 5BMH A; 2K8C A; 4HXD A; 4FAD A; 2LI5 A; 2MBH A; 2KC2 A; 4LNF A; 3Q8A A; 3VUW A; 2RGF A; 1ZGU B; 3I63 C; 5C2T B; 1WF9 A; 3DWM A; 2WX1 A; 4NZL B; 1NVI D; 2G3Q B; 5D3D A; 4DWF A; 2KLC A; 5T8I A; 2RR9 A; 1YIW A; 1MG8 A; 1GPX A; 3T3N A; 2IND C; 2EEL A; 4I6N B; 2N1V A; 3SFD B; 1YNT E; 5E6O A; 2ZCB A; 4AUQ C; 4MH8 A; 2BS4 B; 1PQS A; 3GP7 A; 2OHF A; 3L16 A; 4RGN A; 2FNJ B; 1M94 A; 2J52 A; 2I2Y A; 1TZ1 A; 2ONQ A; 2MBE A; 3CSF A; 2DLB A; 1C3T A; 3R7R A; 4XWT A; 1P7F A; 1GC6 A; 3RT3 B; 4NQK E; 2PE6 B; 1FFU A; 3PO0 A; 1XO3 A; 1K52 A; 2M0X A; 3M62 B; 4NJC A; 3T8M A; 1SXT A; 3IG3 A; 4W9K A; 2LFI A; 3NS1 A; 1S3S G; 3NOB A; 2MHJ A; 1E7U A; 2FCQ A; 3N1Z C; 3KVF B; 4A9A A; 4OVZ A; 4LDT B; 4P7I A; 2W55 A; 4EUT A; 1JRU A; 4JX1 C; 1UBQ A; 1KFY B; 2KWD A; 3GS2 A; 3HVD A; 3N1Y C; 1MPE A; 3ZLZ A; 2WXI A; 4AQ7 A; 2QHO A; 2RD0 A; 2BB5 A; 2KDE B; 1WGH A; 2FUH B; 2ZNV B; 1HZ6 A; 2KVZ A; 2WDQ B; 1HQR D; 4PS8 A; 1I35 A; 2IBI B; 2DZI A; 2BQQ A; 4HCN B; 4M8N A; 5D3I B; 1E10 A; 2C7N B; 3RN9 C; 3V05 A; 1V86 A; 3W1Y A; 1GOZ A; 4AOF A; 2NTS A; 2LRW A; 2C7M B; 3VDZ A; 3QAR A; 4A90 A; 1F77 A; 2UU7 A; 1RAX A; 2CU1 A; 4HVB A; 1WJ6 A; 5FR6 A; 5C1Z A; 3DHI C; 2AL3 A; 3RNG C; 4F1S A; 4EZJ A; 2W82 A; 3EEC A; 2KWC A; 3NG0 A; 2PLP A; 1TGZ B; 4E71 A; 1MFW A; 3NVV A; 3Q8C A; 2MJ3 A; 3AE6 B; 2M8S A; 2PTL A; 2XEW A; 4HPM B; 1NYR A; 4DDI D; 4MGK E; 3AE5 B; 2BVC A; 2MW5 A; 3DBL I; 2JPH A; 1I42 A; 1TYG B; 4ITK A; 3KUC B; 2IY1 B; 3AU5 A; 2ZPN A; 4MAC A; 3P4R B; 2KOX A; 1F2R C; 5E6P A; 4W9G A; 2K22 A; 3ZDT A; 3NVY A; 3KQ4 A; 2X8X X; 4CHK A; 3UF8 A; 1JML A; 1R4N B; 2KMM A; 1G6J A; 3DPD A; 3RMK C; 1IP9 A; 3GZN I; 4A8X C; 4HRS A; 1K53 A; 1QOF A; 1WGY A; 1XLN A; 3HM3 A; 1E90 A; 3PLV A; 1J7A A; 2D3A A; 3P2B A; 2N7D A; 4W9J A; 1D6E C; 1FFV A; 2JZ3 B; 3N1X C; 1FRR A; 1RLF A; 3IT6 B; 3V61 A; 4BAX A; 5AUI A; 4ZYN A; 2JY6 A; 3KLS X; 2JXX A; 4XGA B; 1E8Y A; 1UUP A; 4MJS B; 2E3T A; 4GB9 A; 5FR3 A; 1YN4 A; 3P42 A; 2QDF A; 4W9F A; 4ZRP A; 3VUX A; 4IKG A; 4RCO A; 4S17 A; 2KQS A; 4FHK A; 1WFY A; 3P4P B; 4LDT D; 1HZ5 A; 2KMA A; 1F52 A; 4A3O A; 2MLB A; 2WXO A; 2L8J A; 4HPP A; 5BYS A; 3VRA B; 1ACC A; 3KYC D; 2HE7 A; 4ZRK A; 4ANX A; 3H7P B; 3AEC B; 1SJH D; 2ZVN A; 3DWG C; 4G0N B; 2BYV E; 4E74 A; 1WRD B; 4GN1 A; 1HEZ E; 3DCG A; 3SEB A; 1WH3 A; 3N32 A; 4G50 A; 3V6C B; 5EE1 A; 1D5X C; 3FIL A; 4N9F 4; 4ZOH C; 2BPS A; 3JW0 X; 3ZRC A; 2V4L A; 1PFD A; 1C9F A; 2KWV B; 3WIM A; 2QIL A; 3J9C A; 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2BBC A; 1T5X D; 2LGX A; 3DVN V; 4MSM B; 3JVZ X; 1CZP A; 4XYC A; 2QMT A; 3A4S C; 3H7S A; 4W9C A; 3AXC A; 2WP9 B; 1T6B X; 4IM3 A; 1KRH A; 3RFZ B; 3DVG Y; 2KJH B; 3RYT A; 4GU2 A; 3QJZ A; 3H8H A; 4YL8 A; 1RYJ A; 2KD0 A; 2RMM A; 4DXF A; 1UH6 A; 2KDB A; 2HDE A; 1QF6 A; 1B9R A; 3B1L X; 3B0A A; 3NZU A; 2JU6 X; 1P0R A; 1L4Z B; 3B2F A; 2GLS A; 1MVK A; 4REZ A; 2MBB B; 4F7Z A; 1DYQ A; 1I4Q A; 2EMS A; 3RPF C; 3JSV A; 1SJE D; 1T0S C; 2K25 A; 3MC0 B; 1YN3 A; 2GRI A; 3RNB C; 1F0Z A; 3T3O A; 1GC7 A; 2INC C; 1IYF A; 1L0Y B; 3CMM B; 3M3J A; 2WLB A; 3BII D; 5J17 A; 3NZS A; 4MM3 B; 1A5R A; 4MEM A; 4GDK A; 3NS8 A; 2K6Q A; 4OVV A; 2MH7 A; 2G4S A; 1OQQ A; 4GSW A; 1JWM D; 2B76 B; 4ANV A; 3RZW C; 1SF0 A; 4HKZ E; 3PHX B; 1C79 A; 3PSE B; 5DPT A; 4UDU C; 4CQN A; 2MP2 A; 5GXG B; 1TIF A; 2RDB C; 4FN2 A; 5TR5 A; 4QAY A; 2M0A A; 3VH4 B; 3BY4 B; 5HG2 A; 1LO5 D; 2DBY A; 4KGS A; 2DX5 B; 1UBI A; 4N6E B; 2L76 A; 1QQR A; 1GB4 A; 4ARC A; 5CTR C; 1VCB A; 2KJR A; 1EU3 A; 4TV3 A; 2BKR B; 1FRD A; 3KUD B; 4YXD B; 4MGI E; 2IO3 B; 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