The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Staphylococcus aureus
|
| publication title |
Crystal Polymorphism of Protein GB1 Examined by Solid-State NMR Spectroscopy and X-ray Diffraction.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
16
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2IGH A; 1IBX B; 1F2R C; 4KGT A; 5BMG A; 1XCT L; 2KDM A; 1XCQ L; 1MHX A; 1IBX A; 2PW9 A; 4OZA A; 2KWD A; 4KGR A; 4OZB A; 3FIL A; 4MAC A; 1C9F A; 2GB1 A; 5JXV A; 1JML A; 1P7E A; 2GI9 A; 2IGG A; 1MI0 A; 1UWX A; 1MPE A; 1YNT E; 2RPV A; 4WH4 A; 5HG2 A; 3UI3 A; 1PGA A; 5BMH A; 4IKG A; 2KAC A; 5HI1 A; 1P7F A; 2JWU A; 2RMM A; 2LHE A; 2I38 A; 2IGD A; 2PLP A; 3V3X A; 2ZW1 A; 4KGS A; 4D2K A; 5HFY A; 2QMT A; 2JZP A; 1GB1 A; 1K52 A; 1YMH E; 1FCC C; 2J52 A; 1HZ5 A; 1IGC A; 3MP9 A; 1F2R I; 2KQ4 X; 5HHD G; 2LUM A; 2I2Y A; 1K51 A; 2KN4 A; 1MVK A; 1HEZ E; 2N9L A; 1D4B A; 1MHH E; 1QKZ A; 5BMI A; 1FCL A; 2LHD A; 2K0P A; 2LGI A; 1Q10 A; 2J53 A; 4HKZ E; 4IOI E; 1FD6 A; 4OZC A; 2ON8 A; 2OED A; 2PTL A; 4GLS C; 2NMQ A; 1IGD A; 1K53 A; 1EM7 A; 3FIL B; 2JSV X; 3GB1 A; 2ZW0 A; 2N9K A; 1PGB A; 1ZXH A; 1XF5 L; 2ONQ A; 1HZ6 A; 2QSD A; 1PGX A; 1K50 A; 1GB4 A; 2EEL A; 2JU6 X; 2N7J A; 1KH0 A; 4HJG E; 2JXT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KAN A; 4TMA B; 1IPG A; 4C4V A; 2FAZ A; 2WXM A; 1LFD A; 2MP2 B; 3RMK C; 2GMI C; 3RNB C; 2CKH B; 5IP4 D; 3J9C A; 1U4A A; 3P63 A; 2Z0E B; 2KZR A; 2DEN B; 4GU2 A; 1UEL A; 4US8 A; 1TIF A; 3AH7 A; 3Q2A C; 3Q14 C; 2JF5 A; 2UU7 A; 2R61 A; 1JML A; 4GDK A; 4W9L A; 1LXD A; 2MBH A; 2LGY A; 3B08 A; 4TV3 A; 3Q3M C; 1D6E C; 4NY0 A; 4KKJ A; 2WXL A; 1T6B X; 3IAM 1; 4GN1 A; 2LHE A; 1OQR A; 1WSP A; 1LGR A; 1VLB A; 2WXR A; 5J18 A; 1IP9 A; 4WWO A; 3ZJV A; 1OFF A; 3ZDM C; 1YQB A; 4A6Q A; 2KAJ A; 1HEZ E; 3L08 A; 2IY1 B; 3VTV A; 2JQR B; 4HCN B; 4YTP B; 4RGO S; 1ISN A; 1WI0 A; 2WXF A; 4FXC A; 1WJU A; 1EWC A; 3W1S C; 4ACF A; 3AEA B; 2JZZ A; 1FPY A; 3NUH B; 4RMA A; 4HKZ E; 2KYW A; 1PYW D; 1K53 A; 3FIL B; 4N59 A; 2JSV X; 2ZW0 A; 2N9K A; 5IN7 A; 2N9E B; 2NPT A; 3RYT A; 2RR9 A; 2KT7 A; 1OGW A; 3C0R B; 1AWD A; 2KVZ A; 5C1Z A; 2LVP A; 3APC A; 1ZDX A; 2MLB A; 3ZNG C; 3MC0 B; 4NNJ B; 5H8Y E; 1IBX B; 3NOB A; 4DDG D; 2RDB C; 4C7Y A; 4XYC A; 4MM3 B; 3L16 A; 1RYJ A; 2KWD A; 4KGR A; 4GSW A; 2ICI A; 1HXY D; 1OEY J; 4MAC A; 4DHJ B; 1I4X A; 1ZDV A; 3B0A A; 3AV8 A; 3V62 A; 3Q69 A; 4AOF A; 1C3T A; 3PO0 A; 3RNA C; 1MPE A; 2RPV A; 1JRP A; 3WAM A; 4USA A; 3A4R A; 2IJ0 A; 5C3J B; 2AL3 A; 1L6V A; 2IGD A; 4JLC A; 1Q0W B; 2FIF A; 1WH3 A; 5BYR A; 2Y5P A; 4J6I A; 1WXQ A; 1WYW B; 2BS3 B; 2Z0D B; 3A1Q B; 1PUT A; 2C60 A; 1OTR B; 1IGC A; 2K6D B; 1F2R I; 2KO3 A; 4HEA 1; 1D4B A; 3HIZ A; 4AJY B; 3PRZ A; 3U8Z A; 4C4V B; 1GUA B; 1CMX B; 3R2T A; 4DDI D; 2G4S A; 4CYE A; 1JCK B; 2J7Q B; 4CHK A; 3R8B A; 5GMV A; 1QLB B; 3QQ8 B; 3Q3J A; 1BUI C; 2KDB A; 5BYQ A; 4MEM A; 3WAO A; 1XO3 A; 4GDK B; 2DX5 B; 4WAA A; 4YXD B; 4II3 B; 1T0S C; 3E56 A; 1D3Z A; 1ESF A; 2QIL A; 1N63 A; 3EA6 A; 4LDT B; 1HTQ A; 1SJH D; 3DVG X; 3RNC C; 2YVC A; 3LYY A; 3AED B; 4P1C C; 2WDR B; 1QOG A; 3NY5 A; 4J3O D; 5GXG B; 4RCO A; 4FJV B; 2DAF A; 5KHQ A; 2FCN A; 2PE9 A; 4F7Z A; 2GBR A; 2WXN A; 1WX8 A; 4OW0 A; 1JWB D; 3UIN B; 3P42 A; 2WS3 B; 3EUB 2; 3D32 A; 1MI0 A; 4XDD A; 1YJI A; 2WU2 B; 2SAK A; 4CQN A; 3DBL B; 3VQI A; 1GPX A; 3QIJ A; 2WNM A; 1TS3 A; 3QWZ B; 4DBG A; 2ZEQ A; 2BYF A; 4ZDV A; 2MRP A; 3L17 A; 3ZQ4 A; 1WX9 A; 2ZW1 A; 3R3M A; 5LLI A; 3H7S A; 3ZRC A; 2D3C A; 3RFZ B; 3I9V 1; 3RNE C; 4NQK E; 3PGE A; 2NPT B; 5C23 A; 2X38 A; 3VR9 B; 2MSE D; 1RAX A; 4WJQ A; 2WHI A; 2ASQ A; 3I57 A; 1VR9 A; 1KF6 B; 3AUL A; 4ASW C; 1OQQ A; 3AU4 A; 3B1L X; 5HKH A; 2J4X A; 4MH0 E; 1QZE A; 5D2M B; 2YLM A; 5JZE B; 3KQ4 A; 3ZGZ A; 4FUL A; 4C56 C; 2ON8 A; 4BAX A; 3QA8 A; 3WCQ A; 1EF1 A; 4XWT A; 1X1M A; 2LMC A; 1CJE A; 2LGD A; 1WRD B; 2JWZ A; 1TTN A; 4ANU A; 1SJE D; 4JQW C; 3AE5 B; 1MG8 A; 2N7J A; 3DCG A; 3CSF A; 4TQ1 A; 3EC8 A; 2IGH A; 4M00 A; 3PHX B; 2BPS A; 1Y56 A; 1GG3 A; 4JWS C; 4G3X B; 4ZYS A; 4XX5 A; 4LNF A; 4K7U A; 3WA0 A; 3JSV A; 5J2R A; 1D5M C; 2KQ7 A; 2RDH A; 3NVV A; 2MQJ A; 1R7S A; 1UGJ A; 5AZF A; 3OJ3 A; 1C76 A; 4H2A A; 1DOY A; 4A3P A; 3LXF A; 1AN8 A; 3K9O B; 2DNF A; 4TKN A; 2OHF A; 1FNW A; 2LRW A; 3HM6 X; 1ZUD 2; 4BFR A; 1ZGU B; 2KAC A; 5IAA C; 1TYG B; 3WAL A; 2KMA A; 3R2I A; 1I4R A; 2C5L C; 2DYO A; 2JWU A; 4LNN A; 3ZYY X; 1IYF A; 2UYZ B; 1WJ4 A; 1PQS A; 1UNS A; 3RNG C; 1SBB B; 4NQL B; 2XBB C; 2WDQ B; 2W3R A; 1LM8 B; 5JH5 C; 4BKS D; 2HTM E; 4HVB A; 3AE2 B; 3QK0 A; 4ZHO A; 4IWO A; 2I2Y A; 4B0M A; 4XDC A; 1VZ6 A; 2GBK A; 2N9X A; 2VZK B; 3PRP B; 4UDU C; 2K39 A; 1E8Z A; 2CR5 A; 4YWG G; 3RUL A; 3CST A; 1XQQ A; 2QEJ C; 2KFJ A; 2WXO A; 1BXT A; 1C4C A; 2HE7 A; 1WXV A; 2K0P A; 1T3Q A; 2LVQ A; 4JWU C; 3TEZ A; 1FIQ A; 3IFW B; 2YEP F; 4ANX A; 2KC1 A; 3N20 C; 4WQM A; 1YX6 B; 2D07 B; 3GB1 A; 4PYU A; 3TSS A; 3PSE B; 4WJO A; 1ZXH A; 3ETR A; 1XF5 L; 4M0W A; 4NJ7 A; 1PGX A; 3OG5 A; 2BKF A; 1L0V B; 2KQS A; 1VJK A; 1KRH A; 3IXS A; 2KMM A; 3VUX A; 2L52 A; 1I4G A; 2D3B A; 4L23 A; 1YX5 B; 1T5X D; 2W9N A; 4XZ4 A; 1OEY A; 1R4M B; 5FR6 A; 1E0Z A; 1PDX A; 2K8C A; 3LDZ E; 1C9F A; 4W9I A; 2LUE A; 2WXK A; 1XT9 B; 2Q5W D; 3KWV A; 4DQO C; 2N7D A; 2N0S B; 4LK0 M; 2LVO A; 2ZCC A; 2KVR A; 3UI3 A; 1SE4 A; 1YN5 A; 3DBH B; 2KD0 A; 1NEN B; 1ZKH A; 4A9A A; 2DAJ A; 1MFW A; 2D3A A; 3MJ5 A; 1T0R C; 1TKE A; 2I38 A; 2KC2 A; 3V3X A; 1Q5W B; 3SR6 A; 2WXG A; 2CHZ A; 3AE3 B; 2MX2 A; 1GB1 A; 4EZL A; 3URY A; 2J0K A; 2DWQ A; 2J52 A; 1V1P A; 1Z5S B; 3NRZ A; 4GGQ A; 2EMT A; 1FXI A; 2N9P C; 1J7B A; 2SEB D; 2WLB A; 3EFU A; 3H7P A; 2LXA A; 1QOA A; 4JPS A; 4PYZ A; 1MG4 A; 1JRO A; 2MJ3 A; 4K3C A; 4EOY A; 3AM9 A; 2HJ8 A; 2INP E; 2QCZ A; 2IO0 B; 2G3Q B; 3FAH A; 1WMH B; 3JSV B; 4M01 A; 2BS4 B; 4OZC A; 3UF8 A; 2C9W B; 1F77 A; 3SHQ A; 3RZW C; 2KTF A; 3Q8B A; 3Q8A A; 3ML8 A; 3M63 B; 1FXT B; 1A5R A; 4DXA B; 1K50 A; 3IT4 B; 2IY0 B; 3TBL D; 3VFK A; 1SE9 A; 2L32 A; 3QHT A; 5IKC M; 1NI3 A; 4B95 A; 4RH6 A; 4ZRK A; 3U4E G; 4MDK E; 2WXI A; 3VAW A; 1WF9 A; 4A20 A; 1E10 A; 5FK9 C; 5CX3 A; 2L83 A; 5EDS A; 1HA5 A; 1RFA A; 1GJZ A; 4BOS C; 3R66 C; 1WJN A; 3AE7 B; 2GRI A; 3RN9 C; 3E9S A; 3W2D A; 2D10 A; 3V61 A; 2NBV B; 3R7Q A; 2NBU A; 2UWQ A; 1GAQ B; 5LXI B; 3PPA A; 2BWF A; 4ICU A; 2DLB A; 1WXA A; 3U7Z A; 3ZLZ A; 3AB5 A; 1V49 A; 2FCQ A; 4F8C B; 1ZW7 A; 3PTF C; 4DK5 A; 5DPT A; 1EF5 A; 2ZPY A; 4N58 A; 1C1Y B; 2GOW A; 4ZRJ A; 2GBN A; 2NVU I; 2GLS A; 2M4N A; 3RT3 B; 3IG3 A; 4BKG A; 3X0W A; 2O6V B; 5HHD G; 2CJN A; 4FJZ A; 3N1Y C; 3NS8 A; 4S17 A; 1MVK A; 4M0W B; 3RUI B; 1E8X A; 2K25 A; 1UGM A; 2DYB A; 3ZXV A; 1QT9 A; 5DPS A; 3V05 A; 3N9Y C; 3H1U A; 4ANV A; 3K9P B; 1N60 A; 4FAD A; 2VH2 A; 2REX A; 3ZIM A; 1IUE A; 5EE0 A; 1CZP A; 2HTH A; 2J53 A; 3NS1 A; 4HLE A; 3BIN A; 1L0X B; 2V0G A; 2QIE B; 1J7C A; 3RI7 C; 4II2 B; 1L4D B; 1S1Q B; 4XE0 A; 4GXB A; 2WXH A; 1TS4 A; 2LAS A; 2MCN B; 3ZRF A; 3ZVV A; 3ZNZ B; 1E6E B; 1XLN A; 1V5O A; 1YJ1 A; 4RGT A; 2ZZP B; 5DPR A; 3PVL A; 2KK8 A; 2E6X A; 4K7W A; 2DZJ A; 4EKU A; 1FM0 D; 2M0X A; 5BMG A; 5DPW A; 2KDM A; 4NJ6 A; 4IUM B; 1YD8 U; 1F52 A; 2PW9 A; 3X23 A; 1VZ8 A; 5BO4 B; 1V1P B; 2KWU B; 4YTN B; 4ZHP A; 1STE A; 3SU8 X; 2GI9 A; 4W9G A; 2KTR A; 4P6V F; 3B2G A; 3FC4 A; 4PS3 A; 3JVZ X; 3Q8F A; 1V9J A; 2EMS A; 2M19 A; 3DOW A; 4XC2 A; 1JWU D; 2CS4 A; 1HTO A; 2AWT A; 3P1M A; 1KLU D; 1ZPS A; 3W1S A; 3RCZ A; 3MHZ A; 1ET6 A; 1VZ7 A; 3MC8 A; 3Q6B A; 1VRA B; 3TIX A; 3PHW B; 1C79 A; 1N6Z A; 1NDD A; 4I6P A; 4YSY B; 1BML C; 4ARI A; 4RNA A; 4AP4 C; 1V80 A; 4IWQ A; 1HQR D; 1UF0 A; 4BVU C; 3CF6 E; 1WXS A; 2OJR A; 2M17 A; 1B9R A; 3TL5 A; 1NYR A; 4YT0 B; 1TBE A; 1NI2 A; 2BF8 B; 2K1F A; 1BT0 A; 2PVG C; 4M02 A; 2DZM A; 3IT6 B; 4JX1 C; 1WX7 A; 1C77 A; 1RFK A; 1WGH A; 3KUC B; 4WWP A; 3VTU A; 4JE3 B; 2QSD A; 2MHJ A; 2PE6 B; 1GC7 A; 4KVG B; 1V81 A; 3ONS A; 2IYD B; 2JXT A; 1FFU A; 1WM3 A; 4ZRI A; 3MFG A; 3OAW A; 3ZW3 A; 2IND C; 4JGH B; 3DVN U; 2LJI A; 1XCQ L; 1MHX A; 2JVC A; 2V1Y A; 2LFI A; 4DXF A; 4EFO A; 1WR6 E; 2R2Q A; 1E7U A; 2AQ2 B; 4IM2 A; 5JXV A; 4HRO A; 3A9J A; 2IO3 B; 3GE8 C; 4BBN C; 4C80 A; 1UWX A; 2K3U A; 5EE9 A; 1G6J A; 2WXJ A; 1SSN A; 3M3J A; 3PRM B; 1V86 A; 2AX5 A; 5AUI A; 4A90 A; 1YQ4 B; 1M4V A; 2FCM A; 3UGB B; 2PLP A; 3TUO A; 3IHP C; 2WDV B; 4FN2 A; 4KGS A; 1WGY A; 2V3S A; 1N62 A; 3SDL C; 2JX5 A; 2JZP A; 3V60 A; 5AUK A; 4IM0 A; 3WIM A; 3H6N A; 5DCN A; 2ZJD A; 3C19 A; 2L1A A; 4GB9 A; 2RD0 A; 3IBE A; 1XD3 B; 2L3Z A; 2ZNV C; 1YN3 A; 4W9H A; 4HJK A; 1UBI A; 3ENE A; 5H92 C; 4S0R A; 4XGA B; 2FBW B; 2LGI A; 1WZ0 A; 2RSU A; 3UIP B; 3GZN I; 3S2A A; 4US9 A; 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1NEK B; 4WJN A; 2J0M A; 2J0J A; 1TJE A; 2TSS A; 3A9J B; 4KZ0 A; 2BGF A; 1XEE A; 1V8C A; 1JW9 D; 4DHZ E; 3SFD B; 4LNK A; 2KDF B; 4O1N A; 3M62 B; 3SEB A; 2K5P A; 4XWW A; 5C2T B; 3L0W B; 2MP2 A; 3VUW A; 2N1W A; 5CHF A; 4P1B C; 3N3K B; 2KN5 A; 4N9F 4; 3GE3 C; 1V2Y A; 1YJJ A; 4OVZ A; 2DHZ A; 4ZOH C; 2QDF A; 1V1O A; 5MPO A; 4MEL A; 2MBO A; 1M94 A; 3DHI C; 2BYV E; 1TKG A; 4LDT D; 4MGY E; 3ECI A; 1J0G A; 3DQV A; 2JY6 A; 2C7M B; 3SD5 A; 2B3A A; 2QMT A; 2LI5 A; 2BBC A; 3HVD A; 3VVW B; 2MBQ A; 3NVZ A; 3DPD A; 1XXG A; 1JWA D; 3IAS 1; 1VDV A; 4B0E A; 2LUM A; 5TR5 A; 3RPF C; 1A70 A; 3AEF B; 2QC8 A; 3PLV A; 2XNA C; 4BZA A; 4E74 A; 1K8R B; 3Q3O C; 3OLM D; 4TSS A; 2O2V A; 4KV2 A; 1ROE A; 3GP7 A; 4MH8 A; 5FKA C; 1YQ3 B; 3O13 A; 1FD6 A; 3VRB B; 3AI5 A; 2PTL A; 1GOZ A; 3OJ4 B; 1RLF A; 2CU1 A; 2M8S A; 4GDL B; 2KJR A; 1RM6 C; 4HDQ A; 3AEB B; 1DOI A; 1WJ6 A; 1I4P A; 3W5U B; 2DBY A; 4FA6 A; 4W9D A; 2DYM A; 2LWP A; 2JRH A; 4OVV A; 3LJ3 A; 1CQV A; 1GC6 A; 1NVI D; 2H88 B; 3DHG C; 4QAY A; 4N6E B; 2PMV A; 4GMV A; 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