The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
b'MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| publication title |
Crystal Polymorphism of Protein GB1 Examined by Solid-State NMR Spectroscopy and X-ray Diffraction.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus
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| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
16
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PW9 A; 3FIL A; 2N9L A; 2OED A; 5HI1 A; 3FIL B; 3GB1 A; 1IGC A; 1FCL A; 1QKZ A; 1UWX A; 2J52 A; 2RMM A; 1F2R C; 1K52 A; 1GB1 A; 2N9K A; 2JZP A; 4KGT A; 1HEZ E; 1HZ6 A; 2K0P A; 1Q10 A; 4D2K A; 1ZXH A; 1P7E A; 2ZW0 A; 2KN4 A; 1PGB A; 1JML A; 1MHH E; 2QMT A; 4HJG E; 1EM7 A; 4WH4 A; 2IGH A; 2LGI A; 1P7F A; 5JXV A; 5BMG A; 2JXT A; 4OZA A; 1FD6 A; 2PTL A; 2KDM A; 2JWU A; 2KWD A; 2NMQ A; 1IBX A; 1IGD A; 1HZ5 A; 1F2R I; 1IBX B; 2LHD A; 1MVK A; 4MAC A; 2GB1 A; 1YMH E; 5HG2 A; 4KGR A; 2JSV X; 5HHD G; 2PLP A; 2ZW1 A; 5BMI A; 1GB4 A; 2GI9 A; 4OZC A; 2KQ4 X; 5BMH A; 3V3X A; 2N7J A; 2J53 A; 4OZB A; 2I2Y A; 2LUM A; 1YNT E; 4GLS C; 1XCQ L; 2RPV A; 1KH0 A; 1PGA A; 4IOI E; 1MHX A; 1K50 A; 1C9F A; 2JU6 X; 1XF5 L; 1MI0 A; 4IKG A; 2KAC A; 2LHE A; 1D4B A; 1PGX A; 1MPE A; 4KGS A; 2ON8 A; 2I38 A; 2IGG A; 5HFY A; 3MP9 A; 4HKZ E; 2ONQ A; 1FCC C; 2QSD A; 3UI3 A; 1XCT L; 1K51 A; 2IGD A; 1K53 A; 2EEL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W3S A; 1P1A A; 1IP9 A; 2L0F A; 2AQ3 B; 3DWM A; 2GBK A; 1KLG D; 1Q5W B; 3Q8F A; 4XDD A; 1WJ4 A; 3L10 B; 2L0T A; 3B08 A; 4K3C A; 4ZRJ A; 2MJE A; 4XYC A; 1L7Y A; 4C4V B; 3VXW A; 2KN4 A; 4L2Y A; 3HHM A; 3PTF C; 3EUB 2; 1WXM A; 2KLC A; 2LXC A; 3H9D A; 4W9D A; 4W9H A; 1D5Z C; 3MC8 A; 2M17 A; 2M0X A; 3Q3O C; 4IWP A; 1FRD A; 4RF1 A; 3PT2 B; 1LM8 B; 2BVC A; 1VJK A; 3MTN B; 1F9J A; 3Q8C A; 5MPO A; 1FXA A; 3Q8B A; 3IXS A; 2IND C; 2HTH A; 2KWD A; 4A6Q A; 1AW7 A; 3JSV B; 4AJW A; 4LDT D; 2WXG A; 4CYE A; 4OW0 A; 5EE0 A; 5G55 A; 4MAC A; 2FCN A; 1YMH E; 2JUO A; 2OJW A; 1OQQ A; 1JAL A; 4EZJ A; 1V1P A; 5H8Y E; 3PRM B; 2INC C; 5DCN A; 1VZ8 A; 2KQ4 X; 2L7R A; 2Y5C A; 1JWS D; 2HE7 A; 3P63 A; 3RNA C; 1WI0 A; 4CQN A; 3QC8 B; 4IKG A; 1WJU A; 3M63 B; 1R4N I; 1XXG A; 3HVD A; 1PGX A; 1I4P A; 3A9K B; 3IHP C; 1H4R A; 1GC7 A; 3MP9 A; 4W9C A; 2YEP F; 1N63 A; 4P1B C; 1XCT L; 3O65 B; 3DBL B; 4KVG B; 3AI5 A; 2CJO A; 3BVZ A; 1SBB B; 3GS2 A; 1T0S C; 1YN4 A; 4EFO A; 4ZYS A; 1E10 A; 2WXN A; 2LAS A; 2RMM A; 4B0M A; 4NJ6 A; 4FJY A; 3I57 A; 1FXI A; 4RMA A; 1ZE3 D; 1AN8 A; 4B9K A; 3E56 A; 5D3D A; 5BYQ A; 3R3M A; 1WF9 A; 1CMX B; 4C7Z A; 5C3J B; 1J7A A; 1F0Z A; 2KTF A; 3ZO5 B; 1I4G A; 4JWU C; 4WJO A; 2IY0 B; 3PGE A; 4MGY E; 2D2Q A; 1SEB D; 1TTN A; 4KIK A; 5J17 A; 4FHJ A; 2JXT A; 5AZH A; 4WQM A; 2O6V B; 5GMV A; 3U2S C; 3SU8 X; 1LQB A; 2MW5 A; 3Q69 A; 3TL5 A; 3B0A A; 4IWO A; 4KDI C; 5E6P A; 4N58 A; 4KX6 B; 1I7H A; 2MBO A; 3I63 C; 3HM6 X; 1D3Z A; 2V3S A; 5AZG A; 1WMH A; 3AU4 A; 4JE3 B; 3RFZ B; 1JCK B; 2C5L C; 1KF6 B; 2MBH A; 1K8R B; 1ZDX A; 1VD2 A; 2PVG C; 1WX7 A; 1ZKH A; 2D11 A; 1V81 A; 1FRR A; 1BUI C; 3AE5 B; 1FNW A; 2LRW A; 4FXC A; 2JYT A; 5BO4 B; 3HUI A; 2MP2 B; 2NBU A; 1SE2 A; 2MH7 A; 4ARC A; 2AWT A; 3SEB A; 1UUP A; 2LI5 A; 3KLS X; 3ZUN A; 2LEK A; 2N9L A; 1BT0 A; 2KDI A; 1MFW A; 1FCL A; 1SJE D; 4OVZ A; 2SEB D; 3A1Q A; 5EE1 A; 4ITK A; 3BVM A; 3AV8 A; 1FFV A; 4GU2 A; 2KKC A; 1GJZ A; 2E6X A; 4N59 A; 4KGT A; 4EE2 A; 2KMA A; 1HEZ E; 4I6P A; 2K0P A; 1SXT A; 2WHI A; 3VVW B; 3W9C B; 2LJI A; 1E7P B; 2BPS A; 1V2Y A; 1RAX A; 4YWG G; 1E8X A; 4MDK E; 1RM6 C; 2N1V A; 3BK2 A; 3UIN B; 2LVO A; 3Q14 C; 2FBW B; 2PEA A; 2JRI B; 4WQO B; 4NAW B; 3KWL A; 2KWV B; 3EA6 A; 3ZJU A; 1RFA A; 3VTU A; 3NUH B; 2I1J A; 5D6J B; 4WUR A; 2QCZ A; 3IAM 1; 4HDO A; 1LFD A; 4W9I A; 3V62 A; 4C00 A; 4R3D A; 5DPT A; 4LJO B; 2LUE A; 5JHB A; 3NHE B; 3ZYY X; 1HTQ A; 3APF A; 2LD9 A; 2WQY B; 3ZGZ A; 1YN5 A; 1L0V B; 1SJH D; 4ZRQ A; 2WXI A; 2JZ3 B; 4ACF A; 2RPV A; 2YVC A; 2L3Z A; 3IAS 1; 4YTN B; 1E5W A; 3CWI A; 3KQ4 A; 1E6E B; 2WXP A; 3DVG Y; 1C3T A; 3JYU A; 2QEJ C; 5DPS A; 3WCQ A; 4LDT B; 1NYR A; 4A20 A; 1V6E A; 1DOY A; 1K53 A; 2GLS A; 2TSS A; 3M3J A; 2PIA A; 4RGO S; 4IM0 A; 3QX1 A; 3NRZ A; 4C56 C; 1L4D B; 1DOX A; 3NY5 A; 3FIL B; 3GB1 A; 3DCG A; 4WJN A; 1RLF A; 5IN7 A; 2IJ0 A; 1IGC A; 3PVL A; 3QAQ A; 4KV2 A; 2J52 A; 3J9C A; 1FEH A; 4S0R A; 3H7P B; 2L1A A; 1XLN A; 1FM0 D; 2K8H A; 5HKH A; 1TZ1 A; 2GMI C; 3BYY B; 2R61 A; 3EGR A; 2BKR B; 1YQ4 B; 3VUW A; 5T8I A; 1RWS A; 1R4M I; 3UIP B; 3EEC A; 4US8 A; 3W5U B; 4HVB A; 1EM7 A; 3KW5 B; 1LGR A; 2ZPY A; 4M8N A; 1YX6 B; 2MRP A; 4IG7 B; 4S17 A; 3QWZ B; 4DWF A; 3AED B; 2MBQ A; 1X1M A; 4MJS A; 2NTS A; 4TSS A; 1SE9 A; 5CHF A; 2OOB B; 1CJE A; 2LGS A; 1UF0 A; 1E8Z A; 4BKG A; 4NJC A; 2DYB A; 3NZ3 A; 3ZTC A; 2DZK A; 4E74 A; 4FHK A; 5BMI A; 3CMM B; 2MX2 A; 1T3Q A; 2JF5 A; 1WY8 A; 1GPX A; 3LJ3 A; 3ZNZ B; 3RUL A; 2G3Q B; 5AUK A; 2O2V B; 3OJ4 B; 4GN1 A; 4IUM B; 3T8M A; 4W9J A; 1KLU D; 1J0G A; 2KO3 A; 2VH2 A; 4PK1 A; 4GMV A; 4M8M A; 1D5X C; 1V86 A; 4JGH B; 3C0R B; 1UD7 A; 1KTK A; 2PW9 A; 2MQJ A; 1MG4 A; 5J2R A; 3EHV A; 5E6J A; 4ZHP A; 4HWI B; 4EZK A; 1QKZ A; 2FCQ A; 1GB1 A; 1XLP A; 3NVZ A; 4FJZ A; 2J0K A; 2EMT A; 2YLM A; 3HK0 A; 1ZXH A; 3NG0 A; 4HJK A; 1WGG A; 2Y5P A; 3NOB A; 3Q3M C; 3R2T A; 4B95 A; 3U7Z A; 1V49 A; 2J0J A; 2C7H A; 4GGQ A; 2J42 A; 1T5X D; 5DPR A; 3L13 A; 3BK1 A; 4W9K A; 4NAM A; 3AM9 A; 2KQS A; 4BKT A; 1QT9 A; 3MJ5 A; 3SFE B; 3B2F A; 2PTL A; 2KDM A; 1NEN B; 3C8Y A; 1JWA D; 4OVV A; 1JRO A; 1BML C; 1D5M C; 3IVF A; 1QLB B; 2LMC A; 2KC2 A; 3R8B A; 1IUE A; 2WU2 B; 5E6N A; 2DAJ A; 3AE4 B; 4DHZ E; 1S3S G; 1XD3 B; 2EKI A; 1C78 A; 2WXM A; 4RGN A; 3Q2A C; 3SHQ A; 2KC1 A; 1PYW D; 2MCN B; 2IZV B; 1L2N A; 4GDL A; 1V1O A; 3V3X A; 3P2B A; 2LVP A; 3NS1 A; 3NZU A; 1MHX A; 2JU6 X; 4EKU A; 1I4Q A; 2W3R A; 4W9F A; 2BKF A; 1OQR A; 3DDC B; 4ANU A; 2K9X A; 3DBS A; 5TR5 A; 2ZCC A; 2D5G A; 4MM3 A; 4AOF A; 4EOY A; 4DXG A; 4GIV A; 3OAW A; 5FR3 A; 2CJN A; 2DNF A; 4LNN A; 2BYT A; 3PLV A; 2KX0 A; 3JVZ X; 4US9 A; 3MC0 B; 2VZK D; 2WYQ A; 4OVU A; 1JWB D; 4HPP A; 1WJ6 A; 1TS4 A; 4RM8 A; 1YIW A; 4HLE A; 3KWV A; 3ZJT A; 3MJW A; 1WM2 A; 4HEA 1; 1UNS A; 3ZXV A; 1IYF A; 2BT6 A; 2QMT A; 1FNV A; 4HJG E; 2KDF B; 2M56 B; 4ANW A; 5BYS A; 3A9J A; 2GBM A; 4DBG A; 4O1N A; 1V1P B; 5D7G A; 3PHW B; 1IBX A; 4LLG M; 1HZ5 A; 4FBJ B; 4WJQ A; 1TYG B; 2JVC A; 1G6J A; 1AWD A; 2ZVN A; 1YX5 B; 3JW0 X; 2L32 A; 4A90 A; 2SAK A; 3GE8 C; 4JX1 C; 1NBF C; 2RD0 A; 2Z8L A; 4WIP A; 2HJ8 A; 4JLC A; 2KK8 A; 2KX3 A; 2WDQ B; 3ABV B; 5AZF A; 1V5O A; 1WGY A; 2DZM A; 4N6E B; 2V1Y A; 3ZQ4 A; 1VLB A; 2D10 A; 1I42 A; 4K81 A; 2INN E; 1UWM A; 3U30 A; 4HCN B; 5AUI A; 3NVY A; 1HXY D; 2ASQ A; 3DOW A; 3RNE C; 2MJD A; 1KJT A; 1WR1 A; 1HA5 A; 5HI1 A; 1A5R A; 2FNJ B; 1NI3 A; 4W9G A; 2MSE D; 4F8C B; 1L6U A; 4JPS A; 2HTM E; 1YJ1 A; 3N1Z C; 2KFK B; 4PYZ A; 3QJZ A; 2IO3 B; 4A3O A; 1YD8 U; 3VUX A; 2BYV E; 3PSE B; 2PJH A; 2C7N B; 4C4V A; 3VR8 B; 1AAR A; 1B9R A; 4WWM A; 3GZN B; 2W9N A; 2XNA C; 2W55 A; 3RCZ A; 4B0E A; 2QDF A; 2UWQ A; 3A4S C; 2FCM A; 4BOZ B; 1FFU A; 3PRE A; 2V3P A; 2KMC A; 2IO1 B; 4ZOH C; 3APC A; 5JXV A; 2J7Q B; 4PS3 A; 4FA6 A; 4BBN F; 3VTW A; 3JSV A; 4ZRK A; 2KN5 A; 1L0X B; 1Y56 A; 2HDE A; 3V60 A; 3UQA A; 2ZVO A; 3VRB B; 3DQV A; 3TEY A; 5LXH A; 1TGZ B; 5LXI B; 1UH6 A; 2MHJ A; 2RDG A; 1S1Q B; 4II3 B; 2KWU B; 1ZDV A; 2IPK D; 1SB3 C; 4MSM B; 1WJN A; 5DPW A; 2K22 A; 1I4H A; 1TBE A; 4KSK C; 2J53 A; 4AJY B; 4OZB A; 3HIZ A; 2M0A A; 1K50 A; 3UQB A; 3A9K A; 3NZS A; 3DVN V; 1E7V A; 5CX3 A; 3QA8 A; 1J7B A; 4KGS A; 3DBL I; 1WR6 E; 3GZN I; 2ZCB A; 1DYQ A; 4LNF A; 4MEM A; 5I4D A; 5G5H A; 3TUO A; 1XT9 B; 3W2D A; 1SSN A; 4KSL C; 4MEL A; 4AS1 A; 1GNU A; 1V9J A; 1SIF A; 3HVZ A; 2WXK A; 3PZ8 A; 2ZNV B; 3MC9 A; 4LTU A; 3B9J A; 3I5J C; 1V5T A; 4LCD E; 1ET6 A; 5CTR C; 1I4X A; 4M0W A; 4HRO A; 5IKC M; 1HTO A; 3ZIM A; 1PGB A; 1KM7 A; 4KZ0 A; 4II2 B; 1PFD A; 4RGT A; 1UZX B; 1ZP0 B; 1SGH A; 2MLB A; 4CO7 A; 4GDK B; 3NJT A; 1P98 A; 2O6V A; 1WX8 A; 3VDZ A; 2D3A A; 1E90 A; 3RUI B; 4TUU A; 1P7F A; 1QOF A; 2XEW A; 4GXB A; 2KAN A; 2LGY A; 1QQR A; 1UBQ A; 2VZK B; 2NMQ A; 2BF8 B; 1WH3 A; 1F2R I; 3V6C B; 2CKH B; 2JX5 A; 2PE9 A; 4WAF A; 1R7S A; 3ZRF A; 1QOG A; 2RDH A; 4DHJ B; 1J8C A; 1VDV A; 3ALB A; 2L52 A; 4J3O D; 2WDR B; 5D94 A; 4LJP B; 4BBN C; 1P9D U; 2JT4 B; 3LB8 C; 1WM3 A; 2WS3 B; 2ZW1 A; 3CIR B; 1NEK B; 3SDL C; 1GB4 A; 2L76 A; 1JRP A; 1ZPS A; 4Q2J A; 4G0N B; 3ZNI D; 2A4Z A; 4RCO A; 3AUL A; 2LUM A; 2MP2 A; 4YSZ B; 1PGA A; 3BII D; 2NCN A; 4P6V F; 3AEB B; 1ZW7 A; 5FKA C; 1N6Z A; 1D4B A; 4JWS C; 2ON8 A; 2AX5 A; 2I38 A; 3V05 A; 2KJ6 A; 3ZVV A; 1YOV B; 5LNK 1; 2ONQ A; 3VAW A; 1WXS A; 2ZJD A; 3TJP A; 3MHS D; 5LLI A; 3DPD A; 1KFY B; 4ANX A; 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2K39 A; 3H7P A; 4YTP B; 3D32 A; 3S2A A; 4USA A; 2DYM A; 5GXG B; 3RN9 C; 1HQR D; 3OLM D; 1WGD A; 2D3G A; 3ZDM C; 4MGZ E; 2CR5 A; 2NBW B; 1P7E A; 3RT3 B; 1OTR B; 4FN2 A; 1B1Z A; 3GE3 C; 2IYD B; 1XEE A; 1SE3 A; 2FE8 A; 1I35 A; 1JML A; 2KVZ A; 1EUV B; 3VR9 B; 4WAA A; 1TKG A; 2Z59 B; 3BVG A; 2AL3 A; 2JXX A; 4WH4 A; 3WA0 A; 1EWY C; 3AEF B; 3RNB C; 4BVU C; 1OGW A; 1YQB A; 2FAZ A; 3QQ8 B; 4TQ1 A; 3M62 B; 1WGR A; 4A8X C; 5L95 C; 2M19 A; 2BBC A; 2KT7 A; 2V0G A; 3I3T B; 4QAY A; 2W54 A; 3CF6 E; 2ZPN A; 1V80 A; 2Z0D B; 1NDD A; 3DBH B; 2JSV X; 3AE9 B; 5HHD G; 3U8Z A; 2DYO A; 1T6B X; 1MJD A; 1FNU A; 1EWC A; 2WNM A; 2O2V A; 3VTV A; 4OZC A; 1ROE A; 2NBV B; 3V6E B; 4IOI E; 1T0Y A; 4NNJ B; 1UEL A; 3FAH A; 1FCC C; 3IT6 B; 2KVR A; 1TJE A; 3TSS A; 3ZJV A; 1ZGU B; 2D3C A; 2BWF A; 2QJL A; 2NPT B; 4XWW A; 3M95 A; 1ESF A; 2RSU A; 3HRD D; 1N5X A; 2K25 A; 1GC6 A; 1WSP A; 4IW0 A; 3ZTD A; 2JY6 A; 3TIX A; 1F2R C; 1TT5 B; 3TEW A; 3O13 A; 1RRB A; 1EO6 A; 3IG3 A; 2EKE C; 4ZDV A; 2WDV B; 2FIF A; 1T0R C; 4YTM B; 4CHK A; 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