The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
136
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structure length |
125
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Chain Sequence |
MIAGPEALLDRPSVNNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/blood clotting
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Plasminogen
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| total genus |
29
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| structure length |
125
|
| sequence length |
136
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1L4Z B; 1QQR A; 1C4P A; 1L4D B; 1BML C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4TMA B; 4I6L B; 1WM3 A; 2LVO A; 2KMC A; 1XLQ A; 4OW0 A; 1I4H A; 2NVU I; 4RGM A; 4DDG D; 1SBB B; 2YEP B; 1UGM A; 1R4N B; 4II3 B; 2NPT B; 2QHO A; 4ZRP A; 5IOI A; 2N0S B; 1N5X A; 2NTT A; 3EHV A; 3M63 B; 1EU3 A; 2M56 B; 1PGB A; 1I35 A; 3HK0 A; 2FAZ A; 3AE4 B; 2J0K A; 1RLF A; 4HXD A; 1XEE A; 1VJK A; 2KT7 A; 1DOX A; 4E74 A; 4MM3 B; 4FAD A; 1FPY A; 3DCG A; 3NG0 A; 1RYJ A; 4FBJ B; 4W9K A; 2B76 B; 1EF5 A; 1WE6 A; 3V6C B; 1L0V B; 1EM7 A; 1TS3 A; 4ICV A; 4NQL B; 2ZNV B; 4OZC A; 3ZDT A; 2NS5 A; 1PDX A; 2BB6 A; 5EE1 A; 1YQB A; 5C23 A; 3ALB A; 1V9J A; 4L1B A; 2JXT A; 5DPW A; 1LM8 B; 3GP7 A; 2Z0D B; 1TIF A; 1XLN A; 4DK5 A; 1ROE A; 3B1L X; 3AXC A; 2L52 A; 1UEL A; 1F52 A; 3LYY A; 3NHE B; 3IAS 1; 3PRM B; 3VTV A; 3ZNZ B; 2LVQ A; 3JSV B; 2AQ2 B; 1E8Z A; 5HKH A; 3GOE A; 3VVW B; 3ZIM A; 4MAC A; 4HJG E; 4WJQ A; 2DHZ A; 4JGH B; 5G5G A; 2PLP A; 3APF A; 2BVC A; 3ZRF A; 1SE3 A; 1GG3 A; 1MI0 A; 4GU2 A; 2BS2 B; 3DBS A; 1KM7 A; 2UWQ A; 4LDT D; 4XWW A; 2EKI A; 2WXQ A; 1WJN A; 2KC2 A; 4AQ7 A; 2WNM A; 2G4D B; 2XN9 C; 2IO3 B; 4B0E A; 1WZ0 A; 4MH8 A; 1DYQ A; 1WGY A; 3A33 B; 3AU4 A; 4C4V A; 4TV3 A; 5KHO A; 1FNV A; 3SFD B; 4ANV A; 2LZ6 A; 2G9H D; 1C79 A; 1AW7 A; 4K7U A; 3QK0 A; 4EKU A; 2MSE D; 5E6J A; 2FE8 A; 4I6P A; 4EFO A; 5G2N A; 2IY0 B; 1N62 A; 4ZHP A; 1FCL A; 4YTP B; 2L05 A; 4AWJ A; 4NJC A; 2WQY B; 2KAC A; 2C5L C; 3VTW A; 3I63 C; 2JZZ A; 1ISN A; 1C4A A; 2V1Y A; 5EDS A; 4OVZ A; 1FXA A; 4IC7 B; 5C3J B; 1WH3 A; 4PT5 A; 3U8Z A; 3M95 A; 2MX2 A; 5E6P A; 5GXG B; 3RN9 C; 4DXA B; 2JSV X; 3VUY A; 4US9 A; 2RGF A; 3BIN A; 3HVZ A; 5HFY A; 1T3Q A; 1ZXI A; 4I6N B; 3E56 A; 3VQI A; 4LTU A; 3M3J A; 3ZYY X; 3ZNI D; 2WXH A; 3DHG C; 1VR9 A; 1MHH E; 5TSS A; 4F7Z A; 1GNU A; 2YEP F; 5EE3 A; 3TEZ A; 4D2K A; 4WQM A; 4IUM B; 2Y5C A; 3DBR I; 1QOG A; 3BK1 A; 2PE6 B; 4BAX A; 3RNC C; 3P4S B; 1IPG A; 2JRI B; 4XX5 A; 4YXD B; 3ZXV A; 3AED B; 1WMH B; 2FIF A; 4K3B A; 2JZP A; 1AN8 A; 4CQN A; 2Z0E B; 2KMA A; 4J3O D; 5LXI B; 4DHJ D; 2KXJ A; 2CS4 A; 2LJI A; 4JWU C; 4TQ0 A; 3FAH A; 3Q3O C; 3CWI A; 4O1N A; 3OAW A; 2E3T A; 2DZK A; 4KSL C; 3MC9 A; 2LGD A; 1D4B A; 3U52 E; 3AM9 A; 3IT4 B; 1J19 A; 1J7C A; 4OVU A; 3SDL C; 2FUG 1; 3B0A A; 4XDC A; 3V05 A; 2EEL A; 1FM0 D; 1JWU D; 1HQR D; 2IGG A; 2N9P C; 3L16 A; 3KUD B; 4RH6 A; 3BVM A; 1E10 A; 2XEW A; 3Q8E A; 1OQQ A; 4P1B C; 3AE3 B; 4ARI A; 3IAM 1; 2WXN A; 1HEZ E; 1YJJ A; 3TIX A; 3DBH I; 4AJY B; 1PFD A; 1TS2 A; 1EO6 A; 3CST A; 3HRD D; 5AEK B; 1KLV A; 4P16 A; 2MBE A; 3CMM B; 4RGO S; 2RR9 A; 5HHD G; 2HDE A; 2CR5 A; 1N6Z A; 4LNK A; 4M01 A; 2L00 B; 4FJV B; 2ON8 A; 4HKQ A; 2BKR B; 1ZP0 B; 1WXV A; 1AAR A; 1MPE A; 4CO7 A; 3EFU A; 2V4I B; 1XLP A; 3TCA A; 5DPR A; 5BO4 B; 1YJI A; 3MP9 A; 2KNB A; 3VFK A; 5CTR C; 4C56 C; 1L4D B; 1YN5 A; 1WXS A; 1AWD A; 4CYE A; 2WXP A; 3V61 A; 1STE A; 2WXF A; 2NTS A; 4NNJ B; 3R2T A; 2D3G A; 2QC8 A; 5L83 A; 1BML C; 4HCP B; 1GAQ B; 1OTR B; 1G6J A; 2LRW A; 2RPQ A; 3NUH B; 3ZO5 B; 2PE9 A; 1YX6 B; 1WGG A; 2KMM A; 2MWS B; 5HI1 A; 1QZE A; 1I7H A; 2LUM A; 1DOI A; 1XXG A; 4NAW B; 1XF5 L; 3A9J B; 3QC8 B; 1ACC A; 1YIW A; 2BWE S; 3KLS X; 3MJ5 A; 4FJZ A; 4ACF A; 2C9W B; 4N6E B; 3GE3 C; 2NMQ A; 2RD0 A; 2MBQ A; 4HJK A; 1QQR A; 3N32 A; 2QJL A; 1TZ1 A; 3N1X C; 3A9K A; 2L0F A; 3WIM A; 3PZ7 A; 3H7S A; 1WJ4 A; 3NZ3 A; 4N58 A; 2R2Q A; 4IM0 A; 1XT9 B; 4RF1 A; 1WJU A; 4P6V F; 2EMS A; 1WGH A; 3W1S A; 3KYC D; 3L17 A; 2DZJ A; 3OJ3 A; 1QOA A; 1YOV B; 4A55 A; 3DVG X; 2K5P A; 1ESF A; 2J0M A; 1QOB A; 2WU2 B; 2LAS A; 2RDG A; 3FC4 A; 1IBX B; 5IN7 A; 2WGS A; 1NYQ A; 3O65 B; 2LGI A; 4KIK A; 3DVN V; 4TQ1 A; 4RCO A; 4GOC A; 3VHT C; 4BKT A; 3ZQ4 A; 1ZKH A; 2LEK A; 5AZH A; 5LNK 1; 3ZJV A; 1E9M A; 4BFR A; 2FCQ A; 2MW5 A; 1N60 A; 1J7A A; 2BYF A; 3VH4 B; 2MBH A; 3P2B A; 2WDQ B; 2BS4 B; 2RPV A; 4OVV A; 5CX3 A; 3RI7 C; 3EGR A; 3NVZ A; 1WR6 E; 3PHX B; 2INC C; 3R3M A; 1J0G A; 1FNW A; 3PRP B; 4GN1 A; 4A20 A; 4B9K A; 3B9J A; 2X38 A; 1UUP A; 4ZRQ A; 2LGY A; 1V2Y A; 2KFK A; 3AEF B; 3H6N A; 3ZXR A; 4HLE A; 2NR2 A; 3AE5 B; 1SXT A; 4HKZ E; 2D10 A; 4M8M A; 2ZCB A; 2JYE A; 3IT6 B; 2KD0 A; 3R7R A; 2KN4 A; 4M8N A; 5BYS A; 3AE7 B; 5C1Z A; 4A9A A; 4HWI B; 1UF0 A; 4W9J A; 5JXV A; 3AEG B; 3A4S C; 2MLB A; 4ZYN A; 1WYW B; 3ZKJ C; 3Q3M C; 4K3C A; 1SEB D; 2ZPN A; 1N5W A; 4HRO A; 4LNI A; 1UWX A; 2LD9 A; 2WXJ A; 4DHJ B; 3WA0 A; 4KKJ A; 1Y8R C; 2ZCC A; 2MP2 B; 3FIL A; 5J2R A; 4W9F A; 2FCM A; 2GB1 A; 1C77 A; 1ZXH A; 4W9G A; 4IM3 A; 1SIJ A; 2UU7 A; 2BTE A; 3PT2 B; 2PVG C; 1A5R A; 2KO3 A; 2ZNV C; 2GBN A; 3RPF C; 3TBL D; 4HDO A; 2NBV B; 3ZDM C; 3DBL B; 1F2R I; 3BYY B; 2O2V A; 4P1C C; 3BZD B; 4XGA B; 2UYZ B; 3RNG C; 1MHX A; 4BBN C; 1I4P A; 2DZI A; 4LJP B; 3PTF C; 4E71 A; 2J4X A; 1HZ6 A; 4BVU C; 3E9S A; 1KJT A; 3QCA A; 3AB5 A; 2D5G A; 4KKI A; 4AOF A; 2NBW B; 4US8 A; 2IYD B; 1VDV A; 1GB4 A; 3Q8F A; 3UI3 A; 1P3Q U; 4JPS A; 3APD A; 2JF5 A; 3TEX A; 1KF6 B; 5DPT A; 3C19 A; 3T9L A; 1KRH A; 2M19 A; 2WU5 B; 1V86 A; 1I4Q A; 2WXI A; 5BYR A; 1WY8 A; 4ANW A; 3IFW B; 5JH5 C; 1C9F A; 2WX1 A; 4IG7 B; 4URK A; 3D32 A; 4ZHO A; 4G3X B; 4WQO B; 3PVL A; 4HEA 1; 4C7Z A; 1ZDV A; 3RUL A; 1WM2 A; 1N61 A; 3AEB B; 1TY0 A; 2BBC A; 2M1M A; 2O6V A; 4GDK A; 4ICU A; 3R66 C; 1FO4 A; 4N59 A; 1YD8 U; 4DDI D; 3Q2A C; 3VUX A; 5IP4 D; 2KAJ A; 2K9X A; 4BKS D; 3AE9 B; 1Q1O A; 5D3D A; 1FD6 A; 4GLS C; 4Q2J A; 1H8C A; 4ASW C; 2KOX A; 1FRD A; 1HTO A; 5GMV A; 3HIZ A; 5IKC M; 1L5P A; 3MHS D; 2IO0 B; 2DAJ A; 4IWP A; 4AP4 C; 2OHF A; 2LGX A; 3DVN U; 1R4M I; 2BPS A; 3AV8 A; 4TUU A; 2R2O A; 2W3R A; 3WAM A; 2GBJ A; 3DWM A; 5JHB A; 3BY4 B; 4GSW A; 1WGR A; 1WGK A; 2A4Z A; 1CK1 A; 3ML8 A; 1NI3 A; 4RGN A; 3DVG Y; 4JQW C; 5CHV C; 2I2Y A; 1F0Z A; 1V5O A; 2BF8 B; 3PV1 A; 1S3S G; 3AH7 A; 4RM8 A; 4GDL A; 3HHM A; 3R8B A; 2IDY A; 3X23 A; 2WX0 A; 2XK5 B; 2LRU A; 3BVG A; 3PHW B; 1UD7 A; 3VAW A; 1D5X C; 3NY5 A; 2INN E; 5J17 A; 3PSE B; 4G0N B; 2DZM A; 1B9R A; 3BYT B; 2IGD A; 5HG2 A; 1FIQ A; 2V3P A; 1K51 A; 2DX5 B; 3TL5 A; 3NVY A; 3OG5 A; 1WWT A; 4ANX A; 3C0R B; 2SEB D; 4DXF A; 3SEB A; 2LJ5 A; 1UGJ A; 3LB8 C; 3U7Z A; 1C4P A; 5L95 C; 2KTR B; 1CJE A; 5FR3 A; 2KZR A; 2KC1 A; 2L83 A; 3MHZ A; 2AL6 A; 4QAY A; 2XBB C; 3RCZ A; 3DQV A; 3SHQ A; 4YTN B; 1KFY B; 2D11 A; 4MEL A; 4ANU A; 3L13 A; 2JT4 B; 2DBY A; 4XYC A; 2WXK A; 3ML9 A; 2CKH B; 4H2A A; 2PEA A; 2WS3 B; 1ZUD 2; 3GS2 A; 3X0W A; 3TUO A; 1V1P B; 2LWP A; 2Y5B B; 4E3C A; 1VRA B; 5CHW A; 5LXH A; 4WIP A; 3DOW A; 3ZGZ A; 1WX9 A; 3VR9 B; 1SE4 A; 2JX5 A; 2DAF A; 2AEH A; 2NPT A; 1C4C A; 2IPK D; 3V6E B; 5E6O A; 2LHE A; 1QKZ A; 3RZW C; 1WZ3 A; 3VDZ A; 3PS6 A; 2IO1 B; 1V97 A; 3J9C A; 3W1Y A; 3PLU A; 1QIL A; 2QEJ C; 1TJE A; 2RMM A; 5DPS A; 4OHJ A; 2EMT A; 2KDF B; 4WWO A; 2L0T A; 3Q3J A; 3PRZ A; 2LHD A; 4C00 A; 1ZOY B; 2LXC A; 2VH2 A; 4M02 A; 1YNT E; 2FID A; 3A1Q B; 4LK0 M; 3GB1 A; 4MT5 A; 2AQ3 B; 2N4F A; 2KDM A; 2ZJD A; 3U4E G; 2GLS A; 4MM3 A; 4MJS A; 4F1S A; 4JL9 A; 4KGR A; 3Q14 C; 2KK8 A; 3Q6B A; 3ABV B; 3RMK C; 4ZYS A; 1BUI C; 2K25 A; 4EUT A; 4K7W A; 3A9K B; 2ZPY A; 3H7P B; 2ACZ B; 2KYW A; 2CJO A; 2W55 A; 4ITK A; 2VZK B; 1FMA D; 3ZUN A; 4FHK A; 1WFY A; 1C1Y B; 2MA9 B; 1V49 A; 1GC6 A; 2PW9 A; 4WH4 A; 2DLB A; 4GIV A; 2CU3 A; 2J52 A; 2IBI B; 1D3Z A; 1F9J A; 1LQB A; 3U7D A; 4WJO A; 4MGY E; 3U30 A; 1QOF A; 4IOI E; 3N9Y C; 1Z2M A; 3R2I A; 2VRR B; 2CHZ A; 4KDL B; 5JZE B; 3QHT A; 3JSV A; 3ONS A; 3NZU A; 2K22 A; 2KAN A; 1RAX A; 1NEK B; 2LFI A; 2C60 A; 2V3N A; 1TT5 B; 4USA A; 1GPX A; 2N9E B; 3RNB C; 2K8H A; 2W82 A; 2MQJ A; 2JPH A; 1BT0 A; 2ICI A; 4WWN A; 1TKY A; 1TS5 A; 4HVB A; 3UIN B; 1F1H A; 4KZC A; 2XNA C; 4IWO A; 1K8R B; 3MJW A; 1LGR A; 1E5W A; 1JQ4 A; 2KFK B; 3C8Y A; 3WAP A; 4IKG A; 5MPO A; 1NI2 A; 2ZVO A; 3P42 A; 3QIJ A; 3EEC A; 4DHZ E; 5TR5 A; 3N20 C; 3N3K B; 2OED A; 2WXG A; 3GZN I; 2CU1 A; 1WJ6 A; 4S0R A; 1SJE D; 3WAN A; 3QA8 A; 2HTM E; 2L32 A; 2LMC A; 3TEY A; 2HJ8 A; 1OEY J; 2KN5 A; 1ZPS A; 5CHF A; 2BW2 A; 2EKE C; 2N7E A; 4M0W A; 1HXY D; 1E0Z A; 3OWE B; 5I4D A; 2JY6 A; 2KHW B; 2PMV A; 2GBR A; 4KV2 A; 3Q8C A; 2KX3 A; 3T3O A; 2RSU A; 2V4L A; 2WXR A; 1T6B X; 4FLH A; 2QCZ A; 2JWZ A; 4MSM B; 4OZB A; 1L0X B; 1YQ4 B; 3WCQ A; 4XWT A; 3WAL A; 1VD2 A; 4WWM A; 5D2M B; 1F77 A; 5G5H A; 1R4N I; 4PS8 A; 3W5V B; 3AUL A; 4JX1 C; 2HE7 A; 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1XQQ A; 1YJ1 A; 3UIO B; 4LCD E; 1UZX B; 5FK9 C; 4FA6 A; 2WWZ A; 1FXI A; 4JLC A; 3IBE A; 4P7I A; 3A4R A; 3KWV A; 2K8C A; 3BII D; 2KJ6 A; 3O13 A; 3DBH B; 3RUI B; 3APC A; 1L4Z B; 1WSP A; 2C7M B; 2KTF A; 4HPL B; 2Z8L A; 3H8H A; 2RDB C; 3MC0 B; 3CIR B; 1WRI A; 5D6J B; 4NAW A; 3Q8A A; 3TMP B; 2G3Q B; 3KQ4 A; 4IWQ A; 4MGK E; 1CZP A; 2ZZP B; 3NVW A; 4TSS A; 1EF1 A; 2D3B A; 1P0R A; 2VZK D; 1PQS A; 4II2 B; 2ZVN A; 4C80 A; 4KDI C; 1KOT A; 1SGH A; 4C4V B; 4KZ0 A; 1LO5 D; 5JHA A; 1C3T A; 3Q8B A; 2K8B A; 2Y3A A; 3MC8 A; 4EOY A; 3QJZ A; 4CHK A; 2KVZ A; 1SB3 C; 2KWU B; 4RF0 A; 1VZ8 A; 1IBX A; 2ZW0 A; 2QMT A; 2C7N B; 1HZ5 A; 2WDR B; 4EE2 A; 2L8J A; 2M4N A; 3NVV A; 5FR6 A; 2I1K A; 2TSS A; 3AE8 B; 3L54 A; 2BWF A; 3Q69 A; 3VRB B; 1E8W A; 2WHI A; 4PS7 A; 2Q5W D; 1L0Y B; 2W54 A; 4YSY B; 3Q3F A; 2AYO B; 2MJ3 A; 4NJ7 A; 1C76 A; 2H88 B; 1SJH D; 2IJ0 A; 5T8I A; 2IO2 B; 1JW9 D; 4A3P A; 1JWA D; 3PZD A; 3VRA B; 2I38 A; 3QWZ B; 4REZ A; 1F2R C; 2INP E; 1T5X D; 1EWY C; 4MJS B; 1EWC A; 1IGC A; 2AX5 A; 1FRR A; 5DCN A; 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