The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
MIKVLFFAQVRELVGTDATEVAADFPTVEALRQHMAAQSDRWALALEDGKLLAAVNQTLVSFDHPLTDGDEVAFFPPVTGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Crystal structure of molybdopterin synthase and its evolutionary relationship to ubiquitin activation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MOLYBDOPTERIN CONVERTING FACTOR, SUBUNIT 1
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| total genus |
22
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JRP A; 2G1E A; 4YSX B; 1QOA A; 1L5P A; 1QOG A; 3AE4 B; 4LTU A; 4A9A A; 3AEG B; 5G5H A; 2WLB A; 4ZHP A; 4YT0 B; 3AE8 B; 1J7A A; 3AE3 B; 4FXC A; 1DOY A; 2BS2 B; 1FXI A; 3B9J A; 2DWQ A; 2H88 B; 3AE7 B; 1B9R A; 4N6E B; 3B2G A; 2HTM E; 1N60 A; 1VDV A; 1GPX A; 3FAH A; 4HRO A; 3NVY A; 3AE5 B; 3VRB B; 2M19 A; 1JAL A; 2M56 B; 5EE0 A; 1QT9 A; 5G5G A; 1CZP A; 3ETR A; 3SR6 A; 4YXD B; 2W55 A; 4N59 A; 3BII D; 1V8C A; 1FXA A; 3AEA B; 1FFV A; 4WQM A; 1TYG B; 1T3Q A; 1N63 A; 3P4S B; 1CJE A; 4US8 A; 3RPF C; 1GAQ B; 1ROE A; 2K5P A; 3CWI A; 3AMZ A; 1YJJ A; 2CJN A; 1L6U A; 1SF0 A; 2ACZ B; 1WYG A; 2QJL A; 4JWU C; 1FM0 D; 1YQ4 B; 5C2T B; 4C7Z A; 1JQ4 A; 4ZHO A; 1N62 A; 4KX6 B; 3AEF B; 4JX1 C; 5EE9 A; 4N58 A; 3P63 A; 2BS4 B; 1ZP0 B; 2KMM A; 3HUI A; 2JX5 A; 1E7P B; 2WDV B; 1NEK B; 2L52 A; 3AE1 B; 3AE9 B; 2W3S A; 2WS3 B; 3NVW A; 5EE1 A; 1TKE A; 1UWM A; 3ABV B; 4YSY B; 1PDX A; 4YTP B; 3AE6 B; 2B76 B; 1XLP A; 3FC4 A; 3P4R B; 2WU2 B; 3AE2 B; 2PIA A; 2MJ3 A; 1XLO A; 1QF6 A; 1WWT A; 3W5U B; 5C3J B; 1DOX A; 2K22 A; 2WU5 B; 1NVI D; 3AN1 A; 3PO0 A; 4YSZ B; 2JQR B; 1L0V B; 1I7H A; 1OFF A; 1RFK A; 2BS3 B; 2E3T A; 3AEB B; 1NEN B; 1KRH A; 1SB3 C; 1E9M A; 1J7B A; 2OHF A; 1QOF A; 1TKY A; 4USA A; 1JWA D; 1PUT A; 2KAJ A; 1YQ3 B; 4HRS A; 3AEE B; 1TKG A; 3WCQ A; 3DWG C; 4YTM B; 1FIQ A; 1J7C A; 1FRR A; 1N5X A; 2CU3 A; 1OQQ A; 4C7Y A; 2PVO D; 3EUB 2; 1VJK A; 2K9X A; 4JWS C; 1NYR A; 3W5V B; 3AM9 A; 3AED B; 3SFE B; 2PVG C; 4ITK A; 2MJD A; 1N5W A; 1ZXI A; 2LEK A; 3LXF A; 5GXG B; 1KFY B; 3VR8 B; 3W9C B; 2N0S B; 1EWY C; 2AX5 A; 3AB5 A; 5MPO A; 3DWM A; 2EKI A; 3SFD B; 3AV8 A; 1L6V A; 1VLB A; 4C80 A; 2QIE B; 1JW9 D; 1RWS A; 1R7S A; 1WRI A; 1TJE A; 3B2F A; 2DBY A; 5AUK A; 1FFU A; 2Y5C A; 5EE3 A; 2W54 A; 3P1M A; 4ZOH C; 1SIJ A; 1OQR A; 4P6V F; 2WP9 B; 2Q5W D; 2PKO A; 1DGJ A; 1N61 A; 1XLN A; 1XO3 A; 2BT6 A; 2MJE A; 1V97 A; 5H92 C; 1JRO A; 1DOI A; 3AEC B; 1WGK A; 3P4P B; 3VRA B; 1ZUD 2; 1AYF A; 4US9 A; 3CIR B; 3NS1 A; 3P4Q B; 2W3R A; 2WDQ B; 4WWM A; 2H89 B; 1E10 A; 3VR9 B; 1AWD A; 1XLQ A; 3LB8 C; 1IUE A; 1ZOY B; 3L4P A; 5AUI A; 1E0Z A; 1E6E B; 1PFD A; 3NVV A; 1FRD A; 1WXQ A; 1NI3 A; 3KWL A; 1F0Z A; 1JWB D; 3HRD D; 1YJI A; 4YTN B; 1QLB B; 2L83 A; 1KF6 B; 1NYQ A; 1RM6 C; 3AH7 A; 2WQY B; 3HVZ A; 4IDI A; 3NRZ A; 1A70 A; 2MH7 A; 1FO4 A; 1RYJ A; 2CJO A; 5H8Y E; 1FMA D; 2FBW B; 3ZYY X; 3NVZ A; 1QOB A; 2WDR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2G1E A; 4WAA A; 5AZH A; 1QOG A; 1V81 A; 3NS8 A; 4RGO S; 3VHT C; 2WLB A; 2J4X A; 4M8N A; 3P42 A; 4W9K A; 4KZ0 A; 2O6V D; 4IUM B; 1WGH A; 1FXT B; 1WRD B; 3KUC B; 5CHW A; 3BII D; 2WXL A; 4AWJ A; 3EC8 A; 2QCZ A; 3RN9 C; 1CJE A; 3CWI A; 4KGR A; 3ZNI D; 1SF0 A; 2J7Q B; 3ZLZ A; 1G6J A; 1IBX B; 1HTO A; 2KMM A; 1V80 A; 2J0K A; 1RAX A; 1T6B X; 3D32 A; 2KWC A; 2WXJ A; 2MBE A; 1WR6 E; 3OJ3 A; 4ACF A; 1WX7 A; 1JML A; 3VH4 B; 4GDK A; 4RCO A; 4FJZ A; 3UI3 A; 2KAJ A; 3UF8 A; 1UEL A; 4YTM B; 1TKG A; 1C77 A; 4EFO A; 4H2A A; 2OJR A; 3B1L X; 3ONS A; 3KVF B; 2ZEQ A; 5FK9 C; 3A1Q A; 3JSV B; 1WY8 A; 1TT5 B; 2MHJ A; 3KQ4 A; 2BBC A; 2NBV B; 3V62 A; 3RNC C; 2K1F A; 3V6C B; 1WZ3 A; 1NI2 A; 4LDT B; 4C00 A; 2ZPY A; 3WIM A; 4WWM A; 4OVV A; 2KDI A; 4IM2 A; 1XXG A; 1GC7 A; 1PFD A; 2K8H A; 3W1Y A; 5IAA C; 2NPT B; 2AWT A; 2MSE D; 1RM6 C; 3AH7 A; 1YOV B; 1LGR A; 1WJ6 A; 2CU1 A; 1FMA D; 1P1A A; 3CSF A; 2KJR A; 4B0E A; 2WDR B; 2VH2 A; 4RGN A; 2KMA A; 3A9K B; 1XCT L; 3PS6 A; 1QOA A; 1L5P A; 2KO3 A; 4PS8 A; 3B0A A; 1XQQ A; 3UIP B; 3AE3 B; 3MC8 A; 1YNT E; 2LI5 A; 4B6W A; 1B9R A; 1FEH A; 4HDO A; 1BXT A; 1UGM A; 2LZ6 A; 5D3I B; 4I6L B; 5EE0 A; 3W2D A; 2KTR A; 1T5X D; 1UZX B; 1CK1 A; 2PE6 B; 3VVW B; 1SEB D; 1WYG A; 3PTF C; 3I9V 1; 2XEW A; 1TKE A; 2N7J A; 1B1Z A; 1PGA A; 1WWT A; 2K22 A; 1OQY A; 2RDB C; 2M8S A; 1MJD A; 4ZRQ A; 1L0V B; 3AEB B; 3GE8 C; 1UGJ A; 3FIL A; 2O6V B; 1M4V A; 1MPE A; 2Z8L A; 3AM9 A; 4ITK A; 1ZXI A; 5BO4 B; 2EKI A; 3TMP B; 4ZRP A; 2QIE B; 3VUX A; 4ASW C; 1ACC A; 5J17 A; 3NY5 A; 1Y8R C; 1WGK A; 2WXQ A; 2IO1 B; 2DYM A; 1KOT A; 1LO5 D; 3VR9 B; 2MW5 A; 1NDD A; 2KHW B; 3PHX B; 3V61 A; 4WIP A; 3KYC D; 5CHF A; 2L7R A; 1I35 A; 2EMS A; 4K7W A; 2K39 A; 4A20 A; 4BOZ B; 2PW9 A; 2MLB A; 1HQR D; 5G2N A; 2L1A A; 4HVB A; 3APF A; 1D5Z C; 3GB1 A; 1TIF A; 3AEG B; 5G5H A; 3N3K B; 1J7A A; 5JHB A; 2AL3 A; 4DQO C; 4WWN A; 4ANU A; 2MBQ A; 3AE7 B; 2HD5 B; 2R2O A; 2RDH A; 1YQB A; 2GBK A; 2JXT A; 4EZJ A; 2BQQ A; 3PV1 A; 2XNA C; 4ZYN A; 1UD7 A; 4ZRK A; 4BKS D; 5DPW A; 3AEF B; 2IZV B; 4MGY E; 2XBB C; 2MX2 A; 2FUG 1; 2WS3 B; 4EOY A; 1F1H A; 3T9L A; 2WU2 B; 2LWP A; 4IM0 A; 1ET9 A; 3QA8 A; 4PT5 A; 1WX9 A; 2JQR B; 4GU2 A; 4M0W A; 1GNU A; 5LLI A; 3BYY B; 5E6O A; 3TCA A; 1F2R C; 2Z0D B; 2I1K A; 3DHH C; 2V4L A; 3C19 A; 5E6N A; 2IPK D; 2V3S A; 3UQA A; 2YEP F; 4XE0 A; 4AUQ C; 1KLU D; 2MJD A; 2N9E B; 2AX5 A; 4PS7 A; 2KJ6 A; 1IP9 A; 3B2F A; 1SJH D; 5D6J B; 3P1M A; 1ZPS A; 1Z5S B; 1TY2 A; 2WP9 B; 4EZK A; 1YN3 A; 1R4N B; 2BKR B; 3QQ8 B; 1FCL A; 2JRH A; 3L08 A; 1V5O A; 3BVM A; 1TS3 A; 4W9D A; 2SAK A; 1HXY D; 4GDL A; 2X38 A; 1MHH E; 1IUE A; 1Q0W B; 3I5J C; 1A5R A; 2GRI A; 4JIO U; 3KWV A; 3LDZ E; 2KQS A; 1SXT A; 3N1Y C; 2G9H D; 2OOB B; 2JPH A; 2O2V B; 1ZE3 D; 1C76 A; 4X57 B; 1TS2 A; 1EUV B; 3N1Z C; 5H8Y E; 1GC6 A; 2REX A; 2K8B A; 3UIO B; 2GBJ A; 3H6N A; 4HPM B; 2KD0 A; 2KAN A; 1YJ1 A; 5C23 A; 4W9E A; 2R61 A; 5L83 A; 2MBB B; 4HRO A; 1R4M I; 2G4S A; 3AE5 B; 3RNE C; 1QT9 A; 2VH1 A; 2JYT A; 2M0X A; 4MGI E; 1N63 A; 3EFU A; 4W9C A; 2JRI B; 2KFK B; 3N32 A; 4DXA B; 2G3Q B; 4II2 B; 1T0R C; 1E7P B; 1C4A A; 3TEY A; 3C8Y A; 4F1S A; 2B76 B; 1GUA B; 1UH6 A; 1V1P B; 3IT4 B; 4MSQ B; 3URY A; 2ZCC A; 4HPL B; 2BS3 B; 2PMV A; 1WJ4 A; 4A3O A; 4FA6 A; 4HCP B; 3DWG C; 4DBG A; 4TSS A; 2LVP A; 2KDE B; 3AB5 A; 1WGG A; 3AV8 A; 4E74 A; 4MM3 B; 1RWS A; 4Q2J A; 2IO2 B; 2YLM A; 4XGA B; 2KX3 A; 4IWQ A; 5HI1 A; 2WGS A; 4M02 A; 1WIA A; 2LJI A; 1DOI A; 3P4P B; 4C56 C; 2M0A A; 2IDY A; 1AW7 A; 1AWD A; 2ZNV C; 2VRR B; 4A55 A; 4LJO B; 2OED A; 2PPH A; 5AEK B; 2QEJ C; 3T8M A; 1RFA A; 4DXF A; 1LXD A; 2WNM A; 2WXI A; 4PYZ A; 3DVN V; 3H7S A; 4ANX A; 3U7Z A; 1YX6 B; 3MHZ A; 3DBH B; 1J8C A; 3LJ3 A; 1DYQ A; 1XD3 B; 2NBU A; 4ICV A; 3QC8 B; 4CHK A; 4ARC A; 2KVR A; 2JT4 B; 3B2G A; 3NZU A; 1GPX A; 2EMT A; 2ZW1 A; 3ZJU A; 3GOE A; 2J42 A; 4LCD E; 2QIL A; 2K5P A; 3DBR B; 3BYT B; 4XWW A; 3H8H A; 2LJ5 A; 2XN9 C; 2RSU A; 1P98 A; 5G55 A; 2KMC A; 4G3X B; 3BVZ A; 5HG2 A; 1E90 A; 2BPS A; 1PDX A; 3FC4 A; 1KLV A; 3RCZ A; 3NG0 A; 2LGY A; 2WU5 B; 3AN1 A; 1V9J A; 1WI0 A; 4YSZ B; 1FNV A; 1WM2 A; 3H9D A; 4KVG B; 4USA A; 3CMM B; 4HKQ A; 1JWS D; 2KDF B; 4C4V A; 2JXX A; 3DBS A; 5EDS A; 4A8X C; 3TBL D; 3UGB B; 1D3Z A; 2D11 A; 3X0W A; 3T3O A; 1XLN A; 1FNU A; 2D3C A; 1K8R B; 3VRA B; 2FCQ A; 3ZRC A; 1JCK B; 4IWP A; 4EEW A; 3Q3J A; 3VTW A; 1OEY J; 2WX1 A; 1UUP A; 2KDM A; 2HDE A; 4DHZ E; 3KWL A; 1FCC C; 4K3C A; 2L83 A; 5E6P A; 1D4B A; 3L17 A; 3HK0 A; 2FIF A; 2KTR B; 2D5G A; 2LAS A; 3ECI A; 2WXM A; 3EA6 A; 2JWU A; 2N9X A; 3SD5 A; 1UF0 A; 4ZHP A; 4JPS A; 3AE8 B; 3RUI B; 3ZUN A; 3L54 A; 2C9W B; 3Q6B A; 1WXA A; 3FAH A; 2M19 A; 2DAJ A; 5G5G A; 3RFZ B; 3SR6 A; 3K9P B; 2MP2 A; 3FIL B; 1L2N A; 1F2R I; 4MGZ E; 1QF6 A; 4W9I A; 1YQ4 B; 1N62 A; 3KW5 B; 3P2B A; 4XZ4 A; 5BYS A; 3NVW A; 1UWM A; 4YTP B; 4BVU C; 4BAX A; 2LGS A; 2D3G A; 1XLP A; 2WXR A; 2BYT A; 4I6P A; 3BY4 B; 3DDC B; 1WE7 A; 2V0G A; 2KTF A; 5HFY A; 2INN E; 3EEC A; 2IGD A; 4KZC A; 1PGB A; 1P9D U; 2KJH B; 2KC1 A; 1SIF A; 2LRU A; 1OQQ A; 4FJV B; 3Q3O C; 3W5V B; 3WAL A; 3N30 A; 3A9J A; 2KNB A; 1WYW B; 2KZR A; 5MPO A; 1P0R A; 3SFD B; 1JRU A; 3ZIM A; 4N9F 4; 3R7Q A; 1KM7 A; 3IG3 A; 3KUZ A; 5HKH A; 1FFU A; 2Y5C A; 3GE3 C; 3OJ4 B; 2UYZ B; 2JVC A; 2YEP B; 2RDG A; 2Z59 B; 3VXW A; 1FPY A; 1V49 A; 5JHA A; 4WWP A; 3P4Q B; 4I6N B; 3BWU D; 4MEM A; 2K6Q A; 3BZD B; 4YTN B; 3RZW C; 1QLB B; 3RNF C; 3BIN A; 5D2M B; 2D3B A; 4NQL B; 4A90 A; 4GSW A; 2IO0 B; 2GB1 A; 3QIJ A; 4WWO A; 3VTV A; 4DHJ B; 1HTQ A; 4K7U A; 1VDV A; 4DHZ B; 1VR9 A; 4EZL A; 4K1R B; 3SU8 X; 3ETR A; 3RT3 B; 1GJZ A; 1U4A A; 2NMQ A; 5IKC M; 2WWZ A; 2IYD B; 1R4N I; 1TZO A; 1MFW A; 2CKH B; 3VUW A; 1I4H A; 5C2T B; 1JQ4 A; 2PTL A; 4WJQ A; 3DVN U; 4N58 A; 3R8B A; 3C0R B; 3MC9 A; 4KSK C; 1WJN A; 3P4R B; 2KWU B; 2MJ3 A; 2PIA A; 1DOX A; 5IA7 A; 4II3 B; 3RNB C; 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1NYR A; 3W1S C; 2JZ3 B; 3PZ7 A; 1N5W A; 3QJZ A; 3H1U A; 5JXV A; 1D5X C; 1HZ6 A; 3QX1 A; 3DBR I; 4P6V F; 2BT6 A; 2MJE A; 5H92 C; 1V97 A; 1LQB A; 4LNF A; 2WDQ B; 1ISN A; 1XLQ A; 2KX0 A; 1E0Z A; 4AOF A; 2WYQ A; 3AU4 A; 2SEB D; 4BBN C; 1V1O A; 4WJO A; 1CQV A; 1UNS A; 1ZXH A; 4MEL A; 4OVU A; 2FBW B; 1QOB A; 3A4R A; 5CX3 A; 2N9K A; 4LTU A; 2XK5 A; 4JGH B; 2L8J A; 1F52 A; 3U7D A; 4JL9 A; 1E8Y A; 2N9P C; 2VZK D; 2KXJ A; 2JYE A; 3ZXV A; 1N60 A; 4NJ7 A; 4AP4 C; 3NHE B; 2DHZ A; 2JY6 A; 3TEX A; 4BZA A; 2N1V A; 4WJP A; 1T3Q A; 3PLU A; 2DYO A; 3AMZ A; 1Q1O A; 4C7Z A; 4KKJ A; 4KX6 B; 3VH3 B; 2YVC A; 2KC2 A; 4W9J A; 2CHW A; 4HEA 1; 3DHG C; 2A4Z A; 3H7P B; 3VDZ A; 3ZTC A; 4ZYS A; 3EHV A; 3DQV A; 3PVL A; 2I38 A; 2RMM A; 2PE9 A; 1WGD A; 2AQ2 B; 4NAW B; 2IGH A; 1VD2 A; 1TY0 A; 4ARI A; 3VQI A; 3QHT A; 1YQ3 B; 2V9H A; 4NZL B; 2L0T A; 2LEK A; 2QHO A; 3VAW A; 3MJ5 A; 2AQ1 B; 2WXH A; 4ZOH C; 1JWM D; 3QWZ B; 1H8C A; 1DGJ A; 1XO3 A; 3U8Z A; 2RPV A; 3AEC B; 3MTN B; 1ET6 A; 1I4Q A; 3IHP C; 3ML8 A; 3PPA A; 1MHX A; 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