The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
65
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structure length |
65
|
Chain Sequence |
QILFNDQAMQCAAGQTVHELLEQLDQRQAGAALAINQQIVPREQWAQHIVQDGDQILLFQVIAGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the Escherichia coli ThiS-ThiF Complex, a Key Component of the Sulfur Transfer System in Thiamin Biosynthesis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Adenylyltransferase thiF
|
| molecule tags |
Transferase/biosynthetic protein
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
14
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| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| chains with identical sequence |
4
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| 2 | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T3Q A; 2KMM A; 4KX6 B; 2N0S B; 1NVI D; 3RPF C; 3ZYY X; 2G1E A; 1QOA A; 4US8 A; 1FFU A; 1GAQ B; 3ETR A; 1I7H A; 1KRH A; 1RWS A; 1SF0 A; 2Y5C A; 4JX1 C; 1XLN A; 3WCQ A; 1NYR A; 1QT9 A; 2JQR B; 1DOX A; 1J7B A; 2WS3 B; 1WRI A; 3AEF B; 3AN1 A; 1DOI A; 4HRO A; 1FFV A; 3LB8 C; 4US9 A; 2MJE A; 1IUE A; 1JRP A; 3PO0 A; 1QLB B; 1PFD A; 3W5V B; 1F0Z A; 1EWY C; 1E6E B; 5EE3 A; 1VDV A; 4YTP B; 1QOG A; 1FM0 D; 1FIQ A; 1J7A A; 1N5W A; 2PKO A; 1R7S A; 1XLO A; 2QJL A; 2WQY B; 3AE4 B; 3AE2 B; 2MH7 A; 3AEA B; 1TKY A; 2HTM E; 1NI3 A; 1FXI A; 1NEK B; 5AUI A; 3AE1 B; 3AE7 B; 5EE9 A; 1PUT A; 2MJD A; 2BS4 B; 2E3T A; 1FRR A; 1ROE A; 4ZOH C; 3LXF A; 4C80 A; 2WLB A; 2Q5W D; 5G5H A; 3AMZ A; 4YTM B; 3SR6 A; 4ZHO A; 3BII D; 1AWD A; 1N5X A; 1ZOY B; 3AEG B; 4YXD B; 1QOB A; 2H89 B; 4WWM A; 4LTU A; 1A70 A; 2MJ3 A; 1E0Z A; 1CZP A; 1WXQ A; 4YT0 B; 3SFE B; 3KWL A; 2OHF A; 1JQ4 A; 3VR9 B; 2ACZ B; 5EE1 A; 1B9R A; 3FAH A; 2EKI A; 4FXC A; 1RYJ A; 3P4S B; 3AB5 A; 3AE6 B; 3VR8 B; 1VLB A; 2WU2 B; 1L0V B; 1SB3 C; 1ZP0 B; 2L52 A; 1OQQ A; 1KFY B; 1OFF A; 1AYF A; 2PIA A; 1J7C A; 1DGJ A; 1TKE A; 3AE8 B; 1L5P A; 3P4P B; 1WYG A; 5GXG B; 2K22 A; 3AEE B; 4YSX B; 1YJI A; 1TYG B; 5EE0 A; 3NVY A; 2CJO A; 1RM6 C; 3AV8 A; 3B9J A; 3P1M A; 1VJK A; 2H88 B; 4YSZ B; 4C7Z A; 3P4R B; 2M56 B; 1YJJ A; 5C2T B; 4USA A; 3AE3 B; 1FMA D; 1JW9 D; 2CU3 A; 3HRD D; 4YSY B; 3AED B; 3B2F A; 1JRO A; 3AM9 A; 1V97 A; 4N59 A; 4YTN B; 2LEK A; 2WU5 B; 1ZXI A; 1N62 A; 2L83 A; 1CJE A; 1L6U A; 3NVW A; 3HUI A; 5H8Y E; 3P4Q B; 4C7Y A; 3CWI A; 1RFK A; 2JX5 A; 4N6E B; 5AUK A; 2M19 A; 3ABV B; 2WDR B; 3CIR B; 1QF6 A; 2FBW B; 4P6V F; 2BT6 A; 4WQM A; 3VRA B; 1UWM A; 1WGK A; 3W9C B; 1QOF A; 5C3J B; 3W5U B; 1N60 A; 2DWQ A; 3L4P A; 2WDQ B; 1PDX A; 3P63 A; 1E9M A; 3NS1 A; 1TJE A; 1N61 A; 3AE9 B; 1JWB D; 1XLP A; 1XLQ A; 2W54 A; 1N63 A; 2BS3 B; 2PVG C; 2QIE B; 3AEB B; 4IDI A; 1XO3 A; 1JAL A; 1NYQ A; 2WP9 B; 2CJN A; 5H92 C; 3AH7 A; 1KF6 B; 3NVV A; 3NVZ A; 3EUB 2; 3AE5 B; 1DOY A; 1FO4 A; 3NRZ A; 3B2G A; 4JWU C; 2K9X A; 1YQ3 B; 1YQ4 B; 2DBY A; 2PVO D; 2W3R A; 3VRB B; 2BS2 B; 4A9A A; 3DWG C; 1OQR A; 3HVZ A; 2K5P A; 2KAJ A; 1V8C A; 3DWM A; 1FRD A; 3AEC B; 4JWS C; 1E10 A; 2B76 B; 2W55 A; 1TKG A; 2W3S A; 1SIJ A; 3SFD B; 1FXA A; 1JWA D; 1NEN B; 4ITK A; 4N58 A; 2WDV B; 3FC4 A; 5G5G A; 4ZHP A; 5MPO A; 2AX5 A; 4HRS A; 1GPX A; 1E7P B; 1L6V A; 1WWT A; 1ZUD 2; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UGB B; 2KMM A; 1K50 A; 2RDH A; 1D5M C; 4WIP A; 3KH0 A; 1AW7 A; 4WJQ A; 4PS8 A; 4MM3 A; 3D32 A; 1XXG A; 1OGW A; 1TZO A; 2LAS A; 3VAW A; 1J19 A; 2LFI A; 4W9F A; 4PK1 A; 1JML A; 1VZ8 A; 3OAW A; 5EE3 A; 4XDD A; 2Y5P A; 1YN3 A; 3QJZ A; 3AE1 B; 2BS4 B; 2FCM A; 2KVZ A; 1LGR A; 3AU5 A; 1FEH A; 4HCN B; 3AI5 A; 3L0W B; 3VTU A; 2JPH A; 4G3X B; 3ECI A; 2I1J A; 3Q3F A; 3T3N A; 2K3U A; 2IBI B; 1T5X D; 2CU1 A; 1HZ6 A; 3P4P B; 2KDF B; 3Q3O C; 1YOV B; 4P16 A; 1WXM A; 3L13 A; 4HDO A; 3QX1 A; 4HK2 A; 3GZN B; 3PGE A; 4J6I A; 1H8C A; 1CJE A; 3NVW A; 3HUI A; 3BVZ A; 3P4Q B; 2NTS A; 1C79 A; 5AUK A; 3DBL B; 2KAC A; 3VDZ A; 2JYE A; 2IGD A; 1VCB A; 2K8H A; 3DVN U; 5HKH A; 3W5U B; 2PMV A; 4B6W A; 1TT5 B; 3HM6 X; 2PVG C; 2C7M B; 2JVC A; 5TR5 A; 1EF5 A; 2KX3 A; 3V6E B; 3FIL B; 3DHI C; 4B0M A; 2PVO D; 1GG3 A; 2LHD A; 1YN4 A; 3VH4 B; 2LXA A; 5D7G A; 3CF6 E; 2JF5 A; 4OZC A; 4DDG D; 5T8I A; 3SFD B; 5FKA C; 3V60 A; 4IKG A; 1YD8 U; 3ZIM A; 2MCN B; 1T3Q A; 1GB4 A; 3EFC A; 3NZ3 A; 4JL9 A; 5JHA A; 4JX1 C; 1VZ6 A; 3APC A; 1J7B A; 3PPA A; 3J9C A; 4G0N B; 2ZW1 A; 4MH8 A; 1IP9 A; 3PVL A; 2WXF A; 2YVC A; 1WXV A; 4ANW A; 1E90 A; 1TS4 A; 1J7A A; 1ACC A; 3AXC A; 1V1O A; 4GDK A; 2MRP A; 1WGG A; 1S1Q B; 4MT5 A; 5EDS A; 3N1Y C; 2NR2 A; 2XNA C; 1PQS A; 4PS7 A; 3GP7 A; 1GUA B; 2J53 A; 1TTN A; 1ZP0 B; 5IN7 A; 1JRU A; 1DGJ A; 1EM7 A; 2EEL A; 3NHE B; 3PRM B; 2CHZ A; 4XWW A; 2K6Q A; 2W9N A; 3B9J A; 3P1M A; 2LXC A; 1ZXH A; 4CQN A; 3BY4 B; 2INP E; 4RGN A; 4A3O A; 1FPY A; 4K7W A; 3GE3 C; 3B2F A; 3MC0 B; 1A5R A; 3DQV A; 4A6Q A; 2QIL A; 2R61 A; 2DZJ A; 2PW9 A; 2WXL A; 4W9C A; 2CR5 A; 3PLV A; 2M0A A; 1AAR A; 1N60 A; 4RM8 A; 3TBL D; 2XN9 C; 2WHI A; 3JW0 X; 4RGT A; 1XO3 A; 2RMM A; 1VZ7 A; 3MC8 A; 1CK1 A; 4EZK A; 5D2M B; 2BWE S; 4P7I A; 1OQR A; 2AL6 A; 3T9L A; 2DYO A; 3WAO A; 4M00 A; 2B76 B; 1V1P A; 1C1Y B; 1DYQ A; 1BXT A; 3C19 A; 4FBJ B; 2KWC A; 4KX6 B; 3Q3N C; 2RGF A; 3KQ4 A; 1WI0 A; 1V9J A; 2ON8 A; 1SF0 A; 2JZP A; 3UIP B; 2N9P C; 2Y5C A; 1XLN A; 1V2Y A; 1IBX B; 2JYT A; 4MSQ B; 5BO4 B; 4ZRJ A; 1HXY D; 3EGR A; 4AS1 A; 3W5V B; 2JXT A; 2LVQ A; 3APD A; 4XYC A; 3DCG A; 2I2Y A; 3RNF C; 2MH7 A; 3KYC D; 4JPS A; 4NAW A; 1FRR A; 4IG7 B; 2IYD B; 1X1M A; 1EO6 A; 2NCN A; 4WWM A; 1A70 A; 3R7R A; 1ZE3 D; 4DXF A; 1B1Z A; 2EKI A; 2HD5 B; 1RYJ A; 2IO0 B; 4M0W B; 1UGM A; 2WXP A; 1HQR D; 1OFF A; 1P1A A; 3LYY A; 2K0P A; 2K6D B; 2ZZP B; 4JGH B; 5E6N A; 3NVY A; 4Q2J A; 1GC6 A; 3I5J C; 3NZU A; 1WGH A; 5J2R A; 3Q14 C; 3R7Q A; 1MHX A; 2KJH B; 4DXG A; 3KYD D; 4YSY B; 1JRO A; 1R4M I; 2L83 A; 4C7Y A; 4N6E B; 3NG0 A; 1K8R B; 3ZNH B; 4LCD E; 2J0M A; 2MBO A; 1QOF A; 2DWQ A; 2HE7 A; 2WDQ B; 2V3N A; 3AE9 B; 1LXD A; 2W54 A; 4NZL B; 2BS3 B; 3ONS A; 2Z8L A; 3URY A; 3RFZ B; 2XBB C; 4QAY A; 3M3J A; 4FAD A; 2MA9 B; 2KZR A; 4NY0 A; 2NS5 A; 2W55 A; 4KSK C; 2LUM A; 4P1B C; 4WQO B; 3ZQ4 A; 2KWD A; 3DBH I; 5DPS A; 4BBN F; 2GMI C; 4WWN A; 1FFU A; 1ISN A; 1M94 A; 1K53 A; 1C77 A; 1STE A; 1WF9 A; 1HEZ E; 4LNI A; 4S17 A; 2JWU A; 2K1F A; 1YJ1 A; 4ZRP A; 3A9K B; 2GRI A; 4FLH A; 1Q0W B; 1SJH D; 2NBW B; 2DHZ A; 3M63 B; 1P7E A; 4LNN A; 5AUI A; 3AE7 B; 3RI7 C; 1IGD A; 2Q5W D; 2PLP A; 2JRI B; 4YWG G; 2GBR A; 1F2R C; 3N9Y C; 3I57 A; 1WZ0 A; 4HJK A; 3SEB A; 3K9P B; 2LGX A; 4BVU C; 3AE6 B; 4YL8 A; 5CHW A; 2YEP F; 1VLB A; 3CST A; 4C00 A; 2L0T A; 2K22 A; 1FCC C; 2DAF A; 2CJO A; 1UF0 A; 3X0W A; 3UIO B; 4I6L B; 1GJZ A; 1JW9 D; 4AJY B; 2KX0 A; 2KOX A; 5D3I B; 1N62 A; 3CWI A; 1UH6 A; 3ABV B; 4ZRQ A; 3HK0 A; 2AQ3 B; 4H2A A; 1UWM A; 3UI3 A; 2INC C; 3NUH B; 3QAR A; 3ZNG C; 2IND C; 2JY6 A; 1D5Z C; 4MDK E; 5H92 C; 3X23 A; 4XE0 A; 3VH3 B; 5L83 A; 1P3Q U; 2BS2 B; 3ZNZ B; 1R4N B; 4MGZ E; 2WDT B; 3HVZ A; 4GXB A; 3WAP A; 3AEC B; 1TY2 A; 2MLB A; 2KDI A; 2M4N A; 2BKF A; 1SE4 A; 1SIJ A; 1F52 A; 4ITK A; 2M1M A; 4MJS A; 1GPX A; 1LO5 D; 4CO7 A; 2BQQ A; 4TUU A; 4BFR A; 1GAQ B; 3KVF B; 2AQ1 B; 5CHF A; 2AYO B; 1DOX A; 1N6Z A; 4KIK B; 3TEW A; 2IO2 B; 3ZKJ C; 3LB8 C; 2ZCC A; 1Y56 A; 5DPR A; 3FKY A; 2L8J A; 4YTP B; 3GE8 C; 1TY0 A; 2PKO A; 3AEA B; 4TQ1 A; 2QCZ A; 2V4L A; 2DZK A; 2BVC A; 4HJG E; 4ZOH C; 1WMH A; 4C80 A; 5IP4 D; 2LGS A; 4GDL A; 3BII D; 3TSS A; 3ZJV A; 1MFW A; 1SSN A; 2MJ3 A; 4MGY E; 3TUO A; 1Q1O A; 3U52 E; 4DHZ B; 3VR8 B; 3ALB A; 1LFD A; 3VTW A; 3PLU A; 4DQO C; 3MC9 A; 1PGA A; 4ZYS A; 2RD0 A; 4KZ0 A; 5E6P A; 2C7N B; 5CTR C; 3RUI B; 1FNU A; 4HPL B; 5GMV A; 3A9J A; 1ZDX A; 4X57 B; 2IY0 B; 1QF6 A; 4LNO A; 4EEW A; 4OZB A; 1E8W A; 5L95 C; 3GB1 A; 2KC1 A; 3HM3 A; 2G3Q B; 1ZPS A; 1N61 A; 2MWS B; 4IDI A; 2RR9 A; 3KLS X; 4GU2 A; 2I1K A; 3DVG X; 2WXG A; 4OW0 A; 4JWU C; 4BKS D; 3H1U A; 4MGK E; 2KQS A; 4PS3 A; 1E10 A; 2KDM A; 3PZ8 A; 5LNK 1; 4OVU A; 2DZI A; 2J7Q B; 4ICV A; 1C4P A; 3ZJU A; 2FAZ A; 4FUL A; 4A55 A; 1NVI D; 5BYR A; 3A1Q A; 1PGX A; 1SE3 A; 3LDZ E; 1JCK B; 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