The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
MPLITFISPDGSRKTYEAYDGETLLSLAHRNNVDLEGACEGSLACSTCHVIIDPSWYDIVEQHNEISDEENDMLDLAFGLTDTSRLGCQIILTKELDGLCVILPTETRNISFVKNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Backbone 1H, 13C, and 15N Chemical Shift Assignments and structure of Iron-sulfur cluster binding protein from Ehrlichia chaffeensis
rcsb |
| molecule keywords |
Iron-sulfur cluster binding protein
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| molecule tags |
Metal binding protein
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| source organism |
Ehrlichia chaffeensis
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| total genus |
13
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00111 | Fer2 | 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MJ3 A; 1ZUD 2; 3FC4 A; 2WDV B; 4IDI A; 1JQ4 A; 1I7H A; 5EE1 A; 1RWS A; 1ZOY B; 3ABV B; 2WP9 B; 3CWI A; 3AB5 A; 3W5U B; 3AE9 B; 3AEG B; 4YTP B; 2M19 A; 2M56 B; 4N58 A; 1IUE A; 2BT6 A; 1NEN B; 3P4R B; 1JWA D; 1N61 A; 3NVW A; 3DWM A; 3AE4 B; 4A9A A; 1NVI D; 1E9M A; 2WLB A; 1QOB A; 1WXQ A; 1A70 A; 2Y5C A; 2PVO D; 3NVY A; 2N0S B; 2G1E A; 1PDX A; 3ETR A; 1L0V B; 1ZXI A; 3VRB B; 3WCQ A; 3ZYY X; 1E0Z A; 4YSY B; 3DWG C; 3AE7 B; 3NRZ A; 3HRD D; 3NS1 A; 1ZP0 B; 4US9 A; 5G5G A; 1YJJ A; 3NVV A; 3VRA B; 4ZHO A; 1B9R A; 3B9J A; 1KRH A; 3HUI A; 4N6E B; 1J7C A; 3VR8 B; 2K9X A; 3AEA B; 5G5H A; 4KX6 B; 2KAJ A; 2OHF A; 3P4S B; 3AE1 B; 2W54 A; 4C7Z A; 1CZP A; 2PIA A; 1JWB D; 5EE0 A; 3AE5 B; 1DOY A; 3AEE B; 1FIQ A; 1ROE A; 1N5X A; 2MJE A; 1V8C A; 1WGK A; 1E7P B; 4WWM A; 2K5P A; 5C3J B; 3AV8 A; 2B76 B; 1YQ3 B; 4ITK A; 4YSX B; 4C80 A; 1TJE A; 1N60 A; 2HTM E; 3AM9 A; 3KWL A; 4HRS A; 1TKY A; 2ACZ B; 1XO3 A; 3LXF A; 5C2T B; 1XLQ A; 1L6U A; 1NYR A; 1F0Z A; 1V97 A; 2WS3 B; 3P63 A; 1J7A A; 3AN1 A; 5AUI A; 1QT9 A; 3SR6 A; 1SIJ A; 5H8Y E; 4YTM B; 3W5V B; 1YJI A; 4YSZ B; 2H89 B; 1EWY C; 1L5P A; 1CJE A; 1SB3 C; 1FM0 D; 1T3Q A; 1AWD A; 2LEK A; 3P4P B; 1FXI A; 1OQQ A; 1R7S A; 1YQ4 B; 2MH7 A; 1GAQ B; 3SFD B; 2WU5 B; 1JAL A; 1JRP A; 2QIE B; 3P4Q B; 3LB8 C; 4US8 A; 1FRR A; 1SF0 A; 2DBY A; 1QLB B; 1AYF A; 1NI3 A; 2QJL A; 4N59 A; 1FFU A; 1FXA A; 1RM6 C; 4JWS C; 1JRO A; 4JWU C; 3AE6 B; 1QOF A; 3SFE B; 1VJK A; 2PKO A; 3AE2 B; 4WQM A; 1QOG A; 1KF6 B; 4JX1 C; 5MPO A; 1PFD A; 1TKE A; 2EKI A; 2Q5W D; 3HVZ A; 1E6E B; 4FXC A; 5EE9 A; 1FO4 A; 1FMA D; 3L4P A; 2K22 A; 2DWQ A; 1XLN A; 1RYJ A; 1RFK A; 5EE3 A; 2CU3 A; 1KFY B; 1N5W A; 4ZHP A; 2JX5 A; 1TKG A; 2PVG C; 1OFF A; 1NYQ A; 2CJN A; 3AEB B; 2BS4 B; 1N63 A; 1WWT A; 1GPX A; 3NVZ A; 2BS2 B; 3P1M A; 1QF6 A; 1UWM A; 3CIR B; 1N62 A; 2WQY B; 4C7Y A; 2CJO A; 3W9C B; 1L6V A; 2L52 A; 2WDQ B; 1E10 A; 3AE3 B; 2W3R A; 3EUB 2; 3AMZ A; 2L83 A; 2W3S A; 3AEF B; 4ZOH C; 1QOA A; 2WU2 B; 1DOI A; 1TYG B; 1WYG A; 3AE8 B; 4P6V F; 2JQR B; 2MJD A; 1J7B A; 3B2G A; 2WDR B; 5H92 C; 1VDV A; 2KMM A; 3RPF C; 4LTU A; 4YXD B; 2E3T A; 3B2F A; 1FRD A; 1NEK B; 1PUT A; 1OQR A; 1WRI A; 2W55 A; 2H88 B; 3FAH A; 2AX5 A; 1VLB A; 3AED B; 1DOX A; 1FFV A; 2BS3 B; 4USA A; 1XLP A; 3BII D; 4HRO A; 1DGJ A; 3AEC B; 3PO0 A; 4YTN B; 1XLO A; 1JW9 D; 5AUK A; 3VR9 B; 3AH7 A; 4YT0 B; 5GXG B; 2FBW B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M95 A; 3DDC B; 3L16 A; 4YTP B; 2VZK D; 3GE8 C; 3N30 A; 1WXS A; 1MI0 A; 3RYT A; 2KFK B; 3ZTD A; 1B9R A; 2QCZ A; 1XT9 B; 2L76 A; 1ESF A; 2EMT A; 2Y3A A; 1KLV A; 4TUU A; 2JXX A; 2M4N A; 1FXT B; 1WMH B; 3TEY A; 1I4X A; 4KGS A; 3AV8 A; 4J6I A; 1V1P A; 4XX5 A; 3KLS X; 2GI9 A; 1XLQ A; 4WQO B; 1J7A A; 1TZO A; 2DX5 B; 4C4V B; 2KC1 A; 3SR6 A; 3W5V B; 1TT5 B; 1P9D U; 4WWP A; 1EWY C; 5E6O A; 4AOF A; 4A3O A; 3IXS A; 3WAO A; 2QSD A; 1V6E A; 3SFD B; 2KWD A; 2WX0 A; 3DBL I; 3GS2 A; 2X8X X; 1KLU D; 3T9L A; 4ASW C; 2FCN A; 4BFR A; 1ZE3 D; 4DDG D; 3RFZ B; 2DNF A; 1XF5 L; 3MHZ A; 1WX7 A; 4K81 A; 3FIL B; 4XC2 A; 3M3J A; 1JWS D; 3OG5 A; 4ZDV A; 3VTU A; 2PW9 A; 2HJ8 A; 4KGT A; 1FEH A; 2PVG C; 1VZ7 A; 1GNU A; 2WXF A; 1HZ5 A; 4OHJ A; 1NDD A; 2C7H A; 2L0F A; 4BKS D; 1DYQ A; 4W9G A; 4P16 A; 1LXD A; 4ZRI A; 1JWM D; 2W55 A; 2E6X A; 2H88 B; 2J0M A; 1WJN A; 4EEW A; 1XXG A; 3APF A; 1LGR A; 2KMC A; 2R2O A; 5AZH A; 2IPK D; 2CHW A; 1SSN A; 2AQ3 B; 5D3I B; 1C4P A; 3AE7 B; 3QIJ A; 5C1Z A; 2RR9 A; 1L0Y B; 1SIF A; 1OEY A; 1Y8R C; 4KX6 B; 1V49 A; 3MC0 B; 3AE5 B; 3HK0 A; 4ZRP A; 3RUL A; 2KAN A; 3ML9 A; 3PPA A; 2UYZ B; 1WGK A; 1EUV B; 2PPH A; 1N60 A; 5HKH A; 3UI3 A; 3CF6 E; 2FIF A; 1JCK B; 4OVV A; 4ICU A; 4WAA A; 1SEB D; 1QT9 A; 3PS6 A; 2IY0 B; 2LZ6 A; 2DYB A; 4R3D A; 1YJI A; 3ZQ4 A; 1T3Q A; 2MBQ A; 1IBX B; 3RI7 C; 4LNI A; 2QIL A; 4GXB A; 4TMA B; 1ZDX A; 2KXJ A; 1WJ4 A; 1V81 A; 2BKF A; 4LK0 M; 3L54 A; 4JGH B; 3H6N A; 5LLI A; 2Y5B B; 3ZVV A; 1UEL A; 2SAK A; 1PQS A; 3W2D A; 4GDK B; 2MP2 B; 1TKE A; 3LJ3 A; 2XBB C; 1FMA D; 2RGF A; 4B6W A; 5IO9 A; 3AU4 A; 4FUL A; 1OFF A; 1NYQ A; 1WWT A; 2K8B A; 2DAF A; 3S2A A; 4PS7 A; 4HCP B; 2C7N B; 3PV1 A; 2WU2 B; 5D6J B; 2FUH B; 4W9K A; 2XK5 B; 2KOX A; 3QCA A; 3MC9 A; 3WA0 A; 2KMM A; 2E3T A; 2R2Q A; 4JLC A; 1FRD A; 2K6D B; 3GZN I; 2WHI A; 2BS3 B; 4GSW A; 5AUK A; 4KSK C; 2FBW B; 4ZYN A; 4RGM A; 4WJN A; 2LGD A; 3AEG B; 3PHW B; 5C3J B; 4DXG A; 1YNT E; 2RMM A; 1WJU A; 3ETR A; 1ZP0 B; 2EMS A; 3HHM A; 4MM3 B; 4TV3 A; 5HFY A; 3A4R A; 3X0W A; 4KKJ A; 3HUI A; 2XN9 C; 4I6L B; 3RNC C; 4D2K A; 2EKE C; 4JE3 B; 1P7E A; 4K7U A; 3PZ8 A; 1TS5 A; 2O2V B; 2B76 B; 1PGX A; 2IYD B; 4LNO A; 1F0Z A; 2EEL A; 4X57 B; 4L1B A; 1F2R I; 2V1Y A; 2WGS A; 2WXL A; 1AWD A; 3A9K A; 4W9D A; 2ON8 A; 3N32 A; 1TZ1 A; 3JYU A; 4ANV A; 4E74 A; 2TSS A; 3KQ4 A; 1V86 A; 5CHW A; 3UIP B; 5LXH A; 1P3Q U; 1FXA A; 1I42 A; 4JWU C; 3SFE B; 2KKC A; 4HPP A; 1TS2 A; 4AJW A; 1RFA A; 5EE3 A; 2D5G A; 2CS4 A; 2LJ5 A; 2ZNV C; 4HLE A; 1N62 A; 1WH3 A; 1SJE D; 2BBC A; 5EDS A; 4P6V F; 3IHP C; 2LMC A; 1OGW A; 1MHH E; 1NEK B; 1WRI A; 2WX1 A; 1VLB A; 4WWN A; 4NPN A; 1FFV A; 5D94 A; 3RZW C; 4HWI B; 1E8W A; 3A1Q A; 2JWZ A; 3AH7 A; 3BVM A; 1C4A A; 1FCL A; 4MGY E; 2WDV B; 1JQ4 A; 1RWS A; 1YIW A; 1I4R A; 4N9F 4; 4PYU A; 4W9I A; 1IUE A; 2AWT A; 3Q8C A; 2KLC A; 2N9E B; 2LVP A; 2AEH A; 2N0S B; 3NZS A; 3URY A; 3APD A; 1WF9 A; 3TSS A; 3TL5 A; 3NVV A; 3W1S C; 2L3Z A; 4J3O D; 1KRH A; 2N9X A; 2DHZ A; 1WX9 A; 2NBU A; 4G50 A; 1WIA A; 1V5T A; 3T8M A; 1C1Y B; 2D2Q A; 1YOV B; 2RDH A; 1SGH A; 1SJH D; 2HTM E; 5FKA C; 2K25 A; 4A8X C; 1V2Y A; 2LUM A; 3VH4 B; 4K7W A; 4L2Y A; 1CJE A; 2MH7 A; 1KM7 A; 3U52 E; 2KDF B; 1C3T A; 1P0R A; 1IYF A; 3IBE A; 1EF1 A; 3VDZ A; 3NG0 A; 4NQL B; 2KMA A; 4II2 B; 4BBN C; 1QOF A; 2N1V A; 2PMV A; 3RT3 B; 1GJZ A; 2C60 A; 1E6E B; 3VUY A; 3TUO A; 4IW0 A; 2LI5 A; 3NZU A; 1Q10 A; 3Q69 A; 1WM3 A; 2C5L C; 1UWM A; 3Q2A C; 3KVF B; 2G3Q B; 2M0X A; 4HKZ E; 1P7F A; 4BBN F; 4MGI E; 1STE A; 2C9W B; 3EC8 A; 4A3P A; 1WXA A; 1VDV A; 3KUD B; 3L0W B; 2KLG A; 2KDM A; 3ML8 A; 3Q8F A; 2YEP B; 3DCG A; 1D3Z A; 4EE2 A; 1BUI C; 1I4G A; 3EFU A; 3Q3J A; 2IDY A; 1V9J A; 1I7H A; 1YQB A; 1HZ6 A; 4HJG E; 2KQS A; 1E9M A; 4IM0 A; 2CHZ A; 2VZK B; 1PDX A; 1ZXI A; 2BWE S; 3QJZ A; 5G5G A; 4MSQ B; 2V3S A; 3ZUN A; 2PE9 A; 1V1P B; 1T0Y A; 2PLP A; 2N9L A; 2GRI A; 1D5X C; 3RNA C; 1DOY A; 1EWC A; 4NJ6 A; 1ROE A; 1UBQ A; 3I57 A; 1QQR A; 1D6E C; 3EFC A; 3IAM 1; 2A4Z A; 3RUI B; 3AU5 A; 1LQB A; 1NBF C; 4H2A A; 5FR6 A; 4B95 A; 1L5P A; 3Q6B A; 3IG3 A; 1LFD A; 1OQQ A; 3R3M A; 3RD2 A; 1KH0 A; 4EZL A; 1IGC A; 4ICV A; 2J4X A; 5JHA A; 1TBE A; 4BVU C; 3R7Q A; 2PKO A; 4WQM A; 2QC8 A; 1PFD A; 2EKI A; 2QMT A; 3DBR B; 1FO4 A; 2MEK A; 1IPG A; 3L4P A; 2LFI A; 4GDL A; 2JXT A; 3TIX A; 2ZEQ A; 2VH1 A; 2CHX A; 4K3B A; 3E9S A; 3V3X A; 4ARI A; 1QF6 A; 2Z0D B; 3QK0 A; 4FBJ B; 4C7Y A; 2YLM A; 3KYD D; 2BW2 A; 2YEP F; 2VRR B; 3TEZ A; 1XEE A; 1TYG B; 1WYG A; 2HDE A; 3VFK A; 4HK2 A; 1C4C A; 2D3G A; 1EF5 A; 4BOZ B; 4KVG B; 1UBI A; 4K1R B; 2AQ1 B; 1RRB A; 4KIK B; 1AN8 A; 2LGX A; 3PRE A; 4YTN B; 4IC7 B; 3FC4 A; 5EE1 A; 3A9J A; 2WXG A; 3HIZ A; 4FLH A; 1Q5W B; 2J42 A; 1F9J A; 2JRI B; 3ZTC A; 1QOB A; 4PS8 A; 3KW5 B; 3QHT A; 1EM7 A; 3QA8 A; 1E8Z A; 1C9F A; 4A20 A; 4O1N A; 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