The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
MEKDLLDKLGQHLVWRMGRAEDEDVLVVRVGLASATPRFRELPRLLNLPEAEMRRLVQEGRVRVEWVEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structure of TT1592 from Thermus thermophilus HB8
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein TTHA1281
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Thermus thermophilus
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| total genus |
16
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-01-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11609 | DUF3248 | Protein of unknown function (DUF3248) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E6X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BKG A; 3RD2 A; 2J42 A; 4IW0 A; 1HXY D; 2BPS A; 5J2R A; 1OQQ A; 1WE7 A; 1SSN A; 2R2Q A; 3V05 A; 4PS8 A; 3QAQ A; 2D3G A; 1EU3 A; 2WXF A; 4RM9 A; 5LXH A; 2MRP A; 1IPG A; 4XC2 A; 2K8C A; 1KFY B; 2QEJ C; 3DCG A; 3DBH B; 1XCT L; 2M56 B; 4GXB A; 1MHH E; 4XE0 A; 1AAR A; 1K50 A; 5FR6 A; 1CZP A; 2N9P C; 1DYQ A; 4FUL A; 4PS3 A; 4MEM A; 1K52 A; 5IN7 A; 4W9K A; 3N32 A; 3ZQ4 A; 3VTW A; 4BVU C; 4HJG E; 4A3P A; 1WXM A; 3L17 A; 4RFB A; 4BOZ B; 3QX1 A; 3H7S A; 3MJW A; 2NPT A; 2GBJ A; 1ET9 A; 4OZC A; 1ROE A; 4GDL B; 4USA A; 2Q5W D; 3WAP A; 3HVD A; 3QHT A; 2EKE C; 2MBQ A; 3ABV B; 1KLV A; 1P9D U; 3JSV B; 4M00 A; 3SD5 A; 3BY4 B; 3BWU D; 4LNI A; 1D5X C; 2O6V B; 1R4N B; 1I4X A; 2D5G A; 3NZS A; 1XCQ L; 3ZUN A; 3VTV A; 2LWP A; 1N5X A; 3T3O A; 4ZDV A; 2QHO A; 1TBE A; 2BGF A; 1TS3 A; 2CHX A; 5EE1 A; 2UYZ B; 2DZK A; 3PRM B; 3T8M A; 3L13 A; 4I6P A; 3PGE A; 4ICU A; 1I7H A; 4X57 B; 4NZL B; 1ISN A; 2LGD A; 5FK9 C; 3NZ3 A; 3RNC C; 2WXR A; 2YEP F; 4REZ A; 1B9R A; 2O6V D; 4TMA B; 3V3X A; 1H8C A; 2BWE S; 1UEL A; 1TIF A; 3B0A A; 3ZNI D; 1MG8 A; 2QC8 A; 3A9J A; 1PDX A; 3MJ5 A; 2WU2 B; 2A4Z A; 4N58 A; 1PGB A; 3Q3O C; 2IO3 B; 2KVZ A; 4XWW A; 1I4H A; 4HCN B; 3P63 A; 3K9O B; 5FKA C; 4II3 B; 3RT3 B; 4MH0 E; 1WRI A; 2K1F A; 1BXT A; 3X23 A; 4US9 A; 1Q5W B; 2KHW B; 1SE9 A; 3PO0 A; 4MM3 A; 3R66 C; 3BYY B; 4MSQ B; 2PJH A; 3CST A; 2LZ6 A; 3C0R B; 2QSD A; 2L1A A; 3RPF C; 2MSE D; 2WDT B; 3DVG X; 3C19 A; 2NTS A; 2JYE A; 4WQO B; 1JWU D; 2XK5 A; 2EKI A; 4I6L B; 4WQM A; 5G2N A; 3L0W B; 1NDD A; 1K8R B; 3ZTC A; 2NCN A; 3B1L X; 1JWM D; 2K22 A; 2KZR A; 2LXC A; 3H8H A; 1GOZ A; 3U52 E; 5D3I B; 3UQA A; 2RDG A; 2MQJ A; 2G4S A; 3AV8 A; 2DEN B; 3VVW B; 3DDC B; 4E3C A; 3DBL B; 1QQR A; 1UBI A; 3EHV A; 2WDQ B; 4OZA A; 3RNG C; 4Q2J A; 1K53 A; 2PTL A; 4DQO C; 3GZN B; 1NYQ A; 1V2Y A; 1F0Z A; 2KVR A; 2NVU I; 1XEE A; 1GAQ B; 4HJK A; 2O2V A; 2D3A A; 1U4A A; 4ANW A; 1WYG A; 5EE9 A; 2FIF A; 1MPE A; 1E7U A; 1JRO A; 2M0X A; 4OZB A; 3SFE B; 3Q8B A; 4FXC A; 1I4G A; 2FAZ A; 3ZGZ A; 1TGZ B; 4DHZ E; 2BS3 B; 2DYB A; 2MP2 A; 3IBE A; 5AUI A; 3ZDT A; 1N5W A; 4US8 A; 2JXT A; 2QCZ A; 1FD6 A; 1F52 A; 4URK A; 3DBS A; 3ZKJ C; 1E8W A; 3AE6 B; 1FM0 D; 4BOS C; 3JYU A; 2ZVO A; 2JWU A; 3W9C B; 1SXT A; 2M17 A; 3L10 B; 4IG7 B; 2IGG A; 4W9H A; 4JWU C; 4K7U A; 4DDG D; 1D4B A; 1KJT A; 1AWD A; 1WMH A; 2PW9 A; 1ZW7 A; 2N4F A; 1T5X D; 1RLF A; 2KFJ A; 4W9E A; 4A55 A; 3RZF A; 2MEK A; 3H9D A; 4NY0 A; 1LO5 D; 1DOI A; 3UGB B; 3AU5 A; 1CJE A; 2JY6 A; 3D32 A; 4YWG G; 3ZYY X; 4GDK A; 1CMX B; 2BF8 B; 3URY A; 1VLB A; 1E5W A; 2WS3 B; 2DZJ A; 4IOI E; 4FAD A; 4EKU A; 1I4Q A; 2VZK B; 2L05 A; 2ZEQ A; 4P16 A; 2OOB B; 3NG0 A; 2W3S A; 1F77 A; 1C9F A; 3E9S A; 3WAM A; 2L0F A; 2W82 A; 5J18 A; 4BAX A; 1DOX A; 2N1W A; 3W1Y A; 3WA0 A; 5HG2 A; 2D11 A; 3BVM A; 5C3J B; 1J19 A; 3DBR I; 3NUH B; 2Y3A A; 3FAH A; 3N30 A; 2PVG C; 2N9L A; 2WGS A; 2IO0 B; 3Q8A A; 3B2G A; 3WAO A; 3UIP B; 1TYG B; 1KH0 A; 2ZJD A; 1M4V A; 2VZK D; 5IP4 D; 1BUI C; 2CR5 A; 1WJ6 A; 1L6U A; 3W5V B; 2Z8L A; 3O65 B; 4RF1 A; 1WY8 A; 3BIN A; 3MC9 A; 1NYR A; 2KFK A; 4KDI C; 1YQB A; 3ZJT A; 4LNF A; 4CQN A; 1EWC A; 2OED A; 5H8Y E; 4NJ6 A; 1SE4 A; 4AJY B; 3NZU A; 4HPL B; 1VD2 A; 5BYS A; 5GMV A; 4WWP A; 1AYF A; 3ZNG C; 4MJS A; 1VR9 A; 2FCS A; 3TUO A; 1C4A A; 3LB8 C; 4W9J A; 2MA9 B; 2KLC A; 2IO1 B; 3NVY A; 4ZHP A; 4IM3 A; 3AI5 A; 1WJU A; 2MWS B; 5E6N A; 2KT7 A; 2HE7 A; 2MX2 A; 4ARC A; 2INP E; 4KKJ A; 1P3Q U; 1ZKH A; 1JAL A; 1UUP A; 2WX1 A; 2RSU A; 4OVV A; 3B2F A; 5E6O A; 2N9X A; 3Q3M C; 2FUH B; 1SJH D; 1WGH A; 2IGD A; 3A33 B; 3ZVV A; 4MGZ E; 4WWN A; 1E8Z A; 3RUI B; 1PQS A; 3BYT B; 5D3D A; 1EO6 A; 2GBR A; 3EUB 2; 1MJD A; 3R3M A; 3LDZ E; 4HPP A; 4K1R B; 1VRA B; 3TMP B; 3KUD B; 4FBJ B; 3V62 A; 3T3N A; 1WE6 A; 1WZ3 A; 3KYD D; 4KGR A; 4J6I A; 2LVO A; 3TBL D; 2R2O A; 3IG3 A; 3QQ8 B; 1VDV A; 3AEB B; 2WXG A; 2BB5 A; 3R2T A; 4IWP A; 4MAC A; 3N20 C; 5G55 A; 2SAK A; 3EA6 A; 4KIK B; 1UWX A; 3A1Q A; 3PRE A; 4RNA A; 3VDZ A; 2IPK D; 1FRD A; 2UU7 A; 4FN2 A; 4MT5 A; 1EF1 A; 4EOY A; 4OVZ A; 3P2B A; 1FNW A; 3L16 A; 2W9N A; 4PYZ A; 1XT9 B; 4RMA A; 2AQ1 B; 3V60 A; 2QIL A; 1UGM A; 3GOE A; 1NBF C; 1WXV A; 1UF0 A; 2I1J A; 3PT2 B; 3W5U B; 2KK8 A; 2KWD A; 4F8C B; 1YN3 A; 1YJ1 A; 4EE2 A; 2KWU B; 1OQY A; 3QJZ A; 1LQB A; 3HHM A; 2AL6 A; 4TUU A; 3RUL A; 4M02 A; 4RH6 A; 3HIZ A; 4CYE A; 5HKH A; 3OWE B; 2LXA A; 2PMV A; 4WJN A; 1KLG D; 4BKT A; 1TY2 A; 2J0M A; 2KN5 A; 3ONS A; 2FCN A; 4GGQ A; 1ENF A; 2EMS A; 2WU5 B; 4AUQ C; 3ZTD A; 3ZNH B; 4G50 A; 1YIW A; 3AEG B; 1KLU D; 4NPN A; 4TQ0 A; 2ON8 A; 2GRI A; 4F1S A; 3EEC A; 3RNB C; 2RGF A; 3HM3 A; 4E74 A; 1STE A; 2DZI A; 1P0R A; 2KD0 A; 4L2Y A; 1HEZ E; 1VZ6 A; 4L1B A; 4W9F A; 1XD3 B; 4B0E A; 1L5P A; 1TKE A; 2GMI C; 3SU8 X; 3ZRF A; 4HDQ A; 3BII D; 3ETR A; 3Q3J A; 3QC8 B; 3AE7 B; 4UDU C; 1YOV B; 4ITK A; 3VRA B; 1L4Z B; 2KX3 A; 3PZ7 A; 1E6E B; 2KKC A; 4PT5 A; 1D5Z C; 2QJL A; 2QMT A; 1GC6 A; 2LVQ A; 2G45 B; 5E6J A; 4G3X B; 1SBB B; 3NVW A; 4YTP B; 2R61 A; 2L76 A; 2C7N B; 3CSF A; 3PS6 A; 2DAJ A; 4MSM B; 4JE3 B; 2MH7 A; 4EZK A; 1N60 A; 1OFF A; 2KTR B; 2K6D B; 1M94 A; 3CMM B; 2ZZP B; 4YSX B; 1JQ4 A; 4HCP B; 4S17 A; 5G5G A; 4LJP B; 2L52 A; 3IAM 1; 1Y8R C; 2KLG A; 2PKO A; 2L3Z A; 1EU4 A; 2V1Y A; 3P4R B; 2ZNV C; 4ANX A; 4II2 B; 2MBE A; 2BTE A; 4PK1 A; 1T0R C; 3KW5 B; 1SIJ A; 4FJZ A; 1N62 A; 1WFY A; 1YD8 U; 2KQ4 X; 4GDL A; 2PPH A; 4HK2 A; 5L95 C; 1N6Z A; 2JRI B; 2WXJ A; 3PVL A; 2D2Q A; 4GN1 A; 5HHD G; 2RMM A; 3AE3 B; 2KNB A; 3ZIM A; 1V8C A; 3JSV A; 2RD0 A; 3AB5 A; 1YNT E; 3AN1 A; 5JHB A; 4CO7 A; 2LJ5 A; 3DPD A; 1QOF A; 1Q1O A; 2O6V A; 1BT0 A; 1E90 A; 1TZO A; 4BZA A; 2I1K A; 1MVK A; 2BT6 A; 1TKG A; 2G3Q B; 1A5R A; 2HJ8 A; 2WXM A; 1SIF A; 1E7P B; 1GB1 A; 3TJP A; 4RCO A; 2MJE A; 4B95 A; 3RNE C; 3APD A; 4MEL A; 2Z0E B; 2CHW A; 4ZYS A; 2LGS A; 5EE3 A; 3KUC B; 4FHK A; 3PPA A; 2L32 A; 3ECI A; 1V49 A; 3AU4 A; 2JVC A; 2LHE A; 1VZ7 A; 3WAN A; 1QKZ A; 2DHZ A; 5DPS A; 3TIX A; 3RFZ B; 4C00 A; 2KDE B; 2BKR B; 3BZD B; 1QLB B; 1D5M C; 4JWS C; 3RMK C; 4IM2 A; 2LUE A; 2WWZ A; 3R7Q A; 2KJH B; 1HQR D; 5HFY A; 1JWB D; 4R3D A; 2ZVN A; 2ZW0 A; 2BQQ A; 2VH1 A; 1TS2 A; 1WYW B; 2JUO A; 4XDC A; 2ZCB A; 1P7E A; 4A3O A; 1WR1 A; 3WAL A; 2W55 A; 1CK1 A; 4K3C A; 3SDL C; 2YEP B; 2KQS A; 1T0S C; 1YN4 A; 3FIL B; 4LK0 M; 5LXI B; 3PZD A; 1I42 A; 4BKS D; 3AE4 B; 2WNM A; 2IO2 B; 1QOA A; 4D2K A; 2H88 B; 4KZC A; 4AP4 C; 1YJJ A; 1V81 A; 4KGT A; 2PIA A; 4EZL A; 3RNF C; 4ZHO A; 1WXS A; 2TSS A; 4KKI A; 2J52 A; 3A9K B; 1RFK A; 2ONQ A; 3S2A A; 2HTM E; 2H89 B; 1OEY A; 5C1Z A; 3IT4 B; 5FR3 A; 4TSS A; 5CX3 A; 3EFC A; 3R8B A; 1FMA D; 2SEB D; 3Q14 C; 4E71 A; 3CIR B; 3NHE B; 4KSK C; 3MHZ A; 3U7Z A; 2WP9 B; 1WGD A; 4AQ7 A; 1HA5 A; 1LXD A; 1A70 A; 4JGH B; 1I35 A; 1CQV A; 1JML A; 2M8S A; 4HVB A; 3QCA A; 1WXQ A; 1IGC A; 2LMC A; 1J7B A; 5D6J B; 2PLP A; 2WXO A; 4P7I A; 2N1V A; 2OJR A; 4ZOH C; 1WJN A; 1ZE3 D; 3GE8 C; 4C4V B; 2KDF B; 4J3O D; 3Q6B A; 2REX A; 1E9M A; 1FCC C; 3M62 B; 5BYR A; 2N9K A; 2XN9 C; 2DZM A; 2KMC A; 5JZE B; 5HI1 A; 2BYT A; 2KAC A; 4KDL B; 3M63 B; 1ZXI A; 2NMQ A; 3N1Y C; 4BBN C; 2K39 A; 2HDE A; 3B08 A; 3IXS A; 4A9A A; 1QIL A; 2V3N A; 3K9P B; 3TEX A; 2JT4 B; 4C80 A; 2PE6 B; 1IBX B; 4MGK E; 1V5O A; 3IAS 1; 1N61 A; 2D07 B; 4O1N A; 1V86 A; 4FJV B; 2QIE B; 2V3S A; 3VQI A; 1ZGU B; 3ZXR A; 3AH7 A; 2RR9 A; 1Z5S B; 4W9I A; 2LFI A; 2NR2 A; 4RM8 A; 3OJ4 B; 1R7S A; 1FXA A; 2KDB A; 2JF5 A; 1FO4 A; 3H6N A; 4MGY E; 1C3T A; 1E10 A; 3TSS A; 3M95 A; 4M0W B; 1ZXH A; 2Y5C A; 1KF6 B; 1OQR A; 4M01 A; 3Q69 A; 1FNU A; 1PUT A; 4IUM B; 2FNJ B; 2IY0 B; 1Q10 A; 4DXG A; 3W2D A; 1X1M A; 3L54 A; 2J0K A; 1V6E A; 3U2S C; 2LGX A; 2WDV B; 3UF8 A; 1TT5 B; 1HZ6 A; 3KWL A; 2Y5B B; 3P1M A; 3PRZ A; 2W3R A; 2RPV A; 1C77 A; 4HDO A; 3V6C B; 3GZN I; 1TZ1 A; 3KLS X; 3HM6 X; 3TEW A; 2ZPN A; 1V1O A; 1HE8 A; 1UNS A; 3RYT A; 1GG3 A; 2AYO B; 4ACF A; 4GOC A; 3ML9 A; 3I9V 1; 4HKZ E; 4A20 A; 1MFW A; 3NS8 A; 3ZLZ A; 5H92 C; 2Z59 B; 1SJE D; 3AE2 B; 1NEN B; 4GU2 A; 1I4R A; 3PHX B; 1E7V A; 1XLP A; 3KUZ A; 4HWI B; 1C1Y B; 4NJ7 A; 1FXT B; 1IP9 A; 1NVI D; 4LCD E; 4LNO A; 5EDS A; 1QF6 A; 2JZ3 B; 2Y5P A; 4P6V F; 4WUR A; 3SHQ A; 4ZYN A; 3OAW A; 4RGT A; 1N63 A; 4JLC A; 3E56 A; 1MI0 A; 2CJN A; 1YQ3 B; 2C9W B; 3O13 A; 3TEY A; 5D94 A; 2FID A; 4A90 A; 1NI3 A; 2L7R A; 2OJW A; 3I57 A; 3P4Q B; 4AJW A; 2AL3 A; 1RM6 C; 3IVF A; 1UZX B; 3TL5 A; 3VXW A; 5BMI A; 3DHI C; 5JHA A; 2FCM A; 3NJT A; 5J17 A; 3DHH C; 4DHZ B; 3DWG C; 3APF A; 3I5J C; 2LUM A; 2WXK A; 3CWI A; 2I2Y A; 2EEL A; 2IYD B; 1JRU A; 1JW9 D; 2KOX A; 2WQY B; 4TQ1 A; 2BVC A; 2ZNV B; 2LRW A; 1WM2 A; 1R4M B; 1RAX A; 3AMZ A; 2LD9 A; 1J7A A; 2NTT A; 3KH0 A; 1UH6 A; 2KWC A; 1WM3 A; 1WWT A; 4WH4 A; 5I4D A; 2JSV X; 4IDI A; 3R7R A; 3EFU A; 1J7C A; 1XF5 L; 2JZZ A; 2ACZ B; 2LGI A; 1RWS A; 1ZUD 2; 4LNN A; 3UIN B; 2W54 A; 4MH8 A; 4KX6 B; 3MHS D; 4AWJ A; 1EM7 A; 4HXD A; 1GUA B; 4HRO A; 2IJ0 A; 1SGH A; 4GSW A; 1FCL A; 3JVZ X; 3U8Z A; 1FIQ A; 4K81 A; 1C4C A; 2NBW B; 1WF9 A; 3RN9 C; 2LHD A; 1T6B X; 3PSE B; 2NBV B; 4KIK A; 4GB9 A; 1FRR A; 3I63 C; 4RGM A; 2K3U A; 4IWQ A; 4GLS C; 1GJZ A; 3DHG C; 2KTF A; 1G6J A; 3VRB B; 4W9L A; 2KXJ A; 4DHJ B; 5DPR A; 2J53 A; 3AEF B; 2IZV B; 4YTM B; 3GS2 A; 5IAA C; 2FCQ A; 4NAW B; 5AUK A; 1F9J A; 2C60 A; 1UBQ A; 2M0A A; 2YVC A; 3BVG A; 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