The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
b'EEVFVFTPKGDVISLPIGSTVIDFAYAIHSAVGNRMIGAKVDGRIVPIDYKVKTGEIIDVLTTK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Uncharacterized protein
|
| publication title |
Northeast Structural Genomics Consortium Target QlR13A
rcsb |
| source organism |
Clostridium leptum
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-06-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02824 | TGS | TGS domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SR6 A; 3AED B; 5EE0 A; 3P4S B; 3P4P B; 5EE9 A; 2L52 A; 1T3Q A; 1QLB B; 2BT6 A; 2W55 A; 4ZHO A; 1FM0 D; 1DOY A; 4ZOH C; 4C7Y A; 2WU2 B; 1QOB A; 3RPF C; 4US8 A; 5MPO A; 1GPX A; 2MJE A; 1J7A A; 3NS1 A; 3NVV A; 4N6E B; 3ZYY X; 4YTM B; 2Q5W D; 1DOX A; 1N63 A; 1RFK A; 1WGK A; 2WQY B; 2QJL A; 2K22 A; 3AE7 B; 4JWU C; 1AWD A; 2OHF A; 2W54 A; 1ROE A; 4WQM A; 2PKO A; 1ZXI A; 4HRO A; 4ITK A; 1ZP0 B; 1QF6 A; 3AE4 B; 1JRO A; 5C3J B; 3HUI A; 4YTP B; 1DGJ A; 3CWI A; 4JWS C; 2CJN A; 3AE5 B; 3VR9 B; 1TYG B; 2M56 B; 2WLB A; 1TKG A; 1OQQ A; 1XLQ A; 2CU3 A; 1L0V B; 2JQR B; 4FXC A; 4HRS A; 1RM6 C; 4YXD B; 1N62 A; 3AH7 A; 2CJO A; 3ETR A; 3P4Q B; 1JW9 D; 1TKY A; 2K9X A; 5EE3 A; 1AYF A; 3VRA B; 3HRD D; 2B76 B; 1PUT A; 2N0S B; 4LTU A; 1FMA D; 2BS4 B; 2DWQ A; 2MJD A; 2M19 A; 3AB5 A; 2QIE B; 5G5G A; 5C2T B; 3AV8 A; 1IUE A; 1J7C A; 5G5H A; 1ZOY B; 2KAJ A; 2WP9 B; 1NYR A; 1TJE A; 3P63 A; 3W5V B; 1N61 A; 1L6V A; 3NVZ A; 4YT0 B; 2JX5 A; 2ACZ B; 1XLO A; 2Y5C A; 1NEK B; 3L4P A; 1KRH A; 3AE2 B; 3LXF A; 1NEN B; 1SIJ A; 2LEK A; 3VR8 B; 1NYQ A; 1FXA A; 1RWS A; 1YQ4 B; 2BS3 B; 1FFU A; 3AE8 B; 1CJE A; 2E3T A; 5AUK A; 3AEE B; 3B9J A; 3NRZ A; 3AEC B; 1FRD A; 1VJK A; 2K5P A; 1QOF A; 1WRI A; 1WWT A; 1VDV A; 3LB8 C; 5EE1 A; 3W9C B; 4A9A A; 3NVW A; 3VRB B; 1L6U A; 4WWM A; 5AUI A; 1JWB D; 2PVO D; 1WXQ A; 3CIR B; 1OFF A; 4KX6 B; 2EKI A; 2HTM E; 2WDR B; 3AEG B; 1PFD A; 1N60 A; 4N58 A; 1FIQ A; 3AE6 B; 3DWG C; 3AM9 A; 3AN1 A; 4ZHP A; 1J7B A; 4US9 A; 3NVY A; 1E0Z A; 1V8C A; 1L5P A; 3AE1 B; 3EUB 2; 1CZP A; 1N5X A; 3AMZ A; 1FFV A; 1N5W A; 1I7H A; 3KWL A; 3PO0 A; 1JRP A; 4YSX B; 1FRR A; 1EWY C; 4P6V F; 1TKE A; 2PVG C; 2PIA A; 3AEB B; 4IDI A; 1KFY B; 2DBY A; 3P4R B; 2H89 B; 1SF0 A; 3AE3 B; 3FAH A; 1YJJ A; 1KF6 B; 1E6E B; 1XLP A; 1FXI A; 2WU5 B; 1E7P B; 1UWM A; 4USA A; 1R7S A; 3AE9 B; 1XLN A; 1DOI A; 3B2G A; 4YSZ B; 1WYG A; 1QOG A; 3BII D; 3P1M A; 2W3S A; 2WS3 B; 1E9M A; 1YJI A; 1JQ4 A; 3DWM A; 2WDV B; 1JAL A; 4C80 A; 3ABV B; 1QOA A; 1OQR A; 2AX5 A; 2G1E A; 5H8Y E; 4JX1 C; 1YQ3 B; 1PDX A; 2MJ3 A; 3AEA B; 1NVI D; 5H92 C; 1V97 A; 1E10 A; 3WCQ A; 1F0Z A; 1ZUD 2; 2FBW B; 4YTN B; 2L83 A; 2H88 B; 3AEF B; 4C7Z A; 1FO4 A; 1SB3 C; 1B9R A; 2MH7 A; 1A70 A; 2W3R A; 1NI3 A; 5GXG B; 3SFD B; 3FC4 A; 1XO3 A; 2BS2 B; 4N59 A; 1RYJ A; 4YSY B; 1QT9 A; 3W5U B; 2WDQ B; 3SFE B; 3HVZ A; 1JWA D; 3B2F A; 1VLB A; 1GAQ B; 2KMM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3U7Z A; 3Q3F A; 4JE3 B; 2VH1 A; 1OTR B; 2JU6 X; 2YEP F; 4WUR A; 4W9F A; 3IT4 B; 2Z0D B; 1WGK A; 1X1M A; 2KHW B; 4JWU C; 3M95 A; 4LCD E; 4AUQ C; 1Q1O A; 3Q8C A; 4WAA A; 1MHH E; 4I6L B; 3L54 A; 2MCN B; 2CJO A; 3VRA B; 2KLC A; 4WWN A; 1L0Y B; 1ZOY B; 1WX7 A; 2NTS A; 3ZW3 A; 2IYD B; 3IXS A; 3L4P A; 1XF5 L; 3LXF A; 3H7S A; 3BVZ A; 2CHZ A; 5JXV A; 1WGR A; 1CJE A; 2LI5 A; 4XWW A; 1LQB A; 1PYW D; 3AU5 A; 5EE1 A; 3VRB B; 2IO0 B; 2BYE A; 2RPV A; 3APF A; 4RF0 A; 3O13 A; 5CHF A; 3PTF C; 2GB1 A; 3AE6 B; 3DWG C; 2AL3 A; 1J7B A; 2IO1 B; 1Y8R C; 2JWZ A; 1RAX A; 1JRP A; 2IGH A; 1TZO A; 2DYB A; 1KF6 B; 1J19 A; 2Y5B B; 4KSL C; 2D11 A; 2D2Q A; 3GS2 A; 5CHW A; 3D32 A; 2KAN A; 4HPL B; 1PGX A; 2J0K A; 2KC2 A; 1WGD A; 1KLG D; 2A4Z A; 3ZXV A; 1BML C; 1S3S G; 3DHH C; 2G1E A; 5G2N A; 3I5J C; 1NVI D; 1SJE D; 5E6N A; 5DPW A; 4X57 B; 2LVO A; 2LUM A; 2KTR B; 4M8M A; 2LVP A; 1C4C A; 3TUO A; 3ONS A; 3B08 A; 5D3I B; 3HVZ A; 1JWA D; 2WXR A; 4A3P A; 4EE2 A; 1WGH A; 3IG3 A; 1F2R I; 4ZOH C; 1QOB A; 4IWO A; 2KDF B; 3NVV A; 1RFK A; 1YMH E; 1ZKH A; 1AWD A; 4HRO A; 1MHX A; 3AU4 A; 1JRO A; 1HEZ E; 4MGZ E; 4YTP B; 1DGJ A; 1I4P A; 4F8C B; 2JZ3 B; 4HCN B; 4M00 A; 4B0M A; 1YX6 B; 5EE3 A; 2PMV A; 2XBB C; 1ZE3 D; 3AB5 A; 3VR8 B; 4ARI A; 5C2T B; 4RGM A; 1SBB B; 2MW5 A; 2IO3 B; 4BKG A; 4M0W B; 3DQV A; 2DX5 B; 3ZJU A; 1AW7 A; 1EO6 A; 2LWP A; 3RCZ A; 1IBX A; 1ZXH A; 3IHP C; 2K8C A; 2K25 A; 3UI3 A; 4BZA A; 4W9H A; 3AXC A; 2ON8 A; 1FNV A; 1I7H A; 5JHA A; 1F77 A; 4P6V F; 1WGY A; 2YEP B; 4P1B C; 1UWM A; 1F2R C; 1XLN A; 1F9J A; 3URY A; 4ZRI A; 1WYG A; 2BYV E; 4RNA A; 1TS3 A; 3P1M A; 1UD7 A; 3BVM A; 4MDK E; 2B3A A; 3S2A A; 1V1P A; 1Z2M A; 2YVC A; 3EGR A; 1VZ8 A; 3DHG C; 3KUC B; 3TEZ A; 3O65 B; 2KJR A; 3QX1 A; 1C78 A; 2QSD A; 2MHJ A; 4C7Z A; 1SB3 C; 1B9R A; 1FXT B; 1I4G A; 4KIK B; 1QT9 A; 3B2F A; 2JRH A; 1QZE A; 4RGT A; 3KH0 A; 3WAN A; 2BBC A; 1SXT A; 2BQQ A; 1QLB B; 2N9E B; 1ISN A; 3A9K A; 1ZGU B; 1WFY A; 4ARC A; 1WRD B; 2WQY B; 4GIV A; 1WR1 A; 1I4X A; 2OHF A; 4G3X B; 2VZK D; 4KDI C; 4ITK A; 2NBU A; 2WXM A; 3UF8 A; 4KKJ A; 1XLQ A; 4KV2 A; 2LGD A; 4YXD B; 1UBI A; 2MQJ A; 2M0X A; 1ENF A; 3HRD D; 3VDZ A; 2KTF A; 2KAJ A; 4FHJ A; 5J18 A; 2V9H A; 1TY2 A; 5I4D A; 2KAC A; 5D7G A; 3ZKJ C; 4K3C A; 4JLC A; 1QQR A; 1SIJ A; 1NI2 A; 1RWS A; 4A6Q A; 4FN2 A; 4NQK E; 3R66 C; 3AEE B; 4K3B A; 3WAL A; 4KKI A; 1VRA B; 3PPA A; 3KQ4 A; 3VFK A; 4KX6 B; 2FCM A; 2RDG A; 2WNM A; 3DVN V; 2OOB B; 1M94 A; 4WIP A; 1M4V A; 1C4A A; 3KLS X; 3ZUN A; 1OEY J; 3N1Y C; 4K7U A; 4WJP A; 3ZNI D; 1I35 A; 1WMH A; 2KFJ A; 3C0R B; 1YN5 A; 3FKY A; 1DYQ A; 1FXI A; 3EEC A; 1L4Z B; 2XK5 A; 1OEY A; 3RMK C; 1TTN A; 3VH3 B; 3BII D; 3BIN A; 1MG4 A; 3DWM A; 4C80 A; 4S0R A; 1NDD A; 5D6J B; 2KQ4 X; 4EZK A; 4UDU C; 4LDT B; 2O2V B; 2EMT A; 1KOT A; 2KK8 A; 4G11 A; 2WX0 A; 2KKC A; 3JSV A; 1KLV A; 1VD2 A; 4NAM A; 2ZCC A; 2CS4 A; 2AQ3 B; 3EHV A; 3AED B; 2V4L A; 4ZRJ A; 1DOY A; 2ZZP B; 1FNW A; 2MJE A; 2JSV X; 4KGR A; 4TQ0 A; 3PHW B; 3ZIM A; 4YTM B; 3NG0 A; 4NAW A; 3ZVV A; 2AWT A; 2V3S A; 3KW5 B; 1LM8 B; 4RM8 A; 5C3J B; 3C19 A; 1E8Y A; 2L0T A; 4W9I A; 2CJN A; 3JVZ X; 4FXC A; 5LXI B; 3UGB B; 3V61 A; 3I9V 1; 3M62 B; 4CHK A; 4NZL B; 1XLO A; 1KRH A; 4S17 A; 4A3O A; 5EDS A; 3A4S C; 5AZH A; 2GRI A; 1FFU A; 1LGR A; 3LB8 C; 1K51 A; 4IOI E; 5HFY A; 1L6U A; 3LYY A; 3W1S A; 3NUH B; 2JT4 B; 3CIR B; 1VZ7 A; 2JF5 A; 2WDR B; 3AEG B; 2MBQ A; 4FJZ A; 3MC0 B; 1L4D B; 1WX9 A; 1HXY D; 3KWL A; 1WJ4 A; 2FID A; 1SE3 A; 4EEW A; 1UZX B; 3ZNZ B; 5BYQ A; 2G9H D; 4DHZ B; 4AJW A; 3Q8E A; 1E7P B; 4MM3 A; 3PV1 A; 1MJD A; 2WXI A; 4DXA B; 1DOI A; 2BF8 B; 3L08 A; 1VCB A; 3NHE B; 5CX3 A; 2VZK B; 3DBL I; 3VTU A; 4BKS D; 1GUA B; 1SE9 A; 2R2O A; 2AX5 A; 3PRE A; 1P98 A; 2QCZ A; 3T3N A; 1JWM D; 1ZUD 2; 2J0M A; 2KFK B; 4PYZ A; 3A1Q B; 4EOY A; 1TGZ B; 2ICI A; 2Y5P A; 1KM7 A; 2BS2 B; 1MPE A; 3W2D A; 2LRW A; 1YOV B; 1HQR D; 1QIL A; 1XCQ L; 1V1P B; 1UGM A; 2CKH B; 3A9J B; 1UNS A; 1L7Y A; 4L2Y A; 1FM0 D; 2WU2 B; 3TMP B; 2KO3 A; 3TCA A; 1GG3 A; 1WJU A; 1I42 A; 4RH6 A; 1T6B X; 2KT7 A; 1I4Q A; 4NJ6 A; 1QF6 A; 3AE4 B; 1WXM A; 1RM6 C; 1D4B A; 1JW9 D; 5DCN A; 5JH5 C; 1FMA D; 3A9K B; 2FAZ A; 1E5W A; 4IM0 A; 3V62 A; 4DXG A; 3BYT B; 4HCP B; 3PRM B; 2WYQ A; 2WHI A; 5IOI A; 1NEN B; 4EUT A; 2IDY A; 5J17 A; 2YLM A; 3U52 E; 1XQQ A; 1WM3 A; 1WWT A; 3RNE C; 3NVW A; 4ZYN A; 4XDC A; 2JWU A; 2V0G A; 4XYC A; 3VQI A; 3AM9 A; 4MT5 A; 2HE7 A; 2RDH A; 1ACC A; 4C00 A; 2UYZ B; 2PJH A; 1T0S C; 3K9O B; 5E6P A; 3U2S C; 1NBF C; 1SE2 A; 4XE0 A; 1JWU D; 4IDI A; 5BYS A; 3KUZ A; 1EF5 A; 5DPT A; 1GB4 A; 4USA A; 2WXL A; 3R7Q A; 4PK1 A; 4P7I A; 3KUD B; 2ZPN A; 4A90 A; 3JW0 X; 4KGS A; 4LJP B; 3BK1 A; 1R4N I; 3L16 A; 2L8J A; 3APD A; 2SAK A; 1TT5 B; 1WMH B; 2LXC A; 4DBG A; 2MJ3 A; 3V6E B; 1F0Z A; 2WX1 A; 3BWU D; 2L83 A; 3PZD A; 2XK5 B; 1V6E A; 3W1S C; 3N1X C; 3W5U B; 3QCA A; 4OVV A; 5HI1 A; 5FR3 A; 2BB6 A; 4MAC A; 3RD2 A; 4KZC A; 3NZ3 A; 4US8 A; 2WXP A; 3H1U A; 5MPO A; 2LAS A; 2RGF A; 2Q5W D; 2KNB A; 1FEH A; 3PT2 B; 4WJN A; 4TKN A; 4JWS C; 2A5U A; 3DBL B; 2HDE A; 4BOS C; 2BKR B; 2JUO A; 1WF9 A; 4LNF A; 4JPS A; 2NBV B; 4NAW B; 4FJV B; 3Q8A A; 3NVZ A; 4YT0 B; 1T0R C; 4Q2J A; 1RRB A; 4CO7 A; 2CHX A; 2D3G A; 2LRU A; 2Z59 B; 2FCN A; 3W1Y A; 3EFC A; 3W9C B; 1WRI A; 2GBK A; 2WXQ A; 1ET6 A; 4HXD A; 4TMA B; 4E3C A; 4HVB A; 1FPY A; 3V60 A; 1C79 A; 4FHK A; 4A8X C; 4XDD A; 1EWC A; 4EZL A; 4LJO B; 1N5X A; 1SIF A; 4GDK A; 2BW2 A; 1KLU D; 2G4D B; 3MJW A; 2IPK D; 4RM9 A; 4IC7 B; 3BVG A; 1V2Y A; 4FAD A; 2WDV B; 2OJR A; 2ASQ A; 4W9J A; 4E71 A; 1YQ3 B; 1PDX A; 2MRP A; 4EKU A; 3P2B A; 2WWZ A; 5BYR A; 4N59 A; 3I63 C; 2RR9 A; 4YSY B; 2G3Q B; 2IGD A; 2E6X A; 5T8I A; 1GAQ B; 4ZHO A; 1D3Z A; 5BMH A; 2EMS A; 4NJ7 A; 2K22 A; 1RLF A; 1ROE A; 2INN E; 2FCQ A; 3L10 B; 3TBL D; 1D5Z C; 1G6J A; 1TYG B; 2M56 B; 1ZPS A; 1OQQ A; 4W9G A; 2WXG A; 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4C4V A; 2V1Y A; 2GLS A; 1N6Z A; 3NZU A; 4GB9 A; 3ZO5 B; 1ZDV A; 1PGA A; 2KC1 A; 1NYQ A; 1YQ4 B; 4JGH B; 1KH0 A; 4NQL B; 2NCN A; 2RD0 A; 2LJ5 A; 2DLB A; 4KZ0 A; 4ANU A; 2JXT A; 2JY6 A; 4RF1 A; 1STE A; 2LGY A; 2LZ6 A; 4N58 A; 3KWV A; 2BYT A; 1P7E A; 1V8C A; 3M3J A; 4HK2 A; 3GE8 C; 3WAM A; 3K9P B; 2HJ1 A; 3RZW C; 1FRR A; 5JZE B; 3UIO B; 3VH4 B; 4ZDV A; 2V3P A; 2KYW A; 4WQO B; 3WAO A; 3KYD D; 3LJ3 A; 3AE9 B; 4FA6 A; 3B2G A; 3TEW A; 2CR5 A; 4LNO A; 1WYW B; 1FCL A; 1WE7 A; 1YJI A; 2N1W A; 4MGI E; 4GDK B; 4DWF A; 2BGF A; 4GXB A; 1B1Z A; 4IUM B; 4JX1 C; 3SEB A; 5H92 C; 2D5G A; 4KDL B; 2O6V D; 3R7R A; 1AAR A; 3Q8B A; 3ZNH B; 1WIA A; 1R4M B; 3SFD B; 3FC4 A; 2BVC A; 4B95 A; 1PGB A; 3OWE B; 1J0G A; 1T3Q A; 4ZRP A; 1EU4 A; 3H6N A; 4GLS C; 1S1Q B; 4BBN C; 1GC6 A; 3AE7 B; 3ZXR A; 4J6I A; 2PKO A; 2EEL A; 2LUE A; 3HUI A; 2J7Q B; 4J3O D; 4K1R B; 2CU3 A; 3VAW A; 1N62 A; 1MG8 A; 3NY5 A; 4REZ A; 4DHJ B; 5CHV C; 2WP9 B; 2BPS A; 4FJY A; 2N7D A; 3L13 A; 2KD0 A; 2MBB B; 1XD3 B; 2GOW A; 2LJI A; 3PSE B; 1K53 A; 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