The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
75
|
structure length |
75
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Chain Sequence |
CYVDTNNDGAYEGDELSGTMEYKLILNGKTLKGETTTCAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| publication title |
Two-point anchoring of a lanthanide-binding peptide to a target protein enhances the paramagnetic anisotropic effect
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
|
| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
14
|
| structure length |
75
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| sequence length |
75
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IGC A; 2JU6 X; 2IGD A; 2GB1 A; 4OZC A; 2QSD A; 3V3X A; 2RPV A; 1YMH E; 2RMM A; 2ZW0 A; 2KDM A; 2I2Y A; 3FIL B; 2KQ4 X; 2PW9 A; 4WH4 A; 2LHD A; 1K50 A; 2GI9 A; 2PLP A; 2JWU A; 1FCC C; 2N9K A; 2ON8 A; 4KGR A; 1UWX A; 2KWD A; 1Q10 A; 1IGD A; 4GLS C; 4MAC A; 2QMT A; 1YNT E; 2J53 A; 4IOI E; 1FCL A; 1JML A; 2EEL A; 1K53 A; 2N7J A; 4IKG A; 1IBX B; 1XF5 L; 1MHX A; 2JXT A; 2N9L A; 4HJG E; 3GB1 A; 1KH0 A; 5HHD G; 1EM7 A; 2KN4 A; 1GB4 A; 4OZA A; 1F2R C; 1K52 A; 1D4B A; 1HEZ E; 5HI1 A; 5BMI A; 3MP9 A; 2JSV X; 5JXV A; 2NMQ A; 1FD6 A; 1F2R I; 1QKZ A; 5BMH A; 1PGA A; 1MHH E; 1HZ5 A; 2K0P A; 2OED A; 2J52 A; 2IGG A; 3UI3 A; 2IGH A; 2LHE A; 2KAC A; 1ZXH A; 2LUM A; 2JZP A; 1HZ6 A; 4KGT A; 4D2K A; 1P7E A; 1PGX A; 1XCT L; 2PTL A; 1K51 A; 2ONQ A; 1MVK A; 1P7F A; 1C9F A; 1PGB A; 1GB1 A; 1IBX A; 1MI0 A; 5HFY A; 1MPE A; 1XCQ L; 4OZB A; 2ZW1 A; 4KGS A; 4HKZ E; 2I38 A; 2LGI A; 5BMG A; 5HG2 A; 3FIL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XBB C; 2WXH A; 2NS5 A; 4JWS C; 4MDK E; 4HDO A; 2GB1 A; 4P1C C; 2WXK A; 4BKS D; 4M8N A; 1S1Q B; 3GE8 C; 3NVZ A; 2LHD A; 4FJY A; 2Y3A A; 2DX5 B; 2CHZ A; 2C9W B; 1KRH A; 3LXF A; 3PRP B; 4WWP A; 2KWV B; 3Q3J A; 1F77 A; 4GU2 A; 5JHA A; 1J8C A; 1WFY A; 1V2Y A; 3W1S C; 4C00 A; 1V1P B; 2IJ0 A; 1TS4 A; 1M94 A; 3VR9 B; 1SB3 C; 5IO9 A; 1V9J A; 1JCK B; 3PRZ A; 5EE0 A; 1R4N I; 3BII D; 2GLS A; 2L76 A; 2Z59 B; 3PTF C; 4WWO A; 1GC7 A; 3ZDM C; 1UGJ A; 5BYS A; 2WDR B; 3P1M A; 3RNF C; 5HI1 A; 4YT0 B; 2K22 A; 3UGB B; 3DOW A; 4ZRP A; 2LJ5 A; 5JHB A; 3U8Z A; 1HZ5 A; 2WDV B; 3WIM A; 5CHV C; 3TUO A; 2YEP F; 1NVI D; 3VHT C; 3ZRC A; 2DZI A; 4KIK A; 1VZ6 A; 2KDE B; 5JH5 C; 4WJO A; 3Q8C A; 5BYR A; 1MPE A; 1PFD A; 2FAZ A; 4XE0 A; 2CS4 A; 2JRH A; 3DBL B; 2WDT B; 3P4R B; 2KZR A; 5HG2 A; 1VZ7 A; 1C4C A; 2J0J A; 3WAN A; 1C4P A; 1UBQ A; 2KDF B; 2KC1 A; 3AE6 B; 1TJE A; 2ZJD A; 3U30 A; 1PDX A; 2Z0E B; 3VFK A; 3FKY A; 1C76 A; 2G4D B; 4NZL B; 3ZUN A; 4A6Q A; 2JWU A; 1OTR B; 2MP2 A; 1FFV A; 1B1Z A; 2N9K A; 3BVG A; 3AEC B; 3BYT B; 2N1V A; 4II2 B; 2ON8 A; 2IO3 B; 1RWS A; 3L10 B; 1CK1 A; 4KX6 B; 2DBY A; 1T6B X; 2K3U A; 1TS2 A; 1K8R B; 2BB6 A; 2J53 A; 4LTU A; 1RFK A; 3BK1 A; 3K9O B; 1I42 A; 4TSS A; 1D3Z A; 3NRZ A; 2WQY B; 3I9V 1; 4R3D A; 2V3S A; 5HHD G; 1KOT A; 3AEB B; 3U52 E; 1GB4 A; 2JXX A; 4XYC A; 4AS1 A; 3LJ3 A; 3L16 A; 1JWS D; 5AEK B; 1KLV A; 4GDL B; 2IND C; 1P1A A; 2G45 B; 2AQ2 B; 1MHH E; 3BWU D; 4BKT A; 2C7H A; 2V3P A; 3A4R A; 1UUP A; 2IGH A; 3IAM 1; 2K8B A; 2D11 A; 2KWC A; 2WXG A; 2FCQ A; 1DOX A; 2JYT A; 4YTM B; 2WXI A; 3U2S C; 4OZB A; 3UF8 A; 2BS3 B; 1E7V A; 4KGS A; 4E71 A; 2AWT A; 2KAN A; 2O6V B; 3ZJU A; 5TSS A; 5DPS A; 5CHW A; 2IO0 B; 2XEW A; 1RRB A; 2WX1 A; 3M63 B; 2YEP B; 3DBR B; 2W9N A; 2W82 A; 1ET9 A; 2KFK B; 5DCN A; 4KSK C; 4BOS C; 3CWI A; 5IKC M; 3HK0 A; 5HKH A; 2KQ4 X; 3B1L X; 5J17 A; 2I1K A; 2L8J A; 1SGH A; 1IYF A; 4LJP B; 3RMK C; 3ETR A; 4BKS A; 4C4V A; 2WXJ A; 2ZVO A; 1UH6 A; 2SEB D; 2KC2 A; 1HTO A; 5FR6 A; 2K25 A; 1I4G A; 5T8I A; 2MBO A; 1JML A; 1WXM A; 2D3C A; 2K6Q A; 5L83 A; 3ENE A; 4OVU A; 4W9L A; 1TKY A; 4I6L B; 5IN7 A; 4BOZ B; 1E8Y A; 2CJO A; 1RYJ A; 3L0W B; 1ESF A; 2KTR A; 3VH3 B; 1F1H A; 3PS6 A; 1P98 A; 4F1S A; 3JSV B; 4W9K A; 1UGM A; 3ML9 A; 3QWZ B; 1Z2M A; 2CKH B; 2KJR A; 2RDB C; 4WJN A; 1RLF A; 2MW5 A; 3EUB 2; 3UI3 A; 2LHE A; 4GSW A; 2OJR A; 1MJD A; 2FUG 1; 2X38 A; 1P0R A; 1J19 A; 4KKI A; 1OQY A; 4LNN A; 1T0Y A; 3BVZ A; 4B0M A; 3VUY A; 5E6P A; 5HFY A; 2E3T A; 3KUC B; 4G0N B; 1B9R A; 4FLH A; 3URY A; 1WXQ A; 2IO2 B; 1YJJ A; 1ISN A; 3DBR I; 3QX1 A; 4LNO A; 4DXG A; 5CTR C; 2LGI A; 1UNS A; 4XZ4 A; 2IZV B; 5H8Y E; 4MSM B; 1ZW7 A; 1JRU A; 2HTM E; 3JYU A; 3M62 B; 3ZRF A; 4EE2 A; 1A5R A; 4I6P A; 2RMM A; 4C7Y A; 2ZW0 A; 3ECI A; 3Q3N C; 4DBG A; 3QK0 A; 1P3Q U; 4NY0 A; 2PLP A; 1H4R A; 1LO5 D; 1WZ0 A; 2L0F A; 3UQB A; 1WF9 A; 2DYO A; 4IUM B; 3VUX A; 2X8X X; 2JVC A; 1BXT A; 4YSY B; 4LLG M; 2BYT A; 3LB8 C; 3QCA A; 4IDI A; 4ZRJ A; 4WQO B; 4ZRQ A; 3RNC C; 2JUO A; 5EE1 A; 1KH0 A; 1V49 A; 2L32 A; 4OHJ A; 2RDG A; 2BB5 A; 2MH7 A; 4M0W A; 5J2R A; 4RM9 A; 3DVN U; 1OQR A; 4YSZ B; 3KLS X; 1UBI A; 2NMQ A; 4TQ0 A; 5I4D A; 3WAO A; 4DHZ E; 5IOI A; 1F2R I; 1CMX B; 2MRP A; 1LFD A; 3KVF B; 3GZN B; 3KH0 A; 4AP4 C; 1WRI A; 2WLB A; 2LZ6 A; 5AZF A; 2M4N A; 2QDF A; 3WAP A; 2V4L A; 4D2K A; 1QLB B; 2LGS A; 1MVK A; 1P7F A; 3AEE B; 1TZO A; 3KYC D; 1E6E B; 3MFG A; 1GB1 A; 4ZYS A; 5FKA C; 4DXA B; 4B9K A; 5IP4 D; 2DWQ A; 4FAD A; 2WXF A; 3VTV A; 4TQ1 A; 1WH3 A; 2D5G A; 3DWG C; 3AH7 A; 2JT4 B; 2D07 B; 3RT3 B; 2GMI C; 2KK8 A; 2LFI A; 4ZYN A; 1KM7 A; 2PKO A; 4MM3 A; 3QJZ A; 3N1Z C; 2BF8 B; 2HTH A; 3PRE A; 3VDZ A; 1TBE A; 2LXC A; 2DHZ A; 2GI9 A; 1D5M C; 1KFY B; 4W9H A; 2WXN A; 3Q14 C; 4TV3 A; 3EEC A; 2MJE A; 4OW0 A; 4FJZ A; 2K8C A; 2FCN A; 4N59 A; 1N5X A; 4FHJ A; 4EEW A; 4NAW A; 1FCL A; 1BT0 A; 2KMM A; 1RFA A; 4JQW C; 5D94 A; 1YOV B; 3PRM B; 3ZXV A; 2BS2 B; 1ZDX A; 3SFD B; 2ICI A; 2KN5 A; 5G5H A; 2A5U A; 5BYQ A; 2ZZP B; 4A90 A; 1F2R C; 1GC6 A; 2Y5B B; 3DHH C; 3I5J C; 3MP9 A; 5JXV A; 3GZN I; 2L00 B; 2VH1 A; 2YLM A; 2WXM A; 3AUL A; 3A4S C; 1L0Y B; 3BVM A; 1T5X D; 1E90 A; 1WGK A; 3P42 A; 4W9E A; 4X57 B; 1ENF A; 1YJI A; 2MBE A; 2Y5P A; 3VTU A; 1P9D U; 2QC8 A; 3RI7 C; 3MHS D; 2CR5 A; 2NPT A; 3PVL A; 3ZIM A; 2KMA A; 4CO7 A; 1R4N B; 3AE7 B; 4C56 C; 4BVU C; 1PYW D; 4HK2 A; 2WGS A; 4US9 A; 1V8C A; 2V0G A; 4E74 A; 4LJO B; 2M56 B; 1E9M A; 4K7S A; 4QAY A; 4KIK B; 1JWB D; 3TL5 A; 1C1Y B; 4DHJ B; 1G6J A; 2MLB A; 1IGC A; 4REZ A; 4N6E B; 5KHO A; 1EO6 A; 3Q3F A; 5C23 A; 3UQA A; 3WCQ A; 2QSD A; 2C7M B; 1L0X B; 3D32 A; 4PS7 A; 1V1O A; 4NPN A; 1XLN A; 2WU2 B; 3VUW A; 3U7Z A; 4IM2 A; 4GN1 A; 1WM3 A; 5GMV A; 1WMH B; 3RUI B; 1E8X A; 1YN5 A; 2IY1 B; 3ZNH B; 1JWA D; 3NG0 A; 1VDV A; 1LGR A; 2ZEQ A; 3C8Y A; 1MFW A; 1FEH A; 2BWF A; 4BFR A; 2QCZ A; 1WI0 A; 3B08 A; 2GBM A; 2MP2 B; 2ZCC A; 2V3N A; 2JY6 A; 1R4M I; 4YTP B; 4EKU A; 1WSP A; 4WAA A; 3DVN V; 4DXF A; 1E8Z A; 1J7B A; 3HHM A; 2Y5C A; 4ARC A; 4A3P A; 1TGZ B; 3T9L A; 2KN4 A; 2MHJ A; 2JX5 A; 3AEF B; 2HD5 B; 2OJW A; 1WYG A; 2JF5 A; 1GOZ A; 4KDL B; 2IDY A; 5BMI A; 2EKI A; 1TY0 A; 2FIF A; 3V6C B; 2Q5W D; 2KVZ A; 3APD A; 1LQB A; 3HIZ A; 2BWE S; 4G11 A; 4KKJ A; 1XQQ A; 1F9J A; 1DOI A; 2YVC A; 1ZXH A; 5EE3 A; 3L08 A; 4DHZ B; 4XX5 A; 3RPF C; 2NBW B; 3WAM A; 3X23 A; 4K7U A; 2WNM A; 1K51 A; 2WDQ B; 1E7P B; 2D3A A; 5CX3 A; 2BVC A; 1MG8 A; 3DHG C; 3HVZ A; 1FRD A; 1I4H A; 3RNG C; 3QAQ A; 4DDI D; 2KAJ A; 1R7S A; 1SBB B; 2KDB A; 2N9X A; 2QIE B; 2KJH B; 1TIF A; 4K3C A; 2JZ3 B; 3AE5 B; 1KLU D; 1J7A A; 3RNB C; 4OZC A; 1NI3 A; 2FUH B; 3L13 A; 1C79 A; 1YMH E; 2WXR A; 1V97 A; 1FXI A; 2D2Q A; 1FM0 D; 1NEN B; 1E10 A; 4MEL A; 1J7C A; 1QOB A; 4A8X C; 1WWT A; 2DAF A; 5D6J B; 3DQV A; 1SE9 A; 1OEY J; 1UWX A; 1XLO A; 1WMH A; 4GLS C; 1QZE A; 4JX1 C; 2VZK B; 2KTF A; 2AQ3 B; 1WXS A; 1KJT A; 2QEJ C; 3ZNZ B; 3CST A; 1V5O A; 3ZO5 B; 3AI5 A; 1L6U A; 4C4V B; 3L54 A; 3CMM B; 2JXT A; 3UIN B; 3VTW A; 2FNJ B; 1WXV A; 5C2T B; 3ZNG C; 3SR6 A; 4URK A; 2HJ8 A; 3MC9 A; 4S17 A; 1ZDV A; 3A9J A; 3NJT A; 3NS8 A; 3AXC A; 2K39 A; 1D5X C; 4ICU A; 3PZD A; 1FRR A; 1QQR A; 1L0V B; 2KX3 A; 3Q8A A; 1RAX A; 2EMT A; 2KTR B; 3N1X C; 1FNU A; 1OQQ A; 3DPD A; 1HXY D; 3PGE A; 1EUV B; 1WRD B; 2D10 A; 3QQ8 B; 1VLB A; 1XD3 B; 3APF A; 3NZS A; 5AZG A; 1KLG D; 3L4P A; 3DHI C; 4HDQ A; 1UD7 A; 4PS3 A; 2GOW A; 2XK5 A; 1PGB A; 2MSE D; 2NCN A; 4XC2 A; 2DZM A; 2PPH A; 4LDT D; 1M4V A; 1XCQ L; 4FJV B; 1WR1 A; 3PPA A; 4XDC A; 4IM3 A; 4LK0 M; 3EC8 A; 1CJE A; 2G9H D; 3AU4 A; 1N6Z A; 2PJH A; 2FE8 A; 3IT6 B; 4MGZ E; 2L7R A; 4JL9 A; 4L1B A; 2H88 B; 1UEL A; 1JRO A; 2ZCB A; 2W55 A; 2KT7 A; 1JWM D; 1SE4 A; 4GMV A; 5AZH A; 3C0R B; 4MAC A; 1N63 A; 1Q5W B; 1ZOY B; 2KOX A; 4YSX B; 3IG3 A; 1QOG A; 2K8H A; 2ZPN A; 4J6I A; 2EEL A; 3AM9 A; 1K53 A; 2K1F A; 3R7Q A; 2D3G A; 4H2A A; 2L0T A; 3NZU A; 4HPM B; 1VD2 A; 3FAH A; 3GB1 A; 1NDD A; 3P4P B; 3TBL D; 4HJK A; 3SFE B; 3VRA B; 4ACF A; 3S2A A; 4AJY B; 3VR8 B; 2JRI B; 4MH0 E; 1EF1 A; 4JLC A; 4W9I A; 2JSV X; 3TMP B; 4RGN A; 3SD5 A; 1KTK A; 3AMZ A; 4M0W B; 1D5Z C; 2MBB B; 2OOB B; 4IWO A; 4HWI B; 3ALB A; 4RGT A; 3ZXR A; 1HZ6 A; 1SEB D; 3ZJT A; 2MJD A; 3A1Q A; 2KWU B; 3VXW A; 3CIR B; 2DAJ A; 3I3T B; 3AE4 B; 1SJE D; 4GDK A; 1WE6 A; 2LVO A; 3V05 A; 1WJ6 A; 2AEH A; 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4NNJ B; 2KLG A; 5DPW A; 2BW2 A; 3W2D A; 4BZA A; 2CU1 A; 4B0E A; 3JVZ X; 2KDM A; 3AE3 B; 2J0M A; 4WH4 A; 1U4A A; 3BYY B; 1OEY A; 2LXA A; 1AYF A; 1EF5 A; 3E9S A; 1FCC C; 2WXP A; 4MGI E; 3RNA C; 3BY4 B; 4BBN C; 5E6J A; 2W3S A; 2N9E B; 4EFO A; 3TIX A; 4IWP A; 3NHE B; 4ZHP A; 3N1Y C; 2N7J A; 4L2Y A; 4DWF A; 3DBH I; 4HVB A; 1VJK A; 3A9K A; 1UZX B; 2REX A; 1XF5 L; 1MHX A; 1ET6 A; 4YWG G; 4LNI A; 3P4S B; 2J4X A; 5H92 C; 2FCM A; 3DBS A; 1E8W A; 1ZP0 B; 3TEY A; 3ML8 A; 3AU5 A; 3B2F A; 2LRU A; 1GJZ A; 1FXA A; 3W1Y A; 4FHK A; 4AOF A; 2HDE A; 3V6E B; 1TKE A; 4UDU C; 1IPG A; 5LLI A; 1R4M B; 1QT9 A; 3V60 A; 3NVY A; 2LI5 A; 2PTL A; 3PV1 A; 5D3I B; 2GRI A; 1C9F A; 1E5W A; 3BIN A; 3AE1 B; 3TJP A; 2ZVN A; 2IO1 B; 3PZ8 A; 1IUE A; 1C77 A; 4F8C B; 2LUE A; 3EA6 A; 3ZW3 A; 5IAA C; 3Q3M C; 2KQS A; 4ZHO A; 2M8S A; 3UIO B; 3V3X A; 5CHF A; 4KZC A; 3N9Y C; 4EOY A; 2I2Y A; 1I4Q A; 4NJ6 A; 4FA6 A; 4BAX A; 4FBJ B; 4EZK A; 3KWL A; 2J0K A; 2B76 B; 5LXI B; 3V61 A; 1ZGU B; 3HM3 A; 4ASW C; 1ZKH A; 3VQI A; 2BKR B; 3KQ4 A; 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