The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
56
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structure length |
52
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Chain Sequence |
DTYKLILNGKTLKGETTTEAVDATAEVFQYADNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Comparison of design strategies for alpha-helix backbone modification in a protein tertiary fold.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| molecule tags |
De novo protein
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| total genus |
11
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| structure length |
52
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F2R I; 2PW9 A; 1K52 A; 1PGB A; 2J53 A; 4KGT A; 5BMG A; 2KQ4 X; 1D4B A; 1FCL A; 1IGD A; 4WH4 A; 1K53 A; 2JU6 X; 5HG2 A; 5HFY A; 1HZ6 A; 2OED A; 1FD6 A; 2JZP A; 2JXT A; 2EEL A; 1K51 A; 2GI9 A; 2KDM A; 3UI3 A; 4GLS C; 2JSV X; 2ONQ A; 5BMI A; 2KWD A; 2PTL A; 5HHD G; 2RPV A; 1GB4 A; 4KGR A; 3V3X A; 2N9L A; 1MVK A; 3FIL A; 1K50 A; 1IBX A; 1XCT L; 1P7E A; 1IGC A; 2JWU A; 5JXV A; 1F2R C; 2LHD A; 2PLP A; 4MAC A; 1HEZ E; 4OZB A; 2QSD A; 2ZW1 A; 2LHE A; 1PGX A; 2LUM A; 2ON8 A; 4OZC A; 2LGI A; 1XCQ L; 1C9F A; 1ZXH A; 1JML A; 4OZA A; 1QKZ A; 1PGA A; 4IOI E; 2KN4 A; 2K0P A; 3MP9 A; 4D2K A; 4HJG E; 2GB1 A; 1Q10 A; 1MI0 A; 2QMT A; 2N7J A; 1MPE A; 2N9K A; 2NMQ A; 1GB1 A; 2I38 A; 2IGG A; 5HI1 A; 1KH0 A; 4HKZ E; 1HZ5 A; 1MHX A; 1YNT E; 1UWX A; 3GB1 A; 4IKG A; 1EM7 A; 2IGH A; 2IGD A; 2RMM A; 2ZW0 A; 1FCC C; 3FIL B; 1XF5 L; 1IBX B; 1P7F A; 2J52 A; 5BMH A; 2I2Y A; 1YMH E; 4KGS A; 2KAC A; 1MHH E; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IZV B; 2L76 A; 2ZCC A; 1WFY A; 2W9N A; 4KGT A; 2V4I B; 4J3O D; 2FE8 A; 2JU6 X; 1FXT B; 3HM3 A; 2FID A; 2B3A A; 4JIO U; 3TEW A; 2L00 B; 1V2Y A; 2FCM A; 2ZJD A; 1FO4 A; 1GG3 A; 2KLG A; 4C00 A; 2O6V B; 4BKT A; 3VUX A; 2VRR B; 4ICV A; 3T9L A; 1MVK A; 1VJK A; 3V6E B; 1VR9 A; 4P16 A; 4O1N A; 2AEH A; 3UIO B; 1P98 A; 3IHP C; 2R2O A; 2VH1 A; 1F2R C; 1N60 A; 4YT0 B; 2YEP F; 4MEL A; 1EF1 A; 4WWM A; 3DBL I; 1H4R A; 3AH7 A; 1AW7 A; 4BZA A; 4KZ0 A; 2N1V A; 4IC7 B; 1OGW A; 1CZP A; 1VLB A; 1SB3 C; 4AS1 A; 1V81 A; 4HJG E; 1S3S G; 4LLG M; 5IKC M; 3EA6 A; 4M02 A; 4B95 A; 3AUL A; 4ARC A; 4EUT A; 1TY0 A; 1EO6 A; 1TZ1 A; 2NMQ A; 4K7U A; 3L0W B; 1UNS A; 1YQ3 B; 3NVV A; 3SFE B; 3ZNH B; 4IKG A; 3A9K A; 2IGH A; 5AUK A; 3KYD D; 2H88 B; 1OFF A; 3VR9 B; 5FK9 C; 2V4L A; 1RLF A; 1I4H A; 4MSQ B; 2ZVO A; 3PZ8 A; 4C7Y A; 2K39 A; 3BK1 A; 1YD8 U; 2LUE A; 4BAX A; 1N6Z A; 4N6E B; 4XDC A; 4F7Z A; 3L54 A; 1D5Z C; 4WH4 A; 2BWF A; 1FRD A; 1PFD A; 4ASW C; 2MHJ A; 5CHF A; 2WNM A; 4HKQ A; 2FIF A; 2XEW A; 5BO4 B; 1VZ8 A; 1FRR A; 4X57 B; 3VHT C; 2M4N A; 2MBE A; 2WXO A; 2BYV E; 1WGY A; 3RZW C; 4LNN A; 3PLU A; 4LDT D; 1K50 A; 4EZK A; 1R7S A; 2KFJ A; 3BZD B; 4LNI A; 1L0X B; 3NVZ A; 4GOC A; 4B9K A; 1HEZ E; 2V3N A; 3APD A; 4XE0 A; 4GDK A; 3PRE A; 4W9K A; 1WF9 A; 4ANW A; 4BBN C; 3L17 A; 3J9C A; 3UF8 A; 1E8Y A; 1RFA A; 2BYF A; 3TUO A; 5JH5 C; 2WYQ A; 2KN4 A; 2RDG A; 4ZHP A; 1TS4 A; 4HXD A; 2N4F A; 1YJ1 A; 2I1K A; 1WXV A; 1FMA D; 3SR6 A; 2KN5 A; 3AM9 A; 1MPE A; 4WWO A; 4F1S A; 2CHW A; 2I38 A; 2NPT A; 1HTO A; 4ANX A; 2KFK B; 1HTQ A; 3PT2 B; 2C7N B; 3HUI A; 2ZW0 A; 1FCC C; 1L2N A; 1J8C A; 3VH4 B; 1A5R A; 1V6E A; 2WXH A; 1ESF A; 4FHJ A; 2RR9 A; 1GOZ A; 4BOZ B; 2N7D A; 1K52 A; 2INC C; 3DPD A; 5IOI A; 1FEH A; 4IM0 A; 1E5W A; 1PQS A; 4B0M A; 1IGD A; 3URY A; 1C1Y B; 3KH0 A; 2JXT A; 1WGH A; 1KM7 A; 4JPS A; 3IT4 B; 3MC9 A; 2D07 B; 2D3G A; 2G1E A; 4LJO B; 2BF8 B; 4BKS D; 2WDV B; 1WZ3 A; 2WU5 B; 3AEF B; 1YJJ A; 2JWZ A; 2BYE A; 4ITK A; 3LB8 C; 4KIK A; 2LZ6 A; 1P7E A; 4FJZ A; 1NYR A; 2GBM A; 3E9S A; 4OZB A; 2QSD A; 4EOY A; 4WIP A; 1BT0 A; 4KKI A; 2IO3 B; 2KK8 A; 4G50 A; 1B9R A; 3VH3 B; 4OZC A; 1WMH A; 2MP2 B; 4JWS C; 2J4X A; 1KLV A; 2QEJ C; 1V1P B; 1QKZ A; 2ZNV C; 5D7G A; 1GNU A; 4M0W A; 3A33 B; 1AN8 A; 1MI0 A; 2MSE D; 4I6P A; 4R3D A; 3ZTD A; 2WLB A; 4P1C C; 4XDD A; 2YLM A; 4PT5 A; 2BW2 A; 4L23 A; 3WCQ A; 5BYQ A; 2VZK B; 3FIL B; 3EGR A; 4PK1 A; 3W5U B; 4MGZ E; 1XLO A; 4GXB A; 2W3R A; 4DHZ E; 2JT4 B; 5CX3 A; 1NI3 A; 2CU1 A; 3JVZ X; 5DPS A; 5HKH A; 1J7C A; 2LJ5 A; 2B76 B; 4BBN F; 1UGJ A; 2GRI A; 1GJZ A; 4EE2 A; 4US9 A; 3ZRC A; 4HDQ A; 1YN3 A; 1ZDV A; 1DOY A; 1S1Q B; 3LXF A; 2JVC A; 1TZO A; 2GI9 A; 2YVC A; 3RPF C; 2KX3 A; 2WXK A; 3M95 A; 1TGZ B; 4GLS C; 3SU8 X; 5J2R A; 3L4P A; 1V49 A; 4FA6 A; 1WX7 A; 1T3Q A; 4P1B C; 2QC8 A; 1N5X A; 2KZR A; 2REX A; 3ML8 A; 4KGR A; 3OJ3 A; 1EF5 A; 1UWM A; 3NS1 A; 1ZPS A; 1D5M C; 2EKE C; 5D3D A; 3WAP A; 1Z2M A; 2KWC A; 3TMP B; 2FAZ A; 2LWP A; 5T8I A; 3ZXR A; 4II3 B; 4IM2 A; 3K9P B; 2J0M A; 1QOF A; 1D5X C; 1F1H A; 4W9C A; 1JWA D; 3A4R A; 4RF0 A; 3DBS A; 1UGM A; 2DLB A; 3V60 A; 3VUY A; 2HTM E; 1A70 A; 3OG5 A; 4W9J A; 3NHE B; 2M56 B; 2LRU A; 1SSN A; 4NNJ B; 2WHI A; 3Q8E A; 4S0R A; 1ZE3 D; 3MP9 A; 2M8S A; 4IM3 A; 4XWW A; 2WU2 B; 1WE7 A; 1Z5S B; 2N7J A; 1WGD A; 3PS6 A; 2BB5 A; 2LGS A; 4HPL B; 4A8X C; 4I6L B; 2J7Q B; 4ZYS A; 1M94 A; 1HZ5 A; 3MFG A; 3T8M A; 3TSS A; 2ZEQ A; 3ZDT A; 4ZRQ A; 4FJV B; 3OWE B; 5EE3 A; 1VRA B; 4NPN A; 2PJH A; 2IYD B; 1WM3 A; 4IDI A; 4REZ A; 3GE8 C; 4KKJ A; 2BS4 B; 2PE9 A; 4ZRK A; 3JYU A; 2KAC A; 2RGF A; 4OVZ A; 2EMT A; 2XNA C; 3CIR B; 5GMV A; 1YQ4 B; 5JHB A; 4BKG A; 5LNK 1; 1B1Z A; 3GZN I; 2MA9 B; 3L16 A; 1XQQ A; 1SIJ A; 1FCL A; 3R8B A; 5HFY A; 5JHA A; 1WIA A; 4LNO A; 1P3Q U; 1FD6 A; 1C4C A; 2JZP A; 1P1A A; 2INN E; 4DXA B; 2LGD A; 4XX5 A; 4C7Z A; 2FCN A; 2L0T A; 2KDI A; 3C19 A; 2KWV B; 3WAO A; 2CJO A; 1U4A A; 4C80 A; 4EKU A; 2LI5 A; 3R2I A; 3L08 A; 2CS4 A; 4FN2 A; 1ZUD 2; 1KLG D; 3TBL D; 2C9W B; 3B2F A; 2Z0E B; 1UBI A; 1LGR A; 3U30 A; 5H8Y E; 1WXM A; 3DHH C; 2K22 A; 2WGS A; 3ZLZ A; 2NVU I; 3HRD D; 2K6D B; 3N3K B; 2YEP B; 1J7B A; 1UH6 A; 1YIW A; 2KHW B; 3JSV A; 4E3C A; 1JML A; 3EC8 A; 1UZX B; 1I4R A; 3KWL A; 5G5H A; 3ZO5 B; 4HRO A; 2BS2 B; 2IO1 B; 4HLE A; 1WXQ A; 2BKR B; 3P42 A; 4D2K A; 3KUC B; 5AZF A; 3EHV A; 1Q10 A; 2M19 A; 4KDL B; 4DHJ D; 4XGA B; 1VDV A; 3H6N A; 1NYQ A; 1LM8 B; 2DAF A; 2IND C; 4NJ6 A; 2BTE A; 4URK A; 3AN1 A; 4I6N B; 4NAW B; 2N7E A; 1GUA B; 3NOB A; 4AWJ A; 2CJN A; 3DOW A; 5D6J B; 2CR5 A; 3Q8F A; 4CHK A; 1GAQ B; 1NDD A; 4RF1 A; 2L1A A; 1TS3 A; 4K7W A; 4A20 A; 4WJP A; 1F2R I; 4USA A; 2PW9 A; 2E6X A; 3KWV A; 2KO3 A; 2INP E; 4YTN B; 4AP4 C; 2I1J A; 3A9J B; 4YTM B; 2DYO A; 2KAN A; 2XK5 A; 3PRP B; 3EFC A; 3TEX A; 4G0N B; 2N0S B; 3QAQ A; 2BGF A; 3LDZ E; 5G2N A; 3FKY A; 1KFY B; 2FUG 1; 3M62 B; 2WDT B; 1ACC A; 5G55 A; 4YSY B; 2KNB A; 4EFO A; 2MLB A; 3E56 A; 5HHD G; 2M1M A; 3U4E G; 4XWT A; 4MH8 A; 3AEE B; 3VR8 B; 1T0Q C; 1TKG A; 2PVG C; 3VFK A; 2FCS A; 3ABV B; 4K81 A; 1P9D U; 4GDL A; 3BY4 B; 2KQ7 A; 1R4N B; 3I63 C; 3QHT A; 4WQM A; 3DBR I; 1QLB B; 4G3X B; 3DCG A; 5EE1 A; 3APC A; 5TSS A; 1Y56 A; 1JRU A; 3NUH B; 1JCK B; 1C9F A; 1VCB A; 3ONS A; 4JE3 B; 3ZRF A; 2K0P A; 3BYT B; 4FBJ B; 3P4R B; 1L6U A; 3GE3 C; 4W9D A; 1KTK A; 2GB1 A; 5CHV C; 2WWZ A; 1ZDX A; 3TIX A; 1N62 A; 2WXN A; 3AI5 A; 3RNE C; 1RWS A; 4HK2 A; 4W9I A; 3S2A A; 3WAN A; 3T3N A; 1PYW D; 2IGG A; 2WXF A; 3X0W A; 2QDF A; 3RT3 B; 3AEA B; 2WXJ A; 1JAL A; 3MTN B; 1OQR A; 2MJD A; 2I2Y A; 3ZJV A; 3PZD A; 1QZE A; 3UQB A; 2RDB C; 4CQN A; 4W9L A; 2L52 A; 3N30 A; 4K3B A; 2KVR A; 3Q8C A; 1FFU A; 2MBQ A; 4PYZ A; 2ZCB A; 4AJY B; 1PUT A; 1ZXI A; 1HXY D; 4KSK C; 1HZ6 A; 4XC2 A; 3FC4 A; 3B0A A; 4TKN A; 1I4X A; 2GBK A; 1UUP A; 3BK2 A; 5MPO A; 4B6W A; 3TEZ A; 1WZ0 A; 2JSV X; 3Q69 A; 4C4V A; 2PTL A; 4WWP A; 2RPV A; 2CHX A; 3VTV A; 3U7D A; 1EU3 A; 3ZJT A; 3WAL A; 2M17 A; 2L0F A; 4RFB A; 2ZPN A; 2Y5B B; 4YL8 A; 2PPH A; 2GOW A; 2DAJ A; 3IFW B; 2SEB D; 5EE9 A; 2JRI B; 4RM9 A; 1J7A A; 4FLH A; 2WDR B; 1XCQ L; 3GS2 A; 2WXI A; 2VH2 A; 3QCA A; 3KW5 B; 2K8H A; 4LCD E; 1E0Z A; 2KDF B; 3V05 A; 2N9K A; 1SE2 A; 2NCN A; 3B08 A; 4NZL B; 1E7P B; 3DBL B; 4HKZ E; 2AQ2 B; 3KVF B; 1JWM D; 2G3Q B; 1XLQ A; 5DPR A; 1OQY A; 4W9G A; 3ZTC A; 1Y8R C; 1V5T A; 1XF5 L; 5C23 A; 1TBE A; 2D3A A; 2N1W A; 1MFW A; 3A1Q A; 2KAJ A; 1E9M A; 2MJ3 A; 1NBF C; 5HG2 A; 3QIJ A; 2BWE S; 2W54 A; 3ZNZ B; 1WYW B; 2QIL A; 4HWI B; 5CTR C; 2ZPY A; 4MJS B; 4LTU A; 2C7H A; 3ML9 A; 2EMS A; 3B1L X; 2PVO D; 3IAS 1; 5J18 A; 1IYF A; 5BMI A; 1UD7 A; 5D94 A; 3VDZ A; 1MG4 A; 1SE3 A; 1Q5W B; 3DHI C; 3VQI A; 2AQ3 B; 3VRB B; 2ICI A; 3A9K B; 4TQ1 A; 1YN4 A; 4IWO A; 1Q0W B; 3AE4 B; 2K8C A; 2C7M B; 4MAC A; 3ECI A; 1T0S C; 5DPT A; 3I9V 1; 4LNF A; 1KF6 B; 4CO7 A; 3AEC B; 4OVU A; 1F52 A; 2GBJ A; 2KC1 A; 3U8Z A; 2CKH B; 3AB5 A; 4WJQ A; 5AZG A; 1L0V B; 2V3S A; 3DVN V; 1T6B X; 4HCP B; 3PVL A; 2DBY A; 3SEB A; 5HI1 A; 4AQ7 A; 5D2M B; 3TJP A; 1DOX A; 4JL9 A; 3ZXV A; 2AX5 A; 1E8W A; 4WAA A; 2KDE B; 1TY2 A; 2L3Z A; 3BIN A; 3N20 C; 5L83 A; 4GB9 A; 2DZM A; 1YJI A; 3TL5 A; 4YSX B; 3DWG C; 4MGI E; 1FNW A; 2LD9 A; 4BKS A; 1K8R B; 2WS3 B; 3DHG C; 4GDK B; 4L2Y A; 3HK0 A; 4S17 A; 3VTU A; 2DNF A; 1FPY A; 4NJ7 A; 4A3O A; 1ZP0 B; 1WXS A; 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3RUL A; 1F77 A; 3Q8A A; 1C77 A; 4M0W B; 2HE7 A; 2KWU B; 2GBN A; 2L05 A; 1I4Q A; 3HHM A; 4A55 A; 3UI3 A; 1ISN A; 3U52 E; 2QHO A; 1EWC A; 4LJP B; 5KHQ A; 1ENF A; 5KHO A; 3NY5 A; 2K3U A; 2KWD A; 1TTN A; 2O6V D; 2HTH A; 3P2B A; 4TQ0 A; 1TT5 B; 1IBX A; 1XCT L; 2AYO B; 5FR6 A; 2O2V A; 2MCN B; 2BQQ A; 1E10 A; 2JWU A; 2E3T A; 3PGE A; 2DZI A; 3AU4 A; 4YWG G; 4ZDV A; 3TEY A; 1OEY A; 2LHE A; 3DVG X; 2LGX A; 3AV8 A; 3PLV A; 3PTF C; 3CMM B; 4HEA 1; 2JZZ A; 4NY0 A; 3ZQ4 A; 2KYW A; 2Y5P A; 2WXM A; 1QOB A; 1ZOY B; 3ZDM C; 3BVM A; 2KJH B; 4IG7 B; 1DGJ A; 1WYG A; 3H1U A; 4ZHO A; 1C78 A; 3W1S A; 1UBQ A; 4JX1 C; 1STE A; 4E74 A; 2O6V A; 3RYT A; 4A6Q A; 3SFD B; 1Q1O A; 4E71 A; 2BYT A; 1KH0 A; 4KV2 A; 1MHX A; 3P63 A; 1L4D B; 3BII D; 4MT5 A; 4M00 A; 4TSS A; 3QK0 A; 4XZ4 A; 4MEM A; 1ET6 A; 3EFU A; 4RMA A; 2HDE A; 3K9O B; 4WAF A; 2NR2 A; 3DDC B; 4GMV A; 2LXA A; 1YN5 A; 1NI2 A; 2G45 B; 3KLS X; 4N59 A; 3ZJU A; 2TSS A; 1JWS D; 1XD3 B; 2G9H D; 3NZ3 A; 1JQ4 A; 4H2A A; 3V61 A; 3KUD B; 4OW0 A; 5E6N A; 4PS8 A; 3W9C B; 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