The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANASTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OED A; 2JU6 X; 4KGT A; 2I38 A; 4OZB A; 4OZA A; 2IGD A; 1YMH E; 1HZ5 A; 5HG2 A; 1EM7 A; 1HZ6 A; 2N9L A; 4MAC A; 2GI9 A; 1K53 A; 1MVK A; 2JZP A; 1MI0 A; 4IKG A; 1YNT E; 1UWX A; 4D2K A; 2LHE A; 5BMH A; 1MHX A; 2QSD A; 2JXT A; 1PGX A; 1MHH E; 3UI3 A; 4HJG E; 1F2R C; 2N7J A; 2LGI A; 2KWD A; 4KGR A; 5BMI A; 4GLS C; 1K52 A; 1FD6 A; 2J53 A; 3FIL A; 1IGC A; 1D4B A; 1QKZ A; 4WH4 A; 2ONQ A; 2IGG A; 1K50 A; 1IGD A; 1FCL A; 2PTL A; 5HI1 A; 1KH0 A; 2I2Y A; 1P7E A; 1FCC C; 2ZW0 A; 2N9K A; 2GB1 A; 1Q10 A; 2RPV A; 1GB1 A; 2QMT A; 1K51 A; 2EEL A; 5BMG A; 2KDM A; 3FIL B; 5HHD G; 4HKZ E; 1C9F A; 1XCT L; 4IOI E; 1PGB A; 2LUM A; 1XCQ L; 2ZW1 A; 2JWU A; 3V3X A; 1HEZ E; 3GB1 A; 1F2R I; 2J52 A; 1XF5 L; 2KAC A; 2K0P A; 5JXV A; 4KGS A; 2ON8 A; 1MPE A; 2NMQ A; 1IBX B; 1P7F A; 5HFY A; 1ZXH A; 2KN4 A; 3MP9 A; 1GB4 A; 1PGA A; 1IBX A; 4OZC A; 2JSV X; 2LHD A; 2PW9 A; 2KQ4 X; 2PLP A; 2RMM A; 1JML A; 2IGH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1J7C A; 1WJ4 A; 4DXG A; 2E6X A; 3QX1 A; 3NZ3 A; 1D5M C; 2ZEQ A; 2C7N B; 4MM3 B; 2N9L A; 3Q8C A; 1AAR A; 3ML9 A; 3FAH A; 4RFB A; 3SU8 X; 3APC A; 4MM3 A; 2WXG A; 4CO7 A; 3N1Y C; 4K7W A; 3PSE B; 1QZE A; 1LM8 B; 2PVO D; 4HCP B; 1OEY J; 1YN4 A; 2WX1 A; 3U7Z A; 3APF A; 4W9H A; 3HUI A; 2LEK A; 4LNN A; 3BK2 A; 1GUA B; 2DZK A; 3URY A; 1EF1 A; 3BVZ A; 4W9K A; 1IYF A; 2MBQ A; 3VTW A; 2KMA A; 2ACZ B; 3FIL A; 5DPT A; 2RDG A; 1P98 A; 1TS2 A; 1D6E C; 1QOB A; 5J17 A; 1ET6 A; 2PTL A; 4ZRJ A; 4DDI D; 1YOV B; 2JUO A; 2WLB A; 2N9K A; 4KZC A; 1ZGU B; 2BPS A; 3RYT A; 5BMG A; 1F77 A; 2ZCC A; 2LD9 A; 4IG7 B; 1C1Y B; 3Q69 A; 3SEB A; 2EKE C; 4WWO A; 4LNF A; 3N1Z C; 3T3N A; 1V1O A; 2LUM A; 4ANV A; 1TT5 B; 3WCQ A; 1NI2 A; 1TY0 A; 2WGS A; 5CHV C; 4ZRP A; 4DHZ E; 4K7U A; 4M0W B; 4PYZ A; 5AZF A; 1WR1 A; 2ON8 A; 1E8X A; 1C77 A; 1V1P B; 2K3U A; 3SHQ A; 3OJ4 B; 1GOZ A; 4M0W A; 1ZXH A; 1WGY A; 2LGY A; 2MH7 A; 4IDI A; 3IVF A; 3L16 A; 1PGA A; 1V1P A; 3X23 A; 4F1S A; 4YL8 A; 3PRM B; 4OVZ A; 2QIL A; 2Y5C A; 4USA A; 4ITK A; 3R7R A; 2RDH A; 2K6Q A; 2WU5 B; 4W9E A; 2NBU A; 3M62 B; 4GDK A; 1E6E B; 1SJE D; 3IAM 1; 1UBI A; 4E71 A; 2BBC A; 3MHZ A; 3BK1 A; 1UZX B; 2HTH A; 3UQA A; 4RGN A; 2NS5 A; 3VXW A; 2KWC A; 3FC4 A; 3TMP B; 5AEK B; 2QSD A; 3T9L A; 5JH5 C; 1E8Z A; 1FRD A; 4HPP A; 1P3Q U; 3WAN A; 5KHO A; 5HKH A; 3WIM A; 3HHM A; 3DPD A; 4DHJ D; 4GU2 A; 3BII D; 3PTF C; 2XBB C; 4GDL A; 4K81 A; 1WXS A; 3OAW A; 3CF6 E; 2WDT B; 3E9S A; 2D3B A; 4DHZ B; 1EWY C; 3ZNH B; 4ASW C; 1PFD A; 2VH1 A; 2R61 A; 4L23 A; 3AU5 A; 1G6J A; 3ZJV A; 2I2Y A; 4YT0 B; 4KV2 A; 3U4E G; 1I4X A; 2VZK B; 2ZCB A; 5G5H A; 3DBR I; 3ZTD A; 5G55 A; 1L7Y A; 1ZW7 A; 3AED B; 1YJI A; 3QA8 A; 1XXG A; 2H89 B; 3HM3 A; 1WM3 A; 3VH4 B; 1L2N A; 2PEA A; 3A9K B; 2OJW A; 1VRA B; 1Y8R C; 4ZHP A; 1R4N B; 2CJO A; 3TEX A; 4TQ1 A; 2L3Z A; 3IT6 B; 1E7V A; 3QAQ A; 1KM7 A; 5E6N A; 5L95 C; 5AZH A; 1VJK A; 1D5X C; 2N9X A; 2KTF A; 2WXN A; 4RMA A; 2V4I B; 2GMI C; 1TZ1 A; 4EUT A; 2JU6 X; 1ZOY B; 1RLF A; 2MBE A; 4OHJ A; 4P7I A; 1EM7 A; 3DHI C; 2PKO A; 3VQI A; 3ZXV A; 1UNS A; 3Q2A C; 1WYG A; 4CQN A; 3NJT A; 2IYD B; 2PMV A; 1WR6 E; 2PE6 B; 3PZ7 A; 3W5V B; 3AB5 A; 1TJE A; 3TEZ A; 3R3M A; 1MI0 A; 3ZNZ B; 1BML C; 1UWX A; 3ZO5 B; 4D2K A; 4BZA A; 4HK2 A; 2DYO A; 1C76 A; 3R8B A; 4WQO B; 1F52 A; 2CJN A; 2WXM A; 2DYM A; 4B9K A; 4A55 A; 1F0Z A; 1D5Z C; 4F7Z A; 4W9L A; 1I4R A; 4US8 A; 2PE9 A; 2N1W A; 1J7B A; 2J0K A; 5EE1 A; 3FKY A; 3RZW C; 2LVP A; 1V5O A; 2JQR B; 2GBM A; 3Q14 C; 2M56 B; 4WWP A; 2MLB A; 1ACC A; 1SIJ A; 1L6V A; 1YN5 A; 1WI0 A; 4WWN A; 1P9D U; 4IOI E; 2WXP A; 1UGJ A; 2JRH A; 2UU7 A; 5EE0 A; 3N9Y C; 1TS3 A; 2WXO A; 4GN1 A; 3A4S C; 1UD7 A; 3QWZ B; 3ZTC A; 2KVZ A; 2JY6 A; 1PYW D; 1WXA A; 1GAQ B; 4MSM B; 2LVQ A; 5FK9 C; 2G4D B; 2CS4 A; 4JWS C; 3CWI A; 2IY0 B; 1XD3 B; 1J0G A; 2PLP A; 3GOE A; 3I9V 1; 2QHO A; 1B1Z A; 4KKI A; 4KSK C; 1QF6 A; 3ZJT A; 3EGR A; 3W5U B; 1WX7 A; 2L8J A; 2KDB A; 4XDD A; 1V86 A; 3RD2 A; 2J0J A; 3GZN I; 4W9F A; 4J6I A; 2L7R A; 2R2O A; 4DWF A; 1KF6 B; 3P1M A; 5AUK A; 4M8M A; 3L17 A; 4RM8 A; 1KOT A; 2NPT B; 3L4P A; 2FCN A; 3V6C B; 3UIO B; 1RYJ A; 3MTN B; 3DBH B; 2NPT A; 2LRU A; 3GP7 A; 4GOC A; 3EUB 2; 4DXA B; 4LTU A; 1WZ0 A; 2K1F A; 3QIJ A; 4ZDV A; 4XDC A; 1Q1O A; 3AE3 B; 2VH2 A; 1Z5S B; 3NVW A; 4FJZ A; 4I6L B; 2CKH B; 4KSL C; 2FUH B; 2FE8 A; 2IGG A; 3P63 A; 1IGD A; 3S2A A; 1SEB D; 1FCC C; 2MBO A; 3B08 A; 2KJR A; 2RPV A; 2J7Q B; 3V62 A; 2MEK A; 2DHZ A; 4LDT D; 1CZP A; 1DYQ A; 1RWS A; 4FJY A; 2DX5 B; 3LJ3 A; 4BBN C; 1I4G A; 1I7H A; 1HEZ E; 2MJE A; 3BYY B; 3ZYY X; 3AXC A; 1VCB A; 2K0P A; 3Q3M C; 2BGF A; 2W54 A; 4II3 B; 1KJT A; 1FMA D; 3HVD A; 2KFK A; 2BS3 B; 1BT0 A; 2LZ6 A; 2LMC A; 5DPR A; 2XN9 C; 1V80 A; 4C4V B; 1NEK B; 3NVV A; 2BQQ A; 2NCN A; 1M4V A; 1PQS A; 2LGS A; 3O65 B; 2O6V B; 5D3D A; 4FBJ B; 3QC8 B; 3VAW A; 1EU4 A; 1FXI A; 4IW0 A; 2O6V A; 3HRD D; 2BS2 B; 3MJW A; 4NQK E; 1HZ6 A; 1NBF C; 4KX6 B; 2D3A A; 2FAZ A; 1V81 A; 2Z0D B; 3KWV A; 2WXQ A; 2WDV B; 2QEJ C; 4XX5 A; 1WJU A; 4PS7 A; 4AJW A; 1WGR A; 2L0T A; 1PGX A; 2V1Y A; 1YQ4 B; 2A4Z A; 2N7J A; 1KRH A; 2LGI A; 3DVG X; 3H1U A; 1GJZ A; 3BVM A; 3W2D A; 1K52 A; 4II2 B; 1VDV A; 4WJQ A; 4NZL B; 1DOX A; 1HE8 A; 3WAM A; 1EF5 A; 2BKF A; 3U2S C; 3VUX A; 2AYO B; 2O2V A; 4M02 A; 2GB1 A; 3DBL B; 1GB1 A; 1H8C A; 2DAF A; 2KDM A; 1R7S A; 2BB5 A; 2CR5 A; 2ZNV B; 5HHD G; 5D7G A; 3QHT A; 5FR3 A; 1C9F A; 1NYQ A; 1PGB A; 1WXQ A; 4BOS C; 1E7U A; 3RT3 B; 2W82 A; 1S1Q B; 4M00 A; 2NBV B; 3ZNG C; 2CU1 A; 3ZQ4 A; 4MGI E; 4NJC A; 3N20 C; 1LGR A; 2ZVN A; 1P0R A; 2BB6 A; 2KX3 A; 1ENF A; 3JSV B; 4EEW A; 2LI5 A; 1T6B X; 3CST A; 1YX5 B; 2D10 A; 3JSV A; 2OED A; 1JRU A; 2DBY A; 1WE7 A; 3DBS A; 1WM2 A; 1OFF A; 2G1E A; 1D3Z A; 1N5W A; 4IM3 A; 1NYR A; 2KXJ A; 3L08 A; 1CMX B; 3RNB C; 1FEH A; 1LFD A; 3RMK C; 1AW7 A; 1B9R A; 2EKI A; 2CHW A; 4IM2 A; 4JL9 A; 2SAK A; 2JZP A; 2PVG C; 3VTV A; 3KUZ A; 2EMS A; 2INN E; 4OVU A; 1EU3 A; 1UEL A; 2W9N A; 2KWU B; 2JXT A; 1OQR A; 4K7S A; 2KN5 A; 3A1Q B; 1WMH B; 4KVG B; 1V49 A; 1CJE A; 4AS1 A; 3A1Q A; 1WMH A; 4A6Q A; 3NRZ A; 1H4R A; 3I3T B; 1L0X B; 3IXS A; 5HI1 A; 3AI5 A; 4B0E A; 2MBH A; 3MFG A; 2JYE A; 5LXI B; 2LXA A; 2JPH A; 1A5R A; 3VUY A; 3LB8 C; 1VR9 A; 1N5X A; 2QMT A; 1OEY A; 4A9A A; 4H2A A; 1GG3 A; 1FRR A; 2G9H D; 1YX6 B; 3BYT B; 3FIL B; 3BZD B; 2EMT A; 3AMZ A; 4NY0 A; 3NVZ A; 1UGM A; 1DOY A; 4IM0 A; 3Q3J A; 1S3S G; 1XF5 L; 5DPS A; 3WAO A; 3P2B A; 1LXD A; 1R4M I; 3LXF A; 1WFY A; 1SXT A; 1VD2 A; 2PJH A; 2G3Q B; 1TY2 A; 3AEA B; 2MJD A; 1N62 A; 2IO1 B; 1QT9 A; 2LHD A; 3KQ4 A; 2B76 B; 3RUL A; 5LNK 1; 1WJ6 A; 2BKR B; 3T8M A; 4DQO C; 1HZ5 A; 5HG2 A; 1Q5W B; 1T0R C; 1WRI A; 2FUG 1; 2M19 A; 3X0W A; 3AEF B; 4ZYN A; 4P1C C; 5IOI A; 1WF9 A; 3I57 A; 3KYD D; 2KQ7 A; 3V61 A; 2ZPN A; 2AWT A; 3U30 A; 3KYC D; 1YIW A; 1XLO A; 1C79 A; 4GDK B; 2KDI A; 2N7E A; 2IBI B; 4MGZ E; 3O13 A; 3N30 A; 2M0A A; 3Q6B A; 4FLH A; 1P1A A; 2ZZP B; 4DBG A; 2RR9 A; 2AL3 A; 4LNI A; 1QKZ A; 2V3P A; 2D5G A; 5AZG A; 1V9J A; 2KJ6 A; 2L76 A; 4XC2 A; 3MC0 B; 3AE1 B; 4GDL B; 1XLQ A; 3ZIM A; 1AYF A; 3M95 A; 3RNG C; 1SIF A; 4CHK A; 1YQ3 B; 2MWS B; 2JRI B; 4B6W A; 3WAL A; 4E74 A; 2WQY B; 1L0V B; 1KFY B; 2J52 A; 3IT4 B; 1SE4 A; 2KAC A; 3DQV A; 1SE2 A; 4ICU A; 2AQ2 B; 2C5L C; 1P7F A; 3RZF A; 1ZUD 2; 4CYE A; 4JPS A; 3PZD A; 3ML8 A; 2QCZ A; 1WXV A; 2KZR A; 4NAW A; 2KQ4 X; 1WGD A; 4KDL B; 2BW2 A; 4HXD A; 4ANU A; 4BBN F; 4RM9 A; 1ZPS A; 1K8R B; 2LUE A; 4NPN A; 1ESF A; 3EA6 A; 2WHI A; 1AWD A; 4JLC A; 1RFA A; 3PGE A; 2MQJ A; 3QQ8 B; 3NS8 A; 4G3X B; 3AE2 B; 4P16 A; 3D32 A; 1RFK A; 4G0N B; 3PS6 A; 3AN1 A; 2HJ1 A; 1X1M A; 1JWA D; 3N1X C; 2LHE A; 5CTR C; 3SR6 A; 2HTM E; 2MW5 A; 1NDD A; 1HA5 A; 1UBQ A; 4N6E B; 4A90 A; 1T0S C; 4KGR A; 4ZOH C; 1BXT A; 2BTE A; 1I4Q A; 1OGW A; 2RD0 A; 3NS1 A; 2J0M A; 4BAX A; 1HXY D; 5BYS A; 1XQQ A; 5C1Z A; 3H8H A; 5EE3 A; 1JWM D; 5D3I B; 3PRZ A; 3ZVV A; 4XGA B; 1K51 A; 4FXC A; 1C78 A; 2CU3 A; 2LJ5 A; 5D94 A; 2JWZ A; 4ARI A; 2ZW1 A; 2JXX A; 2JWU A; 3SD5 A; 1N6Z A; 2J42 A; 2GLS A; 5JXV A; 1FNU A; 3AEE B; 3UF8 A; 3HVZ A; 2L05 A; 3CIR B; 1MPE A; 2Z8L A; 4NAM A; 3DCG A; 1JQ4 A; 1F1H A; 4WAF A; 1IBX B; 1TKY A; 4PS3 A; 1YD8 U; 1FNW A; 4RGT A; 4JWU C; 4ANW A; 1IBX A; 2YEP B; 2ZVO A; 4HDO A; 2HDE A; 4YTP B; 3H9D A; 3VVW B; 2QDF A; 1IUE A; 3TEW A; 1EUV B; 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4PYU A; 5E6O A; 4P6V F; 1KLG D; 4S0R A; 1ZP0 B; 1YN3 A; 3OG5 A; 2K9X A; 4DXF A; 1ZDX A; 3V60 A; 4GMV A; 4B95 A; 2VRR B; 1JRO A; 2KC1 A; 2D3G A; 1VZ7 A; 3PVL A; 1M94 A; 4TUU A; 5GXG B; 3TCA A; 3Q3O C; 4HEA 1; 2WP9 B; 1SE9 A; 2CHX A; 5D2M B; 4ZRK A; 3ZLZ A; 2WXH A; 2LRW A; 4A20 A; 5C2T B; 1EO6 A; 1E90 A; 1K50 A; 3U7D A; 1QLB B; 1Q10 A; 4TQ0 A; 2KFJ A; 2JYT A; 1HQR D; 1STE A; 4HPL B; 3K9P B; 2HE7 A; 5JZE B; 4ANX A; 2BYV E; 2LWP A; 4EKU A; 1UF0 A; 5IKC M; 2O2V B; 2PIA A; 3L54 A; 1NI3 A; 2NTT A; 4MGK E; 2O6V D; 3UGB B; 3W1S C; 2IDY A; 3ZXR A; 2NMQ A; 4NJ6 A; 4XE0 A; 2RDB C; 3R66 C; 5HFY A; 2TSS A; 4YTM B; 4HDQ A; 3VR9 B; 2ASQ A; 1CQV A; 2L0F A; 3L0W B; 1XLN A; 3WA0 A; 2ICI A; 1FIQ A; 2PW9 A; 2DLB A; 5G5G A; 4WQM A; 2MSE D; 2IGD A; 2KDE B; 2DZJ A; 3TUO A; 4GIV A; 4HJK A; 5D6J B; 3C0R B; 2RGF A; 3DDC B; 2NBW B; 2AEH A; 4C7Y A; 1RRB A; 4NJ7 A; 5DPW A; 4FHK A; 3NOB A; 3VUW A; 2KNB A; 4L1B A; 2IPK D; 3QAR A; 1R4N I; 2K8C A; 3OWE B; 2RPQ A; 1TTN A; 2WDR B; 3OJ3 A; 5IAA C; 2GBN A; 1E5W A; 2YVC A; 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