The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
93
|
structure length |
93
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Chain Sequence |
GSSGSSGYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPYSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKKSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Developmentally-regulated GTP-binding protein 1
|
| publication title |
Solution structures of the TGS domain of human developmentally-regulated GTP-binding protein 1
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
14
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| structure length |
93
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| sequence length |
93
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02824 | TGS | TGS domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4YT0 B; 1NEK B; 1QT9 A; 3P63 A; 3AV8 A; 1JRO A; 1RYJ A; 3NS1 A; 3W5V B; 4ZHO A; 1V97 A; 1IUE A; 2EKI A; 2BS2 B; 3DWG C; 1TKY A; 2HTM E; 3AE5 B; 1YJJ A; 4JWS C; 1VJK A; 1JWB D; 2N0S B; 3AE6 B; 1NI3 A; 2BT6 A; 1CJE A; 1OFF A; 1FXA A; 1N62 A; 4USA A; 1N60 A; 2M19 A; 3FC4 A; 1TKE A; 2QJL A; 1V8C A; 1DOI A; 2JQR B; 2JX5 A; 3B2G A; 3VRA B; 3AE9 B; 3VR9 B; 3KWL A; 1L5P A; 3CWI A; 1RWS A; 2L83 A; 1FFU A; 1ZUD 2; 2KAJ A; 3AMZ A; 5MPO A; 2KMM A; 1OQQ A; 3P4S B; 2WDR B; 4A9A A; 1NYQ A; 1XLO A; 2OHF A; 1J7C A; 1ROE A; 1TYG B; 1FRD A; 1ZXI A; 5EE0 A; 1QOA A; 1B9R A; 4KX6 B; 2K5P A; 2G1E A; 4JX1 C; 2BS4 B; 3ETR A; 1E9M A; 1WRI A; 1TKG A; 1OQR A; 4YTP B; 1FO4 A; 2H88 B; 2QIE B; 1AWD A; 3AE7 B; 3AEB B; 5G5G A; 3B9J A; 5G5H A; 1N5X A; 2BS3 B; 2Y5C A; 2CJO A; 5H92 C; 2L52 A; 3LXF A; 1XLN A; 1YJI A; 4N6E B; 4HRO A; 4C7Z A; 4YSZ B; 4US8 A; 1DOY A; 3AEC B; 3NVY A; 1QOG A; 3ZYY X; 1CZP A; 3W5U B; 2MJD A; 4ITK A; 1WWT A; 2W3S A; 3VRB B; 1VDV A; 4ZOH C; 1N61 A; 1JQ4 A; 2WU2 B; 5AUI A; 3RPF C; 1GPX A; 5C2T B; 1SB3 C; 3P1M A; 3AEE B; 2PIA A; 2W3R A; 1JW9 D; 2WDV B; 3BII D; 3P4Q B; 1N63 A; 1YQ4 B; 1KFY B; 3AH7 A; 1T3Q A; 1AYF A; 1SIJ A; 5EE1 A; 1WYG A; 2PVO D; 2W55 A; 3NRZ A; 4JWU C; 5GXG B; 4P6V F; 1RFK A; 3CIR B; 1L6V A; 5EE3 A; 2WLB A; 3AB5 A; 4C7Y A; 1SF0 A; 2K22 A; 2Q5W D; 5C3J B; 1N5W A; 1PUT A; 1GAQ B; 2AX5 A; 1F0Z A; 1J7A A; 1A70 A; 1JWA D; 1QLB B; 3DWM A; 3AED B; 3LB8 C; 1R7S A; 3B2F A; 1WXQ A; 3AEA B; 3P4P B; 2K9X A; 3FAH A; 1PDX A; 1FRR A; 3NVZ A; 3NVW A; 4WQM A; 1E0Z A; 4HRS A; 3WCQ A; 4LTU A; 4WWM A; 1YQ3 B; 4IDI A; 1DGJ A; 2CJN A; 1E6E B; 2WDQ B; 2H89 B; 2MJE A; 1EWY C; 3HUI A; 3VR8 B; 4FXC A; 1JRP A; 1I7H A; 1XLQ A; 4YSY B; 1TJE A; 3HRD D; 4ZHP A; 5AUK A; 1FFV A; 5H8Y E; 1RM6 C; 2B76 B; 4YXD B; 2DBY A; 1DOX A; 3SFD B; 4C80 A; 1QF6 A; 1KF6 B; 1J7B A; 1FXI A; 2CU3 A; 4YTN B; 1L0V B; 3NVV A; 3AEF B; 2ACZ B; 3ABV B; 5EE9 A; 1JAL A; 1WGK A; 3L4P A; 3P4R B; 1FIQ A; 1E7P B; 1NEN B; 1XLP A; 2E3T A; 2WS3 B; 2PVG C; 1QOB A; 2WQY B; 1UWM A; 1FMA D; 1L6U A; 1QOF A; 1PFD A; 1FM0 D; 2WU5 B; 4YSX B; 3W9C B; 1NVI D; 1NYR A; 2DWQ A; 3AE1 B; 3AEG B; 4N59 A; 4N58 A; 3PO0 A; 3SFE B; 1ZP0 B; 2FBW B; 3AE4 B; 3SR6 A; 4YTM B; 3AE3 B; 1ZOY B; 1XO3 A; 2PKO A; 2W54 A; 2MJ3 A; 3AE2 B; 3AM9 A; 3EUB 2; 3AN1 A; 3HVZ A; 2M56 B; 3AE8 B; 2WP9 B; 1VLB A; 4US9 A; 1E10 A; 2LEK A; 1KRH A; 2MH7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AQ1 B; 4X57 B; 4HVB A; 1FPY A; 3VXW A; 1NDD A; 1OFF A; 4HEA 1; 2JZP A; 2OED A; 4WQO B; 3VUX A; 1TKE A; 1E5W A; 1K53 A; 1UNS A; 3TBL D; 1YD8 U; 1OQQ A; 2WGS A; 4ARI A; 1F9J A; 2WXK A; 3PPA A; 4CO7 A; 1R4M I; 2G1E A; 4R3D A; 2BB5 A; 3VFK A; 1C78 A; 2K8B A; 4KKI A; 2QIE B; 1RRB A; 1IBX B; 2WXO A; 2MSE D; 1MG8 A; 1LO5 D; 2IY1 B; 2L52 A; 1I4X A; 3A4S C; 1KM7 A; 1XEE A; 1GC7 A; 1GPX A; 5C2T B; 4AUQ C; 3DHH C; 4WUR A; 1AYF A; 1P0R A; 4ICV A; 4W9G A; 3JW0 X; 2Q5W D; 2DYO A; 4CQN A; 3NOB A; 2NPT A; 2MLB A; 1P1A A; 3APD A; 3MJW A; 4HCN B; 1R4M B; 3ONS A; 1AAR A; 2QCZ A; 1EWY C; 2INP E; 2FCS A; 4AJW A; 4DXA B; 2VRR B; 2ICI A; 2KFK A; 3PZD A; 3V6E B; 4C80 A; 2HE7 A; 1STE A; 4M0W B; 1F2R C; 3NVV A; 3FIL B; 3L4P A; 1FCC C; 5E6J A; 2K3U A; 4O1N A; 2AL3 A; 4FJV B; 2PTL A; 3ZDM C; 2KMC A; 3RMK C; 4ZHO A; 5IAA C; 2FNJ B; 3HM3 A; 4IWQ A; 3IHP C; 4MGY E; 2FCM A; 4WAF A; 1SXT A; 2LGY A; 2FUG 1; 3VTW A; 4IOI E; 3U4E G; 1VD2 A; 3AU5 A; 3NZS A; 3SDL C; 1V86 A; 1P3Q U; 2KNB A; 1VJK A; 3BYY B; 4EZL A; 1CQV A; 3RNB C; 3OG5 A; 3FC4 A; 1QQR A; 4JIO U; 2L1A A; 2XBB C; 3VR9 B; 1FNU A; 3Q8A A; 4S0R A; 2KWD A; 2GOW A; 4MSM B; 1ROE A; 4J3O D; 2J7Q B; 1MI0 A; 2ZW0 A; 2N7D A; 3U7Z A; 1GG3 A; 5HHD G; 1OQR A; 2C7H A; 4FA6 A; 4QAY A; 1YMH E; 3MFG A; 4JPS A; 3AE7 B; 1N5X A; 1N6Z A; 1XLN A; 4GDL B; 1V5T A; 1ZE3 D; 3ZYY X; 1QOG A; 3M63 B; 4LLG M; 1R4N I; 4GLS C; 2DAF A; 1D5Z C; 3NJT A; 3H1U A; 5BMG A; 2GBJ A; 3AH7 A; 3KW5 B; 4YL8 A; 2BYV E; 4LNK A; 2N1V A; 3IBE A; 1F0Z A; 2JWU A; 1UGM A; 2DLB A; 3FAH A; 1FRR A; 3AXC A; 4KIK A; 3CF6 E; 1D5X C; 3GZN I; 1WM3 A; 1V80 A; 1WXM A; 3IXS A; 2NR2 A; 3TL5 A; 1L2N A; 4P16 A; 4MSQ B; 3KUD B; 1QF6 A; 1D5M C; 2CU3 A; 2HD5 B; 3N30 A; 4W9L A; 4FJY A; 1R4N B; 1UWX A; 4IWP A; 2KC1 A; 2JZZ A; 2WU5 B; 4XDD A; 4YTM B; 1ZP0 B; 4GU2 A; 3HVZ A; 2X8X X; 4B6W A; 2WP9 B; 1YOV B; 3A1Q A; 3E9S A; 2MH7 A; 1J19 A; 2DX5 B; 4JQW C; 2GI9 A; 3GZN B; 2G4S A; 4FLH A; 3VAW A; 4PT5 A; 1TKY A; 2KDM A; 4JWS C; 2MX2 A; 4NJC A; 1HQR D; 2N0S B; 1PQS A; 2PPH A; 1N62 A; 3GE8 C; 2LJI A; 3VH4 B; 2O2V A; 4ZRI A; 2JQR B; 1L5P A; 2NBW B; 1H4R A; 1WYW B; 5MPO A; 2D07 B; 2BGF A; 4ZYN A; 4B95 A; 1TYG B; 1I4Q A; 1ZXI A; 3ZXR A; 5G55 A; 4GB9 A; 2JU6 X; 2LVP A; 2E6X A; 4S17 A; 3PRZ A; 4NJ6 A; 1OEY A; 2CJO A; 4BKS A; 2LWP A; 3EC8 A; 3VRB B; 1N61 A; 3RPF C; 4HPP A; 1BT0 A; 2GRI A; 4JWU C; 3AU4 A; 4P6V F; 3OAW A; 3QK0 A; 3ZVV A; 3BVM A; 4DHZ E; 3WAM A; 1SE3 A; 2MP2 A; 4K7W A; 3RI7 C; 4W9H A; 1PYW D; 3U30 A; 3VH3 B; 5JHB A; 1E8Y A; 1XLQ A; 4W9F A; 1FFV A; 1UUP A; 4TKN A; 3K9P B; 5C23 A; 4XGA B; 1JAL A; 1F77 A; 4WJP A; 3SEB A; 2WQY B; 1TGZ B; 2WX1 A; 4IUM B; 4OHJ A; 4RCO A; 2HTH A; 1NVI D; 1KH0 A; 4K3C A; 2V3P A; 1ZOY B; 2Y5B B; 3SHQ A; 3AE2 B; 4G50 A; 4DBG A; 1IGD A; 2C60 A; 1MJD A; 4MT5 A; 3DPD A; 2MBH A; 2PMV A; 1VLB A; 1HTO A; 1RAX A; 4HKQ A; 2K25 A; 3QC8 B; 3VTU A; 1E7V A; 1OTR B; 3RNC C; 3AE6 B; 1NI3 A; 3U2S C; 1KLG D; 5D2M B; 3BY4 B; 2K6Q A; 1EF1 A; 3MHZ A; 3DVN V; 3AMZ A; 2KMM A; 1B1Z A; 4FJZ A; 2KJ6 A; 4C56 C; 1E8X A; 4JX1 C; 1WRI A; 2XNA C; 1WJU A; 2YEP F; 1AWD A; 3ENE A; 5G5G A; 4C00 A; 2ZZP B; 2V0G A; 1WXS A; 2AEH A; 4XDC A; 3V05 A; 2K8C A; 1MG4 A; 3P1M A; 3C19 A; 1ET6 A; 1SBB B; 2KOX A; 4YWG G; 3TEZ A; 1KTK A; 2W55 A; 4WJN A; 5AZF A; 3BIN A; 2NCN A; 2G3Q B; 3LB8 C; 2LGS A; 3KYD D; 4HRS A; 4WWM A; 1PGX A; 4XX5 A; 3HUI A; 3WAO A; 5H8Y E; 1FD6 A; 3ZKJ C; 3DCG A; 4BOZ B; 3RUI B; 2R2Q A; 2MBE A; 1V49 A; 4BVU C; 3TIX A; 5DPR A; 1LM8 B; 4NZL B; 2RMM A; 2ZNV C; 1FM0 D; 2Z0E B; 1J0G A; 1XO3 A; 2QEJ C; 3EUB 2; 2B3A A; 2GBN A; 1T0Y A; 1GB4 A; 4ZRK A; 3GS2 A; 2K0P A; 2KLG A; 1YJJ A; 1I4G A; 1WJ4 A; 1Q10 A; 2A4Z A; 4HK2 A; 4M01 A; 4HCP B; 1SJE D; 3TCA A; 1WGG A; 1MVK A; 3DBR I; 4NPN A; 2WDR B; 2RDB C; 4FN2 A; 2ZCC A; 3RN9 C; 1B9R A; 1JML A; 2KQ7 A; 5G2N A; 3VQI A; 3EFU A; 4OVU A; 2M17 A; 4FHK A; 1PGB A; 4YSZ B; 1QZE A; 1CZP A; 3EEC A; 5IO9 A; 4L2Y A; 3JVZ X; 3R7Q A; 3ZJT A; 4NAW A; 3OLM D; 4OVZ A; 5DCN A; 3SD5 A; 3PLU A; 2FAZ A; 4UDU C; 2MRP A; 5FK9 C; 4AP4 C; 3MP9 A; 3A1Q B; 2JVC A; 3DBR B; 1A70 A; 1JWA D; 1R7S A; 3AEA B; 3RUL A; 3NVZ A; 4K7S A; 4RGM A; 4G11 A; 1E6E B; 2JWZ A; 2D10 A; 4KGS A; 4II3 B; 1TJE A; 3A9K A; 4WWO A; 2IDY A; 5LLI A; 2UU7 A; 1WJ6 A; 3UIO B; 1VZ6 A; 5DPW A; 2V4I B; 1UZX B; 2KAC A; 4DXF A; 1P7E A; 1VZ7 A; 3Q14 C; 1YN5 A; 2IGD A; 4I6P A; 2AL6 A; 2KN4 A; 2M0X A; 4N59 A; 5BYQ A; 2KHW B; 3PO0 A; 1FXT B; 3QCA A; 2INC C; 1KJT A; 4TMA B; 1TS2 A; 5GMV A; 3QX1 A; 4G0N B; 2W9N A; 1TY2 A; 2ZVN A; 5J17 A; 3N3K B; 2KWV B; 3VVW B; 4E74 A; 4A8X C; 1WMH A; 3RNF C; 2BWF A; 2V3S A; 1I4P A; 2AYO B; 1N60 A; 4W9D A; 4DHJ D; 3ZUN A; 2BYE A; 2JT4 B; 2KKC A; 3U8Z A; 2N9X A; 2DNF A; 4MDK E; 2WXL A; 1VRA B; 3ML8 A; 4ACF A; 5E6P A; 2O6V B; 2RPV A; 4FHJ A; 3WA0 A; 2IO3 B; 1GJZ A; 3A4R A; 1YJI A; 2PW9 A; 4C7Z A; 1ESF A; 1K51 A; 3N20 C; 4NQL B; 1EU3 A; 2ASQ A; 2WU2 B; 2GBR A; 2OJR A; 3H7P B; 1C9F A; 2I38 A; 5EE1 A; 2GB1 A; 5GXG B; 3UF8 A; 2V3N A; 1KLU D; 3PRP B; 4DWF A; 2N9K A; 1SF0 A; 3Q8B A; 1J7A A; 1IGC A; 2JRH A; 2CHX A; 4LJO B; 1YQ3 B; 3MC0 B; 5CTR C; 2FE8 A; 1E90 A; 2BYF A; 1LQB A; 3VR8 B; 2DYB A; 3HIZ A; 5D94 A; 1Q0W B; 3B08 A; 3V3X A; 1V1P B; 4MGI E; 4MJS A; 4JGH B; 2SEB D; 5EE9 A; 2KTR B; 2KWU B; 1WGK A; 2RD0 A; 2ZNV B; 3K9O B; 4W9E A; 3WAL A; 2FID A; 1AW7 A; 2J53 A; 4KGR A; 1PFD A; 2RDG A; 1UEL A; 2DEN B; 3QIJ A; 3AM9 A; 4MGK E; 1WZ3 A; 2BW2 A; 3QJZ A; 4ZRP A; 2TSS A; 4M02 A; 3NZU A; 1UGJ A; 1ZW7 A; 1XCT L; 2GLS A; 1V2Y A; 3UI3 A; 1SE2 A; 2IO1 B; 3L16 A; 2ZPY A; 2L83 A; 4EFO A; 3QWZ B; 5L95 C; 3Q8F A; 4IG7 B; 2CU1 A; 2L00 B; 4GN1 A; 3J9C A; 4BZA A; 4HWI B; 4KKJ A; 1E9M A; 1WR6 E; 4GGQ A; 3ZW3 A; 4F7Z A; 2Y5C A; 5AZH A; 2DZJ A; 4LDT B; 3W5U B; 4P1C C; 2FCQ A; 4BBN C; 2CS4 A; 3ZO5 B; 2J0M A; 2ON8 A; 3VDZ A; 2ZCB A; 1WYG A; 4KZ0 A; 1ET9 A; 3RZW C; 5IP4 D; 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4AS1 A; 1FEH A; 1PUT A; 3P42 A; 5D3D A; 2KJH B; 1YQB A; 3P4P B; 1F2R I; 3NVW A; 4RGO S; 4OVV A; 1WE6 A; 2LHE A; 3T3O A; 4WH4 A; 3H6N A; 1Y56 A; 1WX8 A; 3LDZ E; 1V6E A; 4NQK E; 3L0W B; 5EDS A; 1XLP A; 1WX9 A; 2Z0D B; 3W1S A; 2LGD A; 3N1Y C; 1IP9 A; 2MWS B; 1LXD A; 3Q8E A; 1T0S C; 2DZI A; 3WIM A; 2QMT A; 2LRW A; 1OQY A; 3KH0 A; 1JWU D; 4HPL B; 2EMS A; 4RGN A; 1WM2 A; 4FBJ B; 1F52 A; 3KLS X; 4RM9 A; 4OZC A; 2KX3 A; 2EKI A; 1JRU A; 2K8H A; 2NMQ A; 4EZK A; 2MBB B; 1JWB D; 2BT6 A; 1EM7 A; 2NTT A; 2YEP B; 4KV2 A; 4ICU A; 4RM8 A; 4OZB A; 4E3C A; 1DOI A; 3Q3O C; 3CWI A; 2KQS A; 1WE7 A; 3RZF A; 2KMA A; 3ZRF A; 3ZXV A; 3TMP B; 1TKG A; 3QAR A; 1JWS D; 4URK A; 3TSS A; 1WGH A; 1WXV A; 4RF0 A; 4E71 A; 3DBS A; 3T9L A; 1HZ5 A; 2NPT B; 3I3T B; 3W1S C; 1WY8 A; 4NY0 A; 2W3R A; 1JW9 D; 3ZTD A; 1IBX A; 4RFB A; 5E6O A; 1N5W A; 2KFK B; 5BYS A; 3AED B; 3B2F A; 3ZIM A; 2K9X A; 4LTU A; 2AQ3 B; 1YNT E; 2WHI A; 1WZ0 A; 1D4B A; 3X23 A; 4IC7 B; 3O65 B; 4CHK A; 1UF0 A; 3P2B A; 4YTN B; 3ZRC A; 2RSU A; 4K1R B; 4BBN F; 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