The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| publication title |
Solid-State Protein-Structure Determination with Proton-Detected Triple-Resonance 3D Magic-Angle-Spinning NMR Spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
9
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GB1 A; 1MPE A; 3FIL B; 2IGG A; 2K0P A; 1HZ6 A; 1MI0 A; 1KH0 A; 1JML A; 2N9K A; 1MHH E; 1C9F A; 1GB1 A; 1PGX A; 1K52 A; 1UWX A; 4HKZ E; 1GB4 A; 4OZB A; 5HFY A; 2LGI A; 3MP9 A; 1PGA A; 4OZC A; 2RPV A; 1K51 A; 2EEL A; 4GLS C; 1QKZ A; 2JZP A; 2ZW0 A; 4KGS A; 2RMM A; 3UI3 A; 1K50 A; 1FD6 A; 1D4B A; 4D2K A; 1YNT E; 1F2R C; 4IKG A; 1IBX B; 5BMG A; 4MAC A; 2ZW1 A; 5BMH A; 5HG2 A; 2ON8 A; 5HI1 A; 4OZA A; 1ZXH A; 1PGB A; 2LHD A; 1XCT L; 2ONQ A; 1Q10 A; 1MVK A; 5HHD G; 2QMT A; 2N7J A; 4HJG E; 4KGR A; 2JU6 X; 2GI9 A; 1XCQ L; 2PLP A; 2KN4 A; 2QSD A; 2LHE A; 1MHX A; 1XF5 L; 3FIL A; 1IGC A; 2KDM A; 2KAC A; 1FCC C; 1HEZ E; 2JWU A; 2I2Y A; 2J53 A; 1EM7 A; 2LUM A; 2I38 A; 2KWD A; 2N9L A; 2JXT A; 3V3X A; 1IBX A; 1HZ5 A; 1F2R I; 4WH4 A; 1P7F A; 2PTL A; 1P7E A; 5BMI A; 5JXV A; 2IGH A; 2J52 A; 2NMQ A; 2IGD A; 1IGD A; 2KQ4 X; 1FCL A; 2JSV X; 1YMH E; 3GB1 A; 2PW9 A; 4IOI E; 4KGT A; 2OED A; 1K53 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FID A; 2ZEQ A; 2DAJ A; 1MI0 A; 2KTR A; 3O13 A; 1SBB B; 5IAA C; 5DPS A; 4A9A A; 1WGH A; 3Q3O C; 3WCQ A; 2RR9 A; 1FO4 A; 2KDF B; 4WQO B; 4HKZ E; 4KZ0 A; 2O6V D; 3TMP B; 1M94 A; 2YLM A; 2GRI A; 3Q3F A; 3DBR I; 2LAS A; 4ZRQ A; 4HEA 1; 4ZRK A; 1YQ3 B; 4E71 A; 1YN5 A; 3IVF A; 3VRB B; 1QZE A; 2BYT A; 4MAC A; 2L7R A; 2X8X X; 2N9P C; 4RM8 A; 3Q14 C; 2KQS A; 2DWQ A; 4PYZ A; 2JYT A; 2B3A A; 1C78 A; 3Q8E A; 1JAL A; 4KGR A; 2D11 A; 4AJW A; 1XCQ L; 5EE3 A; 1JCK B; 4O1N A; 2BYE A; 3AEB B; 1X1M A; 4A20 A; 5T8I A; 2UWQ A; 3FIL A; 3JSV A; 5TR5 A; 1HE8 A; 3KYD D; 4PS7 A; 2WX1 A; 2FUH B; 2EKE C; 2N9L A; 4CYE A; 3U4E G; 1V1O A; 2LD9 A; 3ZLZ A; 1PDX A; 4DHZ E; 2GBJ A; 3U7Z A; 2C7H A; 5LNK 1; 4JWU C; 3R66 C; 3KUD B; 3UIN B; 1KLG D; 5BMI A; 5JH5 C; 2IGH A; 4YT0 B; 2G4D B; 4XGA B; 3OAW A; 3RNF C; 4A90 A; 4LNN A; 2BBC A; 2KWU B; 4GDL B; 3MJW A; 3H8H A; 4GDK B; 2Z8L A; 4NNJ B; 4B6W A; 1RM6 C; 4KSL C; 3P63 A; 4KIK A; 5DCN A; 4BBN F; 3RYT A; 3ZO5 B; 5BO4 B; 2E3T A; 3RNB C; 3URY A; 2GBM A; 1QQR A; 5HFY A; 5J18 A; 1UZX B; 1MG8 A; 1WM3 A; 1K51 A; 3B08 A; 3ML8 A; 3RNA C; 3PTF C; 5E6N A; 2B76 B; 2QEJ C; 4YSX B; 4K7W A; 4K81 A; 1CZP A; 1FD6 A; 2DBY A; 2AQ1 B; 1YNT E; 2LRU A; 1CK1 A; 2ZPN A; 3AE7 B; 2PMV A; 1SE9 A; 2INN E; 3NJT A; 4MM3 B; 1LM8 B; 1L2N A; 2BYF A; 4GB9 A; 3RI7 C; 1PGB A; 2JY6 A; 2ONQ A; 3RNE C; 2K6D B; 1WGK A; 1IP9 A; 2C60 A; 2QJL A; 2BPS A; 4TKN A; 3L10 B; 4B0M A; 2KT7 A; 4YSY B; 2IY0 B; 2INC C; 1J7A A; 2N9E B; 2MBE A; 1LFD A; 3Q69 A; 3QHT A; 1TGZ B; 4ITK A; 1R4M I; 4DXG A; 3U30 A; 2KDM A; 4EZJ A; 1AAR A; 2W82 A; 5EE9 A; 3X0W A; 3IAS 1; 4XE0 A; 4XWT A; 3W1S C; 3SD5 A; 3Q8A A; 1R7S A; 3C19 A; 2VZK D; 2MX2 A; 2WU2 B; 3AU5 A; 2Y3A A; 2AL6 A; 1C1Y B; 4YTM B; 1V1P A; 1WWT A; 5EDS A; 4DHZ B; 3WA0 A; 1I42 A; 2KKC A; 4C7Z A; 3PS6 A; 2PW9 A; 2CU3 A; 5GMV A; 3VUW A; 3RD2 A; 5CHV C; 1HZ6 A; 3P4S B; 3ALB A; 4MH0 E; 1CQV A; 1V6E A; 2NBW B; 3M62 B; 4MEL A; 3ABV B; 2FAZ A; 3KLS X; 2LWP A; 1WRD B; 4RF1 A; 5G5G A; 3KUZ A; 3HVD A; 1QOF A; 4HRO A; 1N60 A; 3T9L A; 5FR6 A; 2O6V B; 2WGS A; 3RZF A; 1ZUD 2; 3DVG X; 2XEW A; 3BII D; 1E7V A; 3A4S C; 3KVF B; 5IP4 D; 3BZD B; 2AWT A; 5CTR C; 2WQY B; 2EMT A; 1S3S G; 2V1Y A; 3A4R A; 3L0W B; 5HI1 A; 4GSW A; 2WDR B; 1C77 A; 1FFU A; 2LZ6 A; 3APF A; 2O2V A; 3ENE A; 4B0E A; 3TL5 A; 3ZJU A; 3SU8 X; 2HDE A; 3ZDT A; 2WX0 A; 4H2A A; 5JHA A; 3H7S A; 2FCN A; 4PS8 A; 2GBK A; 1WJ6 A; 1NVI D; 3GOE A; 1MHX A; 3PSE B; 3NZU A; 1XLN A; 2XNA C; 3QK0 A; 1YN3 A; 4HDO A; 3SFE B; 1H8C A; 3DOW A; 5J17 A; 4C00 A; 1XLQ A; 2ZCB A; 2NTS A; 1E8X A; 4K3C A; 5AZG A; 1WXV A; 1QT9 A; 4ZYS A; 2HJ8 A; 1E10 A; 1JWB D; 3I9V 1; 1EO6 A; 1P7E A; 3AUL A; 5JXV A; 3KYC D; 4JWS C; 2KX3 A; 4WIP A; 1R4M B; 3VDZ A; 4KGT A; 1ZW7 A; 1C4C A; 3B1L X; 1PQS A; 1WZ3 A; 2IGG A; 2NCN A; 1AWD A; 1RFK A; 3N20 C; 4GU2 A; 2LGS A; 4YSZ B; 1EUV B; 2DYB A; 1D6E C; 1FXT B; 1MHH E; 1OQY A; 1N5X A; 3ZDM C; 1JW9 D; 2WXJ A; 4G11 A; 2PE6 B; 2AX5 A; 1TTN A; 1UWM A; 2RD0 A; 1WX9 A; 4HJK A; 2AL3 A; 3AE6 B; 4AJY B; 4ASW C; 3JSV B; 1I4H A; 4J3O D; 1GUA B; 3OJ4 B; 1XT9 B; 3N32 A; 1E8Y A; 4FXC A; 5C23 A; 3TEW A; 3TEZ A; 2KVR A; 3PLU A; 3ZNI D; 4AP4 C; 1TIF A; 2A5U A; 2Z0D B; 1ZXH A; 3HHM A; 1V80 A; 4EEW A; 3O65 B; 4LTU A; 5BYR A; 3AED B; 3GE3 C; 4UDU C; 2KWV B; 3U8Z A; 3UQA A; 1S1Q B; 4F8C B; 1OEY A; 4M8M A; 1WXA A; 3IG3 A; 4RGM A; 3ZW3 A; 4YL8 A; 2C5L C; 4M01 A; 5D3I B; 4USA A; 4ZHO A; 4GDL A; 1TS5 A; 1T5X D; 1XF5 L; 2J0K A; 5CHF A; 5D94 A; 4KIK B; 1L4Z B; 4N58 A; 1GPX A; 1HEZ E; 2JPH A; 2I2Y A; 2KWD A; 3OLM D; 3HRD D; 3LXF A; 2HJ1 A; 5L95 C; 2WWZ A; 1KF6 B; 2VZK B; 1UGM A; 1VDV A; 1WGY A; 3UQB A; 3AXC A; 5D3D A; 3I3T B; 2CU1 A; 3P4P B; 3AEF B; 2INP E; 2YEP B; 2MH7 A; 1TKE A; 1V81 A; 2JSV X; 1YOV B; 2WS3 B; 1P1A A; 2L05 A; 1V2Y A; 1MPE A; 1YJ1 A; 5DPW A; 1D5X C; 3TEY A; 3V60 A; 2K0P A; 2Y5B B; 3KUC B; 4LLG M; 3DDC B; 4HRS A; 3DHI C; 3DBH I; 3SFD B; 2YVC A; 2LGY A; 2WXH A; 1GNU A; 1JML A; 2J0J A; 2MEK A; 1SJE D; 3TUO A; 2ASQ A; 4AOF A; 3DBL I; 1E6E B; 2N0S B; 4OHJ A; 1GC7 A; 1A70 A; 1OTR B; 2D3G A; 2KDB A; 1E0Z A; 1B9R A; 2RPV A; 2JT4 B; 3A1Q B; 4TQ0 A; 1GOZ A; 2K39 A; 2MJ3 A; 4WWN A; 2MW5 A; 1P3Q U; 4RH6 A; 3RMK C; 4BKS D; 1T3Q A; 3WAN A; 2BS2 B; 2UYZ B; 3IXS A; 1UNS A; 4IKG A; 5BMG A; 1BML C; 3N9Y C; 4N59 A; 3BVM A; 4OZA A; 1UBI A; 2GBR A; 1P9D U; 4BOS C; 4HPP A; 1JRO A; 1V1P B; 3DVN V; 1RYJ A; 2WXO A; 3AEA B; 4CO7 A; 2EKI A; 3PLV A; 2WHI A; 1UD7 A; 1E5W A; 1LXD A; 3NG0 A; 4TUU A; 3VTV A; 1DOY A; 3EUB 2; 2M1M A; 5KHO A; 1L0X B; 3VFK A; 4K1R B; 1WJ4 A; 5KHQ A; 3AEE B; 2LUM A; 3IT6 B; 2AQ2 B; 2PEA A; 2D10 A; 3JW0 X; 2D2Q A; 4QAY A; 3WAP A; 1UBQ A; 2KJH B; 2FBW B; 2RDB C; 1VLB A; 1HXY D; 2L1A A; 1XXG A; 3DWG C; 3H6N A; 4ACF A; 1UUP A; 2IGD A; 2KWC A; 2O6V A; 4FJY A; 3BK2 A; 3ZRF A; 3H1U A; 3KWL A; 3QCA A; 2ZCC A; 1UH6 A; 2K8C A; 1AW7 A; 4X57 B; 2KNB A; 2K9X A; 2IYD B; 3ONS A; 4KKJ A; 3QAQ A; 4PT5 A; 3VUX A; 4LNI A; 3TEX A; 4WWM A; 4C4V A; 1KH0 A; 3P1M A; 1PUT A; 3NS1 A; 3DHH C; 1DGJ A; 1D5M C; 2LGI A; 3GP7 A; 3N1Y C; 2LJI A; 2R2Q A; 2WXK A; 4OW0 A; 1HQR D; 2KFJ A; 1WZ0 A; 2WU5 B; 2H89 B; 4A3O A; 2KC2 A; 3B9J A; 2KVZ A; 4KV2 A; 3LB8 C; 3DBL B; 3NVV A; 2ZW1 A; 3PRZ A; 4ZRJ A; 2WXL A; 3T3O A; 1JWA D; 3L08 A; 2I1J A; 3VTW A; 3JVZ X; 3AMZ A; 4NY0 A; 4HKQ A; 4HJG E; 2JU6 X; 4S0R A; 3EFU A; 4NJ6 A; 3UF8 A; 1Y56 A; 1FCC C; 1WX7 A; 4EKU A; 1SF0 A; 4BKG A; 3NZS A; 1ROE A; 1IBX A; 2XN9 C; 3PRM B; 1TZ1 A; 2FNJ B; 3WIM A; 2W9N A; 3APC A; 4NAW A; 1XQQ A; 2N1W A; 1IYF A; 1FRD A; 2NMQ A; 4BVU C; 2KX0 A; 3L4P A; 2DYM A; 4WJP A; 2PVG C; 5BYS A; 3CWI A; 3RT3 B; 3TBL D; 5DPT A; 2RPQ A; 1UF0 A; 1J7C A; 4ICU A; 1HA5 A; 4IUM B; 2RDG A; 2W3S A; 4EZK A; 2WNM A; 2KO3 A; 3CST A; 3ECI A; 2BQQ A; 1AYF A; 2NR2 A; 2JVC A; 4L23 A; 3U52 E; 1UWX A; 2KXJ A; 4OZB A; 3OG5 A; 3MTN B; 4BFR A; 2E6X A; 2V0G A; 4EFO A; 4GXB A; 1FRR A; 1YX5 B; 2R2O A; 4LK0 M; 1FNW A; 2K1F A; 1VCB A; 3ETR A; 4TMA B; 4II2 B; 3SR6 A; 4DHJ D; 1ZE3 D; 2K25 A; 4OVZ A; 4G50 A; 2V3S A; 1ZPS A; 2L76 A; 5HHD G; 1J7B A; 4K3B A; 1JWS D; 4DWF A; 4DK5 A; 1FM0 D; 2CS4 A; 3UIP B; 1A5R A; 2L83 A; 4DXF A; 2KMA A; 2M0X A; 2ZNV B; 2WXP A; 4MGZ E; 1RAX A; 4ZHP A; 1I35 A; 2CHX A; 1B1Z A; 3I63 C; 3KH0 A; 2I38 A; 4XDC A; 4NJC A; 3C8Y A; 3DBR B; 4WH4 A; 1ENF A; 1HTO A; 4A3P A; 2N9X A; 3Q2A C; 3Q8F A; 4ICV A; 5AEK B; 4I6N B; 4FLH A; 4FUL A; 2KFK A; 1RWS A; 4AQ7 A; 3A1Q A; 2BVC A; 1IGD A; 1JRU A; 2WXG A; 3WAM A; 4MGI E; 2IDY A; 4P1B C; 1YMH E; 3GB1 A; 4N6E B; 2WLB A; 2R61 A; 2BWE S; 1N63 A; 1V49 A; 3AM9 A; 3SEB A; 2BTE A; 3PGE A; 3MHZ A; 2FCM A; 2G3Q B; 3TCA A; 3APD A; 3J9C A; 1J19 A; 1QOG A; 2QIE B; 4OZC A; 3T3N A; 1XLO A; 1GC6 A; 4RFB A; 1SE3 A; 2KDI A; 1F1H A; 3RZW C; 1BXT A; 2BB6 A; 2FCQ A; 2L0T A; 4TSS A; 2OJR A; 3RUI B; 3W5U B; 1F0Z A; 2W54 A; 5IOI A; 2BS4 B; 2Z59 B; 5BMH A; 1KRH A; 4BBN C; 3MFG A; 2LHD A; 1XCT L; 4WWP A; 3V05 A; 2V4L A; 3ZGZ A; 1WH3 A; 1C3T A; 2N7J A; 3NVW A; 2CKH B; 2KQ7 A; 2QC8 A; 3X23 A; 4ZOH C; 3ZNZ B; 4LNF A; 4C4V B; 2M4N A; 3PRE A; 4JQW C; 4W9J A; 3UGB B; 1WMH B; 1WFY A; 2JRH A; 2FIF A; 2N4F A; 4XX5 A; 4II3 B; 3DBS A; 3EGR A; 2M19 A; 1ZXI A; 4GGQ A; 3U7D A; 5FKA C; 1FCL A; 2J4X A; 4P6V F; 2LEK A; 2AYO B; 2ZNV C; 4WUR A; 2W55 A; 3B2G A; 2IO2 B; 1V86 A; 2MBB B; 1WYW B; 4ARC A; 5D2M B; 1G6J A; 4MSQ B; 1MFW A; 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1T0Q C; 2TSS A; 1I4X A; 1YQB A; 2V3P A; 2IY1 B; 4JGH B; 2JX5 A; 3DHG C; 1N62 A; 3FAH A; 2AQ3 B; 3V6C B; 1TYG B; 2IZV B; 2ZW0 A; 1IUE A; 4GMV A; 1SIF A; 4TQ1 A; 1K50 A; 2K3U A; 4L1B A; 5D7G A; 2HE7 A; 1SEB D; 3AE2 B; 1YJI A; 3L16 A; 5E6J A; 2MJD A; 3AH7 A; 1XEE A; 2BF8 B; 1YN4 A; 2KAN A; 2CHW A; 4HLE A; 2CR5 A; 4E74 A; 2KFK B; 2K8H A; 4CQN A; 3VUY A; 1EU3 A; 1E9M A; 1MVK A; 2KJ6 A; 1L5P A; 3QQ8 B; 3R2I A; 2PVO D; 3NUH B; 4JX1 C; 2J7Q B; 3NVY A; 3I57 A; 2J42 A; 5CX3 A; 5L83 A; 1YD8 U; 3BWU D; 3AEC B; 4GOC A; 1LQB A; 1FIQ A; 3R7Q A; 3RFZ B; 3BIN A; 5CHW A; 2JXT A; 5C1Z A; 4LDT D; 1WSP A; 3KWV A; 2D3C A; 3AE8 B; 3SHQ A; 4IWO A; 1L0V B; 2LVP A; 3P42 A; 4MJS A; 2J52 A; 2BS3 B; 4ARI A; 2DZM A; 3ML9 A; 2Y5C A; 3H9D A; 1GJZ A; 1E90 A; 1K53 A; 5IO9 A; 1SE4 A; 2HTM E; 3R3M A; 1V8C A; 4RF0 A; 2KZR A; 4WJN A; 2AEH A; 2PE9 A; 3VVW B; 5C3J B; 3GE8 C; 2FUG 1; 3JYU A; 1C4P A; 5GXG B; 4HPM B; 5LXH A; 1E7U A; 2MHJ A; 1TS3 A; 2IND C; 3LJ3 A; 1C9F A; 1PFD A; 4JPS A; 1YIW A; 3NVZ A; 4FBJ B; 3KW5 B; 1F77 A; 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