The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
b'MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| publication title |
Solid-State Protein-Structure Determination with Proton-Detected Triple-Resonance 3D Magic-Angle-Spinning NMR Spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
9
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2N9L A; 3V3X A; 4IOI E; 2JWU A; 3FIL A; 1MPE A; 1IBX B; 2QMT A; 1JML A; 5HI1 A; 2KAC A; 4KGR A; 4D2K A; 2ZW1 A; 1YMH E; 1EM7 A; 1IBX A; 1MHH E; 1PGA A; 1KH0 A; 5BMI A; 4OZA A; 5BMH A; 5HG2 A; 2JZP A; 1MVK A; 1K52 A; 2N9K A; 2J53 A; 2LGI A; 2JXT A; 2PW9 A; 2PTL A; 1F2R C; 1HZ5 A; 2JSV X; 4MAC A; 2QSD A; 4KGT A; 2GB1 A; 2K0P A; 1F2R I; 2IGH A; 1D4B A; 2LHD A; 1UWX A; 2J52 A; 2KWD A; 4OZB A; 1HEZ E; 2KDM A; 2EEL A; 4IKG A; 1QKZ A; 2KQ4 X; 1HZ6 A; 2KN4 A; 1P7E A; 1IGC A; 1MI0 A; 1IGD A; 2PLP A; 2ONQ A; 1FD6 A; 4KGS A; 5HHD G; 2LUM A; 1XF5 L; 5BMG A; 1FCL A; 1FCC C; 2NMQ A; 1Q10 A; 1XCQ L; 1YNT E; 2JU6 X; 1GB4 A; 2ZW0 A; 1K51 A; 2N7J A; 2OED A; 4WH4 A; 2I2Y A; 1PGX A; 1GB1 A; 1C9F A; 2ON8 A; 4OZC A; 2RMM A; 4HJG E; 1P7F A; 1PGB A; 2GI9 A; 2LHE A; 1K53 A; 3UI3 A; 1ZXH A; 3MP9 A; 5HFY A; 1MHX A; 1K50 A; 4GLS C; 2RPV A; 1XCT L; 2IGD A; 2IGG A; 3GB1 A; 3FIL B; 5JXV A; 2I38 A; 4HKZ E; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JWA D; 4MT5 A; 4EOY A; 3SFE B; 3PZ8 A; 5CX3 A; 3N32 A; 1R4N I; 2WXF A; 5HI1 A; 1D5M C; 3AE2 B; 2BYT A; 5D94 A; 1MG4 A; 4RM9 A; 4RMA A; 1XLQ A; 2NTS A; 2DZM A; 2VRR B; 5BMI A; 1YQB A; 4WUR A; 2G45 B; 1YD8 U; 2A5U A; 3QAR A; 4TSS A; 4K3C A; 3Q3N C; 2NTT A; 1E6E B; 3KH0 A; 2GB1 A; 5AUK A; 4HCN B; 4MGY E; 3SR6 A; 4YL8 A; 2G4D B; 1ZDV A; 1JQ4 A; 1WE7 A; 2WDR B; 3DBR B; 1E9M A; 3VRA B; 2O6V D; 1IGC A; 1WM2 A; 5G5H A; 2V3N A; 2G3Q B; 2GOW A; 3GZN I; 4G3X B; 3MHZ A; 3SD5 A; 2ONQ A; 3QAQ A; 1Z5S B; 1WR6 E; 2IO2 B; 1FXA A; 3P4P B; 4XYC A; 4XZ4 A; 1J8C A; 2KLG A; 3ZLZ A; 1YNT E; 2IBI B; 1XLO A; 5BYS A; 4A3P A; 3AB5 A; 1TY0 A; 1HTQ A; 2M0A A; 2GRI A; 1OFF A; 1OEY A; 4ZRI A; 2JVC A; 1QT9 A; 2G9H D; 4JX1 C; 2KAJ A; 3WAP A; 1P7F A; 2LXA A; 1GAQ B; 1C76 A; 2I1J A; 4XDD A; 1YX6 B; 1MHX A; 2NCN A; 2V4I B; 1V1O A; 4L1B A; 1ZE3 D; 3EA6 A; 2IGG A; 1YQ4 B; 1F9J A; 1A70 A; 4TV3 A; 2LEK A; 3AE8 B; 2BVC A; 4B0E A; 3NUH B; 1MPE A; 2M8S A; 1V86 A; 4GDL B; 2KAC A; 2WU2 B; 2Y5P A; 1CJE A; 3M3J A; 3KW5 B; 3HIZ A; 1SE4 A; 2KVR A; 3AEG B; 2L0F A; 5EDS A; 1H8C A; 2IZV B; 2WWZ A; 2TSS A; 4K81 A; 4ARC A; 3AEE B; 2DWQ A; 3AE6 B; 1VD2 A; 3RD2 A; 4P6V F; 3GE8 C; 1KLU D; 2KDF B; 4AJY B; 2WDV B; 4WJQ A; 4FHK A; 2HE7 A; 2WGS A; 2D11 A; 1WIA A; 2J52 A; 4OZB A; 4DQO C; 2WDT B; 1CK1 A; 4XDC A; 1UNS A; 4S0R A; 4EE2 A; 4A55 A; 1WJ6 A; 4FHJ A; 2CJN A; 4IWP A; 2ZPN A; 1T0Q C; 3RMK C; 3X23 A; 3R3M A; 2LGX A; 2WXG A; 3P4R B; 1JRU A; 2Y3A A; 2WXK A; 4G11 A; 4EZJ A; 1K51 A; 1T5X D; 3LB8 C; 4GGQ A; 1FPY A; 1VJK A; 3ZNG C; 3RPF C; 4H2A A; 4IM0 A; 5TSS A; 3UQB A; 1S1Q B; 4KVG B; 5DPS A; 3ZDM C; 3URY A; 1ZXH A; 1C79 A; 4YT0 B; 3UGB B; 1FM0 D; 4L23 A; 5E6O A; 3AMZ A; 1TBE A; 1V2Y A; 3EHV A; 2JX5 A; 3RNE C; 4K3B A; 2WXL A; 1V97 A; 2AEH A; 4P7I A; 1QZE A; 1WF9 A; 1TKE A; 1ET6 A; 4FXC A; 2ASQ A; 2D10 A; 4LCD E; 3LXF A; 4WWP A; 4GDL A; 3O13 A; 4C00 A; 1KTK A; 1V5T A; 3ZUN A; 1HE8 A; 2KDB A; 5C2T B; 4MM3 B; 3PLV A; 4GXB A; 1WX8 A; 2MCN B; 2N4F A; 2V9H A; 3DDC B; 2WS3 B; 4M8M A; 2KX0 A; 4E71 A; 1UWX A; 4HLE A; 4F1S A; 2C7N B; 3VTU A; 1VCB A; 1HEZ E; 2LFI A; 3FKY A; 3AN1 A; 1ISN A; 4NJ6 A; 3P1M A; 2ZNV C; 4IM3 A; 4ASW C; 3FAH A; 4C56 C; 1C3T A; 4YSX B; 2INP E; 1WE6 A; 3APC A; 2WP9 B; 4EKU A; 1TS5 A; 1Q10 A; 4NQL B; 3AED B; 3APD A; 2K3U A; 2N1W A; 2ZW0 A; 3WA0 A; 2N7J A; 2CR5 A; 3WAL A; 4C4V B; 3DCG A; 3IHP C; 2JYT A; 4LNI A; 4B0M A; 1YN4 A; 1WXQ A; 4M01 A; 3VTV A; 3ZTC A; 1EUV B; 1Q5W B; 1U4A A; 2WXH A; 2AX5 A; 3EFC A; 4DWF A; 2WDQ B; 2K8C A; 1L0X B; 5H8Y E; 5T8I A; 2BBC A; 5L95 C; 4DXF A; 4A8X C; 2KFJ A; 2I38 A; 4MGI E; 3OG5 A; 1E7P B; 3JSV B; 4NY0 A; 2FCN A; 5L83 A; 3AEC B; 1IBX B; 1WMH B; 1PUT A; 3ZJU A; 1I42 A; 3RUL A; 4FLH A; 3BVG A; 4B95 A; 2C9W B; 4FUL A; 1SE2 A; 1DGJ A; 4W9F A; 2WXQ A; 4WQM A; 1HXY D; 2RDH A; 3BWU D; 4KDL B; 4TQ0 A; 4DDI D; 4JWU C; 2RSU A; 4FJZ A; 3RNG C; 1C77 A; 2QC8 A; 2KHW B; 3K9P B; 4MH0 E; 4HWI B; 2BB6 A; 3GZN B; 4ARI A; 5EE1 A; 4CYE A; 2H88 B; 3BIN A; 1Y56 A; 1F77 A; 1T0Y A; 2WXP A; 1EF1 A; 3A4R A; 1VLB A; 2MA9 B; 5BYR A; 4DDG D; 3TEZ A; 3LJ3 A; 2O6V A; 1P9D U; 2GBJ A; 3I63 C; 4GB9 A; 3A9K B; 1E10 A; 4RNA A; 2XN9 C; 4KKI A; 1C78 A; 4L2Y A; 1PGX A; 1N60 A; 2PPH A; 3BYY B; 1C9F A; 1L6U A; 4OZC A; 3DBH B; 2A4Z A; 4C4V A; 3IAS 1; 3QX1 A; 3NVZ A; 4ANV A; 5CHF A; 1WWT A; 2LD9 A; 4M02 A; 1NEN B; 3HRD D; 2PKO A; 4QAY A; 3DQV A; 1SB3 C; 4HEA 1; 3S2A A; 3AH7 A; 2JYE A; 1TS2 A; 3KWV A; 4BFR A; 1FRD A; 2K22 A; 4M0W B; 4W9L A; 2KX3 A; 5GMV A; 1HA5 A; 2QMT A; 3B2F A; 2BT6 A; 2DYO A; 3JSV A; 4ZRJ A; 2RDB C; 4WJP A; 3GOE A; 3QHT A; 4GOC A; 3KUZ A; 1IBX A; 1MHH E; 2SAK A; 4K7U A; 1L7Y A; 4LJO B; 3EUB 2; 3Q3F A; 1OGW A; 3T9L A; 3HUI A; 3NY5 A; 1J19 A; 2DBY A; 3TCA A; 2PW9 A; 1BT0 A; 3V6E B; 3NS8 A; 3ZIM A; 1XQQ A; 4MJS B; 1TS4 A; 2C7M B; 1PDX A; 1WXS A; 2BB5 A; 2HJ8 A; 3PV1 A; 2EEL A; 1SBB B; 1RYJ A; 3IFW B; 2PLP A; 4W9I A; 2JY6 A; 3H6N A; 5LNK 1; 3UF8 A; 1L0V B; 4BVU C; 1RAX A; 4HCP B; 4BBN F; 2D2Q A; 1UGJ A; 3KYD D; 3N1Y C; 3AUL A; 2FCM A; 1RRB A; 4A20 A; 1SIJ A; 2HDE A; 1FXI A; 4KV2 A; 4C80 A; 5G55 A; 5E6N A; 4WH4 A; 3U4E G; 2M56 B; 2K39 A; 2BYF A; 5IKC M; 1CMX B; 3PRM B; 1ROE A; 2SEB D; 1GPX A; 4O1N A; 2DZK A; 4FAD A; 3VH4 B; 1PGB A; 3Q8A A; 3VH3 B; 1WXV A; 2V4L A; 2G4S A; 2N7D A; 2WYQ A; 2LGY A; 5D6J B; 3ALB A; 4XX5 A; 2CHZ A; 1LFD A; 3ZVV A; 3HM3 A; 1E5W A; 4PS7 A; 3IG3 A; 2MJD A; 1QOF A; 3ONS A; 2FID A; 1DOI A; 4M0W A; 2MJ3 A; 4US8 A; 1F52 A; 1NI3 A; 3PTF C; 1WJ4 A; 3LDZ E; 2MP2 B; 3TJP A; 3X0W A; 3BK1 A; 3NJT A; 1XT9 B; 3Q8B A; 2KVZ A; 2E6X A; 1R4M B; 2WHI A; 1E8Z A; 3ZRC A; 3IAM 1; 4FJV B; 2Y5C A; 1WJU A; 2N9K A; 1I4Q A; 2EKE C; 3DHI C; 4KDI C; 1TTN A; 2JSV X; 5KHO A; 3A33 B; 2K0P A; 4P16 A; 3HK0 A; 5AZG A; 1SXT A; 2MBH A; 1WSP A; 3UQA A; 4M8N A; 3RN9 C; 3ML9 A; 5DCN A; 4CQN A; 1ZUD 2; 3Q3M C; 4MJS A; 3ZXR A; 2YEP B; 2VH2 A; 3AEA B; 2R2Q A; 4IWQ A; 2BGF A; 2KMA A; 1NDD A; 2GLS A; 1YX5 B; 2KTF A; 1XF5 L; 5BMG A; 4BAX A; 3U2S C; 3ZKJ C; 5IA7 A; 3DWM A; 5G2N A; 1WJN A; 3B2G A; 2KJH B; 2NBW B; 1XEE A; 4WWM A; 4N9F 4; 2UWQ A; 4GDK B; 3A1Q B; 1FIQ A; 4PYU A; 2PIA A; 2WXM A; 2GI9 A; 3R8B A; 2JZZ A; 2J7Q B; 2B76 B; 1ZKH A; 4UDU C; 1EU3 A; 3OAW A; 2KTR B; 4XWW A; 3R2T A; 2KXJ A; 4IWO A; 1L0Y B; 3AE4 B; 3GB1 A; 5IO9 A; 1I7H A; 4N6E B; 4II2 B; 4KZC A; 3APF A; 4G0N B; 3SHQ A; 4YTM B; 4NPN A; 3KUD B; 2W3R A; 4W9E A; 2D3B A; 4KGR A; 2RR9 A; 3SDL C; 3AU5 A; 5D3D A; 2MP2 A; 4MH8 A; 4ZYS A; 2OJR A; 1VZ6 A; 3PRZ A; 2LJI A; 3CWI A; 1JRP A; 2W9N A; 2QJL A; 1JWM D; 3KLS X; 4KKJ A; 3DBL I; 2QSD A; 2FBW B; 3IBE A; 2G1E A; 2J0K A; 1QQR A; 3KQ4 A; 2AQ3 B; 3PHX B; 1N5W A; 5IOI A; 1AYF A; 2ZNV B; 1PFD A; 2NBU A; 1UH6 A; 4KIK B; 4DK5 A; 1SF0 A; 3E9S A; 1WFY A; 2KAN A; 2O2V B; 1YOV B; 3J9C A; 3KWL A; 3L10 B; 1FD6 A; 1GOZ A; 3IXS A; 1FCC C; 5E6P A; 5EE0 A; 4W9D A; 1BXT A; 1GB4 A; 1QIL A; 2LXC A; 3P63 A; 3PZ7 A; 1JWS D; 2L76 A; 3SEB A; 4C7Z A; 2JF5 A; 1HTO A; 3BK2 A; 1YJ1 A; 2KMM A; 3PS6 A; 4DXG A; 2ON8 A; 1GC7 A; 3U8Z A; 4RGM A; 4WWO A; 4GDK A; 3HM6 X; 4IW0 A; 1SJH D; 2BW2 A; 3A1Q A; 4AWJ A; 1WYG A; 4KX6 B; 2WX1 A; 4LJP B; 2ICI A; 3ZW3 A; 4DHZ B; 3DVN V; 4LK0 M; 4P1B C; 3VUX A; 4USA A; 4WWN A; 2KTR A; 5JH5 C; 1P98 A; 3T8M A; 5IP4 D; 4DHJ B; 3NVV A; 3KUC B; 5AUI A; 1HQR D; 5C3J B; 5JHA A; 3P2B A; 2VZK D; 4D2K A; 2HD5 B; 2FUG 1; 1WGG A; 2PVO D; 2N9X A; 1PGA A; 5BMH A; 4ZRP A; 1ZXI A; 3JW0 X; 4AP4 C; 3FC4 A; 1BML C; 1WGH A; 3BII D; 2IYD B; 2XK5 B; 1EO6 A; 2BS4 B; 4X57 B; 2KWD A; 2LMC A; 2RDG A; 2HTM E; 1MJD A; 4DXA B; 2LGS A; 5FK9 C; 2MRP A; 3TSS A; 4BKS D; 2Q5W D; 2L0T A; 2CHW A; 2XBB C; 3I5J C; 4IDI A; 2IO3 B; 2C7H A; 3AEF B; 1JW9 D; 1BUI C; 4KIK A; 1LQB A; 5HKH A; 1STE A; 2R2O A; 2O2V A; 4MSQ B; 1EF5 A; 2GMI C; 2MBO A; 4MDK E; 3QWZ B; 4JWS C; 3RUI B; 1ACC A; 3CMM B; 4WJO A; 3N20 C; 4W9H A; 4YWG G; 1E8X A; 2O6V B; 3PRE A; 3RYT A; 2JZ3 B; 4NNJ B; 2HTH A; 4TQ1 A; 2MSE D; 3EFU A; 1KRH A; 2BS2 B; 2V0G A; 3ABV B; 1KOT A; 3H7S A; 4GLS C; 2AWT A; 3U7Z A; 1NI2 A; 3L13 A; 2MHJ A; 1GC6 A; 2PJH A; 2UYZ B; 2ZVO A; 2REX A; 3L08 A; 5D2M B; 1C4A A; 1WRI A; 3MJW A; 1V49 A; 1F1H A; 3B0A A; 3QA8 A; 1N63 A; 2L52 A; 3W2D A; 4ZRK A; 5I4D A; 2LWP A; 1WI0 A; 4YTP B; 3MC0 B; 3PO0 A; 3VTW A; 4ANU A; 3VHT C; 2L1A A; 1VRA B; 1ZPS A; 3TEX A; 3RT3 B; 3ZTD A; 2K25 A; 2YVC A; 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3NZS A; 1YN3 A; 4OVV A; 4K7S A; 2DAF A; 2J42 A; 1UGM A; 1F0Z A; 1FRR A; 3JVZ X; 4A3O A; 2NR2 A; 2JUO A; 1MI0 A; 3GP7 A; 1NYQ A; 3R7Q A; 4FN2 A; 2XEW A; 4RF1 A; 4CHK A; 1AWD A; 3U30 A; 4URK A; 5LLI A; 3ZO5 B; 2JRH A; 1FXT B; 3AXC A; 3NHE B; 3SU8 X; 2Z0D B; 3VUW A; 3CST A; 2ZCC A; 1XCQ L; 4ZRQ A; 4A6Q A; 2M4N A; 3RFZ B; 5LXI B; 5BYQ A; 1FNV A; 4F7Z A; 2NVU I; 2D3G A; 3ENE A; 1UUP A; 1B1Z A; 4PS8 A; 1UEL A; 2FUH B; 3QK0 A; 1JAL A; 5D3I B; 5C23 A; 2MBB B; 2JXX A; 3M63 B; 3NVY A; 4RCO A; 1TS3 A; 3AV8 A; 2LVQ A; 3NOB A; 3Q3J A; 5GXG B; 2ZJD A; 2LHE A; 3DVG X; 1WR1 A; 1AN8 A; 1FEH A; 2FNJ B; 2V3S A; 3OJ4 B; 5HFY A; 1P1A A; 3RI7 C; 3P42 A; 3W9C B; 3GE3 C; 3RNA C; 3ZDT A; 2K6Q A; 4ZOH C; 2MEK A; 1LGR A; 2CU1 A; 4CO7 A; 4JPS A; 4IOI E; 1I4X A; 2WXJ A; 4ZYN A; 1UF0 A; 4YTN B; 1YIW A; 4N58 A; 3V62 A; 1WH3 A; 2MW5 A; 4US9 A; 2B3A A; 2NS5 A; 1YJI A; 3NZU A; 2WNM A; 1KLV A; 3MHS D; 4NAW A; 2K5P A; 4RGO S; 1UBQ A; 2KMC A; 1Z2M A; 2DYB A; 1FFV A; 3L17 A; 2KOX A; 1WGD A; 1E7V A; 1I4H A; 1TIF A; 1YJJ A; 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