The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TTYKLVINGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the C2 fragment of streptococcal protein G in complex with the Fc domain of human IgG.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
IGG1 MO61 FC
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| molecule tags |
Complex (antibody/antigen)
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
14
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-01-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FCC C; 2ZW1 A; 1HEZ E; 4KGR A; 1PGA A; 2JWU A; 1MHX A; 4IKG A; 4HKZ E; 4MAC A; 1F2R C; 2RMM A; 1F2R I; 5HI1 A; 4OZA A; 4HJG E; 2QSD A; 2KAC A; 1MI0 A; 1P7E A; 2LGI A; 2QMT A; 1MHH E; 2KN4 A; 2OED A; 1XF5 L; 2J53 A; 4OZC A; 3GB1 A; 1FCL A; 1K53 A; 1XCT L; 2N9L A; 2ZW0 A; 2LHE A; 4D2K A; 2JU6 X; 4GLS C; 2IGD A; 3FIL A; 1IBX B; 1IGC A; 2IGH A; 1YNT E; 1D4B A; 1KH0 A; 1JML A; 1UWX A; 2JSV X; 5JXV A; 2J52 A; 4KGT A; 1K52 A; 5BMG A; 2ONQ A; 1HZ5 A; 1QKZ A; 2N9K A; 1HZ6 A; 1GB4 A; 1YMH E; 1GB1 A; 1Q10 A; 1ZXH A; 1EM7 A; 1K51 A; 2EEL A; 1MVK A; 5BMI A; 2N7J A; 1C9F A; 1MPE A; 4KGS A; 1K50 A; 2I2Y A; 2JXT A; 4OZB A; 2NMQ A; 5BMH A; 5HFY A; 2KDM A; 1XCQ L; 1IBX A; 1PGB A; 1P7F A; 2I38 A; 5HHD G; 2JZP A; 1PGX A; 1FD6 A; 3V3X A; 2KQ4 X; 4IOI E; 3UI3 A; 2RPV A; 2GI9 A; 2K0P A; 2PTL A; 2KWD A; 1IGD A; 4WH4 A; 2PLP A; 2LUM A; 2IGG A; 5HG2 A; 2GB1 A; 2ON8 A; 2LHD A; 3FIL B; 2PW9 A; 3MP9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NOB A; 2Y3A A; 2ZW1 A; 3AM9 A; 2ACZ B; 1TYG B; 3AU4 A; 3UQA A; 2K22 A; 5C1Z A; 3U7Z A; 1FFV A; 3ENE A; 2L32 A; 2REX A; 4OW0 A; 4LNO A; 5HI1 A; 5AUI A; 1J7B A; 1JCK B; 2JZ3 B; 1WE6 A; 4RNA A; 3UIN B; 2KAC A; 1ZP0 B; 2BVC A; 2DZK A; 2N7D A; 2N9E B; 3I57 A; 4GDL B; 4O1N A; 2WXP A; 2ZZP B; 1UZX B; 4HDQ A; 3H9D A; 3WA0 A; 2W3S A; 4BKS D; 3BYY B; 4HPM B; 3ZNG C; 3VR8 B; 2WDV B; 1XLQ A; 3HM6 X; 1A70 A; 5JXV A; 2BKR B; 3MTN B; 4DK5 A; 3V6C B; 3DOW A; 2JUO A; 2M1M A; 4NAW A; 4W9C A; 3RT3 B; 1N61 A; 2XNA C; 4KZC A; 3Q8F A; 4YSX B; 1ZOY B; 4J6I A; 4OVV A; 2R2O A; 1JWB D; 5CHW A; 3L16 A; 3TBL D; 3URY A; 1WYW B; 1K51 A; 4C00 A; 1VD2 A; 2PEA A; 3A4S C; 4B6W A; 2JQR B; 1KOT A; 4GDK B; 4HVB A; 1U4A A; 4XWW A; 1UH6 A; 3TEX A; 4XYC A; 4NQL B; 1L5P A; 4OZB A; 1FFU A; 3I9V 1; 3QAR A; 1UD7 A; 3RNE C; 1P7F A; 4I6N B; 1Q0W B; 4L23 A; 2H89 B; 5DPR A; 2KD0 A; 1E8W A; 2V4I B; 3UF8 A; 5GMV A; 3RI7 C; 2K0P A; 3AE9 B; 5G5G A; 3RFZ B; 2JXX A; 4YTM B; 1V1P A; 4WQM A; 3T3O A; 4W9I A; 3T3N A; 2WLB A; 3RYT A; 2YEP F; 1IP9 A; 1FXA A; 3B2F A; 4N9F 4; 4AQ7 A; 1NYQ A; 1FMA D; 1SB3 C; 5AZH A; 4B95 A; 2JWU A; 4GXB A; 4HKZ E; 2D07 B; 2KFK B; 3HIZ A; 1WGY A; 3FKY A; 2MSE D; 3EC8 A; 2NBV B; 1MHH E; 2K8H A; 4ZYN A; 3KYC D; 1R4N I; 3PRP B; 1OFF A; 3V61 A; 3NJT A; 5BO4 B; 4BOS C; 4LTU A; 2K1F A; 3QCA A; 1WRD B; 4D2K A; 4GLS C; 1N5W A; 3DBR B; 1QF6 A; 2XK5 B; 4HPP A; 1HTO A; 2WXG A; 1TTN A; 1UGJ A; 1BT0 A; 1I42 A; 4F8C B; 1C4P A; 2J7Q B; 1ZKH A; 3PGE A; 2Z59 B; 4HPL B; 2ZNV B; 2HTH A; 3K9O B; 3LDZ E; 1FEH A; 5IOI A; 2H88 B; 2GBN A; 2V1Y A; 2QCZ A; 5CTR C; 1JWU D; 1WWT A; 4BVU C; 3Q6B A; 1FXT B; 3M62 B; 1VCB A; 2DZI A; 1D6E C; 4II2 B; 2FCQ A; 3K9P B; 1WM2 A; 4W9F A; 3KVF B; 1L0V B; 1T0Y A; 3B0A A; 2J0M A; 4YTN B; 1WY8 A; 2PE9 A; 2G1E A; 3R7Q A; 3PZ8 A; 4LK0 M; 2OJW A; 2D3A A; 2WQY B; 3ZJV A; 4M00 A; 5IN7 A; 2W82 A; 1FNV A; 2M19 A; 5D3I B; 3SEB A; 4JL9 A; 3ZNH B; 3OAW A; 1TZ1 A; 5G5H A; 4RF1 A; 4JIO U; 4AJY B; 2C9W B; 1V97 A; 4MJS B; 1YN5 A; 2MBB B; 1SXT A; 1XF5 L; 2V0G A; 1QLB B; 4JLC A; 2GBR A; 3UIP B; 2NCN A; 4CYE A; 1UBQ A; 2RSU A; 3FIL A; 2LMC A; 2K8C A; 3RUI B; 1E7V A; 2RDB C; 2V3S A; 2WDR B; 3W5U B; 3SR6 A; 1Y8R C; 1XO3 A; 2XN9 C; 4F7Z A; 2LFI A; 3VUX A; 2UYZ B; 1PFD A; 2LGS A; 3ONS A; 4FN2 A; 3WCQ A; 1TZO A; 1NEK B; 4YSZ B; 2CJN A; 3PSE B; 4GIV A; 2BWF A; 2DAF A; 2G4D B; 1DYQ A; 1L4Z B; 1WX9 A; 1R7S A; 1IPG A; 4WWM A; 3IAS 1; 1WX7 A; 5EE9 A; 1YQ3 B; 1SIF A; 2KFJ A; 2MP2 B; 2WXN A; 1K50 A; 1C79 A; 3I63 C; 1WIA A; 3A9K A; 1J8C A; 5HFY A; 3GS2 A; 3DVN U; 1WE7 A; 1PGB A; 2FE8 A; 1L0Y B; 1STE A; 3AMZ A; 1ZXI A; 4DHZ B; 1AAR A; 2W54 A; 4IM0 A; 2GI9 A; 2LGD A; 3Q3O C; 4TKN A; 2JVC A; 2MLB A; 2QIE B; 5GXG B; 4HRS A; 1BUI C; 2EMT A; 1TY2 A; 1UGM A; 2PW9 A; 2KMA A; 3V6E B; 1RRB A; 3O13 A; 4KSL C; 3QIJ A; 4ZRI A; 1XD3 B; 3RNB C; 3DVG Y; 4JWS C; 1WMH B; 3FAH A; 2KWU B; 5G2N A; 1V5O A; 5JHA A; 3ZVV A; 4BOZ B; 1ZUD 2; 1P9D U; 1WGK A; 5IP4 D; 2KWV B; 4XDC A; 3KLS X; 3EEC A; 4MEM A; 4OZA A; 1GPX A; 2QSD A; 1V86 A; 1VZ8 A; 2LAS A; 4US9 A; 4ICU A; 1E8X A; 3VR9 B; 3O65 B; 2D3B A; 3AE6 B; 2N9L A; 5E6O A; 2IGD A; 4YTP B; 1IBX B; 3AI5 A; 3ZDT A; 3HVZ A; 1F1H A; 2JSV X; 3E9S A; 4K7W A; 3P4P B; 3I3T B; 2J52 A; 4KGT A; 2D3C A; 3AE1 B; 2ONQ A; 4MT5 A; 4YL8 A; 3Q3J A; 3ZW3 A; 3NS1 A; 3N1Z C; 5JHB A; 1HZ5 A; 3VTW A; 1WH3 A; 3KW5 B; 4IM3 A; 4A55 A; 2CR5 A; 4JE3 B; 3TEZ A; 2L8J A; 2OHF A; 3KH0 A; 3JVZ X; 2QEJ C; 2KO3 A; 3OWE B; 2V3N A; 2AQ3 B; 4EZK A; 3JW0 X; 2QDF A; 5J18 A; 1T0S C; 4J3O D; 1TKE A; 1N6Z A; 3LB8 C; 2RD0 A; 3BWU D; 3HM3 A; 2BS4 B; 1DGJ A; 1RAX A; 3AB5 A; 3GOE A; 2KXJ A; 1IYF A; 1XLO A; 2N1V A; 1PGX A; 1TBE A; 3PZ7 A; 1YX5 B; 2JRI B; 1ISN A; 3IAM 1; 2KWD A; 4FBJ B; 4WWO A; 4GU2 A; 2GB1 A; 3ZJU A; 2AEH A; 3WAP A; 4JPS A; 1KJT A; 3JYU A; 1GNU A; 1E5W A; 1SJH D; 2GOW A; 3N30 A; 1KF6 B; 2KMM A; 3NS8 A; 1VR9 A; 3KYD D; 4BFR A; 4DXG A; 1SJE D; 3ETR A; 4PYZ A; 2SEB D; 1L4D B; 2Z0D B; 1K53 A; 1OEY J; 1QZE A; 2MBE A; 2PKO A; 3BY4 B; 1L6U A; 2K5P A; 2O6V A; 3N9Y C; 1XCT L; 3ZDM C; 1YJI A; 2EKE C; 5CHF A; 3U30 A; 4PT5 A; 4LNF A; 3ABV B; 5KHQ A; 3BVZ A; 4R3D A; 2KTR A; 1D4B A; 1L7Y A; 2D3G A; 3ZNI D; 1Z2M A; 4E3C A; 3B9J A; 3MC9 A; 1WXS A; 3AH7 A; 1D5M C; 1KTK A; 2LGX A; 4N58 A; 1E7U A; 4Q2J A; 1WJU A; 2C60 A; 4WWP A; 5FKA C; 1C1Y B; 3T8M A; 4C4V A; 1FNU A; 2N9X A; 1GB1 A; 4HCN B; 1RYJ A; 2Y5B B; 1P3Q U; 3EFU A; 2DX5 B; 1RWS A; 4ITK A; 2DLB A; 3AU5 A; 1P1A A; 3U8Z A; 5D94 A; 4ARC A; 5E6N A; 2ZPN A; 4LNN A; 3VFK A; 2CJO A; 3ML8 A; 1SF0 A; 1EU3 A; 4M0W B; 2INC C; 4LJP B; 1C4A A; 5HHD G; 5L95 C; 1FD6 A; 2OOB B; 2LRW A; 4RCO A; 2CU3 A; 5HG2 A; 2DWQ A; 3DHG C; 4K81 A; 4EEW A; 3A33 B; 2ZPY A; 2BT6 A; 4IM2 A; 2CHX A; 4AOF A; 4LDT D; 3A1Q B; 1G6J A; 2R2Q A; 2D5G A; 3H1U A; 5AZF A; 2RMM A; 4NZL B; 1PQS A; 1TGZ B; 2AL6 A; 3ZO5 B; 2FUH B; 4PK1 A; 4WJN A; 3QHT A; 4IWQ A; 1JAL A; 2ZCB A; 3DQV A; 2VZK B; 3AEF B; 2KKC A; 2GLS A; 3R7R A; 5CHV C; 2GBM A; 4BBN C; 1JML A; 3SFD B; 1LGR A; 2C5L C; 1EF1 A; 3Q14 C; 3L10 B; 1C77 A; 1F52 A; 4BKT A; 4HWI B; 3IHP C; 3KUC B; 4E74 A; 2KDE B; 1NI2 A; 4MDK E; 3AEG B; 1T0R C; 3AE7 B; 3OJ3 A; 5IKC M; 2FBW B; 4CO7 A; 1XT9 B; 4ANX A; 4MH0 E; 2BBC A; 3OLM D; 1JRP A; 5JZE B; 5D7G A; 3L0W B; 2MHJ A; 3TJP A; 2NMQ A; 1YOV B; 5C23 A; 3IBE A; 1P0R A; 5J2R A; 3DHH C; 2JYE A; 3TL5 A; 2KQ4 X; 2O2V A; 4A6Q A; 4WJO A; 2E6X A; 2PIA A; 1WGR A; 3D32 A; 2IO0 B; 2KAN A; 1YJJ A; 1L6V A; 3VTV A; 3L4P A; 4A20 A; 4W9L A; 2J0K A; 4KGR A; 1ET6 A; 1WX8 A; 2WXM A; 1VDV A; 5TR5 A; 4MM3 B; 1OGW A; 4OHJ A; 1RFK A; 3AEB B; 1MHX A; 1YIW A; 3IG3 A; 1WXQ A; 3GE8 C; 3U2S C; 5G55 A; 2L83 A; 3RUL A; 4C7Y A; 2WYQ A; 3A1Q A; 4ZRP A; 3DHI C; 3RNA C; 4XDD A; 3MHS D; 4FLH A; 2M17 A; 3OG5 A; 4WQO B; 2RPQ A; 3DDC B; 1GJZ A; 2KDF B; 4K3C A; 1WF9 A; 1K52 A; 1K8R B; 3UIO B; 2LD9 A; 2L76 A; 1WZ3 A; 3J9C A; 4P16 A; 2V4L A; 2IO2 B; 4DHJ B; 1ZXH A; 1V8C A; 5D6J B; 4B0E A; 2KMC A; 3H7P B; 1FM0 D; 2ASQ A; 3NZS A; 4GDL A; 1CZP A; 4G0N B; 3N1X C; 1SE2 A; 2D10 A; 4DQO C; 2LJ5 A; 3KWV A; 5C3J B; 1KLG D; 3IT6 B; 4BKG A; 1JWM D; 3RCZ A; 2JZP A; 4W9E A; 1R4M I; 1I4X A; 1QOB A; 1EF5 A; 2EMS A; 4PS3 A; 5J17 A; 5IAA C; 1I7H A; 1QIL A; 2FCS A; 4FXC A; 1LQB A; 3MP9 A; 3RD2 A; 3GE3 C; 3QJZ A; 3Q3N C; 1PDX A; 4YXD B; 1F0Z A; 1KLU D; 4GDK A; 2PE6 B; 1T0Q C; 1H8C A; 2L0F A; 2O6V D; 3ZIM A; 2AWT A; 3PRE A; 1TY0 A; 1E8Z A; 2SAK A; 4TV3 A; 3TUO A; 1XQQ A; 4ANU A; 2MJ3 A; 2J53 A; 1HXY D; 1E9M A; 5C2T B; 2GBJ A; 2KX3 A; 5E6P A; 3A9J B; 4NJC A; 2MBQ A; 3AUL A; 4FA6 A; 3IXS A; 3RNC C; 4E71 A; 2D11 A; 1AW7 A; 1MG8 A; 1ZE3 D; 2WXQ A; 4MSM B; 3AEE B; 3PO0 A; 4ZRJ A; 5IO9 A; 4K3B A; 1GB4 A; 3PHW B; 1JRO A; 4NNJ B; 4CHK A; 2KFK A; 1YQB A; 4MSQ B; 1EWY C; 2IND C; 5EE3 A; 1YN4 A; 4OVZ A; 4FUL A; 4URK A; 1C4C A; 3KUZ A; 2DZM A; 1YJ1 A; 1FNW A; 1CK1 A; 1SIJ A; 2N7J A; 1KM7 A; 3JSV B; 3ZTC A; 3EHV A; 2KNB A; 2C7N B; 3M95 A; 2KJR A; 2RR9 A; 4REZ A; 4USA A; 3Q69 A; 4W9D A; 3RNG C; 2WHI A; 3ZLZ A; 4ZYS A; 2LVP A; 2XK5 A; 2L3Z A; 4NPN A; 2L7R A; 3NVV A; 2BYV E; 2V9H A; 4GSW A; 1C3T A; 2Y5P A; 2ZVO A; 2RPV A; 1NI3 A; 2PVG C; 4NQK E; 2M56 B; 4WH4 A; 1YN3 A; 3C0R B; 2NTS A; 4KV2 A; 1WJ4 A; 4ZRQ A; 2NR2 A; 4RGO S; 2CHW A; 1HE8 A; 3H6N A; 4MGK E; 3N20 C; 2A4Z A; 2FCN A; 3VUW A; 1ROE A; 4AWJ A; 4IKG A; 4MEL A; 1GG3 A; 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3BYT B; 2FAZ A; 1AWD A; 2BB5 A; 3M63 B; 3CIR B; 2N9P C; 2KT7 A; 3MFG A; 3DWM A; 4ZHO A; 2LGY A; 1Q1O A; 3I5J C; 2L05 A; 1SSN A; 1UF0 A; 2FIF A; 3PV1 A; 2MA9 B; 2ZNV C; 3RZF A; 4JWU C; 1YNT E; 2HD5 B; 3PS6 A; 4WJQ A; 5EDS A; 2NBU A; 4WIP A; 3SHQ A; 3EGR A; 2JRH A; 4QAY A; 1WMH A; 3PTF C; 3B08 A; 4EZJ A; 1D3Z A; 1QKZ A; 4DWF A; 1QOF A; 1SE9 A; 4BAX A; 4ZOH C; 4W9J A; 2JZZ A; 5EE0 A; 1NEN B; 3ZRC A; 2L00 B; 2TSS A; 2Q5W D; 2EEL A; 1HTQ A; 1WR6 E; 1RLF A; 5DPS A; 2IPK D; 1TS4 A; 4X57 B; 3N3K B; 4KZ0 A; 4RGN A; 1WR1 A; 5BYR A; 2WXH A; 4KIK A; 1I4H A; 2UWQ A; 1IBX A; 2N7E A; 4N6E B; 3R3M A; 2VH2 A; 3NRZ A; 2BB6 A; 3P63 A; 2ZJD A; 3UI3 A; 3UGB B; 2WX0 A; 2L52 A; 2BS3 B; 4XE0 A; 5JH5 C; 3Q3M C; 4ACF A; 4XZ4 A; 4NJ7 A; 2C7H A; 1J7A A; 3EUB 2; 4TUU A; 3R8B A; 4XC2 A; 3W1S A; 4FHJ A; 3MC8 A; 3VTU A; 2ZCC A; 4LLG M; 4DXA B; 4MGY E; 2DZJ A; 5DCN A; 2BYF A; 1HEZ E; 1R4M B; 3HUI A; 1XLP A; 2LUE A; 4LCD E; 2MH7 A; 4M02 A; 3ZNZ B; 2MW5 A; 3ZXV A; 4EUT A; 3PRM B; 2DHZ A; 3BIN A; 4HXD A; 1E6E B; 4FJV B; 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