The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
MIKVLFFAQVRELVGTDATEVAADFPTVEALRQHMAAQSDRWALALEDGKLLAAVNQTLVSFDHPLTDGDEVAFFPPVTGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of molybdopterin synthase and its evolutionary relationship to ubiquitin activation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MOLYBDOPTERIN CONVERTING FACTOR, SUBUNIT 1
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
23
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N5W A; 5AUK A; 2MJ3 A; 1DOY A; 1JWA D; 1KF6 B; 2N0S B; 2E3T A; 2B76 B; 3AH7 A; 4WQM A; 2H89 B; 4ZHO A; 1JRO A; 2LEK A; 1CJE A; 1FRD A; 3NVZ A; 1EWY C; 1JWB D; 1N60 A; 1N62 A; 5AUI A; 2KMM A; 4YXD B; 3FAH A; 1OQQ A; 4A9A A; 3P4S B; 2MH7 A; 1L6V A; 1RM6 C; 4YTM B; 4ZHP A; 5G5G A; 2QJL A; 1JQ4 A; 3AEA B; 3AE3 B; 1FRR A; 3NS1 A; 1TKG A; 1QOA A; 4N6E B; 3B2F A; 1QLB B; 1CZP A; 2WS3 B; 3L4P A; 1N5X A; 3AE7 B; 2CU3 A; 4IDI A; 4C7Z A; 1WYG A; 1XO3 A; 2L83 A; 2JQR B; 3NVV A; 4C80 A; 2W3R A; 1IUE A; 1TKY A; 3EUB 2; 4JWS C; 1NVI D; 2OHF A; 3ABV B; 2L52 A; 4LTU A; 3AEB B; 3W5U B; 1SB3 C; 3AE8 B; 1R7S A; 1UWM A; 3NVW A; 4WWM A; 1SF0 A; 2MJE A; 1XLP A; 1YJJ A; 2K9X A; 1J7B A; 2FBW B; 4YT0 B; 1E9M A; 4US8 A; 5MPO A; 3P4P B; 3CWI A; 1ZUD 2; 2WLB A; 1FO4 A; 1NEK B; 1PUT A; 5H92 C; 4ITK A; 3AE9 B; 1DOI A; 1WRI A; 3NVY A; 1DOX A; 1J7A A; 1FXI A; 1TKE A; 2M19 A; 2Y5C A; 1B9R A; 1VDV A; 3P4R B; 3ZYY X; 1JAL A; 1JW9 D; 3VRB B; 1F0Z A; 2WU2 B; 1GAQ B; 5C2T B; 5GXG B; 4P6V F; 3DWM A; 2K22 A; 3HVZ A; 1T3Q A; 1N61 A; 4HRS A; 5EE1 A; 3VR9 B; 1RYJ A; 3AED B; 3AE2 B; 4YSY B; 1NYQ A; 1OFF A; 1QOG A; 2CJO A; 2WU5 B; 3AEE B; 1AWD A; 1FFU A; 1KRH A; 1TYG B; 4ZOH C; 1FXA A; 2EKI A; 3AE6 B; 3AV8 A; 1FFV A; 3PO0 A; 1SIJ A; 1NI3 A; 1V97 A; 3W5V B; 2W55 A; 2MJD A; 3LXF A; 2G1E A; 3SR6 A; 4US9 A; 4YSZ B; 2WDV B; 2BT6 A; 3HUI A; 3VRA B; 2QIE B; 4N59 A; 1XLQ A; 4C7Y A; 5EE9 A; 3HRD D; 1FM0 D; 1WWT A; 2BS4 B; 1KFY B; 3AEF B; 3W9C B; 1ZOY B; 3P4Q B; 1QF6 A; 2WDR B; 1RFK A; 3RPF C; 3WCQ A; 1J7C A; 1VLB A; 1YQ3 B; 3AEC B; 3AM9 A; 3AEG B; 3AMZ A; 3FC4 A; 4USA A; 1OQR A; 2WQY B; 1DGJ A; 1L5P A; 1XLN A; 1WGK A; 1NYR A; 5EE0 A; 1E10 A; 1E6E B; 2BS2 B; 2DBY A; 1L0V B; 2WDQ B; 3B2G A; 2PIA A; 4N58 A; 1N63 A; 1XLO A; 4FXC A; 1VJK A; 3DWG C; 2DWQ A; 5H8Y E; 5EE3 A; 1NEN B; 2WP9 B; 3AN1 A; 1JRP A; 2ACZ B; 2BS3 B; 1RWS A; 1ZP0 B; 3AE1 B; 1QT9 A; 5G5H A; 2AX5 A; 3B9J A; 2KAJ A; 4HRO A; 1E0Z A; 1YQ4 B; 3ETR A; 1PFD A; 2HTM E; 1TJE A; 2CJN A; 2M56 B; 3KWL A; 1A70 A; 1FMA D; 3AE5 B; 2PVO D; 1I7H A; 1QOF A; 2JX5 A; 2H88 B; 3AB5 A; 3P1M A; 1ROE A; 1YJI A; 1WXQ A; 3BII D; 4YTN B; 2PKO A; 1L6U A; 1ZXI A; 1FIQ A; 2W54 A; 3LB8 C; 3SFE B; 4YSX B; 1QOB A; 3AE4 B; 2Q5W D; 3P63 A; 4KX6 B; 2W3S A; 1GPX A; 4JWU C; 4YTP B; 3SFD B; 4JX1 C; 1PDX A; 3VR8 B; 5C3J B; 2K5P A; 2PVG C; 1E7P B; 1AYF A; 3CIR B; 3NRZ A; 1V8C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3DDC B; 3ZO5 B; 1EWY C; 1N62 A; 4YTM B; 4LJO B; 2V4I B; 2N7D A; 2IND C; 3NS1 A; 1WH3 A; 1OEY A; 2KHW B; 3TJP A; 1FXT B; 4RF1 A; 4IDI A; 1MFW A; 3I63 C; 3AI5 A; 1E8Y A; 4HCN B; 2AQ1 B; 4GDL A; 4W9D A; 2J0J A; 3EHV A; 3Q2A C; 4RNA A; 2LZ6 A; 4KKJ A; 1ZGU B; 4OZB A; 2IO2 B; 2ZNV B; 1YJ1 A; 1IBX A; 2KQS A; 2MBE A; 4XZ4 A; 4W9E A; 1I4R A; 1D5X C; 3DQV A; 2L8J A; 5GXG B; 2KWU B; 3DWM A; 2Z8L A; 4BBN F; 1N6Z A; 4M8M A; 2M8S A; 1FFU A; 2DLB A; 2M1M A; 4OW0 A; 4IG7 B; 1V97 A; 2V3S A; 2Y5P A; 1FEH A; 4RCO A; 1D6E C; 2KYW A; 1YN4 A; 1X1M A; 1RFK A; 2KTR A; 2NMQ A; 1T5X D; 3W1Y A; 2G3Q B; 1V6E A; 3AUL A; 2ICI A; 3H7S A; 1XLN A; 4ZRK A; 5EE0 A; 1GNU A; 4XYC A; 4KGS A; 2JRH A; 2GBK A; 2KLG A; 2WXH A; 5TSS A; 1KH0 A; 4C56 C; 4FJZ A; 2WXM A; 4IC7 B; 4W9F A; 2K25 A; 1XD3 B; 2KDE B; 3RNG C; 1VZ7 A; 2INN E; 1KJT A; 4GDL B; 3VR8 B; 2PVG C; 3H9D A; 3GS2 A; 2GMI C; 2V9H A; 4EOY A; 3PGE A; 4MSQ B; 5D3D A; 1TBE A; 2DZM A; 2GBR A; 4MDK E; 2WXN A; 1I4G A; 3NVZ A; 1N60 A; 1IBX B; 2UU7 A; 2B3A A; 2KJH B; 4K7W A; 3AEA B; 3SEB A; 4HPM B; 3RNE C; 2PJH A; 2CU3 A; 3BWU D; 4ZRP A; 1GUA B; 1KLG D; 5HKH A; 2V3N A; 2G9H D; 4YT0 B; 4AP4 C; 3P4P B; 2EKE C; 2Z59 B; 1B1Z A; 4FN2 A; 4B6W A; 2JYT A; 2FUH B; 2KTR B; 2NBU A; 1SBB B; 2E6X A; 4ICU A; 5HFY A; 3RNA C; 4KKI A; 5DPT A; 2J42 A; 1LGR A; 3KVF B; 1T3Q A; 1LFD A; 3EA6 A; 1WX7 A; 4MH8 A; 4HPP A; 5IKC M; 3HIZ A; 2D3G A; 4YSZ B; 3MC8 A; 2AQ3 B; 1PYW D; 5T8I A; 4RGT A; 3I3T B; 1TZ1 A; 3RPF C; 3V3X A; 3Q8F A; 3ZDT A; 1OQR A; 1WGK A; 1WYW B; 4KIK A; 2DBY A; 2N9K A; 4IW0 A; 3ZXR A; 3DWG C; 1BUI C; 3QAR A; 1Q10 A; 1NEN B; 3A4S C; 4W9L A; 1RLF A; 2WXG A; 2UWQ A; 2XN9 C; 4FLH A; 1RWS A; 2LWP A; 3V05 A; 1JWU D; 2IGH A; 3AE5 B; 1I7H A; 3Q6B A; 4BKT A; 4P1C C; 1FIQ A; 2Q5W D; 3KLS X; 1GPX A; 3IBE A; 1MJD A; 2BYF A; 4MGK E; 4E3C A; 1V8C A; 1P3Q U; 4MGI E; 1JWA D; 2AL6 A; 3AH7 A; 4OZA A; 4C00 A; 1S3S G; 4DK5 A; 3DBR B; 3W1S A; 3QA8 A; 2N7J A; 2RDH A; 5BYQ A; 4NZL B; 3DVN V; 4ARC A; 1I4P A; 4IM2 A; 2LMC A; 1ZKH A; 2NPT A; 2MHJ A; 3NVV A; 2BYE A; 1NDD A; 5IO9 A; 4AJY B; 3TSS A; 1JML A; 2N9P C; 4WUR A; 2GRI A; 2FCN A; 5JHA A; 3AE9 B; 1DOX A; 4GDK A; 2K8C A; 4GIV A; 3ECI A; 4HPL B; 1M4V A; 1JW9 D; 2O6V D; 4LK0 M; 1CK1 A; 2KOX A; 4KIK B; 1J19 A; 2AYO B; 3HVZ A; 2WX0 A; 3KUZ A; 3UI3 A; 1ET6 A; 1OFF A; 2HD5 B; 5L83 A; 1HQR D; 1FFV A; 1ZPS A; 1V1O A; 2LFI A; 4N59 A; 3Q69 A; 3C0R B; 1SE9 A; 1V5T A; 3BZD B; 3BK1 A; 1VLB A; 4USA A; 1EF1 A; 5TR5 A; 3MP9 A; 4QAY A; 3DPD A; 1ZDX A; 3AN1 A; 4ANV A; 1ZW7 A; 3PLV A; 3WIM A; 1HTQ A; 3N20 C; 4MM3 A; 1WZ0 A; 3ZDM C; 2NPT B; 1FD6 A; 4E74 A; 2KWV B; 2BB5 A; 2W3S A; 2WGS A; 4FBJ B; 3CIR B; 3NRZ A; 2IO1 B; 1TT5 B; 2BF8 B; 1UF0 A; 4GGQ A; 4OVV A; 3KYC D; 3P42 A; 1E8W A; 4GDK B; 1VZ8 A; 4W9G A; 2BKF A; 5FKA C; 1JRU A; 4KDL B; 3RYT A; 2JQR B; 3L54 A; 2HDE A; 2C7M B; 3ZNI D; 2G4S A; 4HWI B; 3W5U B; 1R7S A; 2G4D B; 4ZRJ A; 4WWM A; 1TY2 A; 5JXV A; 2V4L A; 2J52 A; 3OJ3 A; 1C3T A; 1ZUD 2; 4IOI E; 3MJW A; 4MEL A; 4RMA A; 4J3O D; 3NZS A; 3URY A; 2VH2 A; 2LJ5 A; 1WMH B; 2DEN B; 3V61 A; 4HRS A; 4RM9 A; 4XX5 A; 3GOE A; 1KOT A; 3L16 A; 1MPE A; 5J18 A; 1TYG B; 1FXA A; 3AV8 A; 1LO5 D; 3W5V B; 4MM3 B; 3HM3 A; 1XLQ A; 4G0N B; 1V2Y A; 2BS4 B; 1ZOY B; 4HLE A; 4K3B A; 1E8Z A; 1YQ3 B; 1YMH E; 4JGH B; 3WAL A; 3IAM 1; 4NAM A; 1XF5 L; 4B95 A; 4MEM A; 3NHE B; 1R4N I; 2K8B A; 2LRU A; 2KX3 A; 3RNF C; 5EE3 A; 3O13 A; 5AZH A; 5G5H A; 1TS5 A; 1PGX A; 3B9J A; 2KQ7 A; 2KTF A; 1WGR A; 1Y56 A; 2PVO D; 2JX5 A; 2PE6 B; 1Z5S B; 2MBQ A; 1BT0 A; 4ACF A; 3P63 A; 3GP7 A; 3HM6 X; 3ZTD A; 1G6J A; 2YLM A; 3PZ7 A; 2N0S B; 2E3T A; 2B76 B; 4ZHO A; 5LXI B; 1VD2 A; 1FRD A; 3ENE A; 2XK5 A; 3KQ4 A; 4MT5 A; 2ZCC A; 4YXD B; 3ONS A; 2D3B A; 1ZE3 D; 3UGB B; 1TKG A; 3B2F A; 5CTR C; 1UH6 A; 3DVN U; 2KWC A; 3ABV B; 1SE3 A; 3U7D A; 2LJI A; 2IO3 B; 2KAN A; 1J7B A; 4LLG M; 2AQ2 B; 1E9M A; 3KUC B; 3DBR I; 1DOI A; 3IHP C; 3M63 B; 3VRB B; 2LGI A; 2NTT A; 5CHW A; 1YNT E; 1P0R A; 1T0S C; 1MG4 A; 1JCK B; 3PS6 A; 1QOG A; 2WU5 B; 2WXQ A; 2BVC A; 4ANW A; 3GZN I; 4K81 A; 1WGG A; 2YVC A; 3CST A; 1D5M C; 1NI3 A; 4BOZ B; 2MJD A; 4MGZ E; 5CX3 A; 2BKR B; 3EFC A; 1DYQ A; 4KVG B; 2JZP A; 2NBV B; 4HXD A; 3QWZ B; 1ESF A; 3AEC B; 2LD9 A; 3AEG B; 2LUM A; 3IXS A; 2IGD A; 4IWQ A; 2JYE A; 3OWE B; 4OHJ A; 2WDQ B; 2KZR A; 2XK5 B; 2BYV E; 1VJK A; 4MJS A; 4I6P A; 1JRP A; 1WR6 E; 1WRD B; 2KAC A; 2QMT A; 1C9F A; 4HDO A; 1WR1 A; 1WE7 A; 1VR9 A; 2CKH B; 3BY4 B; 2M56 B; 3KWL A; 1IYF A; 1L6U A; 1BXT A; 1QOB A; 1SGH A; 1C78 A; 1E90 A; 4XWT A; 2K1F A; 3ZJU A; 4NAW A; 4FAD A; 2FCQ A; 2W9N A; 1HZ5 A; 1GG3 A; 2H89 B; 1P1A A; 1JRO A; 2WYQ A; 2JXX A; 2KMM A; 3N30 A; 3GE8 C; 3T8M A; 4DHZ E; 5D7G A; 4ARI A; 4NJ6 A; 1PGA A; 2IBI B; 4HJK A; 2BPS A; 4PS8 A; 2WXI A; 3CSF A; 4MH0 E; 4BOS C; 1WYG A; 3ZXV A; 3VUX A; 2LVO A; 2CU1 A; 2VZK D; 4GSW A; 1K52 A; 1XQQ A; 2WXF A; 1XLP A; 1MI0 A; 2LUE A; 1L0Y B; 1U4A A; 4WWO A; 1PQS A; 2JZZ A; 1WX9 A; 4FA6 A; 1MHX A; 3MHS D; 1LM8 B; 3P2B A; 2D2Q A; 1FXI A; 1TKE A; 1F9J A; 1VDV A; 3ZYY X; 4AQ7 A; 1E8X A; 4TV3 A; 1YX6 B; 3AU5 A; 2K0P A; 3PHW B; 3AED B; 4MJS B; 4NJC A; 2EEL A; 4GOC A; 4KGT A; 3PV1 A; 4W9H A; 2ZW1 A; 4A20 A; 2DHZ A; 3KUD B; 4HEA 1; 5EE9 A; 3NG0 A; 3QIJ A; 5E6J A; 2IO0 B; 4NAW B; 3BVG A; 4L23 A; 3V6C B; 2INC C; 2M4N A; 1NYR A; 3R66 C; 1R4M B; 1E6E B; 2BS2 B; 1BML C; 3HVD A; 4P16 A; 1XLO A; 1TS4 A; 2KDB A; 1ET9 A; 4GB9 A; 2DWQ A; 1PGB A; 1TGZ B; 1WXS A; 4P1B C; 5I4D A; 1WXV A; 2L3Z A; 4AOF A; 1QZE A; 3U52 E; 1TJE A; 4PYZ A; 1QIL A; 1I4H A; 1FPY A; 2H88 B; 3BII D; 3A4R A; 3DBS A; 3SFE B; 3C8Y A; 2GBJ A; 4XWW A; 4XGA B; 3OJ4 B; 5D2M B; 2J7Q B; 3R2I A; 2WWZ A; 4I6L B; 4G11 A; 4URK A; 4DHJ B; 1JWB D; 2KO3 A; 3BVZ A; 4WJQ A; 2CHW A; 4ZYS A; 1HA5 A; 2DZJ A; 3JSV A; 2GB1 A; 2MLB A; 2MSE D; 2LVQ A; 4NNJ B; 5L95 C; 1HXY D; 3T9L A; 1GJZ A; 5HG2 A; 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3ML8 A; 3DHH C; 3EEC A; 1F0Z A; 3QAQ A; 1WY8 A; 5CHV C; 2DAJ A; 1AW7 A; 2TSS A; 3GB1 A; 4HCP B; 3RZW C; 5HHD G; 3N3K B; 3SD5 A; 1GC6 A; 4JPS A; 3AE6 B; 4ASW C; 5FR6 A; 2N7E A; 3H6N A; 1P98 A; 1E7U A; 1YX5 B; 2MBB B; 3UIP B; 3AEF B; 3W9C B; 2WDR B; 4S0R A; 3RCZ A; 3WAN A; 1J0G A; 1LQB A; 1WGY A; 2K3U A; 3Q14 C; 3B2G A; 1V1P A; 2KFK B; 3N9Y C; 2FIF A; 4LNK A; 3RI7 C; 4DXG A; 2WHI A; 4RGO S; 1C79 A; 1V86 A; 1QT9 A; 4ICV A; 2HTM E; 2ON8 A; 3DBL B; 1I4Q A; 1WXQ A; 1WGD A; 2J53 A; 4JWU C; 3NY5 A; 3IT4 B; 1WMH A; 1YD8 U; 3M62 B; 3RD2 A; 1R4M I; 1MHH E; 3T3N A; 1C76 A; 1KLU D; 1CJE A; 4B9K A; 4ANX A; 3NS8 A; 4BZA A; 2OJR A; 2A5U A; 2D10 A; 4ZHP A; 4EE2 A; 2ZVN A; 3EFU A; 3RT3 B; 3JYU A; 3VAW A; 3AE3 B; 1H8C A; 4HJG E; 2AWT A; 3O65 B; 2PTL A; 4HDQ A; 1N5X A; 3TEW A; 4C80 A; 5C23 A; 4F1S A; 2JU6 X; 1IPG A; 2LXC A; 4A6Q A; 2NVU I; 3CMM B; 2INP E; 1F2R I; 2LGS A; 1E5W A; 1T0R C; 4DBG A; 2OJW A; 1WRI A; 3NVY A; 1J7A A; 4K7U A; 2XEW A; 3T3O A; 4CQN A; 2MCN B; 4A3P A; 1V1P B; 3VTW A; 1GB1 A; 2IY0 B; 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