The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
MIKVLFFAQVRELVGTDATEVAADFPTVEALRQHMAAQSDRWALALEDGKLLAAVNQTLVSFDHPLTDGDEVAFFPPVTGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of molybdopterin synthase and its evolutionary relationship to ubiquitin activation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MOLYBDOPTERIN CONVERTING FACTOR, SUBUNIT 1
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| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| total genus |
22
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF02597 | ThiS | ThiS family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SB3 C; 4WQM A; 1DOX A; 3EUB 2; 3AN1 A; 1JW9 D; 3LB8 C; 4YTP B; 3B9J A; 3RPF C; 3DWM A; 1N5X A; 3P1M A; 1E10 A; 1WGK A; 3P4Q B; 2OHF A; 1PDX A; 3SR6 A; 1EWY C; 1QOA A; 4C7Y A; 1OQR A; 1DOY A; 1KFY B; 1QOF A; 3P63 A; 1XO3 A; 1NEN B; 2WU5 B; 3HUI A; 1L5P A; 2K9X A; 2L83 A; 1FMA D; 3AEC B; 4YSX B; 3B2G A; 1RM6 C; 5C3J B; 2FBW B; 1L0V B; 1TKY A; 2W54 A; 3FAH A; 4USA A; 2DWQ A; 3AE7 B; 1FFV A; 1ROE A; 1TYG B; 5EE9 A; 2B76 B; 1YQ4 B; 4WWM A; 1KF6 B; 1R7S A; 1L6V A; 1WWT A; 2BS2 B; 2DBY A; 2WU2 B; 3P4S B; 2QJL A; 2KMM A; 3P4R B; 4C7Z A; 1FIQ A; 3NRZ A; 5C2T B; 1TKE A; 1FO4 A; 2MJE A; 3NVY A; 1NI3 A; 1AWD A; 3DWG C; 2W3S A; 3AE5 B; 4YSY B; 3AE4 B; 5AUK A; 2CJO A; 3AB5 A; 3SFD B; 4ITK A; 3KWL A; 1JRO A; 1PFD A; 3BII D; 4JWS C; 3CWI A; 3AMZ A; 1FXI A; 1QF6 A; 1JRP A; 1AYF A; 1NYQ A; 1N5W A; 2PIA A; 2K5P A; 2WDQ B; 2CJN A; 3AH7 A; 3CIR B; 3PO0 A; 5GXG B; 2WS3 B; 4C80 A; 3AE9 B; 5H92 C; 2H88 B; 5MPO A; 1T3Q A; 2PKO A; 4FXC A; 1NYR A; 3AE6 B; 2MJ3 A; 3ETR A; 1XLO A; 2HTM E; 1ZUD 2; 2KAJ A; 1L6U A; 1OFF A; 1NVI D; 4YTN B; 3AE3 B; 3NVW A; 2QIE B; 4YSZ B; 3AE1 B; 1J7A A; 1NEK B; 4IDI A; 1RYJ A; 3NVV A; 5H8Y E; 4KX6 B; 4LTU A; 3AEB B; 1QT9 A; 4YTM B; 4HRS A; 1ZOY B; 1JAL A; 2JQR B; 4N6E B; 2BS4 B; 2M19 A; 3NS1 A; 2BS3 B; 1TJE A; 1TKG A; 1VJK A; 1XLP A; 4US9 A; 4US8 A; 1CJE A; 1RFK A; 1WRI A; 2CU3 A; 1GPX A; 3AV8 A; 1FXA A; 1OQQ A; 1SIJ A; 1VLB A; 2H89 B; 1E0Z A; 1IUE A; 2Y5C A; 2AX5 A; 1DOI A; 1JWA D; 5EE1 A; 3W5V B; 3AED B; 1CZP A; 3VRB B; 3AE8 B; 3SFE B; 3WCQ A; 1V8C A; 1ZP0 B; 2WLB A; 4P6V F; 4ZOH C; 1YQ3 B; 1J7C A; 2M56 B; 2JX5 A; 2W3R A; 1E9M A; 2WDR B; 1YJJ A; 3AEG B; 3P4P B; 1B9R A; 1FFU A; 1XLN A; 2WQY B; 5G5H A; 1SF0 A; 2ACZ B; 2PVO D; 2WP9 B; 3HVZ A; 2L52 A; 3L4P A; 3AM9 A; 1UWM A; 3ABV B; 4HRO A; 1N62 A; 3HRD D; 5EE0 A; 1WXQ A; 1WYG A; 1GAQ B; 2MH7 A; 4ZHO A; 3W5U B; 2MJD A; 4N59 A; 1FRD A; 3VR8 B; 1QOB A; 2N0S B; 5AUI A; 1J7B A; 2EKI A; 1E7P B; 5G5G A; 1N60 A; 3B2F A; 2BT6 A; 3LXF A; 3AE2 B; 2E3T A; 1KRH A; 2LEK A; 4YT0 B; 2G1E A; 5EE3 A; 3AEA B; 2WDV B; 1FRR A; 2PVG C; 3AEE B; 4JWU C; 3VRA B; 1QOG A; 2W55 A; 3ZYY X; 1JQ4 A; 2Q5W D; 1N61 A; 2K22 A; 3NVZ A; 3VR9 B; 4ZHP A; 4YXD B; 1VDV A; 4A9A A; 4JX1 C; 3AEF B; 1DGJ A; 1XLQ A; 1A70 A; 1E6E B; 1QLB B; 1YJI A; 1V97 A; 1FM0 D; 1F0Z A; 1PUT A; 3FC4 A; 1RWS A; 1ZXI A; 1I7H A; 3W9C B; 1JWB D; 1N63 A; 4N58 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I4Q A; 2N9X A; 3KVF B; 2KWV B; 1OQR A; 3SHQ A; 4BKG A; 1HE8 A; 4BVU C; 5BYR A; 3OAW A; 2IO1 B; 1FIQ A; 3VHT C; 1TKE A; 2MJE A; 1XCQ L; 3NVY A; 1LO5 D; 5KHQ A; 2JYT A; 3DPD A; 1ZGU B; 3ZW3 A; 2J0J A; 3AE4 B; 3AB5 A; 3WAM A; 4LNF A; 4MSM B; 2D11 A; 1Q0W B; 5AEK B; 3CWI A; 3H1U A; 3R2I A; 3TEX A; 5MPO A; 3V6E B; 3BVG A; 5JHB A; 2HE7 A; 1ZUD 2; 2GB1 A; 2K8B A; 3NHE B; 3EGR A; 2M1M A; 2SEB D; 3T3O A; 4B9K A; 1T0S C; 5J18 A; 5L95 C; 3V3X A; 2K3U A; 2BYF A; 2MBH A; 3RNA C; 1WMH B; 1IUE A; 1JWA D; 2LRU A; 1CZP A; 1KLG D; 3ZJT A; 1L0X B; 2BPS A; 3PRE A; 2OJW A; 4TUU A; 1FFU A; 2ASQ A; 1YN5 A; 2KC2 A; 2PVO D; 2NBV B; 3IFW B; 4G3X B; 4BFR A; 3E9S A; 3VFK A; 2VZK D; 2LUM A; 3VH3 B; 1YMH E; 1GAQ B; 2RPV A; 2QHO A; 1FRD A; 1WM2 A; 2Y3A A; 3RNG C; 5FR3 A; 3A9J B; 1WJN A; 1KJT A; 1T5X D; 2FCN A; 3L54 A; 3W2D A; 2WXF A; 3I63 C; 3ZJV A; 3Q8F A; 4MM3 A; 3ML8 A; 2MW5 A; 1QLB B; 3ENE A; 2VRR B; 4IM2 A; 4JGH B; 5IN7 A; 2Y5B B; 3KUZ A; 2CHW A; 5TSS A; 4A90 A; 1E5W A; 1EWY C; 2ZPN A; 3HIZ A; 4EUT A; 4AS1 A; 1KFY B; 2WXK A; 3HUI A; 1D5X C; 1N6Z A; 2KD0 A; 4PYU A; 5EE9 A; 3P4S B; 4KZC A; 2HDE A; 4ICU A; 2KN5 A; 1WX8 A; 3P42 A; 4FJV B; 3L0W B; 1RRB A; 2INC C; 3DVN V; 1AAR A; 2K6Q A; 2W82 A; 3KWL A; 3C0R B; 2YEP F; 3PHW B; 1N5W A; 5IP4 D; 3U4E G; 3LYY A; 1T3Q A; 4CHK A; 3AE6 B; 4NQK E; 1UGJ A; 3VVW B; 3Q69 A; 3PGE A; 4KIK A; 1IBX A; 4A55 A; 4YSZ B; 1CQV A; 4KZ0 A; 4MGI E; 1SJH D; 1C9F A; 4BKT A; 4HRS A; 2V0G A; 1JAL A; 2Z8L A; 3QC8 B; 2WWZ A; 3UGB B; 4S0R A; 2XNA C; 2MRP A; 2J0K A; 2LVO A; 1WIA A; 2AL6 A; 2D3C A; 2EMS A; 4TQ0 A; 1X1M A; 3KUC B; 4GN1 A; 4EZL A; 2M8S A; 4WIP A; 2DYB A; 1L4D B; 1FEH A; 3QIJ A; 1E8Z A; 4LNN A; 2BB6 A; 4WWN A; 3GOE A; 2BKR B; 3DVN U; 1UWM A; 2QMT A; 3N20 C; 5IOI A; 2FUH B; 3CST A; 1PQS A; 2D10 A; 2J4X A; 2BT6 A; 3PPA A; 2E3T A; 3MC8 A; 3AEE B; 4YWG G; 3VR9 B; 1GUA B; 4RF1 A; 1XLQ A; 2JWU A; 2KQS A; 1QIL A; 4N58 A; 1SB3 C; 4HDO A; 1N5X A; 2BQQ A; 1XCT L; 1P9D U; 3A1Q A; 1PGB A; 3RYT A; 4EFO A; 5IKC M; 3P63 A; 4MAC A; 4MJS A; 4WAF A; 1WFY A; 3ZO5 B; 4K81 A; 2V3N A; 4PK1 A; 4GB9 A; 2JY6 A; 4GOC A; 1KLV A; 1FD6 A; 5BMG A; 3ZRC A; 4W9L A; 1WX7 A; 2KFK B; 4RGT A; 2KOX A; 3TIX A; 4LJO B; 4UDU C; 2G4D B; 3OJ4 B; 3N1Y C; 4R3D A; 4PYZ A; 2LFI A; 1D5Z C; 1WM3 A; 2GBK A; 5DCN A; 4AJW A; 2MSE D; 2O2V A; 1R4M B; 2V3P A; 2HTM E; 2KLC A; 3AE1 B; 2AEH A; 1E8W A; 1PYW D; 1YN4 A; 3RFZ B; 1TT5 B; 1WRI A; 2DAJ A; 3Q8A A; 4AWJ A; 3GZN B; 1WGG A; 1TGZ B; 2QDF A; 1E7U A; 4KVG B; 1ZP0 B; 2KQ4 X; 3GE8 C; 4IKG A; 2HJ1 A; 3D32 A; 3FIL B; 3L16 A; 1UD7 A; 2IND C; 3MP9 A; 4HWI B; 2MH7 A; 2L76 A; 2IO0 B; 2WXJ A; 3N9Y C; 1UGM A; 4WUR A; 5IAA C; 3WAP A; 2XK5 A; 4WJQ A; 2LWP A; 3AEA B; 1FRR A; 4TSS A; 1TS2 A; 1HXY D; 1MPE A; 4MGY E; 4ZHP A; 2V4L A; 1L7Y A; 3DHI C; 3MC9 A; 3C19 A; 5D6J B; 2WXN A; 4LK0 M; 3BY4 B; 4YTP B; 5AZH A; 3DBH B; 4JE3 B; 1E10 A; 2KTR B; 3KH0 A; 3BYT B; 3PS6 A; 4HDQ A; 3CSF A; 3N1Z C; 1QOF A; 4PS3 A; 4AP4 C; 2WU5 B; 1VR9 A; 1C76 A; 3V05 A; 3B2G A; 4BBN C; 1L0V B; 2B76 B; 1WYW B; 1F0Z A; 5D7G A; 4RNA A; 1WXV A; 1IP9 A; 3IAM 1; 3ZNZ B; 1WR6 E; 5AUK A; 5LLI A; 4X57 B; 3IHP C; 4E71 A; 1EU3 A; 2MBE A; 4MH0 E; 1UBI A; 2J0M A; 2BKF A; 4OZA A; 3L10 B; 1MHH E; 2JF5 A; 2NPT A; 2JVC A; 5D3D A; 1OFF A; 1SE2 A; 2QIE B; 1V1P B; 3BVZ A; 5H8Y E; 4KX6 B; 1RAX A; 2M0X A; 3AEB B; 2J53 A; 3BYY B; 4ZYN A; 1MG8 A; 2DAF A; 4DHJ B; 2H89 B; 2QIL A; 2ON8 A; 1WY8 A; 2YVC A; 4DQO C; 3ZUN A; 2W3R A; 3NS8 A; 4NAM A; 3HM6 X; 5G5H A; 4GDK B; 1E7V A; 4HK2 A; 1LQB A; 2L0F A; 4FBJ B; 3APC A; 2V1Y A; 1UUP A; 5TR5 A; 4LDT D; 2IY1 B; 1M94 A; 3LXF A; 3PLU A; 1TZ1 A; 2JXX A; 2UU7 A; 2OJR A; 2KXJ A; 4RMA A; 4HCN B; 1JQ4 A; 1QOG A; 2KQ7 A; 4ANU A; 4NPN A; 3IAS 1; 4PS7 A; 3U8Z A; 3QAQ A; 3ALB A; 4C4V A; 1QOA A; 4KDI C; 2KWC A; 2BW2 A; 1FNU A; 3AEC B; 1SJE D; 2N7E A; 1RM6 C; 2FBW B; 4WJP A; 2M17 A; 4GGQ A; 2BS2 B; 2GBR A; 3P4R B; 1V1O A; 4C7Z A; 4IM3 A; 1FO4 A; 3AXC A; 5KHO A; 2J42 A; 3R7R A; 2IO2 B; 2W3S A; 4XDD A; 1I4R A; 4ITK A; 4TMA B; 2WYQ A; 3CF6 E; 3MHS D; 2JT4 B; 4FXC A; 5HKH A; 5E6O A; 3N3K B; 4RH6 A; 1NVI D; 2ZVN A; 1ZXH A; 1EU4 A; 3CMM B; 2KYW A; 2KKC A; 1M4V A; 1UBQ A; 2LJ5 A; 4N6E B; 2BS4 B; 1JWU D; 2BBC A; 4AUQ C; 1VJK A; 2D3G A; 3X23 A; 4A20 A; 4HKQ A; 1LXD A; 3R7Q A; 5DPR A; 1SSN A; 1SXT A; 2N7J A; 1EF1 A; 5DPS A; 2NCN A; 1FNW A; 3AE8 B; 4B0E A; 2FCM A; 1EM7 A; 2KJH B; 3Q8B A; 2BTE A; 1YQ3 B; 4ARI A; 4FUL A; 3ZNH B; 2X8X X; 3P4P B; 3A4R A; 2ACZ B; 1J8C A; 3B08 A; 1N62 A; 3TMP B; 3DHG C; 1F2R I; 4MEL A; 2KDE B; 3L13 A; 4KKJ A; 4N59 A; 2MBQ A; 4J6I A; 2C7H A; 4IW0 A; 3ECI A; 3O13 A; 4Q2J A; 2WDV B; 4RGN A; 3ZYY X; 2D3B A; 2Q5W D; 4II3 B; 4M0W A; 4XYC A; 3L17 A; 2R2O A; 2LD9 A; 4XDC A; 1TS3 A; 1N63 A; 1MG4 A; 3DHH C; 3QA8 A; 2MBO A; 4DHZ B; 2UYZ B; 1JRU A; 5CHW A; 1XT9 B; 1YX5 B; 2N7D A; 4C56 C; 4TV3 A; 2ICI A; 2DBY A; 3BVM A; 4XC2 A; 1VZ6 A; 4K3C A; 3NG0 A; 3I5J C; 2RD0 A; 4N9F 4; 2MP2 A; 2Z0E B; 2JWZ A; 3WIM A; 4NNJ B; 2MHJ A; 1QF6 A; 3NY5 A; 2K5P A; 3RT3 B; 3VAW A; 2RPQ A; 3L08 A; 1RLF A; 2PKO A; 1LGR A; 3V62 A; 4CQN A; 4URK A; 4YTN B; 4K7U A; 4LNO A; 4NAW A; 3VUY A; 4JL9 A; 1P7E A; 2G9H D; 3ZGZ A; 1KLU D; 3OG5 A; 2BWE S; 1ZDX A; 2BS3 B; 4US8 A; 4US9 A; 2WXM A; 3TL5 A; 3ONS A; 1S3S G; 1OEY A; 4EKU A; 1YNT E; 3QK0 A; 2E6X A; 1F1H A; 4ZOH C; 3RNC C; 2WXQ A; 4GXB A; 1UF0 A; 3IXS A; 4B6W A; 4ANW A; 3DCG A; 1TS5 A; 2W9N A; 3HRD D; 1Z2M A; 2KJR A; 3WAL A; 5IO9 A; 2JUO A; 2MJD A; 3OWE B; 3APD A; 1S1Q B; 2C60 A; 1Y8R C; 5AZF A; 1WJ4 A; 2MQJ A; 3VTV A; 4MGK E; 1TY0 A; 2L3Z A; 1EUV B; 1T0Y A; 3ML9 A; 4JX1 C; 3RD2 A; 4W9C A; 2I38 A; 3M63 B; 1WH3 A; 2IYD B; 4HPP A; 2KLG A; 3SR6 A; 2JSV X; 2ZNV C; 4C7Y A; 1SE4 A; 4FHK A; 3IT6 B; 3HHM A; 1JCK B; 4L1B A; 1YX6 B; 1R4N B; 2C5L C; 1WGH A; 4KSL C; 1TYG B; 3H8H A; 5E6N A; 3W1S C; 2KMM A; 5BYQ A; 2IZV B; 4DDI D; 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4LNK A; 4MSQ B; 2AL3 A; 2LXA A; 1ENF A; 2BVC A; 3A9K B; 3EEC A; 1F52 A; 2X38 A; 2V4I B; 3I3T B; 2R2Q A; 3DBR B; 4GDL A; 5LXI B; 2WXR A; 1XLP A; 2Y5P A; 2WXG A; 3AV8 A; 1VZ8 A; 1SIJ A; 2PLP A; 2QC8 A; 3NZ3 A; 1DOI A; 2L8J A; 3R3M A; 1HTO A; 3ZVV A; 4XX5 A; 2GLS A; 1YD8 U; 2LGS A; 3SDL C; 1XLN A; 3HVZ A; 3H6N A; 2WHI A; 2ZCB A; 3K9P B; 4FJY A; 5FR6 A; 4ZRQ A; 4HLE A; 2NTS A; 3MJW A; 3QAR A; 4RM8 A; 4O1N A; 3V60 A; 3IT4 B; 4HXD A; 3KYD D; 1E8Y A; 4ZDV A; 1UEL A; 1D6E C; 1T6B X; 1YJI A; 2C9W B; 3PHX B; 3H7P B; 2JPH A; 5FK9 C; 1T0R C; 2KDB A; 2M0A A; 4BOS C; 2L00 B; 2G45 B; 5CTR C; 1V2Y A; 3LDZ E; 1XF5 L; 1WMH A; 1IPG A; 4G50 A; 2ZNV B; 4RCO A; 4USA A; 4BOZ B; 4REZ A; 2LGD A; 1R7S A; 2KDI A; 4F7Z A; 2O6V B; 1VCB A; 3U2S C; 1NI3 A; 3Q14 C; 1C77 A; 1AN8 A; 1PFD A; 1I4P A; 2WXP A; 1Y56 A; 1HEZ E; 3TUO A; 3A9J A; 4EZK A; 1ACC A; 2MBB B; 1OGW A; 5AZG A; 4OZC A; 3NVW A; 1J7A A; 2KAC A; 2MP2 B; 1V9J A; 1E8X A; 4XGA B; 1GC7 A; 2EKE C; 2R61 A; 3UQB A; 1QZE A; 2Y5C A; 4JQW C; 3N1X C; 1EWC A; 3SFE B; 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