The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
72
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structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHGMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVVPKAYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conversion of monomeric protein L to an obligate dimer by computational protein design.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Finegoldia magna
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| total genus |
12
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GB4 A; 2OED A; 4KGR A; 4D2K A; 1PGX A; 2ZW1 A; 5BMH A; 4GLS C; 2IGG A; 1C9F A; 1ZXH A; 2KWD A; 2IGH A; 2PW9 A; 1P7E A; 1XCT L; 1UWX A; 2GB1 A; 2J53 A; 4IKG A; 1HEZ E; 1FCC C; 2NMQ A; 2JU6 X; 4OZB A; 1MVK A; 2RPV A; 2N9K A; 1MHX A; 4KGT A; 1F2R I; 1K53 A; 1K50 A; 2QSD A; 2GI9 A; 4MAC A; 2ONQ A; 2ZW0 A; 3FIL B; 2LGI A; 4WH4 A; 2PLP A; 1F2R C; 1HZ6 A; 3GB1 A; 1YMH E; 3FIL A; 2RMM A; 1FCL A; 5JXV A; 2JSV X; 2PTL A; 4HJG E; 1MPE A; 2ON8 A; 1XCQ L; 1HZ5 A; 1KH0 A; 5BMG A; 1K52 A; 3UI3 A; 1MI0 A; 1PGB A; 5HHD G; 1IBX B; 1JML A; 2KQ4 X; 2N7J A; 2I38 A; 2J52 A; 4KGS A; 2KN4 A; 1IBX A; 4OZA A; 2I2Y A; 2KDM A; 2JXT A; 1FD6 A; 1Q10 A; 1D4B A; 5BMI A; 2LUM A; 1MHH E; 2QMT A; 1PGA A; 4IOI E; 4HKZ E; 2K0P A; 4OZC A; 2N9L A; 2KAC A; 1EM7 A; 3V3X A; 1XF5 L; 1QKZ A; 2LHE A; 5HI1 A; 1GB1 A; 1K51 A; 5HFY A; 2IGD A; 2EEL A; 2LHD A; 5HG2 A; 1IGC A; 2JWU A; 3MP9 A; 2JZP A; 1YNT E; 1P7F A; 1IGD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3DVG X; 1D5Z C; 2GBJ A; 1LO5 D; 3ZRC A; 1PGX A; 1V1P B; 4YXD B; 4IWO A; 4JWS C; 4HRO A; 1Z2M A; 2D07 B; 4WIP A; 2RSU A; 4NJ6 A; 4LCD E; 3MJW A; 2XNA C; 1EWC A; 2NCN A; 5IO9 A; 4TUU A; 1JWA D; 4JX1 C; 4L23 A; 4S0R A; 4MGZ E; 4YSY B; 4B9K A; 1K50 A; 1S3S G; 3AU4 A; 4C80 A; 3ML9 A; 2QJL A; 3PV1 A; 3ZNZ B; 2V4I B; 3R7R A; 3H6N A; 4KIK B; 4PYU A; 3KW5 B; 3RNC C; 3VFK A; 1QOF A; 3DBH I; 2WXI A; 1YJJ A; 4I6P A; 1L0X B; 3P4R B; 1Q1O A; 1Z5S B; 4G11 A; 1MPE A; 2WHI A; 2BKF A; 2JQR B; 4II3 B; 3SEB A; 3AE9 B; 3VDZ A; 2O6V B; 1IBX B; 3A9K B; 4KZ0 A; 2KDE B; 4M00 A; 4OVU A; 4ZHO A; 4A9A A; 3APC A; 5DPS A; 2HJ8 A; 2YEP B; 2OJW A; 4MGI E; 3GE3 C; 2M0A A; 3AEC B; 1KLU D; 1LXD A; 1FD6 A; 2CU3 A; 1XQQ A; 2G45 B; 2K8B A; 1EU3 A; 3L08 A; 1D6E C; 1EM7 A; 2ACZ B; 2IZV B; 4RGN A; 3T8M A; 4C7Z A; 3ZXR A; 4JL9 A; 4FN2 A; 4RCO A; 3PRZ A; 3AE8 B; 2AEH A; 4REZ A; 1L2N A; 1FIQ A; 2YEP F; 2JPH A; 3AEB B; 4NAW B; 2LVO A; 2NBU A; 2FUG 1; 4LLG M; 1L0Y B; 2WYQ A; 4TKN A; 4K7W A; 2L7R A; 3CMM B; 3VQI A; 1HTQ A; 2LFI A; 1WSP A; 2C9W B; 1WH3 A; 1AAR A; 2CU1 A; 2A4Z A; 4LDT B; 2L05 A; 3RNE C; 3UIO B; 2G4D B; 2ZJD A; 2GLS A; 2LMC A; 2JU6 X; 4HCN B; 1WE6 A; 2RPV A; 3KYC D; 1ZXI A; 2N9K A; 3DBR I; 2IO1 B; 2C7M B; 2IND C; 4GDK B; 1M4V A; 4KDI C; 4YTN B; 5D7G A; 3P42 A; 3AMZ A; 1NEK B; 4DXA B; 3GP7 A; 4N59 A; 2OHF A; 2ZVN A; 3AUL A; 2GMI C; 4TSS A; 2QDF A; 1WXM A; 3V61 A; 1KM7 A; 4HRS A; 3LB8 C; 1NVI D; 1WGD A; 3B2F A; 2KAJ A; 3NZ3 A; 1DGJ A; 2NPT A; 3ZVV A; 1RRB A; 3PHW B; 5H92 C; 1BT0 A; 4NQK E; 2I2Y A; 2V3S A; 2BS4 B; 4NAM A; 3CST A; 3DBS A; 2AQ3 B; 1WYG A; 4W9C A; 4A3P A; 2J0K A; 4ZDV A; 1C78 A; 1AYF A; 2L32 A; 4TV3 A; 3APF A; 4W9I A; 3U4E G; 1C3T A; 1TBE A; 3DVG Y; 3LJ3 A; 2JY6 A; 2INN E; 3AEA B; 3MP9 A; 3A9J A; 3MC8 A; 2RD0 A; 3UIN B; 3WAP A; 2ICI A; 2OED A; 1WX8 A; 3WIM A; 2KYW A; 4PT5 A; 4I6N B; 2IGG A; 1YN4 A; 3ZDT A; 3RYT A; 5C3J B; 4FAD A; 1ET6 A; 5G55 A; 4TQ1 A; 2NVU I; 2LD9 A; 1FFU A; 3VH4 B; 3W5U B; 2FAZ A; 1OEY J; 3N20 C; 3Q69 A; 4FHK A; 1TKG A; 1MFW A; 2MBE A; 4DBG A; 1MHX A; 2J0J A; 2L83 A; 4W9E A; 1SJH D; 1SXT A; 1GC7 A; 2KKC A; 1QF6 A; 4MAC A; 2ONQ A; 4WWP A; 3I57 A; 3KYD D; 1E8Z A; 3WAN A; 1TY2 A; 2SAK A; 4G0N B; 1NDD A; 4J6I A; 5CHW A; 3AB5 A; 4KIK A; 3DQV A; 4ZRI A; 1JWM D; 1WJ4 A; 2QHO A; 1RLF A; 1SSN A; 4HCP B; 1JW9 D; 1ISN A; 2CHX A; 3PLU A; 2N7J A; 3LXF A; 1J7A A; 3H7P B; 3NVY A; 2O6V A; 1IBX A; 3A9K A; 3HIZ A; 1P98 A; 5D2M B; 3S2A A; 1QIL A; 4JE3 B; 1PDX A; 4EOY A; 3H9D A; 1PQS A; 3DOW A; 2KC1 A; 3IFW B; 4DXF A; 2DEN B; 1FNV A; 5BMI A; 2QMT A; 4I6L B; 2KX0 A; 1VR9 A; 1J7B A; 2SEB D; 1C4A A; 3PZ8 A; 3PLV A; 1HE8 A; 3QJZ A; 1UGJ A; 1V6E A; 2RR9 A; 4W9J A; 4M0W B; 2KTR B; 2NS5 A; 4JPS A; 1ACC A; 2Y3A A; 5IAA C; 3PO0 A; 4JGH B; 1TIF A; 1E8X A; 4D2K A; 2DZI A; 3UGB B; 3TEZ A; 4L1B A; 3NVV A; 4NAW A; 1E8Y A; 5LXH A; 1XO3 A; 4GGQ A; 4J3O D; 4A55 A; 2KWD A; 4HLE A; 2IJ0 A; 4DHZ B; 5JZE B; 3NHE B; 5EDS A; 3GOE A; 5BYR A; 1R4N I; 1VCB A; 2K1F A; 1UEL A; 1E90 A; 1WR1 A; 3RNA C; 2KLC A; 1T0R C; 5G5G A; 3RN9 C; 2G3Q B; 2V3P A; 3I3T B; 4HVB A; 4PYZ A; 1NI2 A; 2N9X A; 3J9C A; 4JIO U; 1F0Z A; 4GDK A; 5CHV C; 3VUY A; 1YMH E; 3R2T A; 5JXV A; 2L1A A; 2C5L C; 2WP9 B; 3NVZ A; 1SB3 C; 1UNS A; 1VRA B; 2KZR A; 2V9H A; 2MBO A; 1HZ5 A; 3IT4 B; 1FFV A; 3QAR A; 1WZ3 A; 2JYT A; 3HRD D; 2K39 A; 3RNF C; 4A6Q A; 3NJT A; 2BYE A; 3ECI A; 1UBI A; 2D3C A; 3QC8 B; 2AWT A; 3N1Y C; 4IG7 B; 1JCK B; 4OZA A; 1PUT A; 4ARC A; 3TUO A; 3M3J A; 1TZO A; 2M1M A; 1NYQ A; 4LNO A; 4DQO C; 2CR5 A; 5TR5 A; 3ZUN A; 2M56 B; 4OZC A; 2KDI A; 3DBL I; 3C0R B; 2BGF A; 2CHW A; 2D3A A; 1MG8 A; 2EEL A; 3AED B; 2Z0D B; 5HG2 A; 4LNF A; 1T0Y A; 3B9J A; 3DCG A; 2VRR B; 1N5X A; 2MJD A; 3IVF A; 2JZ3 B; 3RI7 C; 4KVG B; 4KGR A; 4EZL A; 4K3B A; 4KZC A; 1YX6 B; 2FNJ B; 2QIE B; 3WAO A; 1TY0 A; 5D3I B; 4OW0 A; 3HK0 A; 2L76 A; 3N3K B; 2MBH A; 4IKG A; 3KUD B; 1FCC C; 1T3Q A; 1JWU D; 5AEK B; 2VH1 A; 2WXM A; 1E7P B; 2G1E A; 4MGK E; 1SEB D; 5DPW A; 4KV2 A; 3MHS D; 1K8R B; 1F2R I; 2R61 A; 3MHZ A; 3MJ5 A; 2KD0 A; 2X8X X; 1P9D U; 4HDO A; 1UGM A; 3Q8A A; 4EZK A; 1VZ7 A; 3DWG C; 1R4M I; 4DDI D; 2BS2 B; 2GBR A; 2MEK A; 4N9F 4; 1WI0 A; 2MLB A; 4Q2J A; 2DAF A; 4WAA A; 1KLV A; 3W9C B; 2HTH A; 1YIW A; 1MG4 A; 2KO3 A; 4MH8 A; 2BW2 A; 1AW7 A; 4BBN F; 4AWJ A; 2H88 B; 4CQN A; 4KX6 B; 3TMP B; 4FA6 A; 3H7P A; 2KK8 A; 2K3U A; 3ZTC A; 2LUM A; 2IPK D; 5IKC M; 2K0P A; 1XF5 L; 2LHE A; 2A5U A; 1GB1 A; 3DDC B; 2UWQ A; 2NBV B; 3N9Y C; 5CTR C; 4DDG D; 3EFC A; 1H4R A; 1L7Y A; 4XGA B; 4US8 A; 4HPL B; 3DHI C; 1UZX B; 2KTR A; 3GZN B; 2ZCC A; 1PFD A; 3I9V 1; 1DOI A; 2W82 A; 4YL8 A; 4EFO A; 5JHA A; 1NYR A; 1C4P A; 3RMK C; 2NBW B; 1LFD A; 3ZO5 B; 5EE0 A; 3VR8 B; 4ITK A; 4KSL C; 4ANU A; 1HEZ E; 1EF1 A; 2LI5 A; 2NMQ A; 1N61 A; 2N9P C; 3NS1 A; 2BKR B; 1GC6 A; 3WA0 A; 1I4G A; 3U30 A; 2K22 A; 2HTM E; 3ZIM A; 1LQB A; 1JRP A; 4C7Y A; 2PMV A; 3JSV B; 3VTV A; 1U4A A; 2D3G A; 2RPQ A; 3Q8C A; 1I42 A; 1ZKH A; 4N6E B; 2V4L A; 4URK A; 4KKI A; 2LJ5 A; 4ZRK A; 2PIA A; 4FHJ A; 1WFY A; 1PGB A; 1V49 A; 2GBN A; 2WXG A; 2PEA A; 5AZH A; 3M63 B; 3VRB B; 2JXT A; 2N4F A; 5DCN A; 2KHW B; 2KQ7 A; 3LDZ E; 2LRW A; 5CHF A; 3PTF C; 4ANX A; 2JX5 A; 1P1A A; 1SGH A; 5AUI A; 3EFU A; 2M8S A; 5IOI A; 2EMS A; 4WJO A; 1G6J A; 5FK9 C; 1SBB B; 4N58 A; 1K51 A; 1BXT A; 2XBB C; 2J0M A; 2LHD A; 3OLM D; 2INC C; 4MT5 A; 1WGY A; 2JZP A; 1F9J A; 1IP9 A; 3C8Y A; 1GB4 A; 2KAN A; 1JWB D; 2TSS A; 2L8J A; 1V9J A; 2KWC A; 1NI3 A; 3HM6 X; 3HUI A; 2LUE A; 1LM8 B; 2QCZ A; 4RGM A; 3A4R A; 3ZDM C; 1SF0 A; 2IGH A; 4BOZ B; 3IXS A; 4GIV A; 1F1H A; 3BK1 A; 3P2B A; 3OJ4 B; 4LTU A; 3KUC B; 2BVC A; 2ZNV C; 1YOV B; 4JLC A; 2Z8L A; 4XWT A; 4USA A; 2LVP A; 4ZYN A; 3W1S A; 2OOB B; 2HE7 A; 1A70 A; 3ZKJ C; 2Z0E B; 4GMV A; 4GB9 A; 4JQW C; 4C4V B; 2AX5 A; 1N6Z A; 1WGR A; 1BML C; 4AJY B; 3RT3 B; 1XLO A; 2O6V D; 1RFA A; 4S17 A; 1K52 A; 3R2I A; 4BKS A; 1ESF A; 4E3C A; 4K7U A; 1HA5 A; 2PE6 B; 1EO6 A; 4LNK A; 2W3R A; 3L10 B; 4B0M A; 1RFK A; 2WLB A; 1WXS A; 1ET9 A; 2DNF A; 1J8C A; 2KDM A; 2HDE A; 2BWE S; 2KJR A; 3NZU A; 4DWF A; 1Q5W B; 1GOZ A; 1FNU A; 4F1S A; 1EWY C; 1L6V A; 2JF5 A; 1QT9 A; 4W9D A; 2CJO A; 2MBQ A; 2KDF B; 2IO0 B; 1XLQ A; 2IO2 B; 3T9L A; 2MBB B; 3QWZ B; 4YT0 B; 2JXX A; 1V86 A; 4NJ7 A; 1STE A; 2FUH B; 2MWS B; 4GXB A; 1WZ0 A; 1DYQ A; 3RNB C; 3P4P B; 4LJO B; 3NG0 A; 1SE2 A; 3A1Q B; 3URY A; 3LYY A; 1Y56 A; 2RDG A; 4YSZ B; 3KUZ A; 4B6W A; 1IPG A; 4LDT D; 3BYY B; 1S1Q B; 4RF1 A; 1P7E A; 3R7Q A; 5AZF A; 4ICV A; 2KDB A; 2GB1 A; 3VH3 B; 1SE9 A; 4B0E A; 2BTE A; 4AUQ C; 3SD5 A; 1WRI A; 4FXC A; 2QSD A; 4UDU C; 2MQJ A; 1SE4 A; 3VUX A; 3BZD B; 5L83 A; 2B76 B; 1F2R C; 1HZ6 A; 2ZZP B; 3DVN U; 2L3Z A; 3AEF B; 1HQR D; 1GUA B; 4F8C B; 4ZOH C; 1XCQ L; 3JSV A; 3FAH A; 2Q5W D; 2V0G A; 1I4P A; 5J18 A; 2N0S B; 1JRU A; 2H89 B; 1E9M A; 2W55 A; 2WXN A; 3PT2 B; 1ZPS A; 1GNU A; 2ZEQ A; 1WJ6 A; 1TS2 A; 5L95 C; 2KN4 A; 2O2V A; 1OTR B; 3DHH C; 3GS2 A; 3Q14 C; 2W3S A; 4WJP A; 1JRO A; 4HWI B; 5T8I A; 4K3C A; 1WRD B; 2EKI A; 4CO7 A; 3OAW A; 1D4B A; 4HDQ A; 1I4X A; 4HJK A; 3BWU D; 2MCN B; 3QQ8 B; 2BYV E; 4NPN A; 4IOI E; 4HKZ E; 1B1Z A; 1OGW A; 2QEJ C; 5E6P A; 4LNI A; 3L13 A; 1J19 A; 3M95 A; 4XE0 A; 1IGC A; 3KVF B; 2XK5 B; 3KWV A; 3ZJU A; 5D3D A; 3U2S C; 2K9X A; 4AS1 A; 2KMC A; 5FKA C; 4A20 A; 1WWT A; 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3SFE B; 4TQ0 A; 3L17 A; 2LEK A; 2PVO D; 3PS6 A; 1E0Z A; 3AH7 A; 2V1Y A; 3JW0 X; 4RM9 A; 3V6E B; 3EC8 A; 1XD3 B; 2DX5 B; 1UH6 A; 3ZLZ A; 1WGH A; 1K53 A; 5IA7 A; 2BB5 A; 2K25 A; 2D10 A; 4NZL B; 2ZW0 A; 4WWM A; 4WJN A; 1SE3 A; 2LWP A; 4MGY E; 2C7H A; 2KWU B; 2BQQ A; 2R2O A; 3Q3J A; 2OJR A; 2INP E; 2BWF A; 5LLI A; 2K6Q A; 2RMM A; 2JYE A; 1J7C A; 4C56 C; 4US9 A; 2ON8 A; 2BF8 B; 4M8M A; 4IWQ A; 1F52 A; 4HK2 A; 2DYM A; 3BVZ A; 1V81 A; 2I38 A; 3U7D A; 1RAX A; 2FCS A; 2JRI B; 1SIJ A; 3EA6 A; 5G5H A; 3C19 A; 5GMV A; 3QK0 A; 3AV8 A; 1YQ3 B; 4WJQ A; 2DLB A; 3VUW A; 4K1R B; 5JH5 C; 2WU5 B; 2KJ6 A; 4ZRJ A; 4BKG A; 2DZJ A; 4AJW A; 4BVU C; 2EKE C; 4ZHP A; 4AP4 C; 1D5M C; 3AE7 B; 3KQ4 A; 4M02 A; 3PRM B; 3APD A; 3U52 E; 1E5W A; 3EGR A; 2DZM A; 4QAY A; 3RFZ B; 2FCQ A; 1IGD A; 1GJZ A; 2XK5 A; 1WXQ A; 3GZN I; 1E6E B; 3PHX B; 1VZ8 A; 4GLS C; 1T5X D; 1M94 A; 4XDC A; 1ZXH A; 2CJN A; 3V60 A; 5BYS A; 4RGT A; 1TGZ B; 1YQB A; 3ZJV A; 2KT7 A; 1TS3 A; 2GOW A; 5TSS A; 3PRE A; 4GDL A; 1TYG B; 5IP4 D; 2AL6 A; 2N9E B; 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