The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
EEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTADVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
18
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OZA A; 4OZC A; 2JWU A; 4IOI E; 2N9L A; 4HJG E; 1MHH E; 1P7F A; 2J53 A; 4OZB A; 2IGH A; 5HI1 A; 1ZXH A; 5BMI A; 5BMH A; 1XCQ L; 4IKG A; 5HG2 A; 4KGR A; 2LHE A; 1K51 A; 4D2K A; 2GI9 A; 4GLS C; 1MVK A; 2RMM A; 1XF5 L; 3V3X A; 3GB1 A; 2ON8 A; 1PGX A; 5BMG A; 2J52 A; 3FIL B; 2KN4 A; 2LHD A; 1HEZ E; 4KGS A; 1IBX A; 2PTL A; 2JZP A; 2QMT A; 2I38 A; 1K53 A; 1XCT L; 3MP9 A; 1F2R I; 2JXT A; 1FD6 A; 2IGD A; 2JU6 X; 2NMQ A; 2OED A; 1D4B A; 2ZW1 A; 1GB4 A; 1K50 A; 1C9F A; 2PW9 A; 1IGD A; 2EEL A; 1HZ6 A; 2PLP A; 2ONQ A; 5HHD G; 1KH0 A; 4HKZ E; 2LUM A; 1YNT E; 1HZ5 A; 2IGG A; 1IBX B; 2N9K A; 4KGT A; 1PGA A; 2KQ4 X; 1YMH E; 1K52 A; 2QSD A; 2JSV X; 3UI3 A; 2N7J A; 4MAC A; 2RPV A; 5JXV A; 1QKZ A; 1JML A; 2KDM A; 5HFY A; 1MPE A; 3FIL A; 1PGB A; 2KWD A; 2GB1 A; 2I2Y A; 1UWX A; 4WH4 A; 1GB1 A; 1MI0 A; 2KAC A; 1IGC A; 2LGI A; 2K0P A; 1FCC C; 1EM7 A; 1FCL A; 2ZW0 A; 1MHX A; 1F2R C; 1P7E A; 1Q10 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KWV B; 3GZN B; 5J2R A; 2FUH B; 2N9L A; 5DPS A; 3M62 B; 4NJ6 A; 4A3P A; 2OJR A; 1ZXH A; 3N20 C; 1XQQ A; 4YSX B; 4AOF A; 1TZ1 A; 4R3D A; 1XXG A; 4F1S A; 4GLS C; 2BYF A; 3RNB C; 1N5W A; 2BGF A; 3CIR B; 4LJP B; 3VDZ A; 2J52 A; 1HEZ E; 2V3P A; 4AQ7 A; 4B9K A; 2I38 A; 4XE0 A; 2MJ3 A; 2KC2 A; 1JWB D; 2JT4 B; 3BII D; 2IYD B; 3WAO A; 2WXG A; 1RAX A; 1WXS A; 3A1Q B; 4FA6 A; 2C5L C; 4US9 A; 1QIL A; 3R2I A; 2PKO A; 3BVZ A; 4L1B A; 4Q2J A; 2RD0 A; 2KTF A; 1WI0 A; 2KWC A; 1GB4 A; 1K50 A; 1U4A A; 3KYC D; 4E74 A; 2QCZ A; 3NOB A; 5E6P A; 3P4Q B; 4NAW A; 3KWL A; 1YD8 U; 3IHP C; 3DDC B; 2ZPY A; 1STE A; 1QOA A; 2IGG A; 1BT0 A; 5DCN A; 2LZ6 A; 4JPS A; 4GDK B; 4W9K A; 3SHQ A; 4AJW A; 3NVV A; 3UGB B; 2CS4 A; 1I4H A; 3ZVV A; 4XGA B; 4NY0 A; 1P3Q U; 2K8H A; 3K9P B; 4JIO U; 1YIW A; 2PIA A; 1ZUD 2; 2NBW B; 2JYT A; 1FPY A; 4XWW A; 1QKZ A; 3A9K B; 1JML A; 3VH3 B; 3BYY B; 3BY4 B; 1R7S A; 1DOX A; 2KT7 A; 2MBQ A; 2LRW A; 1VZ6 A; 4EOY A; 3A9J B; 1MI0 A; 1Y56 A; 1E8X A; 1V2Y A; 5E6N A; 4X57 B; 2AQ1 B; 2XBB C; 2K1F A; 4RM8 A; 2V3S A; 1MHX A; 1WFY A; 4OZC A; 2JWU A; 3CSF A; 4MM3 B; 1TTN A; 2I1J A; 3QWZ B; 2NPT B; 4CQN A; 4QAY A; 5BO4 B; 5HI1 A; 4LJO B; 4W9D A; 1LGR A; 2CU3 A; 1OGW A; 4IM0 A; 2WDT B; 5D94 A; 2Z8L A; 1WX8 A; 4WJP A; 3Q8E A; 3BK2 A; 4HKQ A; 4J6I A; 1HA5 A; 2L52 A; 2Y5C A; 4II3 B; 5BYQ A; 1E10 A; 3RD2 A; 2IO0 B; 3AV8 A; 1E8Y A; 3SEB A; 2V9H A; 2K5P A; 2V1Y A; 4RF0 A; 4A90 A; 1SXT A; 4RGT A; 3E9S A; 2FIF A; 3A4R A; 4EE2 A; 1MG8 A; 1KLU D; 2PW9 A; 4NAM A; 1WZ0 A; 1XLN A; 5LXH A; 1Z5S B; 2NR2 A; 3JYU A; 4OVZ A; 4ZHP A; 4YTP B; 3O65 B; 2PJH A; 3U7D A; 4G3X B; 4HEA 1; 3ETR A; 2QIL A; 2O6V A; 5T8I A; 1JRP A; 3AE1 B; 3AED B; 1N60 A; 4LNO A; 3TCA A; 3RZF A; 2AX5 A; 1C1Y B; 2KMC A; 2PE9 A; 3RMK C; 2LAS A; 1L0X B; 1C77 A; 2D3G A; 3ZRC A; 4AWJ A; 3EGR A; 2K0P A; 2V3N A; 1C3T A; 2HE7 A; 4MGI E; 4LTU A; 1WJU A; 4NAW B; 2DWQ A; 5EDS A; 2WS3 B; 4AUQ C; 5G55 A; 2L00 B; 3GE8 C; 3LXF A; 4K81 A; 3P1M A; 5TSS A; 4BVU C; 3VR9 B; 2EMT A; 1P7F A; 2J53 A; 2IPK D; 4IDI A; 2GBM A; 2J0M A; 1CJE A; 1T0R C; 5BMH A; 3NVW A; 2JY6 A; 4MH8 A; 3V3X A; 3AM9 A; 3RUL A; 2KN4 A; 4HWI B; 2GRI A; 1C4A A; 3QJZ A; 2JZP A; 2BB6 A; 2LFI A; 2KWU B; 3HIZ A; 5LNK 1; 5G5G A; 1UBI A; 1F2R I; 2JPH A; 2YVC A; 1WJN A; 3DQV A; 3TBL D; 4GIV A; 1D5Z C; 4C7Y A; 2ZVN A; 4LNF A; 1XO3 A; 2KTR A; 2KJ6 A; 4EUT A; 2CHZ A; 1X1M A; 3N32 A; 1GC7 A; 1WJ6 A; 4YT0 B; 1UD7 A; 1IPG A; 4RM9 A; 5D7G A; 1ZDV A; 2D11 A; 4IG7 B; 3U8Z A; 2JZ3 B; 3B1L X; 3EFU A; 1WXA A; 1FM0 D; 4NQK E; 2WXM A; 2BKR B; 2PLP A; 1IYF A; 2ONQ A; 5HHD G; 4FJZ A; 4P16 A; 1TIF A; 4WUR A; 2KMM A; 4MEL A; 1WX7 A; 4KSK C; 1HTO A; 4JWS C; 3JW0 X; 2KDF B; 4M02 A; 4W9H A; 3PRE A; 3CF6 E; 3KUC B; 1WSP A; 2WXJ A; 4P1C C; 3BWU D; 3EHV A; 4TKN A; 3SFE B; 1L4D B; 2I2Y A; 1N63 A; 1WWT A; 1L0V B; 3TMP B; 3T8M A; 2LVP A; 2G45 B; 1YQB A; 3H1U A; 5C23 A; 2KJR A; 2KX0 A; 2JQR B; 1OQY A; 4E71 A; 2LMC A; 4DHJ D; 4MDK E; 1PYW D; 2WXL A; 4HJG E; 4HVB A; 3L17 A; 4S17 A; 5C2T B; 2O6V B; 1YN4 A; 2CJN A; 1SIJ A; 1JRO A; 2Y5P A; 1KLG D; 3L08 A; 2VRR B; 4FUL A; 4ACF A; 3LJ3 A; 4FLH A; 3HHM A; 2OJW A; 3DVN U; 4TQ0 A; 2XEW A; 1PQS A; 1M94 A; 2FCN A; 2N4F A; 4NJC A; 3H6N A; 2B3A A; 2K8B A; 2M56 B; 1QLB B; 1XCT L; 2W3S A; 3SR6 A; 4MEM A; 2JXT A; 1V1P A; 3ONS A; 2E6X A; 4N59 A; 4W9E A; 1NVI D; 1TKG A; 4GMV A; 4MGY E; 2MLB A; 4JWU C; 4NPN A; 1NYQ A; 5FKA C; 3SD5 A; 3VUY A; 1KM7 A; 1WIA A; 1JWS D; 5AZH A; 2JWZ A; 3DBH I; 5J18 A; 1VDV A; 3PS6 A; 2BYE A; 2AL3 A; 1ZOY B; 4WJQ A; 2LUM A; 3A33 B; 3Q3N C; 1HTQ A; 3B9J A; 3RUI B; 4BKS A; 2KQ4 X; 3DVN V; 3RYT A; 4HDQ A; 2KMA A; 2V4I B; 3TIX A; 4KSL C; 4YSY B; 1SE9 A; 3DBL B; 2W54 A; 3VR8 B; 5IP4 D; 3ENE A; 4TMA B; 4PYZ A; 2KTR B; 1D3Z A; 1L5P A; 3ZGZ A; 3SFD B; 4RFB A; 2Z0D B; 2I1K A; 1TBE A; 1ZGU B; 3LDZ E; 1FFV A; 4M8N A; 1FCL A; 2ZW0 A; 2K6Q A; 4HDO A; 2JXX A; 2X8X X; 2ZCC A; 4ZRJ A; 3ZNH B; 3HK0 A; 1HXY D; 3PGE A; 4A6Q A; 2L76 A; 3UQB A; 3U52 E; 2K39 A; 1V8C A; 1CK1 A; 1C78 A; 2KXJ A; 5C1Z A; 2D3C A; 4W9F A; 2EKI A; 4W9C A; 3DVG X; 1WJ4 A; 4USA A; 4GSW A; 5IAA C; 4JQW C; 1J0G A; 2H88 B; 1ZKH A; 2FID A; 1MVK A; 3Q8F A; 3VTV A; 4DWF A; 5KHO A; 1FXA A; 4K3C A; 5H92 C; 4JL9 A; 1I42 A; 2JVC A; 1D6E C; 4DXG A; 4ARI A; 3ZRF A; 1V80 A; 1J7A A; 5IKC M; 1TS3 A; 1VZ8 A; 1UZX B; 4KVG B; 2LRU A; 3IG3 A; 2GMI C; 2NBU A; 4IM3 A; 4L2Y A; 2FCQ A; 3TEW A; 4EEW A; 4XWT A; 2IY0 B; 2N9K A; 3M63 B; 2FE8 A; 3GOE A; 3AU4 A; 3LB8 C; 3UIN B; 4ZRP A; 3O13 A; 2LXA A; 4MAC A; 1V1P B; 2JF5 A; 1R4M B; 1GG3 A; 2RPV A; 1K8R B; 1YN3 A; 2K25 A; 1KF6 B; 1YX5 B; 3MHS D; 1V9J A; 1WGH A; 2N1V A; 3RNG C; 1E7V A; 1NI3 A; 3AE6 B; 2DYB A; 3N1X C; 2WXH A; 3ML8 A; 4LK0 M; 2J42 A; 4RGM A; 2KQ7 A; 1QQR A; 3FKY A; 1V1O A; 4ZRI A; 3PHX B; 4AJY B; 2MCN B; 2XK5 A; 3H9D A; 4URK A; 3IBE A; 1CZP A; 3RCZ A; 4G0N B; 4H2A A; 3Q14 C; 4ZRK A; 2RMM A; 2ON8 A; 4GOC A; 1R4N I; 2BS2 B; 4B95 A; 3R3M A; 1RWS A; 4WQM A; 4ZOH C; 3MP9 A; 5TR5 A; 1P9D U; 2C9W B; 3P4P B; 4ANU A; 2O2V A; 2DZK A; 2EMS A; 2KK8 A; 3IAM 1; 4RCO A; 3RNE C; 3RT3 B; 2M1M A; 3I9V 1; 2DZM A; 3D32 A; 2OED A; 3PZ7 A; 4IWP A; 2XN9 C; 3ECI A; 5IO9 A; 1IGD A; 2C60 A; 2K22 A; 1WZ3 A; 4HKZ E; 2BT6 A; 1YNT E; 1GOZ A; 1XT9 B; 3I57 A; 3MC8 A; 4L23 A; 3BVM A; 2L83 A; 1K52 A; 2G1E A; 4MSM B; 2RDG A; 3VFK A; 4GGQ A; 3DWM A; 1VRA B; 5JZE B; 2KKC A; 3IFW B; 3L54 A; 4RH6 A; 3APC A; 2XNA C; 2ZEQ A; 4NJ7 A; 3Q6B A; 1DGJ A; 4CHK A; 3AEA B; 3VTW A; 4HPP A; 4AS1 A; 5HFY A; 1I4Q A; 4IWO A; 3QAR A; 2IY1 B; 3KH0 A; 2RSU A; 2LGY A; 4W9G A; 3RNC C; 1FCC C; 2D10 A; 2INN E; 3P2B A; 4HLE A; 4M00 A; 3IT6 B; 1L7Y A; 3SU8 X; 4FAD A; 2KX3 A; 1P7E A; 4OW0 A; 4TSS A; 3R66 C; 2N0S B; 4PS3 A; 1WY8 A; 3AE7 B; 4K7S A; 1WM3 A; 2R2O A; 3ZNG C; 4TV3 A; 3R7R A; 2FAZ A; 4P1B C; 2Z0E B; 1M4V A; 2JUO A; 4C00 A; 1KRH A; 2WDV B; 1F52 A; 3DBR I; 2LHE A; 4D2K A; 3B2F A; 5BMG A; 1IBX A; 2LHD A; 2BS4 B; 3AE4 B; 4ITK A; 1WR6 E; 3TEZ A; 2WXF A; 4JLC A; 2JRI B; 2WDQ B; 1ZDX A; 3VH4 B; 3E56 A; 4I6N B; 4KV2 A; 2LGD A; 1OEY J; 4LDT B; 4XC2 A; 4N9F 4; 1YJJ A; 2FCM A; 4OHJ A; 2BPS A; 2XK5 B; 3DHH C; 2NMQ A; 2MRP A; 4W9L A; 2MSE D; 3P4R B; 1VR9 A; 1AN8 A; 1XLO A; 4NZL B; 1BUI C; 4ZDV A; 2WYQ A; 3V62 A; 1R4M I; 1LFD A; 1HQR D; 3L13 A; 4HPM B; 2ZCB A; 1RM6 C; 4BZA A; 2JX5 A; 3MTN B; 4PT5 A; 3PRM B; 3X0W A; 3PV1 A; 2GBJ A; 1GNU A; 2O2V B; 5I4D A; 5FR3 A; 2HJ1 A; 4ICV A; 3NS1 A; 1ZPS A; 4NNJ B; 4C4V A; 2DZI A; 2DHZ A; 3OAW A; 1UWM A; 1WF9 A; 3N30 A; 2GBR A; 4MSQ B; 4TQ1 A; 3DHI C; 2VZK B; 2MP2 A; 3QC8 B; 1YQ4 B; 2REX A; 2KAC A; 5KHQ A; 1IGC A; 3W1S A; 3AE9 B; 3EC8 A; 3B0A A; 3C0R B; 3NVY A; 3AEB B; 2IJ0 A; 4M0W A; 2LVO A; 1RYJ A; 3M95 A; 1T6B X; 1I7H A; 4FJV B; 4LNI A; 1XLQ A; 4LNK A; 4DHZ B; 3V61 A; 2WXP A; 5BMI A; 1SJH D; 3T3O A; 3GZN I; 1WGR A; 4IKG A; 2KLG A; 1FMA D; 1PUT A; 2K9X A; 5D3I B; 2E3T A; 2DZJ A; 3R8B A; 5AEK B; 2JRH A; 1N61 A; 5D2M B; 2L32 A; 4RGO S; 4XZ4 A; 1YX6 B; 2BF8 B; 4KKJ A; 3V60 A; 2PEA A; 3PVL A; 1TKE A; 3Q8A A; 3IAS 1; 4WQO B; 3HUI A; 2KDE B; 3H8H A; 5D3D A; 3P4S B; 1SSN A; 2LGS A; 4F8C B; 1NEK B; 2MWS B; 1EWY C; 1N5X A; 1UUP A; 4MT5 A; 4P7I A; 5DPR A; 2CJO A; 1F77 A; 3ZTC A; 2MBB B; 2FNJ B; 3ML9 A; 4GN1 A; 1SBB B; 1SE4 A; 3V05 A; 5CTR C; 3ZXR A; 2IO3 B; 1HE8 A; 1IBX B; 3PZ8 A; 1QOB A; 3B08 A; 3C8Y A; 3L0W B; 2CHW A; 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3WCQ A; 2W55 A; 2RPQ A; 3P42 A; 3DPD A; 1DOY A; 2C7H A; 3MHZ A; 2NBV B; 4ASW C; 1MJD A; 4JE3 B; 1GJZ A; 3AEE B; 1WYW B; 2HTH A; 2KO3 A; 3QX1 A; 1SF0 A; 3JSV A; 4HXD A; 4ANX A; 1MG4 A; 4N6E B; 1SE2 A; 1GAQ B; 3M3J A; 4IOI E; 1L4Z B; 1WH3 A; 1J7B A; 3NRZ A; 1UEL A; 2IGH A; 4WWN A; 3W1S C; 3Q8B A; 1NBF C; 2INC C; 5EE3 A; 2M8S A; 3N1Z C; 3U4E G; 2WU2 B; 4K7W A; 4C7Z A; 2KQS A; 2WX0 A; 5BYR A; 1G6J A; 5LXI B; 4WIP A; 4WWP A; 2W9N A; 2WNM A; 1WRD B; 4HCN B; 1WXQ A; 3EUB 2; 4YSZ B; 1WRI A; 1RFK A; 2OHF A; 4YXD B; 2DYO A; 2FBW B; 4DHZ E; 1EU3 A; 2KFK B; 1B1Z A; 1TY2 A; 1KOT A; 4O1N A; 1ZXI A; 2KJH B; 2N9X A; 2ZNV C; 2JU6 X; 4OVU A; 5AUK A; 2GLS A; 2JYE A; 2LD9 A; 3KUZ A; 1VLB A; 4A3O A; 1ESF A; 2WGS A; 4WJN A; 2CKH B; 2DX5 B; 3TSS A; 1WMH B; 4KZ0 A; 1AAR A; 1T3Q A; 3UF8 A; 2DYM A; 1PGA A; 2EKE C; 2A5U A; 2NTT A; 2QSD A; 4W9J A; 3U30 A; 1YOV B; 1GPX A; 3U7Z A; 4GB9 A; 3MC0 B; 2N9E B; 3AI5 A; 1TS2 A; 1QOG A; 2ACZ B; 2BWE S; 2WXI A; 1WXM A; 3P63 A; 3RNF C; 3PTF C; 4W9I A; 1VD2 A; 2QDF A; 4ZYN A; 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