The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
72
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structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADKAYTLNIKFAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Finegoldia magna
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| total genus |
11
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FIL A; 1MHX A; 1PGA A; 2QSD A; 5BMI A; 2PW9 A; 2GB1 A; 2JXT A; 5HHD G; 1IGC A; 2LHD A; 2GI9 A; 5BMG A; 5BMH A; 3MP9 A; 4MAC A; 2LHE A; 2RMM A; 5JXV A; 2NMQ A; 1GB1 A; 1GB4 A; 1XCT L; 4HJG E; 5HFY A; 2IGH A; 1P7F A; 1MI0 A; 4IOI E; 1K51 A; 1FD6 A; 1KH0 A; 2ONQ A; 2KDM A; 1IBX B; 1D4B A; 1F2R I; 4HKZ E; 1PGB A; 2PLP A; 1QKZ A; 4KGR A; 2KQ4 X; 3GB1 A; 1HEZ E; 1MHH E; 5HI1 A; 4OZB A; 2K0P A; 2EEL A; 1UWX A; 2IGD A; 2LUM A; 4OZA A; 2JZP A; 2I2Y A; 1PGX A; 2ZW1 A; 1HZ5 A; 2J52 A; 1HZ6 A; 4WH4 A; 3FIL B; 2ZW0 A; 1K50 A; 2JSV X; 1JML A; 2JU6 X; 1IBX A; 1Q10 A; 2KAC A; 2J53 A; 4KGS A; 2IGG A; 2PTL A; 1EM7 A; 3V3X A; 4D2K A; 4IKG A; 1MPE A; 2RPV A; 1MVK A; 1ZXH A; 1F2R C; 2ON8 A; 2JWU A; 1C9F A; 1IGD A; 1XF5 L; 4GLS C; 2N9K A; 2OED A; 1YMH E; 2N9L A; 3UI3 A; 4KGT A; 1XCQ L; 1YNT E; 5HG2 A; 2QMT A; 2I38 A; 2N7J A; 1FCL A; 2KWD A; 4OZC A; 1K52 A; 1K53 A; 1P7E A; 2LGI A; 1FCC C; 2KN4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KX3 A; 5AZH A; 3SEB A; 3VRA B; 3IFW B; 4WUR A; 3PLV A; 3ZKJ C; 1V9J A; 4C4V B; 1XQQ A; 4EZJ A; 1P9D U; 3MC9 A; 1GAQ B; 4RM9 A; 3KWL A; 1XO3 A; 2V4I B; 3AI5 A; 1JW9 D; 4AJY B; 1C4A A; 4MGZ E; 1P7F A; 1WF9 A; 1UD7 A; 3DVG X; 4IUM B; 4KSL C; 1AWD A; 4W9H A; 3TEY A; 4JLC A; 1QZE A; 1QOF A; 1QT9 A; 3ZGZ A; 4BZA A; 3BK2 A; 1HA5 A; 4HKZ E; 1KFY B; 4KZC A; 3P4R B; 1TKG A; 1R4N I; 4R3D A; 5JH5 C; 2WXF A; 2WXK A; 3GB1 A; 3MTN B; 2IO0 B; 4XX5 A; 1IP9 A; 1L6U A; 2ICI A; 2AQ1 B; 1D5M C; 2BWF A; 2CS4 A; 2JZP A; 2V3P A; 1Y56 A; 2XK5 A; 2V3N A; 2LI5 A; 1T0R C; 4DK5 A; 2OJW A; 2BBC A; 4WJN A; 4DXG A; 3BVZ A; 1YQ3 B; 2MJ3 A; 3L0W B; 1NDD A; 1JML A; 4A6Q A; 4N58 A; 2IGG A; 3PRP B; 2M1M A; 2N1V A; 3U52 E; 1XT9 B; 2KFK A; 1ZXH A; 3RUL A; 2M0X A; 3GZN I; 1V1O A; 5D94 A; 1I42 A; 2RSU A; 3TIX A; 4LJP B; 1KM7 A; 4UDU C; 1OEY A; 4JX1 C; 1TT5 B; 4WJP A; 5AZG A; 4BOZ B; 2MJE A; 3AEG B; 1GUA B; 2KWD A; 3ML8 A; 3N9Y C; 2J0M A; 4KKI A; 3Q8A A; 4HPP A; 1FXA A; 4URK A; 4GDK A; 2Z0E B; 3RPF C; 2REX A; 2CHW A; 1PYW D; 5JHB A; 3O13 A; 4C7Y A; 5BMH A; 2KAN A; 1VLB A; 1RLF A; 3AEF B; 2KQS A; 3N1Y C; 1D5X C; 2OOB B; 4XC2 A; 1J19 A; 1GB1 A; 3IG3 A; 4JQW C; 1XCT L; 1F0Z A; 5HFY A; 1RFA A; 3N1X C; 1T5X D; 2L0T A; 4F7Z A; 1FNU A; 3RZF A; 3Q8B A; 2IY0 B; 4FJZ A; 4HDQ A; 2UWQ A; 4FAD A; 2MP2 A; 1EF1 A; 4GDL A; 3M3J A; 3ZLZ A; 3R3M A; 2V9H A; 4TQ1 A; 1SGH A; 2NPT B; 2LVQ A; 4XWW A; 3ZJT A; 2VZK D; 2MBH A; 1TY0 A; 2PE6 B; 3ZIM A; 2KVR A; 3RMK C; 4GB9 A; 1M4V A; 3RNF C; 2FNJ B; 3AE7 B; 1WJU A; 1VZ6 A; 2MRP A; 2K3U A; 3AXC A; 3Q8C A; 1I4P A; 3OLM D; 2G4D B; 3ZNZ B; 2ZVN A; 3I63 C; 1FFU A; 1Q5W B; 3EC8 A; 3KYC D; 1LO5 D; 1EM7 A; 3OAW A; 3V3X A; 1V81 A; 5D2M B; 1WSP A; 1F52 A; 5IKC M; 1NYR A; 3IAM 1; 2DLB A; 2J0J A; 1C4C A; 4KIK B; 2FID A; 1E8W A; 3L17 A; 4F8C B; 2L52 A; 2AWT A; 1QQR A; 5IA7 A; 2OHF A; 1V1P A; 1WFY A; 5G55 A; 3AE1 B; 1UH6 A; 2SEB D; 4NQL B; 3BYY B; 2H89 B; 3APF A; 1AN8 A; 3EFU A; 2NTT A; 4RM8 A; 2KO3 A; 4KDL B; 4MM3 B; 3OWE B; 4ZRK A; 2GI9 A; 2LFI A; 2QIL A; 2KTF A; 4K3B A; 4DHZ B; 3ZRC A; 3U4E G; 3PT2 B; 1JQ4 A; 3WIM A; 1WX9 A; 2VZK B; 2DNF A; 3A4S C; 1T0Y A; 2W9N A; 3GOE A; 3SD5 A; 2WHI A; 2K8B A; 2PEA A; 5CHW A; 1IBX B; 5AZF A; 4RGN A; 1PGB A; 1TYG B; 4FLH A; 1WH3 A; 4AJW A; 3VTW A; 3QHT A; 4ICV A; 4NY0 A; 2WWZ A; 4I6L B; 2CKH B; 3A9K B; 1P1A A; 4ZDV A; 2IDY A; 4J6I A; 4EZL A; 3IXS A; 1N6Z A; 4KV2 A; 2RGF A; 1YN4 A; 2KJ6 A; 3TJP A; 3RD2 A; 2DZM A; 2DYB A; 1E9M A; 2FCQ A; 3GP7 A; 3TEW A; 4KGS A; 1HXY D; 2KWV B; 1OTR B; 4CQN A; 4D2K A; 2FAZ A; 1AAR A; 2WXJ A; 4MH8 A; 2ON8 A; 1C9F A; 2LWP A; 1XEE A; 2PPH A; 2WX1 A; 2WDV B; 5J17 A; 2ZPY A; 3DBR I; 3I5J C; 5G5G A; 1V97 A; 2CHZ A; 3DWG C; 2MH7 A; 1E7P B; 4RF0 A; 1P7E A; 3ZNG C; 3AUL A; 2XNA C; 3TEZ A; 1T3Q A; 5C2T B; 3WAL A; 2KZR A; 2WGS A; 4ZRI A; 1XLP A; 4LDT D; 5E6N A; 1L0V B; 1YN5 A; 4ANV A; 4DHJ D; 1HTQ A; 4M0W B; 2KMA A; 5TR5 A; 2L8J A; 4YT0 B; 3PRZ A; 3BVG A; 3HUI A; 3HVZ A; 2KT7 A; 2C5L C; 1JRO A; 3C8Y A; 4XDD A; 2CU3 A; 1Z5S B; 4CO7 A; 4GGQ A; 1EO6 A; 2JYT A; 5AEK B; 1PFD A; 1FD6 A; 2D11 A; 4XYC A; 3DDC B; 2WXH A; 3DQV A; 4KX6 B; 1V80 A; 4B0M A; 2KHW B; 2YVC A; 3L13 A; 1E10 A; 1GG3 A; 4HRO A; 1DYQ A; 2R2O A; 4OVZ A; 2LZ6 A; 4IM3 A; 1WJN A; 2WS3 B; 1XXG A; 2W54 A; 4OZB A; 4EFO A; 1MG8 A; 3BIN A; 3B2G A; 4K81 A; 2BKF A; 1A70 A; 4N9F 4; 1CJE A; 2BGF A; 3KVF B; 1SE2 A; 2KK8 A; 2HE7 A; 2GLS A; 2VRR B; 2KYW A; 1TTN A; 3W9C B; 2DHZ A; 2J42 A; 1VJK A; 2C7M B; 1LM8 B; 3NZS A; 2EMS A; 4EZK A; 3P63 A; 5GMV A; 4IWQ A; 5C3J B; 3HRD D; 2MEK A; 4HJK A; 2IND C; 2O2V A; 2FE8 A; 3DBL B; 3BK1 A; 4JGH B; 2PKO A; 3Q3M C; 2BQQ A; 3P42 A; 3VUY A; 2LVO A; 3PRE A; 2JX5 A; 4DHJ B; 3H7P B; 2KDB A; 3AED B; 2V0G A; 2K22 A; 4NAW A; 3AH7 A; 3VAW A; 2G45 B; 1WGD A; 4A9A A; 2PE9 A; 4KKJ A; 3ZYY X; 4IDI A; 1CK1 A; 3RZW C; 2JF5 A; 2MHJ A; 3V6E B; 1ACC A; 2B3A A; 1EU3 A; 3W1S A; 3NG0 A; 3Q2A C; 5FKA C; 2NMQ A; 1VDV A; 3NY5 A; 4ARI A; 4HJG E; 2IGH A; 1BT0 A; 3OJ4 B; 4DWF A; 4IG7 B; 4FUL A; 4NNJ B; 1C78 A; 1J7B A; 2KKC A; 2Z8L A; 3JSV B; 1RAX A; 4AOF A; 2K6D B; 5JZE B; 3IT4 B; 2L7R A; 2BB5 A; 1WJ6 A; 1TBE A; 1LFD A; 2A4Z A; 4AQ7 A; 4II2 B; 3KH0 A; 1QOG A; 2M0A A; 3NZ3 A; 3MC0 B; 1WXA A; 1FNV A; 2DX5 B; 2O6V A; 4BFR A; 3M62 B; 4TMA B; 2KD0 A; 1R4M I; 4W9C A; 3ZJU A; 3B1L X; 1N63 A; 2BS2 B; 1SF0 A; 4ZYS A; 2YLM A; 3JYU A; 3AU5 A; 4AS1 A; 3WAP A; 3GS2 A; 2PVO D; 2KTR A; 1A5R A; 1FIQ A; 2NVU I; 2KVZ A; 1V2Y A; 3KWV A; 3P4S B; 1LXD A; 2RDB C; 3R7R A; 1WR1 A; 1FNW A; 1PDX A; 1J7C A; 3T3N A; 3ALB A; 2G3Q B; 1WXM A; 4GMV A; 2WYQ A; 3Q6B A; 1XLO A; 4HPL B; 3LYY A; 3DBR B; 1R7S A; 3X0W A; 2D2Q A; 1DOX A; 3HHM A; 4AP4 C; 2WXI A; 2JXT A; 4MEM A; 1IGC A; 1VD2 A; 4HK2 A; 1OGW A; 2MQJ A; 3Q3O C; 1WMH A; 2JRI B; 2NS5 A; 2AQ2 B; 1UZX B; 2IBI B; 3VUX A; 4WAF A; 2XK5 B; 2NBV B; 2GMI C; 2GOW A; 1SJH D; 2KJH B; 3NS1 A; 1NI3 A; 4JIO U; 4WQO B; 2JWZ A; 1LQB A; 4W9I A; 1VRA B; 3UQA A; 2QEJ C; 4ANU A; 1C1Y B; 3PZ8 A; 3ZXV A; 2KFK B; 3W1Y A; 3NVY A; 3M63 B; 1VCB A; 2M56 B; 1N5X A; 4M01 A; 3TUO A; 3ZDM C; 1E8Z A; 2LUM A; 2WXR A; 2KNB A; 2W3S A; 3R2T A; 3ZUN A; 4ICU A; 4GU2 A; 2MBO A; 3SFE B; 3ZDT A; 3T9L A; 4FXC A; 3WAM A; 4REZ A; 4LNF A; 1YD8 U; 4NJ7 A; 4GDK B; 3V6C B; 3FAH A; 3KUD B; 3Q3N C; 2KAC A; 1I4X A; 4K7S A; 2JYE A; 2JZZ A; 2L0F A; 5CTR C; 5D7G A; 3Q8F A; 2D5G A; 1E0Z A; 2CR5 A; 4US9 A; 2W3R A; 4GXB A; 2L05 A; 2MP2 B; 1V86 A; 2LJI A; 4E3C A; 4GDL B; 1MHX A; 1PGA A; 3K9O B; 4PS7 A; 2PW9 A; 1UEL A; 2YEP B; 1P98 A; 1C4P A; 5EE1 A; 1ET9 A; 4B0E A; 4GN1 A; 2KAJ A; 2WXQ A; 3AE2 B; 2RDG A; 3ZXR A; 1Z2M A; 4E71 A; 3HK0 A; 2J7Q B; 5D6J B; 4P6V F; 2IPK D; 1PQS A; 5EE3 A; 2LEK A; 2Y5C A; 5DPW A; 4ITK A; 4A90 A; 2NCN A; 4DXA B; 3PZ7 A; 4M8N A; 2DBY A; 2FBW B; 3CMM B; 4DXF A; 2WLB A; 4ZOH C; 3AN1 A; 3R2I A; 1J0G A; 4WWO A; 4S0R A; 1CMX B; 4FHJ A; 2IO2 B; 1WI0 A; 4CHK A; 3PO0 A; 1ZGU B; 4W9D A; 4LJO B; 5CHV C; 4WWM A; 2FCM A; 3AMZ A; 1RWS A; 1E8Y A; 1TKE A; 4W9L A; 2KC2 A; 4ZRQ A; 5H92 C; 1V1P B; 5BYS A; 3PPA A; 3N3K B; 4ZYN A; 2HTM E; 3LJ3 A; 2K8H A; 2GRI A; 1IYF A; 3EEC A; 5BYR A; 2GBM A; 1ZP0 B; 3NJT A; 1YQB A; 3BZD B; 3NUH B; 4P1B C; 1I35 A; 2V1Y A; 2N7E A; 2BTE A; 4B9K A; 3AE3 B; 2LMC A; 3I3T B; 2RDH A; 1OQQ A; 4L23 A; 2L3Z A; 1WGY A; 2L76 A; 3I57 A; 3B9J A; 1ENF A; 4W9J A; 1HE8 A; 3DVN U; 2D07 B; 3EGR A; 1TZ1 A; 1YN3 A; 3ABV B; 2BPS A; 3VUW A; 4BAX A; 4FA6 A; 3PHX B; 4DDI D; 2DEN B; 3MP9 A; 5DPS A; 3M95 A; 1E6E B; 3DBH I; 2DAF A; 5T8I A; 1SIJ A; 5C23 A; 3I9V 1; 1CQV A; 2RR9 A; 3V61 A; 1QF6 A; 2VH2 A; 1Q1O A; 1OFF A; 3URY A; 2BKR B; 5IN7 A; 2KQ7 A; 3TEX A; 1LGR A; 1UUP A; 2K9X A; 1T0Q C; 4JWU C; 1TZO A; 4IM2 A; 4WWN A; 4PS8 A; 3VR9 B; 2KXJ A; 1F2R I; 4K7U A; 1UGM A; 2BS4 B; 1OQR A; 3APC A; 4KGR A; 2NR2 A; 3UIO B; 1TY2 A; 1WY8 A; 4EUT A; 4WAA A; 1F77 A; 3UIP B; 2EEL A; 4M02 A; 3P4Q B; 3FC4 A; 4E74 A; 3VVW B; 1IPG A; 1KLV A; 4OZA A; 4YTP B; 2LGY A; 1YX5 B; 5J18 A; 2IJ0 A; 2J52 A; 3H8H A; 2BYF A; 1E90 A; 4XE0 A; 1N62 A; 3VFK A; 3AEB B; 4A8X C; 3RN9 C; 1R4N B; 1QLB B; 1DOI A; 3HIZ A; 4HCN B; 4YTN B; 1I4R A; 4XDC A; 1L5P A; 1WYG A; 1SIF A; 2WDQ B; 3T8M A; 5J2R A; 3HVD A; 2LUE A; 2OED A; 1VR9 A; 2ZPN A; 1E7U A; 3DHH C; 1AYF A; 2W55 A; 5HG2 A; 5TSS A; 3LDZ E; 4S17 A; 1K53 A; 4KIK A; 2LGI A; 3RT3 B; 1FXT B; 3AE8 B; 1JWU D; 1NEK B; 3FIL A; 1F9J A; 1SB3 C; 3ONS A; 2KLG A; 4TSS A; 5BMI A; 3PLU A; 1FRD A; 1RRB A; 1WXQ A; 1Q0W B; 2FCS A; 3CIR B; 2JT4 B; 2WU5 B; 3NHE B; 4LCD E; 4HEA 1; 2D3A A; 2LGX A; 3DHG C; 4TV3 A; 3GZN B; 5BO4 B; 2YEP F; 2MJD A; 3N20 C; 2ACZ B; 2QCZ A; 4P16 A; 3VQI A; 1EU4 A; 3U7D A; 5IO9 A; 1WJ4 A; 2INP E; 1WRD B; 4MDK E; 2KWU B; 3B0A A; 3N1Z C; 2N4F A; 2C7N B; 4XGA B; 4WWP A; 2O2V B; 4LNO A; 3A1Q A; 2K5P A; 3VRB B; 1SEB D; 1NYQ A; 3KLS X; 4I6P A; 1TS4 A; 1SSN A; 5IAA C; 2KWC A; 2M17 A; 1KJT A; 1STE A; 4HLE A; 1QOB A; 4WH4 A; 4NAW B; 1HQR D; 2CJN A; 5KHQ A; 3H9D A; 3T3O A; 3NS8 A; 4LTU A; 2H88 B; 4KZ0 A; 3H6N A; 3PZD A; 1FRR A; 1S1Q B; 3QIJ A; 1JWS D; 4F1S A; 1RYJ A; 3KUZ A; 2FUH B; 4OHJ A; 5E6J A; 4AUQ C; 1XD3 B; 2QSD A; 3QAQ A; 3EFC A; 1UNS A; 4P7I A; 4RGM A; 4OW0 A; 1OQY A; 1QIL A; 3PTF C; 3UIN B; 3RYT A; 1C77 A; 2DAJ A; 2WXN A; 3L10 B; 4K3C A; 1MJD A; 1GC6 A; 1WM2 A; 5D3I B; 3AEC B; 2WXP A; 2O6V B; 2DYO A; 4H2A A; 2AX5 A; 2CU1 A; 3SFD B; 1E5W A; 1D6E C; 1JWA D; 2KTR B; 4BKS A; 1FEH A; 3TSS A; 3QC8 B; 1C3T A; 1TGZ B; 2DYM A; 2JRH A; 4WIP A; 1XLN A; 2KQ4 X; 3IHP C; 2C7H A; 1WYW B; 1WR6 E; 2JQR B; 2L83 A; 4USA A; 3P2B A; 4NPN A; 1L6V A; 2LJ5 A; 4G50 A; 4PT5 A; 1OEY J; 3MHZ A; 3NVZ A; 4PYZ A; 2GBN A; 1HZ6 A; 1MFW A; 3B08 A; 2WXM A; 3TCA A; 2I1J A; 1RFK A; 2TSS A; 2K1F A; 1KF6 B; 2BB6 A; 3U30 A; 2KMM A; 5CX3 A; 1UGJ A; 2NTS A; 4M8M A; 5FR6 A; 3RI7 C; 1EWC A; 1WMH B; 4LNN A; 3ZRF A; 2BW2 A; 2L32 A; 2UU7 A; 2JWU A; 4ACF A; 1IGD A; 4I6N B; 3QK0 A; 1E8X A; 2E6X A; 2HD5 B; 4GLS C; 2I1K A; 1XCQ L; 3MHS D; 1VZ7 A; 4DQO C; 3DVG Y; 3ZJV A; 2INC C; 2D10 A; 3IT6 B; 4C7Z A; 1SJE D; 1FCL A; 4P1C C; 1D5Z C; 2KJR A; 3AB5 A; 2IO3 B; 1G6J A; 1L4Z B; 3V62 A; 4B6W A; 2E3T A; 2K6Q A; 4MJS A; 4LK0 M; 5I4D A; 2GB1 A; 4YSX B; 2QC8 A; 1VZ8 A; 3Q3J A; 4NQK E; 3RFZ B; 2LHD A; 1QOA A; 2HDE A; 2PVG C; 4MSQ B; 2IYD B; 2MBQ A; 3ZQ4 A; 2WXL A; 3LXF A; 1L4D B; 2DZK A; 2WNM A; 2K39 A; 3N32 A; 2AEH A; 1FXI A; 3RNC C; 2RPQ A; 3JVZ X; 4L2Y A; 4RGT A; 3VDZ A; 5G2N A; 2G9H D; 2ONQ A; 2IO1 B; 2KFJ A; 4CYE A; 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