The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADGGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4KGT A; 4WH4 A; 5BMI A; 1PGX A; 1JML A; 4HKZ E; 1HZ5 A; 1F2R C; 2J52 A; 4OZA A; 1XF5 L; 2PW9 A; 1C9F A; 4KGR A; 2JXT A; 2JU6 X; 1IBX A; 2IGD A; 5HG2 A; 2I38 A; 1YMH E; 2IGG A; 2ZW1 A; 5JXV A; 1K52 A; 4MAC A; 1IGD A; 5BMH A; 5HI1 A; 1MHH E; 2N9K A; 1XCT L; 3MP9 A; 3UI3 A; 3FIL B; 2EEL A; 5HHD G; 1XCQ L; 1D4B A; 2JSV X; 2LUM A; 2NMQ A; 1K51 A; 2LHD A; 1MPE A; 4IOI E; 1GB1 A; 2K0P A; 2JZP A; 3V3X A; 1PGB A; 2N9L A; 1HEZ E; 2ONQ A; 4OZB A; 1IGC A; 1UWX A; 1Q10 A; 2KAC A; 2PLP A; 2QMT A; 2KN4 A; 4OZC A; 5HFY A; 1HZ6 A; 2KWD A; 2RMM A; 2ON8 A; 2N7J A; 1MI0 A; 1K53 A; 2ZW0 A; 4D2K A; 2I2Y A; 1GB4 A; 3FIL A; 2PTL A; 1FCC C; 1MHX A; 2IGH A; 1QKZ A; 1P7F A; 2LGI A; 2KQ4 X; 1IBX B; 1KH0 A; 2GB1 A; 2GI9 A; 4IKG A; 4KGS A; 1MVK A; 5BMG A; 1P7E A; 1F2R I; 1PGA A; 2QSD A; 2JWU A; 3GB1 A; 2J53 A; 1ZXH A; 1EM7 A; 1FCL A; 2LHE A; 1FD6 A; 2KDM A; 4HJG E; 2RPV A; 4GLS C; 1YNT E; 2OED A; 1K50 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WIM A; 3I5J C; 4JLC A; 4US8 A; 3NVV A; 1EUV B; 1HZ5 A; 3RNB C; 3OWE B; 2PW9 A; 3CST A; 2IO0 B; 2AQ2 B; 5MPO A; 1QOA A; 1V1P A; 3TL5 A; 3WA0 A; 1WGD A; 2L76 A; 4A3O A; 4IWO A; 3D32 A; 1K52 A; 3KQ4 A; 1UBI A; 4AUQ C; 4L2Y A; 1WFY A; 4ACF A; 2IDY A; 3KVF B; 1VJK A; 2RDH A; 3DBS A; 3RNC C; 2RDG A; 1YJJ A; 1E8Y A; 1JW9 D; 2R2O A; 1GB1 A; 2KN5 A; 2D07 B; 4IWQ A; 3T9L A; 3TEY A; 3IT4 B; 1QQR A; 2JZP A; 2DWQ A; 5CHW A; 1J19 A; 4PYU A; 3BIN A; 4IW0 A; 1V1P B; 3L16 A; 1V97 A; 3V05 A; 2B76 B; 2KNB A; 1WJU A; 3TEW A; 3TUO A; 4ZRK A; 3IG3 A; 1KFY B; 2ZPN A; 1TKE A; 3RD2 A; 2RDB C; 2FCN A; 2L83 A; 1SE2 A; 2N9X A; 3P4R B; 2RR9 A; 2LXC A; 3O13 A; 1FCC C; 1MHX A; 2LI5 A; 2KQ4 X; 2M0A A; 3ETR A; 3AE1 B; 2WXM A; 2DBY A; 4IKG A; 4ASW C; 1RYJ A; 2ZZP B; 2R61 A; 4YL8 A; 4RH6 A; 3UQB A; 1ZP0 B; 3DBL I; 1ZXH A; 3BVZ A; 2MX2 A; 2WDT B; 1I4H A; 4KV2 A; 1RM6 C; 2AWT A; 1E5W A; 2OED A; 2WXR A; 2RGF A; 3GS2 A; 2PIA A; 2CJO A; 4WIP A; 4N58 A; 4PK1 A; 1FIQ A; 2LVP A; 2YLM A; 3H8H A; 4DXF A; 2H89 B; 2MA9 B; 2IGD A; 3ZGZ A; 5C1Z A; 3RT3 B; 4RMA A; 4A90 A; 2D3G A; 1FXA A; 1P0R A; 3QCA A; 2RD0 A; 2I1J A; 1NEN B; 3TSS A; 3PZ7 A; 1C3T A; 1M4V A; 2JSV X; 4IM2 A; 4JPS A; 4EKU A; 3HUI A; 4KIK B; 1PFD A; 4WWO A; 1WJN A; 5LNK 1; 4K3B A; 3UIP B; 2DAJ A; 3WCQ A; 4NJ6 A; 2KHW B; 4TQ1 A; 4TQ0 A; 5AZH A; 3WAO A; 4HCP B; 1UD7 A; 5D2M B; 4XX5 A; 5TR5 A; 3Q8A A; 4W9L A; 2K5P A; 1ZOY B; 3WAM A; 5HKH A; 3Q8E A; 1GAQ B; 3FIL A; 3N1Z C; 1SEB D; 2MBH A; 1ENF A; 1NDD A; 2K1F A; 3QK0 A; 3NZ3 A; 2GLS A; 2BQQ A; 3ZIM A; 2V3P A; 1QZE A; 3HIZ A; 3JW0 X; 1P7E A; 4QAY A; 4DHJ D; 4IG7 B; 1QOG A; 2JWU A; 2LHE A; 4LJO B; 1V1O A; 1OEY J; 3DBH I; 3E9S A; 2N0S B; 3Q3M C; 1VR9 A; 2W55 A; 3ZRF A; 3KWV A; 2C9W B; 3DBR I; 3VQI A; 4OZA A; 5DPR A; 5AUK A; 4CHK A; 2LD9 A; 3VAW A; 2WXG A; 2D2Q A; 3DCG A; 1ZXI A; 1FPY A; 2GRI A; 1DOX A; 1HXY D; 4TV3 A; 2PVO D; 4A6Q A; 3GOE A; 2BPS A; 1IP9 A; 2QHO A; 2Y5C A; 3B08 A; 5LXH A; 4XYC A; 2QC8 A; 1CQV A; 5D7G A; 1EF1 A; 4RGT A; 5KHO A; 2NMQ A; 4IOI E; 3N9Y C; 2IO1 B; 2PVG C; 1LGR A; 4A3P A; 1D5Z C; 4E3C A; 2W3S A; 3ZJV A; 3W5V B; 4OW0 A; 3P4S B; 2DYO A; 2IND C; 1E7V A; 2KAC A; 3SDL C; 5EE3 A; 1XLP A; 1XQQ A; 3BVM A; 4EFO A; 1KLU D; 1ESF A; 2NR2 A; 1RWS A; 2KK8 A; 1R4M B; 1RFK A; 2A4Z A; 3NZU A; 1K53 A; 2KZR A; 2FCQ A; 2Y3A A; 2I2Y A; 1VRA B; 4BZA A; 3TMP B; 2K9X A; 2I1K A; 3VDZ A; 2N7E A; 3QJZ A; 3LXF A; 4YTM B; 4FA6 A; 1B9R A; 2LXA A; 1FM0 D; 5D3I B; 1FXI A; 1TS2 A; 4AWJ A; 3GB1 A; 4G0N B; 1M94 A; 4BKG A; 1LM8 B; 3N32 A; 4W9D A; 1EM7 A; 3B0A A; 4PS8 A; 2HTM E; 3ZXV A; 3HK0 A; 1NI3 A; 2KOX A; 1EF5 A; 3BWU D; 2JT4 B; 4EE2 A; 4MH8 A; 5KHQ A; 4P1B C; 2CR5 A; 1JWS D; 3ZLZ A; 2K8C A; 2JXT A; 3LDZ E; 4MSQ B; 3VRA B; 1BXT A; 5J2R A; 2KC1 A; 3EGR A; 1YIW A; 2SEB D; 1LFD A; 4LDT B; 4II2 B; 4XDD A; 2O2V B; 4ZRI A; 3RI7 C; 4M00 A; 1MHH E; 2O6V A; 3KW5 B; 1J7C A; 1UUP A; 1JRP A; 1VLB A; 4HLE A; 2NS5 A; 2KJR A; 3U8Z A; 2JPH A; 1IUE A; 2WX0 A; 5TSS A; 3PZD A; 4I6N B; 1WX8 A; 1J7A A; 4YTN B; 2VRR B; 4C56 C; 1JRU A; 2G4S A; 2PLP A; 2L0T A; 4BAX A; 5L83 A; 3H7P A; 3A9K B; 1ZDV A; 2N7J A; 3AED B; 1MJD A; 2FID A; 4MGY E; 4HPM B; 3V60 A; 1V49 A; 2MH7 A; 2WDR B; 2ZW0 A; 5JHA A; 2BB5 A; 2O6V B; 2XK5 B; 4C4V B; 1ET6 A; 3DWM A; 3C8Y A; 1D6E C; 1P7F A; 2GBK A; 4M8N A; 2E3T A; 5AZF A; 2WXF A; 1TBE A; 3S2A A; 1VCB A; 2C5L C; 3BYY B; 2D3B A; 1UBQ A; 3IFW B; 2GMI C; 1F2R I; 3RZW C; 2ACZ B; 2FCS A; 3ZYY X; 3PHW B; 3MC0 B; 3RYT A; 3VFK A; 2PJH A; 1YJ1 A; 1P1A A; 2RPV A; 3BVG A; 3RNG C; 3PTF C; 4LJP B; 2QCZ A; 1UH6 A; 1SE4 A; 2RPQ A; 2ZJD A; 1WZ0 A; 3RMK C; 4HKZ E; 3VXW A; 2M4N A; 2MBO A; 1WX9 A; 2KJ6 A; 2WS3 B; 2D10 A; 2KQS A; 3ZNI D; 3PRM B; 1DOY A; 1P3Q U; 3PHX B; 4K81 A; 1QLB B; 4N9F 4; 2R2Q A; 2EKE C; 3T3O A; 1V5O A; 2KFK B; 4XWW A; 1Y8R C; 3QHT A; 2IPK D; 5JXV A; 5CTR C; 4XE0 A; 1UZX B; 3HM3 A; 2K6D B; 4PYZ A; 2MCN B; 2BS2 B; 4LNK A; 4WJP A; 1ZGU B; 2MBQ A; 2K0P A; 3NRZ A; 2M8S A; 4YWG G; 4A8X C; 2KXJ A; 3NS1 A; 1WE7 A; 2KKC A; 2M0X A; 3AEG B; 4C7Z A; 4BOS C; 3ZNZ B; 1C4C A; 1GUA B; 4MJS A; 4JE3 B; 2IZV B; 2KMM A; 4RF1 A; 4ZDV A; 2L1A A; 4CYE A; 1QOB A; 2HTH A; 3UF8 A; 2C60 A; 1AAR A; 3IT6 B; 1BML C; 1NYR A; 5EE0 A; 4ZHP A; 5G2N A; 2WU2 B; 4F8C B; 2IGH A; 1C4A A; 3JVZ X; 3OJ4 B; 4TUU A; 2IYD B; 1KH0 A; 1SE9 A; 3AE6 B; 1CJE A; 2LWP A; 1SIJ A; 3NVY A; 4ANW A; 2BTE A; 4DXG A; 2CHZ A; 2ZCB A; 2BYV E; 3BY4 B; 5C23 A; 3X0W A; 4NAW B; 2KMA A; 1L0X B; 1E6E B; 5AZG A; 3NUH B; 3AV8 A; 2INN E; 1XEE A; 4HVB A; 3IXS A; 3N30 A; 5LLI A; 2CU3 A; 2NPT A; 3O65 B; 2C7M B; 1WMH A; 2TSS A; 1NBF C; 5DPS A; 4KSK C; 1JWU D; 1P98 A; 1SSN A; 3Q8B A; 4MGI E; 2IGG A; 5H8Y E; 2WP9 B; 1VD2 A; 2WDV B; 4JIO U; 1FFV A; 4MGZ E; 4XWT A; 4BKT A; 3FAH A; 1PYW D; 1A70 A; 4MH0 E; 3NZS A; 1MG4 A; 1WM2 A; 4EZL A; 1UF0 A; 3MC8 A; 3V6E B; 1FMA D; 3ZNG C; 3N20 C; 2NPT B; 4WJN A; 1WMH B; 2L05 A; 3N1X C; 5IN7 A; 4AJW A; 4FJY A; 4K7S A; 4JGH B; 5CHF A; 4XDC A; 2KDI A; 1Q10 A; 2KMC A; 2EKI A; 2ZPY A; 4GOC A; 2V3N A; 2LGY A; 1HZ6 A; 4DDG D; 2Z59 B; 2X8X X; 3ZVV A; 4F7Z A; 1YX6 B; 4LNF A; 1VZ8 A; 3TIX A; 2V9H A; 3KUZ A; 4TMA B; 1C4P A; 3JSV A; 4NQK E; 4IUM B; 3IBE A; 1KM7 A; 1QF6 A; 3UQA A; 5IOI A; 5GXG B; 5BYR A; 2KQ7 A; 3VH3 B; 5EE1 A; 3M3J A; 2RSU A; 1N63 A; 4FLH A; 4J3O D; 1TS3 A; 3Q8F A; 1N62 A; 4W9J A; 2QSD A; 2WLB A; 4JX1 C; 4PT5 A; 4WUR A; 2K25 A; 2KDM A; 1QT9 A; 2ZVO A; 2K3U A; 2L52 A; 1FNU A; 3R8B A; 2L3Z A; 3JSV B; 1T6B X; 2IO2 B; 4FJZ A; 3EC8 A; 4WH4 A; 3R7Q A; 3AE5 B; 2GOW A; 3R66 C; 4HPP A; 2XNA C; 4EEW A; 2MW5 A; 2VH1 A; 1I4G A; 3OAW A; 4BKS D; 1D5M C; 3PRZ A; 4DHZ E; 4LCD E; 3Q3J A; 3AU5 A; 3V62 A; 3DOW A; 1YQ4 B; 3AE8 B; 3CF6 E; 2LGD A; 1RAX A; 4E71 A; 3AB5 A; 1WRD B; 3ZDM C; 2M56 B; 1Z2M A; 4W9G A; 3NOB A; 4YT0 B; 3J9C A; 2JRH A; 1YN5 A; 3DHI C; 4N6E B; 4W9C A; 4US9 A; 1HEZ E; 4HDQ A; 1XLO A; 2VH2 A; 2QMT A; 4OZC A; 3DBL B; 4RGM A; 4FHK A; 3CIR B; 5E6N A; 1EWY C; 3APC A; 2DZI A; 1WGR A; 1E8W A; 2JF5 A; 2EMS A; 2PTL A; 1WE6 A; 1IPG A; 3A1Q A; 3DQV A; 3AUL A; 1WXM A; 2VZK B; 2KFJ A; 2QJL A; 3VUY A; 3GZN I; 1MVK A; 4AS1 A; 3M95 A; 1ROE A; 2DEN B; 3DPD A; 1WH3 A; 1DGJ A; 3NG0 A; 2AL6 A; 3CWI A; 2QEJ C; 3P4Q B; 1FCL A; 3RN9 C; 2N7D A; 3UIO B; 3ZKJ C; 1C78 A; 2ZNV B; 2JY6 A; 4HEA 1; 1T0Y A; 4P6V F; 1SXT A; 2N4F A; 3AMZ A; 2BB6 A; 4USA A; 2WHI A; 4MGK E; 2JU6 X; 1SJH D; 4LNO A; 2W9N A; 1C77 A; 4DHZ B; 2KVR A; 2I38 A; 2DX5 B; 3EHV A; 1ZKH A; 2CHX A; 4W9F A; 4HCN B; 1N61 A; 1WJ4 A; 3AE3 B; 3DVG X; 4WJO A; 5D94 A; 1MG8 A; 1E9M A; 3PV1 A; 4Q2J A; 2LEK A; 4NAM A; 3MP9 A; 3L0W B; 2YEP B; 3FIL B; 4WAA A; 1H4R A; 1XXG A; 1MPE A; 1GJZ A; 2KVZ A; 4TKN A; 4MM3 A; 1OGW A; 1I4R A; 2NTT A; 2A5U A; 1V9J A; 4GU2 A; 1Z5S B; 2KTR A; 1AYF A; 4O1N A; 3RUL A; 3I9V 1; 3SD5 A; 2MWS B; 1XD3 B; 1XO3 A; 3NHE B; 2V4I B; 2J4X A; 1WI0 A; 4KX6 B; 2CHW A; 1R4N I; 1V5T A; 3DBH B; 3BII D; 1WXQ A; 3LYY A; 1RRB A; 1I7H A; 2D3A A; 2W82 A; 2BBC A; 2VZK D; 1WJ6 A; 2SAK A; 4YSX B; 3HM6 X; 4RF0 A; 2JRI B; 3DBR B; 1L4Z B; 3GP7 A; 3AU4 A; 4RFB A; 3RCZ A; 1TY0 A; 2KTR B; 1ZUD 2; 4I6P A; 1FNV A; 2WXP A; 3PO0 A; 2OOB B; 4ZRP A; 2INP E; 3DHG C; 3EEC A; 4GB9 A; 4OVZ A; 3TCA A; 2BF8 B; 3RNF C; 2CS4 A; 2LVO A; 2OJR A; 1JWB D; 1JML A; 2CU1 A; 2N9P C; 1WGY A; 1JWA D; 4ICU A; 4K3C A; 1UEL A; 1TTN A; 4B95 A; 1FFU A; 2GBN A; 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4DQO C; 4OVU A; 2WXN A; 4FN2 A; 4HRO A; 4UDU C; 4AOF A; 1E8Z A; 2WXK A; 3N1Y C; 3WAP A; 3A33 B; 5AUI A; 2KX0 A; 3AEA B; 2L32 A; 2MBE A; 3Q8C A; 2KDE B; 4ANV A; 1JWM D; 4PS3 A; 3VHT C; 1T0Q C; 1WGK A; 4K1R B; 4LDT D; 4JQW C; 1F77 A; 3HHM A; 4KVG B; 3K9P B; 3EUB 2; 1V8C A; 1P9D U; 2PMV A; 2WX1 A; 2PPH A; 2PE9 A; 2K22 A; 2BWF A; 4M0W A; 1DYQ A; 1GB4 A; 3MC9 A; 3ZO5 B; 3SR6 A; 3NVW A; 2D11 A; 5IAA C; 4EOY A; 4JWS C; 5JHB A; 1T3Q A; 1L6V A; 2O6V D; 2LGX A; 4W9H A; 4BBN C; 3BK1 A; 2CKH B; 1KLG D; 4WWM A; 4LNI A; 5IA7 A; 3W1S A; 1LQB A; 3IAS 1; 4A20 A; 5D3D A; 2WXJ A; 2AL3 A; 2NBW B; 1C1Y B; 3L54 A; 1PQS A; 3L17 A; 1TS4 A; 2G3Q B; 3H9D A; 1KRH A; 3OJ3 A; 3W2D A; 3Q3O C; 3T3N A; 1HTQ A; 1V80 A; 3A4R A; 3MJ5 A; 2D5G A; 3GE3 C; 4MJS B; 2PEA A; 4B6W A; 1AN8 A; 5AEK B; 5E6P A; 3C0R B; 3SU8 X; 4M02 A; 1IGD A; 1Q0W B; 1I4P A; 4MEM A; 5HI1 A; 2L0F A; 2LJ5 A; 3ZQ4 A; 3NVZ A; 3ML9 A; 4L23 A; 1HA5 A; 2N9L A; 4RCO A; 2E6X A; 2JUO A; 2FCM A; 2N1W A; 2V0G A; 3WAN A; 3B2G A; 1L2N A; 2KLC A; 5G55 A; 3KLS X; 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