The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADGGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JWU A; 1IBX A; 3UI3 A; 2N9K A; 2ZW1 A; 2QMT A; 2KWD A; 1MVK A; 2LGI A; 1MPE A; 2LHE A; 2IGD A; 1MI0 A; 2RMM A; 1FCL A; 3GB1 A; 2RPV A; 1K50 A; 1UWX A; 2OED A; 2GI9 A; 4D2K A; 2LHD A; 2ON8 A; 4KGR A; 2KQ4 X; 2I38 A; 5HFY A; 1F2R I; 5HI1 A; 1D4B A; 1ZXH A; 2PTL A; 1FD6 A; 1JML A; 1HEZ E; 3FIL B; 2JZP A; 5BMI A; 2JXT A; 1P7F A; 2QSD A; 2NMQ A; 1F2R C; 4KGS A; 2KN4 A; 4IKG A; 1IGC A; 2PLP A; 3FIL A; 1K52 A; 5HG2 A; 1PGX A; 2I2Y A; 2PW9 A; 1IGD A; 2LUM A; 1YNT E; 1K53 A; 2KDM A; 2KAC A; 1GB4 A; 2K0P A; 1HZ6 A; 2IGG A; 2GB1 A; 4IOI E; 5HHD G; 4HKZ E; 4WH4 A; 1EM7 A; 5BMG A; 3MP9 A; 1PGB A; 1XCT L; 2JSV X; 1Q10 A; 2ZW0 A; 5BMH A; 4OZB A; 1MHX A; 4HJG E; 1KH0 A; 1P7E A; 1C9F A; 2J53 A; 2JU6 X; 2ONQ A; 4MAC A; 1GB1 A; 5JXV A; 1PGA A; 4OZA A; 1FCC C; 4GLS C; 3V3X A; 1MHH E; 1XF5 L; 2EEL A; 2J52 A; 2IGH A; 1XCQ L; 1YMH E; 1K51 A; 1IBX B; 2N7J A; 2N9L A; 4KGT A; 1HZ5 A; 4OZC A; 1QKZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1LM8 B; 2JWU A; 1TKY A; 3OWE B; 2N9K A; 2B76 B; 3AU4 A; 1KJT A; 4J3O D; 2IZV B; 2GRI A; 4ANU A; 1WE6 A; 4A6Q A; 4EEW A; 1SXT A; 1V1P A; 3GB1 A; 3V61 A; 3Q3O C; 2KVZ A; 3HUI A; 4YL8 A; 1DYQ A; 2MBQ A; 4S17 A; 3PRE A; 1Y56 A; 1ZDV A; 1E8Z A; 1Z5S B; 2N4F A; 4HPP A; 4BVU C; 2KN4 A; 4YXD B; 5E6O A; 3UQB A; 4TUU A; 2JRH A; 3FIL A; 3RFZ B; 2KD0 A; 4TV3 A; 1PUT A; 2Y5P A; 3ENE A; 3NVY A; 2M17 A; 2BYE A; 3HHM A; 2IGG A; 4JWS C; 2IPK D; 1J7A A; 2LXA A; 2WXH A; 4DQO C; 2IBI B; 4RH6 A; 1M4V A; 2ZW0 A; 4KX6 B; 2FUG 1; 4FJZ A; 2IO3 B; 1TGZ B; 2DBY A; 1OFF A; 2C5L C; 3R3M A; 3EGR A; 2HJ1 A; 3NVV A; 3AE4 B; 2ZJD A; 3VTV A; 1WXQ A; 4EOY A; 2Q5W D; 1WXM A; 3B1L X; 3OJ3 A; 4REZ A; 1XQQ A; 1KLU D; 2KMM A; 1E8W A; 4FJV B; 4FLH A; 2INP E; 2IJ0 A; 3PRM B; 2V3S A; 1TY2 A; 2BS3 B; 3DVG Y; 2OJW A; 3B2G A; 4OVZ A; 2YEP B; 4GOC A; 1MVK A; 1WGR A; 5IOI A; 1JAL A; 3UIP B; 3BVZ A; 3MC8 A; 4I6P A; 2ZNV C; 3BK2 A; 4L23 A; 2NVU I; 2OED A; 3ZTC A; 2MP2 B; 3Q8E A; 1HTO A; 2L0T A; 1WGK A; 4EFO A; 3EHV A; 3KH0 A; 2WXJ A; 4MH8 A; 2VH2 A; 2YLM A; 1OQY A; 3B9J A; 1KM7 A; 3AV8 A; 2NMQ A; 5DPR A; 3RUL A; 5J17 A; 5HG2 A; 3VDZ A; 1VZ7 A; 2AEH A; 2K3U A; 1NEN B; 2ZPN A; 3M3J A; 2K39 A; 1CMX B; 3SU8 X; 1PDX A; 3SD5 A; 4USA A; 4F7Z A; 2D3A A; 3JYU A; 2QCZ A; 5HHD G; 1GC6 A; 2GBM A; 3RZW C; 3Q8C A; 2R2O A; 2AQ1 B; 4MDK E; 4MM3 A; 3MJW A; 4CQN A; 4HJG E; 4S0R A; 3RPF C; 4EE2 A; 1E0Z A; 1ZW7 A; 2DYM A; 4N58 A; 1N62 A; 5D7G A; 4F8C B; 1N63 A; 3BYY B; 3RNE C; 4OZA A; 1QT9 A; 1YQ4 B; 2KO3 A; 1MHH E; 3BII D; 3JVZ X; 3RNG C; 1SE3 A; 3ZUN A; 1XCQ L; 1WJN A; 3Q3N C; 1SJH D; 1IBX B; 1QF6 A; 2PJH A; 1WYG A; 4FBJ B; 2HE7 A; 5LLI A; 4HLE A; 3AI5 A; 3KUZ A; 3HM3 A; 5BO4 B; 3L13 A; 2KOX A; 5I4D A; 3ML9 A; 3VH3 B; 1V86 A; 4C4V B; 4FA6 A; 1VD2 A; 1J0G A; 4BKS A; 1RFK A; 1ACC A; 2WX1 A; 3JW0 X; 3AEF B; 1UWX A; 3PT2 B; 4E71 A; 2C60 A; 2LHD A; 2KQ4 X; 4DXA B; 2CS4 A; 1N6Z A; 2IO2 B; 3AEC B; 2MBB B; 1TTN A; 4HRO A; 3W2D A; 1I4X A; 1HEZ E; 1V2Y A; 1HQR D; 2QEJ C; 2Z0D B; 3BWU D; 4BKG A; 3RYT A; 3APC A; 4W9I A; 1EU4 A; 1GUA B; 3PHW B; 4JWU C; 2KVR A; 1YX5 B; 4GDK B; 4KSK C; 2RD0 A; 1Q5W B; 3CF6 E; 1FIQ A; 3AEE B; 4B0M A; 4ZYS A; 3VRA B; 3Q69 A; 1GB4 A; 2BS2 B; 2QDF A; 4ANV A; 2KAJ A; 2WP9 B; 3TEW A; 3WA0 A; 2G3Q B; 2I1J A; 1YJI A; 4N9F 4; 1Z2M A; 4IC7 B; 3TEY A; 4J6I A; 4LJO B; 3L54 A; 3WAP A; 3R2T A; 1EO6 A; 2CJN A; 2KDE B; 3RNF C; 2D5G A; 1JWS D; 5L83 A; 4MAC A; 5JXV A; 2J0M A; 1ET6 A; 4DDG D; 1G6J A; 2IY0 B; 4M8N A; 3ZJV A; 3P4S B; 1E7V A; 2ZVN A; 3PZ8 A; 4JLC A; 4AWJ A; 3ZKJ C; 3UIO B; 2XK5 B; 4M0W B; 4IM3 A; 4MEM A; 2N7E A; 2V3N A; 4K7S A; 3Q8B A; 3HK0 A; 3APD A; 2W55 A; 2K5P A; 4QAY A; 1MG4 A; 3ZTD A; 3KVF B; 2KKC A; 1YJJ A; 4KVG B; 2KDB A; 1FCL A; 5HKH A; 1V8C A; 2B3A A; 1PYW D; 4AS1 A; 1EF1 A; 2L3Z A; 1T0Y A; 2RSU A; 3B0A A; 1WYW B; 3GS2 A; 1AAR A; 1QOA A; 2CU3 A; 5JH5 C; 5H8Y E; 1YQB A; 2XNA C; 2MP2 A; 3V6C B; 1E90 A; 1ESF A; 3VUY A; 5EE0 A; 2UU7 A; 2AX5 A; 2MX2 A; 1VRA B; 1HXY D; 1TKE A; 2LVO A; 1WX7 A; 3V60 A; 4I6L B; 2KC1 A; 1YD8 U; 1K53 A; 1I35 A; 5FK9 C; 4IOI E; 5EE3 A; 5BMG A; 5TSS A; 3MP9 A; 3EC8 A; 3P42 A; 5JZE B; 2X8X X; 4N6E B; 1LO5 D; 2QIE B; 3AU5 A; 3NZU A; 3BK1 A; 4BBN F; 3CIR B; 1LFD A; 4MGK E; 3BVG A; 2KWU B; 2QHO A; 4PS7 A; 1BML C; 3M95 A; 2LMC A; 1CQV A; 2J7Q B; 3VH4 B; 1AW7 A; 1SEB D; 3WAO A; 1FNU A; 1H4R A; 4US9 A; 3TSS A; 2K8C A; 1NI2 A; 1UBI A; 4IWO A; 3IHP C; 4ZRK A; 1X1M A; 2CU1 A; 1IBX A; 4HXD A; 3ZLZ A; 1IUE A; 3TBL D; 4CO7 A; 1TT5 B; 1P1A A; 2N0S B; 3W5U B; 1T5X D; 5GXG B; 3HM6 X; 5C23 A; 2GI9 A; 4ITK A; 2FBW B; 4C4V A; 1F2R I; 2ZPY A; 2WDQ B; 2BS4 B; 1JWU D; 1XD3 B; 2AWT A; 2VRR B; 1VJK A; 4I6N B; 2A5U A; 1WXA A; 4C7Z A; 2JXT A; 1TS3 A; 1KRH A; 2CHX A; 4NZL B; 1FFV A; 4W9E A; 2LVP A; 2WXM A; 5L95 C; 4K3C A; 1T3Q A; 1K52 A; 4DHJ B; 4P1C C; 1PGX A; 2R61 A; 1UGM A; 3O13 A; 1FNV A; 1C79 A; 2LRW A; 2KDM A; 3T3O A; 2NBU A; 1SIF A; 1RM6 C; 4GDK A; 4WH4 A; 1EM7 A; 3W1Y A; 4LNO A; 1PGB A; 4NQK E; 1WXS A; 3PPA A; 1K8R B; 1KH0 A; 1L6U A; 2FCS A; 2CHW A; 1QZE A; 4MSM B; 2V4I B; 1TY0 A; 4G3X B; 4MT5 A; 2LWP A; 1ENF A; 1C9F A; 2DAF A; 3AM9 A; 4P7I A; 4LTU A; 1ISN A; 2LUE A; 1S1Q B; 2WLB A; 2R2Q A; 1VCB A; 3DPD A; 3BY4 B; 4WJQ A; 4OVU A; 3U30 A; 2BT6 A; 2JY6 A; 4RCO A; 5AZH A; 3FC4 A; 1LXD A; 2DNF A; 2L05 A; 1DOI A; 4II3 B; 2PMV A; 1RRB A; 3MTN B; 3QHT A; 5C1Z A; 2MBO A; 3RZF A; 2XK5 A; 4M0W A; 4ZHP A; 3P4R B; 3RNA C; 4ANX A; 2LAS A; 2KN5 A; 1CJE A; 4DHZ E; 4ICU A; 4HDQ A; 2FCQ A; 4KZC A; 3Q6B A; 2MSE D; 2ON8 A; 3OLM D; 3QCA A; 1FM0 D; 4G11 A; 4MGZ E; 3AEA B; 1LGR A; 1F77 A; 2BWE S; 4YTN B; 1P7F A; 1RFA A; 4DHZ B; 2BYV E; 5AZG A; 2WXO A; 2NCN A; 1HTQ A; 2VH1 A; 1XLQ A; 4TKN A; 3AXC A; 2KMC A; 4AQ7 A; 2JT4 B; 1A5R A; 2M0A A; 2CR5 A; 4FHK A; 1WJ6 A; 4WQM A; 3KLS X; 3ZXR A; 3KUC B; 1SE2 A; 2M1M A; 4IUM B; 1N5X A; 2JSV X; 1H8C A; 2G4D B; 2KAN A; 1QOG A; 1MHX A; 1V81 A; 2PE6 B; 3AE1 B; 2O2V B; 5AUI A; 2REX A; 2PEA A; 4NQL B; 1JCK B; 1I4Q A; 3D32 A; 3N30 A; 3ZXV A; 4GGQ A; 1GB1 A; 1PGA A; 3HRD D; 3MJ5 A; 2JPH A; 4DWF A; 4BOZ B; 1B9R A; 1VDV A; 3LB8 C; 1WF9 A; 2WXL A; 4HWI B; 3E9S A; 1WGY A; 3ZNH B; 2D07 B; 4GB9 A; 2KDI A; 2DAJ A; 3UF8 A; 1L0V B; 3PSE B; 4PT5 A; 5EE1 A; 4ASW C; 1OQR A; 3PLU A; 1SF0 A; 2M8S A; 3AMZ A; 3ZIM A; 4X57 B; 3KYD D; 2QJL A; 4A20 A; 3H6N A; 2KNB A; 1WX9 A; 4C56 C; 2MRP A; 1JRU A; 4OW0 A; 4BOS C; 2WWZ A; 5IKC M; 5LNK 1; 5T8I A; 3V62 A; 4OVV A; 2V3P A; 3MHZ A; 4ZOH C; 2XEW A; 3RN9 C; 2BB6 A; 2GBN A; 1NI3 A; 2GBJ A; 1GNU A; 1YX6 B; 1WIA A; 5TR5 A; 1F0Z A; 4P6V F; 1I4R A; 2OHF A; 4HVB A; 4WWN A; 3IT6 B; 3NZ3 A; 2KT7 A; 2RDG A; 4WAF A; 3DVG X; 2K1F A; 4MSQ B; 2Z0E B; 4IM2 A; 1D5Z C; 4A90 A; 2QIL A; 5DPW A; 4PS3 A; 3DHI C; 2GB1 A; 3BIN A; 4PK1 A; 2BYF A; 3DCG A; 4HKZ E; 2PPH A; 3ZNI D; 1UGJ A; 3NY5 A; 1OGW A; 1Q10 A; 3HVD A; 1V49 A; 5BMH A; 4RGT A; 4A8X C; 4P16 A; 5GMV A; 1WSP A; 2D11 A; 2WX0 A; 3VRB B; 4IG7 B; 3IAS 1; 5J2R A; 1IYF A; 2JU6 X; 1I4P A; 2W9N A; 1BUI C; 4URK A; 2KLC A; 2WGS A; 5D3I B; 3IG3 A; 3Q14 C; 4JX1 C; 1VZ8 A; 4AJY B; 3M63 B; 1WRI A; 2J0J A; 2WXR A; 1J19 A; 2N1W A; 1HZ5 A; 2FID A; 5AEK B; 2ZCB A; 2K6Q A; 2MHJ A; 1I4G A; 3P63 A; 2JQR B; 3K9O B; 2NR2 A; 4RNA A; 4FHJ A; 1E8Y A; 1FNW A; 4DBG A; 3VFK A; 2DHZ A; 3OAW A; 1WE7 A; 3UQA A; 1JW9 D; 3K9P B; 2RPV A; 3Q3J A; 3H7P B; 5FKA C; 2H89 B; 4NY0 A; 3NVW A; 3UIN B; 2M0X A; 3AE7 B; 4GMV A; 1ZXH A; 3RI7 C; 1XT9 B; 1AN8 A; 4ZRJ A; 3RT3 B; 2JZZ A; 2LJI A; 2J42 A; 1TIF A; 2EKE C; 2Z8L A; 4M00 A; 3QQ8 B; 4FXC A; 3DQV A; 2PW9 A; 4A55 A; 2BB5 A; 4CYE A; 2LGY A; 2LJ5 A; 4GIV A; 1KLV A; 3QJZ A; 2K6D B; 1ZKH A; 1FMA D; 4B95 A; 1V5T A; 1V97 A; 4M02 A; 5CX3 A; 1TKG A; 2M4N A; 3H9D A; 4M8M A; 3PS6 A; 4K81 A; 2J53 A; 1LQB A; 2O2V A; 3X0W A; 3NOB A; 4O1N A; 3ZRC A; 2IGH A; 1ZE3 D; 1WGG A; 3JSV B; 1ZP0 B; 2WYQ A; 3TMP B; 2GBK A; 3ZNG C; 4OZC A; 5BYR A; 2KMA A; 2EMS A; 2LHE A; 2IGD A; 3EEC A; 1GPX A; 5BYQ A; 5G2N A; 1J7B A; 2L1A A; 3U2S C; 4ANW A; 4JIO U; 1SB3 C; 2Y3A A; 1FO4 A; 2FNJ B; 4KSL C; 2BWF A; 2IDY A; 2Y5C A; 1QIL A; 4HCP B; 1V6E A; 1R4M I; 5DPS A; 3EUB 2; 1Q0W B; 1YN4 A; 4MJS B; 2BF8 B; 2LI5 A; 2O6V D; 3DHG C; 3MHS D; 2LRU A; 2K8B A; 3FKY A; 4NJ6 A; 2BKR B; 4HKQ A; 3NUH B; 4NAW B; 2RR9 A; 1WXV A; 3FAH A; 3PGE A; 4KV2 A; 4K7W A; 1V5O A; 4ZHO A; 3CWI A; 1C76 A; 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2MJE A; 5D3D A; 4TQ1 A; 2MWS B; 2D3C A; 5BYS A; 2WXF A; 2QC8 A; 3TCA A; 4BBN C; 4BKT A; 3L17 A; 2KFJ A; 2Y5B B; 2GBR A; 2PVO D; 2UWQ A; 4UDU C; 4YTP B; 2ONQ A; 1WWT A; 1WJ4 A; 4OHJ A; 2X38 A; 1L4D B; 1KLG D; 2PKO A; 3A9K B; 1JRO A; 1UH6 A; 4IWP A; 4TQ0 A; 2MW5 A; 3DBR B; 4GN1 A; 2BVC A; 2WDR B; 3PRP B; 2EMT A; 4AUQ C; 2N9P C; 2OOB B; 1UZX B; 3UI3 A; 3JSV A; 4XDC A; 2IO1 B; 1GC7 A; 3WAL A; 3ALB A; 1A70 A; 3GE8 C; 3I5J C; 1L0X B; 4BZA A; 2C7M B; 1R4N I; 3WCQ A; 4XGA B; 1C77 A; 4EKU A; 3AH7 A; 3ETR A; 5E6J A; 1E7P B; 2VZK D; 3L16 A; 2ZCC A; 3A9J B; 4W9H A; 4II2 B; 1JML A; 2DYO A; 2QSD A; 1F2R C; 1F1H A; 3NG0 A; 3WIM A; 3Q2A C; 3DVN U; 4WAA A; 3EFC A; 4DXF A; 3SDL C; 2KXJ A; 2DZM A; 4MJS A; 1V1O A; 3UGB B; 2L83 A; 4YSZ B; 3TEX A; 2UYZ B; 4LLG M; 2YEP F; 3LJ3 A; 1R7S A; 5AZF A; 3S2A A; 4NPN A; 4NAW A; 1KOT A; 1S3S G; 4WIP A; 5DPT A; 1C78 A; 1VZ6 A; 4BAX A; 2N7D A; 3IT4 B; 1RYJ A; 2V4L A; 3MC0 B; 1YQ3 B; 2NPT A; 3C8Y A; 4LNN A; 3RNC C; 1WI0 A; 2EKI A; 4DXG A; 3SR6 A; 3TUO A; 2KDF B; 4TMA B; 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