The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANASTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LGI A; 3FIL A; 3UI3 A; 1F2R I; 1ZXH A; 1MPE A; 2I38 A; 1MHX A; 2K0P A; 2LUM A; 1MVK A; 2PW9 A; 2N9L A; 1K51 A; 1K52 A; 1FD6 A; 1C9F A; 2J53 A; 2IGH A; 2ZW0 A; 1K53 A; 2EEL A; 2RPV A; 2GB1 A; 2GI9 A; 4OZB A; 4D2K A; 1PGX A; 2ZW1 A; 1K50 A; 2QMT A; 2QSD A; 2KAC A; 3MP9 A; 4IKG A; 4OZA A; 1PGB A; 5HHD G; 1EM7 A; 4HJG E; 2PLP A; 2JU6 X; 4WH4 A; 5HI1 A; 4KGR A; 1QKZ A; 4KGS A; 2KQ4 X; 1YMH E; 4IOI E; 1IBX B; 1MHH E; 1P7E A; 1XCQ L; 2N9K A; 2JXT A; 5BMI A; 2ONQ A; 1F2R C; 1GB4 A; 1GB1 A; 2LHD A; 1JML A; 5JXV A; 1IGC A; 4MAC A; 1D4B A; 2ON8 A; 1KH0 A; 5HFY A; 1IBX A; 2KDM A; 2JSV X; 2JZP A; 4KGT A; 2LHE A; 1YNT E; 1HEZ E; 1UWX A; 1Q10 A; 2IGD A; 4OZC A; 1XCT L; 2I2Y A; 1HZ6 A; 1FCC C; 4HKZ E; 2PTL A; 3FIL B; 3GB1 A; 1HZ5 A; 2J52 A; 1PGA A; 5BMH A; 3V3X A; 2RMM A; 1FCL A; 2N7J A; 1XF5 L; 2OED A; 2JWU A; 2IGG A; 2KN4 A; 2NMQ A; 1MI0 A; 4GLS C; 5HG2 A; 5BMG A; 1P7F A; 1IGD A; 2KWD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QQ8 B; 2YEP B; 5E6O A; 1WFY A; 2KX3 A; 1E10 A; 3AEF B; 1FRD A; 2ZPY A; 5LXI B; 4W9J A; 4CO7 A; 3VTU A; 3A9J B; 1Q1O A; 4LNN A; 1FIQ A; 4IG7 B; 2KTR B; 2BGF A; 1KLU D; 1XLO A; 3M63 B; 4WJN A; 4NAW A; 3I5J C; 2KMM A; 4W9E A; 2RD0 A; 3NHE B; 2WYQ A; 3P4R B; 5GXG B; 4OZA A; 2J42 A; 3A1Q B; 3DHG C; 1HQR D; 1V6E A; 1JCK B; 1N5X A; 3V60 A; 4PYZ A; 4JL9 A; 3EUB 2; 5KHQ A; 2PMV A; 3VTW A; 2FNJ B; 3H8H A; 5JZE B; 1YN4 A; 3AXC A; 2KN5 A; 3ZNZ B; 3UIN B; 3FC4 A; 4WQM A; 3P42 A; 4LDT D; 5FR6 A; 2PPH A; 3E9S A; 1NYQ A; 4GU2 A; 1E5W A; 3U2S C; 2BT6 A; 1A70 A; 3IG3 A; 3RYT A; 1GJZ A; 3ZNG C; 3H7P A; 1E90 A; 1V5T A; 3E56 A; 1PUT A; 2XK5 B; 1FPY A; 5FR3 A; 2BYT A; 2J7Q B; 2NBW B; 3AE9 B; 2SAK A; 1E0Z A; 2DBY A; 1LXD A; 1QOG A; 3TUO A; 2AEH A; 3CWI A; 2ASQ A; 1YX6 B; 2LGX A; 1I4X A; 3N3K B; 3JVZ X; 4A6Q A; 2N9E B; 4REZ A; 3IBE A; 1HZ5 A; 2J52 A; 2JZZ A; 3V3X A; 3W2D A; 4OHJ A; 2ZNV B; 3W1S A; 5CX3 A; 5HG2 A; 4R3D A; 4AUQ C; 1SGH A; 2WQY B; 2MRP A; 4KV2 A; 2A5U A; 1ZGU B; 1LGR A; 3VRA B; 3U30 A; 2V3N A; 2WLB A; 3DVN V; 4MH0 E; 1XD3 B; 3ZTC A; 4EZK A; 4ZOH C; 4FUL A; 1C4P A; 2KVR A; 1MJD A; 5H8Y E; 4F1S A; 1SJE D; 3AI5 A; 4OZB A; 1AWD A; 3Q8E A; 1K50 A; 2KLG A; 3QWZ B; 2C9W B; 4HKQ A; 4P16 A; 1YJI A; 2ZVN A; 3T3N A; 5IOI A; 1J7A A; 1RFK A; 3A9J A; 2N4F A; 1WGD A; 2JXX A; 2GBJ A; 4RF1 A; 2JU6 X; 4WH4 A; 2KTR A; 4ANV A; 2X38 A; 2M0A A; 4KGR A; 4MGY E; 1T0R C; 1L2N A; 3ZDM C; 2N1V A; 2EKI A; 3T9L A; 2MSE D; 4FHK A; 3A1Q A; 2VZK B; 4N59 A; 4I6L B; 5G5G A; 3URY A; 1HTQ A; 2KAN A; 4B0E A; 1L4D B; 1WJU A; 3BII D; 2HDE A; 4DHJ D; 3AM9 A; 1KH0 A; 1RWS A; 3KQ4 A; 1LQB A; 4FBJ B; 4HDQ A; 1U4A A; 1SB3 C; 1YNT E; 3RN9 C; 5MPO A; 2BKF A; 1WR1 A; 4EKU A; 3Q8F A; 1R4N B; 2CR5 A; 5BYQ A; 4GSW A; 5C23 A; 3I63 C; 4W9F A; 2GLS A; 1ROE A; 2LEK A; 4G3X B; 2XK5 A; 3QC8 B; 4RM9 A; 2CKH B; 1PGA A; 4C7Y A; 2VH2 A; 2WS3 B; 4EFO A; 3VH3 B; 3AU4 A; 2KQ7 A; 2WXL A; 3Q2A C; 2WXQ A; 1Q5W B; 5AUK A; 3GOE A; 2IGG A; 1RM6 C; 2FUH B; 3KUD B; 2KC2 A; 3Q14 C; 4RFB A; 2KWD A; 4HVB A; 3NZS A; 3LYY A; 1UD7 A; 5L83 A; 1TS3 A; 4ZYS A; 3TEW A; 2SEB D; 3ZQ4 A; 2KVZ A; 1QIL A; 2W55 A; 4IW0 A; 5G2N A; 2MX2 A; 1WIA A; 4HCP B; 2M17 A; 1C9F A; 4HRS A; 3PLV A; 4XGA B; 2UYZ B; 1KTK A; 3L13 A; 2WXG A; 2JQR B; 3KH0 A; 5E6P A; 4ARC A; 4WWO A; 2MJD A; 1L6V A; 4K3B A; 2MP2 B; 2IY0 B; 4HPP A; 5JH5 C; 1UH6 A; 2DZK A; 3MJ5 A; 5HI1 A; 4S0R A; 2BBC A; 1IBX B; 2PKO A; 3NZU A; 4NJ6 A; 3DOW A; 4BKS D; 3M62 B; 3AE6 B; 3V05 A; 2IND C; 1I35 A; 4CHK A; 1P3Q U; 1IGC A; 2WDQ B; 1S1Q B; 4KX6 B; 2W3S A; 1FEH A; 1S3S G; 3BWU D; 3B9J A; 2LHE A; 3ZUN A; 2NTS A; 1L0Y B; 1JAL A; 1Q10 A; 2LGS A; 2KJR A; 4ZDV A; 2L7R A; 3KLS X; 2E3T A; 2N0S B; 3N1Z C; 3B1L X; 1ZUD 2; 1YOV B; 2DX5 B; 2DZM A; 1CZP A; 4UDU C; 2MJE A; 3IT6 B; 4J6I A; 3RNC C; 4TSS A; 3UQB A; 2KNB A; 3VTV A; 2ZCC A; 4LLG M; 1V9J A; 3OLM D; 1SSN A; 3AE3 B; 3D32 A; 2B76 B; 3PRE A; 2KOX A; 3HIZ A; 4KVG B; 5LNK 1; 1K51 A; 3ZJU A; 1OQY A; 3S2A A; 2WXF A; 1BT0 A; 1IPG A; 2HTM E; 4KSL C; 3ZXR A; 3DVG X; 2WDT B; 3DBR I; 4MJS B; 2KWC A; 2KJH B; 4MSQ B; 4USA A; 3RPF C; 1WXA A; 4KKI A; 4LNI A; 2K8H A; 2IO3 B; 1QOA A; 2HD5 B; 4OVZ A; 4BVU C; 3MFG A; 5AZG A; 2JZ3 B; 2LHD A; 2MP2 A; 2NPT B; 3R2I A; 3Q3N C; 2J0J A; 1AYF A; 4MAC A; 4ZRK A; 4ANX A; 4WUR A; 4DQO C; 4JE3 B; 4WAA A; 2DYB A; 2KFK B; 3PRP B; 3VXW A; 1IBX A; 2G3Q B; 4KZ0 A; 4DHZ E; 1FNV A; 2ZEQ A; 3KUC B; 4DDG D; 3QA8 A; 3AE7 B; 3IAS 1; 1FNU A; 1TT5 B; 4HRO A; 2B3A A; 2BS2 B; 4K1R B; 4W9K A; 3CIR B; 1JRO A; 1I4H A; 3QHT A; 2KZR A; 2GBN A; 2OHF A; 4MDK E; 3GB1 A; 3MC9 A; 3ZDT A; 5D3D A; 3A9K B; 4KDI C; 3NOB A; 3WAO A; 3PZ7 A; 1BUI C; 3EFC A; 1J7C A; 3QIJ A; 1C77 A; 2BQQ A; 2GBM A; 4WJQ A; 5AZF A; 3V62 A; 5BYS A; 1PDX A; 2KDI A; 1CQV A; 1KFY B; 3UI3 A; 4KZC A; 3BIN A; 2LUM A; 1WXM A; 3Q8B A; 2C7M B; 1F52 A; 2KYW A; 4HWI B; 1FNW A; 2M4N A; 1TIF A; 4C80 A; 3UGB B; 3VUX A; 1JWS D; 1PQS A; 3DWG C; 2L0F A; 1UWM A; 3APD A; 2FCS A; 4YL8 A; 4ZYN A; 2K5P A; 3ALB A; 1RFA A; 4K7U A; 4BAX A; 2WX1 A; 2KMC A; 3GE3 C; 1UGM A; 1JRP A; 4MJS A; 3AN1 A; 2RDG A; 1JML A; 5JXV A; 2TSS A; 2AQ2 B; 2JRH A; 4IUM B; 1WX9 A; 1J0G A; 3AEC B; 2JF5 A; 3DBL B; 3JW0 X; 2G4S A; 4HPL B; 2N7D A; 1I4P A; 4RMA A; 2JZP A; 3ZNH B; 2LMC A; 2BB5 A; 3K9O B; 3ZGZ A; 3SFD B; 2NPT A; 1UWX A; 4GN1 A; 1HXY D; 2QIL A; 2QC8 A; 2HJ1 A; 4DXF A; 1STE A; 1V97 A; 1WM3 A; 4ZRI A; 2KFK A; 1ZDX A; 3P4P B; 2M0X A; 3TEY A; 1TS4 A; 1WGK A; 4PYU A; 1EUV B; 2KDE B; 1ESF A; 1RLF A; 3HK0 A; 3NUH B; 2MEK A; 2QJL A; 1G6J A; 1M94 A; 1WM2 A; 2L3Z A; 4AQ7 A; 1F2R I; 1ZXH A; 1WRD B; 2MW5 A; 2L83 A; 3A9K A; 1EU3 A; 4K3C A; 1N62 A; 2DLB A; 2GB1 A; 1PGX A; 5IO9 A; 1EO6 A; 2M56 B; 3B08 A; 2QSD A; 1ET6 A; 5IP4 D; 2K22 A; 4WJO A; 2KT7 A; 2JWZ A; 4GMV A; 2JRI B; 4TQ1 A; 1XO3 A; 2DNF A; 1WXS A; 2VH1 A; 1KJT A; 3CF6 E; 1FO4 A; 3RFZ B; 2KQ4 X; 4YSY B; 2CHW A; 1YMH E; 4RCO A; 1BXT A; 3SDL C; 2N9K A; 2WXO A; 3NZ3 A; 1WGY A; 4XZ4 A; 1GB1 A; 3C0R B; 2CU1 A; 2BW2 A; 2N9P C; 3I57 A; 5GMV A; 2WXJ A; 4JIO U; 1JRU A; 4WWM A; 1V2Y A; 1E8Z A; 1ACC A; 1WZ0 A; 3BYY B; 2O6V D; 3BK2 A; 3X0W A; 4XX5 A; 2QCZ A; 1GNU A; 5EE3 A; 1JWM D; 1T0S C; 1YQB A; 2Y5C A; 1J19 A; 1KM7 A; 3Q3O C; 4US8 A; 2LFI A; 3TIX A; 4DDI D; 2PE9 A; 3NY5 A; 1N61 A; 4OZC A; 1QF6 A; 1WY8 A; 2DAJ A; 4EZL A; 2R61 A; 3NVW A; 3MTN B; 3U8Z A; 2LUE A; 1CMX B; 2W82 A; 4FAD A; 2RMM A; 2Z59 B; 1J7B A; 1IYF A; 3I3T B; 2XBB C; 3WA0 A; 4A3O A; 4WJP A; 4FN2 A; 1FXA A; 2NMQ A; 5J17 A; 3RCZ A; 3HM6 X; 3R66 C; 1C4A A; 3VUY A; 3UF8 A; 3VHT C; 3DVG Y; 1MVK A; 4ARI A; 2Z0E B; 3H6N A; 3ZJV A; 4XDC A; 2FID A; 2NVU I; 1J8C A; 1UZX B; 5D94 A; 4E3C A; 4IC7 B; 5TSS A; 1R4N I; 4AJW A; 2BYV E; 1N6Z A; 4URK A; 3N32 A; 4JQW C; 5D6J B; 3Q69 A; 5DPS A; 3RMK C; 2K25 A; 3ML9 A; 3OG5 A; 4EEW A; 3H1U A; 3AB5 A; 2IPK D; 2Y5P A; 1VZ6 A; 1KF6 B; 2C7N B; 3AED B; 1WGG A; 3RZW C; 1AW7 A; 1ZOY B; 4P7I A; 1I4Q A; 3OAW A; 3ZKJ C; 3EHV A; 4GXB A; 4W9D A; 2RPQ A; 1SJH D; 3IHP C; 2NCN A; 4YXD B; 1VZ7 A; 4IWQ A; 3V6E B; 3H9D A; 1TYG B; 3EFU A; 2FAZ A; 3KWL A; 3AE2 B; 3RD2 A; 1YQ3 B; 4YSX B; 2G45 B; 2Z0D B; 1F9J A; 4GDL B; 1OQR A; 3AEG B; 4KIK B; 2KHW B; 2NTT A; 2ZCB A; 4PS3 A; 3AV8 A; 4WWN A; 2BWF A; 4A55 A; 5IA7 A; 3FIL B; 2DEN B; 3Q8C A; 2CS4 A; 4FJV B; 1A5R A; 1E8W A; 1TZO A; 2IDY A; 1D3Z A; 1C1Y B; 4LDT B; 3AEB B; 4A90 A; 1VZ8 A; 2KN4 A; 3A33 B; 1P7F A; 1OGW A; 2JYE A; 3AE5 B; 1P0R A; 2FCN A; 4A8X C; 2D11 A; 2LRU A; 2K6Q A; 4TMA B; 5EDS A; 2LVP A; 2EKE C; 2ZJD A; 1WI0 A; 4QAY A; 3ZRF A; 1K53 A; 4EOY A; 4RGM A; 1EU4 A; 2RGF A; 2INN E; 1GOZ A; 1T3Q A; 3QJZ A; 2YEP F; 1WJ6 A; 2KTF A; 4HJG E; 2KKC A; 3L4P A; 3U4E G; 3BVZ A; 1OTR B; 2BS4 B; 2M19 A; 2MBH A; 1QQR A; 1VRA B; 4KDL B; 1WE6 A; 4MEM A; 1GC6 A; 4JLC A; 3W5U B; 4XE0 A; 5BO4 B; 1DYQ A; 3DHH C; 3L08 A; 4IDI A; 3H7S A; 1EWY C; 4C4V B; 2NBV B; 2OOB B; 4B95 A; 3RUL A; 3JYU A; 3MHS D; 2KWV B; 3APF A; 3NVY A; 3WAN A; 2MCN B; 3TL5 A; 1HTO A; 2LVO A; 2LD9 A; 1D5Z C; 4BFR A; 2ZPN A; 4B9K A; 2K3U A; 4RGN A; 3PRM B; 4BOS C; 3Q3M C; 4NQK E; 3BVG A; 1HZ6 A; 2BYE A; 4HDO A; 1L6U A; 3A4R A; 2G1E A; 1T6B X; 4XWW A; 3AMZ A; 3P4Q B; 4W9G A; 2HTH A; 1NEK B; 3PSE B; 3VVW B; 4GDL A; 2FCQ A; 5JHB A; 4KIK A; 1N63 A; 2DWQ A; 2MBO A; 4KKJ A; 1IGD A; 3NG0 A; 1WGR A; 2LGY A; 2OJR A; 1I4R A; 3FIL A; 2NS5 A; 2BWE S; 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3GP7 A; 2ZW0 A; 2K8C A; 4GB9 A; 2EEL A; 2AWT A; 5TR5 A; 4ZHO A; 4WWP A; 2ZW1 A; 4BBN F; 2K9X A; 5H92 C; 2UU7 A; 1SEB D; 3SEB A; 3PS6 A; 1PGB A; 4MM3 A; 1NEN B; 1L7Y A; 1E7V A; 3J9C A; 3HRD D; 1E6E B; 4AWJ A; 1QKZ A; 2M8S A; 3BYT B; 5C1Z A; 2XEW A; 1DOY A; 1QZE A; 2V3S A; 4XYC A; 1FMA D; 4M01 A; 1EF1 A; 4FJZ A; 5AEK B; 1R4M B; 4RM8 A; 1WJ4 A; 5IKC M; 4CQN A; 2ON8 A; 3W5V B; 4MGI E; 2JUO A; 3ZTD A; 1YIW A; 4W9I A; 3L54 A; 1SE3 A; 2KDB A; 4I6P A; 2WNM A; 1IUE A; 2KO3 A; 4FA6 A; 1WH3 A; 2WHI A; 2JY6 A; 1SE2 A; 4M0W B; 1P9D U; 2AQ1 B; 1FCC C; 4HKZ E; 3ZXV A; 1L5P A; 3RNG C; 2PVG C; 2EMS A; 3NVV A; 4EZJ A; 4HCN B; 2V3P A; 4MEL A; 4BOZ B; 1VDV A; 1VLB A; 3C19 A; 2JWU A; 1GAQ B; 4X57 B; 3B2F A; 4PS8 A; 2G9H D; 2I38 A; 1MHX A; 2V4I B; 3PLU A; 2L76 A; 1EWC A; 2MBQ A; 1FD6 A; 3ECI A; 3VUW A; 4BKS A; 2K1F A; 3IVF A; 1TTN A; 3MHZ A; 2DYO A; 3RT3 B; 2WDV B; 4L23 A; 1TKG A; 1YD8 U; 3ZRC A; 3BZD B; 1E9M A; 4OVU A; 3WAM A; 3RZF A; 1E7U A; 4RGT A; 2GBR A; 1EF5 A; 3EA6 A; 1R7S A; 1TY2 A; 2KJ6 A; 1TGZ B; 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