The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANASTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADKGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Finegoldia magna
|
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Protein L
|
| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K53 A; 2IGH A; 2KDM A; 1MVK A; 2JU6 X; 3FIL A; 2KAC A; 2JWU A; 1HZ5 A; 1QKZ A; 4IOI E; 1K51 A; 4KGT A; 2PW9 A; 2J53 A; 1YMH E; 2KN4 A; 1PGX A; 1MHH E; 4OZC A; 1MPE A; 2JZP A; 4D2K A; 1FCL A; 3V3X A; 1P7E A; 2ZW0 A; 4OZB A; 2QMT A; 2LHE A; 5JXV A; 4KGS A; 1HEZ E; 4MAC A; 1IBX B; 1YNT E; 2I38 A; 5HFY A; 4KGR A; 1FCC C; 1ZXH A; 4OZA A; 5HHD G; 2RMM A; 2I2Y A; 1MI0 A; 2N9K A; 1IBX A; 4WH4 A; 5BMH A; 2N9L A; 3GB1 A; 4HJG E; 5BMG A; 1P7F A; 1XCQ L; 3UI3 A; 1Q10 A; 1XCT L; 1GB1 A; 1PGB A; 1IGD A; 1IGC A; 2ON8 A; 4HKZ E; 2GI9 A; 4GLS C; 1KH0 A; 2QSD A; 2OED A; 1PGA A; 1C9F A; 1HZ6 A; 1XF5 L; 1FD6 A; 2JXT A; 2RPV A; 2NMQ A; 2PTL A; 2PLP A; 1GB4 A; 2IGG A; 1EM7 A; 2J52 A; 1F2R C; 2EEL A; 2GB1 A; 1UWX A; 5HI1 A; 1MHX A; 5BMI A; 2LHD A; 1F2R I; 3MP9 A; 1D4B A; 1K52 A; 2ONQ A; 4IKG A; 1JML A; 2IGD A; 2KWD A; 3FIL B; 2JSV X; 2K0P A; 2ZW1 A; 2KQ4 X; 2LGI A; 5HG2 A; 2N7J A; 1K50 A; 2LUM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FNW A; 2IBI B; 4M01 A; 2NS5 A; 3KUC B; 1EWY C; 4MM3 A; 3P4P B; 3RNB C; 3T8M A; 3RI7 C; 1VR9 A; 1V97 A; 5D2M B; 3NZ3 A; 1TKE A; 2Q5W D; 4LK0 M; 2INN E; 4GDK A; 1YN5 A; 3PSE B; 3U7D A; 3ZJU A; 1UF0 A; 2KWC A; 1CK1 A; 3Q3M C; 4M8N A; 2LJI A; 2QIL A; 3PHX B; 2V3P A; 3AEE B; 4LNO A; 5MPO A; 2ZVO A; 2EMT A; 3OWE B; 2KX0 A; 3A9K B; 3LJ3 A; 2LHE A; 4KGS A; 2QHO A; 2IY0 B; 2KJ6 A; 3IXS A; 2WXI A; 4GGQ A; 1L2N A; 2D11 A; 4K81 A; 3P63 A; 3EFC A; 3BII D; 3A9J A; 1L0Y B; 1WGR A; 2LUE A; 2WDT B; 3AM9 A; 4HJG E; 1PUT A; 3TMP B; 1FEH A; 1TY2 A; 2M17 A; 3Q14 C; 1XCQ L; 3C0R B; 2N4F A; 3CSF A; 3SFD B; 5EE9 A; 4MGZ E; 3BK1 A; 1HTO A; 2NBU A; 4AJY B; 2KYW A; 4JPS A; 4YT0 B; 2K5P A; 1WGG A; 2BWE S; 2KTF A; 4CYE A; 5JHB A; 5KHQ A; 1EF5 A; 1QT9 A; 2CJO A; 2EKE C; 2KMA A; 3RN9 C; 2DHZ A; 4N59 A; 1ZPS A; 2AWT A; 2HJ8 A; 2SAK A; 2V3S A; 2VRR B; 3RNC C; 2JVC A; 4RF1 A; 3N1Y C; 3VDZ A; 3SFE B; 2HE7 A; 2LVP A; 3AED B; 2L1A A; 1FXT B; 3DVG X; 1OGW A; 1YOV B; 2ASQ A; 5HG2 A; 4MM3 B; 5C2T B; 3EC8 A; 2XK5 A; 3EUB 2; 5AZG A; 5DPS A; 4AQ7 A; 1UWM A; 5FK9 C; 4GDK B; 3R2T A; 1QKZ A; 1Q0W B; 2W9N A; 1R4M I; 2MSE D; 3AMZ A; 4WJN A; 4I6L B; 3Q69 A; 3MC8 A; 2WXN A; 2LFI A; 3DHH C; 4H2A A; 1HA5 A; 3C8Y A; 4TQ1 A; 2K39 A; 1WJN A; 3Q8F A; 2IY1 B; 2NVU I; 2VZK B; 1ISN A; 3TIX A; 2LXC A; 3U52 E; 4FN2 A; 3L54 A; 1T0S C; 3QCA A; 2CU1 A; 4ZHP A; 1SIF A; 2NBW B; 4W9F A; 1UNS A; 3ZYY X; 1GOZ A; 4G50 A; 2A4Z A; 2E3T A; 2OJW A; 1OQR A; 2M0A A; 1S1Q B; 1WRD B; 4GIV A; 1WYW B; 4NNJ B; 3RZF A; 1XLO A; 4RGM A; 4W9G A; 2N7E A; 1C1Y B; 1N5W A; 2WDV B; 4DBG A; 4PK1 A; 2MQJ A; 2MEK A; 4HWI B; 1WR1 A; 2IZV B; 4PT5 A; 3V6E B; 2JQR B; 4ZDV A; 2WXP A; 3ZXR A; 3Q2A C; 2GBM A; 2AQ1 B; 3ALB A; 1TS5 A; 5HI1 A; 3OJ4 B; 2D5G A; 3TEW A; 3WAP A; 5IN7 A; 1PYW D; 1SE3 A; 4WWN A; 1GPX A; 3E9S A; 1WM2 A; 4EZJ A; 1V1P B; 3WAL A; 3OAW A; 3EEC A; 2UU7 A; 1K50 A; 3IHP C; 3WAM A; 1R4N I; 1YX6 B; 3TCA A; 4NJC A; 1K53 A; 4G3X B; 4BKT A; 3MJ5 A; 5J2R A; 3Q8C A; 2LZ6 A; 2FNJ B; 3APD A; 2AL6 A; 1ZDV A; 4FHK A; 4XYC A; 4HCN B; 4JQW C; 1KF6 B; 1V6E A; 2KD0 A; 1SJE D; 1WXS A; 2DAJ A; 2JPH A; 4EFO A; 4W9E A; 1J8C A; 1UBI A; 2BKF A; 4EUT A; 2MJ3 A; 3WAO A; 2D3C A; 1ZXI A; 3ENE A; 3BVG A; 2I38 A; 2O6V B; 1TS3 A; 1ZKH A; 3RT3 B; 2WXR A; 4CQN A; 2REX A; 2MCN B; 3M95 A; 1OQY A; 3R66 C; 1XLN A; 5EE1 A; 4RGT A; 1C4P A; 3A1Q A; 4C00 A; 4HPP A; 2XN9 C; 1YN3 A; 4MH0 E; 1WE6 A; 5CHV C; 1WXM A; 3ECI A; 1KTK A; 3VQI A; 1IYF A; 4HDQ A; 1FXI A; 3AEA B; 1IGD A; 2ZEQ A; 5CX3 A; 3ETR A; 1YQ4 B; 2QSD A; 1I4H A; 3RPF C; 2PMV A; 2GOW A; 2BKR B; 2KDF B; 4YTN B; 3CIR B; 2LMC A; 2LGX A; 3IAM 1; 4K7S A; 3L17 A; 2BYV E; 3ABV B; 2KFK A; 3Q8A A; 5D3D A; 1RFK A; 1VCB A; 4W9L A; 1F2R C; 2N1W A; 1VD2 A; 4KIK B; 1UGM A; 1Q1O A; 2NR2 A; 1LO5 D; 1E5W A; 5GXG B; 1TS2 A; 3NUH B; 5J17 A; 1TZ1 A; 2WQY B; 4QAY A; 2MHJ A; 3DVG Y; 3TJP A; 4PS7 A; 1JML A; 3AI5 A; 4HJK A; 4M0W B; 2JSV X; 3P4Q B; 2KOX A; 4O1N A; 2AYO B; 2W3S A; 4RM8 A; 4KZ0 A; 1JRO A; 1E8W A; 1D5Z C; 3Q8E A; 1OEY J; 2JY6 A; 3U4E G; 3ZJV A; 1I4Q A; 2RGF A; 5LLI A; 4K7W A; 4RFB A; 2ACZ B; 1RLF A; 1B1Z A; 1V2Y A; 3P2B A; 3ZNI D; 3Q8B A; 5C23 A; 2MBH A; 3N3K B; 3HUI A; 2RPQ A; 4OZC A; 1MPE A; 5FKA C; 1Z2M A; 3IVF A; 2IO0 B; 4BBN F; 3DOW A; 2ZW0 A; 2DZM A; 4N6E B; 2IO3 B; 2W55 A; 4ASW C; 3B0A A; 4MAC A; 3A4S C; 3QQ8 B; 1WH3 A; 5HFY A; 3H8H A; 2K8H A; 5G2N A; 5HHD G; 4TQ0 A; 4S17 A; 3MHZ A; 4ANU A; 4WUR A; 5E6P A; 4MJS B; 2C7N B; 4EOY A; 1D6E C; 1WM3 A; 5H8Y E; 2KWV B; 2N9L A; 1V81 A; 1YJI A; 1H4R A; 3H9D A; 3M62 B; 2ZVN A; 1WX7 A; 4HPM B; 2BQQ A; 3N20 C; 5TR5 A; 2KFK B; 3PHW B; 1LQB A; 3RNF C; 4A6Q A; 5BO4 B; 1TT5 B; 3TUO A; 4KKJ A; 2NTS A; 2K8B A; 2JXT A; 1J7B A; 2RDH A; 4DHZ E; 2JF5 A; 1P3Q U; 1GB4 A; 3EHV A; 3B2G A; 2C7H A; 1OEY A; 4NJ6 A; 4MH8 A; 2KWU B; 3GOE A; 2EEL A; 3CMM B; 4KV2 A; 2LRW A; 2VZK D; 3R8B A; 2G45 B; 1FO4 A; 4MSM B; 3V62 A; 4HRO A; 1WJU A; 2BYE A; 1I7H A; 2JRH A; 4YSX B; 2ZW1 A; 2LGI A; 4RNA A; 5BYS A; 1L6V A; 2Z0E B; 2L3Z A; 2HD5 B; 2IGH A; 2KDM A; 2KTR A; 1UUP A; 3QAQ A; 2G9H D; 2IPK D; 2BYF A; 1E90 A; 4NQK E; 2V0G A; 3SDL C; 4GXB A; 1QIL A; 2J53 A; 4TV3 A; 1AWD A; 1HTQ A; 3DBL I; 3RNE C; 4B0E A; 3I9V 1; 4KSK C; 1KM7 A; 1N5X A; 3WAN A; 1JWS D; 4AP4 C; 2M8S A; 1YD8 U; 4OW0 A; 2M1M A; 5LXI B; 3GE3 C; 2K9X A; 1CZP A; 1ZXH A; 1RFA A; 4URK A; 1X1M A; 4JWU C; 3DBS A; 3LXF A; 4OVZ A; 4IC7 B; 3WCQ A; 1IBX A; 4WH4 A; 3H1U A; 3GB1 A; 3PZ8 A; 1LFD A; 1WMH A; 1FPY A; 3WA0 A; 4IWO A; 1Q10 A; 2VH1 A; 2L7R A; 2GMI C; 4R3D A; 1EF1 A; 1C9F A; 1T0R C; 2BS3 B; 2PE6 B; 1STE A; 2BB6 A; 1XEE A; 3A9K A; 4EKU A; 1JW9 D; 1ZW7 A; 3Q3O C; 1E7U A; 1WXV A; 3BZD B; 4ZOH C; 4JE3 B; 2WXG A; 4C80 A; 2NMQ A; 2D07 B; 3AE6 B; 1V5T A; 2GBK A; 4AOF A; 2J0K A; 2QC8 A; 3T9L A; 2K3U A; 3VFK A; 3IAS 1; 1UWX A; 3HK0 A; 1C76 A; 1SB3 C; 3WIM A; 1EUV B; 1R4N B; 3NRZ A; 4BKS A; 2KTR B; 2WU5 B; 2KXJ A; 1E8Y A; 4A3O A; 4XX5 A; 1I4P A; 2BS2 B; 1NVI D; 5AEK B; 2Y5B B; 4LNF A; 4FAD A; 2O2V A; 3Q6B A; 4LLG M; 3HHM A; 4RMA A; 5AUI A; 4YSY B; 4JWS C; 4DQO C; 3K9P B; 2ZJD A; 1T5X D; 1VZ8 A; 4LDT B; 2CJN A; 1JWB D; 3SEB A; 2M19 A; 3RCZ A; 4KX6 B; 2KN4 A; 5BYQ A; 3ZNZ B; 1E7P B; 4IM3 A; 2OOB B; 1KLG D; 1FRD A; 2DYB A; 5C1Z A; 1FNU A; 1V5O A; 1KOT A; 4K3B A; 2UYZ B; 1IBX B; 4EZK A; 2ZNV B; 2Z0D B; 3HM3 A; 5G5G A; 1WMH B; 2N9E B; 1JWU D; 5BMH A; 1EU4 A; 4RF0 A; 1PFD A; 3KYD D; 5BMG A; 1CJE A; 4BAX A; 3UI3 A; 4BOZ B; 2LD9 A; 1E8X A; 2W3R A; 3AEB B; 1IGC A; 5G5H A; 2N1V A; 2MJD A; 1N61 A; 2ICI A; 1R7S A; 2D2Q A; 2X38 A; 3VXW A; 3KUZ A; 1XF5 L; 5D3I B; 4HEA 1; 5GMV A; 2D10 A; 3A4R A; 1SIJ A; 2KVZ A; 2QJL A; 4ZRI A; 4NPN A; 1EU3 A; 3HVD A; 3SHQ A; 1XLP A; 4DXG A; 4W9C A; 3C19 A; 1JRU A; 4RGO S; 4F1S A; 1ET9 A; 2MBB B; 3TEX A; 4N9F 4; 2O2V B; 1N6Z A; 5EDS A; 5IO9 A; 1D4B A; 2ONQ A; 2WDR B; 4NQL B; 5CTR C; 3QK0 A; 1BT0 A; 3DBR B; 2WU2 B; 3SD5 A; 4X57 B; 1SBB B; 5KHO A; 1UZX B; 1TKG A; 1TY0 A; 2NCN A; 4NAW A; 4XWT A; 4HVB A; 2JWZ A; 1MG8 A; 3PRM B; 3AE3 B; 1XQQ A; 4HK2 A; 4F8C B; 3NY5 A; 2JYE A; 1F77 A; 4K1R B; 5G55 A; 3HIZ A; 1UEL A; 1V1P A; 3VRB B; 4LNN A; 2HJ1 A; 1WGY A; 1WSP A; 3VR8 B; 2BW2 A; 3M63 B; 3P42 A; 3RMK C; 2D3A A; 3AU4 A; 2MLB A; 2LJ5 A; 2M4N A; 2IJ0 A; 3UF8 A; 2K6D B; 4US9 A; 1UGJ A; 1GB1 A; 3AU5 A; 2YVC A; 1WF9 A; 2EMS A; 2BF8 B; 5E6O A; 4ZRP A; 3GZN I; 1KH0 A; 4E74 A; 3RZW C; 3IFW B; 1PGA A; 2JZ3 B; 3NVY A; 1DOI A; 2O6V A; 3ZW3 A; 3DWM A; 4KVG B; 3V60 A; 1DYQ A; 1I35 A; 4CHK A; 2A5U A; 2WWZ A; 3PT2 B; 3K9O B; 1CQV A; 1GNU A; 2V9H A; 1FRR A; 2PVO D; 2RR9 A; 1BML C; 2PIA A; 5J18 A; 2LHD A; 4PYU A; 4HDO A; 4P7I A; 4MGY E; 3IG3 A; 2L32 A; 2X8X X; 2CU3 A; 3V61 A; 5H92 C; 2LUM A; 4KSL C; 2V3N A; 4NAW B; 2KAC A; 2LI5 A; 3DBL B; 4ZYN A; 1V80 A; 2RDG A; 3FAH A; 4W9H A; 5D6J B; 1WJ6 A; 4HCP B; 2GBN A; 4KIK A; 1IUE A; 4MSQ B; 3TBL D; 2RSU A; 2XNA C; 2KN5 A; 1L4D B; 1QOB A; 4B9K A; 1C79 A; 2INP E; 3JW0 X; 4M0W A; 2WNM A; 3DBH B; 3CWI A; 4KDI C; 3H7S A; 4M8M A; 1TKY A; 1Q5W B; 2L76 A; 4OVV A; 1I42 A; 2JZZ A; 2BYT A; 2WLB A; 3BY4 B; 1VZ7 A; 4US8 A; 1D5M C; 1J19 A; 5C3J B; 2Y5P A; 4YTP B; 4UDU C; 4LJP B; 2CHX A; 4ANW A; 1QLB B; 3GE8 C; 4MEM A; 4DHJ B; 3U7Z A; 5D94 A; 1QF6 A; 3N1Z C; 4HPL B; 1I4R A; 1L0V B; 2FAZ A; 4MJS A; 4XE0 A; 3NVV A; 1EM7 A; 2IGG A; 4FJV B; 1WX9 A; 4OVU A; 2CKH B; 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3W2D A; 2KQS A; 5DPR A; 4YTM B; 4IOI E; 3ZLZ A; 2NPT B; 1ZGU B; 1I4X A; 4XWW A; 3R2I A; 3V6C B; 2YEP F; 2JZP A; 4ICV A; 2BB5 A; 4KKI A; 1SEB D; 3VUX A; 3V3X A; 2L0T A; 3ZO5 B; 5D7G A; 3ZJT A; 1HE8 A; 2ZNV C; 1R4M B; 2WX0 A; 4EE2 A; 4DDI D; 4WJP A; 4OZA A; 2K22 A; 2LXA A; 2AL3 A; 2KX3 A; 2RMM A; 3R7Q A; 4M02 A; 2QIE B; 3FKY A; 4P6V F; 2BTE A; 3N1X C; 4IUM B; 3ZVV A; 3AN1 A; 4ACF A; 4FA6 A; 3ZUN A; 2W54 A; 3DHI C; 3PZD A; 4GDL A; 2N9X A; 2WXH A; 3ONS A; 2WXO A; 1TYG B; 4MDK E; 2ON8 A; 4RGN A; 4KZC A; 1XT9 B; 4B6W A; 2J0J A; 4I6P A; 3Q3N C; 4HXD A; 4AWJ A; 3SU8 X; 1Y8R C; 1QOA A; 3ZRC A; 1S3S G; 1WZ3 A; 2KKC A; 3TL5 A; 3TEZ A; 2DZJ A; 4P1B C; 1QOF A; 2AQ2 B; 2PPH A; 3L4P A; 3W5U B; 2LGD A; 1F0Z A; 2I1J A; 4Q2J A; 1KFY B; 2MW5 A; 2MP2 B; 4XDD A; 3PV1 A; 3H7P B; 3LB8 C; 4W9I A; 1JWM D; 3W1Y A; 4AUQ C; 2KWD A; 1YN4 A; 4EEW A; 4WWO A; 3L16 A; 3NVW A; 1QQR A; 1VZ6 A; 4JL9 A; 1TS4 A; 2WS3 B; 3RNG C; 1MVK A; 2O6V D; 3HRD D; 1TZO A; 2DNF A; 4TSS A; 2Y5C A; 4GOC A; 2FIF A; 3QA8 A; 1MHH E; 2B76 B; 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