The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PLASMINOGEN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QQR A; 1L4D B; 1C4P A; 1L4Z B; 1BML C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VD2 A; 4BKS D; 2KMC A; 3KUD B; 1BML C; 2O2V B; 1JWS D; 2BS4 B; 4EZK A; 3CSF A; 2D3B A; 3BVM A; 1IGD A; 1ZOY B; 4A9A A; 2IO3 B; 4RGN A; 2CHX A; 4F1S A; 2V3S A; 1WFY A; 5L83 A; 1BUI C; 3MTN B; 2EKE C; 2WXF A; 2UWQ A; 4XWW A; 1JRU A; 2BKF A; 1LGR A; 3I63 C; 3NVW A; 2BGF A; 2RDB C; 2WXR A; 3PZ7 A; 3L0W B; 1AN8 A; 3M62 B; 4JLC A; 2MBB B; 4JX1 C; 1MHX A; 1WX9 A; 3ZKJ C; 4W9J A; 2KLC A; 1FXA A; 3PLV A; 5KHQ A; 4MGI E; 2G1E A; 3V61 A; 3VHT C; 3R2T A; 4KVG B; 3ZNH B; 3Q8B A; 5IOI A; 2LEK A; 4B0M A; 1J8C A; 3UQB A; 2KAN A; 2C60 A; 1WGH A; 3MC0 B; 1JWA D; 2G3Q B; 2H89 B; 4TUU A; 2LGX A; 1RWS A; 4PS3 A; 2LGS A; 2ZW1 A; 3R7Q A; 1XLO A; 4IUM B; 4S0R A; 1QF6 A; 4IC7 B; 2LUE A; 2KDF B; 1C1Y B; 1GC6 A; 2Y5P A; 3Q69 A; 3SDL C; 4HCP B; 4LK0 M; 1H8C A; 3ETR A; 4FJV B; 2RDH A; 4BOS C; 1NYQ A; 1ACC A; 1B9R A; 1ZGU B; 1KRH A; 3UF8 A; 1AWD A; 3L10 B; 2NBW B; 5FKA C; 2MLB A; 3AE5 B; 2LVQ A; 1UWM A; 1T6B X; 3TSS A; 1IGC A; 1WF9 A; 2KXJ A; 1XF5 L; 2R2O A; 4LTU A; 4P16 A; 3VR8 B; 2FCQ A; 5CHV C; 1HZ5 A; 3MJW A; 4EKU A; 2INP E; 2OOB B; 1JRP A; 1FFU A; 1QOF A; 1UGJ A; 4WQO B; 2EMS A; 1K50 A; 2CS4 A; 1XCT L; 4DDG D; 5HI1 A; 1C76 A; 5IAA C; 2M17 A; 3DBS A; 4TKN A; 5CTR C; 2DX5 B; 1V49 A; 3DBH I; 2A5U A; 3ZJT A; 2NBV B; 1ENF A; 2SEB D; 3HK0 A; 4X57 B; 1WXQ A; 3L54 A; 2GMI C; 1T5X D; 4L23 A; 1UWX A; 1WZ3 A; 4BKG A; 2L8J A; 1CZP A; 2IO0 B; 4HK2 A; 2C7H A; 1H4R A; 2V4L A; 4ZRQ A; 3TL5 A; 4K7S A; 1WJ6 A; 3OJ3 A; 3ZUN A; 2RPV A; 1NVI D; 1JAL A; 1YN3 A; 1MFW A; 4ZRP A; 4S17 A; 1NDD A; 4YTM B; 1C4A A; 2XN9 C; 4OW0 A; 3VXW A; 2LI5 A; 2OJW A; 1U4A A; 4CYE A; 2R2Q A; 1VDV A; 2XNA C; 3BVG A; 1PYW D; 2LJI A; 3E9S A; 2M0A A; 1WH3 A; 3ZYY X; 2DLB A; 2NTS A; 2PW9 A; 3PRM B; 4DXG A; 1YNT E; 4BVU C; 4FXC A; 1MVK A; 1YOV B; 4FA6 A; 3DBR I; 2K6Q A; 3AXC A; 2WXH A; 5EE3 A; 3DBL B; 1P7E A; 2MBQ A; 3DVG Y; 3DOW A; 2K1F A; 1ZKH A; 3MHS D; 4ACF A; 3LDZ E; 3FC4 A; 5BYQ A; 1Y56 A; 3WCQ A; 2GBN A; 1FNU A; 2PIA A; 3KH0 A; 4WAA A; 4P7I A; 1JWU D; 2KC1 A; 4GDK A; 3WAM A; 3FKY A; 4ICU A; 1YJ1 A; 1TIF A; 2K3U A; 2MBH A; 2KN5 A; 1V5T A; 3I57 A; 1TZO A; 3ZNG C; 4KGT A; 2J0M A; 2MJ3 A; 3UIO B; 3FIL A; 3ZNZ B; 3P4S B; 2I1K A; 2JZP A; 2PE9 A; 4G0N B; 1E90 A; 1MJD A; 3AEE B; 1TZ1 A; 2JUO A; 1YQB A; 4GMV A; 2MH7 A; 5FR6 A; 2BYF A; 4KDL B; 3RNF C; 3KW5 B; 1HTQ A; 1QZE A; 1T0R C; 4FLH A; 4RF0 A; 2ZNV C; 3TEZ A; 2IGG A; 4NZL B; 2WDV B; 3APC A; 1TS3 A; 1M94 A; 1VLB A; 1VCB A; 4ZOH C; 1SJH D; 2YLM A; 3ZDT A; 2PVG C; 3VUX A; 2FIF A; 4K7W A; 2ZW0 A; 4YWG G; 2MP2 B; 4HXD A; 2AL6 A; 2BBC A; 2QC8 A; 1B1Z A; 1N5W A; 1UF0 A; 2W3S A; 1UGM A; 1D5X C; 1IBX B; 5D2M B; 2NVU I; 2LHD A; 1V80 A; 4ZRJ A; 3TUO A; 4IM0 A; 2VZK D; 3I5J C; 3MHZ A; 2ZCC A; 1E8Z A; 2OED A; 2QJL A; 3ZXV A; 2KLG A; 3RUI B; 1ZPS A; 4ZDV A; 3H8H A; 5HG2 A; 2MWS B; 1UD7 A; 4HPL B; 3DDC B; 2M0X A; 2Z0E B; 1GPX A; 1KH0 A; 1SJE D; 1KLG D; 1RFK A; 1EM7 A; 4MJS A; 1FFV A; 4RMA A; 1L6V A; 1YX5 B; 4IWQ A; 3P4R B; 1UBI A; 2GBM A; 2WXO A; 4EFO A; 1K52 A; 3DWG C; 1OGW A; 3ZGZ A; 1GJZ A; 3QAR A; 1XLN A; 4BAX A; 2WXK A; 2LGI A; 4A3P A; 3SEB A; 4LNO A; 3WIM A; 3L16 A; 3PHW B; 3N9Y C; 3PHX B; 4WH4 A; 5LLI A; 2K25 A; 2MHJ A; 3A9K A; 1ZP0 B; 2N0S B; 3IAM 1; 3QHT A; 1Z5S B; 2L83 A; 3VH3 B; 4KSK C; 2JWZ A; 2K0P A; 2RMM A; 3AE6 B; 3KVF B; 4TQ1 A; 2KMA A; 2KDI A; 4WJQ A; 3AV8 A; 1XLQ A; 2DHZ A; 3ECI A; 4EZL A; 4URK A; 2BS3 B; 4P1B C; 1YN5 A; 4UDU C; 1EF5 A; 2LGY A; 4M0W B; 4EZJ A; 3Q3O C; 2WXP A; 4WIP A; 3AU4 A; 4MH8 A; 4RM8 A; 1GG3 A; 3Q2A C; 1DGJ A; 1V8C A; 1F0Z A; 1ESF A; 1JWB D; 4DQO C; 3N1X C; 5DPW A; 1RYJ A; 2RR9 A; 3Q3F A; 2MCN B; 2B76 B; 2WXG A; 1N60 A; 1C9F A; 3PT2 B; 2E3T A; 2WDR B; 4XGA B; 2WS3 B; 1N62 A; 2C7M B; 5MPO A; 5D3I B; 4BBN F; 2LRU A; 3NJT A; 4ANW A; 1CK1 A; 2D2Q A; 1V81 A; 2M8S A; 4USA A; 3MFG A; 2WX0 A; 4R3D A; 3DBH B; 4HJK A; 4C4V A; 1NBF C; 2M19 A; 3DWM A; 4L1B A; 1XLP A; 2AQ3 B; 2NCN A; 1L0Y B; 1LQB A; 2KWC A; 4KKI A; 2NPT A; 2DWQ A; 4WAF A; 3UIN B; 3A1Q A; 3IFW B; 4MM3 A; 3S2A A; 2MQJ A; 5EDS A; 4FJY A; 1P3Q U; 1A5R A; 1WMH B; 3IT4 B; 3R2I A; 1TJE A; 3C19 A; 2HTM E; 1RFA A; 3R3M A; 2NBU A; 4FBJ B; 1C77 A; 5DCN A; 1N6Z A; 2ASQ A; 5JH5 C; 1LFD A; 1OFF A; 2IGH A; 2J0J A; 3NS8 A; 4NAW A; 3ZQ4 A; 3H7P A; 1UEL A; 3ALB A; 3P2B A; 3AE7 B; 3ZJU A; 1KM7 A; 1WRI A; 2MSE D; 5D3D A; 2WXQ A; 3AEA B; 1ZDX A; 3NUH B; 1GNU A; 5H92 C; 3DBR B; 4PS8 A; 5D94 A; 3W1Y A; 2J4X A; 1UNS A; 3V3X A; 2Z59 B; 1L0X B; 1PGB A; 3FAH A; 1GC7 A; 2KTR A; 2WWZ A; 2N7D A; 3U4E G; 3URY A; 5IA7 A; 3C0R B; 2FBW B; 3N3K B; 1GUA B; 2KX0 A; 4JL9 A; 1X1M A; 2IY1 B; 2JPH A; 2HJ8 A; 2WGS A; 2N1V A; 1JML A; 2CU3 A; 2FUG 1; 1L4D B; 2V3P A; 3RNB C; 1P9D U; 2KZR A; 3ZIM A; 4OHJ A; 1I4R A; 4ZYN A; 1JQ4 A; 3VR9 B; 4HVB A; 4GDK B; 2Y5C A; 4P6V F; 5BYR A; 3BVZ A; 2WP9 B; 5C3J B; 5G5G A; 1VZ7 A; 3EFU A; 4DXA B; 4E71 A; 1F2R I; 5G5H A; 3RNE C; 3KWV A; 2KAC A; 4TMA B; 2FNJ B; 2CJN A; 1C79 A; 1TS4 A; 5FK9 C; 2IDY A; 2BWE S; 3FIL B; 4AUQ C; 4C7Z A; 4C7Y A; 3GP7 A; 4FHJ A; 3DVN V; 2KKC A; 1C78 A; 3RNA C; 2WXL A; 2LVP A; 1S1Q B; 1E7V A; 1JRO A; 4K81 A; 2D5G A; 2ACZ B; 2NMQ A; 2KQS A; 1ZDV A; 4MT5 A; 2CU1 A; 4HRS A; 2KJ6 A; 4EEW A; 2JQR B; 3AU5 A; 4YSZ B; 5E6N A; 2WXJ A; 1WI0 A; 2MJE A; 1I4H A; 4US9 A; 4KDI C; 3W2D A; 3U7D A; 1I7H A; 5L95 C; 5BO4 B; 3OJ4 B; 2JX5 A; 5AUK A; 2HE7 A; 1DYQ A; 1WZ0 A; 4YTN B; 2KK8 A; 2LGD A; 3H9D A; 5DPS A; 1BXT A; 4K3C A; 2O6V B; 4E3C A; 4DXF A; 2INN E; 5JXV A; 5KHO A; 1WXS A; 2UYZ B; 4J6I A; 4G3X B; 3KUC B; 3ZO5 B; 4M02 A; 2B3A A; 3NZ3 A; 4PYU A; 2MRP A; 1PQS A; 1VZ8 A; 4CHK A; 2KYW A; 4DWF A; 2DZI A; 2V9H A; 1WWT A; 4FHK A; 2WDT B; 3L08 A; 3APD A; 2G4S A; 2K6D B; 1WR6 E; 1QQR A; 2FUH B; 4A6Q A; 1SIJ A; 2D07 B; 4MDK E; 5D7G A; 4EOY A; 2IZV B; 1DOY A; 1Q0W B; 2GI9 A; 3PS6 A; 1GAQ B; 1FXT B; 3AB5 A; 3VTV A; 4RCO A; 5HHD G; 1OQQ A; 1TGZ B; 1RRB A; 1FNV A; 4W9F A; 4RFB A; 2VH2 A; 3M3J A; 4HKZ E; 1K53 A; 4LDT B; 3RZF A; 3GB1 A; 5C23 A; 3DVG X; 4ZRI A; 3JYU A; 2MW5 A; 1FMA D; 3X23 A; 1EWY C; 4RM9 A; 2WU5 B; 2L3Z A; 2KHW B; 3A9K B; 2IGD A; 3NRZ A; 2O6V D; 1HQR D; 4W9D A; 4IG7 B; 5C2T B; 5JZE B; 4YSX B; 4B0E A; 3W5V B; 3U7Z A; 3AE2 B; 1L6U A; 2MA9 B; 2LFI A; 3GS2 A; 3BYT B; 4K1R B; 3IHP C; 1WXV A; 3IG3 A; 2BB6 A; 4JWU C; 3JSV A; 1E6E B; 4YTP B; 1V1P A; 1ZXH A; 2PVO D; 1CQV A; 3GE8 C; 1OEY A; 3KUZ A; 4E74 A; 3W1S C; 4EE2 A; 5J17 A; 4MSQ B; 2KWU B; 1P7F A; 1FO4 A; 3ABV B; 2L00 B; 1E8Y A; 1BT0 A; 1KLU D; 4LDT D; 4NNJ B; 4HCN B; 4BZA A; 5J18 A; 2AQ1 B; 5AZH A; 1KJT A; 4WJP A; 3NZS A; 3CWI A; 1V9J A; 3AH7 A; 3VUW A; 4KZC A; 2HJ1 A; 2MX2 A; 3HVD A; 1FM0 D; 3HHM A; 4C4V B; 1A70 A; 1C4P A; 4ICV A; 4N58 A; 1E5W A; 3ZTC A; 2QCZ A; 4A8X C; 3PPA A; 3PVL A; 3ZLZ A; 1JCK B; 4G50 A; 1ET9 A; 1EWC A; 1JW9 D; 2NPT B; 4MM3 B; 4OVZ A; 4FN2 A; 3N1Z C; 3B9J A; 1G6J A; 1CJE A; 2ZVN A; 1UUP A; 3I3T B; 4GGQ A; 4XZ4 A; 2GBR A; 2PKO A; 4C56 C; 3DPD A; 3HIZ A; 2N9K A; 2ZEQ A; 3QAQ A; 5TSS A; 3RNC C; 1QKZ A; 1L7Y A; 4KZ0 A; 3NVZ A; 3H1U A; 1HTO A; 2V3N A; 4IDI A; 2V1Y A; 1HA5 A; 2Z8L A; 3EC8 A; 4DBG A; 4NAW B; 3AEB B; 4OZB A; 3H7P B; 4RGM A; 3CMM B; 4HRO A; 4RGT A; 2C7N B; 2NS5 A; 4AP4 C; 4LJO B; 4TSS A; 2FCN A; 4XDC A; 2ZVO A; 5CX3 A; 2QMT A; 2X8X X; 5AZG A; 4ASW C; 3VAW A; 4XWT A; 1WJN A; 1Q1O A; 2O2V A; 2KTR B; 3GZN I; 1YX6 B; 1TTN A; 3Q14 C; 4IWP A; 2FAZ A; 1PGA A; 4IM2 A; 3W9C B; 1PGX A; 4WWP A; 3ZW3 A; 4XYC A; 4N6E B; 1WE7 A; 3V6E B; 1V6E A; 2ZNV B; 1WJU A; 3VRB B; 3K9O B; 1N63 A; 3AE4 B; 2G4D B; 1XT9 B; 2LJ5 A; 2IBI B; 2R61 A; 1QIL A; 2DYM A; 2C9W B; 2L0F A; 4W9E A; 4MEM A; 3NG0 A; 1M4V A; 2WHI A; 4BFR A; 2AQ2 B; 3T3O A; 3NZU A; 2RPQ A; 4NQK E; 2KN4 A; 1RM6 C; 1OQR A; 4CQN A; 2DBY A; 2KQ7 A; 1C4C A; 2BT6 A; 1FRR A; 1RLF A; 4A90 A; 3IVF A; 1MPE A; 2JY6 A; 3DCG A; 3CIR B; 2J52 A; 1T0S C; 3B0A A; 4JGH B; 1WY8 A; 2J7Q B; 4P1C C; 2LUM A; 4LNF A; 3PTF C; 3AI5 A; 5BYS A; 2EKI A; 4G11 A; 1ISN A; 2PLP A; 2INC C; 3PGE A; 2M56 B; 4MGY E; 1DOI A; 1XD3 B; 2DYB A; 5G55 A; 1D4B A; 2LZ6 A; 3RFZ B; 3RN9 C; 4XX5 A; 3KYC D; 2G45 B; 3HUI A; 5IP4 D; 1EUV B; 1WYW B; 3RUL A; 3Q8A A; 5EE9 A; 5I4D A; 3KLS X; 5HFY A; 2W9N A; 4ZYS A; 1KFY B; 1NI3 A; 1J7A A; 3V60 A; 1I4X A; 4HJG E; 3EA6 A; 4YSY B; 2KO3 A; 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3RNG C; 2WXN A; 5LXI B; 1NYR A; 3RD2 A; 2Y3A A; 5LNK 1; 4LNK A; 3CST A; 2LHE A; 1OEY J; 3JVZ X; 1NEK B; 2N9E B; 1LXD A; 4OZA A; 3VFK A; 2JYT A; 3ZXR A; 2BF8 B; 3T8M A; 1OQY A; 1IP9 A; 1J19 A; 1YD8 U; 3O65 B; 1UH6 A; 3NY5 A; 1PDX A; 5BMH A; 1ZUD 2; 1J7B A; 1ZXI A; 1L4Z B; 2LXC A; 4FUL A; 4LNI A; 3UQA A; 2M4N A; 4HWI B; 1GB4 A; 3P1M A; 3VQI A; 1V86 A; 2GB1 A; 1ZW7 A; 1DOX A; 4NY0 A; 2JSV X; 2IO1 B; 5DPT A; 3LB8 C; 4ZHO A; 1TYG B; 3C8Y A; 3GZN B; 1MG4 A; 3EUB 2; 4GN1 A; 1LO5 D; 1SB3 C; 1WE6 A; 3A33 B; 3ZTD A; 2WNM A; 3H7S A; 4MGK E; 3AMZ A; 2K39 A; 2AL3 A; 2I2Y A; 3SU8 X; 5J2R A; 1FCL A; 3NS1 A; 4FAD A; 3ML8 A; 4K7U A; 4ANX A; 1V2Y A; 4IKG A; 1I42 A; 1KOT A; 4GLS C; 4BOZ B; 3LJ3 A; 1FPY A; 3EGR A; 3AEG B; 4DK5 A; 3HM6 X; 1E8X A; 2K8C A; 2BS2 B; 1WSP A; 2BQQ A; 1WX8 A; 3M95 A; 3EEC A; 3IT6 B; 3QJZ A; 3OG5 A; 3PLU A; 2K5P A; 2L32 A; 1MI0 A; 1L2N A; 4H2A A; 2NR2 A; 1XXG A; 4IW0 A; 2CHZ A; 3CF6 E; 3RT3 B; 4AJY B; 1C3T A; 1GB1 A; 5JHB A; 1TKY A; 2WLB A; 4F7Z A; 1AYF A; 2K22 A; 3DQV A; 3ZNI D; 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