The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PLASMINOGEN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
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| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1L4Z B; 1L4D B; 1C4P A; 1BML C; 1QQR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2A4Z A; 4HDO A; 3E56 A; 1YN3 A; 4L23 A; 1FM0 D; 1LQB A; 4WAA A; 1S3S G; 2ZVN A; 3T9L A; 3DBS A; 1TJE A; 2M0A A; 1D4B A; 2ZZP B; 2KD0 A; 3AED B; 1M4V A; 3TEX A; 1DGJ A; 2V3S A; 1R4M B; 2WGS A; 3AM9 A; 3DBL B; 2NBV B; 5IOI A; 1QKZ A; 2JX5 A; 4CO7 A; 3MC9 A; 4K81 A; 4MH0 E; 4RF1 A; 2SEB D; 1F52 A; 1I4R A; 4MEM A; 4TMA B; 1JML A; 4M0W A; 2IYD B; 1EWY C; 1T6B X; 2C60 A; 4S17 A; 1HTO A; 3URY A; 3VXW A; 1NEN B; 3RNE C; 5FR3 A; 2I1J A; 2M56 B; 4HPP A; 1TS2 A; 3Q3N C; 1ZW7 A; 2FCS A; 4JWS C; 3W9C B; 1IGC A; 2J0K A; 1T3Q A; 5CHF A; 3SHQ A; 2Z0D B; 4JPS A; 2EKI A; 2KJ6 A; 3L13 A; 2RDB C; 1RLF A; 1MI0 A; 4MH8 A; 2KZR A; 4FHK A; 1E0Z A; 4DHJ D; 2CR5 A; 1E7U A; 2PJH A; 2WX0 A; 3SFE B; 3KYD D; 3LDZ E; 3VHT C; 2JUO A; 5HKH A; 1UF0 A; 2IND C; 3CIR B; 2K8B A; 1N5X A; 3PHW B; 4KKI A; 1JWA D; 3EFU A; 2I38 A; 4J6I A; 5HHD G; 1EF5 A; 3C8Y A; 1QOA A; 2BYT A; 3RNA C; 4YWG G; 4FHJ A; 1YX5 B; 2A5U A; 4HK2 A; 3VUW A; 2BYF A; 4HEA 1; 2NVU I; 3JVZ X; 2O6V A; 1D5Z C; 1MG4 A; 2ZPN A; 1F9J A; 5FKA C; 2KFK A; 5EE9 A; 2KDM A; 1XLO A; 2AYO B; 1E8X A; 1TY2 A; 3MJW A; 1C4A A; 1GB1 A; 1HXY D; 2N7D A; 2YEP B; 1WYW B; 4ZDV A; 4RH6 A; 1DOY A; 3AEC B; 4XYC A; 3QJZ A; 4OHJ A; 3A1Q A; 3T3O A; 1WMH A; 4BBN F; 4KIK A; 4OVV A; 5IO9 A; 1T0Y A; 3PVL A; 4BVU C; 2DZK A; 2BWE S; 1EM7 A; 2PLP A; 4LDT D; 1YJI A; 2N1V A; 2Z59 B; 4ZYN A; 1FNV A; 3NVW A; 3AEA B; 2WXG A; 2KTR A; 2R61 A; 3ZRC A; 1EO6 A; 2LXA A; 3K9O B; 1F0Z A; 1UZX B; 3AB5 A; 2KJR A; 4CQN A; 2KVR A; 1SJH D; 1HZ6 A; 4P7I A; 2KDI A; 4KVG B; 1V49 A; 1SGH A; 2C7H A; 3N32 A; 3VVW B; 1WGY A; 1WY8 A; 3H6N A; 4DBG A; 2MLB A; 2ZW0 A; 1AYF A; 3A4S C; 1JRP A; 2WXP A; 4FJV B; 2VH2 A; 1J7C A; 3ZKJ C; 3APF A; 3BVZ A; 3BIN A; 4YTM B; 1RFK A; 5IP4 D; 4NY0 A; 4NQK E; 1GPX A; 2B76 B; 2INN E; 1GB4 A; 2FCQ A; 1IPG A; 3V3X A; 4W9I A; 3DHI C; 2HTH A; 3K9P B; 1QT9 A; 2NCN A; 2WDQ B; 4RGO S; 3PZD A; 1K53 A; 1VLB A; 5BMI A; 4G50 A; 2V0G A; 4AQ7 A; 3FIL B; 1DOI A; 3WAO A; 2WWZ A; 1YX6 B; 3DDC B; 3X23 A; 3ZNG C; 2L32 A; 1A70 A; 1PQS A; 4IM3 A; 3GP7 A; 2PW9 A; 3TBL D; 4X57 B; 2DZM A; 2L0F A; 4BKG A; 2BB5 A; 4IWP A; 4HCP B; 3VAW A; 4YSY B; 3KLS X; 2RDG A; 2MA9 B; 3PZ7 A; 3AE5 B; 3U52 E; 1E9M A; 4WUR A; 4EUT A; 4W9G A; 3PRZ A; 1V6E A; 3TUO A; 3AEE B; 5G2N A; 1D5M C; 1HTQ A; 1E7P B; 5D3I B; 4AS1 A; 3ZYY X; 3HM3 A; 3EHV A; 5EDS A; 3PGE A; 3FAH A; 3ZUN A; 4JL9 A; 4AJY B; 2C9W B; 2M4N A; 1WR1 A; 3CMM B; 2GRI A; 5BYQ A; 3H7P A; 2AWT A; 4IKG A; 1H8C A; 2PVG C; 2QEJ C; 1BML C; 4MAC A; 1E7V A; 3IAS 1; 4EFO A; 1I4G A; 1TIF A; 1AW7 A; 1V2Y A; 1OQQ A; 5IAA C; 5T8I A; 3NZS A; 1OQR A; 1P7E A; 4P1B C; 3VH3 B; 1E6E B; 2BQQ A; 4KGS A; 3H8H A; 5AZF A; 3GE8 C; 3SDL C; 3PT2 B; 3Q2A C; 1TS5 A; 4GLS C; 4K7U A; 3QAR A; 2ZNV B; 2LJI A; 3ZQ4 A; 1UD7 A; 1V81 A; 3RZW C; 2O2V A; 3WAM A; 4C56 C; 3PV1 A; 2CHX A; 1CQV A; 2RR9 A; 4F8C B; 3ZW3 A; 2IGH A; 1IBX A; 2JY6 A; 2E3T A; 4C7Z A; 3L54 A; 5DPT A; 3EEC A; 2WXO A; 4KV2 A; 1E10 A; 2B3A A; 5JHA A; 3R2I A; 4OZA A; 4DK5 A; 2W82 A; 2LHD A; 5DPW A; 2PTL A; 3J9C A; 3I57 A; 1T0S C; 2DHZ A; 1K8R B; 3UF8 A; 1ZXH A; 5CHW A; 4ZRQ A; 2C7M B; 4ASW C; 2JXT A; 3ZGZ A; 2QSD A; 1M94 A; 2DZI A; 1FXA A; 4WQM A; 1UGM A; 1WE6 A; 2W54 A; 5L95 C; 3KQ4 A; 1L4D B; 2INP E; 4IWQ A; 2E6X A; 4XDC A; 4MJS A; 3VUY A; 2ZNV C; 2LEK A; 4NAW A; 2DLB A; 2KDE B; 2D5G A; 1XEE A; 3CWI A; 1YIW A; 4TUU A; 4I6P A; 3I9V 1; 2CJN A; 1JCK B; 3W1S A; 2KQS A; 2HDE A; 4KDI C; 2J0M A; 1QOF A; 1L7Y A; 1KOT A; 3P4P B; 3U7D A; 1SF0 A; 4K3C A; 4P16 A; 4IC7 B; 4F7Z A; 3VH4 B; 1NYR A; 2K9X A; 4HRO A; 2PIA A; 1I4X A; 3BVM A; 5BMH A; 5FK9 C; 1RFA A; 4TQ0 A; 4USA A; 3EFC A; 2UWQ A; 2ZCB A; 4JQW C; 1CK1 A; 2FUH B; 2WP9 B; 2R2O A; 2OED A; 2N9K A; 1E8Y A; 2GI9 A; 2M0X A; 3Q8A A; 1AN8 A; 2ACZ B; 3DBL I; 1Q0W B; 2J7Q B; 2L7R A; 1KLU D; 2LFI A; 1K52 A; 4LJO B; 1WMH B; 3VFK A; 3AE7 B; 3RI7 C; 2FID A; 2OOB B; 1TZO A; 1WIA A; 4REZ A; 1MVK A; 3DBH B; 2AQ2 B; 1OFF A; 4IM2 A; 5GMV A; 1R7S A; 4M8N A; 3ZNZ B; 4TV3 A; 4BFR A; 1BXT A; 4YSZ B; 4DXF A; 5JHB A; 3IT4 B; 1GOZ A; 3A9J A; 1LFD A; 2AQ3 B; 2MH7 A; 3Q69 A; 4JLC A; 3HIZ A; 3H9D A; 2FCM A; 4WJN A; 3HK0 A; 4ICU A; 2KLG A; 2ZJD A; 4FLH A; 1ZOY B; 3WIM A; 4DDG D; 1WJ6 A; 2L0T A; 5C1Z A; 1WXS A; 1K51 A; 4ANU A; 3M95 A; 3CSF A; 5KHQ A; 3IBE A; 4M02 A; 5MPO A; 1SE3 A; 4ZRP A; 1LM8 B; 3R7Q A; 1V80 A; 3L10 B; 5L83 A; 4ANV A; 3OJ4 B; 4L1B A; 2JF5 A; 2EKE C; 1KLG D; 1Z2M A; 2IY1 B; 3TEY A; 3RNF C; 2CJO A; 4GDK A; 5LNK 1; 4HXD A; 3V60 A; 3CST A; 1A5R A; 3SU8 X; 1K50 A; 2Y5P A; 2D2Q A; 3BVG A; 4FA6 A; 5DCN A; 2WNM A; 3JW0 X; 2RMM A; 4RM8 A; 1ISN A; 3NRZ A; 1ESF A; 4H2A A; 5AEK B; 3JSV B; 1PGB A; 4ARI A; 4FXC A; 2AQ1 B; 2WQY B; 3N30 A; 3IT6 B; 2CU1 A; 2WDT B; 1T0Q C; 2M17 A; 4PS8 A; 2LD9 A; 1KF6 B; 3Q3O C; 2J53 A; 3LXF A; 2BYV E; 3Q3J A; 2M8S A; 3ETR A; 4FJZ A; 2LHE A; 2KAC A; 2AL6 A; 2KVZ A; 3PSE B; 5CX3 A; 1UUP A; 3ABV B; 1JWS D; 1V86 A; 3AXC A; 1KTK A; 1RWS A; 4GU2 A; 1QZE A; 3WAN A; 4IW0 A; 1C9F A; 1TKY A; 1WXQ A; 2MJE A; 1F2R I; 3H7P B; 4ZRJ A; 3R8B A; 4II2 B; 4R3D A; 5BYR A; 1LGR A; 2MJD A; 1ZPS A; 1YN5 A; 4O1N A; 1MJD A; 1WYG A; 4KZ0 A; 1WRI A; 4KGR A; 5J18 A; 3NG0 A; 2LAS A; 4OZC A; 3TL5 A; 1ET6 A; 3QK0 A; 3SFD B; 2EMT A; 1WGD A; 2WXK A; 5DPS A; 2ZW1 A; 4DDI D; 4IOI E; 2L05 A; 3ZTC A; 3NOB A; 2WU2 B; 2NPT B; 3NZ3 A; 5AUI A; 5J17 A; 1R4N I; 1TKE A; 4IM0 A; 4WAF A; 4NNJ B; 3QWZ B; 2KWD A; 2W55 A; 1P9D U; 1VZ7 A; 2KWU B; 2GBN A; 3AEG B; 2YEP F; 2MEK A; 1SIF A; 1GJZ A; 3L08 A; 3R2T A; 2N9X A; 1B1Z A; 5TR5 A; 4LNI A; 2D3A A; 1ZP0 B; 2L76 A; 2WXR A; 3APC A; 4S0R A; 1N61 A; 2WDR B; 1FFV A; 3PHX B; 2GLS A; 1XD3 B; 2JRH A; 4XZ4 A; 4PS3 A; 3APD A; 3PPA A; 3C19 A; 3N1X C; 2DAJ A; 1P3Q U; 2QCZ A; 3OWE B; 5AZH A; 1VD2 A; 4LLG M; 1STE A; 1NDD A; 4AP4 C; 4W9H A; 1FNW A; 1I7H A; 1PFD A; 4W9D A; 3B08 A; 1JWU D; 2WXH A; 1J7A A; 3ZJT A; 3AE9 B; 1GNU A; 2NBU A; 2DZJ A; 2NR2 A; 2Q5W D; 2D3G A; 2MBH A; 4G3X B; 1I4Q A; 2BS2 B; 2RPQ A; 3VDZ A; 3CF6 E; 4US9 A; 4MGI E; 1L5P A; 2WXQ A; 1N62 A; 2WXF A; 1CJE A; 2K39 A; 4ZRI A; 3A4R A; 3Q8B A; 2N0S B; 3ZJU A; 1WJN A; 3N9Y C; 1Q10 A; 2K3U A; 4PK1 A; 1TYG B; 4K1R B; 3DHG C; 1WR6 E; 4FN2 A; 4ANW A; 4B9K A; 2D07 B; 4P1C C; 3JYU A; 4KSK C; 1S1Q B; 4DWF A; 4LNF A; 1IGD A; 2LVO A; 2OHF A; 3AE1 B; 3BWU D; 4AWJ A; 2ONQ A; 4G0N B; 1GG3 A; 3MJ5 A; 4EOY A; 4II3 B; 3ALB A; 1NEK B; 2BS4 B; 3DHH C; 2BBC A; 3DQV A; 4LTU A; 4US8 A; 3Q8F A; 4EKU A; 3T8M A; 3C0R B; 1E90 A; 1WGG A; 3IFW B; 2N4F A; 2DAF A; 3H1U A; 1EUV B; 1QIL A; 1UWX A; 3W1S C; 3N3K B; 1TT5 B; 2FNJ B; 2JU6 X; 3NS1 A; 3PRM B; 1R4N B; 2LWP A; 4YT0 B; 4HLE A; 1NYQ A; 1WX8 A; 2PVO D; 3MC0 B; 1ZKH A; 4XWT A; 5EE3 A; 2BGF A; 4YTN B; 3W1Y A; 2KMA A; 3QCA A; 4BKS A; 2N9P C; 3OG5 A; 3UQA A; 2DYO A; 3AE8 B; 3B9J A; 2K0P A; 3P4R B; 3DBR B; 3VRB B; 3B2F A; 2MRP A; 1IP9 A; 4MM3 A; 4BZA A; 4EZL A; 2WXL A; 5E6P A; 3L17 A; 4K7S A; 5G5H A; 3GOE A; 4YTP B; 1F2R C; 3RUL A; 3TJP A; 4B95 A; 5E6N A; 5EE0 A; 4OVU A; 2XK5 B; 1SE9 A; 4F1S A; 5JZE B; 4N6E B; 1UEL A; 1WM2 A; 5BO4 B; 1QOB A; 2LGI A; 2JYE A; 3KWV A; 2W9N A; 3NVZ A; 2ON8 A; 1HA5 A; 1WWT A; 1MHX A; 3WCQ A; 5CTR C; 4I6L B; 1V5O A; 3TEW A; 2LVQ A; 1UBI A; 3O65 B; 3AU4 A; 4KDL B; 1ET9 A; 1WGK A; 4ICV A; 4ZHO A; 3PRE A; 1NI2 A; 2UU7 A; 2M19 A; 3Q8C A; 3PTF C; 2PE6 B; 2SAK A; 1TGZ B; 1WSP A; 5H92 C; 2KT7 A; 1MPE A; 3PRP B; 3Q6B A; 3AU5 A; 3RNG C; 1JAL A; 4RGM A; 4WWP A; 4XWW A; 2PEA A; 2PMV A; 3Q3M C; 1YQB A; 3N20 C; 3P63 A; 1KFY B; 1UH6 A; 4L2Y A; 1ZXI A; 2FUG 1; 2WHI A; 3WAL A; 2I2Y A; 1YN4 A; 2R2Q A; 2J52 A; 1EWC A; 2PE9 A; 3FKY A; 2KQ4 X; 1XCQ L; 2K1F A; 5IN7 A; 1OEY A; 4K7W A; 3VUX A; 4RGT A; 1L0V B; 1P7F A; 1WGR A; 4ZOH C; 3VTV A; 3DWG C; 4W9K A; 4CYE A; 4WWO A; 2L00 B; 3DBH I; 4IG7 B; 4LCD E; 4WWM A; 2KN4 A; 3AE2 B; 1WJ4 A; 4KGT A; 5C2T B; 1SXT A; 2NTS A; 4MGK E; 3HVZ A; 3WA0 A; 2DBY A; 1V5T A; 3QA8 A; 1VDV A; 1JRU A; 3DVN U; 2JT4 B; 1VZ8 A; 4M0W B; 3ENE A; 5D3D A; 2D11 A; 4OZB A; 2V3P A; 2KJH B; 4BOZ B; 4E74 A; 3ZIM A; 2CS4 A; 3OJ3 A; 5J2R A; 1PYW D; 1V1P A; 1E5W A; 4MSM B; 3MFG A; 1L6V A; 4KSL C; 4B0M A; 2AL3 A; 2WXN A; 2LMC A; 1C3T A; 4QAY A; 4WIP A; 1TBE A; 3BZD B; 3DPD A; 1FIQ A; 2RD0 A; 3ZXR A; 1V1O A; 1TS3 A; 2BS3 B; 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