The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PLASMINOGEN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
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| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QQR A; 1L4D B; 1L4Z B; 1BML C; 1C4P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SE2 A; 4WWP A; 1ACC A; 4P16 A; 2J0M A; 3NY5 A; 4HCP B; 1FEH A; 2N1V A; 4ICU A; 2LJI A; 1SJH D; 4W9I A; 1FNU A; 2MJE A; 2INC C; 4DXF A; 3PRM B; 3AB5 A; 2ZJD A; 2NBU A; 2KT7 A; 2MBE A; 5JH5 C; 4NQL B; 2WXN A; 3W1S C; 3WAN A; 3Q3J A; 1KLV A; 2K8H A; 3DVN V; 1GPX A; 3SU8 X; 5TR5 A; 4DK5 A; 3H7S A; 2IGD A; 1SSN A; 3LB8 C; 3J9C A; 2MJD A; 3T3O A; 1I42 A; 3U7Z A; 2EKE C; 2CJO A; 1E5W A; 3ETR A; 4FAD A; 4KV2 A; 4NPN A; 1VCB A; 4BKS A; 3PRZ A; 1QZE A; 4FHK A; 3A9K A; 3SFE B; 2N9P C; 1GC7 A; 3BIN A; 1FFU A; 3QA8 A; 1TJE A; 3GZN I; 1EUV B; 4GXB A; 2INP E; 4M0W B; 1P3Q U; 1WE7 A; 1Q1O A; 3TEX A; 3Q14 C; 2KAJ A; 4HJK A; 1FFV A; 2MP2 A; 1N61 A; 3P2B A; 2KQS A; 3QC8 B; 4HDO A; 1KJT A; 4HWI B; 5MPO A; 1XEE A; 1HTQ A; 1KTK A; 4JPS A; 1NVI D; 1KFY B; 1J7B A; 2BYT A; 2LGY A; 1GNU A; 3AEA B; 3B08 A; 3AE3 B; 1ZDX A; 3MJW A; 2NBV B; 4KIK A; 1RM6 C; 4K7U A; 1C4A A; 3GS2 A; 4G50 A; 1KM7 A; 2MA9 B; 1D5X C; 2WP9 B; 3Q8F A; 4M8N A; 4ZOH C; 1P7E A; 3PLU A; 4B0M A; 1TY0 A; 3VAW A; 2DHZ A; 2DX5 B; 3PPA A; 3X0W A; 4I6P A; 3LDZ E; 2LGD A; 3P4S B; 1CJE A; 3AU5 A; 3VXW A; 3DDC B; 3DBR B; 3C8Y A; 3H9D A; 2DYM A; 4KGS A; 2J52 A; 4JIO U; 4W9J A; 5G2N A; 3I9V 1; 1STE A; 2OHF A; 3RNE C; 3UGB B; 3DBL B; 1PYW D; 1XCT L; 3AM9 A; 4MJS A; 4XWW A; 1Z5S B; 2KDE B; 1F52 A; 5C3J B; 2WXG A; 3VH4 B; 2EEL A; 1CK1 A; 4B6W A; 2VH1 A; 5D3D A; 4KDI C; 3FIL B; 4II2 B; 4OZC A; 3ZNI D; 3RZF A; 4MT5 A; 2EKI A; 3R66 C; 2Y5C A; 5C2T B; 4YSZ B; 3C0R B; 2LVQ A; 4FUL A; 2WYQ A; 1YJ1 A; 3KUD B; 4PS8 A; 4ANX A; 1EWY C; 2CHW A; 1PDX A; 2KWD A; 4I6L B; 4LNO A; 3TEY A; 2K6Q A; 2MW5 A; 1E8Y A; 2J0J A; 3DBH B; 4K1R B; 3ZIM A; 1L0X B; 4LNK A; 4NJ6 A; 3TUO A; 3X23 A; 3AEF B; 3DVG X; 2K39 A; 1RAX A; 3HVD A; 1NYR A; 1T0Y A; 2IY0 B; 2JUO A; 3NZS A; 1VRA B; 4W9L A; 3TIX A; 5CTR C; 4ARI A; 4RM9 A; 2IO2 B; 2L1A A; 1DOI A; 1YD8 U; 3VH3 B; 3EC8 A; 1EF5 A; 3GOE A; 4RGT A; 3PZD A; 2AEH A; 1IP9 A; 2YEP F; 1E9M A; 1TKE A; 1QT9 A; 2ASQ A; 4M0W A; 1MG4 A; 3ZDM C; 1MHH E; 1WMH B; 1XF5 L; 5HHD G; 2WWZ A; 4DDG D; 1AYF A; 3Q2A C; 3H6N A; 3LXF A; 4W9H A; 2CJN A; 3P63 A; 4EOY A; 3LJ3 A; 2KYW A; 4H2A A; 1UGJ A; 2Y5B B; 4EZJ A; 2IDY A; 4LDT D; 2C7N B; 2NBW B; 2M56 B; 2WS3 B; 1ZXI A; 1E7P B; 1I4Q A; 2DYO A; 2E3T A; 1Y56 A; 3TBL D; 4US8 A; 3SDL C; 1LXD A; 3FC4 A; 4RCO A; 1KRH A; 1B9R A; 2L76 A; 2BBC A; 3AEB B; 1P9D U; 2M1M A; 4HLE A; 4F8C B; 3OLM D; 4A20 A; 3BY4 B; 2GBJ A; 1SEB D; 2YVC A; 1JWM D; 3P1M A; 2I1K A; 3RNF C; 3RPF C; 2BYE A; 3VR9 B; 1F0Z A; 1WGY A; 1E90 A; 1VR9 A; 4HKZ E; 1PGB A; 2D5G A; 3ZLZ A; 5EE0 A; 4DXG A; 3AE2 B; 2EMT A; 3NVY A; 4ANW A; 2QC8 A; 1C9F A; 1V6E A; 1WXV A; 4HCN B; 2WLB A; 5H92 C; 3NJT A; 2XBB C; 2DYB A; 4L23 A; 4ZHO A; 4IOI E; 1DGJ A; 4WH4 A; 1WJ4 A; 2GOW A; 1J0G A; 4DXA B; 2LUE A; 1XLN A; 1WXS A; 5AZH A; 2FCS A; 2QDF A; 2WXP A; 3B9J A; 3DPD A; 5L83 A; 4GB9 A; 4USA A; 5CHW A; 2MBH A; 3FIL A; 4GLS C; 1FRR A; 1TBE A; 1T5X D; 4EZK A; 1M4V A; 2GLS A; 1WE6 A; 5H8Y E; 4QAY A; 4A3O A; 2KJR A; 4G11 A; 5BYR A; 5AUK A; 2N7E A; 4RMA A; 1V80 A; 4WAA A; 1T6B X; 1T0S C; 2B3A A; 2QMT A; 4JWU C; 2J53 A; 2LVP A; 4YL8 A; 4BAX A; 1YX5 B; 4W9G A; 3Q8E A; 4BKG A; 3QX1 A; 1V5O A; 2C5L C; 4IWP A; 4A9A A; 1OQY A; 3DBS A; 1OEY A; 4C4V B; 4MEM A; 2ON8 A; 2C7H A; 2IY1 B; 5HI1 A; 4P7I A; 3MC9 A; 3NOB A; 4OVU A; 4ZYS A; 1GUA B; 1V49 A; 5IOI A; 4URK A; 3WAO A; 5JZE B; 4PK1 A; 2LJ5 A; 2L32 A; 1WMH A; 2N9E B; 2DAF A; 1ROE A; 2V1Y A; 2G45 B; 1JML A; 1WRD B; 1A5R A; 1C76 A; 2BPS A; 3Q8B A; 4GMV A; 4XZ4 A; 1WJ6 A; 2KVR A; 4R3D A; 2ZCB A; 1QF6 A; 4KZC A; 1PQS A; 4FA6 A; 4K81 A; 2TSS A; 1DOX A; 3Q8C A; 5DPS A; 3ZKJ C; 4WJQ A; 4MGK E; 1SIF A; 1YNT E; 4O1N A; 1XLP A; 2WXQ A; 2WDT B; 3UIP B; 2W54 A; 1J19 A; 5IA7 A; 4AS1 A; 4GOC A; 1YQ4 B; 2D10 A; 4DWF A; 4XC2 A; 5CHV C; 2ZVO A; 3CST A; 3OAW A; 1N6Z A; 3JVZ X; 1TS4 A; 3NG0 A; 4REZ A; 1TS5 A; 3B2F A; 1I7H A; 3BII D; 3IHP C; 2BWE S; 1EF1 A; 3UI3 A; 3V61 A; 4JL9 A; 3U4E G; 3CMM B; 3NS1 A; 2JY6 A; 3KLS X; 2QEJ C; 3Q8A A; 3A4S C; 1LGR A; 4KGR A; 2K0P A; 5JHB A; 3Q3F A; 3AV8 A; 4CYE A; 2BF8 B; 4IKG A; 3BZD B; 4YWG G; 4TV3 A; 2KQ7 A; 3FKY A; 4XDD A; 2IO3 B; 3ZQ4 A; 2IO0 B; 2OOB B; 5FR6 A; 4WWN A; 2L0F A; 3PS6 A; 4WJO A; 1L5P A; 4GGQ A; 5J17 A; 1WSP A; 2WX1 A; 2WXI A; 2JSV X; 1FNW A; 2WXJ A; 1UH6 A; 3HIZ A; 1EWC A; 4RGO S; 1JRP A; 2RD0 A; 4B95 A; 2MEK A; 2W55 A; 4S0R A; 1SE9 A; 2D3C A; 3KYC D; 4OHJ A; 1WJU A; 4MSQ B; 2KDM A; 3EEC A; 2VH2 A; 3WA0 A; 4TKN A; 4RNA A; 1OFF A; 1ZGU B; 2AL3 A; 4C7Z A; 1WWT A; 4PS3 A; 2FCN A; 3BK1 A; 1TS2 A; 4AUQ C; 3APF A; 3QJZ A; 3RZW C; 5HKH A; 4II3 B; 1XCQ L; 1V86 A; 3DHG C; 1XXG A; 3HM3 A; 3PVL A; 3HK0 A; 4ZYN A; 2MWS B; 4XDC A; 2LGI A; 2UYZ B; 1I4R A; 1PGX A; 1I4H A; 2D3G A; 1QKZ A; 3WCQ A; 3RNC C; 2ZNV B; 1FM0 D; 3T3N A; 3Q3N C; 4C4V A; 1XLO A; 2I2Y A; 4NJC A; 3HVZ A; 1JAL A; 3KVF B; 5FK9 C; 2KXJ A; 1E7V A; 3VTW A; 3ZNZ B; 2REX A; 3AE1 B; 4ARC A; 2M0X A; 2ONQ A; 1C79 A; 4EZL A; 3M63 B; 4E71 A; 5JXV A; 3NRZ A; 5IN7 A; 2LUM A; 2ZW1 A; 3K9O B; 3TJP A; 5LLI A; 5BMG A; 2JWU A; 3N9Y C; 1MG8 A; 2HD5 B; 1I4X A; 3D32 A; 1ZKH A; 3VUX A; 2KTF A; 2WGS A; 2L0T A; 2H89 B; 3HHM A; 1MFW A; 3ML8 A; 4DBG A; 3B0A A; 3JW0 X; 1D4B A; 3AXC A; 2O2V B; 3IVF A; 2W3R A; 3H1U A; 4N58 A; 3PRE A; 2KAN A; 3DCG A; 4ZRJ A; 1BML C; 1WXM A; 1AW7 A; 1R4M B; 2A5U A; 3BK2 A; 2N9K A; 3L54 A; 1V81 A; 4YT0 B; 1R4N B; 1RLF A; 1WM2 A; 2X8X X; 3KWV A; 4HRO A; 4MM3 A; 1XLQ A; 3AUL A; 1WI0 A; 1TIF A; 1P7F A; 4OW0 A; 2N9L A; 4WIP A; 3I57 A; 3O65 B; 1FXI A; 3MJ5 A; 3CF6 E; 1BUI C; 2GBK A; 1WRI A; 5C1Z A; 4M8M A; 4PT5 A; 4ZRI A; 4IM3 A; 3B2G A; 3RCZ A; 1I4P A; 3OJ4 B; 1WGG A; 4GIV A; 3Q6B A; 2PJH A; 3VVW B; 5J18 A; 1FXA A; 2HDE A; 5E6N A; 2SAK A; 3ZNH B; 1ZE3 D; 3NUH B; 1DYQ A; 5DPR A; 3WAP A; 4EUT A; 1Q5W B; 2RR9 A; 2K22 A; 4WQM A; 1HZ5 A; 3FAH A; 4FBJ B; 4WJP A; 3V05 A; 2LD9 A; 1C1Y B; 2LZ6 A; 1MPE A; 3U2S C; 3DVG Y; 2WXK A; 3BVG A; 3SD5 A; 4KZ0 A; 2LRW A; 2KMA A; 1FXT B; 4A6Q A; 3ZDT A; 4C56 C; 3W2D A; 2D3B A; 2HE7 A; 2HTH A; 1I35 A; 1VJK A; 2XN9 C; 3T9L A; 3V60 A; 4PS7 A; 2JWZ A; 5HG2 A; 3UQB A; 1ENF A; 3AE6 B; 2O6V B; 5G55 A; 4IW0 A; 1JQ4 A; 1QQR A; 2PKO A; 5G5G A; 4NZL B; 1UEL A; 1FPY A; 1JW9 D; 2L83 A; 1N5X A; 2WXO A; 1U4A A; 1BT0 A; 1SJE D; 1WX9 A; 4AP4 C; 4OZB A; 4YXD B; 2RMM A; 2M19 A; 2RDB C; 4WQO B; 2CKH B; 2IGG A; 1OEY J; 1UWX A; 3CWI A; 1IPG A; 2K3U A; 1FCL A; 1WYG A; 5DPT A; 3HUI A; 3UF8 A; 4OVZ A; 1FMA D; 3BYY B; 1L2N A; 3W5U B; 2O6V D; 5AEK B; 2BS4 B; 1SF0 A; 2O2V A; 4UDU C; 3M3J A; 1IBX B; 1UD7 A; 3URY A; 2K8B A; 3JYU A; 4EKU A; 4JWS C; 4IG7 B; 4NJ7 A; 4HK2 A; 1F2R C; 4IDI A; 4LDT B; 2LGS A; 3VFK A; 1K53 A; 5D94 A; 2ZNV C; 1Q10 A; 2KKC A; 1VZ8 A; 4JE3 B; 3KUC B; 1J8C A; 1R4M I; 2A4Z A; 4DQO C; 2KNB A; 4FJY A; 1D5M C; 2KQ4 X; 3VTV A; 2G4D B; 3KH0 A; 4GU2 A; 4K3B A; 2LXA A; 4ASW C; 1R7S A; 4G3X B; 3M62 B; 2MH7 A; 1P1A A; 2DLB A; 4ZHP A; 3PSE B; 5CX3 A; 1NEK B; 3AE8 B; 4I6N B; 1WX7 A; 1TTN A; 2G9H D; 2WXM A; 1HEZ E; 3LYY A; 2MBB B; 4RGM A; 1XO3 A; 2M4N A; 3ENE A; 1LFD A; 1WYW B; 2W3S A; 2X38 A; 1QOG A; 1XD3 B; 4EFO A; 1FNV A; 2JZZ A; 4IM0 A; 1H8C A; 3MP9 A; 3DHH C; 1T0R C; 4GDL B; 2BB5 A; 1EU4 A; 2HTM E; 3ZNG C; 3TEZ A; 4E3C A; 2PVO D; 4BZA A; 1FIQ A; 1K50 A; 1YJJ A; 1OGW A; 1MVK A; 3MFG A; 2NTT A; 2GMI C; 2J42 A; 4JQW C; 1QOA A; 3WAL A; 2UWQ A; 2KLG A; 4WWM A; 2WDQ B; 1WGR A; 2ACZ B; 2HJ1 A; 3N3K B; 3QQ8 B; 3WIM A; 4BVU C; 4K3C A; 3VHT C; 2KX0 A; 2O6V A; 1GAQ B; 2V3P A; 4US9 A; 2FBW B; 4X57 B; 2R2Q A; 2L05 A; 2AWT A; 3KQ4 A; 3BVZ A; 1NI2 A; 2DZJ A; 1YMH E; 3MC8 A; 3ZO5 B; 5GXG B; 1IGC A; 2IPK D; 2WXF A; 5KHQ A; 3DBR I; 4KGT A; 2CU1 A; 2MBQ A; 1ISN A; 2KC1 A; 3DWG C; 4AJW A; 2ZPN A; 1TZO A; 3RYT A; 3AMZ A; 2HJ8 A; 3DBL I; 1RWS A; 3L0W B; 1TY2 A; 3K9P B; 2D2Q A; 3NZ3 A; 4TSS A; 1V97 A; 2GI9 A; 2SEB D; 5D3I B; 4MSM B; 3EUB 2; 1D5Z C; 1S1Q B; 5D7G A; 3V6E B; 1DOY A; 1L6U A; 1XT9 B; 4KVG B; 3PT2 B; 1IBX A; 4B9K A; 2XK5 B; 1LQB A; 3H8H A; 1UGM A; 1TT5 B; 5J2R A; 1Q0W B; 3N20 C; 1P0R A; 1ZPS A; 4RF0 A; 1WZ3 A; 2DWQ A; 1E8W A; 3I3T B; 2BS3 B; 1WGK A; 3DBH I; 1PFD A; 4M00 A; 3VUW A; 3V62 A; 2N9X A; 3BVM A; 1K51 A; 1EU3 A; 2VZK D; 2DBY A; 2PEA A; 2DZM A; 2C60 A; 1WXQ A; 3BWU D; 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2K25 A; 2LRU A; 1HE8 A; 2JZ3 B; 4HXD A; 4EEW A; 1C77 A; 5CHF A; 1CQV A; 1M94 A; 1ZOY B; 2XK5 A; 4ITK A; 3OJ3 A; 1RRB A; 1TZ1 A; 2RDG A; 3ZGZ A; 2R61 A; 4WUR A; 4ZRK A; 2KWU B; 2JYT A; 5IO9 A; 2ZEQ A; 2AL6 A; 2L52 A; 3L4P A; 3VR8 B; 4MGZ E; 3W1S A; 1GB1 A; 4LLG M; 1I4G A; 1T3Q A; 2FCQ A; 2BYF A; 2WXL A; 4FJV B; 1QLB B; 2IJ0 A; 1WR1 A; 2J0K A; 1TGZ B; 4TMA B; 3NVW A; 4DHZ E; 2L7R A; 5TSS A; 5HFY A; 1EM7 A; 5EE9 A; 3A33 B; 2JF5 A; 2RDH A; 1JWU D; 4GN1 A; 1V1P B; 3IBE A; 1TYG B; 4N59 A; 4KDL B; 3VDZ A; 2QHO A; 1KLG D; 1V2Y A; 4XYC A; 2MRP A; 1E8X A; 3QAQ A; 2NPT A; 4YTP B; 1GC6 A; 3S2A A; 3OWE B; 2ZVN A; 1E6E B; 1Y8R C; 2QSD A; 3OG5 A; 3KW5 B; 2KZR A; 4F1S A; 1JRO A; 2MQJ A; 3U7D A; 4L2Y A; 5FKA C; 4ACF A; 3AEE B; 3MTN B; 1NYQ A; 3N1X C; 1J7A A; 2DZK A; 1C4C A; 2OJW A; 3UIO B; 5T8I A; 2GB1 A; 2NR2 A; 4ANU A; 2MJ3 A; 3RNA C; 4A55 A; 4P1B C; 2RSU A; 1BXT A; 1VLB A; 4A8X C; 3A9J A; 4MH0 E; 2WNM A; 2C7M B; 2KK8 A; 3DHI C; 3P4R B; 2QCZ A; 2KOX A; 2Z0E B; 5E6O A; 3L16 A; 4DHJ B; 1JRU A; 2KX3 A; 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