The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PLASMINOGEN
|
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
|
| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QQR A; 1L4Z B; 1BML C; 1C4P A; 1L4D B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MDK E; 1WFY A; 3NZ3 A; 4ASW C; 3ZJT A; 2KO3 A; 4JPS A; 4WJP A; 1B9R A; 5G5H A; 4HVB A; 4RGN A; 4MSM B; 4XGA B; 2EMT A; 2WXQ A; 3ML8 A; 3X0W A; 3VR9 B; 2N0S B; 3EC8 A; 3WIM A; 3A9J B; 2MLB A; 1WGK A; 3H8H A; 4HWI B; 3ZJU A; 3ML9 A; 2GLS A; 1YN5 A; 3A1Q A; 1C79 A; 3RPF C; 4B9K A; 3HIZ A; 1JRU A; 1E10 A; 3RCZ A; 4P1C C; 1D5Z C; 2A4Z A; 1WGH A; 4II3 B; 2N7J A; 1DOX A; 2DX5 B; 1I7H A; 2M19 A; 2JZ3 B; 3AED B; 1K53 A; 4E74 A; 2KFK B; 4HLE A; 1E8X A; 2LUE A; 3NRZ A; 2WXM A; 1V5T A; 4PS7 A; 4FA6 A; 4AJW A; 3W9C B; 3WAO A; 1XT9 B; 4ZOH C; 2L83 A; 2GBR A; 1K52 A; 3U7D A; 2BKF A; 4HDO A; 2PJH A; 1QOG A; 2KMC A; 2GOW A; 4ZRP A; 2BYF A; 4IM2 A; 4ICU A; 3WA0 A; 1XLQ A; 3V6C B; 4ITK A; 1I4Q A; 1C4P A; 3JSV A; 1ROE A; 1JWM D; 5E6O A; 2B3A A; 3BYT B; 4JQW C; 3P42 A; 2DAF A; 2IY1 B; 1STE A; 4W9I A; 4M0W A; 3R2I A; 2MX2 A; 2EEL A; 4MSQ B; 4KGS A; 1UBI A; 3MHZ A; 2LHD A; 2MJD A; 3BK1 A; 1UUP A; 2RDB C; 3J9C A; 3GE3 C; 4HCN B; 3ZNI D; 4WWM A; 1F1H A; 1QOA A; 2RDH A; 2M0X A; 1WXQ A; 4M00 A; 4MGZ E; 4LLG M; 1NEN B; 2DWQ A; 2KWC A; 3A9K B; 1Y56 A; 4HRO A; 4IM0 A; 1JAL A; 4B6W A; 1TKE A; 1TT5 B; 1LM8 B; 4L23 A; 3U30 A; 3DDC B; 4I6L B; 2UWQ A; 1AAR A; 3RYT A; 3V05 A; 4YTN B; 3ZXR A; 1WZ0 A; 1WXA A; 2I1K A; 2WXN A; 4WQO B; 2LXC A; 1SEB D; 3VR8 B; 2YEP F; 3NS1 A; 4MGY E; 5J18 A; 3BZD B; 4TMA B; 2D3C A; 5IOI A; 4EOY A; 4BVU C; 1WGR A; 1KLV A; 3DHH C; 5FR6 A; 2V3P A; 2DZJ A; 3PPA A; 1WRI A; 3IAM 1; 1VZ7 A; 2DYB A; 2O2V A; 1XD3 B; 2Y3A A; 2JSV X; 3AE9 B; 4ZRJ A; 1KM7 A; 3IFW B; 1KLG D; 2FCM A; 4H2A A; 2D11 A; 2KWU B; 2N1V A; 2XK5 A; 1FFV A; 3M63 B; 4A3O A; 2IY0 B; 4GXB A; 3RD2 A; 4OZC A; 2D3A A; 2MP2 B; 1D4B A; 1HQR D; 1J7B A; 2K0P A; 3MJ5 A; 3MHS D; 3SD5 A; 3ZRC A; 3I5J C; 2KDI A; 5TR5 A; 4IG7 B; 4FHJ A; 2DZM A; 3PT2 B; 2W3R A; 2J53 A; 5HKH A; 3EHV A; 2NBW B; 2WGS A; 2MA9 B; 1ZP0 B; 4BKG A; 3EFU A; 2AQ1 B; 3AE1 B; 4IC7 B; 3GOE A; 4MH0 E; 1WWT A; 3PHW B; 2K8B A; 1E6E B; 1YD8 U; 2AL3 A; 1KRH A; 4HCP B; 2WDV B; 1WX7 A; 2WQY B; 1L7Y A; 2KDM A; 4PYU A; 2L8J A; 2INP E; 1N60 A; 1V86 A; 4NNJ B; 2WXI A; 1XCT L; 3BY4 B; 3HVZ A; 4K81 A; 2M17 A; 2KDF B; 4RCO A; 1WGG A; 1F9J A; 3KUD B; 4FLH A; 4ARI A; 1E7U A; 1YQ3 B; 2N1W A; 3AEB B; 1HZ5 A; 3IVF A; 3I63 C; 3RFZ B; 2FAZ A; 2KTR B; 2KX3 A; 3A4S C; 3RUL A; 1QIL A; 2JQR B; 3L08 A; 5BYS A; 3VH4 B; 3QK0 A; 1V1P B; 3FIL A; 2LJI A; 1FMA D; 2TSS A; 2LJ5 A; 4FBJ B; 2IGG A; 1EO6 A; 1JCK B; 2ZNV B; 2PE6 B; 4IOI E; 4LK0 M; 4K7S A; 4ANU A; 2J0K A; 4M02 A; 1D5M C; 1LO5 D; 1L0Y B; 1GB4 A; 2J52 A; 3PS6 A; 2HD5 B; 4BOZ B; 4OZA A; 3WAP A; 2LD9 A; 3QA8 A; 1N63 A; 1E9M A; 2R61 A; 5DCN A; 2FUH B; 1R4N I; 5DPT A; 3PV1 A; 2Y5P A; 2L05 A; 3PRE A; 4MEM A; 3DHG C; 1FM0 D; 3KYC D; 2OOB B; 4AUQ C; 1JQ4 A; 3DBR B; 1WI0 A; 4KX6 B; 1SGH A; 2WU5 B; 4PK1 A; 3TMP B; 3ZKJ C; 1FRD A; 3W1S A; 3QJZ A; 2KQ7 A; 4P16 A; 2M4N A; 1FCL A; 2DAJ A; 1M94 A; 1XEE A; 2NBU A; 3Q8A A; 3S2A A; 3DVG Y; 1R4N B; 4UDU C; 4AJY B; 2GBK A; 1UWX A; 2K8H A; 2KC2 A; 5IA7 A; 3QC8 B; 1PYW D; 4RMA A; 3MC8 A; 3RZW C; 3TL5 A; 2M8S A; 4IUM B; 2KD0 A; 2IJ0 A; 5CTR C; 3VDZ A; 3HM3 A; 5L83 A; 1N5X A; 3JYU A; 1J7C A; 1QLB B; 3DCG A; 3Q8E A; 4K7W A; 4MH8 A; 4IM3 A; 3VAW A; 2G4D B; 2MWS B; 4YSZ B; 1P1A A; 4CQN A; 1SE3 A; 5CX3 A; 1WGD A; 1ZDX A; 2GRI A; 2HJ1 A; 3N1Z C; 5HHD G; 4FHK A; 2BWE S; 3W5U B; 2OED A; 1N6Z A; 1LXD A; 1HTQ A; 2VH2 A; 4ARC A; 3Q3F A; 3T3N A; 2OJR A; 3M95 A; 4MJS A; 2NR2 A; 2JY6 A; 1ZE3 D; 4HRS A; 5J2R A; 2KMM A; 2ON8 A; 1SE4 A; 1OQQ A; 3CWI A; 2FUG 1; 1Z5S B; 4WWN A; 2FBW B; 2AWT A; 2JXT A; 3APC A; 3ZUN A; 3ZW3 A; 3ZDT A; 2Q5W D; 4KKJ A; 4WWO A; 1MJD A; 3LB8 C; 1V81 A; 5FK9 C; 2DZI A; 3P2B A; 3IBE A; 1T0R C; 5IO9 A; 2INC C; 5DPS A; 2ZPN A; 4KSK C; 3B08 A; 3CF6 E; 2LVO A; 5IAA C; 1FO4 A; 2QIL A; 3L4P A; 4J3O D; 5G55 A; 1L5P A; 4LTU A; 5GMV A; 1GJZ A; 2L0F A; 4GDL A; 5G5G A; 1EUV B; 4N59 A; 4XE0 A; 4BKT A; 1TY0 A; 5D7G A; 2C7N B; 3TUO A; 1DOI A; 3UIP B; 4GDK A; 4NAW A; 1FXI A; 1FNU A; 2Z0E B; 2JU6 X; 2EMS A; 3IT4 B; 1X1M A; 1BML C; 4BFR A; 1SE9 A; 1NEK B; 1YQB A; 2BKR B; 2ZCB A; 1AW7 A; 3CSF A; 4PS3 A; 5HI1 A; 4WAF A; 3U8Z A; 4CYE A; 4TSS A; 3EEC A; 1T3Q A; 1P98 A; 5C3J B; 2JT4 B; 2QCZ A; 2WXG A; 3NG0 A; 3VH3 B; 3CMM B; 3PVL A; 1CMX B; 1C76 A; 2CHZ A; 4KIK B; 3SHQ A; 2KLG A; 2Y5B B; 5BMI A; 2IO2 B; 1OEY J; 3N1Y C; 1XF5 L; 4MGI E; 1FD6 A; 3EUB 2; 2D3B A; 1YN3 A; 3VRA B; 4GOC A; 4YTM B; 2PE9 A; 3U52 E; 1AN8 A; 3Q3J A; 3OAW A; 2O6V B; 2XN9 C; 4A6Q A; 2V9H A; 1V1O A; 4OZB A; 1WF9 A; 3BK2 A; 2QIE B; 3GZN I; 4OVZ A; 2DNF A; 1MVK A; 2LAS A; 1MG8 A; 1VZ6 A; 1VR9 A; 2UU7 A; 3VFK A; 1HEZ E; 5BMG A; 2GBM A; 2HJ8 A; 1WMH B; 2G4S A; 2BT6 A; 2MEK A; 2WDQ B; 1R7S A; 3AU4 A; 1KF6 B; 4HK2 A; 2IND C; 4EUT A; 4MM3 B; 2I38 A; 2NPT B; 2LI5 A; 4DXF A; 2C7M B; 5EE0 A; 1UGJ A; 4FJV B; 1H4R A; 2KFK A; 4IWP A; 1FFU A; 3GZN B; 4DBG A; 2E3T A; 4LNK A; 2BWF A; 1D3Z A; 2BGF A; 1LFD A; 3H7P A; 3RUI B; 2KOX A; 4WUR A; 3VQI A; 5H92 C; 3DPD A; 1F2R C; 2KN4 A; 1FEH A; 3GB1 A; 1XLN A; 4C7Y A; 2DYM A; 2K6D B; 5BYR A; 1ZXI A; 2JWU A; 3L0W B; 3UQA A; 2KX0 A; 1TBE A; 1WXV A; 4NAM A; 3NOB A; 3NZS A; 3PZ7 A; 4IKG A; 1YX5 B; 4KZC A; 1FRR A; 2MBE A; 4QAY A; 1E7P B; 4FJY A; 4DDG D; 3U7Z A; 2ICI A; 4BZA A; 2JRH A; 2KVR A; 4NZL B; 1E5W A; 2BBC A; 4K3B A; 2KQS A; 1JRP A; 4HKZ E; 1GNU A; 1LGR A; 4WQM A; 2ACZ B; 3GS2 A; 4B0E A; 2D07 B; 3AU5 A; 1ESF A; 1DGJ A; 3NVV A; 4ICV A; 3Q14 C; 4G3X B; 1L4Z B; 2ZVO A; 1QKZ A; 1TZ1 A; 1GOZ A; 1T0S C; 1WJ4 A; 4K1R B; 4US9 A; 4HEA 1; 4N9F 4; 1YMH E; 1XLO A; 5EE3 A; 1R4M I; 2Z8L A; 4DDI D; 2R2Q A; 4FN2 A; 3HK0 A; 3A9K A; 2ZJD A; 1SB3 C; 3AE6 B; 2SAK A; 1UF0 A; 3VRB B; 2WXK A; 2RD0 A; 3APD A; 1NYR A; 3P4Q B; 4EZJ A; 3VXW A; 1WSP A; 2JYE A; 2WXO A; 5AEK B; 1J19 A; 3RNG C; 1FNW A; 1YX6 B; 5AZF A; 2MBQ A; 1R4M B; 4ANX A; 3B2F A; 4KGR A; 3TEW A; 3VHT C; 3PZ8 A; 3DBH I; 1SJE D; 2PVO D; 1FNV A; 1WX8 A; 2B76 B; 1ZGU B; 3U2S C; 2L32 A; 3I3T B; 1I4X A; 4PYZ A; 5LNK 1; 3ENE A; 2XBB C; 3A1Q B; 2BS4 B; 2WXF A; 2HTM E; 3NY5 A; 5HG2 A; 3AEA B; 3BVG A; 3DBH B; 3AXC A; 1UGM A; 2BS2 B; 4KKI A; 2G1E A; 4MT5 A; 2RGF A; 3W1Y A; 3ZTD A; 4J6I A; 5L95 C; 1RFK A; 2K6Q A; 3ZTC A; 3QAQ A; 1T0Y A; 2KKC A; 4A8X C; 1V5O A; 1Y8R C; 1I35 A; 2I1J A; 3QWZ B; 4XX5 A; 2YLM A; 1T0Q C; 2JX5 A; 2W55 A; 5G2N A; 2NBV B; 2REX A; 3ZNH B; 2NCN A; 3WCQ A; 1L6U A; 4EE2 A; 3ZO5 B; 2LUM A; 2Y5C A; 2KNB A; 2GI9 A; 3SFD B; 2KTF A; 5DPR A; 1M4V A; 4US8 A; 1L6V A; 5FR3 A; 4FAD A; 4PT5 A; 1C9F A; 3JSV B; 1KOT A; 2LEK A; 2J4X A; 4G0N B; 5T8I A; 1I4R A; 2D10 A; 1UWM A; 4M8N A; 4M0W B; 2M56 B; 3EGR A; 1PUT A; 2IO1 B; 4EZL A; 2QHO A; 4LNI A; 1C4C A; 1GPX A; 2K1F A; 1HZ6 A; 2ZCC A; 3KWL A; 3M62 B; 3BVM A; 3DVN U; 3QCA A; 3KUZ A; 2KWV B; 4DHJ B; 2WWZ A; 2W82 A; 5AUK A; 4D2K A; 1EF1 A; 2WXH A; 1SSN A; 1KJT A; 1HXY D; 4GB9 A; 5D6J B; 1V1P A; 1T5X D; 2K9X A; 2DEN B; 2N9P C; 2L3Z A; 5E6P A; 3HM6 X; 2KAJ A; 3OWE B; 4W9C A; 1KTK A; 4RH6 A; 3DVN V; 4ACF A; 2ZEQ A; 3N20 C; 1P7E A; 4DQO C; 1V8C A; 5MPO A; 1TKY A; 1S1Q B; 2AEH A; 1P3Q U; 3FKY A; 1IGC A; 2SEB D; 1I4G A; 2HE7 A; 2DHZ A; 2PKO A; 3ZNG C; 3SR6 A; 3T3O A; 2BF8 B; 2CR5 A; 2K8C A; 4LDT B; 4JIO U; 4HXD A; 5JHA A; 2ASQ A; 4JX1 C; 5IN7 A; 3ZRF A; 2LGX A; 1J8C A; 2R2O A; 3R7R A; 2ZVN A; 1I4H A; 3B0A A; 1Z2M A; 4F1S A; 2K25 A; 1OFF A; 1WGY A; 4W9H A; 2LRW A; 5KHO A; 1JWB D; 4IW0 A; 3ZJV A; 4BBN F; 5KHQ A; 3ETR A; 4HDQ A; 2LHE A; 1PGA A; 4E71 A; 3H9D A; 3VUX A; 5AZG A; 2RPV A; 3UGB B; 1RRB A; 2IO3 B; 3RT3 B; 1SIJ A; 2J0M A; 3ABV B; 2JPH A; 2WU2 B; 3ONS A; 3DBR I; 1WIA A; 1L0X B; 1EM7 A; 1Q1O A; 4I6P A; 4FXC A; 1PGX A; 2UYZ B; 2ZNV C; 3URY A; 3KWV A; 4YXD B; 4ZYN A; 2LFI A; 1TYG B; 4TKN A; 1ET9 A; 2V1Y A; 2X38 A; 2CS4 A; 1F77 A; 4OVU A; 4L2Y A; 3V3X A; 3WAM A; 5IP4 D; 2O6V D; 2ZW0 A; 3QX1 A; 3E9S A; 2PPH A; 4DK5 A; 3X23 A; 2MBO A; 2PW9 A; 3NS8 A; 4A9A A; 2EKI A; 1IBX B; 2RMM A; 4XWW A; 3A4R A; 3BYY B; 5JZE B; 3B9J A; 4LNN A; 5D3D A; 4FUL A; 1V6E A; 3V6E B; 3TBL D; 3AB5 A; 2KDB A; 2JRI B; 2N9L A; 4GSW A; 4HKQ A; 2N7D A; 3AMZ A; 1GUA B; 4WWP A; 1TKG A; 3KLS X; 3L16 A; 3RN9 C; 3KH0 A; 4RGO S; 5C23 A; 4IDI A; 2IZV B; 1YNT E; 4C4V A; 3Q69 A; 2WXP A; 1I42 A; 4LNF A; 3AEE B; 2CHW A; 4W9F A; 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